单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 32070 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2025-11-02 |
Single-Cell and Machine Learning Analysis Reveal Novel Inflammatory Macrophage Subtypes and Biomarkers in Periodontitis
2025-Oct-30, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2025.103983
PMID:41172679
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和机器学习分析牙周炎中新型炎症巨噬细胞亚型及其生物标志物 | 首次发现牙周炎相关的巨噬细胞新亚型，并构建了具有诊断价值的基因特征 | 研究样本量有限，主要基于体外实验验证 | 识别牙周炎相关巨噬细胞亚群并探索其诊断和预后意义 | 牙周炎患者和健康对照者的牙龈组织 | 机器学习 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 牙周炎患者和健康对照者的牙龈组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 122 | 2025-11-02 |
A Glycerophospholipid Metabolism-Based Prognostic Model Guides Osteosarcoma Therapy
2025-Oct-30, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102572
PMID:41172875
|
研究论文 | 本研究基于甘油磷脂代谢构建了一个预后模型，用于指导骨肉瘤的治疗策略 | 首次将甘油磷脂代谢与骨肉瘤预后和免疫治疗反应相关联，开发了优于42个已发表特征的预后模型 | 样本量相对有限，需要进一步验证 | 探索甘油磷脂代谢在骨肉瘤进展、免疫和治疗中的作用 | 骨肉瘤患者和细胞 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 转录组分析 | Lasso-Cox模型 | 基因表达数据 | TARGET队列85例，GEO队列124例，单细胞RNA-seq数据6个样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 123 | 2025-11-02 |
Characterizing hypoxia-orchestrated post-stroke changes in oligodendrocyte precursor cells for optimized cell therapy
2025-Oct-30, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102687
PMID:41173004
|
研究论文 | 本研究通过整合小鼠单细胞RNA测序数据与体外实验，揭示了缺血性脑卒中后少突胶质前体细胞在不同缺氧程度下的动态适应性变化 | 首次发现'氧张力'是调控OPC在脑卒中后动态适应的关键因素，并识别出两种新型OPC亚群：急性期的'血管生成型OPC'和慢性期的'少突胶质生成型OPC' | 研究主要基于小鼠模型，人类临床适用性需进一步验证 | 探索缺血性脑卒中后少突胶质前体细胞的功能适应性及其在细胞治疗中的优化策略 | 少突胶质前体细胞(OPCs)和小鼠脑卒中模型 | 单细胞生物学 | 缺血性脑卒中 | 单细胞RNA测序, 细胞培养, 细胞移植 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 124 | 2025-11-02 |
Cell-cell fusion and immunostimulatory cytokines significantly impact oncolytic vaccinia virus immunotherapeutic potential
2025-Oct-30, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.10.055
PMID:41174883
|
研究论文 | 本研究开发了一种携带IL-12和CCL21两种免疫刺激细胞因子的融合性溶瘤痘苗病毒，显著增强了对远端肿瘤的免疫治疗效果 | 首次将细胞融合特性与双细胞因子（IL-12和CCL21）武装相结合，通过单细胞转录组分析揭示了该疗法如何系统性地激活肿瘤免疫微环境 | 研究基于小鼠双侧肿瘤模型，临床转化效果需进一步验证；未详细探讨长期安全性和潜在毒副作用 | 提高溶瘤病毒对远端转移肿瘤的免疫治疗效果，克服病毒疗法在转移性肿瘤中的耐药性 | 小鼠双侧肿瘤模型、肿瘤免疫微环境、CD8 T细胞亚群 | 免疫治疗 | 转移性肿瘤 | 单细胞转录组分析、病毒工程改造、免疫细胞分析 | NA | 基因表达数据、免疫细胞表型数据 | 小鼠双侧肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 125 | 2025-11-02 |
FLT3LG as an inflammatory hub bridging tumor immune surveillance to therapy response in breast cancer
2025-Oct-29, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01889-4
PMID:41152656
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现FLT3LG作为炎症枢纽在乳腺癌免疫监视和治疗反应中发挥关键保护作用 | 首次通过单细胞RNA测序和炎症基因网络分析鉴定FLT3LG为乳腺癌的关键保护因子，并揭示其与不同突变谱和免疫治疗反应的关联 | NA | 探索乳腺癌中炎症驱动的免疫失调机制并寻找新的预后标志物和治疗靶点 | 乳腺癌患者队列和肿瘤样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 基因网络分析, 功能分析, 遗传谱分析 | NA | 基因表达数据, 突变数据, 临床数据 | 多个患者队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 126 | 2025-10-31 |
SpateCV: cross-modality alignment regularization of cell types improves spatial gene imputation for spatial transcriptomics
2025-Oct-29, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07245-0
PMID:41162996
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 127 | 2025-11-02 |
Single-cell RNA sequencing reveals beneficial mechanisms of Exendin-4 in autoimmune uveitis
2025-Oct-29, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2025.117483
PMID:41173056
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了Exendin-4在自身免疫性葡萄膜炎中的有益作用机制 | 首次探索Exendin-4在自身免疫性葡萄膜炎中的作用，发现其通过抑制PIM1-AKT-FOXO1通路恢复效应T细胞/调节性T细胞平衡 | NA | 探究Exendin-4在自身免疫性葡萄膜炎中的治疗机制 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎(EAU)模型和Vogt-Koyanagi-Harada病(VKH)患者 | 单细胞组学 | 自身免疫性葡萄膜炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 128 | 2025-11-02 |
Single-cell spatial transcriptomics reveal intraglomerular cell activation and ligand-receptor relationships in chronic, active antibody mediated rejection
2025-Oct-29, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2025.08.042
PMID:41173191
|
研究论文 | 利用单细胞空间转录组技术揭示慢性活动性抗体介导排斥反应中肾小球内细胞激活状态和配体-受体关系 | 首次在单细胞分辨率下应用空间转录组技术解析CAMR中肾小球内细胞的空间分子相互作用 | 样本量有限，仅分析福尔马林固定石蜡包埋肾活检组织 | 阐明慢性活动性抗体介导排斥反应的分子机制 | 肾移植患者活检组织中的肾小球内皮细胞、自然杀伤细胞和巨噬细胞 | 空间转录组学 | 肾移植排斥反应 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | CAMR患者和对照组的肾活检组织 | NA | 单细胞空间转录组学 | CosMx Spatial Molecular Imager | CosMx空间分子成像仪 |
| 129 | 2025-11-02 |
Recent Advances and Applications of Single-cell Sequencing in Insects
2025-Oct-29, Current opinion in insect science
IF:5.8Q1
DOI:10.1016/j.cois.2025.101455
PMID:41173389
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术在昆虫科学研究中的最新进展与应用 | 展示了单细胞多组学技术如何将昆虫科学从基础描述转向功能机制研究，并展望了高通量空间转录组学的潜力 | NA | 探讨单细胞基因组学在昆虫生物学研究中的应用与未来发展 | 昆虫生理、发育、免疫和进化过程 | 基因组学 | NA | 单细胞测序，单细胞多组学，空间转录组学 | 深度学习算法 | 基因组数据，转录组数据，表观基因组数据，蛋白质组数据，代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，单细胞多组学，空间转录组学 | NA | NA |
| 130 | 2025-11-02 |
Exhausted KLRG1hi CD8+ T and Pathogenic GZMA+ Th17 Cells Are Associated with the Mild Mycoplasma pneumoniae Pneumonia in Children
2025-Oct-29, The Journal of infection
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.jinf.2025.106642
PMID:41173398
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和高维流式细胞术分析儿童轻度肺炎支原体肺炎中T细胞和B淋巴细胞的功能障碍 | 首次在MPP患儿中系统表征耗竭性KLRG1hi CD8+ T细胞和致病性GZMA+ Th17细胞的免疫特征 | 研究仅针对轻度肺炎患者且为单中心研究，样本量有限 | 探究适应性免疫在儿童轻度肺炎支原体肺炎发病机制中的作用 | 儿童轻度肺炎支原体肺炎患者的外周T淋巴细胞和B淋巴细胞 | 单细胞生物学 | 肺炎支原体肺炎 | 单细胞RNA测序, 高维流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 131 | 2025-11-02 |
Mitochondrial-activity-driven hematopoietic stem cell fate and lineage choice is first established in the aorta-gonad-mesonephros
2025-Oct-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116296
PMID:40966086
|
研究论文 | 本研究揭示了小鼠胚胎主动脉-性腺-中肾区域中线粒体活性动态变化驱动造血干细胞和祖细胞功能异质性的机制 | 首次证明胚胎发育早期线粒体活性差异决定造血干细胞谱系选择倾向，并阐明了Wnt和PI3K信号通路在此过程中的作用机制 | 研究主要基于小鼠胚胎模型，在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究线粒体代谢在胚胎造血干细胞发育过程中的作用机制 | 小鼠胚胎主动脉-性腺-中肾区域的造血干细胞和祖细胞 | 发育生物学 | 血液系统疾病 | 单细胞转录组测序, 药理学干预, 遗传学方法, 体外功能实验, 体内功能实验 | NA | 基因表达数据, 功能实验数据 | 小鼠胚胎造血干细胞和祖细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 132 | 2025-11-02 |
Differentiation latency and dormancy signatures define fetal liver hematopoietic stem cells at single-cell resolution
2025-Oct-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116289
PMID:40971295
|
研究论文 | 本研究通过单细胞技术揭示了胎儿肝脏造血干细胞具有分化延迟和生物合成休眠的特征 | 首次在单细胞水平定义了胎儿肝脏造血干细胞的分化延迟特征，并开发了模拟胎儿肝脏内皮生态位的培养平台 | 未明确说明研究样本的具体数量限制 | 探索胎儿肝脏造血干细胞自我更新的内在和外在调控机制 | 胎儿肝脏造血干细胞 | 单细胞生物学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 活细胞成像, 移植实验 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 133 | 2025-11-02 |
Single-cell analysis uncovers preserved prostate cancer lineages and universally altered pathways in Matrigel-free patient-derived organoids
2025-Oct-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116352
PMID:41037396
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析无基质胶的前列腺癌患者来源类器官，揭示了其细胞异质性和保留的患者特异性癌细胞谱系 | 发现无基质胶培养条件能更好地保留前列腺癌患者特异性细胞谱系，建立了前列腺类器官单细胞图谱(PPScA)，重新定义了细胞类型标志物 | 研究主要关注短期培养，对长期培养效果和临床转化价值需要进一步验证 | 改进前列腺癌患者来源类器官的培养方法并研究其细胞生物学特性 | 前列腺癌患者来源类器官 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 134 | 2025-11-02 |
scRNA-seq reveals persistent aberrant differentiation of nasal epithelium driven by TNFα and TGFβ in post-COVID syndrome
2025-Oct-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-64778-0
PMID:41152229
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示TNFα和TGFβ驱动的新冠后综合征患者鼻上皮持续异常分化的分子机制 | 首次发现新冠后综合征的持续症状并非由持续病毒载量驱动，而是由免疫细胞活性和慢性细胞因子产生导致，并确定了TNFα-TGFβ轴的关键作用 | 样本量相对有限（25例患者），仅针对鼻上皮组织进行研究 | 探究新冠后综合征的分子机制和潜在治疗策略 | 25名中度或重度新冠后综合征患者的鼻活检组织 | 单细胞转录组学 | 新冠后综合征 | 单细胞RNA测序，气液界面培养 | NA | 单细胞转录组数据 | 25例新冠后综合征患者鼻活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 135 | 2025-11-02 |
Mapping NK cell diversity in response to COVID-19 and mRNA vaccination
2025-Oct-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-11575-w
PMID:41152298
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了NK细胞在COVID-19重症患者和mRNA疫苗接种者中的多样性形成机制 | 发现外周NK细胞发育存在分叉路径，适应性NK细胞在COVID-19恢复期通过克隆扩增和线粒体氧化磷酸化增强形成 | 样本来源仅限于血液NK细胞，未涉及组织驻留NK细胞的研究 | 探索NK细胞功能异质性的形成机制及其在免疫应答中的作用 | COVID-19重症患者、BNT162b2疫苗接种者和健康捐赠者的血液NK细胞 | 免疫学 | COVID-19 | scRNA-seq | 轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | COVID-19重症患者（急性期和ICU后）、mRNA疫苗接种者、健康捐赠者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 136 | 2025-11-02 |
Deletion of cardiac fibroblast growth factor-23 beneficially impacts myocardial energy metabolism in left ventricular hypertrophy
2025-Oct-28, npj metabolic health and disease
DOI:10.1038/s44324-025-00087-w
PMID:41152461
|
研究论文 | 本研究通过特异性敲除心肌细胞中的Fgf23基因，探讨心脏FGF23在左心室肥厚中的作用及其对心肌能量代谢的影响 | 首次揭示心脏特异性FGF23缺失通过调节葡萄糖转运和脂肪酸氧化改善心肌能量代谢 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 阐明心脏FGF23在左心室肥厚发展中的具体作用机制 | 心肌细胞特异性Fgf23敲除小鼠模型 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 空间代谢组学, 空间转录组学, 基因敲除技术 | 小鼠疾病模型 | 分子生物学数据, 代谢组学数据, 转录组学数据 | 实验小鼠模型 | NA | 空间代谢组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 137 | 2025-11-02 |
Evidence from spatial transcriptomics for the mosaic hypothesis and pure cell types in the cortex
2025-Oct-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116363
PMID:41045459
|
研究论文 | 通过空间转录组学数据验证大脑皮层中神经元类型的镶嵌假说和纯细胞类型 | 开发了针对空间转录组数据的统计点过程分析框架，首次在大脑皮层中系统验证了神经元空间回避现象 | 仅在大脑皮层中进行了验证，未涉及其他脑区；空间回避原则的普适性仍需进一步研究 | 验证大脑皮层神经元是否存在类似视网膜的镶嵌分布模式 | 大脑皮层兴奋性和抑制性神经元 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 统计点过程分析框架 | 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 138 | 2025-11-02 |
Emergence of endothelial subtypes and role of cell cycle control in arterial-venous specification during embryonic vascular development
2025-Oct-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116368
PMID:41066228
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了胚胎血管发育过程中内皮细胞亚型的出现及细胞周期控制在动静脉分化中的关键作用 | 首次在胚胎发育早期阶段系统揭示了细胞周期状态与动静脉分化的直接关联，并利用Fucci胚胎模型验证了不同细胞周期阶段的内皮细胞具有特定的转录特征 | 研究主要聚焦于胚胎发育早期阶段（E8.0-E9.5），未涉及更晚期的发育过程 | 探究细胞周期控制在胚胎血管发育过程中动静脉分化中的作用机制 | 小鼠胚胎内皮细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序，Fucci荧光标记技术 | NA | 基因表达数据，成像数据 | E8.0、E8.5和E9.5三个时间点的胚胎内皮细胞 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | NA | NA |
| 139 | 2025-11-02 |
Stomach encyclopedia: Combined single-cell and spatial transcriptomics reveal cell diversity and homeostatic regulation of human stomach
2025-Oct-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116503
PMID:41100257
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 140 | 2025-11-02 |
CCL26 and CXCL12 preserve insulin-sensitizing macrophages in subcutaneous adipose tissue in obesity
2025-Oct-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116450
PMID:41100258
|
研究论文 | 本研究揭示了肥胖状态下皮下脂肪组织通过CCL26和CXCL12信号通路维持胰岛素敏感巨噬细胞的新机制 | 首次发现皮下脂肪组织巨噬细胞释放的小细胞外囊泡具有改善胰岛素敏感性的功能，并阐明CCL26和CXCL12信号通路在维持保护性巨噬细胞群体中的关键作用 | 研究主要聚焦于机制探索，临床转化潜力尚需进一步验证 | 探究肥胖状态下皮下脂肪组织抵抗胰岛素抵抗的分子机制 | 皮下脂肪组织巨噬细胞(ATMs)、小细胞外囊泡(sEVs)、脂肪细胞及其前体细胞 | 代谢疾病研究 | 肥胖相关代谢疾病 | 单细胞RNA测序, 体内外细胞生长和迁移测量 | NA | 基因表达数据, 细胞功能数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |