单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27536 篇文献，本页显示第 14061 - 14080 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 14061 | 2024-08-04 |
DOT1L promotes expression of CD44 through the Wnt/β-catenin signaling pathway in early gastric carcinoma
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.90170
PMID:38495505
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研究论文 | 本研究评估了DOT1L基因在胃癌组织中的表达及其促进癌症干细胞介导的上皮-间质转化的功能 | 发现DOT1L通过Wnt/β-连环蛋白信号通路促进CD44的表达，揭示了其在胃癌干细胞调节中的重要性 | 样本量相对较小，限制了结果的广泛适用性和外推性 | 研究DOT1L在早期胃癌中的作用及其机制 | 通过单细胞测序分析早期胃癌和低级别上皮内瘤变的组织样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 全外显子测序、单细胞测序 | NA | 组织样本 | 24个样本（来自8名患者的3个阶段，其中每个阶段各8个样本） |
| 14062 | 2024-08-04 |
Identification of T-cell exhaustion-related genes and prediction of their immunotherapeutic role in lung adenocarcinoma
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.92839
PMID:38495503
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研究论文 | 本文探讨了与T细胞耗竭相关的基因及其在肺腺癌免疫治疗中的预测作用 | 构建了一个基于T细胞耗竭的模型，用于评估肺腺癌患者的预后和免疫治疗反应 | 未提及具体的实验限制 | 探讨T细胞耗竭对肿瘤微环境的影响及其在肺腺癌中的作用 | 肺腺癌患者的RNA-seq数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA-seq (scRNA-seq)，RNA-seq | LASSO-Cox分析 | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO的LUAD患者数据，涉及多个验证队列 |
| 14063 | 2024-08-04 |
Unravelling spatial gene associations with SEAGAL: a Python package for spatial transcriptomics data analysis and visualization
2023-07-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad431
PMID:37436699
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研究论文 | 本文介绍了一个名为SEAGAL的Python包，用于分析和可视化空间转录组数据。 | SEAGAL包能够在单基因和基因集水平上检测和可视化空间基因相关性，突破了传统共表达分析的局限。 | 尚未提及具体局限性。 | 旨在通过空间转录组分析揭示基因的空间相关性。 | 对空间转录组数据集中的基因表达和空间坐标进行分析。 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 14064 | 2024-08-04 |
Single-cell profiling identifies ACE+ granuloma macrophages as a nonpermissive niche for intracellular bacteria during persistent Salmonella infection
2023-01-06, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.add4333
PMID:36608122
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研究论文 | 本研究揭示了ACE+ granuloma巨噬细胞在持久性沙门氏菌感染中作为非允许性细胞生态位的作用 | 首次通过单细胞转录组分析揭示了ACE巨噬细胞的功能多样性及其在细菌持久感染中的角色 | 研究仅限于小鼠模型，可能无法完全反映人类感染中的机制 | 探讨巨噬细胞在沙门氏菌持久感染中的功能及其异质性 | 沙门氏菌感染的小鼠模型中的巨噬细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 14065 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics reveals peripheral immune responses in non-segmental vitiligo
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1221260
PMID:38077333
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研究论文 | 这项研究使用单细胞RNA测序揭示了非分段性白癜风患者的外周免疫反应 | 首次系统性研究了非分段性白癜风患者外周血液中循环免疫细胞的类型和功能 | 样本量较小，仅包括五个白癜风患者和三个健康对照组 | 研究白癜风患者外周免疫反应的机制 | 五个进展性非分段性白癜风患者和三个健康对照者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 白癜风 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 五个白癜风患者，三个健康对照 |
| 14066 | 2024-08-07 |
A novel signature predicts prognosis and immunotherapy in lung adenocarcinoma based on cancer-associated fibroblasts
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1201573
PMID:37325647
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研究论文 | 本研究旨在探讨肺腺癌中癌症相关成纤维细胞（CAFs）的特征，并开发一种风险标志物以预测肺腺癌患者的预后 | 本研究开发了一种新的风险标志物，结合临床病理特征的诺模图，用于预测肺腺癌的预后和免疫治疗反应 | 研究结果需要在体内实验中进一步验证 | 研究肺腺癌中CAFs的特征，并开发一种风险标志物以预测患者的预后 | 肺腺癌中的癌症相关成纤维细胞（CAFs） | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序 | Lasso回归 | RNA测序数据 | 1731个差异表达基因（DEGs）中的492个基因用于构建风险标志物 |
| 14067 | 2024-08-07 |
Identification of the immune-associated characteristics and predictive biomarkers of keratoconus based on single-cell RNA-sequencing and bulk RNA-sequencing
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1220646
PMID:37965330
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（bulk RNA-seq）数据，探讨了圆锥角膜（KC）的免疫相关特征及其预测性生物标志物。 | 首次综合利用scRNA-seq和bulk RNA-seq技术，结合机器学习算法，识别出与KC进展相关的关键免疫细胞簇和预测性基因标志物。 | 研究依赖于现有的数据库和公开的测序数据，可能存在样本选择偏倚；机器学习模型的泛化能力需进一步验证。 | 旨在探讨圆锥角膜是否为炎症性疾病，并识别其免疫相关特征和预测性生物标志物。 | 圆锥角膜的免疫细胞簇和相关基因表达模式。 | 数字病理学 | 圆锥角膜 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（bulk RNA-seq） | 随机森林（RF），支持向量机（SVM），最小绝对收缩和选择算子（LASSO）回归分析 | RNA序列数据 | 涉及多个细胞簇和1362个差异表达基因（DEGs） |
| 14068 | 2024-08-07 |
Differential in vivo labeling with barcoded antibodies allows for simultaneous transcriptomic profiling of airway, lung tissue and intravascular immune cells
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1227175
PMID:38094305
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研究论文 | 本文介绍了一种基于条形码抗体差异标记的方法，用于同时分析气道、肺组织和血管内免疫细胞的转录组特征 | 该方法不仅提供了基本的空间信息，还允许直接比较不同解剖部位的细胞，并且比传统的单细胞RNA测序方法更节省时间和成本 | NA | 开发一种新的方法来同时分析气道、肺组织和血管内免疫细胞的转录组特征 | 气道、肺组织和血管内免疫细胞的转录组特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 在小鼠细菌性肺感染的临床前模型中进行了可行性验证 |
| 14069 | 2024-08-04 |
Mast cell activation disrupts interactions between endothelial cells and pericytes during early life allergic asthma
2024-Mar-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI173676
PMID:38487999
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研究论文 | 这篇文章研究了过敏性哮喘如何影响早期生命小鼠的肺微循环 | 揭示了肥大细胞激活如何通过蛋白酶破坏内皮细胞与周细胞之间的相互作用 | 研究主要基于小鼠模型，尚需在人类样本中验证 | 探讨过敏性哮喘对早期生命肺微循环的影响 | 新生小鼠肺脏切片以及儿童哮喘支气管活检样本 | 数字病理学 | 过敏性哮喘 | 定量成像与空间转录组学 | NA | 图像和生物样本 | 新生小鼠肺脏切片与儿童哮喘的支气管活检样本 |
| 14070 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing shows mosaic aneuploidy in most human embryos
2024-Mar-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI179134
PMID:38488008
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研究论文 | 该文章探讨了人类胚胎中的马赛克非整倍体现象，指出这一现象在大多数胚胎中普遍存在 | 提供了单细胞基因组测序数据，严谨评估了健康人类IVF胚胎中马赛克非整倍体的发生率和程度 | 研究未探讨非整倍体对胚胎结果的具体临床后果 | 旨在评估人类IVF胚胎中马赛克非整倍体现象的普遍性及其影响 | 健康的人类体外受精（IVF）胚胎 | 数字病理学 | NA | 单细胞基因组测序 | NA | 基因组数据 | 至少80%的胚胎样本 |
| 14071 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA-sequencing of cellular heterogeneity and pathogenic mechanisms in paraquat-induced Parkinson's disease with depression
2024-Mar-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2024.116169
PMID:38447518
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研究论文 | 本研究探讨了对于帕金森病合并抑郁症的小鼠模型中细胞异质性及其病理机制的单细胞RNA测序分析 | 揭示了特定的谷氨酸能神经元群体在帕金森病合并抑郁症进展中的作用并建立了全面的基因表达图谱 | 该研究主要依赖小鼠模型，可能无法完全推导到人类疾病的复杂性 | 全面研究在帕金森病背景下抑郁症进展的细胞异质性和机制 | 以PQ诱导的帕金森病合并抑郁症小鼠模型为研究对象 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 使用了多只小鼠进行实验 |
| 14072 | 2024-08-04 |
Single-cell and multi-omics analyses highlight cancer-associated fibroblasts-induced immune evasion and epithelial mesenchymal transition for smoking bladder cancer
2024-Mar-15, Toxicology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.tox.2024.153782
PMID:38493947
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研究论文 | 研究揭示了吸烟膀胱癌中癌相关成纤维细胞诱导的免疫逃逸和上皮-间质转化的机制 | 构建了一个新的预后标志，并识别了33个与烟草致癌物相关的关键基因 | 对烟草致癌物及其在膀胱癌预后中的具体功能尚缺乏深入阐述 | 系统评估烟草致癌物对膀胱癌预后的影响 | 膀胱癌特异性烟草致癌物相关基因 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序，癌基因组分析 | 基因×基因交互模型 | 基因数据 | 来自南京膀胱癌队列和TCGA数据库的基因数据 |
| 14073 | 2024-08-04 |
Highly sensitive spatial transcriptomics using FISHnCHIPs of multiple co-expressed genes
2024-Mar-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46669-y
PMID:38491027
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研究论文 | 本文介绍了一种名为FISHnCHIPs的技术，用于高度灵敏的细胞类型和基因表达程序的原位剖析 | FISHnCHIPs能够同时成像~2-35个共同表达的基因，具有~2-20倍于单基因FISH的灵敏度 | 未在摘要中提到具体的局限性 | 旨在提高组织样本的空间转录组学分析的灵敏度 | 涉及鼠类肾脏和脑部的组织样本，以及人类结直肠癌活检样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | FISH | NA | 组织样本 | 分析了多个鼠类样本和一个人类活检样本 |
| 14074 | 2024-08-07 |
A prognostic risk prediction model based on ferroptosis-related long non-coding RNAs in bladder cancer: A bulk RNA-seq research and scRNA-seq validation: Erratum
2024-Mar-15, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000037547
PMID:38489743
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 14075 | 2024-08-07 |
Autophagy regulates the maturation of hematopoietic precursors in the embryo
2024-Mar-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46453-y
PMID:38490977
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研究论文 | 本文研究了自噬在胚胎造血前体细胞成熟过程中的作用 | 首次揭示了自噬在胚胎造血前体细胞成熟中的作用，并探讨了自噬相关基因Atg5在血管内皮细胞中的缺失对内皮到造血转变的影响 | NA | 理解调控胚胎造血干细胞发育的机制，促进其再生 | 胚胎造血前体细胞和造血干细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | LC3-RFP-EGFP小鼠模型 |
| 14076 | 2024-08-07 |
Sex disparities revealed by single-cell and bulk sequencing and their impacts on the efficacy of immunotherapy in esophageal cancer
2024-Mar-15, Biology of sex differences
IF:4.9Q1
DOI:10.1186/s13293-024-00598-z
PMID:38491510
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研究论文 | 本研究探讨了性别差异对食管癌免疫治疗效果的影响，通过单细胞和批量测序技术揭示了性别在免疫抑制肿瘤微环境中的作用 | 首次系统地描述了食管癌中性别相关的基因组和细胞差异，并构建了一个性别相关的预测免疫治疗效果的特征 | 研究结果主要基于回顾性数据，未来需要前瞻性研究来验证这些发现 | 探索性别差异对食管癌免疫治疗效果的影响及其分子基础 | 食管癌患者及其免疫治疗效果 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序，T细胞受体测序 | NA | 基因组数据，免疫细胞数据 | 2360名食管癌患者，1425个样本，105,145个免疫细胞 |
| 14077 | 2024-08-04 |
Large-scale single-cell profiling of stem cells uncovers redundant regulators of shoot development and yield trait variation
2024-Mar-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.04.583414
PMID:38496543
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研究论文 | 本文揭示了在植物茎尖干细胞中表达的冗余调控因子，这对于提高作物产量具有重要意义 | 首次对玉米和拟南芥的茎尖干细胞进行了大规模单细胞RNA测序，识别出保守的干细胞调控因子 | 在现有单细胞分析中，植物茎尖干细胞的获取和调控因子的检测存在困难 | 研究植物茎尖干细胞中的调控因子，以促进作物工程提升生产力 | 玉米和拟南芥的茎尖干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 来自玉米和拟南芥的成千上万的干细胞表达细胞 |
| 14078 | 2024-08-04 |
Defining the T cell transcriptional landscape in pediatric liver transplant rejection at single cell resolution
2024-Feb-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.26.582173
PMID:38464256
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研究论文 | 本文探讨了小儿肝脏移植排斥反应中的T细胞转录谱，以单细胞分辨率定义其特征 | 使用单细胞测序和免疫谱系分析揭示了CD8+ T细胞的特异性和基因表达特征，以及在排斥反应中的持续活性 | 本研究的样本量较小，仅包括14名患者，可能限制了结果的广泛适用性 | 研究小儿肝脏移植在急性细胞排斥中的T细胞反应及其转录特征 | 14名小儿肝脏移植患者的肝活检样本 | 免疫学 | 肝脏移植排斥反应 | 单细胞测序和免疫谱系分析 | CD8+ T细胞克隆类型分析 | 生物样本（肝活检） | 14名患者的30个冷冻保存的肝活检样本 |
| 14079 | 2024-08-07 |
Insulin signaling regulates R2 retrotransposon expression to orchestrate transgenerational rDNA copy number maintenance
2024-Feb-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.28.582629
PMID:38464041
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研究论文 | 本文研究了胰岛素信号通路如何通过调节R2逆转录转座子的表达，来维持代际间核糖体DNA（rDNA）拷贝数的稳定 | 首次揭示了胰岛素受体（InR）作为R2表达的主要抑制因子，并通过单细胞RNA测序发现InR表达与rDNA拷贝数的关系 | NA | 探讨胰岛素信号通路在维持rDNA拷贝数稳定中的作用及其机制 | 胰岛素信号通路、R2逆转录转座子、核糖体DNA拷贝数 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 14080 | 2024-08-07 |
Image-activated pico-injection for single-cell analysis
2024-May-15, Talanta
IF:5.6Q1
DOI:10.1016/j.talanta.2024.125765
PMID:38346358
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研究论文 | 本文介绍了一种名为图像激活皮科注射（imgPico）的新技术，用于在无需标记的情况下，按需向液滴中补充试剂 | imgPico技术通过实时图像分析检测目标液滴，并进行针对性的皮科注射，提高了液滴应用中试剂添加的精确性和效率 | NA | 研究并优化图像激活皮科注射技术，以提高其在单细胞分析中的应用效果 | 液滴中的单细胞分析 | 计算机视觉 | NA | 图像分析 | NA | 图像 | 分别包含一个、两个和三个细胞的液滴 |