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当前共找到 39637 篇文献，本页显示第 1381 - 1400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1381 | 2026-05-07 |
Dynamic dysregulation of retrotransposons in neurodegenerative diseases at the single-cell level
2024-10-29, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279363.124
PMID:39424325
|
研究论文 | 利用12个单细胞转录组图谱研究三种神经退行性疾病中逆转录转座子的动态失调 | 首次在单细胞水平系统研究神经退行性疾病中逆转录转座子的动态变化，并构建了scARE数据库 | 未明确说明 | 探究逆转录转座子在神经退行性疾病中的细胞异质性和动态调控 | 阿尔茨海默病、帕金森病和多发性硬化症患者样本 | 单细胞转录组学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 单细胞转录组数据 | 12个单细胞转录组图谱 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1382 | 2026-05-07 |
Mapping RANKL- and OPG-expressing cells in bone tissue: the bone surface cells as activators of osteoclastogenesis and promoters of the denosumab rebound effect
2024-Oct-18, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-024-00362-4
PMID:39424806
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研究论文 | 通过原位杂交和单细胞RNA测序分析，揭示骨表面细胞在RANKL/OPG通路中激活破骨细胞生成及促成denosumab反弹效应的作用 | 首次利用原位杂交直接鉴定骨表面细胞在RANKL/OPG通路中的角色，并揭示OPG:Fc处理导致局部破骨细胞激活位点积累的机制 | 该研究主要基于小鼠模型，人类数据依赖公开数据库，且未完全阐明denosumab反弹效应的全部细胞机制 | 探究骨表面细胞通过RANKL/OPG通路激活破骨细胞生成及denosumab反弹效应的细胞机制 | 小鼠骨组织及人类骨样本中的骨表面细胞、骨细胞和骨髓基质细胞 | 机器学习和数字病理学 | 骨骼疾病 | 原位杂交、单细胞RNA测序 | NA | 图像、基因表达数据 | 多种物种、骨骼部位及经OPG:Fc和PTH处理的小鼠样本 | 未明确提及 | 单细胞RNA测序 | 未明确提及 | 公开可用的小鼠骨髓基质细胞单细胞RNA测序数据 |
| 1383 | 2026-05-07 |
A spatiotemporally resolved atlas of mRNA decay in the C. elegans embryo reveals differential regulation of mRNA stability across stages and cell types
2024-09-20, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.278980.124
PMID:39142810
|
研究论文 | 通过转录抑制结合批量及单细胞RNA测序，直接测量线虫胚胎发育过程中全转录组的mRNA降解速率，揭示mRNA稳定性在不同阶段和细胞类型中的差异调控 | 首次实现胚胎发育过程中时空分辨的mRNA降解速率全转录组测量，并识别不同细胞类型和发育阶段中差异调控的mRNA降解 | NA | 研究线虫胚胎发育过程中mRNA降解的时空调控及其对基因表达动态的影响 | 线虫胚胎 | NA | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1384 | 2026-05-07 |
Benchmarking bulk and single-cell variant-calling approaches on Chromium scRNA-seq and scATAC-seq libraries
2024-09-20, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.277066.122
PMID:39147582
|
研究论文 | 评估在Chromium scRNA-seq和scATAC-seq文库上进行批量与单细胞变异检测的方法 | 系统比较了基于批量聚合读取与单个细胞的变异检测方法在10x Genomics平台上的表现，发现批量方法显著优于单细胞方法，并揭示了单细胞方法中RNA编辑事件的潜在捕获与噪声模式 | 未涵盖所有变异检测工具，且结果基于特定平台（10x Genomics Chromium），可能不适用于其他单细胞技术 | 评估在Chromium scRNA-seq和scATAC-seq文库上不同变异检测方法的优劣与挑战 | 匹配的批量全基因组测序样本库 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq, scATAC-seq, 全基因组测序 | NA | 测序数据 | 多个匹配的批量全基因组测序样本库（具体数量未在摘要中提供） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序文库 |
| 1385 | 2026-05-07 |
A gene regulatory network-aware graph learning method for cell identity annotation in single-cell RNA-seq data
2024-08-20, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.278439.123
PMID:39134412
|
研究论文 | 提出一种基于基因调控网络感知的图学习方法scHGR，用于单细胞RNA-seq数据的细胞身份注释 | 利用基因调控关系构建基因介导的细胞通信图，减少数据源噪声并建立远距离细胞连接，在22个场景中实现准确一致注释 | 未提及具体局限性 | 开发自动化细胞注释工具，提高跨批次、技术、组织和物种数据的注释准确性和鲁棒性 | 单细胞转录组数据中的细胞身份，包括外周血单个核细胞和COVID-19患者细胞图谱 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq | 图学习模型 | 基因表达数据 | 22种场景的数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1386 | 2026-05-07 |
Accurate estimation of pathway activity in single cells for clustering and differential analysis
2024-07-23, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.278431.123
PMID:38981682
|
研究论文 | 提出SiPSiC方法，用于推断单细胞中通路活性，并进行聚类和差异分析 | 提出SiPSiC方法，可在每个单细胞水平推断通路活性，实现更敏感的差异分析和聚类，并能克服患者特异性伪影 | 未明确提及局限性 | 开发准确估计单细胞中通路活性的方法，用于聚类和差异分析 | COVID-19、肺腺癌和胶质瘤数据集中的单细胞 | 机器学习 | COVID-19, 肺腺癌, 胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | COVID-19、肺腺癌和胶质瘤数据集（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1387 | 2026-05-07 |
Piezo inhibition prevents and rescues scarring by targeting the adipocyte to fibroblast transition
2023-Apr-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.03.535302
PMID:37066136
|
研究论文 | 本研究通过机械感应机制揭示脂肪细胞转化为瘢痕成纤维细胞的过程，并证明抑制Piezo可防止和逆转瘢痕形成 | 首次证实脂肪细胞在机械力感应下可转化为成纤维细胞驱动瘢痕形成，并发现Piezo抑制即使在已形成的瘢痕中也能诱导再生愈合 | 未明确说明局限性 | 探究脂肪细胞是否通过机械感应参与瘢痕纤维化，并评估Piezo抑制的治疗潜力 | 小鼠伤口模型和人源异种移植伤口模型中的脂肪细胞与成纤维细胞转化 | 数字病理学 | 瘢痕形成 | 单细胞RNA测序、空间转录组学Visium、CODEX多重成像 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据、成像数据 | 小鼠伤口模型和人源异种移植伤口模型 | 10x Genomics, 其他未指定 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 蛋白质组学成像 | 10x Chromium, 10x Visium, CODEX | 10x Chromium用于单细胞RNA测序，10x Visium用于空间转录组学，CODEX用于多重蛋白成像 |
| 1388 | 2026-05-06 |
Altered crosstalk of bacterial lipopolysaccharide with immune cells in colorectal cancer compared to paired adjacent intestinal tissue
2026-Dec-31, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2026.2665878
PMID:42084500
|
研究论文 | 应用3D光片成像、空间转录组学和成像质谱流式技术，比较结直肠癌与癌旁组织中细菌脂多糖与免疫细胞的交互作用变化 | 首次在患者来源的结直肠癌及癌旁组织中，结合多种空间组学技术同时可视化细菌脂多糖、免疫细胞和血管，揭示了肿瘤微环境中免疫细胞-细菌交互作用的区域差异 | 样本量有限，未深入探讨细菌组成对交互作用的具体影响机制 | 探究结直肠癌中细菌脂多糖与免疫细胞空间交互作用的改变及其对宿主-微生物互作的影响 | 结直肠癌患者肿瘤组织及其配对癌旁肠组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 3D光片成像, 空间转录组学, 成像质谱流式 | NA | 图像, 转录组数据 | 患者来源的结直肠癌及癌旁组织样本 | NA | 空间转录组学, 成像质谱流式 | NA | NA |
| 1389 | 2026-05-06 |
IFN-I-Mediated Transcriptional Reprogramming Drives Myeloid-Skewed Hematopoiesis in Sickle Cell Anemia
2026-Jun, American journal of hematology
IF:10.1Q1
DOI:10.1002/ajh.70277
PMID:41853894
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和功能实验，揭示镰状细胞贫血中I型干扰素介导的转录重编程驱动髓系偏斜造血 | 首次阐明镰状细胞贫血中I型干扰素信号异常激活导致造血干细胞向髓系过早分化的内在机制，并发现造血祖细胞通过上调CSF3R对G-CSF产生响应，从而偏向单核细胞谱系 | NA | 探索镰状细胞贫血中病理性髓系造血和慢性炎症的内在机制 | 镰状细胞贫血患者的造血干细胞和多能祖细胞 | NA | 镰状细胞贫血 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1390 | 2026-03-13 |
Molecular subtypes of vascular endothelial cell differentiation in keloid by single-cell sequencing
2026-May-05, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003971
PMID:41813334
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1391 | 2026-05-06 |
Induction alectinib or crizotinib for stage III NSCLC harboring ALK fusion: A study with 4-year follow-up
2026-May-05, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003798
PMID:41139663
|
研究论文 | 评估阿来替尼或克唑替尼诱导治疗ALK融合阳性III期非小细胞肺癌的短期和长期疗效，并伴有4年随访数据 | 首次系统性评估ALK-TKI诱导治疗在局部晚期NSCLC中的疗效，结合纵向单细胞RNA测序分析肿瘤微环境变化 | 样本量较小（40例），且为回顾性研究，可能存在选择偏倚 | 验证ALK靶向诱导治疗在III期肺癌中的疗效和安全性 | ALK融合阳性的IIIA-IIIB期非小细胞肺癌患者 | 医学影像分析 | 肺癌 | ALK-TKI诱导治疗、单细胞RNA测序 | NA | 临床数据、纵向单细胞RNA测序数据 | 40例III期NSCLC患者 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 1392 | 2026-05-06 |
Patient-derived surgical samples reveal the cellular and molecular signatures of glioblastoma infiltration in distinct radiological zones
2026-May-05, Brain pathology (Zurich, Switzerland)
DOI:10.1111/bpa.70106
PMID:42083511
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研究论文 | 研究揭示胶质母细胞瘤在不同放射学区域浸润的细胞和分子特征 | 首次结合MRI分区与多区域活检，系统描述GBM周边区域的细胞景观与临床关联 | 基于MRI的nCE区域分类低估了水肿区域内的肿瘤浸润 | 定义GBM外周区域的细胞景观及其临床意义 | 45例胶质母细胞瘤患者的161份活检样本 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 免疫组化、单细胞RNA测序转录组分析 | NA | 图像、转录本数据 | 45例患者，161份活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1393 | 2026-05-06 |
Constitutive interferon epsilon expression shapes antiviral epithelial states in the female reproductive tract and intestine
2026-May-05, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00340-26
PMID:42084361
|
研究论文 | 研究干扰素ε在雌性生殖道和肠道中组成型表达对抗病毒上皮状态的调控作用 | 首次揭示IFNε在雌性生殖道外（尤其是肠道）的功能，证明其作为组成型、空间限制性干扰素协调黏膜抗病毒防御的独特机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本仅限于原代细胞，缺乏体内功能验证；肠道中IFNε的具体调控机制尚未完全阐明 | 探究干扰素ε在不同黏膜表面（雌性生殖道和肠道）的细胞来源、表达规律及抗病毒功能 | 小鼠和人类原代雌性生殖道细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠（包括不同肠段和发情周期样本）及人类原代细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 测序平台 |
| 1394 | 2026-05-06 |
Advances in sex-specific single-cell transcriptomic profiling in Parkinson's disease
2026-May-05, Journal of Parkinson's disease
DOI:10.1177/1877718X261436548
PMID:42084601
|
综述 | 综述单细胞转录组学在帕金森病研究中的应用进展，重点关注性别特异性分子改变 | 系统总结了单细胞RNA测序技术揭示帕金森病中细胞异质性和性别特异性分子变化的创新发现 | 主要基于现有文献总结，未涵盖所有潜在性别差异研究，且技术方法仍在快速发展中 | 探讨单细胞转录组学如何深化对帕金森病病理机制的理解，并强调性别意识研究设计的重要性 | 帕金森病相关细胞类型，包括多巴胺能神经元、小胶质细胞和少突胶质细胞 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1395 | 2026-05-06 |
Syrah: a pipeline to maximize spatial transcriptomics data output
2026-May-04, G3 (Bethesda, Md.)
DOI:10.1093/g3journal/jkag107
PMID:42081452
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研究论文 | Syrah是一个用于最大化空间转录组学数据输出的分析流程，通过识别和纠正Slide-seqV2和Curio Seeker数据集中的条形码错误来显著提高可用读数 | 提出基于生化模型和条形码序列数据的错误校正方法，无需额外数据集或复杂计算，相比传统精确匹配方法可多恢复35%的读数 | 未提及 | 开发一种能够最大化空间转录组学数据输出的分析流程 | Slide-seqV2和Curio Seeker空间转录组数据集 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | Slide-seqV2, Curio Seeker | Slide-seqV2和Curio Seeker空间转录组平台 |
| 1396 | 2026-05-06 |
Cell-o1: Training LLMs to Solve Single-Cell Reasoning Puzzles with Reinforcement Learning
2026-May-04, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag208
PMID:42082388
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研究论文 | 本文提出一个名为CellPuzzles的基准测试，将单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释重塑为批量级推理任务，并训练了7B参数的大语言模型Cell-o1，通过监督微调和强化学习实现最先进的批量级细胞类型注释性能 | 创新性地提出了批量级推理的细胞类型注释范式CellPuzzles，以及通过监督微调蒸馏推理轨迹和强化学习训练的Cell-o1模型，实现了跨多种组织、疾病和供体条件的高性能推理注释 | 未明确提及限制，但从上下文推断可能包括：模型依赖高质量推理轨迹数据、在极端复杂或少见细胞类型时的泛化能力可能受限、批量级精度提升但推理开销增加 | 提高大语言模型在单细胞RNA测序数据中批量级细胞类型注释的推理能力和准确性 | 来自不同组织、疾病和供体条件的单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释任务 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | 大语言模型 | 文本 | CellPuzzles基准测试涵盖多种组织、疾病和供体条件，具体样本量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1397 | 2026-05-06 |
REACTOR: REgulon Activity analysis and Comparison Tool for single-cell transcriptOmics Research
2026-May-04, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag203
PMID:42082398
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研究论文 | 介绍了一种名为REACTOR的计算工具，用于分析单细胞RNA测序数据中转录调控因子及其靶基因的差异调控活性 | 引入稳健统计检验来检测多重复条件下（如疾病与对照）的差异调控活性，从而识别关键条件和细胞类型特异性调控子 | 未明确提及局限性 | 开发一种能够检测单细胞转录组数据中转录调控因子差异活性的工具 | 单细胞RNA测序数据中的转录调控子活性 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1398 | 2026-05-06 |
Multi-omics reveals CXCR4 drives immune escape in colorectal cancer via metabolic reprogramming and immune microenvironment remodeling
2026-May-04, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08795-x
PMID:42082463
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研究论文 | 通过整合单细胞转录组学和代谢组学分析，揭示CXCR4通过谷氨酰胺代谢重编程和免疫微环境重塑驱动结直肠癌免疫逃逸的新机制 | 首次发现CXCR4通过PI3K-Akt-SMAD4通路介导代谢重编程，并双向调控“谷氨酰胺代谢-免疫微环境”轴，驱动肿瘤相关巨噬细胞极化和CD8 T细胞耗竭，为克服免疫检查点阻断疗法耐药提供了新靶点 | 研究主要基于结直肠癌小鼠模型和体外实验，结果需要在临床样本中进一步验证；CXCR4的具体下游分子机制仍有待深入探究 | 揭示CXCR4在结直肠癌免疫抑制微环境和谷氨酰胺代谢重编程中的关键作用，以及其对免疫检查点阻断疗法的影响 | 结直肠癌细胞、肿瘤相关巨噬细胞、CD8 T细胞、结直肠癌荷瘤小鼠 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞转录组学、代谢组学 | NA | 单细胞转录组数据、代谢组数据、体外共培养实验数据 | 体外实验使用结直肠癌细胞系；体内实验使用结直肠癌荷瘤小鼠 | NA | 单细胞RNA测序、代谢组学 | NA | NA |
| 1399 | 2026-05-06 |
Single-cell transcriptome sequencing (ScRNA-seq) uncovers the regulatory role of lodicule cells in rice floret opening (FO)
2026-May-04, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10191-2
PMID:42082742
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示水稻浆片细胞在颖花开放中的调控作用 | 首次在单细胞水平解析浆片细胞调控水稻颖花开放的分子机制，发现了韧皮部与浆片细胞间的通信涉及钙离子、可溶性糖和水分的运输，并揭示了细胞壁重塑相关基因的异质性激活 | 未明确提及实验局限性，但样本仅涉及开花前后两个时间点，可能未覆盖整个发育过程的动态变化 | 探究水稻浆片细胞调控颖花开放的潜在分子机制 | 水稻小穗的开花前后样本 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 开花前和开花后两个时间点的小穗样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1400 | 2026-05-06 |
IgG2a-formatted 4-1BB agonism combined with S100A9 inhibition enhances T cell activation and tumor control in a preclinical model of multiple myeloma
2026-May-04, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-026-03716-4
PMID:42082972
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研究论文 | 本研究探讨了IgG2a形式4-1BB激动剂联合S100A9抑制剂在多发性骨髓瘤小鼠模型中增强T细胞活化和肿瘤控制的效果 | 首次验证了4-1BB激动剂的亚型特异性抗肿瘤效应，并建立了联合S100A9抑制剂的协同治疗策略 | 仅基于小鼠模型和有限的患者样本，缺乏临床试验验证 | 评估4-1BB刺激联合S100A9抑制在多发性骨髓瘤免疫治疗中的潜力 | 多发性骨髓瘤小鼠模型（5TGM1荷瘤小鼠）和新诊断多发性骨髓瘤患者骨髓样本 | 免疫治疗 | 多发性骨髓瘤 | scRNA-seq，流式细胞术 | NA | 基因表达数据，免疫细胞表型数据 | 小鼠模型（具体数量未明确）和多名新诊断多发性骨髓瘤患者骨髓样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |