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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1401 | 2025-10-05 | OPIOID-EXPRESSING B CELLS SILENCE TUMOR-INFILTRATING NOCICEPTOR NEURONS 
          2025-Sep-03, Research square
          
         
          DOI:10.21203/rs.3.rs-7389517/v1
          PMID:40951290
         | 研究论文 | 本研究揭示了阿片类药物通过调节B细胞产生的痛敏肽/孤啡肽(N/OFQ)来影响肿瘤浸润伤害感受神经元活性的新机制 | 首次发现B细胞是N/OFQ的主要来源,并阐明了N/OFQ-OPRL1和CGRP-RAMP1信号通路在调节肿瘤疼痛和抗肿瘤免疫中的相互作用 | 研究主要基于头颈鳞癌和黑色素瘤模型,在其他癌症类型中的普适性需要进一步验证 | 探索癌症疼痛与抗肿瘤免疫之间的分子机制 | 头颈鳞状细胞癌患者、黑色素瘤患者、口腔鳞癌小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 头颈癌, 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 动物模型, 细胞共培养 | 小鼠肿瘤模型 | 基因表达数据, 临床数据, 行为学数据 | 头颈癌患者回顾性分析, 多种小鼠肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 1402 | 2025-10-05 | Integrative genomics elucidates the evolutionary, temporal, and developmental origins of a hydrocephalus risk gene 
          2025-Sep-02, medRxiv : the preprint server for health sciences
          
         
          DOI:10.1101/2025.09.01.25334358
          PMID:40950474
         | 研究论文 | 本研究通过整合基因组学方法揭示了脑积水风险基因MAEL的进化起源、时间表达模式和发育谱系特征 | 首次系统描绘MAEL基因在人类大脑发育过程中的进化起源、时空表达模式,并在人类脑积水组织中直接验证其表达降低 | MAEL基因在常用模式生物中序列同源性低,限制了体外和体内机制研究的适用性 | 阐明MAEL基因在脑积水和发育中人类大脑中的进化、时间、发育和谱系表达特征 | 人类大脑组织,包括发育中大脑和脑积水患者手术获取的皮质组织 | 基因组学 | 脑积水 | 单细胞RNA测序,整合基因组学分析 | NA | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | 49个大脑区域的单细胞RNA测序数据,加上手术获取的脑积水原代皮质组织 | Allen Institute | 单细胞RNA测序 | NA | 发育中人类大脑图谱的单细胞RNA测序数据 | 
| 1403 | 2025-10-05 | Exploring mechanisms of britannin against colorectal cancer based on experimentally validated network pharmacology 
          2025-Sep, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
          
         
          DOI:10.1007/s00210-025-03995-2
          PMID:40080155
         | 研究论文 | 本研究通过实验验证的网络药理学方法探讨了旋覆花素对结直肠癌的作用机制 | 首次结合网络药理学和单细胞RNA测序技术系统研究旋覆花素的抗结直肠癌机制,并发现其对巨噬细胞极化的调控作用 | 研究机制尚未完全阐明,需要进一步验证具体分子靶点 | 探索旋覆花素治疗结直肠癌的作用机制 | 结直肠癌细胞和肿瘤微环境 | 网络药理学 | 结直肠癌 | 网络药理学,单细胞RNA测序,CIBERSORT分析,体外实验,体内实验 | NA | 基因表达数据,实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 1404 | 2025-10-05 | Mapping molecular landscapes in triple-negative breast cancer: insights from spatial transcriptomics 
          2025-Sep, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
          
         
          DOI:10.1007/s00210-025-04057-3
          PMID:40119898
         | 综述 | 本文综述了空间转录组学在三阴性乳腺癌肿瘤微环境研究中的应用与进展 | 整合空间转录组学与蛋白质组学、成像质谱流式技术,结合AI进行空间分析,推动精准医疗和生物标志物发现 | 需要进一步发展ST技术、计算工具和多中心合作才能将空间转录组学整合到临床常规实践中 | 探讨空间转录组学在三阴性乳腺癌研究中的应用价值 | 三阴性乳腺癌的肿瘤微环境 | 空间转录组学 | 三阴性乳腺癌 | 空间转录组学 | AI-based spatial analysis | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA | 
| 1405 | 2025-10-05 | Anti-Peptidylarginine Deiminase 4 Autoantibodies Derived From Patients With Rheumatoid Arthritis Exert Pathogenic Effects by Activating Monocytes and Exacerbating Inflammatory Arthritis 
          2025-Sep, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
          
         
          DOI:10.1002/art.43168
          PMID:40176290
         | 研究论文 | 本研究揭示了类风湿关节炎患者来源的抗PAD4自身抗体通过激活单核细胞和加剧炎症性关节炎的致病机制 | 首次证明抗PAD4抗体可直接结合单核细胞并触发炎症级联反应,促进T细胞活化和滑膜成纤维细胞炎症表型 | 研究主要基于胶原诱导性关节炎小鼠模型和体外细胞培养,需要进一步验证在人类患者中的直接病理机制 | 阐明抗PAD4自身抗体在类风湿关节炎发病机制中的具体作用 | 类风湿关节炎患者、胶原诱导性关节炎小鼠模型、人类单核细胞和滑膜成纤维细胞 | 免疫学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序、体外细胞培养、流式细胞术 | 胶原诱导性关节炎小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据、细胞表型数据 | 未明确说明具体样本数量,涉及患者来源的抗体、小鼠模型和人类细胞培养 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 1406 | 2025-10-05 | Single-cell epigenetics and multiomics analysis in kidney research 
          2025-Sep, Clinical and experimental nephrology
          
          IF:2.2Q2
          
         
          DOI:10.1007/s10157-025-02679-8
          PMID:40281349
         | 综述 | 概述单细胞分析技术,重点关注新兴表观基因组学和多组学方法及其在肾脏研究中的应用 | 整合表观基因组与转录组的单细胞多组学分析,揭示驱动细胞异质性的基因调控机制 | NA | 促进肾脏疾病新型生物标志物和治疗靶点的发现及临床转化 | 健康与疾病状态下的肾脏细胞 | 生物信息学 | 肾脏疾病 | 单细胞测序技术 | NA | 表观基因组数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞表观基因组学, 单细胞多组学 | NA | NA | 
| 1407 | 2025-10-05 | Colorectal Liver Metastasis Pathomics Model: Integrating Single-Cell and Spatial Transcriptome Analysis With Pathomics for Predicting Liver Metastasis in Colorectal Cancer 
          2025-Sep, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
          
          IF:7.1Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.modpat.2025.100805
          PMID:40473111
         | 研究论文 | 本研究开发了一种结直肠癌肝转移病理组学模型,通过整合单细胞转录组、空间转录组分析和病理组学来预测结直肠癌肝转移风险 | 首次通过整合单细胞RNA测序和空间转录组分析识别出肝转移触发恶性细胞,并开发了基于弱监督学习的深度学习模型预测肝转移风险 | 模型在外部验证集表现存在差异(AUC 0.72-0.89),需要进一步验证和优化 | 提高结直肠癌肝转移风险的识别和预测能力 | 结直肠癌患者 | 数字病理 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组分析, 批量RNA测序 | ResNet18, 一类逻辑回归算法 | 全切片图像, 转录组数据 | 癌症基因组图谱-结直肠癌组织学图像内部测试集及两个外部独立验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA | 
| 1408 | 2025-10-05 | High-Dimensional Analysis of Type 2 Lymphocyte Dynamics During Mepolizumab or Dupilumab Treatment in Severe Asthma 
          2025-Sep, Allergy
          
          IF:12.6Q1
          
         
          DOI:10.1111/all.16633
          PMID:40566935
         | 研究论文 | 本研究通过高维流式细胞术分析美泊利单抗和度普利尤单抗治疗对重症哮喘患者2型淋巴细胞的影响 | 首次系统揭示美泊利单抗通过改变2型淋巴细胞的组织归巢受体表达和细胞因子产生能力来减轻气道炎症的新机制 | 样本量较小(特别是度普利尤单抗组仅7例),单细胞RNA测序样本量有限(n=3) | 探究2型生物制剂对重症哮喘患者循环淋巴细胞的影响机制 | 40例重症哮喘患者的外周血单个核细胞 | 免疫学 | 哮喘 | 高参数流式细胞术, 单细胞RNA测序, 细胞刺激实验 | NA | 流式细胞数据, 单细胞转录组数据 | 40例患者(美泊利单抗33例,度普利尤单抗7例),治疗前及治疗后4、12个月采样 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 1409 | 2025-10-05 | Epithelial Lining Fluid Cystatin SN is a Noninvasive Biomarker for Predicting Type 2 Chronic Rhinosinusitis 
          2025-Sep, Allergy
          
          IF:12.6Q1
          
         
          DOI:10.1111/all.16652
          PMID:40689541
         | 研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现ELF中cystatin SN可作为预测2型慢性鼻窦炎的非侵入性生物标志物 | 首次发现cystatin SN在2型慢性鼻窦炎上皮细胞中特异性表达,并验证其在ELF中的诊断价值 | 样本来源和规模可能限制结果的普适性,需要更大规模研究验证 | 识别2型慢性鼻窦炎的非侵入性生物标志物以实现个体化治疗 | 慢性鼻窦炎患者和对照个体的鼻组织和上皮衬液样本 | 生物医学研究 | 慢性鼻窦炎 | 单细胞RNA测序, Luminex多重分析, 酶联免疫吸附试验, 免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据, 蛋白质浓度数据, 临床评分数据 | 慢性鼻窦炎患者和对照个体(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 1410 | 2025-10-05 | Dopaminergic short axon cells integrate sensory and top-down inputs to enhance discriminative learning in the mouse olfactory bulb 
          2025-Sep, PLoS biology
          
          IF:7.8Q1
          
         
          DOI:10.1371/journal.pbio.3003375
          PMID:40956809
         | 研究论文 | 本研究揭示了多巴胺能短轴细胞在小鼠嗅球中整合感觉和自上而下输入以增强辨别学习的神经机制 | 发现SACs通过突触和结构可塑性实现基于气味效价的感觉输入调节,并确定胆碱能输入作为效价依赖信号调节SAC活动 | 研究局限于小鼠嗅球系统,机制在其他感觉系统中的普适性仍需验证 | 探索辨别学习中增强感觉表征的神经机制 | 小鼠嗅球中的多巴胺能短轴细胞(SACs) | 神经科学 | NA | 光学成像、空间转录组学、电子显微镜 | NA | 图像、转录组数据、显微结构数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA | 
| 1411 | 2025-10-05 | Single-cell sequencing analysis reveals the promotion of ELR CXCL genes on angiogenesis and the influence on malignant progression in glioblastoma 
          2025-Sep-01, Journal of clinical biochemistry and nutrition
          
          IF:2.0Q3
          
         
          DOI:10.3164/jcbn.25-26
          PMID:40963732
         | 研究论文 | 通过单细胞测序分析揭示ELR CXCL基因在胶质母细胞瘤中促进血管生成并影响恶性进展的作用机制 | 首次在胶质母细胞瘤中鉴定出癌症相关骨髓源性巨噬细胞亚群,并发现其特异性高表达ELR CXCL基因(特别是CXCL3)通过促进血管生成驱动肿瘤恶性进展 | 研究主要基于公共数据库数据,实验验证仍需进一步扩展;细胞亚群功能机制研究深度有限 | 探究胶质母细胞瘤微环境中髓系细胞亚群的异质性及其在肿瘤恶性进展中的作用 | 胶质母细胞瘤组织样本和细胞系 | 单细胞生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 血管生成实验, CCK-8, 集落形成实验, Transwell实验, 流式细胞术 | NA | 单细胞基因表达数据, 实验数据 | 来自GEO数据库的胶质母细胞瘤单细胞测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | 
| 1412 | 2025-10-05 | Enhanced hematopoietic stem cell self-renewal and engraftment through human lung exosomal communication 
          2025-Aug-11, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
          
          IF:12.1Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.ymthe.2025.08.020
          PMID:40798884
         | 研究论文 | 本研究通过单细胞外泌体追踪分析发现肺细胞通过外泌体通讯显著增强造血干细胞自我更新和移植能力 | 首次揭示肺细胞通过外泌体通讯调节造血干细胞稳态的新机制,突破了传统认为造血干细胞稳态仅受骨髓微环境调控的认知 | 研究主要基于实验条件,在临床转化应用中仍需进一步验证 | 探究肺细胞通过外泌体通讯对造血干细胞功能的调控机制 | 造血干细胞,特别是长期造血干细胞 | 单细胞生物学 | 镰状细胞病,骨髓衰竭 | 单细胞RNA测序,外泌体microRNA分析,蛋白质组学 | 单细胞外泌体追踪流程 | 单细胞RNA测序数据,miRNA数据,蛋白质数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq,外泌体分析 | NA | NA | 
| 1413 | 2025-10-05 | Overexpression of high affinity Type I adenosine receptors promotes the growth of uterine leiomyomas 
          2025-Jul-03, Molecular human reproduction
          
          IF:3.6Q1
          
         
          DOI:10.1093/molehr/gaaf025
          PMID:40489662
         | 研究论文 | 本研究探讨I型腺苷受体(ADORA1)过表达在子宫肌瘤生长中的作用机制 | 首次发现ADORA1受体在子宫肌瘤中的过表达现象,并阐明其通过调控AKT1信号通路促进肿瘤生长的机制 | 研究样本来源未明确说明具体数量,机制研究主要基于体外实验 | 探究细胞外腺苷水平改变促进子宫肌瘤生长的分子机制 | 子宫肌瘤组织标本和原代培养细胞 | 分子病理学 | 子宫肌瘤 | RT-qPCR, western blot, 免疫组织化学, 单细胞转录组学, siRNA干扰 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA | 
| 1414 | 2025-10-05 | The immune checkpoint regulator CD40 potentiates myocardial inflammation 
          2025-Apr, Nature cardiovascular research
          
          IF:9.4Q1
          
         
          DOI:10.1038/s44161-025-00633-1
          PMID:40217124
         | 研究论文 | 本研究揭示CD40激动剂通过激活CCR2巨噬细胞和招募效应记忆CD8 T细胞重塑心脏免疫环境,促进心肌炎症 | 首次发现CD40激动剂通过CCR2巨噬细胞与CD8 T细胞间的IL-12b/TNF/IFNγ信号正反馈环路驱动心肌炎症 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 探究CD40激动剂诱发心肌炎症的潜在机制 | 遗传工程小鼠模型的心脏免疫细胞 | 免疫学 | 心血管疾病 | 单细胞测序,细胞清除研究 | 遗传小鼠模型 | 基因表达数据,细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 1415 | 2025-10-05 | Dnmt3a-mediated hypermethylation of FoxO3 promotes redox imbalance during osteoclastogenesis 
          2025-Mar-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
          
          IF:9.4Q1
          
         
          DOI:10.1073/pnas.2418023122
          PMID:40106360
         | 研究论文 | 本研究揭示了Dnmt3a介导的FoxO3启动子高甲基化通过促进氧化还原失衡影响破骨细胞生成的新机制 | 首次发现Dnmt3a通过调控FoxO3启动子甲基化影响破骨细胞生成,而非通过RANK-TRAF6解离途径 | NA | 探究FoxO3在破骨细胞生成和骨质疏松中的作用机制 | 人股骨头组织、Lysm-Cre;FoxO3 OVX小鼠模型 | 表观遗传学 | 骨质疏松 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA | 
| 1416 | 2025-10-05 | Single Cell Transcriptome Signatures of Sarcoidosis in Lung Immune Cell Populations 
          2025-Jan-22, bioRxiv : the preprint server for biology
          
         
          DOI:10.1101/2025.01.20.633917
          PMID:39896662
         | 研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析肺结节病患者支气管肺泡灌洗细胞中的免疫细胞组成、基因表达模式和细胞间相互作用 | 首次在肺结节病中系统鉴定五种巨噬细胞亚群并揭示其特异性基因表达谱和细胞间通讯变化 | 样本量相对有限(16例患者和14例对照),且仅基于支气管肺泡灌洗细胞分析 | 识别与肺结节病风险和进展相关的细胞特异性分子变化 | 肺结节病患者(包括进展性和非进展性)和健康对照者的支气管肺泡灌洗细胞 | 单细胞组学 | 肺结节病 | 单细胞RNA测序 | Seurat聚类分析,CellChat细胞通讯分析 | 单细胞转录组数据 | 16例肺结节病患者(8例进展性,8例非进展性)和14例健康对照 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | CellRanger预处理流程 | 
| 1417 | 2025-10-05 | HMG Box-containing Protein 1 (HBP1) Protects Against Pancreatic Injury in Acute Pancreatitis but Promotes Neoplastic Progression 
          2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
          
          IF:7.1Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101536
          PMID:40404099
         | 研究论文 | 本研究探讨HBP1在急性胰腺炎和胰腺肿瘤进展中的双重作用 | 首次揭示HBP1在胰腺炎中具有保护作用但在KRAS突变背景下促进肿瘤进展的双重功能 | 研究主要基于动物模型和细胞实验,需要更多临床验证 | 阐明HBP1在胰腺炎发生和胰腺肿瘤进展中的功能作用 | 人类胰腺炎样本、小鼠模型、人胰腺导管上皮细胞 | 分子病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学、多重蛋白检测、组织学分析、免疫染色 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、组织图像、蛋白质数据 | 人类胰腺炎样本和多种基因工程小鼠模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA | 
| 1418 | 2025-10-05 | Malignant epithelia cells-derived spermine induces APOE+ macrophages to suppress tumor immunity in adenocarcinoma of the esophagogastric junction 
          2025, Frontiers in medicine
          
          IF:3.1Q1
          
         
          DOI:10.3389/fmed.2025.1636699
          PMID:40963562
         | 研究论文 | 本研究揭示了食管胃结合部腺癌中恶性上皮细胞通过精胺诱导APOE+巨噬细胞抑制肿瘤免疫的机制 | 首次发现AEG特异性恶性亚型通过谷氨酰胺-精氨酸-精胺代谢轴驱动肿瘤免疫抑制,阐明精胺-STAT3-APOE轴在代谢-免疫串扰中的作用 | 样本量相对有限(单细胞RNA测序11例,空间转录组4例),需要更大规模验证 | 探究食管胃结合部腺癌进展机制,特别是代谢重编程与免疫微环境的相互作用 | 食管胃结合部腺癌患者的肿瘤组织和配对癌旁正常组织 | 数字病理学 | 食管胃结合部腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 代谢组学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 代谢组数据 | 单细胞RNA测序11例, 空间转录组4例, 代谢组分析26例 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA | 
| 1419 | 2025-10-05 | Machine learning-based integration develops an immune-derived signature for diagnosing high-altitude pulmonary hypertension 
          2025, Frontiers in medicine
          
          IF:3.1Q1
          
         
          DOI:10.3389/fmed.2025.1603140
          PMID:40963580
         | 研究论文 | 本研究通过整合多组学数据和机器学习方法,开发了一种基于免疫特征的诊断模型用于高原性肺动脉高压 | 首次采用单细胞RNA测序、批量RNA测序和蛋白质组学的多组学整合方法,结合机器学习算法筛选出六基因诊断特征 | 样本量相对有限,外部验证队列的AUC值(0.773)低于训练队列(0.995) | 开发高原性肺动脉高压的微创血液诊断方法 | 高原性肺动脉高压患者和对照组的血液样本 | 机器学习 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,蛋白质组学,定量PCR | 随机森林 | 基因表达数据,蛋白质数据 | 单细胞RNA测序10例,批量RNA测序126例,蛋白质组学42例,训练队列55例,验证队列71例 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,蛋白质组学 | NA | NA | 
| 1420 | 2025-10-05 | A machine learning-derived immune-related prognostic model identifies PLXNA3 as a functional risk gene in colorectal cancer 
          2025, Frontiers in immunology
          
          IF:5.7Q1
          
         
          DOI:10.3389/fimmu.2025.1653794
          PMID:40963600
         | 研究论文 | 本研究通过机器学习构建了结直肠癌免疫相关预后模型,并鉴定PLXNA3为关键风险基因 | 整合100多种机器学习算法构建预后模型,首次系统揭示PLXNA3在结直肠癌中的免疫相关功能 | NA | 开发结直肠癌预后生物标志物并探索其生物学功能 | 结直肠癌患者转录组和临床数据 | 机器学习 | 结直肠癌 | 转录组测序, 空间转录组学, 单细胞转录组学, 免疫组化 | LASSO, CoxBoost, StepCox | 转录组数据, 临床数据 | TCGA和GEO队列数据 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |