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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 14261 | 2024-10-11 |
ZNF683 marks a CD8+ T cell population associated with anti-tumor immunity following anti-PD-1 therapy for Richter syndrome
2023-10-09, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2023.08.013
PMID:37738974
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研究论文 | 研究分析了Richter综合征患者在接受PD-1阻断治疗后的单细胞转录组数据,发现ZNF683标记的CD8+ T细胞与抗肿瘤免疫反应相关 | 首次发现ZNF683在PD-1阻断治疗后标记的CD8+ T细胞与Richter综合征患者的抗肿瘤免疫反应相关 | 研究样本量较小,仅涉及6名Richter综合征患者和10名其他患者的预处理外周血样本 | 探究Richter综合征患者在接受PD-1阻断治疗后的抗肿瘤免疫反应机制 | Richter综合征患者的骨髓样本和外周血样本 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 17个骨髓样本和10个外周血样本 | NA | NA | NA | NA |
| 14262 | 2024-10-11 |
Artificial Intelligence Models for Cell Type and Subtype Identification Based on Single-Cell RNA Sequencing Data in Vision Science
2023 Sep-Oct, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2023.3284795
PMID:37294649
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综述 | 本文综述了基于单细胞RNA测序数据在视觉科学中使用人工智能技术进行细胞类型和亚型识别的最新进展 | 介绍了人工智能在细胞类型识别中的应用,提供了更快、更准确和用户友好的方法 | 开发新的单细胞RNA测序数据分析方法仍然是未来研究需要解决的问题 | 帮助视觉科学家选择合适的单细胞RNA测序数据集和计算工具进行分析 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型和亚型 | 计算机视觉 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 14263 | 2024-10-09 |
Single-cell transcriptomics illustrates the immune inflammatory responses of septic mice spleen after capsaicin treatment
2025-Jan, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2024.101256
PMID:39376503
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 14264 | 2024-10-10 |
VSIG4 induces the immunosuppressive microenvironment by promoting the infiltration of M2 macrophage and Tregs in clear cell renal cell carcinoma
2024-Dec-05, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.113105
PMID:39260310
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研究论文 | 本文研究了VSIG4在透明细胞肾细胞癌中通过促进M2巨噬细胞和Tregs的浸润来诱导免疫抑制微环境的作用 | 发现了新的免疫检查点靶点VSIG4,并探讨了其在透明细胞肾细胞癌中的作用及其与免疫治疗耐药性的关系 | NA | 探索透明细胞肾细胞癌中的新型免疫治疗靶点 | 透明细胞肾细胞癌中的免疫相关基因VSIG4及其在免疫抑制微环境中的作用 | 数字病理学 | 肾癌 | 多组学数据分析、病理学审查、批量转录组数据、单细胞测序、Western blotting、免疫组化、体外/体内实验 | NA | 基因表达数据、病理图像 | 训练组:36个正常组织和267个透明细胞肾细胞癌组织;验证组:36个正常组织和266个透明细胞肾细胞癌组织 | NA | NA | NA | NA |
| 14265 | 2024-10-10 |
Sequencing-based study of neural induction of human dental pulp stem cells
2024-Nov, Human cell
IF:3.4Q3
DOI:10.1007/s13577-024-01121-7
PMID:39210197
|
研究论文 | 本研究评估了通过神经诱导的人类牙髓干细胞(DPSCs)获得的神经谱系细胞的细胞成分和分化途径 | 首次通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)详细研究了DPSCs的神经诱导特性及其分化状态 | 研究主要集中在体外培养的DPSCs,未涉及体内实验 | 评估人类牙髓干细胞在神经诱导后的细胞成分和分化途径 | 人类牙髓干细胞(DPSCs)及其神经诱导后的细胞 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 人类牙髓干细胞(DPSCs)的单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 14266 | 2024-10-10 |
Label-free high-throughput impedance-activated cell sorting
2024-Oct-09, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d4lc00487f
PMID:39315634
|
研究论文 | 提出了一种基于阻抗检测和双膜泵的无标记、高通量、高精度的细胞分选系统 | 利用FPGA的低延迟特性,实现了实时双频单细胞阻抗检测,并实现了高吞吐量和高精度的单颗粒分选 | NA | 开发一种无标记、高通量、高精度的细胞分选系统,以应用于早期癌症诊断、细胞分化研究、药物筛选和单细胞测序等领域 | HeLa细胞、MDA-MB-231细胞和Jurkat细胞 | NA | NA | 阻抗检测 | NA | 细胞 | HeLa细胞、MDA-MB-231细胞和Jurkat细胞,每秒处理5 × 10个细胞,实验中Jurkat和MDA-MB-231细胞的吞吐量达到每秒1000个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 14267 | 2024-10-10 |
KLHL21 suppresses gastric tumourigenesis via maintaining STAT3 signalling equilibrium in stomach homoeostasis
2024-Oct-07, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2023-331111
PMID:38969490
|
研究论文 | 研究探讨了KLHL21在胃癌发生中的作用及其通过维持STAT3信号平衡来抑制胃肿瘤发生的机制 | 首次揭示了KLHL21缺失通过STAT3信号通路促进胃癌发生的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和患者样本,缺乏更大规模的人类临床数据验证 | 探讨KLHL21在胃癌发生中的作用及其分子机制 | KLHL21基因、STAT3信号通路、胃癌患者样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序、免疫染色、质谱分析、核糖体测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | 包括多个小鼠模型和胃癌患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 14268 | 2024-10-10 |
Single-cell RNA sequencing identifies a subtype of FN1 + tumor-associated macrophages associated with glioma recurrence and as a biomarker for immunotherapy
2024-Oct-07, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00662-1
PMID:39375795
|
研究论文 | 研究利用单细胞测序、空间转录组学和RNA测序数据,识别出与胶质瘤复发相关的FN1+肿瘤相关巨噬细胞亚型,并探讨其在免疫治疗中的潜在作用 | 首次发现FN1+肿瘤相关巨噬细胞与胶质瘤复发相关,并提出其作为免疫治疗反应的预测标志物 | NA | 探讨胶质瘤复发的分子机制,并寻找新的治疗靶点 | FN1+肿瘤相关巨噬细胞与胶质瘤复发的关系 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞测序、空间转录组学、RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 14269 | 2024-10-10 |
A New Tissue Engineering Strategy to Promote Tendon-bone Healing: Regulation of Osteogenic and Chondrogenic Differentiation of Tendon-derived Stem Cells
2024-Oct, Orthopaedic surgery
IF:1.8Q2
DOI:10.1111/os.14152
PMID:39043618
|
综述 | 本文综述了当前促进肌腱-骨愈合的策略,并分析了相关的临床前和临床研究,重点探讨了肌腱来源干细胞(TDSCs)在肌腱-骨愈合中的潜力 | 本文提出了一种基于TDSCs驱动成骨和软骨分化的肌腱-骨愈合新策略 | NA | 旨在全面审查当前促进肌腱-骨愈合的策略,并分析相关研究,以优化肌腱-骨愈合结果 | 前交叉韧带(ACL)和肩袖(RC)损伤修复手术中的肌腱-骨愈合 | 再生医学 | 运动损伤 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 14270 | 2024-10-10 |
Enhanced interactions within microenvironment accelerates dismal prognosis in HBV-related HCC after TACE
2024-Oct-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000548
PMID:39365124
|
研究论文 | 本文研究了TACE治疗后HBV相关HCC患者的微环境变化及其对预后的影响 | 首次通过单细胞RNA测序分析了TACE治疗后HCC的全球细胞图谱,揭示了TACE诱导的肿瘤异质性和促炎微环境的增强 | 研究样本主要集中在HBV相关HCC患者,结果可能不适用于其他类型的HCC | 探讨TACE治疗后HBV相关HCC患者的微环境变化及其对预后的影响 | HBV相关HCC患者的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 6个新鲜HBV相关HCC样本和757个大规模多中心队列样本 | NA | NA | NA | NA |
| 14271 | 2024-10-10 |
Next-generation spatial transcriptomics: unleashing the power to gear up translational oncology
2024-Oct, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.765
PMID:39376738
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综述 | 本文系统回顾了空间转录组学(ST)技术在转化肿瘤学领域的最新进展和应用 | 本文更新了ST技术的范围,并提出了一个用于ST数据探索的工具箱,特别关注肿瘤微环境中的应用 | 需要实际经验来整合和利用ST工具以实现特定的研究目标 | 探讨空间转录组学在转化肿瘤学中的应用和进展 | 空间转录组学技术及其在肿瘤微环境中的应用 | 数字病理学 | 肿瘤 | 空间转录组学(ST) | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 14272 | 2024-10-10 |
Correction to "Single-cell RNA sequencing of pediatric Hodgkin lymphoma to study the inhibition of T cell subtypes"
2024-Oct, HemaSphere
IF:7.6Q1
DOI:10.1002/hem3.70023
PMID:39380840
|
correction | 对文章“单细胞RNA测序研究儿童霍奇金淋巴瘤中T细胞亚型抑制”的更正 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 14273 | 2024-10-10 |
Clinical cell-surface targets in metastatic and primary solid cancers
2024-Sep-24, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.183674
PMID:39315546
|
研究论文 | 研究了转移性和原发性实体癌中细胞表面靶点的表达情况 | 首次整合了大量RNA-seq和微阵列数据,包括良性样本、原发性肿瘤样本和转移性肿瘤样本,并利用单细胞RNA-seq数据分析了肿瘤的异质性 | 依赖于现有数据集,可能存在数据偏差 | 探讨细胞表面靶点在转移性和原发性实体癌中的表达情况,并评估其在治疗中的潜在应用 | 细胞表面靶点在不同类型癌症中的表达情况 | 数字病理学 | NA | RNA-seq, 微阵列, 单细胞RNA-seq | NA | RNA, 蛋白质 | 7,927个良性样本, 16,866个原发性肿瘤样本, 6,124个转移性肿瘤样本, 36个良性组织, 558个原发性和转移性肿瘤样本, 29个良性组织样本, 1,075个肿瘤样本, 942个细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 14274 | 2024-10-10 |
scDFN: enhancing single-cell RNA-seq clustering with deep fusion networks
2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae486
PMID:39373051
|
研究论文 | 介绍了一种名为scDFN的新型深度学习算法,用于增强单细胞RNA测序数据的聚类效果 | scDFN算法通过融合网络策略,结合自编码器和改进的图自编码器,以及三重自监督策略和四种联合损失函数,显著提升了单细胞RNA测序数据的聚类效果 | NA | 提升单细胞RNA测序数据的聚类效果 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习模型 | 基因表达数据 | 多个数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 14275 | 2024-10-10 |
Single-cell RNA sequencing of pediatric Hodgkin lymphoma to study the inhibition of T cell subtypes
2024-Sep, HemaSphere
IF:7.6Q1
DOI:10.1002/hem3.149
PMID:39233904
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了儿童霍奇金淋巴瘤中的T细胞亚型抑制机制 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术识别了霍奇金和里德-斯特恩伯格细胞中过表达的细胞表面蛋白基因,并发现了潜在的T细胞抑制相互作用 | 研究结果显示患者和肿瘤组织区域之间存在显著的相互作用强度变异性,这可能影响治疗效果 | 旨在通过单细胞RNA测序技术识别儿童霍奇金淋巴瘤中的新治疗靶点 | 儿童经典霍奇金淋巴瘤中的霍奇金和里德-斯特恩伯格细胞及其周围的免疫细胞 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个儿童霍奇金淋巴瘤患者的肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 14276 | 2024-10-10 |
Engineering Toxoplasma gondii secretion systems for intracellular delivery of multiple large therapeutic proteins to neurons
2024-Aug, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-024-01750-6
PMID:39075233
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研究论文 | 本文研究了利用弓形虫的分泌系统将多种大型治疗性蛋白质递送到神经元中的方法 | 通过工程化弓形虫的内源性分泌系统,实现了将多种大型治疗性蛋白质递送到神经元中的创新方法 | 系统目前存在局限性,需要进一步改进以扩大应用范围 | 探索利用弓形虫分泌系统递送治疗性蛋白质到神经元中的潜力和局限性 | 弓形虫的分泌系统、大型治疗性蛋白质、神经元 | NA | NA | scRNA-seq、荧光报告基因 | NA | 图像、文本 | 小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 14277 | 2024-10-10 |
CCR1 and CCR2 Coexpression on Monocytes Is Nonredundant and Delineates a Distinct Monocyte Subpopulation
2024-07-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2400007
PMID:38829123
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研究论文 | 研究探讨了单核细胞上CCR1和CCR2的共表达及其在炎症中的作用 | 提出CCR1和CCR2的共表达并非冗余,而是标记了一个独特的单核细胞亚群 | NA | 验证CCR1和CCR2在单核细胞上的共表达是否冗余,并探讨其在炎症中的作用 | CCR1、CCR2、CCR3和CCR5受体及其在单核细胞上的表达 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠单核细胞亚群 | NA | NA | NA | NA |
| 14278 | 2024-10-10 |
A novel sorting method for the enrichment of early human spermatocytes from clinical biopsies
2024-May, F&S science
DOI:10.1016/j.xfss.2024.02.002
PMID:38369016
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研究论文 | 本文介绍了一种利用荧光激活细胞分选(FACS)从人类睾丸活检中富集早期精母细胞的新方法 | 首次使用TSP50和SWI5-dependent homologous recombination repair protein 1作为表面标记物,通过FACS成功富集早期精母细胞 | 研究样本量较小,仅涉及三名患者 | 确定是否可以通过FACS从人类睾丸活检中富集早期精母细胞 | 早期精母细胞 | NA | NA | 荧光激活细胞分选(FACS) | NA | 单细胞RNA测序数据 | 三名患有阻塞性无精症的男性(年龄范围30-40岁) | NA | NA | NA | NA |
| 14279 | 2024-10-10 |
A Strategy to Compare Single-Cell RNA Sequencing Data Sets Provides Phenotypic Insight into Cellular Heterogeneity Underlying Biological Similarities and Differences Between Samples
2024, Bioinformatics and biology insights
IF:2.3Q3
DOI:10.1177/11779322241280866
PMID:39376245
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scCompare的计算管道,用于比较单细胞RNA测序数据集,以评估样本间的生物相似性和差异 | scCompare通过相关性映射将已知数据集的表型身份转移到另一个数据集,并使用统计学方法确定表型包容性的下限,有助于检测潜在的新细胞类型 | NA | 开发一种方法来评估单细胞RNA测序数据集之间的生物相似性和差异 | 单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自人类外周血单核细胞和心肌细胞的数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 14280 | 2024-10-10 |
Integrated multi-omics profiling reveals the ZZZ3/CD70 axis is a super-enhancer-driven regulator of diffuse large B-cell lymphoma cell-natural killer cell interactions
2024, Experimental biology and medicine (Maywood, N.J.)
DOI:10.3389/ebm.2024.10155
PMID:39376717
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研究论文 | 研究探讨了超级增强子调控弥漫性大B细胞淋巴瘤细胞与肿瘤浸润免疫细胞相互作用的机制 | 首次揭示了ZZZ3/CD70轴通过超级增强子调控弥漫性大B细胞淋巴瘤细胞与自然杀伤细胞相互作用 | 研究主要基于体外实验和数据分析,缺乏体内实验验证 | 探究超级增强子调控弥漫性大B细胞淋巴瘤细胞与肿瘤浸润免疫细胞相互作用的机制 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤细胞与肿瘤浸润免疫细胞的相互作用 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、H3K27ac ChIP-seq | NA | 基因表达数据 | 来自Heidelberg Open Research Data数据库和Gene Expression Omnibus数据库的数据 | NA | NA | NA | NA |