单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 14061 - 14080 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 14061 | 2024-08-07 |
Dynamics of host immune responses and a potential function of Trem2hi interstitial macrophages in Pneumocystis pneumonia
2024-Feb-05, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-024-02709-1
PMID:38317180
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研究论文 | 本研究通过时间分辨的单细胞RNA测序分析，探讨了Pneumocystis肺炎过程中宿主免疫反应的变化及Trem2hi间质巨噬细胞的潜在作用 | 首次详细描述了Pneumocystis肺炎过程中免疫细胞的动态转录变化，并揭示了PCP相关巨噬细胞（PAM）在疾病中的作用 | 研究主要基于小鼠模型，可能需要进一步的人体研究来验证结果 | 阐明Pneumocystis肺炎过程中宿主免疫反应的动态变化及Trem2hi间质巨噬细胞的功能 | Pneumocystis肺炎感染的小鼠肺组织中的CD45+细胞 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 感染Pneumocystis的小鼠肺组织中的CD45+细胞 |
| 14062 | 2024-08-07 |
Neutrophils in the era of single-cell RNA sequencing: functions and targeted therapies in cancer
2024-02-05, Cancer biology & medicine
IF:5.6Q1
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 14063 | 2024-08-05 |
Single-cell and spatial profiling identify three response trajectories to pembrolizumab and radiation therapy in triple negative breast cancer
2024-01-08, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2023.12.012
PMID:38194915
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和空间蛋白组学分析三阴性乳腺癌对pembrolizumab和放疗的反应轨迹 | 首次识别了三阴性乳腺癌患者对pembrolizumab和联合放疗的三种不同反应轨迹 | 该研究的样本主要集中于三阴性乳腺癌，可能不适用于其他类型的癌症 | 旨在改善对接受单一免疫疗法或需要额外治疗的患者的识别 | 三阴性乳腺癌活检样本，比较治疗前后的免疫微环境 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞转录组学和空间蛋白组学 | 小鼠模型 | 生物样本 | NA |
| 14064 | 2024-08-07 |
Neoadjuvant radioimmunotherapy synergy in triple-negative breast cancer: Is microenvironment-guided patient selection on the horizon?
2024-01-08, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2023.12.009
PMID:38194911
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研究论文 | 研究探讨了新辅助化疗联合免疫治疗在三阴性乳腺癌中的应用，并通过单细胞RNA测序和空间蛋白质组学分析揭示了放疗与pembrolizumab之间的协同作用。 | 通过单细胞RNA测序和空间蛋白质组学分析，揭示了放疗与pembrolizumab在三阴性乳腺癌中的协同作用。 | NA | 研究新辅助化疗联合免疫治疗在三阴性乳腺癌中的效果及潜在的协同机制。 | 三阴性乳腺癌患者及其肿瘤微环境。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 14065 | 2024-08-05 |
Antigen-presenting autoreactive B cells activate regulatory T cells and suppress autoimmune arthritis in mice
2023-11-06, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20230101
PMID:37695523
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研究论文 | 本研究探讨了自反应性B细胞如何激活调节性T细胞并抑制小鼠中的自身免疫性关节炎 | 揭示了自反应性B细胞通过诱导调节性T细胞扩展的新机制，并区分了它们与IL10分泌B细胞的不同 | 可能未探讨其他类型B细胞在自身免疫中角色的全面影响 | 研究自反应性B细胞在自身免疫性疾病中的作用 | 研究自反应性B细胞及其对T细胞的影响 | 免疫学 | 自身免疫性关节炎 | 单细胞测序 | NA | 生物样本 | 使用了小鼠作为样本 |
| 14066 | 2024-08-07 |
Characterization of the Limbal Epithelial Stem Cell Niche
2023-10-03, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.64.13.48
PMID:37906057
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研究论文 | 本文研究了角膜缘上皮干细胞微环境的主要成分，特别是透明质酸（HA）及其复合物在维持干细胞状态中的作用 | 首次详细描述了透明质酸/重链复合物在角膜缘上皮干细胞微环境中的存在及其表达情况 | 研究主要基于小鼠模型，可能需要进一步的人体研究来验证结果 | 鉴定角膜缘上皮干细胞微环境的关键成分，特别是透明质酸特异性微环境的组成部分 | 角膜和角膜缘边缘的mRNA提取物 | NA | NA | 单细胞RNA测序、实时PCR、Western blotting、免疫组织化学 | NA | mRNA | 小鼠和人类的角膜样本 |
| 14067 | 2024-08-05 |
Cancer cell plasticity and MHC-II-mediated immune tolerance promote breast cancer metastasis to lymph nodes
2023-09-04, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20221847
PMID:37341991
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研究论文 | 本研究探讨了肿瘤引流淋巴结中的癌细胞可塑性和MHC-II介导的免疫耐受如何促进乳腺癌转移。 | 通过跨物种单细胞RNA测序分析识别了乳腺癌进展和淋巴结转移过程中的癌细胞异质性、可塑性和免疫逃逸特征。 | 本研究未明确提到其局限性 | 研究肿瘤引流淋巴结中癌细胞特征与免疫逃逸和转移的关系。 | 乳腺癌细胞及其在淋巴结中的行为。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 包括小鼠和人类的癌细胞样本 |
| 14068 | 2024-08-07 |
CD4 T cells and toxicity from immune checkpoint blockade
2023-09, Immunological reviews
IF:7.5Q1
DOI:10.1111/imr.13248
PMID:37491734
|
研究论文 | 本文通过多种单细胞和批量测序技术，研究了免疫检查点抑制剂治疗后严重免疫相关不良事件（irAEs）的预处理决定因素。 | 首次发现循环中升高的激活CD4效应记忆T细胞丰度和TCR多样性与严重irAEs的发展相关。 | 研究样本量相对较小，且仅限于晚期黑色素瘤患者。 | 深入理解导致严重irAEs发展的因素，以改善irAEs的预测和预防。 | 晚期黑色素瘤患者在接受免疫检查点抑制剂治疗后的免疫相关不良事件。 | 免疫学 | 黑色素瘤 | 质谱流式细胞术，单细胞RNA测序，单细胞V(D)J测序，批量RNA测序，批量T细胞受体（TCR）测序 | NA | 细胞数据 | 71名晚期黑色素瘤患者 |
| 14069 | 2024-08-05 |
Immune dysfunction revealed by digital spatial profiling of immuno-oncology markers in progressive stages of renal cell carcinoma and in brain metastases
2023-08, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-007240
PMID:37586773
|
研究论文 | 本研究揭示了肾细胞癌进展阶段和脑转移中的免疫功能障碍 | 利用数字空间分析技术，首次对肾细胞癌不同进展阶段及脑转移进行详尽的免疫肿瘤标志物分析 | 样本量虽然相对较大，但仍可能存在选择偏差，并且结果需要进一步验证 | 探索肾细胞癌及其脑转移的肿瘤微环境对免疫反应的影响 | 76个原发肿瘤、27个相邻的正常肾样本和86个转移样本，包括24个脑转移样本 | 数字病理学 | 肾癌 | 数字空间分析 | NA | 组织样本 | 76个原发肿瘤，27个正常肾样本，86个转移样本，包括24个脑转移样本 |
| 14070 | 2024-08-07 |
Assessment of Treatment-Relevant Immune Biomarkers in Psoriasis and Atopic Dermatitis: Toward Personalized Medicine in Dermatology
2023-08, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2023.04.005
PMID:37341663
|
综述 | 本文综述了用于测量炎症性皮肤病中与治疗相关的免疫生物标志物的转化免疫学方法 | 介绍了胶带剥离分析、微针基生物标志物贴片、表皮刮除术的分子分析、RNA原位杂交组织染色和单细胞RNA测序等新技术 | 目前没有批准或广泛使用的皮肤科个性化治疗方法 | 探讨个性化医学在炎症性皮肤病中的应用前景 | 牛皮癣和特应性皮炎中的治疗相关免疫生物标志物 | NA | 皮肤病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 14071 | 2024-08-07 |
Gene knockout inference with variational graph autoencoder learning single-cell gene regulatory networks
2023-07-21, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad450
PMID:37246643
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Gene Knockout Inference (GenKI)的虚拟敲除工具，用于在没有敲除样本的情况下，利用单细胞RNA测序数据预测基因功能 | GenKI通过变分图自编码器模型，在没有真实敲除样本信息的情况下，以无监督方式捕捉基因敲除扰动引起的基因调控模式变化 | NA | 开发一种新的工具，用于在没有敲除样本的情况下，利用单细胞RNA测序数据预测基因功能 | 基因敲除对基因调控模式的影响 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 变分图自编码器 (VGAE) | 基因调控网络 | 使用公开可用的单细胞RNA测序数据集 |
| 14072 | 2024-08-07 |
VISTA (PD-1H) Is a Crucial Immune Regulator to Limit Pulmonary Fibrosis
2023-Jul, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2022-0219OC
PMID:36450109
|
研究论文 | 研究探讨了VISTA（PD-1H）在限制特发性肺纤维化（IPF）中的作用及其治疗潜力 | 首次明确了VISTA在IPF中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 需要进一步研究以验证VISTA作为IPF治疗的新型靶点 | 确定VISTA在IPF中的作用及其治疗潜力 | VISTA在IPF中的表达及其对肺纤维化的影响 | NA | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 包括VISTA缺陷小鼠和野生型同窝小鼠的实验模型 |
| 14073 | 2024-08-05 |
Immune-interacting lymphatic endothelial subtype at capillary terminals drives lymphatic malformation
2023-04-03, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20220741
PMID:36688917
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研究论文 | 本研究揭示了一种新的免疫相互作用淋巴内皮亚型，该亚型在毛细血管末端促进淋巴管畸形 | 发现了一种新的Ptx3阳性皮肤淋巴毛细血管内皮细胞亚型，其能够招募促淋巴管生成的巨噬细胞 | 尚需进一步研究以深入理解该内皮细胞亚型的作用机制和临床应用 | 研究PIK3CA突变驱动的淋巴管畸形的致病机制 | 小鼠模型中的Pik3caH1047R驱动的血管畸形 | 数字病理学 | 淋巴管畸形 | 单细胞转录组学 | NA | 生物样本 | 使用了小鼠模型，具体样本数量未提及 |
| 14074 | 2024-08-07 |
SECANT: a biology-guided semi-supervised method for clustering, classification, and annotation of single-cell multi-omics
2022-Sep, PNAS nexus
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/pnasnexus/pgac165
PMID:36157595
|
研究论文 | 本文开发了一种名为SECANT的生物学指导半监督方法，用于单细胞多组学数据的聚类、分类和注释 | SECANT的创新点包括使用表面蛋白数据中识别的可靠细胞类型标签作为细胞聚类的指导，为每个细胞群提供一般注释，利用具有不确定或缺失细胞类型标签的细胞提高性能，以及准确预测scRNA-seq数据的可靠细胞类型 | NA | 开发一种新的方法来分析单细胞多组学数据，特别是CITE-seq数据 | 单细胞多组学数据，特别是CITE-seq数据 | 生物信息学 | NA | CITE-seq | NA | 单细胞多组学数据 | 多个组织的公共和内部数据集 |
| 14075 | 2024-08-07 |
Metastatic Transition of Pancreatic Ductal Cell Adenocarcinoma Is Accompanied by the Emergence of Pro-Invasive Cancer-Associated Fibroblasts
2022-Apr-28, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14092197
PMID:35565326
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据分析了胰腺导管细胞癌（PDAC）从原发部位向淋巴结转移过程中癌症相关成纤维细胞（CAFs）的变化 | 提出了“进化侵袭水平（ELI）”框架，描述了基质侵袭性的进化，并发现了在PDAC进展的不同阶段，成纤维细胞亚群的显著变化 | NA | 探究胰腺导管细胞癌转移过程中癌症相关成纤维细胞的角色和变化 | 胰腺导管细胞癌及其相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 使用Peng等人发表的单细胞RNA测序数据和The Cancer Genome Atlas中的大量RNAseq数据 |
| 14076 | 2024-08-04 |
Prediction of immunotherapy responsiveness in melanoma through single-cell sequencing-based characterization of the tumor immune microenvironment
2024-May, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2024.101910
PMID:38417293
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研究论文 | 该文章分析黑色素瘤患者的单细胞测序数据，以预测免疫疗法的响应。 | 文章提出了一种基于免疫成分组成的免疫疗法响应预测模型，并在黑色素瘤患者中经过验证，表现优于其他现有模型。 | 研究仅限于黑色素瘤患者，可能无法普遍适用于所有类型的癌症。 | 探讨黑色素瘤患者对免疫检查点抑制剂的反应差异，并建立预测模型。 | 研究对象为接受免疫检查点抑制剂治疗的黑色素瘤患者。 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 集成自多位黑色素瘤患者的单细胞测序数据 |
| 14077 | 2024-08-07 |
Multi-omics analysis-based macrophage differentiation-associated papillary thyroid cancer patient classifier
2024-May, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2024.101889
PMID:38382228
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研究论文 | 本研究通过多组学分析，构建了一个基于巨噬细胞分化特征的甲状腺乳头状癌患者分类器 | 本研究首次从免疫学角度探讨甲状腺肿瘤的预后差异机制，并利用巨噬细胞的分化特性为甲状腺乳头状癌的亚型分类提供新方法 | NA | 重新分类甲状腺乳头状癌 | 甲状腺乳头状癌患者的巨噬细胞分化特征 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从公共数据库获取的甲状腺乳头状癌浸润髓样细胞的单细胞RNA测序数据 |
| 14078 | 2024-08-07 |
A BET inhibitor, NHWD-870, can downregulate dendritic cells maturation via the IRF7-mediated signaling pathway to ameliorate imiquimod-induced psoriasis-like murine skin inflammation
2024-Apr-05, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2024.176382
PMID:38311277
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研究论文 | 研究了BET抑制剂NHWD-870通过IRF7介导的信号通路下调树突状细胞成熟，从而减轻咪喹莫特诱导的类牛皮癣小鼠皮肤炎症的效果 | 发现NHWD-870能通过抑制IRF7的表达来抑制树突状细胞的成熟和激活，从而减轻牛皮癣样皮肤病变 | NA | 探讨NHWD-870对咪喹莫特诱导的类牛皮癣小鼠模型和体外树突状细胞成熟的影响 | NHWD-870对咪喹莫特诱导的类牛皮癣小鼠皮肤炎症和树突状细胞成熟的影响 | NA | 牛皮癣 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型和树突状细胞 |
| 14079 | 2024-08-04 |
Comprehensive analyses and experimental verification of NETs and an EMT gene signature for prognostic prediction, immunotherapy, and chemotherapy in pancreatic adenocarcinoma
2024-Apr, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24082
PMID:38088494
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研究论文 | 本文探讨了中性粒细胞外网和上皮-间充质转化基因在胰腺腺癌预后预测中的作用 | 建立了一个基于八个NET和EMT相关基因的风险模型，并进行了实验验证 | 未详细描述样本数量和外部数据库的选择标准 | 探究NET和EMT基因与胰腺腺癌患者预后的相关性 | 胰腺腺癌患者及其相关的基因 | 数字病理学 | 胰腺癌 | RNA测序 | Cox回归模型 | 转录组数据 | NA |
| 14080 | 2024-08-07 |
Bioinformatics analyses and experimental validation of the role of phagocytosis in low-grade glioma
2024-Apr, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24095
PMID:38112449
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研究论文 | 本文通过生物信息学分析和实验验证，探讨了吞噬作用在低级别胶质瘤中的作用及其分子特征 | 首次研究了低级别胶质瘤中吞噬作用的改变，并构建了吞噬作用相关的预后标志物 | NA | 揭示吞噬作用的分子特征，并为低级别胶质瘤的个性化治疗奠定基础 | 低级别胶质瘤中的吞噬作用及相关基因 | 生物信息学 | 脑瘤 | 非负矩阵分解聚类、LASSO回归分析、单细胞RNA测序、多重免疫组织化学技术 | NA | mRNA、拷贝数变异、单核苷酸变异、甲基化水平、单细胞RNA测序数据 | 涉及多种癌症类型的样本及低级别胶质瘤样本 |