单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27536 篇文献，本页显示第 13981 - 14000 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 13981 | 2024-08-04 |
Integrated analysis reveals crosstalk between pyroptosis and immune regulation in renal fibrosis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1247382
PMID:38343546
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研究论文 | 这项研究探讨了程序性焦亡在肾纤维化中的免疫微环境调节中的潜在作用 | 本研究揭示了程序性焦亡与免疫调节之间的交叉作用，并识别了五种中心调节因子作为肾纤维化的生物标志物 | 本研究的局限性在于使用的是动物模型，可能无法完全反映人类肾纤维化的复杂性 | 研究肾纤维化中程序性焦亡与免疫微环境之间的关系 | 研究对象为肾纤维化患者的样本和小鼠模型 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 包括肾纤维化和正常肾样本的27个程序性焦亡相关调节因子的评估 |
| 13982 | 2024-08-07 |
"The Good, the Bad, and the Ugly" - About Diverse Phenotypes of Hepatic Stellate Cells in the Liver
2024, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2024.01.002
PMID:38216053
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research paper | 本文探讨了肝星状细胞（HSCs）及其激活衍生物在慢性肝损伤进展中的多样性表型及其作用 | 利用遗传谱系追踪模型和单细胞转录组及蛋白质组分析技术，揭示了HSC和MF群体在健康状态及慢性肝损伤各阶段组织变形中的隐藏异质性 | NA | 识别HSC/MF轴上的不同表型，为针对特定MF表型作为慢性肝损伤潜在治疗方法奠定基础 | 肝星状细胞（HSCs）及其激活衍生物，即肌成纤维细胞（MFs） | NA | 肝病 | 遗传谱系追踪模型，单细胞转录组及蛋白质组分析 | NA | 转录组，蛋白质组 | NA |
| 13983 | 2024-08-07 |
Identifying biomarkers of heterogeneity and transplantation efficacy in retinal pigment epithelial cells
2023-12-04, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20230913
PMID:37728563
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研究论文 | 本文通过批量和单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析了成人RPE干细胞衍生的RPE细胞产品，评估了其在体外和体内的功能细胞整合及视觉恢复效果 | 本文首次鉴定了lncRNA（TREX）作为体内疗效的预测标记物，并通过敲低和过表达实验验证了其在细胞整合和视觉恢复中的作用 | NA | 提高视网膜色素上皮细胞移植疗法的疗效和安全性 | 视网膜色素上皮细胞的异质性和移植效果的生物标志物 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | RNA测序 | NA | RNA | 涉及Royal College of Surgeons大鼠 |
| 13984 | 2024-08-05 |
Tumor macrophage functional heterogeneity can inform the development of novel cancer therapies
2023-12, Trends in immunology
IF:13.1Q1
DOI:10.1016/j.it.2023.10.007
PMID:37995659
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研究论文 | 本文讨论了肿瘤相关巨噬细胞的功能异质性及其对癌症新疗法开发的影响 | 识别出巨噬细胞的分子亚型和功能，从而发现新的治疗靶点 | 传统治疗方法未能提供改变临床实践的突破性进展 | 提高对肿瘤微环境中巨噬细胞作用的理解，并推动新型靶向治疗的发展 | 聚焦于肿瘤微环境中的巨噬细胞功能及其潜在治疗靶点 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和空间转录组技术 | NA | NA | NA |
| 13985 | 2024-08-07 |
A single-cell atlas of immunocytes in the spleen of a mouse model of Wiskott-Aldrich syndrome
2023 Nov-Dec, Cellular immunology
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.cellimm.2023.104783
PMID:37944382
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，对Wiskott-Aldrich综合征小鼠模型的脾脏免疫细胞进行了全面的转录组分析 | 首次在单细胞分辨率下揭示了WAS-KO小鼠脾脏免疫细胞的转录特征，并鉴定了与疾病病理相关的新基因 | NA | 探究Wiskott-Aldrich综合征小鼠模型脾脏免疫细胞的免疫缺陷机制 | WAS-KO小鼠脾脏的免疫细胞 | 数字病理学 | 免疫缺陷疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 11,269个细胞 |
| 13986 | 2024-08-07 |
Spatial atlas of the mouse central nervous system at molecular resolution
2023-Oct, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06569-5
PMID:37758947
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研究论文 | 本文使用STARmap PLUS技术在单细胞分辨率下绘制了成年小鼠大脑和脊髓的1,022个基因的空间图谱 | 开发了计算流程来分割、聚类和注释分子细胞类型和分子组织区域，并整合了STARmap PLUS测量与单细胞RNA测序图谱，创建了一个转录组范围的空间图谱 | 未提及 | 绘制小鼠中枢神经系统的分子分辨率空间图谱，揭示脑解剖学和功能的分子基础 | 成年小鼠的大脑和脊髓 | 数字病理学 | NA | STARmap PLUS | NA | 基因表达数据 | 1.09百万个高质量细胞 |
| 13987 | 2024-08-07 |
Cell-type annotation with accurate unseen cell-type identification using multiple references
2023-06, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1011261
PMID:37379341
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研究论文 | 本文提出了一种基于多参考的单细胞RNA测序数据自动注释方法mtANN，用于准确识别未见细胞类型 | mtANN方法整合了深度学习和集成学习以提高预测准确性，并引入了一种新的度量标准，考虑三个互补方面来区分未见细胞类型和共享细胞类型 | NA | 提高细胞类型注释的准确性并发现新的生物学现象 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 深度学习和集成学习 | 基因表达数据 | 涉及两个基准数据集集合和一个COVID-19数据集集合 |
| 13988 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics reveals subtype-specific molecular profiles in Nrf2-deficient macrophages from murine atherosclerotic aortas
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1249379
PMID:37965327
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研究论文 | 本研究分析了小鼠动脉粥样硬化主动脉中缺乏Nrf2的巨噬细胞亚群的转录组 | 揭示了Nrf2缺乏导致的巨噬细胞亚型特异性转录组变化与炎症、铁稳态和细胞损伤或死亡途径之间的联系 | 仅使用了特定的小鼠模型，可能限制了结果的普遍适用性 | 研究Nrf2在小鼠动脉粥样硬化中的具体作用 | 来自小鼠动脉粥样硬化主动脉的不同Nrf2缺乏的巨噬细胞亚群 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA表达数据 | 实验中使用了Cdh5表达细胞中的Nrf2失活小鼠和适当的对照小鼠 |
| 13989 | 2024-08-07 |
Modeling gene expression cascades during cell state transitions
2024-Apr-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109386
PMID:38500834
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据和贝叶斯推理方法，对细胞状态转换过程中的基因表达动态变化进行建模 | 提出了一种贝叶斯推理方法来推断伪时间序列中细胞的转录动态，从而能够对基因表达的时序差异和调控基因相互作用进行分析 | NA | 研究细胞在分化或对外界刺激响应过程中的基因表达动态变化 | 小鼠胚胎前脑和胰腺样本的单细胞RNA测序数据 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 贝叶斯推理模型 | 基因表达数据 | 小鼠胚胎前脑和胰腺样本的单细胞RNA测序数据 |
| 13990 | 2024-08-07 |
Colorectal Cancer-Associated Myofibroblasts Exhibit Enhanced Angiogenin Expression and Signaling via the PLXNB2 Receptor
2024-Apr, The Journal of surgical research
IF:1.8Q2
DOI:10.1016/j.jss.2023.12.036
PMID:38295715
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研究论文 | 本文研究了结直肠癌相关肌成纤维细胞中血管生成素表达及通过PLXNB2受体的信号传导 | 首次在人类结直肠癌组织中发现肌成纤维细胞中血管生成素和PLXNB2受体表达上调，并探讨了其在肿瘤-基质细胞通讯中的作用 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，未涉及临床样本的直接验证 | 探讨血管生成素在人类结直肠癌中的作用及其与肌成纤维细胞的通讯机制 | 结直肠癌组织及其周围的肌成纤维细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 配对的正常人类结肠和结直肠癌组织样本 |
| 13991 | 2024-08-07 |
IDO1 Inhibition Promotes Activation of Tumor-intrinsic STAT3 Pathway and Induces Adverse Tumor-protective Effects
2024-Apr-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300545
PMID:38391297
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探讨IDO1抑制剂在肿瘤微环境中的作用及其对肿瘤细胞的影响 | 发现IDO1抑制剂不仅激活肿瘤内免疫细胞，还促进M2巨噬细胞的浸润和IL-6的分泌，进而激活JAK2/STAT3信号通路，导致肿瘤细胞在高度免疫活性下仍能存活 | 研究主要集中在小鼠模型上，尚未在人类临床试验中验证这些发现 | 探究IDO1抑制剂在癌症治疗中的临床失败原因及其对肿瘤微环境的影响 | IDO1抑制剂对肿瘤内免疫细胞和肿瘤细胞的影响 | 癌症治疗 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠结肠癌细胞CT26移植于BALB/C小鼠 |
| 13992 | 2024-08-04 |
Identification of macrophage-related genes correlated with prognosis and immunotherapy efficacy in non-small cell lung cancer
2024-Mar-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e27170
PMID:38500993
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研究论文 | 本文研究了与非小细胞肺癌预后及免疫疗效相关的巨噬细胞相关基因 | 本研究首次识别出与非小细胞肺癌患者预后和免疫疗效相关的特定巨噬细胞相关基因 | 缺乏临床验证和更大规模的样本确认 | 探索能预测非小细胞肺癌预后和药物有效性的基因标志物 | 非小细胞肺癌及其周围组织中的细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA-seq, 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 13993 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing unveils the hidden powers of zebrafish kidney for generating both hematopoiesis and adaptive antiviral immunity
2024-Mar-18, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.92424
PMID:38497789
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，揭示了斑马鱼肾脏在造血和适应性抗病毒免疫中的双重功能 | 首次全面展示了斑马鱼肾脏中59种造血干细胞/祖细胞和免疫细胞类型，并揭示了其在抗病毒免疫中的多样性功能 | NA | 阐明斑马鱼肾脏在造血和免疫系统中的功能 | 斑马鱼肾脏中的造血干细胞/祖细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 59种造血干细胞/祖细胞和免疫细胞类型 |
| 13994 | 2024-08-07 |
scRNA-seq analysis discovered suppression of immunomodulatory dependent inflammatory response in PMBCs exposed to silver nanoparticles
2024-Mar-17, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-024-02364-0
PMID:38494495
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研究论文 | 本研究通过scRNA-seq分析揭示了银纳米颗粒暴露下PBMCs中免疫调节依赖性炎症反应的抑制 | 本研究首次深入分析了单细胞水平上细胞与金属离子的关联以及特定的免疫反应 | 研究主要集中在体外模型，未涉及体内模型的验证 | 探究银纳米颗粒对PBMCs的免疫毒性 | 银纳米颗粒对PBMCs的免疫反应 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | PBMCs样本 |
| 13995 | 2024-08-04 |
Protocol to dissect and dissociate the mouse brainstem for single-cell RNA-seq applications
2024-Mar-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.102908
PMID:38461411
|
研究论文 | 本文提供了一种用于解剖和分离小鼠脑干以进行单细胞RNA-seq应用的协议 | 提出了一种针对小脑结构（如脑干核）的单细胞转录组学样本处理的新方法 | 样本产量可能较低，协议主要针对新生小鼠的脑干组织 | 研究小鼠脑干的单细胞转录组学 | 小鼠脑干及其相应的细胞样本 | 数字病理学 | NA | SmartSeq3 cDNA文库准备 | NA | 细胞 | 新生小鼠的脑干组织样本 |
| 13996 | 2024-08-04 |
Protocol for acquiring high-quality fresh mouse lung spatial transcriptomics data
2024-Mar-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102825
PMID:38280199
|
研究论文 | 本文介绍了一种高质量新鲜小鼠肺部空间转录组数据的获取协议 | 提出了一种新的协议来克服肺泡内腔给空间转录组实验带来的挑战 | 未提及协议在不同实验条件下的适用性 | 旨在为空间转录组学的实验提供一种有效的样本获取方法 | 新鲜小鼠肺组织 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | cDNA数据 | NA |
| 13997 | 2024-08-04 |
An optimized protocol for isolation of murine pancreatic single cells with high yield and purity
2024-Mar-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.102836
PMID:38219150
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研究论文 | 本文介绍了一种快速分离小鼠胰腺单细胞的优化协议 | 此研究通过优化解剖顺序、酶组成和操作程序，显著提高了可存活胰腺单细胞的产率和纯度 | NA | 旨在提供一种高效的单细胞分离方法，以支持多种研究领域 | 小鼠胰腺单细胞 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 单细胞 | NA |
| 13998 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA sequencing comparison of the human metastatic prostate spine tumor microenvironment
2024-Mar-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102805
PMID:38341849
|
研究论文 | 本文介绍了一种针对前列腺癌患者脊柱肿瘤临床标本的单细胞处理协议 | 提出了一种从手术室到实验室的单细胞处理方法，以应对脊柱肿瘤组织的异质性 | 未提及具体样本的异质性对结果的潜在影响 | 旨在识别脊柱转移瘤患者的预后标志物和治疗靶点 | 涉及前列腺癌患者的脊柱肿瘤标本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床标本 | NA |
| 13999 | 2024-08-07 |
Protocol to study the inheritance and propagation of non-genetically encoded states using barcode decay lineage tracing
2024-Mar-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102809
PMID:38180835
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研究论文 | 本文介绍了一种名为条码衰变谱系追踪结合单细胞转录组分析（BdLT-Seq）的实验方案，用于研究非遗传编码状态的继承和传播 | 提出了一种新的BdLT-Seq技术，能够在保持同质性的同时，以定向方式评估克隆进化，从而比较同源细胞谱系间的非遗传分子特征 | NA | 开发一种新的实验方案，用于研究细胞谱系中的非遗传分子特征的继承和传播 | 非遗传编码状态的继承和传播 | 生物技术 | NA | 条码衰变谱系追踪结合单细胞转录组分析（BdLT-Seq） | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
| 14000 | 2024-08-07 |
Protocol for inferring epithelial-to-mesenchymal transition trajectories from single-cell RNA sequencing data using R
2024-Mar-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102819
PMID:38183653
|
研究论文 | 本文介绍了COMET，一个用于从单细胞RNA测序数据推断上皮-间质转化（EMT）轨迹和状态间转换率的R包 | 提出了COMET R包，用于从单细胞RNA测序数据中推断EMT轨迹和状态间转换率 | NA | 研究上皮-间质转化（EMT）在癌症转移过程中的作用及其在癌症预后中的价值 | 上皮-间质转化（EMT）轨迹和状态间转换率 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 连续时间马尔可夫链 | RNA测序数据 | NA |