单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 14301 - 14320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 14301 | 2024-08-07 |
Ribogenesis boosts controlled by HEATR1-MYC interplay promote transition into brain tumour growth
2024-Jan, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-023-00017-1
PMID:38225354
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研究论文 | 本文揭示了脑肿瘤启动细胞（TICs）在向肿瘤生长过渡期间，通过HEATR1-MYC相互作用增强核糖体生物发生的过程。 | 首次提出脑TICs在肿瘤生长前增强核糖体生物发生，并揭示了HEATR1与MYC结合促进核糖体RNA生成和TIC扩大的机制。 | NA | 研究肿瘤启动细胞向肿瘤生长过渡的早期事件及其分子机制。 | 脑肿瘤启动细胞（TICs）及其在肿瘤生长过程中的分子调控。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 使用果蝇神经干细胞模型进行研究 |
| 14302 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Revealed That the Enrichment of TPI1+ Malignant Hepatocytes Was Linked to HCC Metastasis and Immunosuppressive Microenvironment
2024, Journal of hepatocellular carcinoma
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JHC.S453249
PMID:38410699
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了TPI1+恶性肝细胞在肝细胞癌（HCC）转移和免疫抑制微环境中的作用 | 首次发现TPI1+恶性肝细胞群与HCC转移和免疫抑制微环境的关联，为HCC免疫治疗提供了新的潜在生物标志物 | 研究样本量较小，仅基于10个HCC样本的数据，可能影响结果的普遍性 | 探讨HCC转移相关微环境中特定细胞群的作用 | HCC组织及其邻近和正常组织样本中的恶性肝细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO回归分析 | 基因表达数据 | 10个HCC样本 |
| 14303 | 2024-08-05 |
Unveiling the hidden AP-1: revealing the crucial role of AP-1 in ccRCC at single-cell resolution
2023-12-19, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-023-01913-9
PMID:38114996
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研究论文 | 研究揭示了AP-1在透明细胞肾细胞癌（ccRCC）中的重要角色 | 首次在单细胞分辨率下分析了AP-1在ccRCC中的作用 | 在普通肾脏和ccRCC样本中未检测到AP-1的差异表达可能受到bulk-RNA测序的混杂效应影响 | 探讨AP-1在ccRCC的肿瘤发生中的作用及其调控机制 | 通过分析单细胞多组学数据集来研究AP-1在透明细胞肾细胞癌细胞与肾小管细胞中的表达差异 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞多组学 | NA | 单细胞数据 | 多个研究团队的多个单细胞多组学数据集 |
| 14304 | 2024-08-05 |
Spatial Transcriptomics Reveal Pitfalls and Opportunities for the Detection of Rare High-Plasticity Breast Cancer Subtypes
2023-12, Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology
DOI:10.1016/j.labinv.2023.100258
PMID:37813278
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研究论文 | 该文章研究了高塑性乳腺癌亚型的检测方法及其面临的挑战。 | 提出使用高分辨率空间转录组学分析来识别特定的乳腺癌标记，并揭示了现有检测方法的局限性。 | 研究主要集中在三阴性乳腺肿瘤上，其他亚型的分析不足，可能限制了结果的普遍适用性。 | 探讨高塑性乳腺癌亚型的检测方法及其在临床治疗中的应用。 | 分析11个三阴性乳腺肿瘤，包括3个claudin-low亚型和4个MpBC亚型。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 表达数据 | 11个三阴性乳腺肿瘤样本 |
| 14305 | 2024-08-07 |
Plasma cells in human pancreatic ductal adenocarcinoma secrete antibodies against self-antigens
2023-Nov-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.172449
PMID:37751306
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫球蛋白测序，探索了人类胰腺导管腺癌（PDAC）中肿瘤内B细胞反应的驱动抗原，并发现浆细胞产生的自身抗体与细胞内自身抗原反应。 | 首次揭示了PDAC中浆细胞产生的自身抗体与细胞内自身抗原反应，表明慢性炎症微环境支持适应性免疫反应。 | 研究样本量较小，仅包括7个原发性PDAC样本，可能影响结果的普遍性。 | 探索人类胰腺导管腺癌中肿瘤内B细胞反应的驱动抗原。 | 人类胰腺导管腺癌中的肿瘤内B细胞反应及其驱动抗原。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）和免疫球蛋白（Ig）测序 | NA | RNA序列 | 7个原发性PDAC样本，包括235个浆细胞和12个B细胞 |
| 14306 | 2024-08-07 |
AP-1/c-Fos supports SIV and HIV-1 latency in CD4 T cells infected in vivo
2023-Oct-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108015
PMID:37860759
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了未治疗的SIV感染猕猴的CD4 T细胞中的病毒RNA，发现Activator protein 1 (AP-1)转录因子在病毒潜伏建立和维持中的作用，并提出其作为治疗HIV-1潜伏库的潜在靶点。 | 首次揭示了AP-1在HIV-1和SIV潜伏中的作用，并提出其作为治疗靶点的可能性。 | 文章未详细讨论实验的具体限制，如样本量、实验重复性等。 | 阐明宿主细胞基因表达模式如何调控病毒基因表达，并探索治疗HIV-1潜伏库的新策略。 | SIV感染的猕猴CD4 T细胞和HIV-1治疗患者的感染细胞。 | NA | HIV-1感染 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 未具体说明样本数量 |
| 14307 | 2024-08-04 |
Endogenous adenine mediates kidney injury in diabetic models and predicts diabetic kidney disease in patients
2023-10-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI170341
PMID:37616058
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研究论文 | 内源性腺苷在糖尿病模型中介导肾损伤，并预测患者的糖尿病肾病 | 首次提出内源性腺苷可能是糖尿病肾病的致病因素，并找到其作为机制生物标志物的潜力 | 研究集中于特定患者群体，可能无法广泛适用于所有糖尿病患者 | 探索内源性腺苷在糖尿病肾病中的作用及其机制 | 糖尿病患者尿液样本及动物模型 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 空间代谢组学和单细胞转录组学 | 小鼠模型 | 尿液和组织样本 | 来自多个研究的多名糖尿病患者和糖尿病小鼠 |
| 14308 | 2024-08-07 |
Cell type-specific attenuation of brassinosteroid signaling precedes stomatal asymmetric cell division
2023-09-05, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2303758120
PMID:37639582
|
研究论文 | 研究探讨了激素油菜素内酯（BR）信号传导与气孔发育之间的关系，特别是通过SHAGGY/GSK3样激酶BIN2的作用 | 揭示了BIN2在气孔不对称细胞分裂（ACD）中的双重角色，以及BR信号激活的两种模式如何产生时空上不同的转录反应 | NA | 阐明BR信号如何调控气孔发育 | 油菜素内酯信号传导和气孔发育 | 植物生物学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 14309 | 2024-08-05 |
Approaches for single-cell RNA sequencing across tissues and cell types
2023 Jun-Oct, Transcription
DOI:10.1080/21541264.2023.2200721
PMID:37062951
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综述 | 本文回顾了单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术及其方法。 | 提供了关于单细胞RNA测序技术的全面评述和实验室最佳实践的指导。 | 未详细描述特定技术的应用案例和实验数据。 | 旨在为单细胞RNA测序技术建立稳健的工作流程和最新的协议。 | 涵盖各类组织和细胞类型的单细胞RNA测序方法。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA数据 | NA |
| 14310 | 2024-08-05 |
Understanding spatiotemporal coupling of gene expression using single molecule RNA imaging technologies
2023 Jun-Oct, Transcription
DOI:10.1080/21541264.2023.2199669
PMID:37050882
|
研究论文 | 本文概述了使用单分子RNA成像技术定量理解基因表达的最新进展 | 提出了先进成像技术如何揭示从转录到降解的mRNA生命过程之间的协调关系 | 对未来挑战的讨论尚不够深入 | 提高对基因表达中转录和后转录事件的时空耦合的理解 | 主要关注mRNA在单细胞中的表达监测 | 数字病理学 | NA | 单分子RNA成像技术 | NA | 图像 | NA |
| 14311 | 2024-08-05 |
Impact of disulfidptosis-associated clusters on breast cancer survival rates and guiding personalized treatment
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1256132
PMID:38116315
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研究论文 | 本研究开发了一个与二硫化死亡相关的预后预测工具以指导乳腺癌患者的个性化治疗 | 首次将二硫化死亡及其相关基因与乳腺癌生存率关联，构建了预后模型 | 需要进一步研究以阐明不同风险组的免疫机制 | 研究乳腺癌与二硫化死亡的关系及其对生存率的影响 | 乳腺癌患者的样本数据及相关基因的表达情况 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序和转录组测序 | Cox和Lasso回归模型 | 基因表达数据 | 基于单细胞分析识别的21个细胞簇，包含多种细胞类型 |
| 14312 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing analysis of lung cells in COVID-19 patients with diabetes, hypertension, and comorbid diabetes-hypertension
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1258646
PMID:38144556
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序分析了COVID-19患者中糖尿病、高血压及其合并症患者的肺细胞状态 | 首次揭示了SARS-CoV-2感染下糖尿病和高血压患者肺部纤维母细胞亚群的上调现象，并发现了KREMEN1可能是纤维母细胞激活的受体 | 研究仅限于特定的疾病组合和药物治疗效果的初步评估 | 探讨SARS-CoV-2感染下糖尿病、高血压及其合并症患者的肺细胞状态和潜在治疗靶点 | COVID-19患者中糖尿病、高血压及其合并症患者的肺细胞 | 数字病理学 | 糖尿病, 高血压, COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及糖尿病、高血压及其合并症的COVID-19患者肺样本 |
| 14313 | 2024-08-07 |
Inhibition of the renin-angiotensin system causes concentric hypertrophy of renal arterioles in mice and humans
2021-12-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.154337
PMID:34762601
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研究论文 | 研究通过使用携带荧光细胞谱系示踪剂的小鼠、单细胞RNA测序以及在人和小鼠中长期抑制肾素-血管紧张素系统(RAS)，发现肾素缺失或RAS抑制导致肾内动脉和 arterioles 向心性增厚 | 首次揭示了肾素细胞的多克隆扩张和转化，从经典内分泌表型转变为基质分泌表型，导致血管疾病 | 需要对人类进行前瞻性形态学研究，以确定广泛使用RAS抑制剂导致的肾血管损伤程度 | 探讨肾素-血管紧张素系统抑制对肾血管结构的影响 | 小鼠和人类的肾内动脉和 arterioles | NA | 高血压 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 小鼠和人类样本 |
| 14314 | 2024-08-07 |
Phenotypic variation of transcriptomic cell types in mouse motor cortex
2021-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2907-3
PMID:33184512
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研究论文 | 本研究使用Patch-seq技术结合膜片钳记录、生物素染色和单细胞RNA测序，分析了成年小鼠初级运动皮层中超过1,300个神经元的转录组和形态电生理特性 | 首次在同一组细胞中同时研究了神经元的转录组和形态电生理多样性，揭示了神经元类型在皮层中并非总是形成离散实体，而是在家族级别上形成连续且相关的转录组和形态电生理景观 | 研究仅限于成年小鼠的初级运动皮层，可能需要进一步研究其他脑区和不同发育阶段的神经元类型 | 探讨神经元类型的转录组和形态电生理多样性及其在皮层中的组织方式 | 成年小鼠初级运动皮层中的神经元 | 神经科学 | NA | Patch-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 超过1,300个神经元 |
| 14315 | 2024-08-07 |
A multimodal cell census and atlas of the mammalian primary motor cortex
2021-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-03950-0
PMID:34616075
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研究论文 | 本文报道了通过BRAIN Initiative Cell Census Network (BICCN)生成的哺乳动物初级运动皮层的多模态细胞普查和图谱 | 研究首次整合了单细胞转录组、染色质可及性、DNA甲基化图谱、空间解析的单细胞转录组、形态学和电生理特性以及细胞分辨率的输入-输出映射，并通过跨模态计算分析进行整合 | NA | 推进对大脑细胞类型组织的集体知识和理解 | 哺乳动物初级运动皮层的细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学、染色质可及性分析、DNA甲基化分析、空间解析的单细胞转录组学 | 跨模态计算分析 | 转录组、染色质可及性、DNA甲基化、形态学和电生理数据 | NA |
| 14316 | 2024-08-07 |
Dysbalance of ACE2 levels - a possible cause for severe COVID-19 outcome in COPD
2021-09, The journal of pathology. Clinical research
DOI:10.1002/cjp2.224
PMID:33978304
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研究论文 | 研究探讨了慢性阻塞性肺病（COPD）患者中ACE2及其相关辅助因子的表达水平，以及这些变化如何影响SARS-CoV-2感染的风险 | 首次揭示了COPD患者肺组织中ACE2和TMPRSS2表达增加，同时循环sACE2水平降低，这些变化可能增加COPD患者对SARS-CoV-2感染的易感性 | 研究未涉及这些变化与肺部血流动力学变化之间的关联 | 探究COPD患者中ACE2及其相关辅助因子的表达变化及其对SARS-CoV-2感染的影响 | COPD、特发性肺动脉高压（IPAH）和肺纤维化（PF）患者的肺组织样本及健康对照组样本 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺病 | 定量PCR、酶联免疫吸附试验、单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | COPD患者28例，IPAH患者10例，PF患者10例，健康对照组10例 |
| 14317 | 2024-08-07 |
A Role for Protease Activated Receptor Type 3 (PAR3) in Nociception Demonstrated Through Development of a Novel Peptide Agonist
2021-06, The journal of pain
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jpain.2020.12.006
PMID:33429107
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研究论文 | 研究通过开发一种新的肽激动剂，探讨了蛋白酶活化受体3（PAR3）在痛觉中的作用 | 开发了一种脂质连接的PAR3激动剂C660，该激动剂能特异性地激活PAR3并引起DRG和三叉神经元中的钙反应 | NA | 更好地理解PAR3在外周感觉神经系统中的潜在功能 | PAR3在痛觉中的作用及其与其他PARs的相互作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | G蛋白偶联受体（GPCRs） | RNA序列数据 | 使用了野生型和PAR3敲除的小鼠模型 |
| 14318 | 2024-08-07 |
The alx3 gene shapes the zebrafish neurocranium by regulating frontonasal neural crest cell differentiation timing
2021-04-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.197483
PMID:33741714
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，揭示了alx3基因在调控前鼻神经嵴细胞分化时间和细胞形态中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术，详细定义了颅神经嵴细胞的不同群体，并发现Alx转录因子基因家族在前鼻神经嵴细胞中的富集 | NA | 深入理解控制发育时序的基因如何塑造颅面骨骼元素 | alx3基因在前鼻神经嵴细胞分化中的作用 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 14319 | 2024-08-07 |
Comprehensive single-cell sequencing reveals the stromal dynamics and tumor-specific characteristics in the microenvironment of nasopharyngeal carcinoma
2021-03-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-21795-z
PMID:33750785
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了鼻咽癌肿瘤微环境中的基质细胞动态和肿瘤特异性特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了鼻咽癌肿瘤微环境中的基质细胞群及其亚群，并揭示了其对患者预后和治疗结果的影响 | 研究仅基于14名患者的样本，可能需要更多样本以增强结果的普遍性 | 深入理解鼻咽癌肿瘤微环境中的基质细胞动态，以促进癌症诊断、治疗和预后 | 鼻咽癌肿瘤微环境中的基质细胞及其亚群 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 66,627个细胞来自14名患者 |
| 14320 | 2024-08-07 |
ReactomeGSA - Efficient Multi-Omics Comparative Pathway Analysis
2020-12, Molecular & cellular proteomics : MCP
IF:6.1Q1
DOI:10.1074/mcp.TIR120.002155
PMID:32907876
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研究论文 | 介绍了一种名为ReactomeGSA的新资源，用于多组学数据集的比较途径分析 | ReactomeGSA通过Reactome的现有网页界面和新的ReactomeGSA R Bioconductor包，支持scRNA-seq数据，并能自动将不同物种的数据映射到共同的途径空间，大大降低了多组学、跨物种比较途径分析的技术门槛 | NA | 探索多组学数据集的比较途径分析方法 | B细胞在抗肿瘤免疫中的作用 | 生物信息学 | 肺癌 | scRNA-seq | NA | 多组学数据 | 比较了来自Cancer Genome Atlas (TCGA)的五个转录组学研究和Clinical Proteomic Tumor Analysis Consortium (CPTAC)的两个蛋白质组学研究的B细胞丰富和贫乏的人类癌症样本 |