单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27279 篇文献，本页显示第 13981 - 14000 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 13981 | 2024-08-07 |
Integrated analysis reveals FLI1 regulates the tumor immune microenvironment via its cell-type-specific expression and transcriptional regulation of distinct target genes of immune cells in breast cancer
2024-Mar-06, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10174-9
PMID:38448802
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研究论文 | 本文通过综合分析揭示了FLI1在乳腺癌中通过其细胞类型特异性表达和转录调控免疫细胞的不同靶基因来调节肿瘤免疫微环境 | 本文通过SMR分析和ncRNA网络构建，以及单细胞RNA测序数据的整合分析，验证了FLI1甲基化到基因表达再到乳腺癌发生的因果途径，并构建了以FLI1为中心的ceRNA网络 | NA | 探讨FLI1在乳腺癌中的具体作用及其在免疫调节中的角色 | FLI1在乳腺癌中的表达及其对免疫微环境的影响 | 数字病理学 | 乳腺癌 | GWAS, eQTLs, mQTLs, scRNA-seq | NA | 基因组数据, 表达数据, 甲基化数据, 单细胞RNA测序数据 | 使用乳腺癌基因组关联研究总结数据，血液中的表达数量性状位点和DNA甲基化数量性状位点，以及一系列的单细胞RNA测序数据 |
| 13982 | 2024-08-07 |
Deciphering the molecular regulatory of RAB32/GPRC5A axis in chronic obstructive pulmonary disease
2024-Mar-06, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-024-02724-2
PMID:38448858
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研究论文 | 本研究通过多种生物信息学挖掘和实验验证，探讨了RAB32在慢性阻塞性肺疾病（COPD）中的分子调控机制，并识别了GPRC5A作为与RAB32相互作用的潜在分子。 | 本研究首次详细探讨了RAB32与GPRC5A在COPD中的相互作用及其在肺组织中的共定位，为COPD的机制研究提供了新的视角。 | 研究主要基于生物信息学分析和实验室检测，未来需要更多的临床数据和实验验证来进一步证实这些发现。 | 旨在揭示RAB32在COPD中的分子调控轴及其与GPRC5A的相互作用。 | RAB32在COPD中的分子调控机制及其与GPRC5A的相互作用。 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | RT-qPCR, 免疫荧光, WGCNA, mfuzz聚类, Spearman相关分析 | NA | RNA序列, 蛋白质 | 从中山医院收集的肺组织手术样本，以及来自Gene Expression Omnibus (GEO)的四个COPD微阵列数据集和GSE173896数据集的COPD相关上皮细胞scRNA-seq数据。 |
| 13983 | 2024-08-04 |
Integrated single-nuclei and spatial transcriptomic analysis reveals propagation of early acute vein harvest and distension injury signaling pathways following arterial implantation
2024-Mar-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.31.564995
PMID:37961724
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研究论文 | 本研究通过单核RNA测序和空间转录组学分析，揭示了静脉移植物收获和扩张后信号通路的传播。 | 首次应用单核RNA测序和空间转录组学分析研究静脉病理，提供了对静脉移植物损伤响应的深入理解。 | 使用的模型数量有限，仅包含4个犬模型，可能限制结果的广泛适用性。 | 揭示静脉移植物收获和移植后的响应，识别导致移植物失败的关键不适应性通路。 | 研究对象为犬模型中的静脉移植物，重点关注其在收获和扩张后的基因组效应。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单核RNA测序（snRNA-seq）、空间转录组学（ST） | 犬模型 | 基因组数据 | 4个犬模型的静脉移植物样本 |
| 13984 | 2024-08-04 |
Plant biotechnology research with single-cell transcriptome: recent advancements and prospects
2024-Feb-21, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-024-03168-0
PMID:38381195
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综述 | 本文回顾了植物单细胞转录组学技术的最新进展，以及这些技术在植物生物学和生物技术研究中的潜在作用 | 突出单细胞转录组学在植物研究中的快速应用和先进技术 | 批判性地审视单细胞技术的固有挑战和限制 | 旨在提升对植物发展和生物技术研究的理解 | 重点研究单细胞转录组学在植物中的应用与发展 | 植物生物学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 13985 | 2024-08-05 |
[The characteristics and impact on prognosis of cytopenia after anti-BCMA-CAR-T therapy in patients with relapsed and refractory multiple myeloma]
2024-Feb-20, Zhonghua yi xue za zhi
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研究论文 | 研究复发和难治性多发性骨髓瘤患者在接受BCMA CAR-T免疫治疗后细胞减少症的特征及其预后影响。 | 首次全面分析了BCMA CAR-T细胞治疗后复发和难治性多发性骨髓瘤患者细胞减少症的发生率及其对生存预后的影响。 | 研究基于单中心数据，样本量较小，可能影响结果的普遍适用性。 | 探讨细胞减少症的特征及其对复发和难治性多发性骨髓瘤患者预后的影响。 | 36名接受BCMA CAR-T治疗的复发和难治性多发性骨髓瘤患者。 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞测序 | NA | 临床数据 | 36名复发和难治性多发性骨髓瘤患者 |
| 13986 | 2024-08-04 |
PARD3 drives tumorigenesis through activating Sonic Hedgehog signalling in tumour-initiating cells in liver cancer
2024-Feb-06, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-02967-3
PMID:38317186
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研究论文 | 本研究探讨了PARD3在肝癌肿瘤发生中的作用 | 揭示了PARD3通过激活Sonic Hedgehog信号通路调控肿瘤干细胞，并对肝癌发生具有重要影响 | 未明确说明其他潜在影响因素和机制 | 研究PARD3在肝脏肿瘤发生中的作用 | 主要研究肝癌中的肿瘤发生细胞及其调控机制 | 数字病理 | 肝癌 | RNA测序 | NA | 组织样本 | 在饮食诱导的肝癌模型中进行了评估，研究是否包括具体样本数未说明 |
| 13987 | 2024-08-07 |
Dynamics of host immune responses and a potential function of Trem2hi interstitial macrophages in Pneumocystis pneumonia
2024-Feb-05, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-024-02709-1
PMID:38317180
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研究论文 | 本研究通过时间分辨的单细胞RNA测序分析，探讨了Pneumocystis肺炎过程中宿主免疫反应的变化及Trem2hi间质巨噬细胞的潜在作用 | 首次详细描述了Pneumocystis肺炎过程中免疫细胞的动态转录变化，并揭示了PCP相关巨噬细胞（PAM）在疾病中的作用 | 研究主要基于小鼠模型，可能需要进一步的人体研究来验证结果 | 阐明Pneumocystis肺炎过程中宿主免疫反应的动态变化及Trem2hi间质巨噬细胞的功能 | Pneumocystis肺炎感染的小鼠肺组织中的CD45+细胞 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 感染Pneumocystis的小鼠肺组织中的CD45+细胞 |
| 13988 | 2024-08-07 |
Neutrophils in the era of single-cell RNA sequencing: functions and targeted therapies in cancer
2024-02-05, Cancer biology & medicine
IF:5.6Q1
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 13989 | 2024-08-05 |
Single-cell and spatial profiling identify three response trajectories to pembrolizumab and radiation therapy in triple negative breast cancer
2024-01-08, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2023.12.012
PMID:38194915
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和空间蛋白组学分析三阴性乳腺癌对pembrolizumab和放疗的反应轨迹 | 首次识别了三阴性乳腺癌患者对pembrolizumab和联合放疗的三种不同反应轨迹 | 该研究的样本主要集中于三阴性乳腺癌，可能不适用于其他类型的癌症 | 旨在改善对接受单一免疫疗法或需要额外治疗的患者的识别 | 三阴性乳腺癌活检样本，比较治疗前后的免疫微环境 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞转录组学和空间蛋白组学 | 小鼠模型 | 生物样本 | NA |
| 13990 | 2024-08-07 |
Neoadjuvant radioimmunotherapy synergy in triple-negative breast cancer: Is microenvironment-guided patient selection on the horizon?
2024-01-08, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2023.12.009
PMID:38194911
|
研究论文 | 研究探讨了新辅助化疗联合免疫治疗在三阴性乳腺癌中的应用，并通过单细胞RNA测序和空间蛋白质组学分析揭示了放疗与pembrolizumab之间的协同作用。 | 通过单细胞RNA测序和空间蛋白质组学分析，揭示了放疗与pembrolizumab在三阴性乳腺癌中的协同作用。 | NA | 研究新辅助化疗联合免疫治疗在三阴性乳腺癌中的效果及潜在的协同机制。 | 三阴性乳腺癌患者及其肿瘤微环境。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 13991 | 2024-08-05 |
Antigen-presenting autoreactive B cells activate regulatory T cells and suppress autoimmune arthritis in mice
2023-11-06, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20230101
PMID:37695523
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研究论文 | 本研究探讨了自反应性B细胞如何激活调节性T细胞并抑制小鼠中的自身免疫性关节炎 | 揭示了自反应性B细胞通过诱导调节性T细胞扩展的新机制，并区分了它们与IL10分泌B细胞的不同 | 可能未探讨其他类型B细胞在自身免疫中角色的全面影响 | 研究自反应性B细胞在自身免疫性疾病中的作用 | 研究自反应性B细胞及其对T细胞的影响 | 免疫学 | 自身免疫性关节炎 | 单细胞测序 | NA | 生物样本 | 使用了小鼠作为样本 |
| 13992 | 2024-08-07 |
Characterization of the Limbal Epithelial Stem Cell Niche
2023-10-03, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.64.13.48
PMID:37906057
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研究论文 | 本文研究了角膜缘上皮干细胞微环境的主要成分，特别是透明质酸（HA）及其复合物在维持干细胞状态中的作用 | 首次详细描述了透明质酸/重链复合物在角膜缘上皮干细胞微环境中的存在及其表达情况 | 研究主要基于小鼠模型，可能需要进一步的人体研究来验证结果 | 鉴定角膜缘上皮干细胞微环境的关键成分，特别是透明质酸特异性微环境的组成部分 | 角膜和角膜缘边缘的mRNA提取物 | NA | NA | 单细胞RNA测序、实时PCR、Western blotting、免疫组织化学 | NA | mRNA | 小鼠和人类的角膜样本 |
| 13993 | 2024-08-05 |
Cancer cell plasticity and MHC-II-mediated immune tolerance promote breast cancer metastasis to lymph nodes
2023-09-04, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20221847
PMID:37341991
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研究论文 | 本研究探讨了肿瘤引流淋巴结中的癌细胞可塑性和MHC-II介导的免疫耐受如何促进乳腺癌转移。 | 通过跨物种单细胞RNA测序分析识别了乳腺癌进展和淋巴结转移过程中的癌细胞异质性、可塑性和免疫逃逸特征。 | 本研究未明确提到其局限性 | 研究肿瘤引流淋巴结中癌细胞特征与免疫逃逸和转移的关系。 | 乳腺癌细胞及其在淋巴结中的行为。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 包括小鼠和人类的癌细胞样本 |
| 13994 | 2024-08-07 |
CD4 T cells and toxicity from immune checkpoint blockade
2023-09, Immunological reviews
IF:7.5Q1
DOI:10.1111/imr.13248
PMID:37491734
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研究论文 | 本文通过多种单细胞和批量测序技术，研究了免疫检查点抑制剂治疗后严重免疫相关不良事件（irAEs）的预处理决定因素。 | 首次发现循环中升高的激活CD4效应记忆T细胞丰度和TCR多样性与严重irAEs的发展相关。 | 研究样本量相对较小，且仅限于晚期黑色素瘤患者。 | 深入理解导致严重irAEs发展的因素，以改善irAEs的预测和预防。 | 晚期黑色素瘤患者在接受免疫检查点抑制剂治疗后的免疫相关不良事件。 | 免疫学 | 黑色素瘤 | 质谱流式细胞术，单细胞RNA测序，单细胞V(D)J测序，批量RNA测序，批量T细胞受体（TCR）测序 | NA | 细胞数据 | 71名晚期黑色素瘤患者 |
| 13995 | 2024-08-05 |
Immune dysfunction revealed by digital spatial profiling of immuno-oncology markers in progressive stages of renal cell carcinoma and in brain metastases
2023-08, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-007240
PMID:37586773
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研究论文 | 本研究揭示了肾细胞癌进展阶段和脑转移中的免疫功能障碍 | 利用数字空间分析技术，首次对肾细胞癌不同进展阶段及脑转移进行详尽的免疫肿瘤标志物分析 | 样本量虽然相对较大，但仍可能存在选择偏差，并且结果需要进一步验证 | 探索肾细胞癌及其脑转移的肿瘤微环境对免疫反应的影响 | 76个原发肿瘤、27个相邻的正常肾样本和86个转移样本，包括24个脑转移样本 | 数字病理学 | 肾癌 | 数字空间分析 | NA | 组织样本 | 76个原发肿瘤，27个正常肾样本，86个转移样本，包括24个脑转移样本 |
| 13996 | 2024-08-07 |
Assessment of Treatment-Relevant Immune Biomarkers in Psoriasis and Atopic Dermatitis: Toward Personalized Medicine in Dermatology
2023-08, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2023.04.005
PMID:37341663
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综述 | 本文综述了用于测量炎症性皮肤病中与治疗相关的免疫生物标志物的转化免疫学方法 | 介绍了胶带剥离分析、微针基生物标志物贴片、表皮刮除术的分子分析、RNA原位杂交组织染色和单细胞RNA测序等新技术 | 目前没有批准或广泛使用的皮肤科个性化治疗方法 | 探讨个性化医学在炎症性皮肤病中的应用前景 | 牛皮癣和特应性皮炎中的治疗相关免疫生物标志物 | NA | 皮肤病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 13997 | 2024-08-07 |
Gene knockout inference with variational graph autoencoder learning single-cell gene regulatory networks
2023-07-21, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad450
PMID:37246643
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Gene Knockout Inference (GenKI)的虚拟敲除工具，用于在没有敲除样本的情况下，利用单细胞RNA测序数据预测基因功能 | GenKI通过变分图自编码器模型，在没有真实敲除样本信息的情况下，以无监督方式捕捉基因敲除扰动引起的基因调控模式变化 | NA | 开发一种新的工具，用于在没有敲除样本的情况下，利用单细胞RNA测序数据预测基因功能 | 基因敲除对基因调控模式的影响 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 变分图自编码器 (VGAE) | 基因调控网络 | 使用公开可用的单细胞RNA测序数据集 |
| 13998 | 2024-08-07 |
VISTA (PD-1H) Is a Crucial Immune Regulator to Limit Pulmonary Fibrosis
2023-Jul, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2022-0219OC
PMID:36450109
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研究论文 | 研究探讨了VISTA（PD-1H）在限制特发性肺纤维化（IPF）中的作用及其治疗潜力 | 首次明确了VISTA在IPF中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 需要进一步研究以验证VISTA作为IPF治疗的新型靶点 | 确定VISTA在IPF中的作用及其治疗潜力 | VISTA在IPF中的表达及其对肺纤维化的影响 | NA | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 包括VISTA缺陷小鼠和野生型同窝小鼠的实验模型 |
| 13999 | 2024-08-05 |
Immune-interacting lymphatic endothelial subtype at capillary terminals drives lymphatic malformation
2023-04-03, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20220741
PMID:36688917
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研究论文 | 本研究揭示了一种新的免疫相互作用淋巴内皮亚型，该亚型在毛细血管末端促进淋巴管畸形 | 发现了一种新的Ptx3阳性皮肤淋巴毛细血管内皮细胞亚型，其能够招募促淋巴管生成的巨噬细胞 | 尚需进一步研究以深入理解该内皮细胞亚型的作用机制和临床应用 | 研究PIK3CA突变驱动的淋巴管畸形的致病机制 | 小鼠模型中的Pik3caH1047R驱动的血管畸形 | 数字病理学 | 淋巴管畸形 | 单细胞转录组学 | NA | 生物样本 | 使用了小鼠模型，具体样本数量未提及 |
| 14000 | 2024-08-07 |
SECANT: a biology-guided semi-supervised method for clustering, classification, and annotation of single-cell multi-omics
2022-Sep, PNAS nexus
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/pnasnexus/pgac165
PMID:36157595
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研究论文 | 本文开发了一种名为SECANT的生物学指导半监督方法，用于单细胞多组学数据的聚类、分类和注释 | SECANT的创新点包括使用表面蛋白数据中识别的可靠细胞类型标签作为细胞聚类的指导，为每个细胞群提供一般注释，利用具有不确定或缺失细胞类型标签的细胞提高性能，以及准确预测scRNA-seq数据的可靠细胞类型 | NA | 开发一种新的方法来分析单细胞多组学数据，特别是CITE-seq数据 | 单细胞多组学数据，特别是CITE-seq数据 | 生物信息学 | NA | CITE-seq | NA | 单细胞多组学数据 | 多个组织的公共和内部数据集 |