单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 13981 - 14000 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 13981 | 2024-08-07 |
Integration of single-cell and bulk RNA-sequencing to analyze the heterogeneity of hepatocellular carcinoma and establish a prognostic model
2024-01, Cancer reports (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/cnr2.1935
PMID:37994394
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据，分析肝细胞癌的异质性，并建立了一个预测模型 | 本研究首次结合单细胞和批量RNA测序数据，探讨了肝细胞癌肿瘤异质性与治疗反应和预后的关联，并开发了一个新的预测模型 | NA | 研究肝细胞癌肿瘤异质性与治疗反应和预后的关联 | 肝细胞癌的肿瘤细胞异质性 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA测序 | Cox比例风险模型 | RNA测序数据 | 数据来自TCGA和GEO数据库，具体样本数量未提及 |
| 13982 | 2024-08-07 |
The challenge of defining rare genetic programs by single-cell RNA sequencing: Insights from phloem studies
2024-01-01, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2023.12.012
PMID:38115581
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 13983 | 2024-08-07 |
CAR T-cell Design-dependent Remodeling of the Brain Tumor Immune Microenvironment Modulates Tumor-associated Macrophages and Anti-glioma Activity
2023-12-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-23-0424
PMID:37971169
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研究论文 | 本研究探讨了脑肿瘤免疫微环境（TIME）和嵌合抗原受体（CAR）设计对B7-H3特异性CAR T细胞抗胶质瘤活性的影响 | 研究通过转基因表达41BBL在基于CD28的CAR T细胞中，增强了治疗效果和持久性，并揭示了CAR设计对TIME的调节作用 | 尽管在体外实验中CAR设计提高了抗胶质瘤疗效，但在体内实验中并未观察到类似改善 | 旨在理解转移性免疫细胞与脑肿瘤免疫微环境之间的复杂动态关系，以开发有效的基于T细胞的免疫疗法 | B7-H3特异性CAR T细胞及其在脑肿瘤免疫微环境中的作用 | 免疫学 | 脑肿瘤 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | CAR T细胞 | 细胞 | 使用了七种完全鼠源的B7-H3 CARs进行评估 |
| 13984 | 2024-08-04 |
Cancer-prone Phenotypes and Gene Expression Heterogeneity at Single-cell Resolution in Cigarette-smoking Lungs
2023-11-10, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-23-0195
PMID:37910161
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研究论文 | 该文章通过单细胞RNA测序技术揭示了吸烟肺部的癌症易感性表型和基因表达异质性 | 提出了两种新的单细胞元分析方法VARIED和AGED，并建立了吸烟肺部图谱，揭示了与吸烟相关的基因表达多样性和衰老差异 | 未提及研究的样本来源和潜在的外部影响因素 | 建立吸烟肺部图谱，以探究吸烟对人类肺部细胞多样性的影响 | 104个肺部单细胞RNA测序样本和相关的临床病理信息 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 104个肺部单细胞RNA测序样本 |
| 13985 | 2024-08-07 |
Plasticity in airway smooth muscle differentiation during mouse lung development
2023-03-13, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.02.002
PMID:36868232
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研究论文 | 研究探讨了在小鼠肺部发育过程中，平滑肌分化对气道上皮分支形态的影响 | 发现胚胎期气道平滑肌表现出可塑性，并证实合成型平滑肌层促进气道分支形态发生 | NA | 探究平滑肌分化在肺部发育中的作用及其机制 | 小鼠胚胎肺部平滑肌分化 | NA | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | Srf基因缺失的小鼠胚胎肺部样本 |
| 13986 | 2024-08-07 |
Endothelial and Leptin Receptor+ cells promote the maintenance of stem cells and hematopoiesis in early postnatal murine bone marrow
2023-03-13, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.02.003
PMID:36868235
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了出生后4天、14天和8周的小鼠骨髓基质细胞，探讨了早期新生小鼠骨髓中内皮细胞和瘦素受体阳性细胞在造血干细胞和造血维持中的作用。 | 首次详细描述了早期新生小鼠骨髓中瘦素受体阳性细胞和内皮细胞在造血干细胞和造血维持中的作用，并揭示了这些细胞表达的干细胞因子在不同造血阶段的作用。 | NA | 探究早期新生小鼠骨髓中内皮细胞和瘦素受体阳性细胞在造血干细胞和造血维持中的作用。 | 小鼠骨髓中的内皮细胞和瘦素受体阳性细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 出生后4天、14天和8周的小鼠骨髓基质细胞 |
| 13987 | 2024-08-07 |
Tumor PD-L1 engages myeloid PD-1 to suppress type I interferon to impair cytotoxic T lymphocyte recruitment
2023-03-13, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2023.02.005
PMID:36917954
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研究论文 | 研究揭示了肿瘤细胞PD-L1通过与骨髓细胞PD-1相互作用，抑制I型干扰素信号通路，从而影响细胞毒性T淋巴细胞在肺转移中的招募 | 首次报道了肿瘤细胞PD-L1通过与骨髓细胞PD-1结合，激活SHP2，抑制I型干扰素和STAT1信号通路，减少Cxcl9表达，从而影响细胞毒性T淋巴细胞在肺转移中的招募 | 研究主要在肿瘤小鼠模型中进行，尚未在人体中验证 | 探讨肿瘤细胞PD-L1在肿瘤免疫逃逸中的分子机制 | 肿瘤细胞PD-L1、骨髓细胞PD-1、细胞毒性T淋巴细胞 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及肿瘤小鼠模型和人类癌症患者 |
| 13988 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA-seq revealing the immune features of donor liver during liver transplantation
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1096733
PMID:36845096
|
研究论文 | 本研究揭示了肝移植过程中供体肝脏的免疫特征 | 使用单细胞RNA测序和TCR/BCR谱序列分析供体肝脏免疫细胞的表达和分布 | 样本数量较少，仅分析了三对供体肝脏的免疫特征 | 探讨肝移植过程中免疫细胞的变化及其与移植排斥反应的关联 | 三对供体肝脏的免疫细胞及其TCR/BCR谱 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和TCR/BCR谱序列 | NA | 转录组数据 | 三对供体肝脏样本 |
| 13989 | 2024-08-07 |
Shared immune metabolic reprogramming between COVID-19 patients in the intensive care unit and ischemic stroke: a pilot study
2023, Archives of medical science : AMS
IF:3.0Q1
DOI:10.5114/aoms/172161
PMID:38058697
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研究论文 | 本研究探讨了COVID-19和缺血性中风之间的共享基因特征 | 通过结合现有的批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，更全面地理解了代谢失调的作用，并使用机器学习方法识别了潜在的诊断模型 | NA | 研究COVID-19和缺血性中风之间的共享基因特征 | COVID-19患者和缺血性中风患者 | NA | COVID-19, 缺血性中风 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | 机器学习 | RNA测序数据 | 19个上调差异表达基因和24个下调基因 |
| 13990 | 2024-08-07 |
DeepVelo: Single-cell transcriptomic deep velocity field learning with neural ordinary differential equations
2022-Dec-02, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abq3745
PMID:36449617
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研究论文 | 本文介绍了一种基于神经网络的常微分方程模型DeepVelo，用于模拟单细胞转录组动力学 | DeepVelo能够通过描述单细胞内连续时间的基因表达变化，来模拟复杂的转录组动力学 | NA | 研究单细胞转录组动力学，并探索细胞状态的不稳定性及发育驱动基因 | 单细胞基因表达数据和RNA速度 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 神经网络 | 基因表达数据 | 使用来自不同测序平台的公共数据集 |
| 13991 | 2024-08-07 |
Improving Transcriptome Fidelity Following Synovial Tissue Disaggregation
2022, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2022.919748
PMID:36035425
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研究论文 | 本文通过改进关节组织分散技术，提高了解散关节组织细胞转录组的保真度，特别是对于单细胞RNA测序（scRNAseq）的应用 | 本文引入了RNA聚合酶抑制剂和冷酶消化方法，有效减少了组织处理过程中相关转录本的诱导，从而提高了转录组的保真度 | NA | 提高解散关节组织细胞转录组的保真度 | 骨关节炎（OA）和类风湿关节炎（RA）的关节组织 | 数字病理学 | 关节疾病 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | RNA | 骨关节炎和类风湿关节炎的关节组织样本 |
| 13992 | 2024-08-07 |
A high interferon gamma signature of CD8+ T cells predicts response to neoadjuvant immunotherapy plus chemotherapy in gastric cancer
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1056144
PMID:36685525
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研究论文 | 研究探讨了胃癌中肿瘤微环境（TME）与新辅助免疫治疗加化疗之间的相互作用，并分析了CD8+ T细胞中高基线干扰素γ（IFN-γ）信号对治疗反应的预测作用。 | 首次阐明了胃癌中新辅助免疫治疗加化疗与肿瘤微环境特征之间的相互作用，并强调了CD8+ T细胞的信号在预测治疗反应中的重要性。 | 研究样本量较小，仅涉及十个胃癌样本，可能影响结果的普遍性。 | 探究胃癌中新辅助免疫治疗加化疗与肿瘤微环境的相互作用及其对治疗效果的影响。 | 胃癌患者的肿瘤微环境及CD8+ T细胞的干扰素γ信号。 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 十个胃癌样本 |
| 13993 | 2024-08-07 |
Single-cell computational machine learning approaches to immune-mediated inflammatory disease: New tools uncover novel fibroblast and macrophage interactions driving pathogenesis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1076700
PMID:36685542
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综述 | 本文综述了利用单细胞测序技术结合计算生物学方法，探索纤维母细胞与骨髓细胞在免疫介导炎症疾病中的相互作用及其临床意义 | 介绍了新的计算生物学技术，如维度降低、聚类和轨迹推断，以及这些技术在揭示纤维母细胞亚群与巨噬细胞之间新型相互作用中的应用 | 需要更强大的模型来进一步分析纤维母细胞的异质性及其与骨髓细胞的相互作用 | 总结计算技术在分类纤维母细胞异质性及其与骨髓细胞在特定生物学和临床环境中的相互作用方面的关键进展 | 纤维母细胞的异质性及其与巨噬细胞在免疫介导炎症疾病中的相互作用 | 机器学习 | 免疫介导炎症疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 13994 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics reveals striking heterogeneity and functional organization of dendritic and monocytic cells in the bovine mesenteric lymph node
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1099357
PMID:36685557
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析了牛肠系膜淋巴结中树突状细胞和单核细胞的异质性和功能组织 | 揭示了树突状细胞和单核细胞的十个集群和七个集群，具有明显的转录组特征，并定义了淋巴结定居子集及其前体，以及高度激活的迁移树突状细胞子集 | NA | 研究树突状细胞和单核细胞在次级淋巴组织中启动和塑造适应性免疫反应的复杂系统 | 牛肠系膜淋巴结中的单核吞噬细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 三头成年牛的肠系膜淋巴结 |
| 13995 | 2024-08-07 |
Disordered T cell-B cell interactions in autoantibody-positive inflammatory arthritis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1068399
PMID:36685593
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研究论文 | 研究探讨了在幼年寡关节炎（oligo JIA）中，Tph细胞与B细胞的异常相互作用是否与自身抗体阳性相关 | 通过单细胞转录组学技术，进一步定义了Tph细胞的基因特征，并发现ANA阳性患者的Tph细胞上调了与B细胞帮助相关的基因 | NA | 确定在幼年寡关节炎中，T细胞与B细胞的异常相互作用是否与自身抗体阳性相关 | Tph细胞在幼年寡关节炎患者中的分布及其与B细胞的相互作用 | NA | 幼年寡关节炎 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 13996 | 2024-08-07 |
A single-cell atlas of the developing Drosophila ovary identifies follicle stem cell progenitors
2020-02-01, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.330464.119
PMID:31919193
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了发育中的果蝇卵巢中所有已知细胞类型，并识别了细胞类型特异性标记，用于追踪细胞谱系 | 本研究首次鉴定了难以捉摸的卵泡干细胞前体细胞类型，并预测了已知细胞类型的亚型 | NA | 旨在全面理解成年细胞类型、其起源及前体关系，特别是在器官发生过程中的复杂性 | 发育中的果蝇卵巢中的细胞类型及其前体关系 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 13997 | 2024-08-07 |
Mapping human pluripotent stem cell differentiation pathways using high throughput single-cell RNA-sequencing
2018-04-05, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-018-1426-0
PMID:29622030
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研究论文 | 使用高吞吐量的单细胞RNA测序技术，研究人类多能干细胞的早期分化路径 | 首次提供了人类多能干细胞在单细胞层面的全面分化路线图 | NA | 研究人类多能干细胞的细胞分化过程 | 人类多能干细胞及其早期分化路径 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 多个细胞系，包括神经、肌肉、内皮、基质、肝脏和上皮细胞 |
| 13998 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing identifies celltype-specific cis-eQTLs and co-expression QTLs
2018-04, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-018-0089-9
PMID:29610479
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了约25,000个外周血单个核细胞的表达谱，以识别细胞类型特异性的顺式表达数量性状位点（cis-eQTLs）和共表达QTLs | 本研究首次通过单细胞eQTL分析，识别了新的细胞类型特异性cis-eQTLs，并生成了个性化的共表达网络，发现了显著改变共表达关系的遗传变异（称为共表达QTLs） | NA | 旨在通过无偏倚的方法识别细胞类型特异性的eQTLs和共表达QTLs | 外周血单个核细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 表达谱 | 约25,000个外周血单个核细胞来自45名供体 |
| 13999 | 2024-08-07 |
Molecular transitions in early progenitors during human cord blood hematopoiesis
2018-03-15, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.20178041
PMID:29545397
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研究论文 | 本研究利用Drop-seq技术对人类脐带血中的20,000个前体细胞进行单细胞RNA测序，揭示了脐带血中前体细胞状态的转录组图谱及其命运承诺的转录动力学 | 首次在人类脐带血中使用Drop-seq技术进行大规模单细胞RNA测序，揭示了前体细胞的转录组图谱和命运承诺的动态过程 | NA | 深入理解人类脐带血造血过程中早期前体细胞的分子转变 | 人类脐带血中的前体细胞 | NA | NA | Drop-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 20,000个前体细胞 |
| 14000 | 2024-08-07 |
TALK-1 reduces delta-cell endoplasmic reticulum and cytoplasmic calcium levels limiting somatostatin secretion
2018-03, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2018.01.016
PMID:29402588
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研究论文 | 本文研究了TALK-1通道在δ细胞中的作用，特别是其对内质网和细胞质钙水平的影响，以及对生长抑素分泌的限制作用。 | 首次揭示了TALK-1通道在δ细胞中的生理功能，即通过调节内质网钙泄漏来影响钙处理和生长抑素分泌。 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证TALK-1通道的作用。 | 探讨TALK-1通道在δ细胞中的功能及其对生长抑素分泌和内质网钙水平的调节作用。 | TALK-1通道在δ细胞中的表达和功能。 | NA | 糖尿病 | 免疫荧光、膜片钳电生理学、钙成像和激素分泌测定 | NA | 细胞内钙水平数据 | 控制组和TALK-1通道缺陷（TALK-1 KO）小鼠 |