单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27648 篇文献，本页显示第 14081 - 14100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 14081 | 2024-08-07 |
Matrisome gene-based subclassification of patients with liver fibrosis identifies clinical and molecular heterogeneities
2023-10-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000423
PMID:37098756
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研究论文 | 本文通过分析肝纤维化患者的转录组数据，识别并验证了与肝纤维化相关的基质基因（LFMGs），并探讨了这些基因在临床和生物学上的相关性 | 本文首次识别了与病因无关的肝纤维化特异性基质基因（LFMGs），并揭示了这些基因在肝纤维化进展和逆转中的表达模式和细胞景观 | NA | 旨在揭示与病因无关的基质基因，这些基因在临床上与肝纤维化相关 | 肝纤维化患者的转录组数据和临床特征 | 数字病理学 | 肝纤维化 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 35个肝纤维化特异性基质基因（LFMGs） |
| 14082 | 2024-08-07 |
An immune cell atlas reveals the dynamics of human macrophage specification during prenatal development
2023-09-28, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2023.08.019
PMID:37703875
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，绘制了人类胚胎发育期间（4-26周）巨噬细胞分化动态的图谱 | 首次在多个组织中识别出15种巨噬细胞亚型，包括类似小胶质细胞和促血管生成巨噬细胞，并揭示了它们在胚胎发育中的分布和功能 | NA | 揭示人类胚胎发育期间巨噬细胞的多样性和发育动态 | 人类胚胎发育期间的巨噬细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 涉及19个组织的巨噬细胞 |
| 14083 | 2024-08-07 |
Mapping the two distinct proliferative bursts early in T-cell development
2023-09, Immunology and cell biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1111/imcb.12670
PMID:37465975
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序结合轨迹推断方法，精确确定了T细胞发育过程中胸腺细胞进入细胞周期的时机 | 首次精确界定了T细胞发育早期两个增殖爆发的时间点，即在双阴性(DN) 2a阶段和DN3b阶段 | NA | 研究T细胞发育过程中早期的两个增殖爆发 | T细胞发育过程中的胸腺细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 14084 | 2024-08-07 |
RNA sequencing of single allergen-specific memory B cells after grass pollen immunotherapy: Two unique cell fates and CD29 as a biomarker for treatment effect
2023-03, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.15529
PMID:36153670
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了草花粉免疫治疗后特异性记忆B细胞的变化，并探讨了CD29作为治疗效果生物标志物的可能性 | 首次揭示了草花粉免疫治疗后特异性记忆B细胞存在两种独特的转录特征，并发现CD29可作为治疗效果的早期生物标志物 | 研究样本量较小，仅涉及四名患者，可能影响结果的普遍性 | 探讨草花粉免疫治疗对特异性记忆B细胞的影响及其作为治疗效果生物标志物的潜力 | 特异性记忆B细胞及其表面蛋白表达变化 | NA | 过敏性鼻炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 27名对黑麦草花粉敏感且患有季节性鼻炎的患者 |
| 14085 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA-seq analyses inform necroptosis-associated myeloid lineages influence the immune landscape of pancreas cancer
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1263633
PMID:38149248
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研究论文 | 研究揭示了胰腺癌中与坏死性凋亡相关的髓系细胞谱系对免疫环境的影响 | 首次识别出与坏死性凋亡相关的10个基因以及三种髓系细胞亚群体 | 未提及研究的局限性 | 探讨胰腺导管腺癌中肿瘤浸润髓系细胞的特性和影响 | 16名胰腺导管腺癌患者的肿瘤和正常组织细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | scRNA-seq | NA | 细胞 | 12个原发肿瘤组织和4个转移肿瘤组织，3个正常胰腺组织，以及PBMC样本 |
| 14086 | 2024-08-07 |
Myeloid PFKFB3-mediated glycolysis promotes kidney fibrosis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1259434
PMID:38035106
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研究论文 | 本研究探讨了髓系细胞中糖酵解途径在肾脏纤维化发展中的作用 | 首次揭示了髓系细胞中糖酵解途径在肾脏纤维化中的作用，并提出靶向髓系糖酵解是一种新的抑制肾脏纤维化的方法 | 研究主要基于小鼠模型，未来需在人类样本中验证其有效性和安全性 | 研究髓系细胞中糖酵解途径在肾脏纤维化中的作用 | 髓系细胞中的糖酵解途径及其在肾脏纤维化中的作用 | NA | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型中的髓系细胞 |
| 14087 | 2024-08-07 |
Chemical immune conization of precancerous cervical lesions awakens immune cells and restores normal HPV negative and abnormal proliferation
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1259723
PMID:38235142
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研究论文 | 研究使用半抗原增强的肿瘤内化疗（HEIC）治疗宫颈癌前病变和HPV感染的效果 | 提出了一种新的治疗策略，即通过半抗原增强的肿瘤内化疗来激活免疫细胞，防止宫颈癌前细胞的异常增殖 | 研究仅基于单一患者的细胞样本，可能需要进一步的临床试验来验证其普遍性和有效性 | 探讨半抗原增强的肿瘤内化疗对宫颈癌前病变和HPV感染的治疗效果 | 宫颈癌前病变组织和HPV感染 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 转录组 | 40,239个细胞 |
| 14088 | 2024-08-07 |
Novel tumor-associated macrophage populations and subpopulations by single cell RNA sequencing
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1264774
PMID:38347955
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综述 | 本文通过单细胞RNA测序技术探讨了四种新型肿瘤相关巨噬细胞亚群在不同实体瘤中的核心基因特征及其功能 | 利用单细胞RNA测序技术识别与特定功能相关的肿瘤相关巨噬细胞亚群 | 单细胞RNA测序识别的细胞类型和亚群与其实际功能之间可能存在潜在的脱节 | 探讨肿瘤相关巨噬细胞在不同实体瘤中的亚群及其功能 | 肿瘤相关巨噬细胞及其亚群 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 不同实体瘤组织中的多个样本 |
| 14089 | 2024-08-07 |
Recent advances in cancer-associated fibroblast: Biomarkers, signaling pathways, and therapeutic opportunities
2024-Mar-20, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003031
PMID:38420743
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综述 | 本文综述了癌症相关成纤维细胞（CAFs）的研究进展，重点关注其表型和功能的异质性、特定信号通路以及涉及CAFs的治疗策略 | 单细胞RNA测序和遗传工程小鼠模型增进了对CAF多样性的理解，并定义了许多亚型 | CAFs在肿瘤微环境中的复杂性仍大部分未知，且针对CAFs的临床试验结果并不乐观 | 探讨CAFs在肿瘤微环境中的作用及其作为潜在治疗靶点的可能性 | 癌症相关成纤维细胞（CAFs）及其在肿瘤微环境中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 14090 | 2024-08-07 |
Switch of innate to adaptative immune responses in the brain of patients with Alzheimer's disease correlates with tauopathy progression
2024-Mar-18, npj aging
IF:4.1Q2
DOI:10.1038/s41514-024-00145-5
PMID:38499592
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研究论文 | 本研究通过分析阿尔茨海默病（AD）患者大脑中的单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据，揭示了在tauopathy进展过程中，从先天免疫反应向适应性免疫反应的转变 | 首次通过单细胞RNA测序数据证实了阿尔茨海默病患者大脑中先天免疫反应向适应性免疫反应的转变 | NA | 探讨阿尔茨海默病中神经炎症的关键特征及其与tauopathy进展的关系 | 阿尔茨海默病患者大脑中的免疫反应变化 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 14091 | 2024-08-07 |
Activated mesenchymal stem/stromal cells promote myeloid cell differentiation via CCL2/CCR2 signaling
2024-Mar-12, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.02.002
PMID:38428413
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研究论文 | 本研究探讨了间充质干细胞/基质细胞（MSCs）通过CCL2/CCR2信号通路对造血干细胞/祖细胞（HSPCs）分化的影响 | 首次揭示了MSCs通过分泌CCL2促进粒细胞/巨噬细胞祖细胞向髓系分化的机制 | NA | 探索MSCs对HSPCs分化的影响及其机制 | 间充质干细胞、造血干细胞/祖细胞、髓系细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及小鼠和人类骨髓细胞 |
| 14092 | 2024-08-07 |
Antidepressant fluoxetine alleviates colitis by reshaping intestinal microenvironment
2024-03-12, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-024-01538-5
PMID:38475799
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research paper | 本文研究了抗抑郁药氟西汀通过重塑肠道微环境缓解结肠炎的作用及其分子机制 | 首次揭示了氟西汀通过影响不同细胞群的分布、细胞间通讯和KEGG通路富集来减轻结肠炎症的作用 | NA | 探讨抗抑郁药氟西汀缓解结肠炎的生物效应和分子机制 | C56BL/6小鼠的IBD模型及其对照组 | NA | Inflammatory bowel diseases (IBD) | RT-qPCR, western blot, 单细胞RNA测序, H&E染色, 免疫组织化学染色 | NA | 单细胞RNA测序数据 | C56BL/6小鼠的IBD模型及其对照组 |
| 14093 | 2024-08-07 |
An organism-wide atlas of hormonal signaling based on the mouse lemur single-cell transcriptome
2024-Mar-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46070-9
PMID:38467625
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研究论文 | 本研究利用鼠狐猴（Microcebus murinus）的全器官单细胞转录组图谱，系统地绘制了84类激素的源细胞和目标细胞 | 该研究揭示了先前未被表征的激素调控位点，并展示了激素信号网络密集连接、分散且富含反馈回路的特性 | NA | 旨在系统地研究激素信号在全器官水平上的作用 | 鼠狐猴的激素信号网络及其与人类的比较 | NA | NA | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | 涉及84类激素的源细胞和目标细胞 |
| 14094 | 2024-08-07 |
G protein subunit alpha i2's pivotal role in angiogenesis
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.92909
PMID:38505600
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研究论文 | 本研究探讨了Gαi2（G蛋白亚基alpha i2）在血管内皮细胞功能和血管生成中的潜在作用 | 首次详细研究了Gαi2在血管生成中的作用，并揭示了其在NFAT激活和内皮细胞激活中的关键角色 | NA | 研究Gαi2在血管生成中的作用及其对内皮细胞功能的影响 | Gαi2在血管内皮细胞中的表达及其对细胞增殖、迁移、侵袭和毛细血管形成的影响 | 生物学 | 糖尿病视网膜病变 | shRNA, CRISPR/Cas9, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 涉及多种内皮细胞类型和实验小鼠模型 |
| 14095 | 2024-08-07 |
Dynamic pathological analysis reveals a protective role against skin fibrosis for TREM2-dependent macrophages
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.94121
PMID:38505612
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研究论文 | 本研究通过建立小鼠疾病模型并进行单细胞RNA测序，探讨了TREM2依赖性巨噬细胞在皮肤纤维化中的保护作用 | 首次揭示了TREM2依赖性巨噬细胞在皮肤纤维化中的保护作用，并发现疾病相关TREM2巨噬细胞可能经历类似胎儿皮肤的再编程 | NA | 探讨TREM2依赖性巨噬细胞在皮肤纤维化中的作用及其分子机制 | TREM2依赖性巨噬细胞在皮肤纤维化中的作用 | 数字病理学 | 皮肤纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠和人类样本 |
| 14096 | 2024-08-07 |
An advanced comprehensive muti-cell-type-specific model for predicting anti-PD-1 therapeutic effect in melanoma
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.91626
PMID:38505619
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研究论文 | 本研究通过单核测序和多色免疫荧光染色技术，分析了黑色素瘤患者在接受抗PD-1治疗前后肿瘤组织的细胞亚群变化，并开发了一个基于这些亚群的预测模型，用于评估抗PD-1治疗的疗效 | 本研究首次描述了与抗PD-1治疗效果密切相关的四个细胞亚群，并构建了一个基于这些亚群的预测模型，为评估抗PD-1治疗效果提供了新方法 | 本研究主要集中在细胞亚群的识别和预测模型的开发，未详细探讨这些细胞亚群在抗PD-1治疗中的具体作用机制 | 探讨黑色素瘤患者接受抗PD-1治疗后的细胞亚群变化及其对治疗效果的影响 | 黑色素瘤患者的肿瘤组织 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单核测序 | 预测模型 | 细胞数据 | 多个黑色素瘤患者的肿瘤组织样本 |
| 14097 | 2024-08-07 |
Fibroblasts facilitate lymphatic vessel formation in transplanted heart
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.92103
PMID:38505621
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研究论文 | 本研究探讨了心脏移植后淋巴管形成的机制，特别是激活的成纤维细胞在其中的作用 | 首次揭示了激活的成纤维细胞在心脏移植后淋巴管形成中的关键作用，并阐明了相关的信号通路 | 研究主要集中在小鼠模型上，未来需要进一步在人类中验证这些发现 | 探究心脏移植后淋巴管形成的机制及其对移植心脏存活的影响 | 心脏移植后的淋巴管形成及激活的成纤维细胞的作用 | NA | NA | scRNA-seq, Elisa assay, Western blotting, Q-PCR, 免疫组织化学染色 | NA | 细胞数据 | 小鼠模型 |
| 14098 | 2024-08-04 |
Deep learning in spatial transcriptomics: Learning from the next next-generation sequencing
2023-Mar, Biophysics reviews
IF:2.9Q2
DOI:10.1063/5.0091135
PMID:38505815
|
综述 | 本文综述了用于空间转录组学分析的深度学习方法 | 提出了利用深度学习模型解决空间转录组学特定挑战的新方法 | 目前深度学习模型尚处于初期阶段，需要进一步探索 | 研究深度学习在空间转录组学中的应用及其潜力 | 空间转录组学的数据分析方法 | 机器学习 | NA | 转录组学 | 深度学习模型 | 多模态数据，包括组织学图像和计数矩阵 | NA |
| 14099 | 2024-08-07 |
Single-cell sequencing of diverse microorganisms
2024-Apr, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-024-00708-y
PMID:38366032
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 14100 | 2024-08-04 |
Recent advances in differential expression analysis for single-cell RNA-seq and spatially resolved transcriptomic studies
2024-Mar-20, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elad011
PMID:37022699
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综述 | 本文讨论了单细胞RNA测序和空间解析转录组数据的差异表达分析的最新进展 | 本文填补了有关多条件、多样本实验设计的单细胞RNA测序和空间解析转录组数据差异表达基因检测的综述空白 | 缺乏对现有DE工具的系统评估 | 研究单细胞RNA-seq和空间解析转录组的差异表达分析 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和空间解析转录组(SRT)数据的差异表达基因 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | NA | NA |