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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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1421 | 2025-10-05 |
Neuroinflammation and Alzheimer's disease: Unravelling the molecular mechanisms
2025-Sep-12, Journal of Alzheimer's disease : JAD
DOI:10.1177/13872877251374353
PMID:40938771
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综述 | 本文系统探讨神经炎症在阿尔茨海默病发病机制中的核心作用及分子机制 | 深入解析小胶质细胞和星形胶质细胞的双重功能,揭示神经炎症级联反应与Aβ清除、tau病理传播的关联机制 | NA | 阐明神经炎症在阿尔茨海默病发病机制中的分子作用机制 | 阿尔茨海默病的神经炎症机制 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组学、脂质组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1422 | 2025-10-05 |
Lycium barbarum polysaccharides enhance testicular spermatogenesis in d-galactose-induced aging rats via calcium signaling
2025-Sep-12, Andrology
IF:3.2Q1
DOI:10.1111/andr.70119
PMID:40939042
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研究论文 | 本研究探讨枸杞多糖通过钙信号通路改善d-半乳糖诱导的衰老大鼠睾丸生精功能的作用机制 | 首次通过单细胞测序技术揭示钙信号在睾丸不同细胞类型中的异质性分布,并阐明枸杞多糖通过调控Ca2⁺/CaM/CaMKII信号通路改善睾丸功能的分子机制 | 研究主要基于动物和细胞模型,尚未在人体中进行验证;d-半乳糖诱导的衰老模型可能无法完全模拟自然衰老过程 | 探究枸杞多糖对d-半乳糖诱导的睾丸功能障碍的保护作用及其分子机制 | d-半乳糖诱导的衰老雄性大鼠和TM3细胞(小鼠睾丸间质细胞系) | 生殖医学 | 生殖系统衰老 | 单细胞测序,多组学分析,组织学分析,SA-β-gal染色 | NA | 单细胞测序数据,组织学图像,生化指标 | d-半乳糖诱导的衰老雄性大鼠模型和TM3细胞模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1423 | 2025-10-05 |
Draft de novo genome construction of Scytonema sp. PRP1: identified from single-cell sequencing library preparation
2025-Sep-11, Microbiology resource announcements
IF:0.7Q4
DOI:10.1128/mra.00029-25
PMID:40744872
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研究论文 | 通过单细胞测序文库制备鉴定并构建了Scytonema sp. PRP1蓝藻菌的基因组草图 | 首次从人类脑组织单细胞测序文库中鉴定出蓝藻菌并完成其基因组从头组装 | NA | 构建蓝藻菌Scytonema sp. PRP1的基因组序列 | Scytonema sp. PRP1蓝藻菌 | 基因组学 | NA | 单细胞测序,基因组从头组装 | NA | 基因组序列数据 | 1个蓝藻菌株 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
1424 | 2025-10-05 |
Upfront whole blood transcriptional patterns in patients receiving immune checkpoint inhibitors associate with clinical outcome
2025-Sep-11, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04155-4
PMID:40931197
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研究论文 | 本研究通过全血转录组分析识别与免疫检查点抑制剂临床疗效相关的转录模式 | 首次在14,085个全血转录组中应用共识独立成分分析识别转录成分,并验证其与免疫治疗临床结局的关联 | 样本量相对有限(145例患者),需要更大规模研究验证 | 开发基于全血转录组学的无创生物标志物以改善免疫治疗患者分层 | 晚期癌症患者接受免疫检查点抑制剂治疗 | 生物信息学 | 晚期癌症 | RNA测序,共识独立成分分析,基因集富集分析,单细胞转录组分析 | 多变量分析,置换检验框架 | 全血RNA测序数据,单细胞转录组数据 | 145例患者预处理全血样本,14,085个公共全血转录组 | NA | RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | NA |
1425 | 2025-10-05 |
Xcr1+ type 1 conventional dendritic cells are essential mediators for atherosclerosis progression
2025-Sep-11, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.107742
PMID:40934103
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研究论文 | 本研究揭示了Xcr1+ cDC1细胞通过Xcl1信号通路促进动脉粥样硬化进展的关键机制 | 首次证实cDC1细胞在动脉粥样硬化斑块中的存在,建立了新型cDC1条件性敲除小鼠模型,并发现通过Xcl1靶向cDC1可抑制动脉粥样硬化发展 | 未详细阐明cDC1细胞异质性的具体功能差异,血清脂质水平和巨噬细胞变化未观察到显著差异 | 探究cDC1细胞在动脉粥样硬化发展中的作用机制 | 人类动脉粥样硬化斑块、小鼠模型、Xcr1+ cDC1细胞 | 免疫学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、遗传工程小鼠模型 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、病理学数据 | 人类动脉粥样硬化斑块样本、高脂血症小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1426 | 2025-10-05 |
Acellular Tissue Engineered Vessels as Coronary Artery Bypass Grafts
2025-Sep-11, JACC. Basic to translational science
DOI:10.1016/j.jacbts.2025.101379
PMID:40939573
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研究论文 | 评估小直径无细胞组织工程血管在灵长类动物模型中作为冠状动脉搭桥移植物的可行性和耐久性 | 首次在灵长类动物模型中验证小直径无细胞组织工程血管作为冠状动脉搭桥移植物的长期性能,并发现宿主细胞从旁路冠状动脉向内生长可调节血管直径 | 研究样本量较小(n=5),仅观察了6个月的短期效果 | 解决冠状动脉搭桥手术中自体血管不足或质量差的问题,开发替代性血管移植物 | 成年狒狒(非人灵长类动物) | 组织工程 | 心血管疾病 | 空间转录组学,计算机断层扫描血管成像,组织学分析 | NA | 影像数据,基因表达数据,组织学数据 | 5只成年狒狒 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
1427 | 2025-10-05 |
OmicsTweezer: A distribution-independent cell deconvolution model for multi-omics Data
2025-Sep-10, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100950
PMID:40675159
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研究论文 | 开发了一种分布无关的细胞反卷积模型OmicsTweezer,用于多组学数据中的细胞类型比例估计 | 通过整合最优传输与深度学习,在共享潜在空间中对齐模拟和真实数据,有效缓解数据偏移和组学间分布差异 | NA | 开发能够克服批次效应和分布差异的细胞反卷积方法 | 批量组学数据中的细胞类型比例估计 | 机器学习 | 前列腺癌, 结肠癌 | 最优传输, 深度学习 | 深度学习模型 | 批量RNA-seq, 批量蛋白质组学, 空间转录组学 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 批量蛋白质组学, 空间转录组学 | NA | NA |
1428 | 2025-10-05 |
Paired single-cell and spatial transcriptional profiling reveals a central osteopontin macrophage response mediating tuberculous granuloma formation
2025-Sep-10, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01559-25
PMID:40772762
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研究论文 | 通过配对单细胞和空间转录组分析揭示骨桥蛋白巨噬细胞在结核性肉芽肿形成中的核心作用 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组技术系统解析结核肉芽肿的细胞组成和空间结构,发现骨桥蛋白高表达巨噬细胞群的核心调控作用 | 研究样本来自患者活检标本,样本数量有限;斑马鱼模型与人类疾病存在物种差异 | 阐明结核性肉芽肿的细胞组成、空间结构和形成机制 | 结核病患者肉芽肿活检标本和斑马鱼感染模型 | 单细胞生物学 | 结核病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序, 轨迹分析, 空间去卷积 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | 结核病患者肉芽肿活检标本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
1429 | 2025-10-05 |
Defining the host dependencies and the transcriptional landscape of RSV infection
2025-Sep-10, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01010-25
PMID:40815167
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研究论文 | 本研究通过全基因组CRISPR敲除筛选和单细胞RNA测序技术,揭示了RSV感染过程中宿主决定因素及感染细胞与未感染旁观者细胞的转录差异 | 首次结合全基因组CRISPR筛选和单细胞RNA测序分析RSV感染,揭示了感染细胞与旁观者细胞的不同转录模式,并将发现与17种其他病毒的29项已发表研究进行对比 | 未明确说明样本来源和具体样本数量 | 阐明RSV感染的宿主依赖性因素和转录特征 | 呼吸道合胞病毒(RSV)感染的宿主细胞反应 | 功能基因组学 | 呼吸道病毒感染 | 全基因组CRISPR敲除筛选, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1430 | 2025-10-05 |
Integrated single-cell atlas of human atherosclerotic plaques
2025-Sep-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-63202-x
PMID:40931012
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研究论文 | 构建人类动脉粥样硬化斑块整合单细胞图谱,揭示斑块进展的细胞机制 | 首次创建全面整合的人类动脉粥样硬化斑块单细胞图谱,通过专家共识和表面蛋白测量验证细胞类型注释,识别斑块中性粒细胞特异性标志物、促血管生成内皮细胞簇和特殊巨噬细胞亚群 | NA | 阐明动脉粥样硬化斑块进展的免疫机制和结构细胞转化 | 人类动脉粥样硬化斑块 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 约25万个高质量注释细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1431 | 2025-10-05 |
GPR91 mediates low shear stress-induced endothelial ferroptosis via EGR1-dependent GPX4 repression
2025-Sep-10, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.112127
PMID:40939914
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研究论文 | 本研究揭示了低剪切应力通过GPR91/EGR1/GPX4信号轴诱导血管内皮细胞铁死亡的新机制 | 首次发现GPR91作为机械敏感受体连接低剪切应力与铁死亡信号通路,并阐明EGR1介导的GPX4转录抑制机制 | 研究主要基于体外细胞实验,缺乏在体动物模型验证 | 探究低剪切应力诱导内皮细胞铁死亡的分子机制 | 血管内皮细胞、HEK293T细胞、动脉粥样硬化斑块 | 细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、ChIP-qPCR、RNA-seq、生物信息学分析 | NA | 基因表达数据、表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1432 | 2025-10-05 |
Comparative efficacy and safety of PSCA CAR-engineered Vδ1 γδ T cells for immunotherapy of pancreatic cancer
2025-Sep-09, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011890
PMID:40930745
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研究论文 | 本研究比较了PSCA CAR工程化Vδ1 γδ T细胞在胰腺癌免疫治疗中的疗效和安全性 | 首次直接比较CAR工程化Vδ1 γδ T细胞、Vδ2 γδ T细胞和传统αβ T细胞在胰腺癌治疗中的安全性和有效性 | Vδ1 γδ T细胞在外周血中丰度较低且体外扩增困难 | 评估CAR工程化Vδ1 γδ T细胞对胰腺癌的免疫治疗效果和安全性 | 前列腺干细胞抗原(PSCA)表达的胰腺肿瘤细胞 | 免疫治疗 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | CAR-T细胞疗法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1433 | 2025-10-05 |
EP300 as a potential mediator of stress-induced sleep disruption through blood-brain barrier dysfunction and neuroinflammation
2025-Sep-09, Sleep medicine
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.sleep.2025.106802
PMID:40939466
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证揭示了EP300基因在应激诱导睡眠障碍中的潜在作用机制 | 首次发现EP300在睡眠障碍中的潜在作用,并揭示其通过血脑屏障功能障碍和神经炎症介导睡眠紊乱的机制 | 研究主要基于动物模型,人类临床验证尚需进一步研究 | 识别影响睡眠障碍的关键基因,为理解、预防和治疗睡眠障碍提供新视角 | 睡眠障碍相关基因、小鼠模型的前额叶皮质组织 | 生物信息学 | 睡眠障碍 | 差异表达分析,加权基因共表达网络分析,孟德尔随机化,qPCR,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | 慢性不可预测应激小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1434 | 2025-10-05 |
The RNA-Binding Protein RBMX Mediates the Immunosuppressive Microenvironment of Osteosarcoma by Regulating CD8+T Cells
2025-Sep-06, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17172928
PMID:40941025
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研究论文 | 本研究揭示了RNA结合蛋白RBMX通过调控CD8+T细胞介导骨肉瘤免疫抑制微环境的机制 | 首次发现RBMX在骨肉瘤中高表达并通过调控H2-K1和THBS1影响CD8+T细胞浸润 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 探究RBMX在骨肉瘤免疫微环境中的调控机制 | 骨肉瘤细胞、CD8+T细胞、小鼠肿瘤模型 | 肿瘤免疫学 | 骨肉瘤 | 单细胞转录组测序、流式细胞术、多重免疫荧光、PCR | 小鼠皮下移植瘤模型 | 转录组测序数据、流式细胞数据、免疫荧光图像 | 人类骨肉瘤数据库和小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
1435 | 2025-10-05 |
Long Noncoding RNAs as Emerging Regulators of Seed Development, Germination, and Senescence
2025-Sep-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26178702
PMID:40943616
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综述 | 本文综述了长链非编码RNA在种子发育、萌发和衰老过程中的调控作用 | 整合了lncRNAs在种子发育关键阶段的多重调控机制,包括染色质重塑、RNA指导的DNA甲基化等新兴功能 | NA | 探讨lncRNAs在种子发育生理过程中的调控功能 | 种子发育过程(胚胎发生、成熟、休眠、萌发和衰老) | 自然语言处理 | NA | 单细胞转录组学、空间转录组学、直接RNA测序、RNA-染色质相互作用图谱 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
1436 | 2025-10-05 |
Application of Single-Cell Sequencing and Machine Learning in Prognosis and Immune Profiling of Lung Adenocarcinoma: Exploring Disease Mechanisms and Treatment Strategies Based on Circadian Rhythm Gene Signatures
2025-Sep-05, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17172911
PMID:40941008
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和机器学习方法,基于昼夜节律基因构建肺腺癌预后模型并探索其免疫特征 | 首次结合单细胞测序和机器学习分析昼夜节律基因在肺腺癌中的作用,发现ARNTL2基因的关键促癌功能 | 研究主要基于公共数据库数据,实验验证部分相对有限 | 探索昼夜节律基因在肺腺癌预后和免疫特征中的作用机制 | 肺腺癌患者组织和细胞系 | 机器学习, 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 转录组测序 | Stepwise Cox回归, SuperPC | 转录组数据, 单细胞数据 | TCGA和GEO数据库中的肺腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
1437 | 2025-10-05 |
An Update on Single-Cell RNA Sequencing in Illuminating Disease Mechanisms of Cutaneous T-Cell Lymphoma
2025-Sep-05, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17172921
PMID:40941016
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在皮肤T细胞淋巴瘤疾病机制研究中的最新应用进展 | 系统总结了单细胞RNA测序在揭示CTCL肿瘤微环境异质性和相互作用网络中的最新发现 | CTCL疾病本身具有高度异质性,现有研究仍存在样本量有限等局限 | 更新单细胞RNA测序在皮肤T细胞淋巴瘤研究中的应用现状和发现 | 皮肤T细胞淋巴瘤(CTCL) | 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1438 | 2025-10-05 |
PIAS1 Shapes a Tumor-Suppressive Microenvironment by Suppressing Immune Evasion in Oral Squamous Cell Carcinoma
2025-Sep-04, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17172905
PMID:40941002
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研究论文 | 本研究通过免疫组化和单细胞RNA测序分析,揭示了PIAS1在口腔鳞癌肿瘤微环境中抑制免疫逃逸并塑造肿瘤抑制性微环境的作用机制 | 首次系统阐明PIAS1在口腔鳞癌肿瘤微环境非恶性基质和免疫细胞中的表达特征和功能,发现PIAS1阳性细胞具有肿瘤抑制特性而阴性细胞富集免疫抑制信号 | 研究主要基于观察性数据分析,需要进一步的功能实验验证PIAS1的具体作用机制 | 探究PIAS1在口腔鳞癌肿瘤微环境中的表达特征和功能相关性 | 口腔鳞癌组织样本和正常组织样本 | 肿瘤免疫学 | 口腔鳞状细胞癌 | 免疫组织化学,单细胞RNA测序,差异基因表达分析,通路分析,细胞间通讯推断 | NA | 组织图像,单细胞RNA测序数据 | 口腔鳞癌组织微阵列和单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1439 | 2025-10-05 |
Unraveling the developmental heterogeneity of human retinal ganglion cells within the developing retina to study to the continuity of maturation
2025-Sep-03, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2025.08.025
PMID:40912448
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术解析人类视网膜发育过程中视网膜神经节细胞的连续成熟轨迹 | 首次构建了人类胎儿视网膜从第8周到第27周的单细胞图谱,并应用伪时间分析揭示了视网膜神经节细胞成熟的连续性过程 | 研究仅涵盖胎儿发育阶段,缺乏成年期视网膜发育数据 | 解析人类视网膜发育过程中视网膜神经节细胞的成熟异质性和连续性 | 人类胎儿视网膜组织中的视网膜神经节细胞 | 单细胞基因组学 | 视网膜发育疾病 | 单细胞RNA测序 | 伪时间分析 | 单细胞转录组数据 | 人类胎儿视网膜样本(孕周8-27周) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1440 | 2025-10-05 |
Machine Learning Integration of Bulk and Single-Cell RNA-Seq Data Reveals Cathepsin B as a Central PANoptosis Regulator in Influenza
2025-Sep-02, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26178533
PMID:40943452
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研究论文 | 本研究通过整合bulk和单细胞RNA测序数据,结合机器学习方法,揭示了组织蛋白酶B在流感病毒感染中作为PANoptosis核心调控因子的作用 | 首次将bulk和单细胞RNA测序数据整合分析,采用多种机器学习算法识别PANoptosis关键调控基因,发现组织蛋白酶B在流感相关肺损伤中的核心调控作用 | 研究主要基于小鼠模型,在人体中的验证尚需进一步研究 | 探究流感病毒感染中PANoptosis的分子调控机制 | 流感A病毒感染的肺组织 | 机器学习 | 流感 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | SVM, Random Forest, LASSO回归 | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |