单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28751 篇文献，本页显示第 14101 - 14120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 14101 | 2024-08-07 |
Advancing diabetes treatment: the role of mesenchymal stem cells in islet transplantation
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1389134
PMID:38605972
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综述 | 本文综述了间充质干细胞（MSCs）在胰岛移植治疗糖尿病中的作用 | 利用MSCs的免疫调节特性和分化潜能，以及MSC衍生的细胞外囊泡等创新方法，来提高胰岛移植的效果 | MSCs的异质性和治疗应用的优化仍存在挑战 | 探讨MSCs在提高胰岛移植疗效中的作用，并评估其在糖尿病治疗中的潜力 | 间充质干细胞（MSCs）及其在胰岛移植中的应用 | 再生医学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA | NA |
| 14102 | 2024-08-07 |
Unraveling the tumor immune microenvironment of lung adenocarcinoma using single-cell RNA sequencing
2024, Therapeutic advances in medical oncology
IF:4.3Q2
DOI:10.1177/17588359231210274
PMID:38606165
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综述 | 本文系统回顾了使用单细胞RNA测序技术在肺腺癌中研究肿瘤免疫微环境的最新进展 | 总结了肿瘤免疫微环境的异质性及其在患者预后和治疗反应中的相关标记物或模型 | NA | 探讨肿瘤免疫微环境在肺腺癌发展和治疗中的作用 | 肺腺癌的肿瘤免疫微环境 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 14103 | 2024-08-07 |
Amino acid transporter SLC7A5 regulates cell proliferation and secretary cell differentiation and distribution in the mouse intestine
2024, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.94297
PMID:38617535
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研究论文 | 本文研究了氨基酸转运蛋白SLC7A5在小鼠肠道中的作用，发现其影响细胞增殖和分泌细胞的分化与分布 | 首次报道了肠道上皮细胞特异性敲除氨基酸转运蛋白SLC7A5，并揭示了其对mTORC1信号通路的影响 | NA | 探讨SLC7A5在肠道上皮细胞增殖和分泌细胞分化中的作用 | 小鼠肠道上皮细胞和分泌细胞 | 生物学 | NA | scRNA-seq, 电子显微镜 | NA | 细胞 | 小鼠肠道隐窝细胞 |
| 14104 | 2024-08-07 |
Integrated analysis of scRNA-seq and bulk RNA-seq reveals that GPRC5A is an important prognostic gene in pancreatic cancer and is associated with B-cell Infiltration in pancreatic cancer
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1283164
PMID:38634049
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研究论文 | 本研究通过综合分析单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（bulk RNA-seq）数据，揭示了GPRC5A作为胰腺癌的重要预后基因，并与B细胞浸润相关 | 首次综合利用scRNA-seq和bulk RNA-seq数据，构建了多因素Cox预后模型，并验证了GPRC5A与B细胞浸润及患者预后的关联 | NA | 确定影响胰腺癌预后的相关基因，并研究其与免疫浸润的关系 | 胰腺癌的预后基因及免疫浸润 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（bulk RNA-seq），实时荧光定量PCR（RT-PCR） | Cox回归分析，Lasso回归分析 | 基因表达数据 | 使用了来自GEO数据库的胰腺癌单细胞芯片数据和TCGA的临床数据 |
| 14105 | 2024-08-07 |
Stromal STAT5-Mediated Trophic Activity Regulates Hematopoietic Niche Factors
2023-10-08, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxad055
PMID:37465968
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研究论文 | 研究通过STAT5ab敲除小鼠模型，探讨STAT5在骨髓造血微环境中的作用及其对造血干细胞的影响 | 首次揭示了STAT5ab在骨髓微环境中对造血干细胞分化的调控作用，并通过单细胞转录组分析验证了其机制 | 研究主要集中在小鼠模型上，未来需要进一步在人类样本中验证这些发现 | 探讨STAT5在骨髓造血微环境中的作用及其对造血干细胞的影响 | STAT5ab敲除小鼠模型及其对骨髓造血微环境的影响 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | mRNA表达 | 多种Cre转基因小鼠品系 |
| 14106 | 2024-08-07 |
scMultiGAN: cell-specific imputation for single-cell transcriptomes with multiple deep generative adversarial networks
2023-09-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad384
PMID:37903416
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scMultiGAN的新型深度学习模型，用于单细胞转录组数据的插补，该模型利用多个协作生成对抗网络（GAN）实现细胞特异性插补 | scMultiGAN采用两阶段训练过程和多个GAN实现细胞特异性插补，与传统基于GAN的插补方法不同，后者基于随机噪声生成缺失值 | NA | 提高单细胞RNA测序数据分析中缺失值插补的准确性 | 单细胞转录组数据中的缺失值 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 生成对抗网络（GAN） | 转录组数据 | NA |
| 14107 | 2024-08-04 |
Clinical, morphologic and molecular heterogeneity of HPV-associated oropharyngeal cancer
2023-09, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-023-02819-y
PMID:37666939
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综述 | 本综述探讨了HPV相关的口咽癌的临床、形态和分子异质性 | 提出了针对HPV+口咽鳞状细胞癌的不同亚型及其相关生物标志物的分类概念 | 缺乏对多中心临床试验结果的非劣性分析 | 识别与患者分层和个性化治疗相关的HPV+口咽鳞状细胞癌生物标志物 | HPV+口咽鳞状细胞癌的多样性及其相关临床和生物特征 | 数字病理学 | 咽癌 | 单细胞测序 | NA | 肿瘤样本数据 | NA |
| 14108 | 2024-08-07 |
ONECUT2 regulates RANKL-dependent enterocyte and microfold cell differentiation in the small intestine; a multi-omics study
2023-02-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac1236
PMID:36625255
|
研究论文 | 本研究采用多组学方法探讨了小肠类器官中M细胞分化的分子机制 | 揭示了ONECUT2通过RANK/RANKL信号轴调控小肠中肠上皮细胞和M细胞分化的机制 | NA | 探究小肠中M细胞分化的分子机制及其调控因素 | 小肠类器官中的M细胞分化 | 分子生物学 | NA | 多组学分析, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 小鼠小肠类器官 |
| 14109 | 2024-08-04 |
The aryl hydrocarbon receptor cell intrinsically promotes resident memory CD8+ T cell differentiation and function
2023-01-31, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111963
PMID:36640340
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研究论文 | 该文章探讨了芳香烃受体(Ahr)在CD8 T细胞分化和功能中的内在作用 | 首次揭示了Ahr在CD8 T细胞蕴藏的记忆细胞分化和功能中的促进作用 | 研究主要基于小鼠模型，可能在转化为人类时受到限制 | 研究Ahr在CD8 T细胞功能及其记忆细胞分化中的作用 | 小鼠CD8 T细胞及人类肠道内的CD8 T细胞 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 涉及小鼠和人类的CD8 T细胞 |
| 14110 | 2024-08-07 |
Friend leukemia integration 1 overexpression decreases endometrial receptivity and induces embryo implantation failure by promoting PART1 transcription in the endometrial epithelial cells
2023, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.16105
PMID:37780395
|
研究论文 | 本研究探讨了FLI1在子宫内膜容受性和反复植入失败（RIF）中的作用及其机制 | 发现FLI1通过结合PART1启动子区域促进PART1表达，从而抑制胚胎植入 | NA | 探索FLI1在子宫内膜容受性和反复植入失败中的作用及机制 | 子宫内膜细胞和胚胎植入 | 生殖医学 | 不孕症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq）、定量实时聚合酶链反应（qRT-PCR）、蛋白质印迹（western blotting）、细胞计数试剂盒（CCK）-8、划痕愈合试验、染色质免疫沉淀、双荧光素酶报告试验 | NA | RNA | 包括RIF患者和对照组的子宫内膜组织样本 |
| 14111 | 2024-08-07 |
Chronic superphysiologic AMH promotes premature luteinization of antral follicles in human ovarian xenografts
2022-03-11, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abi7315
PMID:35263130
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research paper | 研究探讨了超生理水平的抗穆勒氏管激素（AMH）对人类卵巢异种移植中卵泡黄素化的影响 | 首次通过共移植人卵巢皮质与表达AMH的血管内皮细胞，并进行单细胞RNA测序，揭示了超生理水平AMH对卵泡发育的影响 | 研究样本量较小，且仅限于免疫缺陷小鼠模型 | 探究AMH对卵泡发育的影响及其可能导致的排卵功能障碍 | 人卵巢皮质中的卵泡 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 共观察了38个卵泡（19个对照组和19个AMH组） |
| 14112 | 2024-08-07 |
Clonal hematopoiesis, myeloid disorders and BAX-mutated myelopoiesis in patients receiving venetoclax for CLL
2022-02-24, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2021012775
PMID:34469514
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研究论文 | 研究长期使用BCL2抑制剂venetoclax治疗慢性淋巴细胞白血病（CLL）患者中出现的骨髓异常和BAX突变情况 | 首次发现BAX突变在venetoclax治疗CLL患者中的骨髓细胞中独立出现，并与BCL2突变在同一患者中同时存在 | 研究样本量有限，且仅限于接受venetoclax治疗的CLL患者 | 探究长期使用venetoclax治疗CLL患者中骨髓细胞的临床和分子异常 | 接受venetoclax治疗的CLL患者及其骨髓细胞 | 血液学 | 慢性淋巴细胞白血病 | 单细胞测序 | NA | 基因突变数据 | 89名患者，其中41名患者的骨髓样本进行了详细分析 |
| 14113 | 2024-08-07 |
TIMEx: tumor-immune microenvironment deconvolution web-portal for bulk transcriptomics using pan-cancer scRNA-seq signatures
2021-Oct-25, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab244
PMID:33901274
|
研究论文 | 本文介绍了TIMEx，一种新的肿瘤免疫微环境（TIME）反卷积方法，用于使用泛癌单细胞RNA-seq特征的批量转录组学估计浸润性免疫细胞 | 开发了TIMEx，一种新的TIME反卷积方法，强调使用泛癌单细胞RNA-seq特征估计浸润性免疫细胞 | NA | 开发和实现一种新的肿瘤免疫微环境反卷积方法 | 肿瘤免疫微环境中的异质细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 反卷积方法 | 转录组数据 | NA |
| 14114 | 2024-08-07 |
Antibiotic-induced disturbances of the gut microbiota result in accelerated breast tumor growth
2021-Sep-24, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.103012
PMID:34522855
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研究论文 | 本研究探讨了抗生素引起的肠道微生物群失调对乳腺癌肿瘤生长的影响 | 发现抗生素诱导的肠道微生物群扰动显著加速了多个乳腺癌小鼠模型的肿瘤进展，并揭示了乳腺癌与微生物群相互作用的新机制 | NA | 研究肠道微生物群在乳腺癌进展中的作用 | 乳腺癌小鼠模型及肠道微生物群 | NA | 乳腺癌 | 宏基因组学, 单细胞转录组学 | NA | 微生物群数据, 细胞转录数据 | 多个乳腺癌小鼠模型 |
| 14115 | 2024-08-07 |
Defining the Design Principles of Skin Epidermis Postnatal Growth
2020-04-30, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.03.015
PMID:32259486
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研究论文 | 本文通过结合体内克隆系谱追踪、增殖动力学、单细胞转录组学和体外微图案实验，解析了出生后皮肤表皮扩张过程中的细胞动力学 | 揭示了由单一发育前体细胞群介导的和谐生长机制，这些前体细胞具有固定的命运失衡自我更新分裂和不断降低的增殖率 | NA | 探究出生后器官和组织生长过程中的细胞动力学 | 皮肤表皮在出生后的生长过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
| 14116 | 2024-08-07 |
Platform Effects on Regeneration by Pulmonary Basal Cells as Evaluated by Single-Cell RNA Sequencing
2020-03-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.03.004
PMID:32209482
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序评估了不同平台对肺基底细胞再生的影响 | 开发了计算流程来比较不同平台样本的全局和群体水平差异 | NA | 阐明体外环境中上皮再生结果的环境效应 | 从大鼠气管中分离并培养的药理学扩增的基底细胞 | 数字病理学 | 慢性肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 从大鼠气管中分离的基底细胞样本 |
| 14117 | 2024-08-07 |
Cortical Foxp2 Supports Behavioral Flexibility and Developmental Dopamine D1 Receptor Expression
2020-03-14, Cerebral cortex (New York, N.Y. : 1991)
DOI:10.1093/cercor/bhz209
PMID:31711176
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研究论文 | 本研究通过特异性敲除小鼠皮质中的Foxp2基因，探讨了Foxp2在皮质发育和行为灵活性中的作用。 | 首次揭示了Foxp2在皮质中对多巴胺D1受体表达和行为灵活性的调控作用，并通过单细胞转录组学分析了D1R表达细胞类型的变化。 | NA | 探究Foxp2在皮质发育和行为灵活性中的分子和行为功能。 | 皮质特异性Foxp2条件敲除小鼠。 | 神经科学 | 神经发育障碍 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 至少五种兴奋性和三种抑制性D1R表达细胞类型 |
| 14118 | 2024-08-07 |
STAT Signaling Modifies Ascl1 Chromatin Binding and Limits Neural Regeneration from Muller Glia in Adult Mouse Retina
2020-02-18, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.01.075
PMID:32075759
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研究论文 | 研究探讨了STAT信号通路对Ascl1染色质结合的影响及其在成年小鼠视网膜Müller胶质细胞神经再生中的限制作用 | 发现STAT信号通路可能引导Ascl1至发育不适宜的目标，使用STAT抑制剂结合重编程范式显著增加了Müller胶质细胞生成神经元的能力 | 新神经元仅从Müller胶质细胞的子集中生成，表明存在限制Ascl1介导的Müller胶质细胞重编程的因素 | 测试损伤诱导的STAT激活是否阻碍Ascl1将Müller胶质细胞重编程为视网膜神经元的能力 | 成年小鼠视网膜中的Müller胶质细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序, Ascl1-ChIPseq, ATAC-seq | NA | RNA, 染色质结合数据 | 未具体说明样本数量 |
| 14119 | 2024-08-07 |
A single-parasite transcriptional atlas of Toxoplasma Gondii reveals novel control of antigen expression
2020-02-17, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.54129
PMID:32065584
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了弓形虫在速殖子和缓殖子阶段的转录组，揭示了其发育过程中的隐藏状态和转录因子 | 发现了AP2IX-1转录因子控制从普遍表达的SAG1到稀有表面抗原的切换，并构建了一个互动的数据浏览器用于可视化资源 | NA | 揭示弓形虫发育过程中的转录调控机制 | 弓形虫的速殖子和缓殖子阶段 | 分子生物学 | 寄生虫病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 超过5,400个弓形虫样本，包括三种广泛研究的菌株 |
| 14120 | 2024-08-04 |
[Current status and prospects of genetic research on IgA nephropathy]
2024-Apr-23, Zhonghua yi xue za zhi
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评论 | 本文讨论了IgA肾病的遗传研究现状和前景 | 提出了基因组医学时代如何通过全基因组测序和多组学研究寻找IgA肾病的易感基因及靶向药物的见解 | 仅讨论了目前的研究进展，未提供新的实验数据或结果 | 探讨IgA肾病的遗传因素及其在发病机制中的作用 | IgA肾病相关的易感基因和临床表型 | 数字病理学 | NA | 全基因组测序（WGS），单细胞测序，表达数量性性状位点（eQTL） | NA | NA | NA |