单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
13981 2024-08-04
Single-Cell Sequencing Reveals Functional Alterations in Tuberculosis
2024-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 这项研究揭示了结核分枝杆菌与人类免疫细胞之间相互作用的功能异质性。 开发了一种新的技术平台,结合单细胞RNA测序和细胞表面抗体测序,提供同一样本的基因组和表型信息。 研究对象限于初次结核病患者和健康对照,可能无法全面代表所有结核患者。 阐明结核病患者的免疫功能差异及其对结核病结果的影响。 分析了23990个外周血单核细胞,来自新一组初次结核患者和健康对照。 数字病理学 结核病 单细胞RNA测序,细胞表面抗体测序 NA 基因组数据,表型数据 23990个外周血单核细胞
13982 2024-08-07
Exploration of the prognostic prediction value of the PANoptosis-based risk score and its correlation with tumor immunity in lung adenocarcinoma
2024-Mar, The journal of gene medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究探索了基于PANoptosis风险评分在肺腺癌中的预后预测价值及其与肿瘤免疫的相关性 首次构建了基于PANoptosis的15个相关基因的风险模型,用于肺腺癌的预后预测 NA 探索肺腺癌中PANoptosis相关基因的预后预测价值及与肿瘤免疫的相关性 肺腺癌患者 数字病理学 肺腺癌 单细胞RNA测序 LASSO-Cox回归分析 RNA表达谱 来自The Cancer Genome Atlas和Gene Expression Omnibus数据库的肺腺癌患者数据
13983 2024-08-04
Human uterine natural killer cells regulate differentiation of extravillous trophoblast early in pregnancy
2024-02-01, Cell stem cell IF:19.8Q1
研究论文 本文探讨了人类子宫自然杀伤细胞如何调控早期妊娠中滋养层细胞的分化 通过单细胞转录组学及体外模型,识别了促进滋养层细胞分化的uNK细胞来源的细胞因子信号 NA 研究uNK细胞在滋养层细胞侵入子宫环境中的作用及其对妊娠结果的影响 人类子宫自然杀伤细胞和滋养层细胞的相互作用 数字病理学 妊娠相关疾病 单细胞转录组学 器官样本模型 组织样本 使用滋养层细胞类器官和原代组织样本
13984 2024-08-07
A time- and single-cell-resolved model of murine bone marrow hematopoiesis
2024-02-01, Cell stem cell IF:19.8Q1
研究论文 本文通过结合持续标记与时间序列单细胞RNA测序,构建了一个实时定量的体内组织动态模型,用于小鼠骨髓造血作用 本文通过结合单细胞表达模式与分化和生长速度的动态变化,揭示了不同谱系间自我更新和分化特性的广泛变化 NA 构建一个实时定量的体内组织动态模型,以理解小鼠骨髓造血作用 小鼠骨髓造血作用 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA序列 NA
13985 2024-08-04
Stimulated Human Umbilical Cord Mesenchymal Stem Cells Enhance the Osteogenesis and Cranial Bone Regeneration through IL-32 Mediated P38 Signaling Pathway
2024, Stem cells international IF:3.8Q2
研究论文 本研究探讨了刺激人脐带间充质干细胞(S-HuMSCs)对骨生成和颅骨再生的影响,重点分析了IL-32介导的P38信号通路 发现IL-32可以通过激活P38信号通路增强间充质干细胞的骨生成分化,揭示了IL-32在颅骨损伤治疗中的潜在疗效 本研究主要在体外和动物模型中进行,临床应用的效果尚待进一步验证 研究刺激人脐带间充质干细胞对骨生成及颅骨再生的机制 人脐带间充质干细胞(S-HuMSCs)及其IL-32高表达变体(IL-32highHuMSCs) 数字病理学 NA 单细胞测序、流式细胞术、定量实时聚合酶链反应、西方印迹 NA 细胞、组织 实验中使用了多种细胞类型和一只大鼠颅骨缺损模型
13986 2024-08-07
Cancer-associated fibroblast spatial heterogeneity and EMILIN1 expression in the tumor microenvironment modulate TGF-β activity and CD8+ T-cell infiltration in breast cancer
2024, Theranostics IF:12.4Q1
研究论文 本文通过结合单细胞RNA测序和空间转录组数据,研究了乳腺癌中癌症相关成纤维细胞(CAF)群体与免疫细胞排除之间的关系 首次展示了乳腺癌中不同CAF群体的空间组织程度,并发现EMILIN1表达与CD8+ T细胞浸润和高患者预后相关 研究结果表明,仅将TGF-β信号与特定CAF亚群相关联是不够的,因为来自其他CAF亚群的蛋白质可以调节其活性 探索肿瘤微环境中癌症相关成纤维细胞与免疫细胞之间的相互作用 乳腺癌中的癌症相关成纤维细胞和免疫细胞 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA 转录组数据 75例乳腺癌患者样本
13987 2024-08-07
Identification of Transcriptomic Signatures of Pancreatic Ductal Adenocarcinoma-Derived Exosomes That Promote Macrophage M2 Polarization and Predict Prognosis: S100A9 Reveals Tumor Progression
2024, Clinical Medicine Insights. Oncology
研究论文 本研究通过分析胰腺导管腺癌(PDAC)细胞衍生的外泌体中的关键基因,揭示了其促进巨噬细胞M2极化并预测预后的机制,特别是S100A9在肿瘤进展中的作用 本研究首次建立了PDAC衍生外泌体和M2巨噬细胞的风险评分模型,并揭示了S100A9在巨噬细胞M2极化中的重要作用 NA 探讨胰腺导管腺癌细胞衍生的外泌体如何促进巨噬细胞M2极化及其在预后预测中的作用 胰腺导管腺癌细胞衍生的外泌体、巨噬细胞M2极化、S100A9基因 数字病理学 胰腺癌 差异表达基因分析(DEGs)、加权基因共表达网络分析(WGCNA)、多变量Cox回归分析、定量聚合酶链反应(qPCR)、蛋白质印迹(western blot)、流式细胞术、细胞转染、Transwell实验、CCK-8实验 风险评分模型 基因表达数据 使用来自exoRbase 2.0、TCGA和ICGC数据库的数据,以及BxPC-3细胞系的外泌体进行体外实验
13988 2024-08-07
Matrisome gene-based subclassification of patients with liver fibrosis identifies clinical and molecular heterogeneities
2023-10-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
研究论文 本文通过分析肝纤维化患者的转录组数据,识别并验证了与肝纤维化相关的基质基因(LFMGs),并探讨了这些基因在临床和生物学上的相关性 本文首次识别了与病因无关的肝纤维化特异性基质基因(LFMGs),并揭示了这些基因在肝纤维化进展和逆转中的表达模式和细胞景观 NA 旨在揭示与病因无关的基质基因,这些基因在临床上与肝纤维化相关 肝纤维化患者的转录组数据和临床特征 数字病理学 肝纤维化 RNA测序 NA 转录组数据 35个肝纤维化特异性基质基因(LFMGs)
13989 2024-08-07
An immune cell atlas reveals the dynamics of human macrophage specification during prenatal development
2023-09-28, Cell IF:45.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,绘制了人类胚胎发育期间(4-26周)巨噬细胞分化动态的图谱 首次在多个组织中识别出15种巨噬细胞亚型,包括类似小胶质细胞和促血管生成巨噬细胞,并揭示了它们在胚胎发育中的分布和功能 NA 揭示人类胚胎发育期间巨噬细胞的多样性和发育动态 人类胚胎发育期间的巨噬细胞 NA NA 单细胞RNA测序 NA RNA序列 涉及19个组织的巨噬细胞
13990 2024-08-07
Mapping the two distinct proliferative bursts early in T-cell development
2023-09, Immunology and cell biology IF:3.2Q3
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序结合轨迹推断方法,精确确定了T细胞发育过程中胸腺细胞进入细胞周期的时机 首次精确界定了T细胞发育早期两个增殖爆发的时间点,即在双阴性(DN) 2a阶段和DN3b阶段 NA 研究T细胞发育过程中早期的两个增殖爆发 T细胞发育过程中的胸腺细胞 免疫学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA NA
13991 2024-08-07
RNA sequencing of single allergen-specific memory B cells after grass pollen immunotherapy: Two unique cell fates and CD29 as a biomarker for treatment effect
2023-03, Allergy IF:12.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了草花粉免疫治疗后特异性记忆B细胞的变化,并探讨了CD29作为治疗效果生物标志物的可能性 首次揭示了草花粉免疫治疗后特异性记忆B细胞存在两种独特的转录特征,并发现CD29可作为治疗效果的早期生物标志物 研究样本量较小,仅涉及四名患者,可能影响结果的普遍性 探讨草花粉免疫治疗对特异性记忆B细胞的影响及其作为治疗效果生物标志物的潜力 特异性记忆B细胞及其表面蛋白表达变化 NA 过敏性鼻炎 单细胞RNA测序 NA RNA 27名对黑麦草花粉敏感且患有季节性鼻炎的患者
13992 2024-08-04
Single-cell RNA-seq analyses inform necroptosis-associated myeloid lineages influence the immune landscape of pancreas cancer
2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 研究揭示了胰腺癌中与坏死性凋亡相关的髓系细胞谱系对免疫环境的影响 首次识别出与坏死性凋亡相关的10个基因以及三种髓系细胞亚群体 未提及研究的局限性 探讨胰腺导管腺癌中肿瘤浸润髓系细胞的特性和影响 16名胰腺导管腺癌患者的肿瘤和正常组织细胞 数字病理学 胰腺癌 scRNA-seq NA 细胞 12个原发肿瘤组织和4个转移肿瘤组织,3个正常胰腺组织,以及PBMC样本
13993 2024-08-07
Myeloid PFKFB3-mediated glycolysis promotes kidney fibrosis
2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究探讨了髓系细胞中糖酵解途径在肾脏纤维化发展中的作用 首次揭示了髓系细胞中糖酵解途径在肾脏纤维化中的作用,并提出靶向髓系糖酵解是一种新的抑制肾脏纤维化的方法 研究主要基于小鼠模型,未来需在人类样本中验证其有效性和安全性 研究髓系细胞中糖酵解途径在肾脏纤维化中的作用 髓系细胞中的糖酵解途径及其在肾脏纤维化中的作用 NA 肾脏疾病 单细胞RNA测序 NA RNA 小鼠模型中的髓系细胞
13994 2024-08-07
Chemical immune conization of precancerous cervical lesions awakens immune cells and restores normal HPV negative and abnormal proliferation
2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 研究使用半抗原增强的肿瘤内化疗(HEIC)治疗宫颈癌前病变和HPV感染的效果 提出了一种新的治疗策略,即通过半抗原增强的肿瘤内化疗来激活免疫细胞,防止宫颈癌前细胞的异常增殖 研究仅基于单一患者的细胞样本,可能需要进一步的临床试验来验证其普遍性和有效性 探讨半抗原增强的肿瘤内化疗对宫颈癌前病变和HPV感染的治疗效果 宫颈癌前病变组织和HPV感染 数字病理学 宫颈癌 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) NA 转录组 40,239个细胞
13995 2024-08-07
Novel tumor-associated macrophage populations and subpopulations by single cell RNA sequencing
2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 本文通过单细胞RNA测序技术探讨了四种新型肿瘤相关巨噬细胞亚群在不同实体瘤中的核心基因特征及其功能 利用单细胞RNA测序技术识别与特定功能相关的肿瘤相关巨噬细胞亚群 单细胞RNA测序识别的细胞类型和亚群与其实际功能之间可能存在潜在的脱节 探讨肿瘤相关巨噬细胞在不同实体瘤中的亚群及其功能 肿瘤相关巨噬细胞及其亚群 数字病理学 肿瘤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 不同实体瘤组织中的多个样本
13996 2024-08-07
Recent advances in cancer-associated fibroblast: Biomarkers, signaling pathways, and therapeutic opportunities
2024-Mar-20, Chinese medical journal IF:7.5Q1
综述 本文综述了癌症相关成纤维细胞(CAFs)的研究进展,重点关注其表型和功能的异质性、特定信号通路以及涉及CAFs的治疗策略 单细胞RNA测序和遗传工程小鼠模型增进了对CAF多样性的理解,并定义了许多亚型 CAFs在肿瘤微环境中的复杂性仍大部分未知,且针对CAFs的临床试验结果并不乐观 探讨CAFs在肿瘤微环境中的作用及其作为潜在治疗靶点的可能性 癌症相关成纤维细胞(CAFs)及其在肿瘤微环境中的作用 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA NA
13997 2024-08-07
Switch of innate to adaptative immune responses in the brain of patients with Alzheimer's disease correlates with tauopathy progression
2024-Mar-18, npj aging IF:4.1Q2
研究论文 本研究通过分析阿尔茨海默病(AD)患者大脑中的单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据,揭示了在tauopathy进展过程中,从先天免疫反应向适应性免疫反应的转变 首次通过单细胞RNA测序数据证实了阿尔茨海默病患者大脑中先天免疫反应向适应性免疫反应的转变 NA 探讨阿尔茨海默病中神经炎症的关键特征及其与tauopathy进展的关系 阿尔茨海默病患者大脑中的免疫反应变化 数字病理学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA NA
13998 2024-08-07
Activated mesenchymal stem/stromal cells promote myeloid cell differentiation via CCL2/CCR2 signaling
2024-Mar-12, Stem cell reports IF:5.9Q2
研究论文 本研究探讨了间充质干细胞/基质细胞(MSCs)通过CCL2/CCR2信号通路对造血干细胞/祖细胞(HSPCs)分化的影响 首次揭示了MSCs通过分泌CCL2促进粒细胞/巨噬细胞祖细胞向髓系分化的机制 NA 探索MSCs对HSPCs分化的影响及其机制 间充质干细胞、造血干细胞/祖细胞、髓系细胞 NA NA 单细胞RNA测序 NA RNA 涉及小鼠和人类骨髓细胞
13999 2024-08-07
Antidepressant fluoxetine alleviates colitis by reshaping intestinal microenvironment
2024-03-12, Cell communication and signaling : CCS IF:8.2Q1
research paper 本文研究了抗抑郁药氟西汀通过重塑肠道微环境缓解结肠炎的作用及其分子机制 首次揭示了氟西汀通过影响不同细胞群的分布、细胞间通讯和KEGG通路富集来减轻结肠炎症的作用 NA 探讨抗抑郁药氟西汀缓解结肠炎的生物效应和分子机制 C56BL/6小鼠的IBD模型及其对照组 NA Inflammatory bowel diseases (IBD) RT-qPCR, western blot, 单细胞RNA测序, H&E染色, 免疫组织化学染色 NA 单细胞RNA测序数据 C56BL/6小鼠的IBD模型及其对照组
14000 2024-08-07
An organism-wide atlas of hormonal signaling based on the mouse lemur single-cell transcriptome
2024-Mar-11, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究利用鼠狐猴(Microcebus murinus)的全器官单细胞转录组图谱,系统地绘制了84类激素的源细胞和目标细胞 该研究揭示了先前未被表征的激素调控位点,并展示了激素信号网络密集连接、分散且富含反馈回路的特性 NA 旨在系统地研究激素信号在全器官水平上的作用 鼠狐猴的激素信号网络及其与人类的比较 NA NA 单细胞转录组 NA 转录组数据 涉及84类激素的源细胞和目标细胞
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