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当前共找到 37326 篇文献,本页显示第 1401 - 1420 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1401 2026-02-26
Integrated single-cell and spatial transcriptomics reveal the differentiation drivers of gastric epithelial lineage progression
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示了胃癌发展过程中胃上皮谱系分化的驱动因素,特别是UPP1在连接幽门螺杆菌驱动的炎症与WNT介导的分化中的关键作用 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学,系统描绘了从慢性胃炎到肠化生再到胃癌的谱系进展,并识别出UPP1作为上皮重编程和肠化生的关键调节因子 研究样本可能有限,且机制验证主要在细胞系和类器官中进行,需进一步在体内模型中确认 阐明胃癌发展过程中分子介导因子,特别是炎症与恶性转化之间的关联 胃黏膜样本,包括萎缩性胃炎、肠化生和胃癌病例,涵盖幽门螺杆菌阳性和阴性情况 数字病理学 胃癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA RNA测序数据, 空间转录组数据 来自萎缩性胃炎、肠化生和胃癌的胃黏膜样本,包括幽门螺杆菌阳性和阴性病例 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1402 2026-02-26
Identification of Monocyte CD11c as a Potential Biomarker for Distinguishing Sepsis From Non-Infectious Inflammation and Predicting the Outcome of Sepsis
2026, Journal of inflammation research IF:4.2Q2
研究论文 本研究探讨了单核细胞CD11c作为区分脓毒症与非感染性炎症及预测脓毒症预后的潜在生物标志物 首次通过CyTOF、单细胞RNA测序和流式细胞术多技术结合,验证了mCD11c在脓毒症诊断和预后中的优越性能,其AUC值(0.939)显著优于传统标志物 研究为单中心观察性队列,样本量有限,需更大规模的多中心研究验证结果并探索干预潜力 评估mCD11c作为脓毒症诊断和预后生物标志物的有效性 脓毒症患者、轻度感染患者、心血管手术后患者、康复脓毒症患者及健康对照者 数字病理学 脓毒症 CyTOF, 单细胞RNA测序, 流式细胞术 NA 外周血样本 发现队列和验证队列(具体人数未明确) NA 单细胞RNA-seq NA NA
1403 2026-02-26
Innovative approaches targeting innate immune cells to promote organ transplant tolerance
2026, Frontiers in transplantation
综述 本文综述了针对先天免疫细胞以促进器官移植耐受的创新策略 提出了通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示先天免疫细胞异质性,并基于此开发选择性调节先天免疫反应而不损害整体免疫力的精准疗法 NA 探讨在最小化全身免疫抑制的同时实现长期移植物存活的策略 先天免疫细胞(包括中性粒细胞、单核细胞、巨噬细胞、树突状细胞、髓源性抑制细胞、先天淋巴样细胞、自然杀伤细胞和γδ T细胞) NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学, CRISPR/Cas9基因编辑 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1404 2026-02-26
Single-cell RNA sequencing and integrated bioinformatics reveal new mitochondrial biomarkers in sarcopenia
2026, Frontiers in molecular biosciences IF:3.9Q2
研究论文 本研究通过整合分析公共转录组数据集和单细胞RNA测序,发现了一个与线粒体功能相关的三基因标志物(CHCHD10、SAMM50、MDH2),可作为肌少症的早期诊断生物标志物 首次通过整合多组学数据和机器学习方法,鉴定出一个在多个独立队列中保守的、与线粒体功能障碍相关的三基因标志物,并构建了具有高诊断准确性的列线图预测模型 研究主要基于公共数据集进行生物信息学分析,尽管进行了体外验证,但缺乏大规模临床队列的直接验证 发现肌少症的早期诊断生物标志物 肌少症患者及对照的转录组数据、C2C12成肌细胞 生物信息学 老年疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、差异基因表达分析、加权基因共表达网络分析(WGCNA)、机器学习、定量PCR 列线图预测模型 转录组数据、单细胞RNA测序数据 多个公共数据集(GSE1428, GSE117525, GSE167186, GSE111006, GSE111010, GSE111016),具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
1405 2026-02-26
Integrative Multi-Omics Identifies S100A4 as a Translational Hub Linking Environmental Bis(2-Ethylhexyl) Phthalate (DEHP) Exposure to Glioblastoma Risk
2026, Mediators of inflammation IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过整合多组学计算框架,揭示了环境污染物DEHP通过S100A4蛋白及脂质代谢轴影响胶质母细胞瘤风险的潜在机制 首次整合网络毒理学、单细胞转录组学、全蛋白质组/代谢组孟德尔随机化及分子动力学模拟,系统性地将环境毒物DEHP暴露与胶质母细胞瘤风险联系起来,并识别出S100A4作为关键翻译枢纽 所提出的机制联系仍为推断性,需要未来体外和体内实验直接验证DEHP对S100A4表达、功能及下游代谢重编程的影响 系统研究环境污染物DEHP与胶质母细胞瘤风险之间的相互作用机制 胶质母细胞瘤(GBM)、环境污染物双(2-乙基己基)邻苯二甲酸酯(DEHP) 计算生物学、生物信息学 胶质母细胞瘤 网络毒理学、单细胞转录组学、孟德尔随机化、分子动力学模拟 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析、分子对接、分子动力学模拟 基因组、转录组、蛋白质组、代谢组数据 来自TCGA、GTEx、GEO等11个独立队列的数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1406 2026-02-26
Single-cell RNA sequencing informs precision targeting of monogenic lupus associated with IKZF1 haploinsufficiency
2025-Dec-15, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序探究了IKZF1单倍体不足驱动的单基因狼疮患者的免疫失调机制 首次利用单细胞RNA测序结合生物信息学分析,揭示了IKZF1单倍体不足患者中B细胞和T细胞的异常分化轨迹及IFN-JAK-STAT信号通路过度激活 研究仅基于一名儿科患者,样本量较小,可能限制结果的普遍性 探究单基因狼疮(IKZF1单倍体不足)的免疫失调机制,以指导精准靶向治疗 IKZF1单倍体不足的儿科狼疮患者、无已知基因突变的狼疮病例及健康对照者的外周免疫细胞 数字病理学 狼疮 单细胞RNA测序 伪时间轨迹分析、加权基因共表达网络分析(WGCNA) 单细胞RNA测序数据 一名IKZF1单倍体不足患者、多例无已知基因突变的狼疮病例及健康对照者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1407 2026-02-26
The SWI/SNF chromatin-remodeling subunit DPF2 regulates macrophage inflammation in intestinal injury via the CACNA1D-mediated MAPK pathway
2025-Nov-18, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究揭示了染色质重塑亚基DPF2通过调控CACNA1D介导的MAPK通路,在巨噬细胞炎症反应和肠道损伤修复中的关键作用 首次发现DPF2缺失通过改变组蛋白修饰(H3K27ac和H3K4me1)调控CACNA1D表达,进而影响细胞内钙水平和MAPK信号通路,最终调节巨噬细胞的炎症极化 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床样本验证的规模可能有限,且具体调控机制中涉及的转录因子或其他共调节因子尚未完全阐明 探究DPF2在肠道损伤中调控巨噬细胞炎症反应和肠道再生的分子机制 巨噬细胞、肠道组织、临床炎症性肠病(IBD)样本、患者来源的类器官 单细胞组学与空间转录组学 炎症性肠病(IBD) 单细胞RNA测序、空间转录组学、小鼠遗传学、类器官培养 NA 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据、临床样本数据 未明确具体样本数量,但涉及小鼠模型、临床IBD样本和患者来源类器官 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1408 2026-02-26
Four Decades of Inquiry Into the Genetic Bases of Specific Reading Disability
2025-Nov-11, Journal of speech, language, and hearing research : JSLHR
研究论文 本研究通过系统梳理过去四十年中与特定阅读障碍相关的候选基因,分析其进化保守性、发育表达模式和功能网络,以揭示阅读障碍的遗传基础 挑战了存在阅读特异性基因的观念,提出特定阅读障碍反映了古老进化神经机制在人类特有大脑结构中的破坏,并识别了发育表达转换和功能网络 基于文献综述和生物信息学分析,缺乏实验验证,且样本数据主要来自公共数据库,可能受限于数据覆盖范围 探究特定阅读障碍的遗传基础,填补阅读能力遗传结构理解的知识空白 175个与特定阅读障碍及阅读相关过程相关的候选基因 自然语言处理 特定阅读障碍 生物信息学分析,包括进化保守性分析、发育转录组分析和单细胞转录组分析 NA 基因表达数据、转录组数据 NA Allen Brain Atlas 单细胞RNA-seq,发育转录组学 NA Allen Brain Atlas的发育和单细胞转录组数据集
1409 2026-02-26
Decoding Alzheimer's Disease: Single-Cell Sequencing Uncovers Brain Cell Heterogeneity and Pathogenesis
2025-Nov, Molecular neurobiology IF:4.6Q1
综述 本文系统总结了单细胞转录组学和表观基因组学方法在阿尔茨海默病研究中的应用,重点阐述了细胞类型和亚型特异性转录组改变的特征 整合单细胞RNA测序、ATAC测序和空间转录组学技术,揭示了疾病轨迹和跨病理阶段的细胞通讯网络,为精准医学提供了新见解 本文为综述文章,未报告原始实验数据,其总结依赖于现有研究的发现和局限性 增强对阿尔茨海默病发病机制的理解,并为通过识别新的治疗靶点和生物标志物实现精准医学铺平道路 阿尔茨海默病患者的大脑细胞 数字病理学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), 转座酶可及染色质测序 (ATAC-seq), 空间转录组学 NA 转录组数据, 表观基因组数据, 空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 NA NA
1410 2026-02-26
Leveraging RNA-seq deconvolution to improve complex in vitro model characterization
2025-09, The Journal of biological chemistry IF:4.0Q2
研究论文 本文评估了利用RNA-seq反卷积技术,结合公开单细胞RNA-seq数据集,从复杂体外模型的bulk RNA-seq数据预测细胞比例,以改进这些模型的表征 首次将RNA-seq反卷积技术应用于复杂体外模型(如肠道类器官和睾丸模型)的细胞组成分析,并评估了单细胞数据插补方法对反卷积准确性的提升效果 反卷积方法的准确性在不同分析中差异显著,且依赖于公开单细胞数据集的可用性和质量 开发新方法以表征复杂体外模型,用于毒理学和药物开发 基于干细胞的人肠道类器官CIVM和新生啮齿动物睾丸CIVM 生物信息学 NA RNA-seq, 单细胞RNA-seq 反卷积模型 bulk RNA-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
1411 2026-02-26
Cathepsin K as a key regulator of myocardial fibrosis in dilated cardiomyopathy and a promising therapeutic target
2025-08, The Journal of biological chemistry IF:4.0Q2
研究论文 本研究通过整合加权基因共表达网络分析和单细胞RNA测序,揭示了组织蛋白酶K在扩张型心肌病心肌纤维化中的关键调控作用 首次通过单细胞RNA测序技术鉴定出CTSK在心脏成纤维细胞中的特异性表达,并证实其通过PDGF-BB通路调控细胞增殖而非TGF-β1诱导的转分化 CTSK敲低仅抑制PDGF-BB诱导的增殖,对TGF-β1诱导的肌成纤维细胞转分化无影响,其具体调控机制仍需进一步研究 探究扩张型心肌病中心肌纤维化的关键调控因子及潜在治疗靶点 扩张型心肌病患者心脏组织及体外培养的人心脏成纤维细胞 心血管疾病研究 扩张型心肌病 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, 免疫荧光染色, Masson三色染色 NA 基因表达数据, 组织图像 未明确样本数量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1412 2026-02-26
Genetic deficiency of EXOSC10 ribonuclease disrupts spermatogenesis and male fertility in mice
2025-07, The Journal of biological chemistry IF:4.0Q2
研究论文 本研究探讨了EXOSC10核糖核酸酶在小鼠雄性生殖细胞减数分裂中的关键作用,揭示其缺失导致精子发生障碍和雄性不育 首次在雄性生殖细胞中系统研究EXOSC10的功能,通过条件性敲除模型结合单细胞RNA测序技术,阐明其在减数分裂转录组调控中的新机制 研究仅限于小鼠模型,人类中的功能保守性尚未验证;单细胞测序样本量相对有限 探究EXOSC10核糖核酸酶在雄性生殖细胞减数分裂调控中的作用机制 小鼠雄性生殖细胞(特别是减数分裂前生殖细胞和精母细胞) 生殖生物学 男性不育症 条件性基因敲除、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、转录组分析 基因敲除小鼠模型 单细胞转录组数据 未明确说明具体样本数量,但涉及条件性敲除小鼠的生殖细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1413 2026-02-26
Endothelial Cell Phenotypic Plasticity in Cardiovascular Physiology and Disease: Mechanisms and Therapeutic Prospects
2025-Jun-16, American journal of hypertension IF:3.2Q2
综述 本文综述了内皮细胞在心血管生理和疾病中的表型可塑性,包括其机制、在疾病进展中的作用以及潜在的治疗前景 系统总结了内皮细胞向间充质、造血、成骨及免疫细胞样等多种表型转化的机制,并探讨了利用单细胞测序等新兴技术揭示其异质性的最新进展,以及通过内皮重编程等策略进行靶向治疗的新方向 本文是一篇综述,主要基于现有文献进行总结和分析,未报告新的原始实验数据或进行直接的机制验证 阐明内皮细胞的异质性和表型可塑性在心血管生理和疾病中的作用机制,并探索基于此的靶向治疗策略 内皮细胞及其在心血管系统中的表型转化 心血管疾病 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1414 2026-02-26
A tumor necrosis factor-α-responsive cryptic promoter drives overexpression of the human endogenous retrovirus ERVK-7
2025-06, The Journal of biological chemistry IF:4.0Q2
研究论文 本研究揭示了内源性逆转录病毒ERVK-7在肺腺癌中通过肿瘤坏死因子-α响应的隐蔽启动子驱动的过表达机制 发现了ERVK-7的两个新型转录本(ERVK-7.long和ERVK-7.short),并阐明了它们由不同上游启动子驱动、受炎症信号通路差异调控的机制 研究主要聚焦于肺腺癌,对其他癌症类型中ERVK-7的调控机制探讨有限 探究内源性逆转录病毒ERVK-7在肺腺癌中的表达调控机制及其临床意义 人类内源性逆转录病毒ERVK-7及其在肺腺癌中的转录调控 表观遗传学 肺腺癌 单细胞转录组测序、表观遗传图谱分析 NA RNA-seq数据、表观遗传数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1415 2026-02-26
NOTCH2 disrupts the synovial fibroblast identity and the inflammatory response of epiphyseal chondrocytes
2025-06, The Journal of biological chemistry IF:4.0Q2
研究论文 本研究探讨NOTCH2信号在小鼠骨骺软骨细胞中对转录组和细胞群体的影响,特别是在炎症反应和骨关节炎发病机制中的作用 通过NOTCH2功能获得性突变和条件性模型,结合bulk RNA-Seq和scRNA-Seq分析,揭示了NOTCH2如何增强炎症通路并破坏关节滑膜成纤维细胞的转录组特性 研究主要基于小鼠模型,可能无法完全反映人类骨关节炎的复杂性,且样本来源和实验条件存在一定限制 探究NOTCH2信号如何调控骨骺软骨细胞的转录组和细胞群体,以理解其在骨关节炎发病机制中的作用 小鼠骨骺软骨细胞,包括NOTCH2功能获得性突变模型和条件性表达NICD2的模型 单细胞组学 骨关节炎 bulk RNA-Seq, 单细胞RNA-Seq (scRNA-Seq) NA RNA序列数据 来自NOTCH2功能获得性突变小鼠和R26-NICD2小鼠的原代骨骺细胞 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
1416 2026-02-26
A comparison of integration methods for single-cell RNA sequencing data and ATAC sequencing data
2025-Jun, Quantitative biology (Beijing, China)
综述 本文系统回顾并评估了超过10种流行的单细胞RNA测序和ATAC测序数据整合方法 强调在生物学相关粒度上进行数据整合的重要性,并考虑不同模态间的固有差异以平衡生物学发现与噪声去除 讨论了这些整合方法的数据偏好、局限性、应用挑战及未来方向 比较和评估单细胞多模态数据整合方法,以解决细胞间对应关系识别这一挑战性任务 单细胞RNA测序数据和ATAC测序数据 单细胞组学 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA 单细胞多模态数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA NA
1417 2026-02-26
Tumor cell villages define the co-dependency of tumor and microenvironment in liver cancer
2025-Mar-12, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过空间单细胞成像和单细胞RNA测序分析肝癌样本,揭示了肿瘤细胞村庄及其与微环境的共依赖性对肿瘤异质性和患者预后的影响 开发了一种基于深度学习的空间动态网络策略,首次将肿瘤细胞状态组织成村庄概念,并展示了其与微环境的特异性分子共依赖性 研究样本量有限(50个肿瘤生物样本),且主要聚焦于肝癌,可能不适用于其他癌症类型 探究肿瘤空间景观的形成机制及其对肿瘤适应性的影响 肝癌肿瘤细胞及其微环境 数字病理学 肝癌 空间单细胞成像,单细胞RNA测序 深度学习 图像,RNA测序数据 超过200万个细胞,来自50个肿瘤生物样本 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
1418 2026-02-26
Single-cell transcriptome analysis profiles cellular dynamics and transcriptional changes in diabetic wound tissues following ESWT treatment
2025, Frontiers in physiology IF:3.2Q2
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,构建了体外冲击波疗法治疗糖尿病伤口组织的细胞图谱,揭示了该疗法促进组织修复的细胞机制 首次在单细胞分辨率下系统描绘了体外冲击波疗法对糖尿病伤口组织的细胞动态和转录重编程影响,并阐明了其通过调节巨噬细胞、成纤维细胞和内皮细胞状态以及增强免疫细胞通讯网络来促进修复的机制 研究主要基于转录组层面的分析,缺乏对蛋白质水平和功能验证的深入探索;样本量相对有限,且为观察性研究,因果关系需进一步验证 探究体外冲击波疗法促进糖尿病伤口愈合的细胞和分子机制 糖尿病伤口组织 数字病理学 糖尿病并发症 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 约39,475个细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1419 2026-02-26
High-resolution single-cell RNA sequencing using canFam4 reveals novel immune subsets and checkpoint programs in healthy dogs
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究利用10x Genomics平台和canFam4基因组,首次构建了健康小型犬外周血白细胞的高分辨率单细胞转录组图谱,揭示了新的免疫亚群和检查点程序 首次使用更新的canFam4基因组进行犬类单细胞RNA测序分析,识别出51个不同的免疫亚群,包括在基于canFam3.1的研究中未被充分代表的多个新亚型,并系统揭示了免疫检查点分子在犬类免疫稳态中的调控机制 研究仅纳入6只健康小型犬,样本量较小,且未涵盖不同品种、年龄或健康状况的犬只,可能限制了结果的普遍性 构建健康犬外周血白细胞的高分辨率单细胞转录组图谱,深入解析犬类免疫系统的异质性和免疫检查点调控机制 6只健康小型犬的外周血白细胞 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 6只健康小型犬,共30,040个高质量转录本 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Genomics单细胞RNA测序平台
1420 2026-01-23
Correction: High-resolution single-cell RNA sequencing using canFam4 reveals novel immune subsets and checkpoint programs in healthy dogs
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
correction 本文是对先前发表的一篇关于使用canFam4进行高分辨率单细胞RNA测序以揭示健康犬类新型免疫亚群和检查点程序的研究文章的更正 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
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