单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27536 篇文献，本页显示第 14141 - 14160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 14141 | 2024-08-05 |
Tumor Niches: Perspectives for Targeted Therapies in Glioblastoma
2023-11, Antioxidants & redox signaling
IF:5.9Q1
DOI:10.1089/ars.2022.0187
PMID:37166370
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review | 本文讨论了胶质母细胞瘤中的五种肿瘤生态位及其相互作用 | 提出了针对胶质母细胞瘤不同肿瘤生态位的治疗策略 | 该研究主要集中在理论探讨，缺乏实验验证 | 阐明肿瘤异质性的机制，为患者开发更有效的治疗方案 | 胶质母细胞瘤及其相关的肿瘤生态位 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 14142 | 2024-08-07 |
Single cell RNA-sequencing of human precision-cut lung slices: A novel approach to study the effect of vaping and viral infection on lung health
2023-07, Innate immunity
IF:2.8Q3
DOI:10.1177/17534259231181029
PMID:37306239
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了人精确切割肺切片中电子烟和流感病毒感染对肺健康的影响 | 首次使用单细胞RNA测序技术在人精确切割肺切片模型中研究电子烟和流感病毒感染的影响 | 研究仅限于特定的电子烟提取物和流感病毒A感染，可能无法完全代表所有电子烟产品和病毒感染的影响 | 探讨电子烟和流感病毒感染对肺部抗病毒和促炎反应的影响 | 人精确切割肺切片中的结构细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 健康捐赠者的肺切片 |
| 14143 | 2024-08-07 |
Mesenchymal-epithelial transition in lymph node metastases of oral squamous cell carcinoma is accompanied by ZEB1 expression
2023-04-19, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04102-w
PMID:37076857
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量转录组测序，探讨了口腔鳞状细胞癌（OSCC）淋巴结转移中上皮-间质可塑性（EMP）的异质性及其对基质细胞的影响 | 首次揭示了在口腔鳞状细胞癌淋巴结转移中，间质-上皮转化（MET）过程中ZEB1的活性增加，表明ZEB1在MET中的复杂作用 | 研究样本量有限，且仅限于口腔鳞状细胞癌，可能限制了结果的普遍性 | 探讨口腔鳞状细胞癌淋巴结转移中上皮-间质可塑性的异质性及其对肿瘤微环境的影响 | 口腔鳞状细胞癌的肿瘤细胞和基质细胞 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 23个口腔鳞状细胞癌病变样本，共7263个癌细胞的单细胞转录组数据 |
| 14144 | 2024-08-07 |
Single-Cell Kinetic Modeling of β-Lapachone Metabolism in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2023-Mar-17, Antioxidants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antiox12030741
PMID:36978989
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据，模拟了β-拉帕醌在头颈鳞状细胞癌中的代谢过程，并分析了其在肿瘤和健康组织中的细胞反应异质性 | 首次利用单细胞RNA测序数据进行系统级模拟，揭示了β-拉帕醌治疗引起的氧化应激反应在健康和恶性细胞模型中的差异 | 研究仅基于10个HNSCC患者肿瘤的转录组数据，样本量较小 | 探究头颈鳞状细胞癌中β-拉帕醌代谢的细胞反应异质性 | 头颈鳞状细胞癌中的β-拉帕醌代谢 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 10个HNSCC患者肿瘤样本 |
| 14145 | 2024-08-05 |
Integrated single-cell and bulk characterization of cuproptosis key regulator PDHB and association with tumor microenvironment infiltration in clear cell renal cell carcinoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1132661
PMID:37350959
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研究论文 | 本研究探讨了cuproptosis关键调节因子PDHB在透明细胞肾癌中的生物功能及其与肿瘤微环境浸润的关系 | 揭示了PDHB作为cuproptosis相关中心基因在ccRCC中的重要性，并探讨其在临床治疗中的潜在应用 | 研究可能未深入探讨cuproptosis与其他肿瘤类型的关系 | 旨在发现cuproptosis调节因子的生物学功能，以指导临床治疗 | 主要研究对象为透明细胞肾癌（ccRCC）患者中的PDHB基因 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序和大规模转录组数据 | NA | 基因表达数据 | 包括ccRCC组织和正常配对组织 |
| 14146 | 2024-08-07 |
Protocol to obtain high-quality single-cell RNA-sequencing data from mouse liver cells using centrifugation
2022-12-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101824
PMID:36386875
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研究论文 | 本文介绍了一种使用离心法从鼠肝细胞中获取高质量单细胞RNA测序数据的方法 | 提出了一种新的离心法来获取可存活的肝细胞和非实质性肝细胞，以避免使用荧光激活细胞分选（FACS）导致的细胞死亡问题 | NA | 开发一种新的方法来获取高质量的肝细胞单细胞RNA测序数据 | 鼠肝细胞，特别是肝细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 14147 | 2024-08-07 |
Deconvolution of cell type-specific drug responses in human tumor tissue with single-cell RNA-seq
2021-05-11, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-021-00894-y
PMID:33975634
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研究论文 | 本文通过结合急性切片培养中的多重药物扰动与单细胞RNA测序（scRNA-seq），研究了人类肿瘤组织中细胞类型特异性药物反应 | 首次使用scRNA-seq技术在单细胞水平上分析肿瘤组织中细胞类型特异性的药物敏感性 | 研究仅限于胶质母细胞瘤（GBM），可能需要进一步研究以验证其他类型肿瘤的适用性 | 旨在开发一种能够在患者肿瘤组织中直接快速筛选细胞类型特异性药物敏感性的平台 | 胶质母细胞瘤（GBM）患者的肿瘤组织 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 7个胶质母细胞瘤（GBM）切除样本 |
| 14148 | 2024-08-07 |
Integrating single-cell RNA-seq and imaging with SCOPE-seq2
2020-11-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-76599-w
PMID:33173156
|
研究论文 | 本文介绍了一种升级版的单细胞光学表型和表达分析技术（SCOPE-seq2），用于结合单细胞成像和表达谱分析 | SCOPE-seq2在通量、分子捕获效率、链接准确性和与标准显微镜设备的兼容性方面有显著改进，引入了改进的光学可解码mRNA捕获珠和更可扩展、简化的光学解码过程 | NA | 旨在提高单细胞成像和RNA测序技术的结合效率和应用范围 | 人类胶质母细胞瘤（GBM）手术样本中的单个原代细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像和文本 | 单个原代细胞 |
| 14149 | 2024-08-07 |
Combinatory use of distinct single-cell RNA-seq analytical platforms reveals the heterogeneous transcriptome response
2018-02-22, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-018-21161-y
PMID:29472726
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研究论文 | 本文探讨了结合不同单细胞RNA测序平台以揭示癌症细胞转录组异质性的有效性 | 提出了一种结合不同单细胞RNA测序平台的方法，以获取更全面的表达差异信息和足够的细胞群体 | 尽管可以分析转录模块的活性，但某些情况下无法精确推断单个基因的信息 | 研究癌症细胞的转录组异质性 | 癌症细胞的转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及少量细胞群体 |
| 14150 | 2024-08-07 |
Novel approaches in function-driven single-cell genomics
2017-07-01, FEMS microbiology reviews
IF:10.1Q1
DOI:10.1093/femsre/fux009
PMID:28591840
|
综述 | 本文综述了功能驱动单细胞基因组学的策略及其未来发展方向 | 提出了一种基于功能的筛选方法，用于从复杂的微生物群落中靶向分离和单细胞基因组测序，从而聚焦于具有特定表型或代谢特征的细胞 | NA | 旨在提高对微生物群落功能及其未表征基因产物空间的理解 | 环境微生物群落及其在生物地球化学中的作用 | 基因组学 | NA | 单细胞基因组学 | NA | 基因组数据 | NA |
| 14151 | 2024-08-04 |
Combinatorial expression of γ-protocadherins regulates synaptic connectivity in the mouse neocortex
2024-Mar-12, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.89532
PMID:38470230
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研究论文 | 本文研究了γ-protocadherins在小鼠新皮层突触连接中的作用 | 识别了组合性γ-protocadherin表达在突触连接中的关键角色 | 尚未探讨如何在其他类型神经元中应用这一发现 | 探讨突触形成过程中的连接选择机制 | 小鼠新皮层中的神经元 | 数字病理学 | NA | 5'端单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 14152 | 2024-08-04 |
Differentiation is accompanied by a progressive loss in transcriptional memory
2024-Mar-12, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-024-01846-9
PMID:38468285
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研究论文 | 本研究探讨了细胞分化过程中的转录记忆丧失与基因表达变异之间的关系 | 首次提供了关于相同细胞在分化早期阶段转录组分化速度的实验数据 | 研究主要集中在两种分化生物系统，可能限制了广泛应用性 | 研究细胞分化过程中转录记忆如何随着细胞分裂而丧失 | 人CD34+细胞和T2EC鸡初级红细胞前体 | 数字病理学 | NA | scRT-qPCR和scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 相关细胞的转录组，包含一代和二代细胞 |
| 14153 | 2024-08-07 |
Rejuvenated iPSC-derived GD2-directed CART Cells Harbor Robust Cytotoxicity Against Small Cell Lung Cancer
2024-Mar-11, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-23-0259
PMID:38380966
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研究论文 | 本文研究了通过引入GD2-CAR到诱导多能干细胞（iPSC）衍生的 rejuvenated 细胞毒性T淋巴细胞（GD2-CARrejT）来增强针对小细胞肺癌（SCLC）的GD2-CART细胞的细胞毒性。 | 本文创新性地使用iPSC衍生的 rejuvenated 细胞毒性T淋巴细胞（GD2-CARrejT），其在体外和体内对SCLC细胞的细胞毒性显著强于传统的GD2-CART细胞。 | NA | 旨在增强GD2-CART细胞对小细胞肺癌的细胞毒性。 | 研究对象为小细胞肺癌（SCLC）细胞和GD2-CART细胞。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | CAR T细胞 | RNA | NA |
| 14154 | 2024-08-04 |
Principled and interpretable alignability testing and integration of single-cell data
2024-Mar-05, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2313719121
PMID:38416677
|
研究论文 | 该文章提出了一种可解释的单细胞数据对齐测试和集成的方法。 | 文章创新性地提出了SMAI框架，提供了严谨的统计检验以评估单细胞数据集的对齐能力，并保持数据结构的完整性。 | 现有方法缺乏对高维单细胞数据集是否可对齐的严格统计检验，并且在对齐过程中可能会严重扭曲数据。 | 研究旨在改进单细胞数据集成的方法，以提高分析的可靠性和可解释性。 | 本研究的对象是不同的单细胞数据集，包括真实和模拟的基准数据集。 | 数字病理学 | NA | 统计检验 | 谱流形对齐与推断框架 | 单细胞数据 | 多种真实和模拟的基准数据集 |
| 14155 | 2024-08-07 |
Adipocyte Precursor-Derived NRG1 Promotes Resistance to FGFR Inhibition in Urothelial Carcinoma
2024-03-04, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-1398
PMID:38175774
|
研究论文 | 本文研究了脂肪细胞前体衍生的NRG1如何促进尿路上皮癌对FGFR抑制剂的抵抗 | 发现脂肪细胞前体通过旁分泌方式促进对erdafitinib的抵抗，并揭示了NRG1通过激活ERBB3信号传导介导的抵抗机制 | NA | 探讨尿路上皮癌对FGFR抑制剂的抵抗机制 | 尿路上皮癌及其对FGFR抑制剂的抵抗 | 数字病理学 | 尿路上皮癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 14156 | 2024-08-07 |
Adipose Stromal Cell-Derived Cancer-Associated Fibroblasts Suppress FGFR Inhibitor Efficacy
2024-03-04, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-3904
PMID:38437636
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研究论文 | 研究揭示了脂肪组织中的前体细胞通过分泌神经调节蛋白1（NRG1）激活HER3信号通路，导致尿路上皮癌对FGFR抑制剂erdafitinib产生耐药性 | 发现NRG1介导的FGFR抑制剂耐药性可通过pertuzumab抗体进行干预 | NA | 探讨脂肪组织来源的细胞如何影响癌症治疗效果 | 脂肪组织中的前体细胞及其在癌症治疗中的作用 | NA | 尿路上皮癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 14157 | 2024-08-04 |
Stromal Signals Dominate Gene Expression Signature Scores That Aim to Describe Cancer Cell-intrinsic Stemness or Mesenchymality Characteristics
2024-02-23, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-23-0383
PMID:38349551
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研究论文 | 本文探讨了肿瘤微环境对EMT相关基因表达特征分数的影响 | 揭示了肿瘤样本中细胞成分主导EMT特征分数的现象 | 未能深入探讨非癌细胞的具体影响机制 | 验证非癌细胞在肿瘤特征评分中的主导作用 | 已发表的11个与EMT相关的基因表达特征 | 数字病理学 | 癌症 | RNA测序(RNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 分析了多个肿瘤类型的样本 |
| 14158 | 2024-08-07 |
EZH2 Inhibition Promotes Tumor Immunogenicity in Lung Squamous Cell Carcinomas
2024-02-13, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-23-0399
PMID:38265267
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研究论文 | 本研究探讨了抑制甲基转移酶增强子zeste 2 (EZH2)是否能增加肺鳞状细胞癌(LSCC)对免疫检查点抑制剂(ICI)的反应 | 首次证明EZH2抑制剂能增加MHC I/II类分子的表达，并通过单细胞RNA测序和免疫细胞分析揭示了肿瘤抑制表型的变化 | NA | 研究EZH2抑制剂在肺鳞状细胞癌中增强免疫检查点抑制剂反应的作用 | 肺鳞状细胞癌(LSCC) | 数字病理学 | 肺鳞状细胞癌 | 染色质免疫沉淀测序 | NA | mRNA和蛋白质 | 使用二维人类癌细胞系和三维小鼠及患者来源的类器官进行体外实验 |
| 14159 | 2024-08-07 |
Data-driven detection of age-related arbitrary monotonic changes in single-cell gene expression distributions
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.16851
PMID:38344300
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研究论文 | 本研究介绍了一种新的工作流程，用于检测单细胞表达谱中与年龄相关的任意单调变化分布 | 使用信息论量化分布差异，并通过距离矩阵进行关联分析 | NA | 理解衰老背后的机制 | 单细胞基因表达随年龄的变化 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 14160 | 2024-08-04 |
Roles of immune microenvironment in the female reproductive maintenance and regulation: novel insights into the crosstalk of immune cells
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1109122
PMID:38223507
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研究论文 | 本文探讨了免疫微环境在女性生殖维持与调节中的作用 | 通过单细胞测序技术揭示了免疫细胞的分布图，为免疫细胞在女性生殖中的作用提供了新见解 | 本文未提及具体的实验数据与样本量 | 构建女性生殖过程中免疫微环境的全面描述 | 关注女性生殖过程中免疫细胞的动态作用 | 数字病理学 | 女性生殖健康 | 单细胞测序（scRNA-seq） | NA | NA | NA |