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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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14061 | 2024-08-05 |
Tissue morphology influences the temporal program of human brain organoid development
2023-10-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.09.003
PMID:37802039
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研究论文 | 本文研究了组织形态如何影响人脑类器官的发展时间程序 | 创新点在于揭示了组织形态对细胞命运决策的影响,并通过单核RNA测序和空间转录组学分析了这种相互作用 | 研究的局限性在于实验模型的复杂性可能影响结果的推广性 | 研究的目的是探讨组织形态如何影响细胞命运和组织架构的相互作用 | 研究对象为人类脑类器官及其发育过程中的细胞命运变化 | 数字病理 | NA | snRNA-seq 和空间转录组学 | NA | NA | NA |
14062 | 2024-08-07 |
CCL21-DC in situ vaccination in murine NSCLC overcomes resistance to immunotherapy and generates systemic tumor-specific immunity
2023-09, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-006896
PMID:37730274
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研究论文 | 本研究探讨了CCL21-DC在位疫苗与免疫检查点抑制剂联合治疗在小鼠非小细胞肺癌(NSCLC)中的应用,旨在克服免疫治疗抵抗并产生系统性肿瘤特异性免疫 | CCL21-DC在位疫苗能够增强免疫抵抗性小鼠NSCLC对免疫检查点抑制剂的敏感性,并建立肿瘤特异性免疫记忆 | NA | 研究CCL21-DC在位疫苗与免疫检查点抑制剂联合治疗对小鼠NSCLC的疗效 | 具有不同驱动突变的小鼠NSCLC模型 | 数字病理学 | 非小细胞肺癌 | 流式细胞术,单细胞RNA测序,全外显子测序 | NA | 细胞 | 具有不同驱动突变的小鼠NSCLC模型(KrasG12D/P53+/-/Lkb1-/- (KPL); KrasG12D/P53+/- (KP); 和 KrasG12D (K)) |
14063 | 2024-08-07 |
Construction of a cross-species cell landscape at single-cell level
2023-01-25, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac633
PMID:35929025
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术构建了跨物种的细胞图谱,涵盖了小鼠、斑马鱼和果蝇等多个生命阶段。 | 首次实现了跨物种的细胞景观动态比较,并识别了生命周期中变化的特征和共同通路。 | NA | 研究不同物种的细胞异质性及其在生命周期中的变化。 | 小鼠、斑马鱼和果蝇的细胞景观。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 细胞数据 | 超过260万个单细胞 |
14064 | 2024-08-07 |
Pathogen Cell-to-Cell Variability Drives Heterogeneity in Host Immune Responses
2015-Sep-10, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2015.08.027
PMID:26343579
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研究论文 | 本文开发了一种结合单细胞RNA测序和荧光标记的实验系统,用于研究单个巨噬细胞对入侵沙门氏菌的反应,并揭示了细菌因子活性的异质性如何影响宿主免疫反应的多样性 | 首次展示了细菌群体中PhoPQ活性的变异性如何通过改变LPS驱动宿主I型IFN反应的变异性,证明了宿主和细菌变异性之间的因果关系 | NA | 研究免疫细胞与入侵细菌之间的相互作用,特别是细胞间变异对感染结果的影响 | 单个巨噬细胞对入侵沙门氏菌的反应 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
14065 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics using spliced leader PCR: Evidence for multiple losses of photosynthesis in polykrikoid dinoflagellates
2015-Jul-17, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-015-1636-8
PMID:26183220
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研究论文 | 本文利用拼接领导者PCR(SLPCR)技术,对海洋沉积物中的单细胞多克里科斯·勒布里亚(Polykrikos lebouriae)进行转录组分析,探讨其光合作用的丢失情况 | 本文首次使用SLPCR技术对单细胞多克里科斯·勒布里亚进行转录组分析,并发现其保留了祖先的peridinin质体,而其近亲则独立地多次丢失了光合作用 | NA | 探讨多克里科斯·勒布里亚的光合作用丢失情况及其在多克里科斯类甲藻中的意义 | 多克里科斯·勒布里亚(Polykrikos lebouriae) | 基因组学 | NA | 拼接领导者PCR(SLPCR) | NA | 转录组 | 单细胞分离物 |
14066 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics systematically discloses the immune-inflammatory responses of peripheral blood mononuclear cells for diabetic nephropathy
2024-Jul, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2023.06.007
PMID:38510479
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
14067 | 2024-08-04 |
Exogenous IL-2 delays memory precursors generation and is essential for enhancing memory cells effector functions
2024-Apr-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109411
PMID:38510150
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研究论文 | 本研究探讨了外源IL-2信号对记忆前体细胞分化的影响 | 本研究首次揭示外源IL-2延迟记忆前体细胞的生成,并增强了记忆细胞的效应功能 | 本研究的局限性在于未探讨其他细胞因子对记忆前体细胞生成的共同作用 | 研究外源IL-2对CD8 T细胞记忆分化的影响 | CD8 T细胞及其在病毒感染小鼠中的记忆分化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 病毒感染小鼠中的转移细胞 |
14068 | 2024-08-04 |
scGREAT: Transformer-based deep-language model for gene regulatory network inference from single-cell transcriptomics
2024-Apr-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109352
PMID:38510148
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研究论文 | 提出了一种名为scGREAT的框架,用于从单细胞转录组数据推断基因调控网络。 | scGREAT使用基因嵌入和Transformer来优化推断过程,相较于现有方法具有更好的性能。 | 尽管scGREAT表现良好,但仍可能受到计算开销的限制。 | 研究单细胞转录组数据中的基因调控网络推断。 | 单细胞测序数据和基因调控信息。 | 计算机视觉 | NA | scRNA-seq | Transformer | 表达数据,基因文本信息 | NA |
14069 | 2024-08-07 |
Aortic Cellular Heterogeneity in Health and Disease: Novel Insights Into Aortic Diseases From Single-Cell RNA Transcriptomic Data Sets
2024-Apr, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979)
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在揭示健康与疾病状态下主动脉细胞异质性方面的最新进展 | 利用单细胞RNA测序技术深入解析了主动脉细胞类型在健康与疾病状态下的异质性及其相关生物过程 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术如何增强我们对主动脉疾病细胞驱动因素的理解 | 主动脉疾病如动脉粥样硬化、主动脉瘤和主动脉硬化 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
14070 | 2024-08-07 |
A single-cell transcriptome atlas of Lueyang black-bone chicken skin
2024-Apr, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2024.103513
PMID:38350389
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了黑羽鸡和白羽鸡皮肤细胞的转录组特征 | 首次报道了鸡皮肤细胞的组成和转录组特征,并鉴定了与色素颗粒捕获和沉积相关的特定细胞亚群 | NA | 揭示鸡皮肤细胞的转录组特征,为家禽育种提供重要信息 | 黑羽鸡和白羽鸡的皮肤细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 黑羽鸡和白羽鸡的皮肤细胞样本 |
14071 | 2024-08-07 |
Exploring the metastasis-related biomarker and carcinogenic mechanism in liver cancer based on single cell technology
2024-Mar-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e27473
PMID:38509894
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研究论文 | 本研究利用单细胞技术探索肝癌中的转移相关生物标志物和致癌机制 | 本研究首次定义了四种支持转移的细胞集群,并发现特定共享基因在促进癌症进展中发挥关键作用 | NA | 探索肝细胞癌(HCC)发展背后的转移相关机制 | 肝细胞癌中的细胞集群及其与癌症转移的关系 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 9种细胞集群 |
14072 | 2024-08-07 |
Combined analysis of bulk RNA and single-cell RNA sequencing to identify pyroptosis-related markers and the role of dendritic cells in chronic obstructive pulmonary disease
2024-Mar-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e27808
PMID:38509896
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研究论文 | 本研究结合批量RNA测序和单细胞RNA测序技术,识别与慢性阻塞性肺疾病(COPD)相关的焦亡标志物,并探讨树突状细胞在COPD中的作用 | 本研究首次结合多种机器学习算法,从GEO数据集中筛选出与COPD诊断相关的焦亡相关基因,并通过外部数据集验证其有效性 | NA | 旨在识别与COPD相关的焦亡标志物,并探讨树突状细胞在COPD发病机制中的作用 | 慢性阻塞性肺疾病(COPD)及其相关焦亡标志物和树突状细胞的作用 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | RNA测序 | 深度神经网络,逻辑回归 | RNA测序数据 | 使用了GEO数据集和外部数据集进行验证 |
14073 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis of age-related changes in leukocytes of diabetic mouse hindpaws
2024-Mar-19, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-024-05128-z
PMID:38502310
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术,分析了健康和糖尿病小鼠后爪中免疫细胞群在12周和21周龄时的失调情况,以揭示慢性糖尿病远端肢体中发生的免疫紊乱。 | 研究首次详细描述了糖尿病小鼠后爪中多种免疫细胞类型的免疫功能和表型随着代谢紊乱和疾病持续时间的改变,特别是在21周龄的Lepr小鼠中观察到 mast 细胞/basophils、真皮γδ T 细胞、异质性 T 细胞和 Type 2 先天淋巴细胞的增加。 | 研究仅限于小鼠模型,可能不完全适用于人类糖尿病患者。 | 探讨糖尿病小鼠后爪中免疫细胞群的失调情况,以理解与糖尿病代谢紊乱相关的病理变化。 | 健康和糖尿病小鼠后爪中的免疫细胞群。 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 健康和糖尿病小鼠后爪中的免疫细胞群,年龄分别为12周和21周。 |
14074 | 2024-08-04 |
Single-Cell Sequencing Reveals Functional Alterations in Tuberculosis
2024-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202305592
PMID:38192178
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研究论文 | 这项研究揭示了结核分枝杆菌与人类免疫细胞之间相互作用的功能异质性。 | 开发了一种新的技术平台,结合单细胞RNA测序和细胞表面抗体测序,提供同一样本的基因组和表型信息。 | 研究对象限于初次结核病患者和健康对照,可能无法全面代表所有结核患者。 | 阐明结核病患者的免疫功能差异及其对结核病结果的影响。 | 分析了23990个外周血单核细胞,来自新一组初次结核患者和健康对照。 | 数字病理学 | 结核病 | 单细胞RNA测序,细胞表面抗体测序 | NA | 基因组数据,表型数据 | 23990个外周血单核细胞 |
14075 | 2024-08-07 |
Exploration of the prognostic prediction value of the PANoptosis-based risk score and its correlation with tumor immunity in lung adenocarcinoma
2024-Mar, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3682
PMID:38508210
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研究论文 | 本研究探索了基于PANoptosis风险评分在肺腺癌中的预后预测价值及其与肿瘤免疫的相关性 | 首次构建了基于PANoptosis的15个相关基因的风险模型,用于肺腺癌的预后预测 | NA | 探索肺腺癌中PANoptosis相关基因的预后预测价值及与肿瘤免疫的相关性 | 肺腺癌患者 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO-Cox回归分析 | RNA表达谱 | 来自The Cancer Genome Atlas和Gene Expression Omnibus数据库的肺腺癌患者数据 |
14076 | 2024-08-04 |
Human uterine natural killer cells regulate differentiation of extravillous trophoblast early in pregnancy
2024-02-01, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.12.013
PMID:38237587
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研究论文 | 本文探讨了人类子宫自然杀伤细胞如何调控早期妊娠中滋养层细胞的分化 | 通过单细胞转录组学及体外模型,识别了促进滋养层细胞分化的uNK细胞来源的细胞因子信号 | NA | 研究uNK细胞在滋养层细胞侵入子宫环境中的作用及其对妊娠结果的影响 | 人类子宫自然杀伤细胞和滋养层细胞的相互作用 | 数字病理学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞转录组学 | 器官样本模型 | 组织样本 | 使用滋养层细胞类器官和原代组织样本 |
14077 | 2024-08-07 |
A time- and single-cell-resolved model of murine bone marrow hematopoiesis
2024-02-01, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.12.001
PMID:38183977
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研究论文 | 本文通过结合持续标记与时间序列单细胞RNA测序,构建了一个实时定量的体内组织动态模型,用于小鼠骨髓造血作用 | 本文通过结合单细胞表达模式与分化和生长速度的动态变化,揭示了不同谱系间自我更新和分化特性的广泛变化 | NA | 构建一个实时定量的体内组织动态模型,以理解小鼠骨髓造血作用 | 小鼠骨髓造血作用 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
14078 | 2024-08-04 |
Stimulated Human Umbilical Cord Mesenchymal Stem Cells Enhance the Osteogenesis and Cranial Bone Regeneration through IL-32 Mediated P38 Signaling Pathway
2024, Stem cells international
IF:3.8Q2
DOI:10.1155/2024/6693292
PMID:38510207
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研究论文 | 本研究探讨了刺激人脐带间充质干细胞(S-HuMSCs)对骨生成和颅骨再生的影响,重点分析了IL-32介导的P38信号通路 | 发现IL-32可以通过激活P38信号通路增强间充质干细胞的骨生成分化,揭示了IL-32在颅骨损伤治疗中的潜在疗效 | 本研究主要在体外和动物模型中进行,临床应用的效果尚待进一步验证 | 研究刺激人脐带间充质干细胞对骨生成及颅骨再生的机制 | 人脐带间充质干细胞(S-HuMSCs)及其IL-32高表达变体(IL-32highHuMSCs) | 数字病理学 | NA | 单细胞测序、流式细胞术、定量实时聚合酶链反应、西方印迹 | NA | 细胞、组织 | 实验中使用了多种细胞类型和一只大鼠颅骨缺损模型 |
14079 | 2024-08-07 |
Cancer-associated fibroblast spatial heterogeneity and EMILIN1 expression in the tumor microenvironment modulate TGF-β activity and CD8+ T-cell infiltration in breast cancer
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.90627
PMID:38505604
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研究论文 | 本文通过结合单细胞RNA测序和空间转录组数据,研究了乳腺癌中癌症相关成纤维细胞(CAF)群体与免疫细胞排除之间的关系 | 首次展示了乳腺癌中不同CAF群体的空间组织程度,并发现EMILIN1表达与CD8+ T细胞浸润和高患者预后相关 | 研究结果表明,仅将TGF-β信号与特定CAF亚群相关联是不够的,因为来自其他CAF亚群的蛋白质可以调节其活性 | 探索肿瘤微环境中癌症相关成纤维细胞与免疫细胞之间的相互作用 | 乳腺癌中的癌症相关成纤维细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 75例乳腺癌患者样本 |
14080 | 2024-08-07 |
Identification of Transcriptomic Signatures of Pancreatic Ductal Adenocarcinoma-Derived Exosomes That Promote Macrophage M2 Polarization and Predict Prognosis: S100A9 Reveals Tumor Progression
2024, Clinical Medicine Insights. Oncology
DOI:10.1177/11795549241239042
PMID:38510315
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研究论文 | 本研究通过分析胰腺导管腺癌(PDAC)细胞衍生的外泌体中的关键基因,揭示了其促进巨噬细胞M2极化并预测预后的机制,特别是S100A9在肿瘤进展中的作用 | 本研究首次建立了PDAC衍生外泌体和M2巨噬细胞的风险评分模型,并揭示了S100A9在巨噬细胞M2极化中的重要作用 | NA | 探讨胰腺导管腺癌细胞衍生的外泌体如何促进巨噬细胞M2极化及其在预后预测中的作用 | 胰腺导管腺癌细胞衍生的外泌体、巨噬细胞M2极化、S100A9基因 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 差异表达基因分析(DEGs)、加权基因共表达网络分析(WGCNA)、多变量Cox回归分析、定量聚合酶链反应(qPCR)、蛋白质印迹(western blot)、流式细胞术、细胞转染、Transwell实验、CCK-8实验 | 风险评分模型 | 基因表达数据 | 使用来自exoRbase 2.0、TCGA和ICGC数据库的数据,以及BxPC-3细胞系的外泌体进行体外实验 |