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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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1401 | 2025-10-05 |
Revealing key regulatory factors in lung adenocarcinoma: the role of epigenetic regulation of autophagy-related genes from transcriptomics, scRNA-seq, and machine learning
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1542338
PMID:40832611
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研究论文 | 本研究通过转录组学、单细胞RNA测序和机器学习方法,揭示了肺腺癌中自噬相关基因的表观遗传调控机制 | 首次系统研究表观遗传-自噬基因在肺腺癌肿瘤微环境中的作用,并鉴定出KDM6B和KANSL1作为新的诊断标志物 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证相对有限,需要进一步的功能机制研究 | 探索肺腺癌中表观遗传调控的自噬相关基因在肿瘤免疫微环境中的作用机制 | 肺腺癌组织和相关免疫细胞 | 生物信息学, 机器学习 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 实时PCR, Western blot | 机器学习算法 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
1402 | 2025-10-05 |
Integrative analysis of lactylation related genes in prostate cancer: unveiling heterogeneity through single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq and machine learning
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1634985
PMID:40832598
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序、批量RNA测序和机器学习方法,系统分析前列腺癌中乳酸化相关基因的作用 | 首次在前列腺癌中整合单细胞和批量RNA测序数据系统研究乳酸化相关基因,并开发了基于机器学习的预后预测模型 | 研究依赖于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 系统研究乳酸化相关基因在前列腺癌中的作用及其预后价值 | 前列腺癌患者 | 机器学习 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 机器学习 | 整合机器学习技术 | RNA测序数据 | 来自TCGA-PRAD、GSE116918和GSE54460数据库的前列腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
1403 | 2025-10-05 |
SPOCK1 promotes the progression of breast cancer by modulating cancer-associated fibroblasts and exerts a synergistic effect with ANXA2
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1619171
PMID:40837013
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研究论文 | 本研究通过多组学分析系统探索了SPOCK1在乳腺癌中的表达模式、预后意义及其通过调控癌症相关成纤维细胞促进乳腺癌进展的机制 | 首次系统揭示SPOCK1通过调控癌症相关成纤维细胞促进乳腺癌进展的机制,并发现其与ANXA2的协同作用 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,需要进一步的功能验证实验 | 探索SPOCK1在乳腺癌中的表达模式、预后意义及其在肿瘤微环境中的作用机制 | 乳腺癌组织样本和细胞系 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 多重免疫组织化学, 转录组分析, 基因组分析 | NA | 转录组数据, 基因组数据, 临床数据, 单细胞测序数据 | TCGA和GEO数据库中的乳腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序, 多重免疫组织化学, 批量RNA测序 | NA | NA |
1404 | 2025-10-05 |
Is postoperative cognitive dysfunction a disease of microglial inflammatory memory? A state-transition model from metabolic stress to epigenetic lock-in
2025, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2025.1648161
PMID:40843245
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综述 | 提出术后认知功能障碍是由小胶质细胞炎症记忆驱动的状态转换模型 | 将POCD重新定义为小胶质细胞命运转换而非短暂免疫反应,提出线粒体功能障碍-染色质重塑-持续极化的闭环炎症记忆回路 | 理论模型尚未通过实验完全验证,需要时间分辨的单细胞技术进一步证实 | 阐明术后认知功能障碍的持续性和机制 | 小胶质细胞炎症记忆和表观遗传机制 | 神经科学 | 术后认知功能障碍 | 时间分辨单细胞转录组学、染色质可及性分析 | 状态转换模型 | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1405 | 2025-10-05 |
Integrated multi-omics profiling of immune microenvironment and drug resistance signatures for precision prognosis in prostate cancer
2025, Cancer drug resistance (Alhambra, Calif.)
DOI:10.20517/cdr.2025.47
PMID:40843359
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研究论文 | 本研究开发了一个以前列腺癌肿瘤微环境为中心的预后模型,整合多组学数据揭示免疫异质性、基因组不稳定性与治疗耐药性的关联 | 首次将肿瘤微环境动态、基因组不稳定性和药物耐药异质性整合到前列腺癌预后模型中,并通过单细胞RNA测序揭示亚型特异性耐药模式 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,需要进一步的前瞻性临床验证 | 开发基于肿瘤微环境的精准预后模型,指导前列腺癌个体化治疗 | 前列腺癌患者和癌细胞系 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序,多组学数据分析,LASSO回归,CIBERSORT,ESTIMATE,WGCNA | LASSO回归模型 | 转录组数据,基因组数据 | 554个TCGA-PRAD样本和329个外部验证样本,835个前列腺癌细胞 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
1406 | 2025-10-05 |
Pathophysiological Insights Into the Role of Osteoclasts in Osteoarthritis: Mechanisms, Therapeutic Targets, and Future Directions
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S525245
PMID:40851840
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综述 | 本文探讨骨关节炎中破骨细胞的病理生理作用机制及靶向治疗前景 | 整合单细胞RNA测序与传统方法从时空维度研究破骨细胞基因表达模式,探索新型治疗靶点 | 未涉及具体临床实验数据验证 | 填补骨关节炎治疗知识空白并推动创新疗法发展 | 骨关节炎中的破骨细胞 | 骨生物学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1407 | 2025-10-05 |
Comprehensive Insights Into the Role of TRPM4 in Pan-Cancer Progression and Immune Regulation
2025, ImmunoTargets and therapy
IF:6.2Q1
DOI:10.2147/ITT.S542176
PMID:40860345
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研究论文 | 本研究通过多组学数据分析探讨TRPM4在泛癌进展和免疫调控中的作用 | 首次系统性分析TRPM4在泛癌中的表达模式及其与免疫浸润和免疫治疗反应的关系 | 样本量有限,特别是验证实验仅涉及19例肺腺癌患者 | 研究TRPM4在泛癌进展和免疫调控中的作用 | 多种癌症类型(泛癌分析),重点验证乳腺癌、肺腺癌和食管癌 | 生物信息学 | 泛癌分析 | RNA测序,单细胞RNA测序,免疫组织化学,多重免疫荧光,体外实验 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据,免疫细胞浸润数据 | TCGA和GTEx数据库的泛癌数据,19例肺腺癌患者组织样本 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
1408 | 2025-10-05 |
smartSim: simulation of splice aware single cell smart-seq3 data
2025, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbaf183
PMID:40861396
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研究论文 | 开发了一个用于模拟Smart-seq3单细胞RNA测序数据的仿真工具smartSim | 首个专门针对Smart-seq3协议设计的读段模拟器,能够模拟已知和新的剪接事件,生成包含UMI和内部读段的真实数据 | 基于经验数据分布模拟,可能无法完全覆盖所有真实实验变异 | 为单细胞RNA测序中的剪接分析和异构体重建计算工具提供基准测试资源 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 测序读段 | NA | NA | single-cell RNA-seq | Smart-seq3 | Smart-seq3全长单细胞RNA测序协议 |
1409 | 2025-10-05 |
Construction of thyroid cancer classification and iodine metabolism related diagnostic model using thyroid differentiation score and bioinformation
2024-Sep-06, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000039464
PMID:39252309
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研究论文 | 构建基于甲状腺分化评分和生物信息学的甲状腺癌分类及碘代谢相关诊断模型 | 首次结合甲状腺分化评分与碘代谢特征构建甲状腺癌诊断模型,识别出5个独立预测基因 | 模型验证主要依赖公共数据库数据,需要进一步临床前瞻性研究验证 | 开发甲状腺癌亚型分类诊断模型以提高诊疗准确性 | 甲状腺癌患者基因表达数据和临床病理信息 | 生物信息学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 机器学习 | 逻辑回归模型, 机器学习模型 | 基因表达谱, 临床数据, 单细胞测序数据 | 来自TCGA和GEO数据库的甲状腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
1410 | 2025-10-05 |
Human Pancreatic α-Cell Heterogeneity and Trajectory Inference Analysis Using Integrated Single Cell- and Single Nucleus-RNA Sequencing Platforms
2023-Nov-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.19.567715
PMID:38014078
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研究论文 | 通过整合单细胞和单核RNA测序技术研究人类胰腺α细胞异质性及其与β细胞的相互转化轨迹 | 首次发现人类胰腺α细胞存在五个不同亚群,并揭示了α-β细胞双向转化的潜在轨迹和特征基因 | 研究主要基于体外胰岛和胰岛移植物,未完全模拟体内自然环境 | 探索人类胰腺α细胞异质性及其在2型糖尿病中与β细胞的相互转化机制 | 人类胰岛细胞(来自非糖尿病供体和2型糖尿病患者)及人类胰岛移植物 | 单细胞生物学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 轨迹推断分析, RNA速率分析 | 轨迹推断模型, PAGA分析 | 单细胞转录组数据, 单核转录组数据 | 人类胰岛样本(来自非糖尿病供体和2型糖尿病患者)及人类胰岛移植物样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | NA |
1411 | 2025-10-05 |
Neuroimmune integration in chronic stress: mechanisms of TRPV1-CB2 crosstalk, inflammation, and neural resilience
2025-Oct-15, Brain research
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.brainres.2025.149826
PMID:40645538
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综述 | 本文综述了慢性压力下神经免疫整合机制,重点关注TRPV1-CB2受体串扰、神经炎症和神经韧性 | 提出神经免疫整合模型,整合TRPV1和CB2受体动态、神经炎症级联和氧化应激特征,采用CRISPR-Cas9基因编辑和单细胞RNA测序等前沿技术 | 分子网络间复杂串扰及先进疗法获取不平等限制了临床转化 | 阐明慢性压力下神经免疫整合机制并开发神经保护治疗策略 | 神经免疫系统、分子信号通路、受体动力学 | 神经科学 | 精神神经疾病 | CRISPR-Cas9基因编辑, 单细胞RNA测序 | 神经免疫整合模型 | 分子信号数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1412 | 2025-10-05 |
Single-cell transcriptome analysis reveals dysregulation of microglial iron homeostasis in temporal lobe epilepsy
2025-Oct-15, Brain research
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.brainres.2025.149885
PMID:40803604
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示颞叶癫痫中小胶质细胞铁稳态失调的关键作用 | 首次在颞叶癫痫中发现具有铁积累和神经炎症特征的独特小胶质细胞表型,该表型与癫痫发作频率正相关 | NA | 研究小胶质细胞在铁代谢和神经炎症中的作用及其与颞叶癫痫发病机制的关系 | 颞叶癫痫患者的脑组织样本 | 数字病理学 | 颞叶癫痫 | 单细胞/单核RNA测序,免疫组织化学,多重免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据,基因表达数据,免疫组织化学图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1413 | 2025-10-05 |
Unveiling Moxibustion's Impact on AD Mice Learning and Memory: Role of Mitochondrial Respiratory Chain Complex I Subunit in the Hippocampus
2025-Oct, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-05147-2
PMID:40531365
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研究论文 | 本研究探讨艾灸通过调节海马线粒体呼吸链复合物I改善阿尔茨海默病小鼠学习记忆能力的机制 | 首次结合空间转录组学、生化检测和电镜技术系统揭示艾灸通过调节呼吸链复合物I改善AD能量代谢的分子机制 | 研究仅使用APP/PS1小鼠模型,尚未在人类患者中验证 | 探究艾灸改善阿尔茨海默病认知功能障碍的作用机制 | APP/PS1转基因阿尔茨海默病模型小鼠 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学, 生化检测, 透射电镜 | 动物模型 | 基因表达数据, 生化指标, 超微结构图像 | APP/PS1小鼠样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
1414 | 2025-10-05 |
Single-Cell Sequencing Screening of Biomarkers Associated with Lipophagy in the MPTP Model Mice of Parkinson's Disease
2025-Oct, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-05014-0
PMID:40537664
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研究论文 | 通过单细胞测序筛选与帕金森病MPTP模型小鼠脂噬相关的生物标志物 | 首次在帕金森病模型中系统研究脂噬相关生物标志物,发现Ubb、Gapdh、Cox4i1和Hsp90aa1四个关键生物标志物 | 样本量较小(每组3只小鼠),仅使用MPTP模型,未在人类样本中验证 | 探索脂噬在帕金森病发病机制中的作用及相关生物标志物 | MPTP诱导的帕金森病模型小鼠脑组织 | 单细胞生物学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | 细胞聚类分析、差异表达分析、细胞通讯分析 | 单细胞转录组数据 | 6只小鼠(3只PD模型,3只对照组) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1415 | 2025-10-05 |
Single-Cell Transcriptome Patterns of Transposable Elements in Alzheimer's Disease
2025-Oct, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-05140-9
PMID:40537665
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研究论文 | 本研究通过单核RNA测序分析阿尔茨海默病患者前额叶皮层样本,揭示了不同脑细胞类型中转座元件转录本的表达模式 | 首次在单细胞水平系统性地揭示了阿尔茨海默病中不同脑细胞类型的转座元件转录本表达动态 | 研究主要基于前额叶皮层样本,其他脑区的情况尚需进一步验证 | 探究阿尔茨海默病中不同脑细胞类型的转座元件转录本表达模式 | 阿尔茨海默病患者前额叶皮层细胞 | 单细胞转录组学 | 阿尔茨海默病 | 单核RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据 | 143,951个细胞 | NA | 单核RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
1416 | 2025-10-05 |
The brainstem BBSome regulates glucose homeostasis and lean mass in a state-dependent manner
2025-Oct, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2025.102222
PMID:40744313
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研究论文 | 本研究探讨了脑干纤毛和BBSome蛋白复合体在能量平衡和葡萄糖稳态调节中的作用 | 首次揭示脑干BBSome通过自主神经平衡调节葡萄糖稳态和瘦体重的状态依赖性机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类相关性尚需验证 | 研究脑干纤毛和BBSome在能量平衡和葡萄糖稳态调节中的功能 | Phox2b神经元特异性敲除Ift88或Bbs1的小鼠模型 | 神经代谢研究 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光, 共聚焦成像, 病毒技术, 神经记录 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 代谢参数, 神经活动记录 | 未明确样本数量的小鼠实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1417 | 2025-10-05 |
Effects of β-catenin deficiency on adipose tissue physiology
2025-Oct, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2025.102226
PMID:40759324
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研究论文 | 本研究探讨β-连环蛋白缺失对脂肪组织基因表达和细胞间通讯的影响 | 首次揭示脂肪细胞β-连环蛋白缺失通过细胞外囊泡和内皮细胞补偿机制维持组织稳态的性别特异性效应 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类样本验证 | 探究脂肪细胞Wnt/β-连环蛋白信号通路在脂肪组织生理调控中的作用机制 | 脂肪细胞特异性β-连环蛋白基因敲除小鼠(Ctnnb1AdKO) | 分子生物学 | 代谢性疾病 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 细胞外囊泡分离 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 代谢表型数据 | 未明确样本数量的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
1418 | 2025-10-05 |
Regulating the cell differentiation trajectory of progenitor cells in adipose tissue fibrosis
2025-Oct, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2025.102231
PMID:40780446
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研究论文 | 本研究通过基因敲除小鼠模型探索了基质Gla蛋白在白色脂肪组织纤维化中对祖细胞分化轨迹的调控作用 | 发现Mgp缺失会促使脂肪祖细胞从正常的成脂分化转向促纤维化分化,并鉴定出两个新的脂肪来源干细胞群体ASC1和ASC4 | 研究主要基于小鼠模型,在人类中的适用性需要进一步验证 | 阐明MGP在白色脂肪组织纤维化过程中的作用机制 | 基因敲除小鼠模型和脂肪祖细胞 | 细胞生物学 | 代谢性疾病 | 单细胞RNA测序,基因敲除,信号通路研究 | NA | 基因表达数据,表型数据 | 基因敲除小鼠模型 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
1419 | 2025-10-05 |
Penthorum chinense Pursh extract ameliorates lupus nephritis disease in MRL/lpr mice via the PPARγ/NFκB signaling axis
2025-Sep-25, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2025.120379
PMID:40780476
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研究论文 | 本研究探讨了Penthorum chinense Pursh提取物通过PPARγ/NFκB信号轴改善狼疮性肾炎的机制 | 首次揭示PGF通过调节巨噬细胞PPARγ/NFκB信号轴改善狼疮性肾炎的作用机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞实验,尚未进行人体临床试验 | 评估Penthorum chinense Pursh提取物对狼疮性肾炎的治疗作用及机制 | MRL/lpr小鼠模型、Raw264.7巨噬细胞和HK2细胞 | 生物医学研究 | 狼疮性肾炎 | UPLC-Q-TOF/MS, 转录组学, 代谢组学, 单细胞RNA测序, 蛋白质印迹, 双荧光素酶报告基因检测, RT-qPCR | 动物疾病模型 | 分子生物学数据, 组学数据, 病理学数据 | MRL/lpr小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组学, 代谢组学 | NA | NA |
1420 | 2025-10-05 |
Transcriptomic bioinformatics analysis proposes a novel BCL2-MAPK14-TXN oxidative stress diagnostic model of sepsis and identifies TXN as an oxidative stress-related signature gene in sepsis
2025-Sep-23, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115016
PMID:40540896
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析提出了一个新型的BCL2-MAPK14-TXN氧化应激诊断模型用于脓毒症诊断,并确定TXN为脓毒症中氧化应激相关特征基因 | 首次提出BCL2-MAPK14-TXN诊断模型,并通过实验初步验证TXN在脓毒症氧化应激中的作用 | 需要进一步实验验证以促进临床应用 | 筛选脓毒症氧化应激相关基因并验证其诊断价值 | 脓毒症患者基因表达数据 | 生物信息学 | 脓毒症 | 微阵列分析,单细胞RNA测序,机器学习算法 | 机器学习算法,诊断列线图 | 基因表达数据 | 来自四个GEO数据集(GSE65682, GSE95233, GSE131761, GSE33118)和单细胞RNA测序数据集(GSE175453) | NCBI | 微阵列,单细胞RNA测序 | GEO数据库 | NCBI基因表达综合数据库 |