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当前共找到 31780 篇文献,本页显示第 1401 - 1420 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1401 2025-10-05
Multi-omics profiling reveals PLEKHA6 as a modulator of β-catenin signaling and therapeutic vulnerability in lung adenocarcinoma
2025, American journal of cancer research IF:3.6Q2
研究论文 通过多组学分析揭示PLEKHA6作为肺腺癌中β-catenin信号通路调节因子和治疗靶点 首次发现PLEKHA6在肺腺癌中特异性过表达,并系统阐明其通过调控Wnt/β-catenin信号通路、细胞粘附和免疫微环境促进肿瘤进展的机制 研究主要基于A549细胞系,需要在更多细胞系和体内模型中验证;临床转化潜力需进一步评估 探索PLEKHA家族基因在肺腺癌中的作用机制和治疗潜力 肺腺癌组织和A549肺腺癌细胞系 癌症生物学 肺腺癌 多组学分析,包括RNA测序、单细胞RNA测序、DNA甲基化分析和药物基因组学 NA 基因组数据、转录组数据、表观遗传数据、药敏数据 未明确样本数量,但涉及肺腺癌组织和细胞系 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, DNA甲基化分析 NA NA
1402 2025-10-05
Lactylation-driven molecular taxonomy of melanoma: linking epigenetic modifications to immune evasion and clinical outcomes
2025, American journal of cancer research IF:3.6Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和批量转录组分析建立了黑色素瘤的乳酸化驱动分子分类系统,揭示了乳酸化在肿瘤免疫逃逸和临床预后中的作用 首次将乳酸化修饰与黑色素瘤分子分型联系起来,建立了基于六基因乳酸化特征的预后模型,并揭示了其在免疫调节中的新机制 研究主要基于转录组数据,需要进一步实验验证乳酸化修饰的具体分子机制 探索乳酸化修饰在黑色素瘤进展和免疫逃逸中的作用,建立预后预测模型 皮肤黑色素瘤样本 数字病理学 黑色素瘤 单细胞RNA测序, 批量转录组分析, 假时间轨迹分析 预后预测模型 基因表达数据 训练、测试和外部验证队列的黑色素瘤样本 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
1403 2025-10-05
Constructing a ferroptosis-related prognostic model for osteosarcoma based on scRNA-seq dataset and WGCNA analysis
2025, International journal of clinical and experimental pathology IF:1.1Q4
研究论文 本研究基于单细胞RNA测序数据和WGCNA分析构建了骨肉瘤铁死亡相关预后模型 首次结合单细胞RNA测序和WGCNA分析构建骨肉瘤铁死亡相关预后模型 NA 探索铁死亡相关基因在骨肉瘤进展中的作用机制 骨肉瘤 生物信息学 骨肉瘤 单细胞RNA测序, WGCNA分析 预后模型 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1404 2025-10-05
Estimating the effect of tissue- and blood-derived cell reference matrices on deconvolving bulk transcriptomic datasets
2025, Computational and structural biotechnology journal IF:4.4Q2
研究论文 本研究系统评估了组织和血液来源的细胞参考矩阵对解卷积批量转录组数据的影响 首次系统比较组织和血液来源细胞参考矩阵在解卷积性能上的差异,并开发了用于构建用户自定义参考矩阵的R包 研究主要基于炎症性肠病和肺腺癌数据,在其他疾病中的适用性需要进一步验证 评估不同来源细胞参考矩阵对批量转录组数据解卷积准确性的影响 炎症性肠病和肺腺癌的转录组数据 生物信息学 炎症性肠病, 肺腺癌 单细胞RNA测序, 批量转录组测序 细胞解卷积算法 基因表达数据 多个公共数据集和模拟伪批量样本 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
1405 2025-10-05
Identification of key ferroptosis-related genes and therapeutic target in nasopharyngeal carcinoma
2025, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过生物信息学分析鉴定了鼻咽癌中四个关键的铁死亡相关枢纽基因 首次系统性地识别了鼻咽癌中铁死亡相关的枢纽基因,并探索了其作为诊断和治疗靶点的潜力 基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证 识别鼻咽癌中铁死亡相关的治疗靶点并探索其作用机制 鼻咽癌患者基因表达数据 生物信息学 鼻咽癌 单细胞RNA测序, 基因表达分析 机器学习算法, WGCNA 基因表达数据 基于GEO数据库的鼻咽癌数据集 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
1406 2025-10-05
Effect of time-weighted average 25(OH)D on the occurrence of major adverse kidney events in IgA nephropathy-from a 10-year population-based cohort study
2025, Frontiers in nutrition IF:4.0Q2
研究论文 本研究探讨时间加权平均25(OH)D水平对IgA肾病患者主要不良肾脏事件的影响 首次在IgA肾病中评估时间加权平均25(OH)D水平与肾脏预后的关联,并建立基于TWA 25(OH)D的风险预测模型 观察性研究设计无法确定因果关系,样本量相对有限 评估维生素D水平与IgA肾病进展的关系及补充治疗的疗效 866例IgA肾病患者 肾脏病学 IgA肾病 Kaplan-Meier生存分析, ROC曲线, 多元逻辑回归分析, 单细胞RNA测序, 分子对接分析 Cox回归模型, 风险预测模型 临床数据, 基因组数据, 单细胞测序数据 866例患者,中位随访4.3年 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1407 2025-10-05
Host Circulating Immunometabolism-Associated Biomarkers for Early Diagnosis of Active Tuberculosis: Multi-Omics Screening with Experimental Validation
2025, Journal of inflammation research IF:4.2Q2
研究论文 通过多组学筛选和实验验证发现免疫代谢相关基因作为活动性结核病的早期诊断生物标志物 首次通过多组学方法识别出四个代谢相关枢纽基因(GCH1, GK, MTHFD2, SLC7A6)用于活动性结核病诊断,并在单细胞水平验证其在巨噬细胞中的表达特征 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步临床验证 开发活动性结核病的早期诊断生物标志物 活动性结核病患者和健康对照者的基因表达数据 生物信息学 结核病 转录组分析,单细胞RNA-seq,机器学习 机器学习算法 基因表达数据 来自GEO数据库的活动性结核病患者和健康对照者数据集 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
1408 2025-10-05
Mechanistic Perspectives on Radiation-Induced Skin Injury and the Protective Effects of Berberine
2025, Journal of inflammation research IF:4.2Q2
研究论文 本研究探讨辐射性皮肤损伤的分子机制及小檗碱的保护作用 首次通过单细胞RNA测序和蛋白质组学分析揭示辐射性皮肤损伤的核心衰老标志物及小檗碱的治疗机制 研究主要基于动物模型和细胞实验,尚未进行大规模临床试验验证 阐明辐射性皮肤损伤的发病机制并评估小檗碱的治疗潜力 患者样本、大鼠、小鼠模型及皮肤细胞 分子生物学 辐射性皮肤损伤 单细胞RNA测序, 蛋白质组学分析, 分子对接, 体外实验 NA 基因表达数据, 蛋白质数据 未明确具体样本数量,涉及患者、大鼠、小鼠和细胞样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1409 2025-10-05
TYK2 rs34536443 (P1104A) Variant Suppresses ICAM1-Mediated Inflammation: Insights From Mendelian Randomization and Functional Analyses
2025, Psoriasis (Auckland, N.Z.)
研究论文 通过孟德尔随机化和功能分析揭示TYK2 rs34536443变异通过抑制ICAM1介导的炎症反应在银屑病中的作用机制 首次通过整合pQTL数据的SMR分析确定ICAM1是银屑病的致病蛋白,并发现TYK2 SNP rs34536443调控ICAM1表达 研究主要基于细胞模型和小鼠模型,需要进一步在人类患者中验证 探索TYK2基因在银屑病中的具体作用和调控机制 THP-1细胞、IMQ诱导的银屑病小鼠模型 遗传学与免疫学 银屑病 孟德尔随机化分析、pQTL分析、单细胞RNA测序、细胞功能实验 NA 基因组数据、蛋白质表达数据、单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1410 2025-10-05
Topology-aware pathway analysis of spatial transcriptomics
2025, PeerJ IF:2.3Q2
研究论文 本研究开发了一种考虑拓扑结构的通路分析方法PSF,用于空间转录组数据分析 将基因表达转化为通路水平活性,整合表达数据与交互网络计算生物通路各分支的数值活性得分 仅使用了两个公共数据集进行验证,需要更多数据验证方法的普适性 开发能够捕捉生物通路连通性和拓扑结构的空间转录组分析方法 人类黑色素瘤和小鼠脑组织的空间转录组数据 空间转录组学 黑色素瘤 空间转录组学 PSF算法 空间基因表达数据 两个公共数据集(人类黑色素瘤和小鼠脑组织) 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间转录组平台
1411 2025-10-05
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Pericytes Acquire a Fibrotic Phenotype and Promote Mesenteric Adipose Tissue Fibrosis in Crohn's Disease
2025, Journal of inflammation research IF:4.2Q2
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示了克罗恩病中周细胞获得纤维化表型并促进肠系膜脂肪组织纤维化的机制 首次在克罗恩病中发现周细胞向纤维化表型转化并驱动肠系膜脂肪组织纤维化的关键作用 研究主要基于体外实验和单细胞测序分析,需要进一步在体验证 阐明克罗恩病爬行脂肪纤维化的细胞起源和周细胞的参与机制 克罗恩病患者的肠系膜脂肪组织样本和原代周细胞 单细胞组学 克罗恩病 单细胞RNA测序, 免疫荧光, 细胞培养 NA 单细胞转录组数据, 图像数据 克罗恩病患者肠系膜脂肪组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1412 2025-10-05
Spatial transcriptomics reveals Inhba/Smad2/E2f4 axis in Lrp2high thecal cell proliferation in androgen-induced PCOS mice
2025, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过空间转录组学技术揭示了多囊卵巢综合征小鼠模型中Lrp2高表达卵泡膜细胞增殖的Inhba/Smad2/E2f4信号轴机制 首次利用空间转录组学在细胞分辨率水平识别出PCOS小鼠卵巢中Lrp2高表达卵泡膜细胞亚群,并发现Inhba/Smad2/E2f4信号轴调控其异常增殖 研究基于DHEA诱导的小鼠模型,与人类PCOS病理生理存在差异;体外功能验证仅限于细胞培养系统 阐明多囊卵巢综合征中卵泡膜细胞异常增殖的分子机制 DHEA诱导的PCOS小鼠模型及体外培养的卵泡膜细胞 空间转录组学 多囊卵巢综合征 空间转录组学, siRNA敲低, EdU掺入, 流式细胞术 NA 空间基因表达数据, 细胞增殖数据 PCOS小鼠卵巢组织及体外培养的卵泡膜细胞 NA 空间转录组学 NA NA
1413 2025-10-05
Revealing key regulatory factors in lung adenocarcinoma: the role of epigenetic regulation of autophagy-related genes from transcriptomics, scRNA-seq, and machine learning
2025, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1
研究论文 本研究通过转录组学、单细胞RNA测序和机器学习方法,揭示了肺腺癌中自噬相关基因的表观遗传调控机制 首次系统研究表观遗传-自噬基因在肺腺癌肿瘤微环境中的作用,并鉴定出KDM6B和KANSL1作为新的诊断标志物 研究主要基于生物信息学分析,实验验证相对有限,需要进一步的功能机制研究 探索肺腺癌中表观遗传调控的自噬相关基因在肿瘤免疫微环境中的作用机制 肺腺癌组织和相关免疫细胞 生物信息学, 机器学习 肺腺癌 单细胞RNA测序, 转录组分析, 实时PCR, Western blot 机器学习算法 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
1414 2025-10-05
Integrative analysis of lactylation related genes in prostate cancer: unveiling heterogeneity through single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq and machine learning
2025, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序、批量RNA测序和机器学习方法,系统分析前列腺癌中乳酸化相关基因的作用 首次在前列腺癌中整合单细胞和批量RNA测序数据系统研究乳酸化相关基因,并开发了基于机器学习的预后预测模型 研究依赖于公共数据库数据,需要进一步实验验证 系统研究乳酸化相关基因在前列腺癌中的作用及其预后价值 前列腺癌患者 机器学习 前列腺癌 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 机器学习 整合机器学习技术 RNA测序数据 来自TCGA-PRAD、GSE116918和GSE54460数据库的前列腺癌样本 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
1415 2025-10-05
SPOCK1 promotes the progression of breast cancer by modulating cancer-associated fibroblasts and exerts a synergistic effect with ANXA2
2025, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过多组学分析系统探索了SPOCK1在乳腺癌中的表达模式、预后意义及其通过调控癌症相关成纤维细胞促进乳腺癌进展的机制 首次系统揭示SPOCK1通过调控癌症相关成纤维细胞促进乳腺癌进展的机制,并发现其与ANXA2的协同作用 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,需要进一步的功能验证实验 探索SPOCK1在乳腺癌中的表达模式、预后意义及其在肿瘤微环境中的作用机制 乳腺癌组织样本和细胞系 生物信息学 乳腺癌 单细胞RNA测序, 多重免疫组织化学, 转录组分析, 基因组分析 NA 转录组数据, 基因组数据, 临床数据, 单细胞测序数据 TCGA和GEO数据库中的乳腺癌样本 NA 单细胞RNA测序, 多重免疫组织化学, 批量RNA测序 NA NA
1416 2025-10-05
Is postoperative cognitive dysfunction a disease of microglial inflammatory memory? A state-transition model from metabolic stress to epigenetic lock-in
2025, Frontiers in molecular neuroscience IF:3.5Q2
综述 提出术后认知功能障碍是由小胶质细胞炎症记忆驱动的状态转换模型 将POCD重新定义为小胶质细胞命运转换而非短暂免疫反应,提出线粒体功能障碍-染色质重塑-持续极化的闭环炎症记忆回路 理论模型尚未通过实验完全验证,需要时间分辨的单细胞技术进一步证实 阐明术后认知功能障碍的持续性和机制 小胶质细胞炎症记忆和表观遗传机制 神经科学 术后认知功能障碍 时间分辨单细胞转录组学、染色质可及性分析 状态转换模型 NA NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1417 2025-10-05
Integrated multi-omics profiling of immune microenvironment and drug resistance signatures for precision prognosis in prostate cancer
2025, Cancer drug resistance (Alhambra, Calif.)
研究论文 本研究开发了一个以前列腺癌肿瘤微环境为中心的预后模型,整合多组学数据揭示免疫异质性、基因组不稳定性与治疗耐药性的关联 首次将肿瘤微环境动态、基因组不稳定性和药物耐药异质性整合到前列腺癌预后模型中,并通过单细胞RNA测序揭示亚型特异性耐药模式 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,需要进一步的前瞻性临床验证 开发基于肿瘤微环境的精准预后模型,指导前列腺癌个体化治疗 前列腺癌患者和癌细胞系 生物信息学 前列腺癌 单细胞RNA测序,多组学数据分析,LASSO回归,CIBERSORT,ESTIMATE,WGCNA LASSO回归模型 转录组数据,基因组数据 554个TCGA-PRAD样本和329个外部验证样本,835个前列腺癌细胞 NA 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq NA NA
1418 2025-10-05
Pathophysiological Insights Into the Role of Osteoclasts in Osteoarthritis: Mechanisms, Therapeutic Targets, and Future Directions
2025, Journal of inflammation research IF:4.2Q2
综述 本文探讨骨关节炎中破骨细胞的病理生理作用机制及靶向治疗前景 整合单细胞RNA测序与传统方法从时空维度研究破骨细胞基因表达模式,探索新型治疗靶点 未涉及具体临床实验数据验证 填补骨关节炎治疗知识空白并推动创新疗法发展 骨关节炎中的破骨细胞 骨生物学 骨关节炎 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1419 2025-10-05
Comprehensive Insights Into the Role of TRPM4 in Pan-Cancer Progression and Immune Regulation
2025, ImmunoTargets and therapy IF:6.2Q1
研究论文 本研究通过多组学数据分析探讨TRPM4在泛癌进展和免疫调控中的作用 首次系统性分析TRPM4在泛癌中的表达模式及其与免疫浸润和免疫治疗反应的关系 样本量有限,特别是验证实验仅涉及19例肺腺癌患者 研究TRPM4在泛癌进展和免疫调控中的作用 多种癌症类型(泛癌分析),重点验证乳腺癌、肺腺癌和食管癌 生物信息学 泛癌分析 RNA测序,单细胞RNA测序,免疫组织化学,多重免疫荧光,体外实验 NA 基因表达数据,蛋白质表达数据,免疫细胞浸润数据 TCGA和GTEx数据库的泛癌数据,19例肺腺癌患者组织样本 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
1420 2025-10-05
smartSim: simulation of splice aware single cell smart-seq3 data
2025, Bioinformatics advances IF:2.4Q2
研究论文 开发了一个用于模拟Smart-seq3单细胞RNA测序数据的仿真工具smartSim 首个专门针对Smart-seq3协议设计的读段模拟器,能够模拟已知和新的剪接事件,生成包含UMI和内部读段的真实数据 基于经验数据分布模拟,可能无法完全覆盖所有真实实验变异 为单细胞RNA测序中的剪接分析和异构体重建计算工具提供基准测试资源 单细胞RNA测序数据 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 NA 测序读段 NA NA single-cell RNA-seq Smart-seq3 Smart-seq3全长单细胞RNA测序协议
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