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当前共找到 39915 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2026-05-31 |
PVAED: prior-guided variational autoencoders with diffusion denoising for interpretable single-cell representation learning
2026-May-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag259
PMID:42202286
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research paper | 提出了一种名为PVAED的框架，将生物先验知识整合到变分自编码器中，并利用扩散去噪模块改进潜在表示，用于可解释的单细胞RNA测序数据降维 | 创新性地将生物先验知识整合到变分自编码器中，结合扩散去噪模块和邻域保持损失项，实现了可解释的单细胞表示学习 | 未提及具体的局限性 | 提升单细胞RNA测序数据的降维效果和可解释性 | 单细胞RNA测序数据 | machine learning | NA | RNA-seq | 变分自编码器（VAE） | 基因表达数据 | 多个基准数据集 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 122 | 2026-05-31 |
REACTOR: REgulon Activity analysis and Comparison Tool for single-cell transcriptOmics Research
2026-May-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag203
PMID:42082398
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研究论文 | 介绍REACTOR，一种用于检测单细胞RNA测序数据中转录调控因子及其靶基因（调控子）差异活性的计算工具 | 通过引入稳健的统计检验来检测不同条件（如疾病与对照）下调控子的差异活性，且支持多个重复样本，扩展了现有的调控子分析框架 | 未明确说明局限性，可能依赖于单细胞数据质量 | 开发一种计算工具，用于分析单细胞RNA测序数据中转录调控子的差异活性 | 单细胞RNA测序数据中的转录调控因子及其靶基因（调控子） | 机器学习 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 使用公开可用的COVID-19数据集 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 123 | 2026-05-31 |
mosna Reveals Different Types of Cellular Interactions Predictive of Response to Immunotherapies and Survival in Cancer
2026-May, Molecular & cellular proteomics : MCP
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.mcpro.2026.101536
PMID:41759628
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研究论文 | 开发了一个名为mosna的Python包，用于分析空间组学数据并整合临床数据，以揭示与免疫治疗反应和癌症生存相关的不同细胞互作类型 | mosna兼容所有空间组学技术，提供从特征计算到机器学习模型训练的完整分析流程，并能无缝整合临床数据（如治疗反应和生存数据），首次在空间组学分析中系统评估细胞生态位对免疫治疗响应的预测能力 | 主要依赖空间网络构建的质量，对大规模数据计算资源需求较高，且部分算法性能仅在少数数据集上验证 | 开发一个易于使用的空间组学分析工具，整合临床数据以识别与免疫治疗反应和癌症生存相关的细胞互作模式 | 空间蛋白质组和空间转录组数据集中的细胞相互作用模式及组织结构 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, MERFISH, seqFISH, Xenium, CODEX, MIBI-TOF, 低多重免疫荧光 | 机器学习模型 | 空间组学数据（含图像和表达数据） | 三个数据集：两个空间蛋白质组数据集和一个空间转录组数据集 | 10x Genomics | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | 10x Visium | 10x Visium（用于空间转录组）；MERFISH, seqFISH, Xenium（亚细胞分辨率转录组）；CODEX, MIBI-TOF（蛋白质组）；Slide-seq, Stereo-seq（基于点的空间转录组） |
| 124 | 2026-05-31 |
Multi-omic characterization of nasopharyngeal carcinoma delineates the subtype-specific landscape of response to induction chemotherapy
2026-May, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-026-01149-8
PMID:41986499
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研究论文 | 通过多组学分析描绘鼻咽癌对诱导化疗反应的亚型特异性景观 | 首次通过蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、基因组学和转录组学等多组学整合，识别出鼻咽癌对吉西他滨+顺铂诱导化疗具有不同治疗脆弱性的三种蛋白质组亚型，并揭示了IgA浆细胞浸润预测化疗耐药但对抗PD-1治疗有效的机制 | 研究仅基于240例患者，亚型分类的普适性需更大队列验证；机制验证依赖单细胞RNA测序和空间分析，功能实验证据有待加强 | 识别鼻咽癌对诱导化疗反应的预测标志物并揭示亚型特异性治疗反应机制 | 接受吉西他滨+顺铂诱导化疗或单独同步放化疗的鼻咽癌患者肿瘤样本 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、基因组学、转录组学、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据、磷酸化蛋白质组数据、基因组数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据、空间分析数据 | 240例鼻咽癌患者肿瘤样本 | NA | 蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、基因组学、转录组学、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 125 | 2026-05-31 |
A spatial atlas of the healthy human liver from live donors
2026-May, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-026-10377-y
PMID:41986723
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研究论文 | 利用空间转录组学和单核RNA测序构建健康人体肝脏空间基因表达图谱，并揭示早期脂肪变性肝细胞的动态变化 | 首次从活体健康捐赠者获取肝脏样本，避免了传统死后或病变邻近组织样本的基因表达偏差，并结合多种空间转录组学技术（Visium、Visium HD、MERFISH、PhenoCycler）和单核RNA测序进行全面分析 | 样本量有限（16个样本），且仅涉及早期脂肪变性，未涵盖其他肝脏疾病阶段 | 构建健康人体肝脏的空间基因表达参考图谱，并研究早期脂肪变性中肝细胞的变化 | 健康肝脏和病变肝脏的邻近正常组织 | 空间转录组学 | 肝脏疾病 | 空间转录组学、单核RNA测序（snRNA-seq）、多重抗误差荧光原位杂交（MERFISH）、PhenoCycler成像 | NA | 基因表达数据、图像 | 16个肝脏样本：8个来自年轻健康活体捐赠者，8个来自肝脏病变个体的邻近正常组织 | 10x Genomics, Vizgen, Akoya Biosciences | 空间转录组学, 单核RNA测序, 多重抗误差荧光原位杂交, PhenoCycler成像 | 10x Visium, 10x Visium HD, MERFISH, PhenoCycler | 10x Visium空间转录组学、10x Visium HD高分辨率空间转录组学、Vizgen MERFISH多重抗误差荧光原位杂交、Akoya PhenoCycler成像系统 |
| 126 | 2026-05-31 |
Spatial atlas of diabetic kidney disease reveals a B cell-rich subgroup
2026-May, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-026-10363-4
PMID:42056516
|
研究论文 | 利用空间转录组学和单核RNA测序构建糖尿病肾病空间图谱，揭示以B细胞为主的亚群与疾病进展加速相关 | 跨平台整合Xenium和CosMx单细胞空间转录组学与单核RNA测序，首次构建可计算的组织架构图谱，并鉴定出以B细胞为主的免疫微环境定义的糖尿病肾病亚型 | 未提及 | 建立糖尿病肾病的空间转录组图谱，识别不同预后亚群及其组织微环境特征 | 糖尿病肾病患者的肾脏组织样本 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 空间转录组学、单核RNA测序 | 未提及 | 空间转录组数据、单核RNA测序数据 | 未明确提及样本数量 | 10x Genomics、NanoString | 单细胞空间转录组学、单核RNA测序 | Xenium、CosMx | 未提及具体平台配置 |
| 127 | 2026-05-31 |
TNBC Spatial Transcriptomic Analysis across Clinical States Reveals Subtype-Specific Networks and Immunosuppressive Niches
2026-May-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-25-0808
PMID:42100798
|
研究论文 | 利用GeoMx空间转录组学分析非转移性原发肿瘤、转移性原发肿瘤和淋巴结转移的临床状态，揭示三阴性乳腺癌亚型特异性网络和免疫抑制微环境 | 提出了免疫空间分子亚型（ISMS）框架，整合分子亚型、免疫浸润和空间结构，揭示TNBC在疾病进展中的异质性和免疫空间可塑性 | 研究样本量有限，且仅关注TNBC亚型切换和免疫空间特征，未涵盖其他乳腺癌分子亚型的全面分析 | 通过空间转录组学表征乳腺癌在临床状态转变中的转录组和免疫空间变化 | 非转移性原发肿瘤、转移性原发肿瘤和淋巴结转移样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 包含非转移性原发肿瘤、转移性原发肿瘤和淋巴结转移样本，具体数量未在摘要中说明 | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx | GeoMx 空间转录组学平台用于组织区域转录组分析 |
| 128 | 2026-05-31 |
Redundant and distinct mechanisms suppress innate immune activation during SARS-CoV-2 infection
2026-May, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3003808
PMID:42160380
|
研究论文 | 利用一系列重组SARS-CoV-2病毒，揭示NSP1与NSP15等蛋白通过冗余和不同机制抑制先天免疫激活 | 首次通过构建12个点突变的重组SARS-CoV-2病毒库，系统比较多种病毒蛋白在感染背景下对先天免疫的抑制相对贡献，并明确NSP1和NSP15在抑制I型干扰素应答和树突状细胞成熟中的关键作用 | 未在动物模型中对其他突变蛋白（如NSP2、ORF6等）进行体内验证；体外实验主要基于293T-ACE2/TMPRSS2细胞和Calu-3细胞系，可能不能完全代表体内感染微环境 | 阐明SARS-CoV-2感染过程中多种病毒蛋白抑制宿主先天免疫的机制及其相对重要性 | SARS-CoV-2病毒蛋白（NSP1、NSP2、NSP3、NSP6、NSP12、NSP13、NSP14、NSP15、NSP16、ORF3a、ORF6和ORF8）及相关突变病毒，人类细胞（293T-ACE2/TMPRSS2，Calu-3），人单核细胞来源树突状细胞，K18 hACE2转基因小鼠 | 分子生物学 | COVID-19 | 细菌人工染色体介导的诱变，ISRE驱动的荧光素酶报告基因检测，RNA-seq，单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据，单细胞转录组数据 | 12个重组SARS-CoV-2病毒突变体；293T-ACE2/TMPRSS2细胞；Calu-3细胞；人单核细胞来源树突状细胞；K18 hACE2转基因小鼠（具体数量未说明） | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA-seq平台 |
| 129 | 2026-05-31 |
[A new nomenclature for natural killer cells]
2026-May, Medecine sciences : M/S
DOI:10.1051/medsci/2026080
PMID:42213981
|
综述 | 基于单细胞转录组学进展提出自然杀伤细胞新命名法 | 整合单细胞转录组数据对NK细胞进行统一分类，揭示其在肿瘤微环境中的行为与功能障碍机制 | 未提及具体技术局限性或命名法验证方法 | 建立自然杀伤细胞的标准化分类体系并理解其抗肿瘤机制 | 自然杀伤细胞 | 单细胞转录组学 | 肿瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 130 | 2026-05-31 |
Multi-Omics Analysis and Mechanistic Validation Reveal RPS8 as a Novel Prognostic Biomarker and Therapeutic Target for Hepatocellular Carcinoma
2026 May-Jun, BioFactors (Oxford, England)
DOI:10.1002/biof.70116
PMID:42216580
|
研究论文 | 通过多组学分析和机制验证，揭示RPS8作为肝细胞癌新型预后生物标志物和治疗靶点的作用 | 首次系统阐明核糖体蛋白S8在肝细胞癌中的促癌作用及其通过激活内质网应激通路促进肿瘤进展的分子机制 | 未提及具体局限性 | 探究RPS8在肝细胞癌进展中的生物学功能、临床意义及调控机制 | 肝细胞癌组织样本、细胞系及小鼠模型 | 数字病理学 | 肝癌 | 多组学分析, 单细胞RNA测序, 全转录组测序, 体外功能实验, 体内异种移植模型 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 蛋白质数据 | 利用TCGA和GEO公共数据集，具体样本量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序, 全转录组测序 | NA | NA |
| 131 | 2026-05-31 |
Atypical memory B cell clonal expansion and inflammatory programs associate with platelet-activating antibody development in COVID-19
2026-Apr-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.201033
PMID:41746733
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研究论文 | 运用单细胞RNA测序和B细胞受体库测序，揭示COVID-19患者中与血小板激活抗体产生相关的非典型记忆B细胞克隆扩增和炎症特征 | 首次系统描述血小板激活抗体阳性COVID-19患者的免疫特征，特别是非典型记忆B细胞的克隆扩增和RKH/Y5重链基序的富集 | 本摘要未明确提及研究局限性 | 鉴定与COVID-19患者血小板激活抗体产生相关的免疫特征 | COVID-19患者中产生血小板激活抗体（PEA+）和不产生抗体（PEA-）的亚群 | 数字病理学 | 冠状病毒病 | 单细胞RNA测序、单B细胞V(D)J-seq、血浆细胞因子和趋化因子分析 | NA | 基因表达数据、序列数据、蛋白质数据 | 未明确提及样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq、单细胞B细胞V(D)J-seq | NA | NA |
| 132 | 2026-05-31 |
Single-cell transcriptome profiling reveals the heterogeneity of ossification of the posterior longitudinal ligament (OPLL) and its immune microenvironment
2026-Apr-18, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-026-10193-0
PMID:42000969
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示后纵韧带骨化（OPLL）的细胞异质性和免疫微环境 | 首次通过单细胞RNA测序构建OPLL病变组织的细胞图谱，描绘了从软骨祖细胞到骨化的分化轨迹，并揭示了SPP1-CD44信号在免疫-基质相互作用中的关键作用 | 样本量较小（4,683个细胞），且仅基于手术切除的颈椎OPLL病变组织，可能无法完全代表不同部位或阶段的OPLL | 探索OPLL的细胞异质性和免疫微环境，阐明其发病机制 | 从人类患者手术切除的颈椎OPLL病变组织中分离的4,683个细胞 | 单细胞组学 | 后纵韧带骨化 | 单细胞RNA测序 | 伪时间分析 | 单细胞转录组数据 | 4,683个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 133 | 2026-04-20 |
Deciphering immune and cellular reprogramming during the progression from inflammatory bowel disease to colorectal cancer using multi-omics single-cell and spatial transcriptomics
2026-Apr-18, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08158-2
PMID:42001187
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 134 | 2026-05-31 |
Dedifferentiation-driven oncogenic stemness promotes tumor-sustaining adaptability in the intestinal epithelium
2026-Apr-17, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08669-2
PMID:41997917
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研究论文 | 揭示去分化驱动的癌干细胞特性如何促进肠道上皮肿瘤的适应性存活 | 首次证明去分化来源的癌干细胞比内源性突变干细胞更能维持肿瘤发生，并发现Notch信号异常和代谢可塑性是其关键机制 | 基于小鼠模型的发现是否完全适用于人类肿瘤尚需验证 | 研究肠道上皮去分化驱动的肿瘤发生机制及其对肿瘤异质性和持续性的影响 | 小鼠肠道上皮细胞（Smad4功能缺失/β-catenin功能获得模型） | 计算机视觉 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用Smad4:β-catenin小鼠模型，具体样本数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 135 | 2026-04-19 |
Single-Cell RNA Sequencing Identifies a Distinct Epithelial Subpopulation Driving Resistance to Neoadjuvant Chemoimmunotherapy in Esophageal Squamous Cell Carcinoma
2026-Apr-17, Biological procedures online
IF:3.7Q1
DOI:10.1186/s12575-026-00337-1
PMID:41998494
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 136 | 2026-05-31 |
Biomimetic KeMA hydrogel encapsulating CAP-EVs-MEF2C for inhibiting inflammation and senescence in intervertebral disc degeneration
2026-Apr-17, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04416-z
PMID:41998644
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研究论文 | 开发一种包载CAP-EVs-MEF2C的KeMA水凝胶，通过调节MEF2C/P21/CDK2轴抑制椎间盘退变中的炎症和衰老 | 利用单细胞RNA测序鉴定MEF2C为关键调控因子，并通过仿生水凝胶系统实现靶向递送和持续释放，以协同抑制炎症和细胞衰老 | 未提及体内长期效果评估及潜在免疫原性 | 开发一种新型生物材料系统治疗椎间盘退变 | 软骨终板软骨细胞和髓核细胞 | 机器学习 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 137 | 2026-04-17 |
Single-cell transcriptomics uncovers heterogenous cell clusters and the biomarker FUT11 in ovarian cancer progression
2026-Apr-15, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-026-04299-y
PMID:41987229
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 138 | 2026-05-31 |
Hypoxia-Induced Fibroblast IL-6 Promotes Immunosuppressive Macrophage Phenotypes in Pancreatic Cancer
2026-Apr-13, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15080683
PMID:42041553
|
研究论文 | 揭示缺氧诱导的成纤维细胞IL-6通过JAK/STAT信号通路促进胰腺癌中免疫抑制性巨噬细胞表型的机制 | 利用胰腺星状细胞-肿瘤类器官共培养模型和单细胞RNA测序分析，首次揭示缺氧驱动的成纤维细胞重编程通过IL-6/JAK/STAT轴促进免疫抑制性巨噬细胞表型 | NA | 阐明缺氧微环境如何通过肿瘤-成纤维细胞-巨噬细胞互作促进胰腺导管腺癌免疫抑制 | 胰腺星状细胞、肿瘤类器官、巨噬细胞 | 计算机视觉 | 胰腺导管腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | na |
| 139 | 2026-05-31 |
Single-cell transcriptomics reveals FXR1 as an actionable target for siRNA therapy in ovarian cancer
2026-Apr-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71468-y
PMID:41932914
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示FXR1可作为卵巢癌siRNA治疗的可行靶点 | 首次通过单细胞RNA测序分析证实FXR1沉默能抑制肿瘤细胞增殖并减少促肿瘤M2型巨噬细胞，同时增加抗肿瘤特性的细胞毒性T细胞、NK细胞和树突状细胞 | 未明确提及局限性，可能涉及长期疗效和安全性评估不足 | 探索FXR1作为卵巢癌治疗靶点的潜力及其通过siRNA治疗的机制 | 卵巢癌肿瘤组织、腹水中的肿瘤细胞、基质细胞和免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, siRNA干扰 | NA | 单细胞转录组数据 | 涉及卵巢癌腹水样本中的肿瘤、基质和免疫细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 未在标题和摘要中明确提供平台配置细节 |
| 140 | 2026-05-31 |
MYC-induced USP10 stabilizes SOX4 to promote thymocyte proliferation and leukemia onset in mice
2026-Apr-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71084-w
PMID:41927540
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研究论文 | 本研究整合去泛素化酶文库筛选和公开的单细胞RNA测序数据，发现USP10通过稳定SOX4促进胸腺细胞增殖和小鼠白血病发生，并揭示其作为T-ALL治疗靶点的潜力 | 首次发现去泛素化酶USP10在胸腺细胞发育和T-ALL中的双重作用，阐明MYC-USP10-SOX4信号轴在白血病发生中的新机制 | 未在人类样本中验证USP10抑制剂疗效，且缺乏对USP10在正常组织中的长期安全性评估 | 探究胸腺细胞发育与白血病转化之间的分子机制，特别是去泛素化酶在其中的调控作用 | 小鼠胸腺细胞、人类胸腺细胞、T-ALL患者外周血样本 | 数字病理学 | T细胞急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型及公开人类胸腺细胞单细胞数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 公开的人类胸腺细胞单细胞RNA测序数据 |