单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
14201	2024-08-07	Classes and continua of hippocampal CA1 inhibitory neurons revealed by single-cell transcriptomics 2018-06, PLoS biology IF:7.8Q1 DOI:10.1371/journal.pbio.2006387 PMID:29912866	研究论文	研究通过单细胞转录组学分析了海马CA1区抑制性神经元的多样性	揭示了10个主要的GABA能神经元群和49个细粒度集群，并发现连续变异在描述这些细胞多样性中的重要性	研究仅限于海马CA1区的抑制性神经元，未涵盖其他脑区或神经元类型	探索海马CA1区抑制性神经元的分类及其多样性	海马CA1区的抑制性神经元	神经科学	NA	单细胞转录组学	NA	转录组数据	3,663个CA1区抑制性细胞
14202	2024-08-07	Establishment of mouse expanded potential stem cells 2017-10-19, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/nature24052 PMID:29019987	研究论文	本文报道了从单个八细胞胚胎卵裂球中建立扩展潜能干细胞的方法，并通过直接转换小鼠胚胎干细胞和诱导多能干细胞实现	扩展潜能干细胞能够同时贡献于胚胎本身和滋养层谱系，并能直接在体外衍生出真正的滋养层干细胞系和胚外内胚层干细胞	NA	展示建立扩展潜能干细胞的可行性，并探讨其在其他哺乳动物中的应用	小鼠扩展潜能干细胞的建立及其特性	干细胞研究	NA	DNA甲基化分析，单细胞转录组分析	NA	DNA甲基化数据，转录组数据	单个八细胞胚胎卵裂球
14203	2024-08-04	scRNA-seq analysis of cells comprising the amphioxus notochord 2024-Apr, Developmental biology IF:2.5Q2 DOI:10.1016/j.ydbio.2024.01.003 PMID:38224933	研究论文	本研究使用单细胞RNA测序分析了含有鳃索的头索动物细胞的特性	本研究首次探讨了头索动物鳃索细胞的单细胞特性，揭示了其在脊索发育中的潜在作用	单细胞水平的特性分析仍然在某些细胞群体中存在不足，可能需要进一步的研究	阐明头索动物鳃索细胞的特性和其在脊索发展中的功能	研究对象为头索动物的鳃索细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA数据	NA
14204	2024-08-07	Neoadjuvant chemotherapy-induced remodeling of human hormonal receptor-positive breast cancer revealed by single-cell RNA sequencing 2024-Mar-31, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2024.216656 PMID:38266804	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和多重免疫荧光染色分析，探讨了新辅助化疗对人类激素受体阳性乳腺癌免疫微环境的重塑作用	发现了新辅助化疗后增加的先前未被识别的免疫细胞亚群，并验证了它们的抗肿瘤功能，同时识别了化疗耐药癌细胞的新基因组和转录模式	NA	探索化疗耐药机制及化疗如何重塑激素受体阳性乳腺癌的免疫微环境	激素受体阳性乳腺癌样本（新辅助化疗前后的配对样本）	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	配对的新辅助化疗前后的激素受体阳性乳腺癌样本
14205	2024-08-04	Single-cell RNA sequencing reveals epithelial cells driving brain metastasis in lung adenocarcinoma 2024-Mar-15, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2024.109258 PMID:38433899	研究论文	本文通过单细胞RNA测序分析了肺腺癌脑转移的上皮细胞角色	发现了一种与脑转移相关的上皮细胞群体，这些细胞在脑转移中发挥重要作用	缺乏直接证据证明脑转移病灶与淋巴结转移病灶之间的关联	阐明肺腺癌脑转移的细胞起源及其驱动因素	主要研究肺腺癌、脑转移和淋巴结转移样本中的细胞组成	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序	NA	样本	涉及的样本包括初级肺腺癌、脑转移和淋巴结转移样本
14206	2024-08-04	Targeting ERBB2 and PIK3R1 as a therapeutic strategy for dilated cardiomyopathy: A single-cell sequencing and mendelian randomization analysis 2024-Mar-15, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e25572 PMID:38434379	研究论文	这篇文章探讨了靶向ERBB2和PIK3R1作为扩张型心肌病的治疗策略。	文章创新地结合了单细胞测序和孟德尔随机化分析来识别药物可治疗的基因。	文章未能找到ERBB2的药物激动剂，并且对PIK3R1和心力衰竭的因果关系的探讨有限。	本研究旨在识别并验证扩张型心肌病中药物可治疗的基因，并分析其与心力衰竭的因果关系。	研究对象是扩张型心肌病中与心力衰竭相关的基因。	数字病理学	心血管疾病	单细胞测序	NA	基因表达数据	四个微阵列表达谱数据集
14207	2024-08-07	Bioinformatics analysis of MMP14+ myeloid cells affecting endothelial-mesenchymal transformation and immune microenvironment in glioma 2024-Mar-15, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e26859 PMID:38434278	研究论文	本研究通过生物信息学分析探讨了MMP14+髓系细胞在胶质瘤中影响内皮间质转化和免疫微环境的作用	识别MMP14为独立的预后标志物，并发现其通过CCL信号通路介导免疫抑制，为胶质瘤治疗提供了新的策略	NA	探讨MMP14+髓系细胞在胶质瘤中的作用及其对治疗策略的影响	MMP14+髓系细胞在胶质瘤中的功能及其对内皮间质转化和免疫微环境的影响	数字病理学	脑瘤	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA	收集了六个批量RNA数据集和一个单细胞RNA测序数据集
14208	2024-08-04	Shotgun lipidomics of human subretinal fluids under rod-dominant retina reveals cone-dominated lipids 2024-Mar, Experimental eye research IF:3.0Q1 DOI:10.1016/j.exer.2024.109807 PMID:38278468	研究论文	本研究利用质谱技术分析视网膜脱离患者的次视网膜液体脂质组成	首次揭示在杆细胞主导的视网膜下，锥细胞主导的脂质在次视网膜液体中的存在	样本量仅限于两位患者，可能影响结果的普遍性	探究次视网膜液体中脂质的组成及其潜在生理意义	研究了来自两位视网膜脱离患者的次视网膜液体样本	数字病理学	视网膜疾病	质谱法	NA	生物分子数据	2个样本来自2位患者
14209	2024-08-04	The detection of Gper1 as an important gene promoting jawbone regeneration in the context of estrogen deficiency 2024-03, Bone IF:3.5Q2 DOI:10.1016/j.bone.2023.116990 PMID:38141748	研究论文	本研究揭示了Gper1在雌激素缺乏背景下促进下颌骨再生的重要性	探讨了Gper1如何通过cAMP/PKA/pCREB信号通路促进下颌骨再生	研究主要基于动物模型，临床应用的相关性尚需进一步验证	研究雌激素缺乏条件下维持骨再生的机制	分析接受拔牙手术的女性患者及雌激素缺乏的大鼠模型	数字病理学	NA	单细胞测序、定量PCR、免疫组织化学等	NA	临床病例数据及动物实验数据	1102名女性患者及雌激素缺乏的大鼠模型
14210	2024-08-07	Allosteric inhibitor of SHP2 enhances macrophage endocytosis and bacteria elimination by increasing caveolae activation and protects against bacterial sepsis 2024-Mar, Pharmacological research IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.phrs.2024.107096 PMID:38320736	研究论文	本文研究了SHP2别构抑制剂通过增强巨噬细胞的胞吞作用和细菌清除能力，从而保护机体免受细菌性脓毒症的影响	发现SHP2别构抑制剂能有效维持巨噬细胞中Cav-1的磷酸化，增强其胞吞作用和细菌清除能力	NA	探讨SHP2别构抑制剂在细菌性脓毒症中的治疗潜力	巨噬细胞的胞吞作用和细菌清除能力	NA	细菌性脓毒症	单细胞RNA测序和批量RNA测序	NA	RNA	NA
14211	2024-08-07	IFN-γ decreases PD-1 in T lymphocytes from convalescent COVID-19 patients via the AKT/GSK3β signaling pathway 2024-02-29, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-55191-6 PMID:38424104	研究论文	本文研究了康复期COVID-19患者中IFN-γ通过AKT/GSK3β信号通路降低T淋巴细胞PD-1表达的现象	首次揭示了IFN-γ通过AKT/GSK3β信号通路调控康复期COVID-19患者CD8 T细胞PD-1表达的机制	NA	探讨康复期COVID-19患者免疫状态异常的原因	康复期COVID-19患者的T淋巴细胞和免疫分子	免疫学	COVID-19	scRNA-seq	NA	细胞和蛋白质表达数据	康复期COVID-19患者的CD8 T细胞和血浆样本
14212	2024-08-07	Integrated meta-omics reveals the regulatory landscape involved in lipid metabolism between pig breeds 2024-Feb-20, Microbiome IF:13.8Q1 DOI:10.1186/s40168-023-01743-3 PMID:38374121	研究论文	本文通过综合代谢组学和宏基因组学方法，揭示了不同猪品种间脂质代谢调控的分子机制	首次系统地研究了不同猪品种间脂质代谢的细胞和分子机制，为改善动物生产和人类疾病提供了新的视角	NA	探究不同猪品种间脂质代谢的调控机制	猪的空肠、结肠、肝脏和背最长肌组织的细胞类型	代谢组学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	两品种猪的多个组织样本
14213	2024-08-07	Mef2c regulates bone mass through Sost-dependent and -independent mechanisms 2024-02, Bone IF:3.5Q2 DOI:10.1016/j.bone.2023.116976 PMID:38042445	研究论文	本文研究了转录因子Mef2c通过Sost依赖和非依赖机制调节骨量的作用	发现了Mef2c通过Sost以外的机制调节骨量，并识别了新的Mef2c转录靶点	NA	识别Mef2c在骨代谢中的新转录靶点	Mef2c在骨形成中的作用及其转录靶点	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	Mef2c; Dmp1-Cre和Mef2c; Bglap-Cre小鼠的股骨细胞亚群
14214	2024-08-07	Single-cell analysis of MYD88L265P and MYD88WT Waldenström macroglobulinemia patients 2024-Feb, HemaSphere IF:7.6Q1 DOI:10.1002/hem3.27 PMID:38435423	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析了MYD88L265P和MYD88WT基因型的瓦尔登斯特伦巨球蛋白血症患者的CD19阳性细胞，揭示了肿瘤内克隆异质性及其对B细胞组成的潜在影响	首次在单细胞水平上分析了两种不同基因型的瓦尔登斯特伦巨球蛋白血症患者的转录组特征，揭示了患者间的转录组差异和共同特征	研究样本量较小，仅包括五名MYD88L265P基因型和两名MYD88WT基因型患者以及两名健康对照	评估瓦尔登斯特伦巨球蛋白血症中的克隆异质性	MYD88L265P和MYD88WT基因型的瓦尔登斯特伦巨球蛋白血症患者的CD19阳性细胞	数字病理学	瓦尔登斯特伦巨球蛋白血症	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	五名MYD88L265P基因型患者、两名MYD88WT基因型患者和两名健康对照
14215	2024-08-04	Molecular classification of small cell lung cancer subtypes: Characteristics, prognostic factors, and clinical translation 2024-Jan-20, Chinese medical journal IF:7.5Q1 DOI:10.1097/CM9.0000000000002693 PMID:37660289	综述	本文回顾并总结了小细胞肺癌的分子分类特征、预后因素和临床应用。	研究了基于小细胞肺癌的关键转录因子的新兴分子分类，为肿瘤的病理生理学、转移、免疫微环境及获得性治疗抵抗提供了更多信息	NA	探讨小细胞肺癌的分子分类及其临床转化	小细胞肺癌的不同亚型及其特征	数字病理学	肺癌	单细胞测序分析	NA	NA	NA
14216	2024-08-04	Single-cell transcriptomics reveal different maturation stages and sublineage commitment of human thymic invariant natural killer T cells 2024-01-19, Journal of leukocyte biology IF:3.6Q2 DOI:10.1093/jleuko/qiad113 PMID:37742056	研究论文	本研究揭示了人类胸腺不变自然杀伤T细胞不同的成熟阶段和亚谱系承诺	首次定义了人类不变自然杀伤T细胞在胸腺发育过程中的成熟阶段，并评估了亚谱系承诺	研究仅限于从胸腺中提取的细胞，缺乏对外周血中细胞的广泛分析	探讨人类不变自然杀伤T细胞在胸腺发育中的成熟阶段和亚谱系承诺	人类Vα24+Vβ11+不变自然杀伤T细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	从胸腺提取的Vα24+Vβ11+不变自然杀伤T细胞
14217	2024-08-04	Role of immune cells in the pathogenesis of myocarditis 2024-01-19, Journal of leukocyte biology IF:3.6Q2 DOI:10.1093/jleuko/qiad143 PMID:37949833	研究论文	此文章总结了免疫细胞在心肌炎发病机制中的角色	本研究强调了免疫细胞的复杂性和细胞间相互作用对心肌炎病理过程的重要性	目前尚不清楚心肌炎的详细发病机制	探讨免疫细胞在心肌炎发病机制中的作用	研究涉及心肌炎患者及多种动物模型中的免疫细胞	数字病理学	心肌炎	单细胞测序	NA	细胞数据	NA
14218	2024-08-04	Single-cell transcriptomics of Treg reveals hallmarks and trajectories of immunological aging 2024-01-05, Journal of leukocyte biology IF:3.6Q2 DOI:10.1093/jleuko/qiad104 PMID:37675661	研究论文	研究了与年龄相关的免疫衰老对CD4+调节性T细胞的影响	识别了6个转录组特异性克隆的调节性T细胞，并揭示了与衰老相关的特征和变化轨迹	主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类的情况	探讨老化对调节性T细胞的影响以及与免疫衰老相关的机制	小鼠淋巴和脂肪组织来源的调节性T细胞	数字病理学	代谢疾病	单细胞转录组学	NA	细胞	针对3个月、18个月和24个月龄小鼠的调节性T细胞进行分析
14219	2024-08-07	BCG vaccination induces innate immune memory in γδ T cells in humans 2024-01-05, Journal of leukocyte biology IF:3.6Q2 DOI:10.1093/jleuko/qiad103 PMID:37672677	研究论文	本研究探讨了卡介苗（BCG）疫苗是否能在人类γδ T细胞中诱导出训练免疫，从而增强其对异源细菌和真菌感染的交叉保护作用	首次证明了BCG疫苗能在人类γδ T细胞中诱导出训练免疫，增强其对异源细菌和真菌刺激的反应性	NA	确定人类γδ T细胞是否能通过BCG疫苗诱导出训练免疫，从而增强其交叉保护作用	健康人类志愿者的γδ T细胞	免疫学	NA	单细胞RNA测序技术	NA	RNA	健康人类志愿者
14220	2024-08-04	Generating single-cell gene expression profiles for high-resolution spatial transcriptomics based on cell boundary images 2024, GigaByte (Hong Kong, China) DOI:10.46471/gigabyte.110 PMID:38434932	研究论文	本研究介绍了一种更新的软件STCellbin，能够生成高分辨率的单细胞空间基因表达特征	该软件结合了细胞膜/细胞壁染色图像与空间基因表达图，增强了单细胞基因表达轮廓的捕获能力	NA	提升空间转录组学中单细胞基因表达的分析精度	小鼠肝脏和种子数据集的单细胞基因表达轮廓	数字病理学	NA	空间转录组学	NA	图像	多个小鼠肝脏和种子的样本