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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1421 | 2026-04-18 |
Single-cell insights: Mosquito Toll activation enhances granulocyte differentiation and immune surveillance via Notch suppression
2026-Apr-14, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2531951123
PMID:41941624
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学研究了蚊子Toll等先天免疫信号通路如何调控血细胞分化和功能,揭示了新的血细胞亚群及其在免疫监视中的作用 | 首次在蚊子中利用单细胞转录组学鉴定出oenocytoid和granulocyte亚群,并发现Toll和JNK激活通过抑制Notch信号促进粒细胞终末分化,增强免疫监视 | 研究仅基于转录组数据,缺乏蛋白质水平验证;样本来源单一,未涵盖不同蚊子品系或感染状态 | 探究蚊子先天免疫信号通路对血细胞分化和功能的调控机制 | 蚊子血细胞(免疫细胞) | 单细胞转录组学 | 疟疾 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | 37,529个血细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1422 | 2026-04-18 |
Spatial multiomics profiling reveals ZFP36-mediated immunometabolic reprogramming in bladder cancer
2026-Apr-14, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2505125123
PMID:41950100
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研究论文 | 本研究通过空间代谢组学和空间转录组学技术,系统描绘了膀胱癌的代谢和转录景观,揭示了肿瘤异质性和免疫相关代谢重编程,并识别ZFP36作为潜在免疫治疗靶点 | 采用空间多组学整合分析,首次在膀胱癌中系统可视化代谢与转录异质性,并发现ZFP36通过调控关键免疫调节因子mRNA降解抑制T细胞功能的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和空间组学数据,人类样本验证和临床转化仍需进一步探索 | 揭示膀胱癌的免疫代谢重编程机制并寻找新的免疫治疗靶点 | 膀胱癌组织样本、ZFP36基因敲除小鼠模型、T细胞 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 空间代谢组学、空间转录组学、基因敲除技术 | 基因敲除小鼠模型 | 空间代谢组数据、空间转录组数据、基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 空间代谢组学、空间转录组学 | NA | NA |
| 1423 | 2026-04-18 |
Sphingosine-1-Phosphate-derived 2-Hexadecenal is a central mediator of ocular neovascularization by inhibiting Sphingosine-1-Phosphate receptor 5
2026-Apr-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71792-3
PMID:41980976
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研究论文 | 本文揭示了S1P代谢产物2-HD通过抑制S1PR5破坏铁稳态并诱导铁死亡,从而在视网膜血管异常中发挥关键作用 | 首次发现S1P衍生的2-HD在血管功能中的作用,并揭示其通过直接与S1PR5相互作用诱导铁死亡的新机制 | 研究主要基于斑马鱼模型和体外分析,人类样本验证有限,且未深入探讨其他S1PRs在过程中的潜在作用 | 探究S1P代谢产物2-HD在血管生成和视网膜血管疾病中的功能及机制 | 斑马鱼视网膜血管、人类新生血管视网膜样本 | 分子生物学 | 糖尿病视网膜病变 | 多组学分析、单细胞RNA测序、RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, RNA测序 | NA | NA |
| 1424 | 2026-04-18 |
The topographical distribution of spermatogonial subpopulations during the cycle of seminiferous epithelium in Macaca Fascicularis
2026-Apr-13, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioag018
PMID:41562564
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研究论文 | 本研究利用免疫组织化学染色和定量分析,探索了食蟹猴睾丸生精上皮中不同精原细胞亚群的空间分布及其与生精上皮周期的关系 | 首次在灵长类动物中描述了不同精原细胞亚群(PIWIL4+、GFRA1+、NANOS3+、KIT+)在生精上皮基底室中的拓扑定位及其阶段依赖性分布模式 | 研究仅基于食蟹猴的固定样本进行免疫组化分析,未涉及动态活体观察或分子机制深入探索 | 解析灵长类动物精原干细胞亚群的空间分布规律及其与生精微环境的动态关系 | 食蟹猴睾丸生精上皮中的精原细胞亚群 | 数字病理学 | NA | 免疫组织化学染色、单细胞RNA测序(引用先前研究) | NA | 组织切片图像 | 食蟹猴Bouin固定睾丸样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1425 | 2026-04-18 |
Scalable genotyping in fixed transcriptomes resolves clonal heterogeneity via single-cell sequencing
2026-Apr-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.11.717967
PMID:41993258
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研究论文 | 本文介绍了一种名为GIFT的新型单细胞测序技术,用于同时检测数百个靶向遗传变异和全转录组谱 | GIFT技术通过设计合理的间隙填充反应,在相邻单链DNA探针之间进行,对原生转录本序列进行条形码标记,实现了高特异性的靶向突变检测 | NA | 解决在固定转录组中大规模链接转录状态与体细胞突变的技术限制 | 骨髓增生性肿瘤患者的单细胞 | 单细胞测序 | 骨髓增生性肿瘤 | 单细胞转录组学,靶向遗传变异检测 | NA | 单细胞转录组数据,遗传变异数据 | 超过700,000个细胞,来自35名捐赠者 | NA | 单细胞RNA-seq,靶向突变检测 | NA | NA |
| 1426 | 2026-04-18 |
Loss of MITF activity leads to emergent cell states from the melanocyte stem cell lineage
2026-Apr-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.23.695681
PMID:41993564
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研究论文 | 本研究利用斑马鱼黑色素干细胞模型,探讨了转录因子MITF在胚胎发育中保护干细胞命运及其在成年后色素克隆形成中的作用 | 首次结合活体成像、单细胞转录组学和谱系追踪技术,揭示了MITF缺失导致黑色素干细胞在胚胎期出现异常扩增和新型转录细胞状态 | 研究主要基于斑马鱼模型,对人类疾病(如黑色素瘤)的直接应用仍需进一步验证 | 探究MITF在黑色素干细胞谱系维持和再生过程中的功能机制 | 斑马鱼的黑色素干细胞及其胚胎至幼体阶段的发育过程 | 发育生物学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组学、谱系追踪、活体成像 | NA | 转录组数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1427 | 2026-04-18 |
Whole-organism spatial transcriptomics at single-cell resolution in C. elegans
2026-Apr-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.09.717568
PMID:41993495
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研究论文 | 本文开发了一种适用于秀丽隐杆线虫全生物体的单细胞分辨率空间转录组学方法,通过单分子荧光原位杂交技术实现多基因表达的空间分析 | 提出了一种单分子荧光原位杂交工作流程,能够在整个线虫中实现单细胞分辨率的多重成像,最多可分析40个基因并保留空间背景 | 该方法在每轮杂交中仅使用两个荧光通道,可能限制了更高通量的基因分析能力 | 开发一种适用于全生物体的空间转录组学方法,以在单细胞分辨率下分析基因表达和细胞身份 | 秀丽隐杆线虫(C. elegans) | 空间转录组学 | NA | 单分子荧光原位杂交(smFISH) | NA | 图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1428 | 2026-04-18 |
Dysregulation of Hippo Signaling Pathway as a Convergent Mechanism Underlying Choroid Plexus Defects in Bipolar Disorder
2026-Apr-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.10.717745
PMID:41993308
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研究论文 | 本研究通过类器官模型和影像学分析,揭示了双相情感障碍中脉络丛异常扩张及其与Hippo信号通路失调的关联 | 首次结合人类皮层类器官、脉络丛类器官和结构MRI数据,识别出双相情感障碍中脉络丛的异常扩张,并发现Hippo信号通路早期过度激活是驱动这一过程的收敛机制 | 研究主要基于类器官模型和影像学数据,体内功能验证和临床转化应用仍需进一步探索 | 探究双相情感障碍中脉络丛缺陷的分子机制和发育起源 | 双相情感障碍患者的类器官模型、结构MRI扫描数据以及健康对照个体 | 数字病理学 | 双相情感障碍 | 单细胞转录组学、全基因组分析、全基因组关联研究、结构磁共振成像 | 类器官模型 | 转录组数据、影像数据、遗传数据 | 涉及双相情感障碍个体和健康对照个体的类器官及sMRI扫描样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1429 | 2026-04-18 |
KRAS inhibition is an effective therapy for appendiceal adenocarcinoma
2026-Apr-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.07.717107
PMID:41993359
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研究论文 | 本研究评估了KRAS抑制剂在阑尾腺癌(AA)中的疗效,通过体外类器官和体内PDX模型以及临床患者数据,证实了KRAS抑制能有效抑制肿瘤生长并重塑肿瘤微环境 | 首次在阑尾腺癌中系统评估KRAS G12D特异性抑制剂(MRTX1133)和泛KRAS抑制剂(RMC-6236)的疗效,并揭示了EMT和TGF-β通路可能介导耐药性,同时发现KRAS抑制能激活先天免疫反应 | 研究样本量较小(仅6例临床患者),且主要基于临床前模型,需要更大规模的临床试验验证 | 评估KRAS抑制剂作为阑尾腺癌治疗靶点的有效性和机制 | 阑尾腺癌(AA)的KRAS突变类器官、PDX模型以及临床患者 | 肿瘤学 | 阑尾腺癌 | 多组学分析、scRNA-seq、GSEA | 类器官模型、PDX模型 | 基因组数据、转录组数据、临床数据 | 6例临床患者,多个PDX和类器官模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1430 | 2026-04-18 |
SCOPE: Localizing fate-decision states and their regulatory drivers in single-cell differentiation
2026-Apr-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.07.717037
PMID:41993275
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研究论文 | 本研究提出了一个名为SCOPE的半监督保形预测框架,用于从高维单细胞测序数据中精确定位细胞命运决定状态及其调控驱动因子 | 通过保形推理将高维单细胞测量转化为严格的、离散的未来命运预测集,首次提供了在生物学窗口内定位多能祖细胞命运决定的统计基础方法 | 未明确说明方法在非造血系统或更复杂发育系统中的普适性限制,以及计算资源需求 | 精确定位细胞分化过程中的命运决定状态(分支点)并识别其调控驱动因子,特别是表观遗传预兆现象 | 小鼠造血系统、人类造血数据集、人类视网膜发生过程中的单细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞多组学测序 | 半监督保形预测(SCOPE) | 单细胞转录组和染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 1431 | 2026-04-18 |
Genetic interaction between Adgrg6 and Sox9 reveals a feedforward mechanism for postnatal spinal stability
2026-Apr-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.06.716681
PMID:41993334
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学揭示了Adgrg6与Sox9之间的遗传互作,通过前馈调控机制维持椎间盘细胞外基质基因表达,从而解析青少年特发性脊柱侧凸(AIS)的遗传机制 | 首次通过空间转录组学在Adgrg6条件性敲除小鼠模型中揭示Sox9表达下调与细胞外基质组织紊乱的关联,并证实Adgrg6与Sox9之间存在自我强化的前馈调控回路 | 研究基于小鼠模型,其病理机制是否完全适用于人类AIS仍需进一步验证 | 解析青少年特发性脊柱侧凸(AIS)多基因遗传的分子机制 | Adgrg6条件性敲除小鼠模型(Adgrg6-cKO)及Sox9低效等位基因小鼠 | 空间转录组学 | 青少年特发性脊柱侧凸 | 空间转录组学,染色质开放性分析 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 空间基因表达数据,染色质互作数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1432 | 2026-04-18 |
Transcriptional profiling of extraocular motor neurons reveals sim1a as a candidate strabismus-related gene
2026-Apr-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.07.717009
PMID:41993546
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研究论文 | 本研究通过转录组分析揭示了sim1a作为斜视相关候选基因,并利用斑马鱼模型验证了其在外眼运动神经元功能中的作用 | 首次结合bulk和单细胞测序技术,在斑马鱼模型中系统性地识别了外眼运动神经元亚群的转录组多样性,并发现sim1a基因突变可影响前庭-眼反射功能 | 研究基于斑马鱼模型,其发现需在哺乳动物系统中进一步验证;样本规模较小,可能限制基因发现的全面性 | 识别与斜视(特别是非共同性斜视)相关的遗传因素,并解析外眼运动神经元的分子特征 | 斑马鱼幼虫的外眼运动神经元(颅核nIII/nIV) | 神经科学 | 斜视 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | 转录组数据 | 斑马鱼幼虫模型 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1433 | 2026-04-18 |
A transcriptomic axis aligns with in vivo functional dynamics in hippocampal inhibitory circuits
2026-Apr-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.07.716935
PMID:41993541
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞分辨率的两光子成像和空间转录组学技术,揭示了小鼠海马抑制性神经元中转录组轴与功能动态之间的直接联系 | 开发了一种端到端管道,将细胞分辨率的两光子成像与空间转录组学结合,首次在海马抑制性电路中建立了分子身份与功能之间的直接、可扩展框架 | 研究仅限于小鼠海马CA1区的抑制性神经元,可能无法推广到其他脑区或物种 | 在单细胞分辨率上链接分子身份与功能,以理解海马抑制性电路的动态 | 小鼠海马CA1区的抑制性神经元 | 神经科学 | NA | 两光子成像,空间转录组学 | 分类器 | 图像,基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1434 | 2026-04-18 |
Genetic interaction between Adgrg6 and Sox9 reveals a feedforward mechanism for postnatal spinal stability
2026-Apr-08, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-9271349/v1
PMID:41994120
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学揭示了Adgrg6和Sox9在青少年特发性脊柱侧弯(AIS)中的遗传相互作用和反馈前调控机制 | 首次利用空间转录组学在Adgrg6条件性敲除小鼠模型中识别脊柱基因表达变化,并揭示了Adgrg6和Sox9之间的自我强化反馈前调控回路 | 研究主要基于小鼠模型,人类AIS的复杂多基因机制可能有所不同 | 探究AIS的遗传机制和功能基础 | Adgrg6条件性敲除小鼠模型和Sox9低效等位基因小鼠 | 空间转录组学 | 青少年特发性脊柱侧弯 | 空间转录组学,基因组关联研究(GWAS) | 条件性敲除小鼠模型 | 空间转录组数据,基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1435 | 2026-04-18 |
Longitudinal Single-Cell RNA-seq Profiling of Lung Cell Phenotypes, Signaling, and Cross-talk During Fibrosis Resolution
2026-Apr-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.06.716772
PMID:41993271
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研究论文 | 本研究通过纵向单细胞RNA测序分析了小鼠肺纤维化自发消退过程中的细胞表型、信号通路及细胞间通讯变化 | 首次在完整肺组织中纵向追踪纤维化消退期的单细胞动态,揭示了促纤维化巨噬细胞群的清除及抗纤维化通路(如cAMP、HGF/MET、TWEAK)的富集 | 研究基于小鼠模型,人类肺纤维化消退机制可能不同;单细胞测序技术本身存在技术噪音和批次效应 | 阐明肺纤维化自发消退过程中的细胞与分子机制,为治疗肺纤维化提供潜在靶点 | 小鼠全肺消化物中的免疫细胞、间充质细胞和上皮细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量的小鼠全肺样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1436 | 2026-04-18 |
STDrug enables spatially informed personalized drug repurposing from spatial transcriptomics
2026-Apr-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.03.715101
PMID:41993522
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研究论文 | 本研究提出了一个名为STDrug的空间信息计算框架,该框架整合空间转录组学、基于图的建模和多模态学习,以实现患者特异性的治疗药物优先级排序 | 首次将空间转录组学数据整合到药物重定位框架中,通过图卷积网络和相干点漂移算法识别并对齐疾病与对照空间区域,并采用结合肿瘤可逆基因特征、基于扰动的逆转评分和知识引导基因加权的综合评分方案 | 研究仅在肝细胞癌和前列腺癌数据集上进行了验证,其普适性在其他癌症类型中尚需进一步评估 | 开发一个能够利用空间组织上下文信息进行个性化药物重定位的计算框架 | 肝细胞癌和前列腺癌患者 | 空间转录组学 | 肝细胞癌, 前列腺癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 图卷积网络, 多模态学习, 机器学习框架 | 空间转录组数据, 电子健康记录, 体外实验数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1437 | 2026-04-18 |
Gain-of-function mutation in SKAP2 leads to type 1 diabetes and broader autoimmunity through hyperactive integrin signaling in myeloid cells
2026-Apr-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.02.716136
PMID:41993266
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研究论文 | 本研究通过发现SKAP2基因的功能获得性突变,揭示了其通过增强髓系细胞整合素信号通路导致1型糖尿病及更广泛自身免疫的机制 | 首次在人类中发现SKAP2功能获得性突变与1型糖尿病的直接关联,并利用基因敲入小鼠模型系统阐明了该突变通过过度激活髓系细胞整合素信号通路引发自身免疫的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床样本验证有限;突变在人群中的普遍性及与其他自身免疫疾病的关联仍需进一步研究 | 阐明SKAP2基因突变导致1型糖尿病及自身免疫风险增加的分子机制 | 携带SKAP2 p.G153R突变的小鼠模型(NOD和C57BL/6J背景)、髓系细胞(树突状细胞、巨噬细胞、中性粒细胞) | 免疫学与遗传学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序、基因敲入小鼠模型、免疫表型分析 | 基因工程小鼠模型 | 基因序列数据、单细胞转录组数据、免疫表型数据 | 未明确说明具体样本数量,但涉及两种遗传背景(NOD和C57BL/6J)的基因敲入小鼠群体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1438 | 2026-04-18 |
Comparative single cell analysis of wound and cancer identifies the metabolic dialogues between tumor initiating stem cells and macrophages
2026-Apr-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.02.716187
PMID:41993506
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研究论文 | 本研究通过比较皮肤伤口愈合和皮肤鳞状细胞癌进展过程中的单细胞RNA测序数据,揭示了肿瘤起始干细胞与肿瘤相关巨噬细胞之间代谢对话的关键作用 | 首次通过比较单细胞分析揭示伤口相关巨噬细胞和肿瘤相关巨噬细胞在脂质代谢调控上的根本差异,并发现SOX2肿瘤起始干细胞是调控肿瘤相关巨噬细胞代谢状态的关键协调者 | 研究主要聚焦于皮肤鳞状细胞癌模型,其他癌症类型中的类似机制尚未验证;单细胞测序技术本身存在技术局限性 | 阐明肿瘤相关巨噬细胞在癌症进展中的独特分子特征及其与肿瘤起始干细胞的相互作用机制 | 皮肤伤口愈合过程中的巨噬细胞和皮肤鳞状细胞癌进展过程中的肿瘤相关巨噬细胞 | 单细胞组学 | 皮肤鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1439 | 2026-04-18 |
An enzyme-responsive electrospun polyester membrane for sustained delivery of polymerized 2-methoxyestradiol to treat peritendinous adhesion
2026-Apr-04, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.04.007
PMID:41942050
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研究论文 | 本研究开发了一种负载聚合2-甲氧基雌二醇的酶响应性电纺聚己内酯膜,用于持续局部释放以抑制成纤维细胞增殖和胶原沉积,从而预防肌腱周围粘连 | 首次将聚合2-甲氧基雌二醇整合到电纺膜中,实现酶响应性持续释放,并通过单细胞RNA测序揭示其通过抑制HIF-1α/Sonic Hedgehog信号通路来预防肌腱粘连的分子机制 | 研究主要基于大鼠模型,临床转化效果需进一步验证;药物释放的长期安全性及膜材料的生物降解性未详细评估 | 开发一种新型生物材料,用于预防肌腱损伤后的周围粘连 | 大鼠跟腱修复模型、人肌腱样本、大鼠208F成纤维细胞 | 生物医学工程 | 肌腱损伤与粘连 | 单细胞RNA测序、RNA测序、酯化反应、RAFT聚合、电纺技术 | NA | 基因表达数据、组织病理图像、生物力学数据 | 未明确指定具体样本数量,但涉及人肌腱样本和大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序、RNA测序 | NA | NA |
| 1440 | 2026-04-18 |
Artificial soil (ArtSoil): Recreating soil conditions in synthetic plant growth media
2026-Apr, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70833
PMID:41911577
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研究论文 | 本文开发了一种名为人工土壤(ArtSoil)的合成植物生长介质,旨在在实验室环境中模拟自然土壤条件,以更准确地研究植物生理和组学特征 | 创新点在于结合了土壤提取物(ASE)来维持土壤微生物组和土壤因子,同时消除了对糖补充的需求,从而提供了更接近自然土壤的生长环境 | NA | 研究目的是开发一种更生理相关的植物生长介质,以改善实验室条件下植物生长的模拟,并应用于单细胞转录组学等空间组学分析 | 研究对象包括拟南芥(Arabidopsis thaliana)和六种不同类型的土壤提取物(ASEs) | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |