单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 14081 - 14100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 14081 | 2024-08-07 |
S100A9+CD14+ monocytes contribute to anti-PD-1 immunotherapy resistance in advanced hepatocellular carcinoma by attenuating T cell-mediated antitumor function
2024-Mar-08, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-02985-1
PMID:38454445
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研究论文 | 本研究探讨了S100A9+CD14+单核细胞在晚期肝细胞癌患者中通过减弱T细胞介导的抗肿瘤功能，促进对PD-1免疫疗法的抵抗作用 | 本研究首次揭示了S100A9+CD14+单核细胞作为预测免疫检查点抑制剂治疗效果的生物标志物，并提出了通过抑制S100A9来增强免疫疗法效果的新策略 | NA | 旨在探索晚期肝细胞癌患者接受PD-1单药治疗前可预测治疗效果的外周生物标志物，并阐明免疫检查点阻断抵抗的分子机制 | 晚期肝细胞癌患者及其对PD-1免疫疗法的反应 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 血液样本 | 晚期肝细胞癌患者的血液样本 |
| 14082 | 2024-08-07 |
Single-cell profiling identifies IL1Bhi macrophages associated with inflammation in PD-1 inhibitor-induced inflammatory arthritis
2024-Mar-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46195-x
PMID:38453911
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了PD-1抑制剂诱导的炎症性关节炎（PD-1-IA）和类风湿性关节炎（RA）患者的外周血和滑液中的CD45细胞，发现PD-1-IA中IL1B髓系细胞的显著扩张及其与耗竭的CD8 T细胞的相互作用。 | 首次揭示了PD-1抑制剂诱导的炎症性关节炎中IL1B髓系细胞的扩张及其与耗竭CD8 T细胞的相互作用，为该疾病的治疗提供了新的潜在靶点。 | 研究仅限于外周血和滑液样本，未涉及其他组织或器官，可能限制了对疾病机制的全面理解。 | 探讨PD-1抑制剂诱导的炎症性关节炎与类风湿性关节炎在细胞和分子水平上的差异。 | PD-1抑制剂诱导的炎症性关节炎和类风湿性关节炎患者的外周血和滑液中的CD45细胞。 | 数字病理学 | 炎症性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | PD-1抑制剂诱导的炎症性关节炎和类风湿性关节炎患者的外周血和滑液样本 |
| 14083 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics data and analytical methods: An updated perspective
2024-Mar, Drug discovery today
IF:6.5Q1
DOI:10.1016/j.drudis.2024.103889
PMID:38244672
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综述 | 本文讨论了空间转录组学的数据库和基于深度学习的空间转录组数据分析模型 | 本文为空间转录组学领域的分析方法提供了更新的视角，强调了AI技术的整合 | 尽管在ST数据分析技术方面取得了显著进展，但模型的生物学相关性仍需提升 | 研究空间转录组学数据分析方法及其在生物医学中的应用 | 空间转录组学相关的数据库和深度学习模型 | 数字病理学 | NA | 高分辨率成像与转录组学 | 深度学习模型 | 转录组数据 | NA |
| 14084 | 2024-08-04 |
Construction and analysis of a joint diagnostic model of machine learning for cryptorchidism based on single-cell sequencing
2024-Mar, Birth defects research
IF:1.6Q4
DOI:10.1002/bdr2.2316
PMID:38459615
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研究论文 | 本研究开发了一种新型的隐睾诊断模型，并确定了与隐睾相关的新生物标志物 | 创新点在于利用人工神经网络构建隐睾的新型诊断模型，并通过单细胞测序分析验证中心基因 | 未提及此模型在临床应用中的局限性 | 研究的目的是开发隐睾的新诊断模型并识别新的生物标志物 | 研究对象为隐睾患者的RNA测序数据 | 数字病理学 | 隐睾 | RNA测序 | 人工神经网络 | 基因表达数据 | 样本来源于南通大学医院和基因表达综合数据库(GEO) |
| 14085 | 2024-08-07 |
Staphylococcus aureus lysate induces an IgE response via memory B cells in nasal polyps
2024-Mar, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2023.10.033
PMID:38056634
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研究论文 | 研究探讨了金黄色葡萄球菌裂解物在慢性鼻窦炎伴鼻息肉（CRSwNP）中诱导IgE合成的机制 | 首次揭示了金黄色葡萄球菌通过IgE阴性记忆B细胞在CRSwNP患者中诱导IgE反应的机制 | NA | 研究金黄色葡萄球菌是否能在CRSwNP中诱导异常IgE合成及其潜在机制 | 金黄色葡萄球菌裂解物对CRSwNP中IgE合成的影响及机制 | NA | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | ELISA, 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 定量逆转录PCR, 免疫组织化学, 免疫荧光 | NA | 细胞 | NA |
| 14086 | 2024-08-07 |
Altered tumor signature and T-cell profile after chemotherapy reveal new therapeutic opportunities in high-grade serous ovarian carcinoma
2024-Mar, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.16074
PMID:38226451
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和T细胞受体测序技术，探讨了高级别浆液性卵巢癌（HGSOC）患者在接受化疗后肿瘤标志物和T细胞谱的变化 | 揭示了化疗后肿瘤标志物和T细胞谱的显著变化，为克服治疗抵抗提供了新的治疗策略线索 | NA | 理解并解决高级别浆液性卵巢癌患者化疗抵抗的问题 | 高级别浆液性卵巢癌患者的组织样本 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序，T细胞受体测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 14087 | 2024-08-04 |
Nicotinamide riboside activates renal metabolism and protects the kidney in a model of Alport syndrome
2024-Feb-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.26.580911
PMID:38464264
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研究论文 | 这篇文章展示了烟酰胺核糖在Alport综合征小鼠模型中激活肾脏代谢并保护肾脏的作用 | 首次在Alport小鼠模型中发现烟酰胺核糖补充恢复近端肾小管中的脂肪酸氧化，并揭示了性别差异 | 当前对NAD补充的保护机制及其主要负责的细胞类型理解较少 | 研究烟酰胺核糖对慢性肾病的保护作用及其机制 | 使用Alport综合征小鼠模型进行研究 | 数字病理学 | 慢性肾病 | RNA测序 | 小鼠模型 | 转录组数据 | NA |
| 14088 | 2024-08-07 |
WITHDRAWN: The effect of ischemia on expression quantitative trait loci (eQTL) in human myocardium and insights into myocardial injury etiology
2024-Feb-20, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3967889/v1
PMID:38464039
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研究论文 | 本研究通过RNA测序和单细胞RNA测序分析了118名接受主动脉瓣置换手术患者的心肌组织样本，探讨缺血对人类心肌表达数量性状位点（eQTL）的影响及其与心肌损伤病因的关系 | 本研究首次在人类心肌组织中识别并复制了缺血条件下的局部表达数量性状位点（cis-eQTL），并结合基因组关联研究，确定了心肌损伤的因果基因 | 研究样本主要集中在接受特定心脏手术的患者，可能限制了结果的普遍性 | 旨在理解人类心肌缺血的病理过程，并探索心肌损伤的病因 | 人类心肌组织样本及心肌损伤的因果基因 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 118名患者的心肌组织样本及2,371名患者的独立队列 |
| 14089 | 2024-08-04 |
Spatial analyses: Focusing on immune-stromal interactions to understand immunity in the tissue context
2024-Feb, Seminars in arthritis and rheumatism
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.semarthrit.2023.152319
PMID:38040516
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研究论文 | 本文探讨免疫细胞在组织环境中的作用，重点分析免疫-基质相互作用 | 运用多重免疫荧光组织学结合基于机器学习的细胞分割和注释方法，以识别和定位稀有免疫细胞群体 | 是否类似的机制适用于其他与纤维化相关的疾病尚待进一步研究 | 全面了解免疫细胞在组织环境中的功能及其微环境的影响 | 研究不同人类组织中的免疫细胞，特别是固有淋巴细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 多重免疫荧光组织学 | 机器学习 | 组织切片 | 涉及多种人类组织中的稀有免疫细胞群体 |
| 14090 | 2024-08-07 |
Transcriptome network analysis of inflammation and fibrosis in keloids
2024-Feb, Journal of dermatological science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.jdermsci.2023.12.007
PMID:38242738
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研究论文 | 本文通过转录组测序和微小RNA测序，分析了人类瘢痕疙瘩组织与正常皮肤组织中的炎症和纤维化转录组图谱，并利用单细胞RNA测序研究了细胞间通讯网络和成纤维细胞的多样性 | 本文首次通过多组学数据揭示了瘢痕疙瘩中炎症细胞与成纤维细胞之间的细胞间对话，并发现了可能与瘢痕疙瘩发展相关的miRNA和基因 | 研究样本量较小，仅包括六个瘢痕疙瘩组织和两个正常皮肤样本，可能影响结果的普遍性 | 探究瘢痕疙瘩中炎症和纤维化的转录组图谱 | 瘢痕疙瘩组织和正常皮肤组织 | 数字病理学 | 皮肤肿瘤 | 转录组测序、微小RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据、微小RNA数据、单细胞RNA数据 | 六个瘢痕疙瘩组织和两个正常皮肤样本，共24,086个细胞 |
| 14091 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA profiling reveals classification and characteristics of mononuclear phagocytes in colorectal cancer
2024-Feb, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011176
PMID:38408082
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，对结直肠癌中的单核吞噬细胞进行了分类和特征分析 | 本研究发现了与结直肠癌预后相关的新亚群，并揭示了调控单核吞噬细胞分化的转录因子调控网络 | NA | 深入全面地理解单核吞噬细胞的免疫功能 | 结直肠癌中的单核吞噬细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 6种不同的单核吞噬细胞亚群 |
| 14092 | 2024-08-07 |
Quantifying and correcting bias in transcriptional parameter inference from single-cell data
2024-01-02, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2023.10.021
PMID:37885177
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研究论文 | 本文开发了一种理论，用于解释在使用标准电报模型从单细胞数据推断参数时估计偏差的大小和符号 | 本文发现了特定偏差特征，这些特征取决于外在噪声的来源（即哪个参数在细胞间变化最大）和转录活性模式 | 本文假设没有外在噪声，即参数在细胞间不变化，因此估计的参数应理解为近似群体中的平均值 | 量化并修正从单细胞数据推断转录参数时的偏差 | 单细胞数据中的mRNA计数分布和转录参数 | 分子生物学 | NA | 单分子荧光原位杂交，单细胞RNA测序 | 两状态电报模型 | 单细胞数据 | NA |
| 14093 | 2024-08-07 |
Combined BRAF, MEK, and heat-shock protein 90 inhibition in advanced BRAF V600-mutant melanoma
2024-01, Cancer
IF:6.1Q1
DOI:10.1002/cncr.35029
PMID:37776537
|
研究论文 | 本研究探讨了在晚期BRAF V600突变型黑色素瘤中，联合使用BRAF、MEK抑制剂及热休克蛋白90（HSP90）抑制剂的效果。 | 本研究首次尝试在晚期BRAF V600突变型黑色素瘤中联合使用BRAF、MEK及HSP90抑制剂，并评估了其疗效和安全性。 | 联合治疗显示出显著的毒性，需要频繁减少剂量，这可能导致了相对较低的无进展生存期，尽管肿瘤反应率较高。 | 评估在晚期BRAF V600突变型黑色素瘤中，联合使用BRAF、MEK及HSP90抑制剂的疗效和安全性。 | 晚期BRAF V600突变型黑色素瘤患者。 | NA | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 25名患者 |
| 14094 | 2024-08-07 |
Corrigendum: Dissecting the single-cell transcriptome network of immune environment underlying cervical premalignant lesion, cervical cancer and metastatic lymph nodes
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1386072
PMID:38464538
|
correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 14095 | 2024-08-04 |
Protocol for isolation of signet ring cells from human gastric mucosa
2023-Dec-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102695
PMID:37925632
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研究论文 | 本文介绍了一种从人类胃黏膜中分离信封细胞的方法。 | 该研究提供了一种高生存率的信封细胞悬浮液制备方案，可能用于进一步的研究和临床应用。 | 未提及研究的样本数量和其他可能的实验限制。 | 研究旨在开发一种有效提取信封细胞的方法以用于进一步分析。 | 研究对象为人类胃黏膜中的信封细胞。 | 数字病理学 | NA | 免疫组化染色，流式细胞术，单细胞测序 | NA | 细胞悬浮液 | NA |
| 14096 | 2024-08-04 |
Protocol to combine brain sections from multiple mice into a single block for spatial transcriptomic analyses
2023-Dec-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102617
PMID:37742175
|
研究论文 | 这篇文章介绍了一种将多个小鼠的脑部切片合并为单个块的方法，以进行空间转录组分析 | 创新点在于提出了一种能够减少试剂消耗并同时处理多鼠样本的协议 | 没有提及具体的实验验证结果或对该协议的局限性分析 | 研究多个小鼠大脑样本的空间转录组特征 | 多个小鼠的海马切片 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 切片 | 多个小鼠 |
| 14097 | 2024-08-07 |
Protocol for PPP1R15A-inhibited mouse model establishment with subcutaneous B16F1 tumor and single-cell analysis
2023-Dec-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102616
PMID:37756156
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研究论文 | 本文介绍了一种探索PPP1R15A抑制剂Sephin1对小鼠B16F1皮下肿瘤抗肿瘤免疫影响的实验方案 | 提出了构建单细胞转录组和TCR文库的方法，并详细描述了基因分化、调控子和细胞间通信分析的步骤 | NA | 探索PPP1R15A抑制剂Sephin1对小鼠B16F1皮下肿瘤抗肿瘤免疫的影响 | 小鼠B16F1皮下肿瘤 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 14098 | 2024-08-07 |
Protocol for isolating single cells from human pancreatic cancer tissues and analyzing major immune cell populations using flow cytometry
2023-Dec-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102679
PMID:37910511
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研究论文 | 本文介绍了一种从人胰腺癌组织中分离单细胞并使用流式细胞术分析主要免疫细胞群体的协议 | 提供了从胰腺癌组织中分离免疫细胞并进行流式细胞术分析的详细方法 | NA | 开发和描述一种用于从胰腺癌组织中分离和分析免疫细胞的方法 | 人胰腺癌组织中的免疫细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 流式细胞术 | NA | 细胞 | NA |
| 14099 | 2024-08-07 |
TimiGP: An R package to depict the tumor microenvironment from bulk transcriptomics
2023-Dec-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102742
PMID:38019649
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研究论文 | 本文介绍了一种基于基因对的R包TimiGP，用于从大量转录组数据中描绘肿瘤微环境，推断细胞间相互作用，并揭示免疫细胞相对丰度与患者预后之间的关系 | 提出了一种新的方法，通过基因对来描绘肿瘤免疫微环境，并结合单细胞RNA测序数据来映射不同癌症类型的肿瘤免疫微环境 | NA | 探索肿瘤微环境中不同免疫细胞类型的临床相关性，以揭示癌症复杂性并开发治疗方案 | 肿瘤微环境中的免疫细胞类型及其与患者预后的关联 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 14100 | 2024-08-07 |
Protocol for nuclear dissociation of the adult C. elegans for single-nucleus RNA sequencing and its application for mapping environmental responses
2023-Dec-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102756
PMID:38043054
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研究论文 | 本文介绍了一种用于成年C. elegans单核RNA测序的核解离协议，并应用于环境响应的映射 | 提出了针对C. elegans的单核RNA测序（snRNA-seq）协议，克服了单细胞RNA测序中的困难 | NA | 旨在克服C. elegans中单细胞RNA测序的困难，并应用于环境响应的研究 | 成年C. elegans的核解离和单核RNA测序 | 分子生物学 | NA | 单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | RNA | 未具体说明样本数量 |