单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27279 篇文献，本页显示第 14081 - 14100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 14081 | 2024-08-07 |
Microglia sense astrocyte dysfunction and prevent disease progression in an Alexander disease model
2024-02-01, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awad358
PMID:37955589
|
研究论文 | 本研究探讨了微胶质细胞在亚历山大疾病模型中感知星形胶质细胞功能障碍并防止疾病进展的作用 | 首次展示了微胶质细胞通过P2Y12受体感知星形胶质细胞功能障碍，并通过改变形态和钙信号传导来保护对抗亚历山大疾病病理 | NA | 探究微胶质细胞在亚历山大疾病中的作用及其机制 | 微胶质细胞和星形胶质细胞在亚历山大疾病模型中的相互作用 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 免疫组织化学研究，钙成像，单细胞RNA测序，ATP成像 | NA | 图像数据 | 60TM小鼠模型和野生型小鼠 |
| 14082 | 2024-08-07 |
A novel batch-effect correction method for scRNA-seq data based on Adversarial Information Factorization
2024-Feb, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1011880
PMID:38386700
|
研究论文 | 本文提出了一种基于对抗信息分解的新型批次效应校正方法，用于单细胞RNA测序数据 | 该方法不依赖于细胞类型的先验知识或特定的标准化策略，适用于任何下游分析任务，并在多种情况下优于现有技术 | NA | 旨在解决单细胞RNA测序数据中的批次效应问题 | 单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 白血病 | scRNA-seq | 对抗信息分解 | 基因表达数据 | NA |
| 14083 | 2024-08-07 |
Soluble TREM2 triggers microglial dysfunction in neuromyelitis optica spectrum disorders
2024-01-04, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awad321
PMID:37740498
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研究论文 | 研究探讨了可溶性触发受体表达于髓样细胞2（sTREM2）在神经脊髓炎视谱系疾病（NMOSD）中的病理生理作用及其作为生物标志物的潜力 | 通过孟德尔随机化分析和单细胞RNA测序，揭示了sTREM2与NMOSD风险之间的遗传关联，并阐明了sTREM2介导的微胶质细胞功能障碍的分子机制 | NA | 阐明sTREM2在NMOSD中的病理生理作用及其作为治疗靶点的潜力 | sTREM2在NMOSD患者中的表达及其对微胶质细胞功能的影响 | 神经科学 | 神经脊髓炎视谱系疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人类巨噬细胞/微胶质样细胞样本 |
| 14084 | 2024-08-07 |
Characterizing hedgehog pathway features in senescence associated osteoarthritis through Integrative multi-omics and machine learning analysis
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1255455
PMID:38444758
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研究论文 | 本研究通过整合多组学和机器学习分析，探讨了Hedgehog信号通路在衰老相关骨关节炎中的特征 | 首次结合Bulk RNA-seq和scRNA-seq技术，识别并验证了与骨关节炎相关的Hedgehog信号通路中的关键基因 | NA | 旨在阐明Hedgehog信号通路在骨关节炎发病机制中的作用 | 骨关节炎中的Hedgehog信号通路及相关基因 | 机器学习 | 骨关节炎 | RNA-seq, scRNA-seq, Real-time PCR | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 涉及八个Bulk RNA-seq数据集和一个scRNA-seq数据集 |
| 14085 | 2024-08-07 |
Chronic chromosome instability induced by Plk1 results in immune suppression in breast cancer
2023-12-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113266
PMID:37979172
|
研究论文 | 本研究通过在Her2乳腺癌模型中过度表达Polo样激酶1（Plk1），探讨了染色体不稳定（CIN）相关的分子特征如何改变肿瘤进化过程中的免疫识别 | 发现高CIN肿瘤通过激活衰老相关分泌表型（SASP）、上调PD-L1和CD206以及诱导非细胞自主核因子κB（NF-κβ）信号，促进免疫逃逸 | NA | 理解CIN相关的分子特征如何影响肿瘤进化过程中的免疫识别 | Her2乳腺癌模型中过度表达Plk1的高CIN肿瘤 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自癌前乳腺组织的单细胞RNA测序数据 |
| 14086 | 2024-08-04 |
Division-Independent Differentiation of Muscle Stem Cells During a Growth Stimulus
2023-Dec-08, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxad091
PMID:38066665
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研究论文 | 这篇文章探讨了成体肌肉干细胞在生长刺激下是否与细胞分裂相关的分化过程 | 提出了一种新的小鼠模型，用于跟踪肌肉干细胞衍生的肌肉细胞核，发现了一种与细胞分裂无关的肌肉干细胞分化和融合 | 研究仅限于小鼠模型，可能无法完全适用于人类肌肉干细胞 | 研究成体肌肉干细胞对生长刺激的反应及其分化机制 | 成体肌肉干细胞的不同转录亚群 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 在小鼠中进行了5天的生长刺激实验 |
| 14087 | 2024-08-07 |
Low-density lipoprotein receptor promotes crosstalk between cell stemness and tumor immune microenvironment in breast cancer: a large data-based multi-omics study
2023-11-30, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04699-y
PMID:38037058
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研究论文 | 本研究通过大规模多组学数据分析，探讨了低密度脂蛋白受体（LDLR）在乳腺癌细胞干性和肿瘤免疫微环境交互作用中的作用 | 首次揭示了LDLR在乳腺癌细胞干性和肿瘤免疫微环境交互作用中的关键作用 | 主要依赖于公共数据库的数据，缺乏体内实验验证 | 识别破坏乳腺癌细胞干性和免疫微环境之间通信的潜在靶点 | 乳腺癌细胞的干性和肿瘤免疫微环境 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA测序, 蛋白质组学分析, 单细胞RNA测序 | Lasso回归分析, Cox生存回归模型 | RNA序列数据, 蛋白质数据 | 3132名乳腺癌患者 |
| 14088 | 2024-08-07 |
The construction of a testis transcriptional cell atlas from embryo to adult reveals various somatic cells and their molecular roles
2023-11-27, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04722-2
PMID:38012716
|
研究论文 | 本文构建了一个从胚胎到成年的睾丸转录细胞图谱，揭示了各种体细胞及其分子作用 | 通过整合单细胞RNA测序数据，构建了跨五个发育阶段的睾丸转录细胞图谱，并使用多种分析技术进行了全面分析 | NA | 更好地理解睾丸从胚胎到成年的发育变化 | 睾丸中的体细胞和生殖细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过26,000个细胞 |
| 14089 | 2024-08-04 |
Talniflumate abrogates mucin immune suppressive barrier improving efficacy of gemcitabine and nab-paclitaxel treatment in pancreatic cancer
2023-11-23, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04733-z
PMID:37996891
|
研究论文 | 本研究探讨了talniflumate如何克服粘蛋白的免疫抑制屏障，从而增强吉西他滨和纳米紫杉醇在胰腺癌治疗中的疗效 | 本研究揭示了GCNT3作为粘蛋白表达的主要调节因子，并提出其作为talniflumate作用的可行靶点 | 研究中使用的样本量较小，仅分析了43个胰腺管内乳头状粘液瘤（IPMN），且主要集中于特定的粘蛋白通路 | 研究旨在识别肿瘤微环境中的免疫抑制机制，并提高对胰腺癌的治疗效果 | 研究对象包括低级和高级胰腺管内乳头状粘液瘤，胰腺癌类器官及T细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学 | 小鼠同种异体模型 | 基因表达数据 | 43个胰腺管内乳头状粘液瘤样本（12个低级，31个高级） |
| 14090 | 2024-08-07 |
Correction: iDESC: identifying differential expression in single-cell RNA sequencing data with multiple subjects
2023-Oct-19, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-023-05523-6
PMID:37858060
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 14091 | 2024-08-07 |
iDESC: identifying differential expression in single-cell RNA sequencing data with multiple subjects
2023-Aug-22, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-023-05432-8
PMID:37608264
|
研究论文 | 本文开发了iDESC方法，用于在包含多个受试者的单细胞RNA测序数据中检测细胞类型特异性的差异表达基因 | iDESC采用零膨胀负二项混合模型，同时考虑了受试者效应和数据中的脱落事件，提高了差异表达分析的准确性和稳健性 | NA | 开发和评估一种新的方法，用于在单细胞RNA测序数据中进行差异表达分析，特别是在考虑多个受试者效应和数据脱落事件的情况下 | 单细胞RNA测序数据中的差异表达基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 零膨胀负二项混合模型 | RNA测序数据 | 多个受试者 |
| 14092 | 2024-08-04 |
Debiased personalized gene coexpression networks for population-scale scRNA-seq data
2023-06, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.277363.122
PMID:37295843
|
研究论文 | 本文提出了一种名为Dozer的方法，用于修正来自scRNA-seq数据集的基因-基因相关性估计。 | Dozer能够消除来自低稀疏表达基因的相关性估计偏差，并能准确量化个体间的网络级变异。 | 尽管Dozer在多种情况下表现出鲁棒性，但仍可能受到技术限制和数据噪声的影响。 | 本研究旨在估计个性化的基因共表达网络，以便在单细胞RNA-seq数据中量化表达变异。 | 研究对象包括来自不同个体的人诱导多能干细胞和阿尔茨海默病后人类组织提取的少突胶质细胞。 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 普瓦松测量模型 | 基因表达数据 | 涉及不同个体的多条人诱导多能干细胞系和人类组织样本 |
| 14093 | 2024-08-07 |
Analysis of immunogenic cell death in atherosclerosis based on scRNA-seq and bulk RNA-seq data
2023-Jun, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.110130
PMID:37075670
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研究论文 | 本文通过scRNA-seq和bulk RNA-seq数据分析了动脉粥样硬化中免疫原性细胞死亡的作用 | 首次系统研究了动脉粥样硬化中的免疫原性细胞死亡，并探讨了其相关基因作为治疗靶点的可能性 | NA | 探讨免疫原性细胞死亡在动脉粥样硬化中的作用及其相关基因的治疗潜力 | 动脉粥样硬化中的免疫原性细胞死亡及相关基因 | 数字病理学 | 心血管疾病 | scRNA-seq, bulk RNA-seq | 随机森林 | RNA序列数据 | 动脉粥样硬化斑块单细胞RNA序列数据及大量RNA序列数据 |
| 14094 | 2024-08-04 |
Evaluation of zero counts to better understand the discrepancies between bulk and single-cell RNA-Seq platforms
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.09.035
PMID:37841335
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研究论文 | 文章探讨了批量RNA测序与单细胞RNA测序之间的差异以及零计数的影响 | 发现RNA完整性、基因长度及转录本数量对零计数的影响，为跨平台表达偏移修正开发新方法提供了基础 | 仅通过四组配对数据分析，样本量或数据丰富性可能有限 | 旨在理解批量与单细胞RNA测序在表达测量上的差异 | 研究对象为测序平台的技术和生物因素以及基因和生物通路 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | 机器学习模型 | 转录组数据 | 四组配对数据集，每组含多个样本 |
| 14095 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing provides novel insights to pathologic pathways in abdominal aortic aneurysm
2023, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2023.1172080
PMID:37288252
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review | 本文综述了利用单细胞RNA测序技术在腹主动脉瘤发病机制研究中的应用 | 单细胞RNA测序技术提供了无偏见的、全局性的转录组特征视图，有助于识别腹主动脉瘤形成的关键通路 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在腹主动脉瘤分析中的应用趋势和未来潜力 | 腹主动脉瘤的发病机制 | digital pathology | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA |
| 14096 | 2024-08-04 |
Exercise potentially prevents colorectal cancer liver metastases by suppressing tumor epithelial cell stemness via RPS4X downregulation
2024-Mar-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e26604
PMID:38439884
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研究论文 | 本研究探讨了运动通过下调RPS4X抑制结直肠癌肝转移的机制 | 研究首次揭示了运动通过调节RPS4X表达来抑制结直肠癌的干性和转移风险 | 该研究主要依赖于生物信息学分析和实验验证，临床数据的验证尚未充分 | 研究运动对结直肠癌肝转移的影响及其机制 | 重点研究结直肠癌的上皮细胞及其干性标志物 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序分析、肿瘤微阵列、细胞/动物实验 | NA | 基因表达数据 | 19331个样本，涉及多种癌症数据集 |
| 14097 | 2024-08-07 |
Liver-restricted Type I IFN Signature Precedes Liver Damage in Chronic Hepatitis B Patients Stopping Antiviral Therapy
2024-Mar-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300569
PMID:38294274
|
研究论文 | 本研究追踪了停止抗病毒治疗的慢性乙型肝炎患者肝脏中的免疫成分和激活状态，使用流式细胞术和单细胞RNA测序分析，发现I型干扰素信号在肝脏损伤前出现。 | 首次揭示了I型干扰素信号在慢性乙型肝炎患者肝脏损伤前的出现，并确认了MIF在炎症反应中的作用。 | 研究样本量未明确提及，且仅限于慢性乙型肝炎患者，可能限制了结果的普遍性。 | 探讨慢性乙型肝炎患者停止抗病毒治疗后，肝脏损伤前的早期免疫激活事件。 | 慢性乙型肝炎患者的肝脏免疫反应。 | NA | 乙型肝炎 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA | NA |
| 14098 | 2024-08-07 |
CD169+ classical monocyte as an important participant in Graves' ophthalmopathy through CXCL12-CXCR4 axis
2024-Mar-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109213
PMID:38439953
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research paper | 本研究通过单细胞RNA测序和多平台分析，探讨了CD169经典单核细胞在Graves眼病中的作用及其通过CXCL12-CXCR4轴的机制 | 首次揭示了CD169经典单核细胞在Graves眼病中的临床意义及其分化为CD169巨噬细胞促进炎症、脂肪生成和纤维化的作用 | 需要进一步研究针对循环中单核细胞和CXCL12-CXCR4轴的治疗策略 | 探究Graves眼病的病理机制及其潜在的治疗靶点 | Graves病和Graves眼病患者 | NA | Graves眼病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括Graves病和Graves眼病患者 |
| 14099 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome profiling implicates the psychological stress-induced disruption of spermatogenesis
2024-Mar-12, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2024.102158
PMID:38439912
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了心理压力对大鼠精子发生的影响，揭示了心理压力导致的细胞和分子层面的变化 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了心理压力对精子发生的细胞和分子机制的影响 | 研究仅限于大鼠模型，未来需要进一步在其他物种中验证这些发现 | 揭示心理压力如何通过细胞和分子机制影响精子发生 | 心理压力对大鼠精子发生的影响 | 数字病理学 | 男性不育 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 11,744个睾丸细胞 |
| 14100 | 2024-08-07 |
Lineage and ecology define liver tumor evolution in response to treatment
2024-Feb-20, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101394
PMID:38280378
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学方法，研究了肝癌患者肿瘤样本在治疗过程中的进化轨迹 | 提出了一种基于细胞谱系和生态学的评分系统，用于监测肿瘤在治疗干预下的进化 | NA | 研究肝癌在治疗反应中的进化机制 | 肝癌患者的肿瘤样本 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 716名肝癌患者 |