单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1401	2025-05-13	MAP4K4 aggravates microvascular anomalies in diabetic retinopathy in a YTHDF2-dependent manner 2025-Jun, Diabetologia IF:8.4Q1 DOI:10.1007/s00125-025-06398-3 PMID:40072537	research paper	该研究揭示了MAP4K4通过YTHDF2依赖的方式加剧糖尿病视网膜病变中的微血管异常	首次发现MAP4K4通过YTHDF2/MAP4K4/NF-κB轴调控糖尿病视网膜病变的微血管异常，为治疗提供了新靶点	研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，未涉及大规模临床样本验证	探究MAP4K4在糖尿病视网膜病变微血管异常中的作用机制	糖尿病视网膜病变患者的纤维血管膜、db/db小鼠模型和人类原代视网膜内皮细胞	digital pathology	diabetic retinopathy	scRNA-seq	db/db小鼠模型	RNA测序数据、蛋白质表达数据	8例增殖性糖尿病视网膜病变患者的纤维血管膜和11例非糖尿病患者的正常视网膜组织
1402	2025-05-13	Intrapancreatic adipocytes and beta cell dedifferentiation in human type 2 diabetes 2025-Jun, Diabetologia IF:8.4Q1 DOI:10.1007/s00125-025-06392-9 PMID:40072535	研究论文	本研究探讨了胰腺内脂肪沉积与2型糖尿病患者β细胞去分化的空间关系及其机制	首次在人类胰腺中证实脂肪含量与β细胞去分化标志物ALDH1A3表达的正相关性，并揭示脂肪细胞通过免疫微环境促进β细胞功能失调的机制	样本量较小（50例器官捐献者），且仅为观察性研究无法确定因果关系	探究2型糖尿病中胰腺脂肪与胰岛β细胞功能障碍的关联机制	人类胰腺组织（15例2型糖尿病患者 vs 35例非糖尿病患者）	糖尿病研究	2型糖尿病	组织学分析、单细胞RNA-seq生物信息学分析	NA	组织切片图像、单细胞转录组数据	50例器官捐献者胰腺样本（15例糖尿病+35例对照），另分析11例糖尿病单细胞RNA-seq数据
1403	2025-05-13	Understanding Enzalutamide-Resistance Based on a Functional Single-Cell Approach 2025-Jun, The Prostate DOI:10.1002/pros.24895 PMID:40211483	研究论文	通过单细胞RNA测序和功能实验研究前列腺癌细胞对恩杂鲁胺的耐药机制	发现恩杂鲁胺治疗前存在的AR-low细胞亚群在治疗中被选择并扩增，导致耐药性	研究主要基于细胞系和异种移植模型，未涉及临床患者样本	探索前列腺癌细胞对恩杂鲁胺耐药的分子机制	前列腺癌细胞系LNCaP及其亚群	癌症生物学	前列腺癌	单细胞RNA测序(scRNA-Seq), 基因集富集分析(GSEA), 异种移植模型	NA	RNA测序数据	LNCaP细胞系及其亚群
1404	2025-05-13	High-resolution transcriptome analysis on a mouse model of neonatal hypoxic-ischemic encephalopathy using single-nucleus RNA-seq 2025-Jun, Biochemistry and biophysics reports IF:2.3Q3 DOI:10.1016/j.bbrep.2025.102026 PMID:40342532	research paper	该研究利用单核RNA测序技术对新生儿缺氧缺血性脑病小鼠模型进行了高分辨率转录组分析	首次在HIE研究中应用单核RNA测序技术，揭示了海马区神经元群体的显著减少和小胶质细胞的特定激活	研究仅基于小鼠模型，结果可能需要进一步验证才能推广到人类	深入理解新生儿缺氧缺血性脑病的发病机制	新生儿缺氧缺血性脑病小鼠模型	基因组学	新生儿缺氧缺血性脑病	单核RNA测序(snRNA-seq)	小鼠疾病模型	RNA测序数据	NA
1405	2025-05-13	The human endometrium: atlases, models, and prospects 2025-Jun, Current opinion in genetics & development IF:3.7Q2 DOI:10.1016/j.gde.2025.102341 PMID:40154154	综述	本文综述了人类子宫内膜的单细胞转录图谱和模型，探讨了其在研究子宫内膜生物学中的新途径、局限性及未来方向	通过单细胞分析揭示了子宫内膜的多样性和动态性，发现了WNT、NOTCH和TGFβ信号通路的调控作用，并利用先进的体外模型捕捉子宫内膜的细胞异质性和结构	子宫内膜功能障碍的病因学研究不足，影响了有效的诊断和治疗	研究子宫内膜的生物学特性及其功能障碍的机制	人类子宫内膜	生物医学	子宫内膜异位症	单细胞转录组分析	体外模型	转录组数据	NA
1406	2025-05-13	Cyclopamine Attenuates Pulmonary Arterial Hypertension Development: Implications of Hedgehog Signaling Involvement for the Pathophysiology 2025-May-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2 DOI:10.1096/fj.202403350R PMID:40353829	研究论文	探讨环巴明通过抑制Hedgehog信号通路对肺动脉高压（PAH）发展的潜在治疗作用	首次提出环巴明作为Hedgehog信号抑制剂在PAH治疗中的潜在应用，并揭示了其对血管重塑的抑制作用	体外实验显示环巴明对缺氧促进的细胞增殖抑制作用有限，且研究仅基于小鼠模型和人类肺动脉平滑肌细胞	探索PAH的新型治疗方法	C57BL/6J雄性小鼠和人类肺动脉平滑肌细胞（HPASMC）	病理生理学	肺动脉高压	单细胞RNA测序分析，RNA测序分析	动物模型（小鼠）	基因表达数据	小鼠模型和人类肺动脉平滑肌细胞
1407	2025-05-13	Multifaceted profiling of virus-specific CD8 T cells reveals distinct immune signatures against cytomegalovirus infection states during pregnancy 2025-May-16, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2025.112416 PMID:40343282	研究论文	通过MHC-dextramer单细胞RNA测序和流式细胞术，研究了孕妇中针对巨细胞病毒(CMV)不同感染阶段的CD8 T细胞免疫特征	揭示了不同CMV感染阶段CD8 T细胞的表型和抗原识别特征，为评估先天性感染风险提供了新方法	样本量有限，仅针对孕妇群体进行研究	研究孕妇中针对CMV不同感染阶段的细胞免疫特征	孕妇中IE1和pp65 CMV抗原特异性CD8 T细胞	免疫学	巨细胞病毒感染	MHC-dextramer单细胞RNA测序, 流式细胞术	NA	单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据	具有不同抗CMV血清学模式的孕妇样本(包括IgGIgM/AI-low, IgGIgM/AI-high和IgGIgM)
1408	2025-05-13	Sex differences in adenosine deaminase activity associate with disparities in SARS-CoV-2 innate immunity 2025-May-16, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2025.112418 PMID:40343269	research paper	该研究探讨了腺苷脱氨酶（ADA）活性在性别差异中对SARS-CoV-2先天免疫反应的影响	揭示了ADA活性性别差异与hERV和ISG表达的关系，并发现IL-18是性别特异性ADA2表达的驱动因素	研究样本可能不足以代表所有人群，且机制研究仍需进一步验证	探究性别差异在抗病毒先天免疫反应中的机制	健康人群和COVID-19患者的血液和肺部单核细胞群	免疫学	COVID-19	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	健康人群和COVID-19患者队列
1409	2025-05-13	Single-cell RNA sequencing highlights a significant retinal Müller glial population in dry age-related macular degeneration 2025-May-16, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2025.112464 PMID:40343286	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了干性年龄相关性黄斑变性（dAMD）中视网膜Müller胶质细胞的关键作用及其损伤机制	发现了一组高表达Sox2的Müller细胞亚群，这些细胞在AMD小鼠模型和患者中发挥重要稳态和神经保护作用，并首次揭示了铁死亡和凋亡是导致这些细胞损伤的原因	研究主要基于小鼠模型和有限的患者样本，需要在更大规模的人类样本中验证这些发现	解析干性年龄相关性黄斑变性的细胞机制和关键致病通路	干性年龄相关性黄斑变性小鼠模型和患者样本中的视网膜细胞	单细胞组学	年龄相关性黄斑变性	单细胞RNA测序	NA	单细胞转录组数据	AMD小鼠模型和dAMD患者样本（具体数量未明确说明）
1410	2025-05-13	Schwann cells secrete IGFBP5 to facilitate the growth of keloids 2025-May-15, Life sciences IF:5.2Q1 DOI:10.1016/j.lfs.2025.123534 PMID:40049369	研究论文	本研究通过单细胞测序技术探究了瘢痕疙瘩（KD）中雪旺氏细胞及其分泌蛋白IGFBP5的作用机制	首次发现雪旺氏细胞通过分泌IGFBP5蛋白促进瘢痕疙瘩的生长，并揭示了IGFBP5通过p53/p21/Cyclin D1通路调控细胞周期	研究主要基于体外实验和兔耳瘢痕模型，临床转化仍需进一步验证	阐明瘢痕疙瘩病理生长的分子机制	瘢痕疙瘩组织、正常瘢痕组织、雪旺氏细胞、IGFBP5蛋白	分子病理学	皮肤纤维增生性疾病	单细胞测序、重组蛋白功能验证、兔耳瘢痕模型	NA	基因表达数据、蛋白质功能数据	未明确说明样本数量（包含KD和NS组织样本）
1411	2025-05-13	Rescue of naïve porcine circovirus type 3 and its pathogenesis in CD pigs 2025-May-12, Journal of virology IF:4.0Q2 DOI:10.1128/jvi.00341-25 PMID:40353661	研究论文	本研究成功拯救了原始猪圆环病毒3型（PCV3）并研究了其在剖腹产猪（CD猪）中的致病机制	首次通过TEM观察PCV3病毒颗粒，并阐明了其在CD猪中的免疫抑制机制	由于病毒分离失败，PCV3在猪中的致病机制尚未准确阐明	研究PCV3病毒的致病机制及其对免疫系统的影响	原始猪圆环病毒3型（PCV3）和剖腹产猪（CD猪）	病毒学	猪圆环病毒感染	免疫荧光检测（IFA）、Western blotting、透射电子显微镜（TEM）、scRNA-seq	NA	分子生物学数据、细胞学数据、组织病理学数据	剖腹产猪（CD猪）
1412	2025-05-13	Gas Bubbles from Biodegradable Magnesium Implants Convey Mechanical Cues and Promote Immune Cell Stimulation 2025-May-11, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202503123 PMID:40349156	研究论文	研究可降解镁植入物产生的气泡对周围组织和细胞行为的影响	揭示了气泡通过机械信号和炎症途径影响组织愈合的机制	研究仅在大鼠模型中进行，未涉及人类患者	探究镁植入物降解产生的气泡对周围组织的生物学影响	大鼠的软组织和免疫细胞	生物医学工程	NA	空间转录组学	NA	基因表达数据	大鼠模型
1413	2025-05-13	Presbycusis: Pathology, Signal Pathways, and Therapeutic Strategy 2025-May-11, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202410413 PMID:40349177	综述	本文综述了老年性耳聋的病理学、信号通路及治疗策略，特别关注血管纹在老年性耳聋中的关键作用	重点探讨了血管纹在老年性耳聋中的作用，并介绍了单细胞转录组学在该领域的应用	NA	增强对老年性耳聋中血管纹作用的理解，为个性化治疗和预防策略提供依据	老年性耳聋（ARHL）及其相关病理机制	NA	老年性疾病	单细胞转录组学	NA	NA	NA
1414	2025-05-13	Microglial MS4A4A Protects against Epileptic Seizures in Alzheimer's Disease 2025-May-11, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202417733 PMID:40349168	研究论文	本文研究了阿尔茨海默病(AD)中与癫痫发作相关的基因MS4A4A的作用及其机制	首次发现MS4A4A基因缺失会加剧AD模型小鼠的癫痫发作，并阐明其通过调节小胶质细胞吞噬功能发挥保护作用的分子机制	研究主要基于小鼠模型，人类临床应用的转化仍需进一步验证	探索AD相关基因MS4A4A在AD伴发癫痫中的保护作用机制	淀粉样β蛋白驱动的AD小鼠模型和癫痫患者脑组织样本	神经科学	阿尔茨海默病/癫痫	单细胞测序/LNP递送技术	AD小鼠模型	基因表达数据/细胞功能数据	未明确说明具体样本数量，涉及AD小鼠模型和人类癫痫患者脑组织
1415	2025-05-13	Identification of MACF1 as a causative gene of generalised epilepsy 2025-May-11, Journal of medical genetics IF:3.5Q2 DOI:10.1136/jmg-2025-110699 PMID:40350249	研究论文	该研究通过全外显子测序发现MACF1基因是全身性癫痫的潜在致病基因	首次揭示了MACF1基因变异与全身性癫痫的关联，并阐明了不同变异类型的基因型-表型关联	样本量较小（仅10例患者），需要更大规模的验证研究	探索MACF1基因在癫痫和神经发育中的作用	来自中国癫痫基因1.0项目的全身性癫痫患者队列	遗传学	癫痫	全外显子测序、单细胞测序	NA	基因组数据	10例无关患者
1416	2025-05-13	CIEC: Cross-tissue Immune Cell Type Enrichment and Expression Map Visualization for Cancer 2025-May-10, Genomics, proteomics & bioinformatics DOI:10.1093/gpbjnl/qzae067 PMID:39363510	research paper	介绍了一个名为CIEC的基于网络的应用程序，用于跨组织免疫细胞类型或状态的富集分析和基因表达图谱可视化	首个整合数据库和富集分析的网络应用程序，用于估计跨组织免疫细胞类型或状态	样本量相对有限，仅包含323名癌症患者的480个样本	深入理解肿瘤免疫系统中免疫细胞的跨组织特性和功能	癌症患者的免疫细胞	digital pathology	cancer	single-cell transcriptome sequencing	KOBAS algorithm	gene expression data	480 samples from 323 cancer patients
1417	2025-05-13	Diversity and functional specialization of oyster immune cells uncovered by integrative single-cell level investigations 2025-May-09, eLife IF:6.4Q1 DOI:10.7554/eLife.102622 PMID:40343849	研究论文	通过整合单细胞水平的研究揭示了牡蛎免疫细胞的多样性和功能特化	首次广泛表征了牡蛎的多种血细胞，识别出至少七种功能不同的细胞类型和三种造血谱系	需要更深入的软体动物和非模式无脊椎动物细胞免疫学研究	研究牡蛎免疫细胞的多样性和功能特化	太平洋牡蛎的血细胞	生物学	NA	单细胞RNA测序、定量细胞学、细胞分选、功能测定和伪时间分析	NA	单细胞RNA测序数据	NA
1418	2025-05-13	Microvascular immunity is organ-specific and remodeled after kidney injury in mice 2025-May-09, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-025-59609-1 PMID:40346040	研究论文	研究小鼠急性肾损伤前后微血管免疫细胞的表型变化及其在肾脏、肝脏和肺中的独特特征	揭示了微血管作为免疫细胞活动的独特位点，并发现了急性肾损伤后肾脏微血管界面的持续重塑	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体中验证	探究急性肾损伤后微血管免疫细胞的动态变化及其在疾病进展中的作用	小鼠的肾脏、肝脏和肺的微血管免疫细胞	免疫学	急性肾损伤	单细胞测序	NA	单细胞RNA测序数据	小鼠模型
1419	2025-05-13	Identification of programmed cell death-related genes and construction of a prognostic model in oral squamous cell carcinoma using single-cell and transcriptome analysis 2025-May-09, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-02520-4 PMID:40346375	研究论文	通过单细胞和转录组分析，识别程序性细胞死亡相关基因并构建口腔鳞状细胞癌的预后模型	基于程序性细胞死亡相关基因构建了一个新的五基因预后特征，并在单细胞水平上验证了这些基因的表达模式	研究样本量有限，且仅基于公开数据库的回顾性数据	探索程序性细胞死亡相关基因在口腔鳞状细胞癌预后中的作用	口腔鳞状细胞癌患者和健康对照的肿瘤组织和单细胞数据	数字病理	口腔鳞状细胞癌	RNA-seq, 单细胞RNA测序	LASSO, Cox回归	转录组数据, 单细胞数据	341例OSCC肿瘤组织, 31例健康样本, 6例OSCC单细胞样本, 76例验证样本
1420	2025-05-13	Multi-omics integration reveals Vha68-3 as a testicular aging-specific factor that coordinates spermatid elongation through mitochondrial metabolic homeostasis 2025-May-09, Cellular & molecular biology letters IF:9.2Q1 DOI:10.1186/s11658-025-00737-3 PMID:40346547	研究论文	本研究通过多组学整合揭示了Vha68-3作为睾丸衰老特异性因子，通过线粒体代谢稳态协调精子细胞伸长	首次发现Vha68-3在睾丸衰老过程中对精子细胞伸长和线粒体代谢稳态的关键调控作用，并提出了通过饮食补充相关化合物缓解睾丸衰老的潜在治疗策略	研究主要在果蝇模型中进行，尚未在高等哺乳动物中验证	探究睾丸衰老过程中线粒体影响精子发生的分子机制	果蝇睾丸组织	生殖生物学	男性不育	CRISPR/Cas9基因编辑、单细胞RNA测序、转录组-代谢组关联分析、液相色谱-串联质谱	果蝇基因敲除模型	基因表达数据、代谢组数据、蛋白质互作数据	Vha68-3基因敲除果蝇模型