单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27667 篇文献，本页显示第 14361 - 14380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 14361 | 2024-08-07 |
Stricturing Crohn's disease single-cell RNA sequencing reveals fibroblast heterogeneity and intercellular interactions
2023-Apr-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.03.534781
PMID:37066202
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，首次揭示了克罗恩病狭窄部位的纤维母细胞异质性及其细胞间相互作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术构建了克罗恩病狭窄肠道的全面图谱，并验证了CDH11作为潜在治疗靶点 | NA | 旨在通过系统层面的研究揭示克罗恩病狭窄形成的病理机制，并发现新的治疗靶点 | 克罗恩病患者的全层肠组织，包括未受累、非狭窄炎症和狭窄段以及正常非克罗恩病肠段 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | RNA | 99个组织样本和409,001个细胞 |
| 14362 | 2024-08-04 |
Transcriptomic analyses reveal neuronal specificity of Leigh syndrome associated genes
2023-03, Journal of inherited metabolic disease
IF:4.2Q2
DOI:10.1002/jimd.12578
PMID:36502462
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研究论文 | 本研究揭示了与Leigh综合征相关基因在神经元中的特异性表达 | 本研究首次通过转录组分析探讨了Leigh综合征相关基因在大脑不同细胞类型中的特异性和潜在的临床重叠性 | 当前仅针对已有的基因进行了分析，未探索新的可能的病因 | 目标是确定与Leigh综合征相关基因在大脑的细胞特异性及其与其他疾病的潜在相似性 | 与Leigh综合征相关的所有基因及其在大脑中的表达模式 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 基于现有的英国大脑表达联盟数据进行的分析 |
| 14363 | 2024-08-04 |
An in vitro approach to understand contribution of kidney cells to human urinary extracellular vesicles
2023-02, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.12304
PMID:36785873
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研究论文 | 本文探索了不同人类肾细胞对尿液外泌体成分的贡献 | 提出了一种体外模型，揭示了酗酒细胞类型特异的外泌体货物，可以作为肾脏疾病的生物标记物 | 未对尿液中所有细胞类型的外泌体成分进行详尽分析 | 旨在理解不同肾细胞分泌的外泌体成分及其在正常尿液中的表现 | 不同类型的人类肾细胞（足细胞、肾小管细胞、肾小球内皮细胞和系膜细胞） | 数字病理学 | 肾脏疾病 | RNA测序、质谱分析、纳米颗粒跟踪分析等 | NA | 生物体液（尿液）、细胞培养的外泌体 | 从不同类型的条件性永生化人类肾细胞中提取的外泌体 |
| 14364 | 2024-08-07 |
Nuclear factor I-C overexpression promotes monocytic development and cell survival in acute myeloid leukemia
2023-02, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-022-01801-z
PMID:36572750
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研究论文 | 本文研究了核因子I-C（NFIC）在急性髓系白血病中的过表达及其对单核细胞发育和细胞存活的影响 | 首次展示了NFIC蛋白在急性髓系白血病患者中的显著过表达，并证明了其在单核细胞分化和细胞存活中的促进作用 | NA | 探讨NFIC在急性髓系白血病中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 急性髓系白血病患者的NFIC蛋白表达及其功能影响 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 69%的急性髓系白血病患者样本，以及AML细胞系和AML患者 blasts |
| 14365 | 2024-08-07 |
The immune-metabolic crosstalk between CD3+C1q+TAM and CD8+T cells associated with relapse-free survival in HCC
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1033497
PMID:36845133
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了肝细胞癌（HCC）中免疫细胞间的免疫代谢交叉对话，特别是CD3+C1q+肿瘤相关巨噬细胞（TAM）与CD8+ CCL4+T细胞之间的相互作用。 | 本研究首次鉴定了CD3+C1q+TAM这一新群体，并揭示了其通过C1q信号通路诱导的代谢和表观遗传重编程影响T细胞免疫，进而可能影响肿瘤预后。 | NA | 揭示肝细胞癌中免疫细胞间的免疫代谢交叉对话，并提供调控免疫抑制性肿瘤微环境的策略。 | 肝细胞癌（HCC）中的免疫细胞及其相互作用。 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 组织 | 配对的肿瘤和肿瘤周围组织 |
| 14366 | 2024-08-07 |
A human fetal lung cell atlas uncovers proximal-distal gradients of differentiation and key regulators of epithelial fates
2022-Dec-08, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2022.11.005
PMID:36493756
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research paper | 本文通过结合单细胞RNA和ATAC测序、高通量空间转录组学和单细胞成像，呈现了一个人类胎儿肺发育的多组学细胞图谱。 | 本文识别了所有肺部细胞区室中先前未被表征的细胞状态，包括与人类小细胞肺癌相关的新型神经内分泌细胞亚型。 | NA | 揭示人类胎儿肺发育过程中的细胞分化梯度和关键调控因子。 | 人类胎儿肺部的上皮细胞、间质细胞、内皮细胞和红细胞/白细胞区室。 | digital pathology | lung cancer | 单细胞RNA测序、ATAC测序、高通量空间转录组学 | NA | 细胞图谱数据 | 从5-22周的胎儿肺部样本 |
| 14367 | 2024-08-07 |
Protein aggregation and calcium dysregulation are hallmarks of familial Parkinson's disease in midbrain dopaminergic neurons
2022-Nov-24, NPJ Parkinson's disease
DOI:10.1038/s41531-022-00423-7
PMID:36424392
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研究论文 | 本文利用人类诱导多能干细胞（hiPSCs）研究了SNCA基因突变引起的帕金森病（PD）中分子事件的时间序列，揭示了早期和可能的致病事件。 | 首次展示了SNCA突变细胞在分化早期形成的β片层丰富的寡聚体聚集物，并揭示了这些聚集物与细胞内钙信号失调的关系，表明蛋白质错误折叠生成神经元内寡聚体是疾病早期的关键事件。 | 研究仅限于使用人类诱导多能干细胞模型，可能与真实的疾病发展过程存在差异。 | 研究SNCA基因突变导致的帕金森病中分子事件的时间序列，以发现早期和可能的致病事件。 | SNCA基因突变引起的帕金森病中的分子事件。 | NA | 帕金森病 | 单细胞RNA测序和蛋白质组学 | NA | 细胞 | 小分子为基础的协议生成的高度富集的中脑多巴胺能（mDA）神经元 |
| 14368 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics reveals the identity and regulators of human mast cell progenitors
2022-08-09, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2022006969
PMID:35500226
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学分析揭示了人类肥大细胞前体细胞的身份及其调控因子 | 首次展示了FcεRI在肥大细胞前体阶段表达的时间关联，并揭示了外部刺激对肥大细胞前体FcεRI表达的调控作用 | NA | 探讨肥大细胞前体细胞的特征及其在疾病中的作用 | 人类肥大细胞前体细胞及其在过敏性哮喘和系统性肥大细胞增多症中的作用 | 数字病理学 | 过敏性疾病 | 单细胞转录组学分析 | NA | 转录组数据 | 成人外周血中的CD34+造血前体细胞 |
| 14369 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing distinguishes dendritic cell subsets in the rat, allowing advanced characterization of the effects of FMS-like tyrosine kinase 3 ligand
2022-Jul, Scandinavian journal of immunology
IF:4.1Q2
DOI:10.1111/sji.13159
PMID:35285040
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序结合多色光谱流式细胞术，对大鼠模型中的组织驻留树突状细胞进行鉴定和表征，并研究了FMS样酪氨酸激酶3配体（FLT3L）对其的影响。 | 首次将单细胞RNA测序与多色光谱流式细胞术结合，用于鉴定和表征大鼠模型中的组织驻留树突状细胞，并详细研究了FLT3L对其数量和表型的影响。 | 研究主要集中在肝脏、脾脏和肠系膜淋巴结中的树突状细胞，未涉及其他组织或器官。 | 探讨FLT3L对大鼠组织驻留树突状细胞数量和表型的影响。 | 大鼠模型中的组织驻留树突状细胞及其亚型。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了Lewis大鼠进行体内实验。 |
| 14370 | 2024-08-07 |
Heterogeneity and clonality of kidney-infiltrating T cells in murine lupus nephritis
2022-04-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.156048
PMID:35271505
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和TCR测序分析了小鼠狼疮性肾炎中肾脏浸润T细胞的异质性和克隆性 | 发现CD8+和CD4+肾脏浸润T细胞在狼疮性肾炎中的不同分化状态，揭示了肾脏微环境对T细胞的抑制作用 | NA | 探讨狼疮性肾炎中肾脏浸润T细胞的功能状态及其与疾病进展的关系 | 小鼠狼疮性肾炎模型中的肾脏浸润T细胞 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序, TCR测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 14371 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis reveals heterogeneity and convergence of the tumor microenvironment in colorectal cancer
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1003419
PMID:36685571
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序数据分析，揭示了结直肠癌肿瘤微环境的异质性和收敛性 | 本研究首次通过追踪分化轨迹，揭示了脂质代谢重塑和免疫功能抑制的关系，并构建了具有良好预后价值的免疫风险模型和临床风险模型 | NA | 探究结直肠癌肿瘤微环境的异质性和收敛性 | 结直肠癌的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 从肿瘤、癌旁组织和外周血中鉴定出8种主要细胞类型和25个亚群 |
| 14372 | 2024-08-07 |
The relevance between hypoxia-dependent spatial transcriptomics and the prognosis and efficacy of immunotherapy in claudin-low breast cancer
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1042835
PMID:36685583
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研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学（ST）与免疫荧光技术，探讨了人claudin-低乳腺癌MDA-MB-231移植瘤中与缺氧相关的空间异质性及其对免疫治疗预后和疗效的影响。 | 首次揭示了claudin-低乳腺癌中基于缺氧依赖的空间异质性，并探讨了其作为临床结果和免疫治疗反应预测生物标志物的潜力。 | NA | 探讨缺氧依赖的空间转录组学与claudin-低乳腺癌患者免疫治疗预后和疗效的相关性。 | 人claudin-低乳腺癌MDA-MB-231移植瘤。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学（ST） | NA | 转录组数据 | 1904例乳腺癌样本 |
| 14373 | 2024-08-07 |
Delayed induction of type I and III interferons mediates nasal epithelial cell permissiveness to SARS-CoV-2
2021-12-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-27318-0
PMID:34876592
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和蛋白质组学分析，探讨了SARS-CoV-2在人类鼻上皮细胞中的感染及其引发的I型和III型干扰素反应 | 首次详细描述了SARS-CoV-2感染鼻上皮细胞后I型和III型干扰素的延迟诱导现象，并探讨了重组干扰素作为化学预防策略的可能性 | NA | 研究SARS-CoV-2在鼻上皮细胞中的感染机制及其引发的免疫反应 | 人类鼻上皮细胞及其对SARS-CoV-2的反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | RNA, 蛋白质 | NA |
| 14374 | 2024-08-07 |
Application of Single-Cell Approaches to Study Myeloproliferative Neoplasm Biology
2021-04, Hematology/oncology clinics of North America
DOI:10.1016/j.hoc.2021.01.002
PMID:33641869
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综述 | 本文综述了利用多种新型单细胞技术研究人类疾病，特别是费城阴性骨髓增生性肿瘤（MPN）生物学的最新见解 | 应用单细胞基因组学、单细胞转录组学和数字病理学等新技术深入研究MPN生物学 | NA | 探讨MPN生物学的新见解 | 费城阴性骨髓增生性肿瘤（MPN） | 数字病理学 | 骨髓增生性肿瘤 | 单细胞技术 | NA | 基因组学数据、转录组学数据 | NA |
| 14375 | 2024-08-07 |
Fibrinolysis influences SARS-CoV-2 infection in ciliated cells
2021-Jan-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2021.01.07.425801
PMID:33442688
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研究论文 | 研究分析了单细胞RNA测序数据，探讨了纤溶酶在SARS-CoV-2感染纤毛细胞中的作用及其与ENaC蛋白的相互作用 | 首次揭示了SARS-CoV-2通过与ENaC纤溶酶网络相互作用，加速病毒侵入易感细胞，并可能导致与ENaC相关的肺水肿呼吸状况 | NA | 探讨SARS-CoV-2感染纤毛细胞的机制及其与ENaC蛋白的相互作用 | 纤溶酶、ENaC蛋白、SARS-CoV-2受体ACE2在不同细胞类型中的表达 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 涉及不同类型的上皮细胞和白细胞 |
| 14376 | 2024-08-07 |
Machine learning predicts putative hematopoietic stem cells within large single-cell transcriptomics data sets
2019-10, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2019.08.009
PMID:31513832
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研究论文 | 本文开发了一种名为hscScore的机器学习工具，用于从单细胞转录组数据中快速识别小鼠骨髓中的造血干细胞 | hscScore工具能够基于已验证的造血干细胞基因表达谱，对单细胞转录组进行评分，从而在缺乏流式细胞术信息的情况下，有效识别造血干细胞 | NA | 开发一种新的方法来识别大型单细胞转录组数据集中的潜在造血干细胞 | 小鼠骨髓中的造血干细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 机器学习模型 | 转录组数据 | 来自不同实验室的scRNA-seq数据 |
| 14377 | 2024-08-07 |
Characterizing the replicability of cell types defined by single cell RNA-sequencing data using MetaNeighbor
2018-02-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-018-03282-0
PMID:29491377
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研究论文 | 本文介绍了一种名为MetaNeighbor的复制框架，用于量化单细胞RNA测序数据中细胞类型的跨数据集复制程度，并快速识别高度相似的集群 | 提出了MetaNeighbor框架，用于评估和提高单细胞RNA测序数据的复制性 | NA | 研究单细胞RNA测序数据中细胞类型的复制性，并定义最佳实践 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型复制性 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 8个技术性和生物多样性不同的数据集，45个中间神经元亚型中的24个 |
| 14378 | 2024-08-07 |
An Efficient Single-Cell RNA-Seq Approach to Identify Neoantigen-Specific T Cell Receptors
2018-02-07, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2017.10.018
PMID:29174843
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研究论文 | 本文提出了一种新的治疗策略，通过遗传修饰自体T细胞与新抗原特异性T细胞受体（TCRs）并将其转移回癌症患者，以提高针对肿瘤特异性突变的T细胞疗法的疗效 | 开发了一种新的方法，通过TILs与TMG转染或肽脉冲的自体抗原呈递细胞（APCs）共培养，并进行单细胞RNA测序分析T细胞，以识别与高表达IFN-γ和IL-2细胞相关的配对TCR序列 | 目前的分离新抗原特异性TCRs的技术耗时且技术挑战大，不适合临床应用 | 提高针对肿瘤特异性突变的T细胞疗法的疗效 | 新抗原特异性T细胞受体（TCRs） | NA | NA | 单细胞RNA测序（RNA-seq） | NA | RNA | 多个TCRs被识别、合成、克隆并转导到供体T细胞中 |
| 14379 | 2024-08-07 |
A stochastic and dynamical view of pluripotency in mouse embryonic stem cells
2018-02, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1006000
PMID:29451874
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研究论文 | 本文开发了一个框架，将布尔级别的网络拓扑结构扩展为更高分辨率的网络模型，明确考虑了启动子结构和基因状态切换动力学 | 提出了一个系统的方法，将布尔级别的网络拓扑结构扩展为更高分辨率的网络模型，明确考虑了启动子结构和基因状态切换动力学 | 文章未明确提及现有方法的局限性 | 研究胚胎干细胞多能性状态的动态和分子随机性 | 胚胎干细胞的多能性状态及其调控网络 | 生物医学科学 | NA | 单细胞测序 | 机器学习方法 | 基因网络拓扑结构 | 未明确提及样本数量 |
| 14380 | 2024-08-07 |
PyClone: statistical inference of clonal population structure in cancer
2014-Apr, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.2883
PMID:24633410
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研究论文 | 介绍了一种用于推断癌症克隆种群结构的统计模型PyClone | PyClone是一种贝叶斯聚类方法，能够将深度测序的体细胞突变分组为假定的克隆簇，同时估计它们的细胞流行率并考虑由片段拷贝数变化和正常细胞污染引入的等位基因不平衡 | NA | 推断癌症中的克隆种群结构 | 深度测序的体细胞突变 | 数字病理学 | 癌症 | 深度测序 | 贝叶斯聚类方法 | 测序数据 | NA |