单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
14041 2024-08-07
Human surface ectoderm and amniotic ectoderm are sequentially specified according to cellular density
2024-Mar, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本文通过建立人类多能干细胞模型,研究了羊膜外胚层和表面外胚层的分化机制 首次提出人类羊膜外胚层和表面外胚层是根据细胞密度沿着共同非神经外胚层轨迹指定的 NA 探究人类羊膜外胚层和表面外胚层的分化机制 人类羊膜外胚层和表面外胚层 NA NA 单细胞RNA测序 NA 细胞 NA
14042 2024-08-04
Recent progress in hair follicle stem cell markers and their regulatory roles
2024-Feb-26, World journal of stem cells IF:3.6Q3
研究论文 本文回顾了毛囊干细胞的分子标记物及其调节作用 探讨了单细胞转录组技术提供的详细数据,聚焦于重要的HFSC分子标记物 缺乏HFSC的实验验证和比较不同标记物的实用性 旨在总结和分析毛囊干细胞标记物及其功能 主要研究毛囊干细胞及其在损伤愈合中的功能 数字病理学 NA 单细胞转录组技术 NA NA NA
14043 2024-08-07
Identification and validation of a pyroptosis-related prognostic model for colorectal cancer based on bulk and single-cell RNA sequencing data
2024-Feb-24, World journal of clinical oncology IF:2.6Q3
研究论文 本研究基于大量和单细胞RNA测序数据,构建并验证了与结直肠癌(CRC)预后相关的细胞焦亡相关预测模型。 首次构建了一个基于细胞焦亡相关基因的结直肠癌预后模型,并验证了其与免疫浸润的相关性。 NA 评估细胞焦亡相关基因对结直肠癌预后的影响及其与免疫浸润的关联。 结直肠癌(CRC)患者的预后及免疫浸润情况。 数字病理学 结直肠癌 RNA测序 LASSO回归算法 基因表达数据 使用了来自TCGA和GEO的数据集,具体样本数量未在摘要中明确。
14044 2024-08-04
Granzyme B+ B cells detected by single-cell sequencing are associated with prognosis in patients with intrahepatic cholangiocarcinoma following liver transplantation
2024-Feb-22, Cancer immunology, immunotherapy : CII
研究论文 本研究探讨了单细胞测序检测到的granzyme B+ B细胞与肝移植后肝内胆管癌患者预后的关系 首次揭示了肿瘤样本中granzyme B+ B细胞的显著增加及其与无病生存的正相关性 研究仅涉及肝内胆管癌,无法广泛适用于其他癌症类型 研究granzyme B+ B细胞在肝内胆管癌中的作用及其对预后的影响 肝移植接受者的肝内胆管癌患者 数字病理学 肝内胆管癌 单细胞测序 NA 样本数据 25个样本来自基因表达综合数据库以及40名肝移植接受者
14045 2024-08-04
Identification macrophage signatures in prostate cancer by single-cell sequencing and machine learning
2024-Feb-13, Cancer immunology, immunotherapy : CII
研究论文 本研究通过单细胞测序和机器学习识别前列腺癌中的巨噬细胞特征。 提出了一种基于巨噬细胞相关基因的风险标签,用于预测前列腺癌患者的进展。 样本来源于公共数据库,可能缺乏来自不同临床环境的数据验证。 分析肿瘤相关巨噬细胞在前列腺癌中的作用,并建立相关的预后模型。 关注肿瘤微环境中巨噬细胞与前列腺癌进展之间的关系。 数字病理学 前列腺癌 单细胞测序、机器学习 NA 基因数据、RNA数据 从多个公共数据库下载的前列腺癌单细胞测序数据
14046 2024-08-07
uPAR (PLAUR) Marks Two Intra-Tumoral Subtypes of Glioblastoma: Insights from Single-Cell RNA Sequencing
2024-Feb-07, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序数据,分析了uPAR(PLAUR)在胶质母细胞瘤(GBM)中的作用及其分子合作者 首次全面研究uPAR在GBM内部亚型中的功能及其分子合作者,无需预设生物学途径 NA 探讨uPAR在胶质母细胞瘤内部亚型中的作用及其分子机制 uPAR在胶质母细胞瘤中的作用及其分子合作者 数字病理学 脑癌 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 37名胶质母细胞瘤患者
14047 2024-08-07
Targeting tumor-stromal interactions in triple-negative breast cancer using a human vascularized micro-tumor model
2024-01-05, Breast cancer research : BCR IF:6.1Q1
研究论文 本研究利用人血管化微肿瘤模型,探索三阴性乳腺癌中肿瘤-基质相互作用的分子基础及潜在治疗靶点 采用先进的体外微生理系统——血管化微肿瘤模型,结合单细胞RNA测序技术,揭示了正常乳腺组织基质细胞在三阴性乳腺癌微环境中的促癌信号通路 NA 研究三阴性乳腺癌中肿瘤-基质相互作用的分子机制,并探索潜在的治疗靶点 三阴性乳腺癌中的肿瘤-基质相互作用及其治疗靶点 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 血管化微肿瘤模型 RNA NA
14048 2024-08-04
Tumor-associated macrophages promoting PD-L1 expression in infiltrating B cells through the CXCL12/CXCR4 axis in human hepatocellular carcinoma
2024, American journal of cancer research IF:3.6Q2
PMID:38455420
研究论文 该研究探讨了肝细胞癌中肿瘤相关巨噬细胞通过CXCL12/CXCR4轴促进浸润B细胞PD-L1表达的机制 发现了一种新型的调节性B细胞PD-L1 Bregs,揭示了它们与CXCL12 TAMs之间的相互作用以及其在肝细胞癌中的作用 该研究的局限性可能在于基于单细胞RNA-seq数据的分析,这可能不能完全代表肿瘤微环境的复杂性 研究肝细胞癌中细胞间通信的机制 调节性B细胞、肿瘤相关巨噬细胞及其在肝细胞癌中的相互作用 数字病理学 肝癌 单细胞RNA-seq、免疫组化 小鼠模型 RNA序列数据 使用了小鼠模型进行实验验证,具体样本数量未提供
14049 2024-08-07
Single-cell analysis reveals one cancer-associated fibroblasts subtype linked to metastasis in breast cancer: MXRA5 as a potential novel marker for prognosis
2024, American journal of cancer research IF:3.6Q2
PMID:38455411
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了乳腺癌中与转移相关的特定癌症相关成纤维细胞亚型FN1+CAF2,并鉴定了MXRA5作为潜在的新型预后标志物。 首次识别出与乳腺癌转移相关的特定癌症相关成纤维细胞亚型FN1+CAF2,并发现MXRA5可能作为新的标志物参与乳腺癌转移的调控。 研究主要基于单细胞RNA测序数据,未来需要更多的实验验证MXRA5在乳腺癌转移中的具体作用机制。 揭示乳腺癌中癌症相关成纤维细胞的异质性及其在转移中的作用,寻找新的预后标志物。 乳腺癌中的癌症相关成纤维细胞及其亚型,以及它们与乳腺癌转移的关系。 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 多个乳腺癌患者的组织样本
14050 2024-08-07
Complement C1q essential for aeroallergen sensitization via CSF1R+ conventional dendritic cells type 2
2023-11, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1
研究论文 研究探讨了补体C1q在CSF1R+常规树突状细胞类型2中通过识别吸入性过敏原在过敏反应中的作用 首次揭示了C1q在CSF1R+cDC2亚群中的选择性富集及其在过敏原识别和哮喘特征中的关键作用 NA 阐明CSF1R+cDC2树突状细胞识别吸入性过敏原的转录程序和受体-配体相互作用 小鼠肺部树突状细胞和人类肺部转录组数据 免疫学 哮喘 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 小鼠模型和人类样本
14051 2024-08-07
Single-cell expression profile of Drosophila ovarian follicle stem cells illuminates spatial differentiation in the germarium
2023-06-20, BMC biology IF:4.4Q1
研究论文 本文利用单细胞RNA测序技术分析了果蝇卵巢滤泡干细胞及其邻近细胞类型的基因表达模式,以研究干细胞群体内的异质性和与分化相关的变化 首次使用单细胞RNA测序技术对果蝇卵巢滤泡干细胞及其邻近细胞类型进行基因表达分析,揭示了干细胞群体的空间分化模式 NA 研究干细胞群体在成年组织中的组织和调控机制,以及这些机制如何影响癌症起源和细胞替代策略的开发 果蝇卵巢滤泡干细胞及其邻近细胞类型 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 包括滤泡干细胞及其邻近细胞类型(护送细胞和滤泡细胞)的预分类细胞群体
14052 2024-08-07
Chi3l1 Is a Modulator of Glioma Stem Cell States and a Therapeutic Target in Glioblastoma
2023-06-15, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 研究揭示了Chi3l1蛋白在胶质母细胞瘤中的作用,表明Chi3l1通过改变胶质瘤干细胞(GSC)的状态促进肿瘤生长,并提出了Chi3l1作为治疗靶点的可能性。 首次展示了Chi3l1与CD44的结合及其对GSC状态的调控作用,以及Chi3l1在体内外抑制肿瘤生长的潜力。 NA 探讨Chi3l1在胶质母细胞瘤中的作用及其作为治疗靶点的可能性。 胶质母细胞瘤、胶质瘤干细胞(GSC)、Chi3l1蛋白。 数字病理学 脑肿瘤 单细胞RNA测序、RNA速度分析、ATAC-seq NA RNA 患者来源的胶质瘤干细胞(GSC)
14053 2024-08-07
Ezrin's role in gastric cancer progression: Implications for immune microenvironment modulation and therapeutic potential
2024-Mar-15, Heliyon IF:3.4Q1
研究论文 本研究通过蛋白质组技术分析胃癌细胞系MKN-45和HGC-27之间的差异表达蛋白,筛选出ezrin作为目标蛋白,并探讨了ezrin表达水平与免疫微环境和基因组变化之间的关系。 首次探讨了ezrin在胃癌中的免疫调节作用及其与基因组不稳定性的关系,并预测了ezrin与免疫治疗和化疗敏感性的关联。 研究主要基于细胞系和数据库分析,未来需要更多临床样本验证ezrin在胃癌中的作用。 阐明ezrin在胃癌中的预后、免疫学和治疗价值。 胃癌细胞系MKN-45和HGC-27,以及TCGA和GEO数据库中的患者信息。 数字病理学 胃癌 蛋白质组技术 NA 蛋白质数据 涉及胃癌细胞系和数据库中的患者信息
14054 2024-08-07
Bulk anda single-cell transcriptome profiling reveals the molecular characteristics of T cell-mediated tumor killing in pancreatic cancer
2024-Mar-15, Heliyon IF:3.4Q1
研究论文 本文通过批量和单细胞转录组分析,揭示了胰腺癌中T细胞介导的肿瘤杀伤的分子特征 开发了TRGscore评分系统,有效预测胰腺癌患者对化疗或免疫治疗的反应及总体生存率 NA 探索胰腺癌中T细胞介导的肿瘤杀伤的分子机制,并识别可能从免疫检查点阻断治疗中获益的患者亚群 胰腺癌患者的T细胞介导的肿瘤杀伤机制 数字病理学 胰腺癌 转录组分析 NA 基因表达数据 涉及胰腺癌患者的样本,分为两个亚群进行分析
14055 2024-08-07
Loss of chromosome Y in regulatory T cells
2024-Mar-05, BMC genomics IF:3.5Q2
研究论文 研究探讨了染色体Y在调节性T细胞中的缺失情况及其对T淋巴细胞分化的影响 首次发现调节性T细胞中染色体Y的缺失显著增加,并影响淋巴细胞分化 研究样本量有限,需要进一步的大规模研究验证 探究染色体Y在特定CD4+ T淋巴细胞亚群中的缺失情况及其对疾病风险的影响 调节性T细胞及其他T淋巴细胞亚群 免疫学 癌症 单细胞RNA测序 NA RNA序列 23个PBMC样本和32个CD4+ T淋巴细胞富集样本
14056 2024-08-07
Targeted knockdown of PGAM5 in synovial macrophages efficiently alleviates osteoarthritis
2024-Mar-04, Bone research IF:14.3Q1
研究论文 本研究探讨了磷酸甘油酸变位酶5(PGAM5)在滑膜巨噬细胞中的作用及其对骨关节炎(OA)的影响 首次发现PGAM5在OA滑膜巨噬细胞中的显著增加,并通过条件性敲除PGAM5减轻OA症状,促进软骨细胞的合成代谢 NA 研究PGAM5在滑膜巨噬细胞中的作用,探索其作为治疗骨关节炎的新策略 骨关节炎(OA)中的滑膜巨噬细胞和软骨细胞 数字病理学 骨关节炎 单细胞RNA测序 NA RNA 人类样本的组织学分析和鼠模型的单细胞RNA测序结果
14057 2024-08-04
Drug resistance mechanisms in dopamine agonist-resistant prolactin pituitary neuroendocrine tumors and exploration for new drugs
2024-Mar, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy IF:15.8Q1
研究论文 本研究探讨了耐多巴胺激动剂的泌乳素瘤中的耐药机制,并探索了新的潜在药物。 本研究首次发现耐多巴胺激动剂的泌乳素瘤与Focal Adhesion信号通路的上调相关,并筛选出了新药Genistein作为潜在的有效治疗药物。 研究主要集中在小样本量的组织模型和细胞系上,可能影响结果的普适性。 调查泌乳素瘤中的多巴胺激动剂耐药机制并识别新的潜在有效药物。 研究对象为27例耐多巴胺激动剂的泌乳素瘤和10例敏感泌乳素瘤的病例。 数字病理学 泌乳素瘤 转录组测序和单细胞测序 类器官模型 组织样本和细胞系 27例耐药泌乳素瘤,10例敏感泌乳素瘤,3例耐药和3例敏感的单细胞
14058 2024-08-07
MAFF confers vulnerability to cisplatin-based and ionizing radiation treatments by modulating ferroptosis and cell cycle progression in lung adenocarcinoma
2024-Mar, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy IF:15.8Q1
研究论文 本研究探讨了MAFF在肺腺癌中的作用及其对顺铂和电离辐射治疗的影响 首次揭示了MAFF通过调节铁死亡和细胞周期进程影响肺腺癌对顺铂和电离辐射治疗的敏感性 NA 研究MAFF在肺腺癌中的作用及其对化疗和放疗的影响 肺腺癌细胞和肿瘤模型 数字病理学 肺癌 CRISPR筛选、单细胞RNA测序、RNA和ChIP测序 NA RNA 细胞和小鼠模型
14059 2024-08-07
The role of histone H1.2 in pancreatic cancer metastasis and chemoresistance
2024-Mar, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy IF:15.8Q1
研究论文 本研究探讨了胰腺癌(PC)中的化学耐药性和肿瘤转移之间的联系及其分子和细胞机制 构建并验证了一个转移和化学耐药性特征(MCS)评分系统,并发现H1-2的高表达与化学耐药性和上皮-间质转化(EMT)相关 NA 探索胰腺癌中化学耐药性和肿瘤转移之间的联系及其可能的分子和细胞机制 胰腺癌的化学耐药性和肿瘤转移 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA
14060 2024-08-07
Single-cell transcriptome analysis reveals the association between histone lactylation and cisplatin resistance in bladder cancer
2024-Mar, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy IF:15.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了组蛋白乳酸化与膀胱癌顺铂耐药性的关联 首次发现H3赖氨酸18乳酸化(H3K18la)在顺铂耐药膀胱癌细胞中的重要作用,并通过靶向抑制H3K18la恢复了顺铂敏感性 NA 探讨膀胱癌顺铂耐药的机制,并寻找新的干预靶点 膀胱癌顺铂耐药细胞及组蛋白乳酸化 数字病理学 膀胱癌 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 特定数量的膀胱癌细胞
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