单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27773 篇文献，本页显示第 14101 - 14120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 14101 | 2024-08-07 |
The molecular and phenotypic makeup of fetal human skin T lymphocytes
2022-04-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.199781
PMID:34604909
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研究论文 | 本文描述了一种从胎儿人皮肤中分离和扩增大量T细胞的新工作流程 | 首次使用单细胞转录组学和TCR谱分析技术，详细描述了胎儿皮肤T淋巴细胞的分子和表型特征 | NA | 深入理解胎儿皮肤免疫机制及其在未来治疗干预中的潜在应用 | 胎儿人皮肤的T淋巴细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞转录组学，TCR谱分析 | NA | 细胞 | 大量胎儿皮肤活检样本 |
| 14102 | 2024-08-07 |
Persistence of mature dendritic cells, TH2A, and Tc2 cells characterize clinically resolved atopic dermatitis under IL-4Rα blockade
2021-01-22, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abe2749
PMID:33483337
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研究论文 | 研究探讨了使用IL-4Rα阻断剂dupilumab治疗后，特应性皮炎（AD）患者皮肤中持久存在的特定免疫细胞群 | 首次发现即使在临床缓解后，特应性皮炎患者皮肤中仍存在成熟的树突状细胞、TH2A细胞和Tc2细胞，这些细胞可能与疾病的复发有关 | 研究仅限于短期和长期使用dupilumab治疗的患者，未涵盖其他治疗方案 | 探讨特应性皮炎治疗后皮肤中免疫记忆的持久性及其对疾病复发的影响 | 特应性皮炎患者和健康对照者的皮肤免疫细胞 | 免疫学 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序和多重蛋白质组学 | NA | RNA和蛋白质 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 14103 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics combined with interstitial fluid proteomics defines cell type-specific immune regulation in atopic dermatitis
2020-11, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2020.03.041
PMID:32344053
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研究论文 | 本文通过结合单细胞转录组学和间质液蛋白质组学，研究了特应性皮炎中细胞类型特异性的免疫调节机制。 | 使用皮肤吸引水泡技术同时采集体细胞和间质液，结合单细胞RNA测序和蛋白质组学分析，揭示了特应性皮炎中新的炎症因子及其在细胞和蛋白质组学微环境中的作用。 | NA | 旨在通过转录组学和蛋白质组学水平上表征特应性皮炎。 | 特应性皮炎的细胞类型特异性免疫调节。 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据和蛋白质组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 14104 | 2024-08-07 |
Commensal microbiota drive the functional diversification of colon macrophages
2020-03, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1038/s41385-019-0228-3
PMID:31772323
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了无特定病原体（SPF）和无菌（GF）C57BL/6小鼠结肠髓样细胞，揭示了结肠巨噬细胞（MPs）和树突状细胞（DCs）的广泛异质性 | 研究首次揭示了肠道共生微生物对结肠巨噬细胞功能多样化的驱动作用，并通过基因表达谱、定位和吞噬能力等方面区分了不同结肠巨噬细胞群体 | 研究仅限于特定的小鼠模型，可能需要进一步的人体研究来验证这些发现 | 探讨肠道共生微生物对结肠巨噬细胞功能多样化的影响 | 结肠巨噬细胞和树突状细胞的功能多样性 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | SPF和GF C57BL/6小鼠的结肠髓样细胞 |
| 14105 | 2024-08-07 |
A benchmark of batch-effect correction methods for single-cell RNA sequencing data
2020-01-16, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-019-1850-9
PMID:31948481
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研究论文 | 本文对现有的单细胞RNA测序数据批次效应校正方法进行了深入的基准研究，以确定最适合的批次效应去除方法。 | 本文设计了五种不同的场景来评估14种方法的性能，并使用四种基准测试指标进行评估，包括kBET、LISI、ASW和ARI。 | NA | 研究目的是评估和比较不同批次效应校正方法在单细胞RNA测序数据中的效果。 | 研究对象是14种不同的批次效应校正方法。 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据集 | NA |
| 14106 | 2024-08-07 |
DENDRO: genetic heterogeneity profiling and subclone detection by single-cell RNA sequencing
2020-01-14, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-019-1922-x
PMID:31937348
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研究论文 | 本文提出了一种名为DENDRO的分析方法，用于通过单细胞RNA测序数据对肿瘤内遗传异质性进行分析，并检测亚克隆 | DENDRO方法利用转录点突变，考虑技术噪声和表达随机性，能够将单细胞聚类成遗传上不同的亚克隆，并重建相关亚克隆的系统发育树 | NA | 开发一种可靠的方法，通过单细胞RNA测序数据检测体细胞突变并推断克隆成员关系 | 单细胞RNA测序数据中的遗传异质性和亚克隆检测 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 涉及三种癌症类型的真实数据和一个对免疫疗法有反应的小鼠黑色素瘤模型 |
| 14107 | 2024-08-07 |
Realistic in silico generation and augmentation of single-cell RNA-seq data using generative adversarial networks
2020-01-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-14018-z
PMID:31919373
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研究论文 | 本文提出使用条件单细胞生成对抗神经网络（cscGAN）来生成真实的单细胞RNA测序数据，以增强生物医学研究中的数据量 | cscGAN能够从复杂的多种细胞类型样本中学习非线性基因间依赖关系，并生成定义类型的真实细胞，优于现有的单细胞RNA测序数据生成方法 | NA | 旨在解决生物医学研究中观察数据量不足的问题，通过生成模拟样本增强真实观察数据，提高分析结果的鲁棒性和可重复性 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 生成对抗网络（GAN） | 基因表达数据 | NA |
| 14108 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of human kidney
2020-01-02, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-019-0351-8
PMID:31896769
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了正常人类肾脏的细胞分类和转录组信息 | 首次对正常人类肾脏的细胞进行了详细的单细胞RNA测序分析，并成功分类了肾小管近端细胞和集合管细胞的亚型 | 研究仅基于三位人类捐赠者的肾脏样本，可能存在样本量不足的问题 | 探讨正常人类肾脏的细胞组成和转录组信息，为肾病和肾癌的细胞起源研究提供参考 | 正常人类肾脏的细胞 | 数字病理学 | 肾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 23,366个高质量细胞，来自三位人类捐赠者的肾脏 |
| 14109 | 2024-08-07 |
A spatially restricted fibrotic niche in pulmonary fibrosis is sustained by M-CSF/M-CSFR signalling in monocyte-derived alveolar macrophages
2020-01, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.00646-2019
PMID:31601718
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研究论文 | 研究通过应用谱系追踪、单细胞RNA测序和单分子荧光杂交技术，揭示了在石棉诱导的肺纤维化中，单核细胞衍生的肺泡巨噬细胞通过M-CSF/M-CSFR信号通路维持纤维化微环境的作用。 | 首次揭示了单核细胞衍生的肺泡巨噬细胞在肺纤维化中的作用及其通过M-CSF/M-CSFR信号通路的自我维持机制，并发现M-CSFR信号通路是治疗肺纤维化的新药物靶点。 | NA | 探讨不同类型的巨噬细胞在器官纤维化中的作用机制，并寻找潜在的治疗靶点。 | 肺纤维化中的巨噬细胞及其信号通路。 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序、单分子荧光杂交 | NA | RNA | 人类和小鼠样本 |
| 14110 | 2024-08-07 |
Method for RNA extraction and transcriptomic analysis of single fungal spores
2020, MethodsX
IF:1.6Q2
DOI:10.1016/j.mex.2019.12.002
PMID:31908984
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研究论文 | 本文描述了一种从单个真菌孢子中提取和扩增转录本的方法，并应用于单细胞转录组学研究 | 该方法首次实现了对微生物孢子的单细胞转录组分析，填补了该领域的空白 | 该方法目前仅适用于真菌孢子，尚未在其他微生物细胞中进行测试 | 开发一种适用于单个真菌孢子转录组分析的新方法 | 真菌孢子 | NA | NA | 转录组分析 | NA | 转录本 | 单个真菌孢子 |
| 14111 | 2024-08-07 |
Chemical Cocktail Induces Hematopoietic Reprogramming and Expands Hematopoietic Stem/Progenitor Cells
2020-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.201901785
PMID:31921559
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研究论文 | 本文报道了通过化学混合物处理，无需引入外源基因即可将小鼠成纤维细胞重编程为造血细胞，并增强造血干细胞/祖细胞（HSPCs）的体外增殖能力 | 首次展示了通过化学混合物实现造血重编程，并促进HSPCs的体外增殖，为获取HSPCs提供了一种新策略 | NA | 探索通过化学混合物实现细胞重编程和HSPCs扩增的方法 | 小鼠成纤维细胞和造血干细胞/祖细胞 | NA | NA | 单细胞测序分析 | NA | 细胞 | NA |
| 14112 | 2024-08-07 |
The brain-placental axis: Therapeutic and pharmacological relevancy to pregnancy
2019-11, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2019.104468
PMID:31600597
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综述 | 本文综述了大脑-胎盘轴的当前知识状态，描述了胎盘与母体和胎儿大脑之间的功能相互作用，并特别强调了胎盘受体对妊娠期间大脑中表达的神经配体的治疗和药理学意义。 | 本文提出了综合药理基因组学、单细胞测序和芯片上器官系统的应用前景，以促进该研究领域的重要领域。 | 目前关于妊娠期神经内分泌功能的信息主要局限于下丘脑-垂体-肾上腺/性腺（HPA/HPG）轴的调节，特别是催产素和催乳素系统，而对大脑和胎盘之间系统级功能相互作用的知识存在重大空白。 | 旨在概述大脑-胎盘轴的当前知识状态，并探讨其在个性化医学和治疗胎盘及胎儿大脑疾病中的应用。 | 大脑-胎盘轴的功能相互作用及其在治疗和药理学中的相关性。 | NA | NA | 综合药理基因组学、单细胞测序、芯片上器官系统 | NA | NA | NA |
| 14113 | 2024-08-07 |
Deciphering Brain Complexity Using Single-cell Sequencing
2019-08, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2018.07.007
PMID:31586689
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在解析大脑复杂性方面的进展和应用 | 介绍了单细胞测序技术在脑研究中的新应用，如细胞类型分类、脑发育和脑疾病机制 | 讨论了单细胞测序领域面临的挑战和未来发展 | 旨在概述单细胞测序产生的大数据如何推动神经科学进步，并揭示理解脑功能和疾病的复杂问题 | 人类大脑中的细胞类型、连接性和功能 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组、基因组和/或表观基因组数据 | NA |
| 14114 | 2024-08-07 |
Non-inflammatory tumor microenvironment of diffuse intrinsic pontine glioma
2018-06-28, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-018-0553-x
PMID:29954445
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研究论文 | 本文比较了弥漫性内在脑桥胶质瘤（DIPG）和成人胶质母细胞瘤（GBM）的炎症特征 | 发现DIPG的肿瘤微环境具有较低的炎症特征，与成人GBM有显著差异 | NA | 探讨DIPG与成人GBM在炎症环境上的差异，为免疫治疗提供依据 | DIPG和成人GBM的肿瘤微环境炎症特征 | 数字病理学 | 儿童中枢神经系统恶性肿瘤 | RNA测序 | NA | RNA | DIPG和成人GBM的肿瘤样本 |
| 14115 | 2024-08-07 |
zUMIs - A fast and flexible pipeline to process RNA sequencing data with UMIs
2018-06-01, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giy059
PMID:29846586
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研究论文 | zUMIs是一个快速灵活的流程，用于处理带有UMIs的RNA测序数据 | zUMIs能够处理已知和随机的BCs，并有效折叠UMIs，还具有自适应降采样功能，有助于处理差异巨大的文库大小 | NA | 开发一个适用于使用BCs和UMIs的主要scRNA-seq协议的数据处理流程 | 单细胞RNA测序数据 | 测序技术 | NA | RNA-seq | NA | 文本 | 数百或数千个细胞 |
| 14116 | 2024-08-07 |
Absence of NEFL in patient-specific neurons in early-onset Charcot-Marie-Tooth neuropathy
2018-Jun, Neurology. Genetics
DOI:10.1212/NXG.0000000000000244
PMID:29888333
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研究论文 | 本研究使用患者特异性神经元培养物，探讨了神经丝轻链（NEFL）隐性无义突变在早发性夏科-马里-图斯（CMT）疾病中的分子遗传机制 | 首次展示了隐性无义突变导致NEFL mRNA几乎完全丢失，进而导致患者培养神经元中NEFL蛋白完全缺失，并提出神经丝积累可能是模拟NEFL缺失的一种机制 | 研究仅基于单一患者样本，可能存在样本代表性不足的问题 | 探究NEFL隐性无义突变在早发性CMT疾病中的分子遗传机制 | 患者特异性神经元培养物 | NA | 神经退行性疾病 | 定量PCR、蛋白质分析、免疫细胞化学、电子显微镜、单细胞转录组学 | NA | mRNA、蛋白质 | 单一患者样本 |
| 14117 | 2024-08-07 |
The Evolution of Gene-Specific Transcriptional Noise Is Driven by Selection at the Pathway Level
2018-01, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1534/genetics.117.300467
PMID:29097405
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研究论文 | 本文利用单细胞转录组数据研究了家鼠基因特异性转录噪声的进化驱动力 | 首次揭示了生物途径层面的自然选择对基因特异性转录噪声的影响 | NA | 探讨基因特异性转录噪声的进化驱动力 | 家鼠的单细胞转录组 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 14118 | 2024-08-07 |
Bringing Renal Biopsy Interpretation Into the Molecular Age With Single-Cell RNA Sequencing
2018-01, Seminars in nephrology
IF:2.8Q2
DOI:10.1016/j.semnephrol.2017.09.005
PMID:29291760
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在肾活检解释中的应用及其对肾脏疾病研究的影响 | 单细胞RNA测序技术能够同时测量数千个单细胞中的数千个基因表达，为全面描述人类肾脏疾病提供了新的视角 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在肾活检中的应用及其对肾脏疾病理解的潜在影响 | 肾活检样本及其在急性肾损伤、慢性肾脏病和同种异体移植功能障碍中的应用 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA |
| 14119 | 2024-08-07 |
Granatum: a graphical single-cell RNA-Seq analysis pipeline for genomics scientists
2017-Dec-05, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-017-0492-3
PMID:29202807
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研究论文 | 本文介绍了Granatum，一个基于网络的单细胞RNA测序（scRNA-Seq）分析管道，旨在使分析过程更广泛地适用于研究人员 | Granatum通过提供一个易于使用的图形界面，使没有编程技能的实验室科学家也能进行scRNA-Seq数据分析 | NA | 开发一个用户友好的scRNA-Seq数据分析工具，以促进单细胞RNA测序技术的广泛应用 | 单细胞RNA测序数据分析 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 14120 | 2024-08-07 |
The promise of single-cell RNA sequencing for kidney disease investigation
2017-12, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2017.06.033
PMID:28893418
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术的发展及其在肾脏疾病研究中的应用前景 | scRNA-seq技术能够在细胞分辨率下生成大量转录组数据，有助于发现新的细胞类型、状态和动态变化 | scRNA-seq数据分析存在计算挑战，且现有软件工具需进一步优化 | 探讨scRNA-seq技术在肾脏发育和疾病研究中的应用潜力 | 单细胞RNA测序技术及其在肾脏疾病研究中的应用 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |