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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1421 | 2025-12-12 |
Leveraging mutual information in Variational Autoencoders for improved dimensionality reduction of single-cell RNA sequencing data: The scInfoMaxVAE approach
2026-Feb, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 本文提出了一种名为scInfoMaxVAE的变分自编码器方法,通过最大化互信息和采用零膨胀计数似然,旨在改进单细胞RNA测序数据的降维和细胞类型分类 | 提出了一种结合互信息最大化与零膨胀计数似然的变分自编码器,专门针对scRNA-seq数据的稀疏性和技术噪声进行优化 | 模型对超参数敏感,且存在一定的运行间方差,建议未来进行自动调优和更大规模的验证 | 改进单细胞RNA测序数据的降维表示和细胞类型分类的鲁棒性与准确性 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 变分自编码器 | 基因表达数据 | 12个公共scRNA-seq数据集,涵盖多种组织和平台 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1422 | 2025-12-12 |
Multiomics data reveal microglia's promotion for choroidal neovascularization in endothelial cells
2026-Jan, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2025.110701
PMID:41130334
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研究论文 | 本研究通过多组学数据分析揭示了小胶质细胞通过上调CSRP2并激活VEGF和TGF-β信号通路,促进脉络膜内皮细胞血管生成,从而驱动脉络膜新生血管(CNV)的病理进程 | 首次通过整合组织、血液样本的单细胞RNA测序分析,并结合体外实验验证,明确了CSRP2作为关键生物标志物在小胶质细胞-内皮细胞互作中的核心调控作用 | 研究主要依赖于GEO数据库的公共数据,样本来源可能有限;体外实验模型可能无法完全模拟体内复杂的微环境 | 阐明脉络膜新生血管(CNV)进展中视网膜和RPE/脉络膜复合体内的特定细胞类型及其分子机制,并探索下游效应物CSRP2的表达变化 | 年龄相关性黄斑变性(AMD)引起的CNV患者及健康对照者的视网膜组织、RPE/脉络膜复合体和血液样本 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序, 差异基因表达分析, 免疫浸润分析, 基因集富集分析, 体外共培养实验 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 来自GEO数据库的湿性AMD患者和健康对照者的组织与血液样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1423 | 2025-12-12 |
Commentary: Toward a global atlas of ocular surface biology: Rationale, design, and clinical applications
2026-Jan, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2025.110705
PMID:41130333
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评论 | 本文提出并阐述了构建全球眼表生物学图谱的倡议,包括其基本原理、设计框架和临床转化应用 | 首次提出并系统规划了针对眼表这一复杂组织的全球性多组学图谱构建计划,整合了单细胞、空间组学及泪液分析技术,并制定了明确的临床转化路线图和决策节点 | 本文为倡议和框架性论述,尚未展示实际数据或验证结果,其可行性和最终效果有待后续研究证实 | 构建一个全面、高分辨率的眼表生物学参考图谱,以推动精准眼科的发展,实现基于机制的疾病分型和个性化干预 | 眼表组织(包括角膜、结膜、泪膜装置),涵盖健康和疾病状态 | 数字病理学 | 眼科疾病(如干眼症、圆锥角膜、角膜移植排斥) | sc/snRNA-seq, ATAC-seq, 空间转录组学, 泪液蛋白质组学/代谢组学 | NA | 多组学数据(转录组、表观基因组、空间信息、蛋白质组、代谢组) | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1424 | 2025-12-12 |
Insights and advancements in molecular biology techniques in ophthalmology
2026-Jan, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2025.110706
PMID:41135834
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综述 | 本文综述了眼科领域分子生物学技术的最新进展,包括下一代测序、单细胞分析和空间转录组学等,及其在疾病机制解析、生物标志物发现和个性化医疗中的应用 | 整合了下一代测序、单细胞分析和空间转录组学等前沿技术,提供了高分辨率的细胞异质性和空间转录景观分析,推动了眼科疾病分子机制的深入理解和个性化医疗的发展 | NA | 综述眼科分子生物学技术的最新进展,以增强对眼部疾病分子机制的理解,并促进非侵入性诊断、疾病监测和靶向治疗的发展 | 眼部疾病及其相关的分子机制、生物标志物(如蛋白质、代谢物、非编码RNA) | 分子生物学 | 眼部疾病 | 下一代测序技术、单细胞分析、空间转录组学、流式细胞术、质谱分析、代谢组学 | NA | 分子数据(如测序数据、蛋白质数据、代谢物数据) | NA | NA | 下一代测序、单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 1425 | 2025-12-12 |
Chronic intermittent cold stress-induced lipophagy promotes foamy macrophage susceptibility to ferroptosis and exacerbates atherosclerosis
2026-Jan, Free radical biology & medicine
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研究论文 | 本研究揭示了慢性间歇性冷应激通过诱导泡沫巨噬细胞铁死亡而加剧动脉粥样硬化的分子机制 | 首次阐明了冷应激通过促进皮质酮释放,激活糖皮质激素受体诱导过度脂噬,进而协同ALOX15介导的脂质过氧化和P62/KEAP1/NRF2/GPX4通路抑制,导致泡沫巨噬细胞铁死亡,从而加剧动脉粥样硬化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,其在人体中的直接适用性尚需进一步验证 | 探究慢性间歇性冷应激是否通过诱导泡沫巨噬细胞铁死亡来促进动脉粥样硬化,并阐明其涉及的分子通路 | 高脂饮食喂养的ApoE缺陷小鼠、泡沫巨噬细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、电子显微镜分析 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1426 | 2025-12-12 |
The influence of oxygen concentration on the fate determination of retinal ganglion cells
2026-Jan, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2025.110751
PMID:41241340
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综述 | 本文综述了氧气浓度对视网膜神经节细胞命运决定的影响及其机制,并比较了常用动物模型和人类类器官模型在模拟体内视网膜发育中的效果 | 强调了利用微流控和类器官芯片等先进技术精确调控氧气水平,并结合单细胞转录组学和CRISPR/Cas9基因组编辑等新技术以增强机制研究深度 | NA | 探讨氧气浓度对视网膜神经节细胞命运决定的影响及其机制 | 视网膜神经节细胞 | NA | 视神经疾病 | 单细胞转录组学, CRISPR/Cas9基因组编辑, 遗传扰动, 细胞成像 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1427 | 2025-12-12 |
A multiscale review of hypothalamic BRS3 neurochemistry: From receptor distribution to circuit-based therapeutic strategies
2026-Jan-01, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2025.124115
PMID:41308866
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综述 | 本文综述了BRS3受体在下丘脑的多尺度神经化学特征,从受体分布到基于神经回路的治疗策略 | 整合了从解剖图谱到前沿空间转录组学的多尺度证据,揭示了功能特化的神经回路网络,并提出了基于回路的层次化治疗策略 | NA | 探讨BRS3受体在能量稳态中的作用及其作为肥胖和糖尿病治疗靶点的潜力 | BRS3受体及其在下丘脑和相关视前区的神经元群体 | 神经科学 | 肥胖和糖尿病 | 空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1428 | 2025-12-12 |
Integrative single-cell transcriptomic and experimental analyses unveil Qihuang granule's protection against retinal photodamage via PI3K/AKT/mTOR-mediated autophagy
2026-Jan, The international journal of biochemistry & cell biology
DOI:10.1016/j.biocel.2025.106881
PMID:41318054
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学与实验分析,揭示了杞黄颗粒通过PI3K/AKT/mTOR介导的自噬通路保护视网膜免受光损伤的机制 | 首次结合单细胞RNA测序与实验验证,阐明杞黄颗粒通过调节PI3K/AKT/mTOR信号通路激活自噬,从而对抗视网膜光损伤的具体分子机制 | 研究主要基于大鼠模型和ARPE-19细胞系,尚未在更复杂的人类临床样本或体内长期模型中验证 | 探究杞黄颗粒在视网膜光损伤中的保护作用及其分子机制 | 蓝光诱导视网膜损伤的大鼠模型和人视网膜色素上皮细胞(ARPE-19) | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1429 | 2025-12-12 |
KRAS-Driven Hypertranscription and Metastatic Dissemination in Colorectal Cancer Could be Overcome by Targeting the NMHC IIA/ PLK1 Signaling Axis with a Novel Acridine Derivative
2026, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.121816
PMID:41362735
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研究论文 | 本研究通过建立患者来源的类器官和异种移植模型,筛选出一种新型吖啶衍生物LS-1-2,可克服KRAS突变结直肠癌的化疗耐药并抑制肝转移 | 发现了KRAS突变诱导的全局高转录活性,并鉴定出靶向NMHC IIA/PLK1信号轴的新型吖啶衍生物LS-1-2作为潜在治疗策略 | 研究处于临床前阶段,尚未进行人体临床试验,疗效和安全性需进一步验证 | 寻找针对KRAS突变型转移性结直肠癌的有效治疗化合物 | 转移性结直肠癌患者来源的类器官、异种移植模型及细胞系 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据,单细胞转录组数据 | 来自转移性结直肠癌患者的一系列PDOs和PDXs模型 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1430 | 2025-12-12 |
Procyanidin Suppresses Tumor Growth by Activating the B-Cell MAPK Pathway through Remodulation of the Gut Microbiota and Metabolites in Hepatocellular Carcinoma
2026, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.113217
PMID:41362739
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研究论文 | 本研究探讨了原花青素通过重塑肠道菌群及其代谢物,激活B细胞MAPK通路,从而抑制肝细胞癌生长的机制 | 首次揭示了原花青素通过肠道菌群-代谢物-肠肝轴调控B细胞MAPK通路并激活CD8T细胞,从而抑制肝癌进展的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,其结论在人体中的适用性尚需进一步验证 | 探究原花青素治疗肝细胞癌的作用机制 | 肝细胞癌小鼠模型(皮下和原位模型)、肠道菌群、代谢物、肿瘤微环境中的免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 16S rDNA测序、单细胞RNA测序、代谢组学分析 | NA | 测序数据、代谢组数据 | NA | NA | 16S rDNA测序, 单细胞RNA测序, 代谢组学 | NA | NA |
| 1431 | 2025-12-12 |
Integrated single-cell transcriptomics and proteomics elucidate the molecular mechanisms and detoxification strategy of rifampicin-induced hepatotoxicity
2026, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.109757
PMID:41362738
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学、蛋白质组学和代谢组学,系统探讨了利福平诱导肝毒性的分子机制和解毒策略 | 首次结合单细胞RNA测序、bulk RNA-seq、质谱蛋白质组学和代谢组学,全面解析利福平肝毒性的区域特异性肝细胞损伤机制,并发现RA的潜在治疗作用 | 研究基于小鼠模型,结果在人类中的直接适用性需进一步验证;部分基因表达变化的具体机制尚未完全阐明 | 探究利福平诱导肝毒性的分子机制,并寻找高效低毒的治疗干预策略 | 利福平诱导的肝毒性小鼠模型 | 数字病理学 | 肝毒性 | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq, 质谱蛋白质组学, 代谢组学 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据, 代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 蛋白质组学, 代谢组学 | NA | NA |
| 1432 | 2025-12-12 |
Susceptibility and protective genes in diabetic retinopathy: A comprehensive single-cell RNA sequencing analysis
2026-Jan, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2025.110673
PMID:41076048
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,分析了糖尿病患者外周血单核细胞,以揭示糖尿病视网膜病变的遗传基础,并识别了相关的易感基因和保护基因 | 首次在单细胞水平上构建了糖尿病视网膜病变的调控网络,并识别了DDR1等促炎基因和TELO2、SNX30、HLA-DRA等保护基因,同时通过分子对接分析提出了潜在的治疗靶点 | 研究主要基于外周血单核细胞,可能无法完全反映视网膜局部微环境的变化;样本量未在摘要中明确说明;遗传和环境因素的交互作用需要进一步探索 | 阐明糖尿病视网膜病变的遗传基础,识别影响其易感性和严重性的关键基因,并为治疗策略提供新方向 | 糖尿病患者的外周血单核细胞,特别关注糖尿病视网膜病变的遗传机制 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1433 | 2025-12-12 |
Single-Cell Transcriptome-Wide Mendelian Randomization and Colocalization Analyses Uncover Cell-Specific Mechanisms in Epigenetic Age Acceleration
2025-Dec-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202503032R
PMID:41378907
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞表达数量性状位点数据与孟德尔随机化和贝叶斯共定位分析,揭示了免疫细胞特异性基因表达对表观遗传年龄加速的因果调控机制 | 首次在单细胞分辨率下结合孟德尔随机化和贝叶斯共定位方法,系统识别了影响四种主要表观遗传时钟的细胞特异性因果基因 | 研究主要聚焦于免疫细胞类型,未涵盖其他组织或细胞类型;因果推断依赖于遗传变异假设 | 揭示表观遗传年龄加速的细胞特异性基因调控机制 | 14种免疫细胞类型中的基因表达与表观遗传时钟的关联 | 生物信息学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序,孟德尔随机化,贝叶斯共定位分析 | 统计因果推断模型 | 单细胞转录组数据,表观遗传时钟数据,全基因组关联数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1434 | 2025-12-12 |
Breaking the shields of resistance: multidimensional therapeutic strategies in the breast cancer drug resistance conundrum
2025-Dec-11, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000004424
PMID:41376375
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综述 | 本文综述了乳腺癌治疗中多维度策略的临床应用与最新进展,并探讨了克服耐药性的创新方法 | 系统整合了单细胞测序、纳米技术和靶向治疗等新兴方法,以应对乳腺癌治疗中的耐药性挑战 | 作为综述文章,未提供原始实验数据或具体临床验证结果 | 总结乳腺癌治疗的临床现状与进展,探讨克服耐药性的多维度策略 | 乳腺癌及其治疗耐药性 | NA | 乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1435 | 2025-12-12 |
EXPRESS: Mast Cell-5-HT-HTR2A Axis Involvement in Chronic Itch Induced by SADBE
2025-Dec-11, Molecular pain
IF:2.8Q2
DOI:10.1177/17448069251410452
PMID:41378780
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研究论文 | 本研究揭示了肥大细胞-5-HT-HTR2A轴在SADBE诱导的慢性瘙痒中的作用机制 | 首次明确了肥大细胞来源的5-HT在SADBE诱导的慢性瘙痒中的作用,并揭示了HTR2A受体在背根神经节神经元亚群中的特异性表达模式 | 研究主要基于小鼠模型,人体内的相关机制仍需进一步验证 | 探究SADBE诱导的过敏性接触性皮炎中慢性瘙痒的分子机制 | SADBE诱导的ACD小鼠模型、背根神经节神经元 | NA | 过敏性接触性皮炎 | 单细胞RNA测序、RNAscope原位杂交 | NA | 基因表达数据、行为学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1436 | 2025-12-12 |
Inhibition of PFKFB3 in macrophages ameliorates intestinal inflammation by modulating gut microbiota in DSS-induced colitis
2025-Dec-11, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.00632-25
PMID:41378888
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研究论文 | 本研究探讨了PFKFB3在巨噬细胞中对肠道炎症和微生物群的影响,发现其缺失可减轻结肠炎并改变肠道菌群 | 首次证明巨噬细胞中PFKFB3缺失通过调节肠道微生物群来缓解结肠炎,为溃疡性结肠炎提供了新的治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据相关性需进一步验证,且抗生素处理可能影响微生物群结果的解释 | 探究PFKFB3在溃疡性结肠炎中的作用机制及其对肠道微生物群的影响 | 人类UC患者、小鼠模型(包括PFKFB3缺陷巨噬细胞小鼠) | NA | 溃疡性结肠炎 | 免疫组化染色、单细胞RNA测序、流式分析、高通量转录组数据分析 | NA | 图像、转录组数据、微生物群数据 | 人类UC队列和健康对照、小鼠模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1437 | 2025-12-12 |
Decoding osteosarcoma from heterogeneity to precision therapy
2025-Dec-11, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04256-7
PMID:41379383
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综述 | 本文全面总结了骨肉瘤分子分型的最新进展,强调了亚型特异性致癌驱动因素及其在肿瘤进展和治疗抵抗中的作用,并探讨了基于这些分子特征制定精准医学策略的潜力 | 整合了多组学数据(包括单细胞转录组学、空间分析、表观遗传图谱和蛋白质组学)来解析骨肉瘤的异质性,并系统阐述了分子亚型与精准治疗策略之间的联系 | NA | 总结骨肉瘤分子分型的研究进展,并探讨其向精准治疗转化的潜力 | 骨肉瘤(Osteosarcoma, OS) | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 多组学研究,包括基因组学、表观基因组学、转录组学、蛋白质组学、空间分析 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 1438 | 2025-12-12 |
Expression Atlas in 2026: enabling FAIR and open expression data through community collaboration and integration
2025-Dec-10, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1238
PMID:41370097
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研究论文 | 本文介绍了Expression Atlas知识库在2026年的更新内容,包括数据扩展、功能增强及社区协作整合 | 新增批量基线实验的标记基因分析模块,整合社区单细胞数据集(如Tabula Sapiens),并计划提供AI就绪数据格式 | 未明确说明数据质量控制的具体标准或潜在的数据异质性挑战 | 构建和维护一个FAIR原则指导下的开放表达数据知识库,支持基础与转化研究 | 多物种(67个物种)的组织、细胞类型和条件特异性基因与蛋白质表达数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq、蛋白质组学 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | 超过4500项研究,包含数百个单细胞RNA-seq实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1439 | 2025-12-12 |
PTEN variant and genetic backgrounds combine to modify cerebellar neuronal differentiation in autism spectrum disorder
2025-Dec-10, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddaf185
PMID:41370235
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研究论文 | 本研究通过小脑类器官模型,探讨了PTEN基因变异与遗传背景如何共同影响自闭症谱系障碍中的小脑神经元分化 | 首次在小脑类器官中结合PTEN p.Ile135Leu变异与ASD遗传背景,揭示了细胞类型特异性表达差异及自发性电活动缺失 | 研究仅关注22周内的小脑分化过程,未涉及长期发育影响;样本基于iPSC系,可能无法完全反映体内复杂性 | 探究PTEN基因变异与遗传背景对小脑发育及神经元网络活动的协同影响机制 | 携带PTEN p.Ile135Leu变异或敲除的等基因人iPSC系及衍生的小脑类器官 | 神经发育生物学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、类器官培养、电生理记录 | 小脑类器官模型 | 基因表达数据、单细胞转录组数据、电生理活动数据 | 基于人iPSC系的小脑类器官样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1440 | 2025-12-12 |
Autophagy of Kupffer cells modulates CD8+ T cell activation in primary biliary cholangitis
2025-Dec-10, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-335611
PMID:41371935
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研究论文 | 本研究探讨了库普弗细胞自噬在原发性胆汁性胆管炎中对CD8+ T细胞活化的调控作用及其治疗潜力 | 首次揭示了库普弗细胞自噬通过降解iNOS来解除对CD8+ T细胞的抑制,从而促进自身免疫性胆管炎的新机制,并开发了靶向Atg5的纳米颗粒siRNA疗法 | 研究主要基于小鼠模型和患者样本,人类样本的深入机制验证可能有限,且纳米颗粒疗法的长期安全性和有效性需进一步评估 | 探究肝巨噬细胞在原发性胆汁性胆管炎中的作用及其治疗潜力 | 原发性胆汁性胆管炎患者、dnTGFβRII小鼠模型、Lyz2-Cre介导的Atg5敲除小鼠 | 数字病理学 | 原发性胆汁性胆管炎 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫组织化学、共培养实验 | 小鼠模型 | RNA序列数据、细胞表型数据、组织图像数据 | 患者样本和小鼠模型,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |