单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
121	2025-06-04	Identification of potential immune-related mechanisms related to the development of multiple myeloma 2024-Jul-05, Chinese medical journal IF:7.5Q1 DOI:10.1097/CM9.0000000000003116 PMID:38844445	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术分析了多发性骨髓瘤患者的骨髓免疫微环境，特别是单核/巨噬细胞的作用	首次全面描述了治疗初发多发性骨髓瘤患者的骨髓免疫细胞特征，特别是发现干扰素相关免疫细胞亚群和免疫抑制性单核/巨噬细胞的富集	样本量相对有限，且仅针对治疗初发患者进行研究	阐明多发性骨髓瘤患者骨髓免疫微环境的特征，特别是单核/巨噬细胞的作用机制	多发性骨髓瘤患者和健康捐赠者的骨髓免疫细胞	生物医学	多发性骨髓瘤	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、转录组分析、流式细胞术	NA	基因表达数据、流式细胞数据	治疗初发多发性骨髓瘤患者和健康捐赠者的样本
122	2025-06-04	6-Formylindolo[3,2-b]carbazole, a potent ligand for the aryl hydrocarbon receptor, attenuates concanavalin-induced hepatitis by limiting T-cell activation and infiltration of proinflammatory CD11b+ Kupffer cells 2024-05-29, Journal of leukocyte biology IF:3.6Q2 DOI:10.1093/jleuko/qiae018 PMID:38366630	研究论文	本研究探讨了FICZ通过激活芳烃受体在自身免疫性肝炎模型中的抗炎作用及其机制	首次揭示了FICZ通过调控CD3+ T细胞活化和CD11b+ Kupffer细胞浸润减轻肝炎的分子机制	研究仅使用小鼠模型，尚未在人体中验证	探究FICZ通过芳烃受体途径对自身免疫性肝炎的保护作用	小鼠自身免疫性肝炎模型	免疫学	自身免疫性肝炎	单细胞RNA测序、转座酶可及染色质测序(ATAC-seq)	NA	基因表达数据、染色质可及性数据	未明确说明具体样本数量的小鼠模型
123	2025-06-04	Recent advances in cancer-associated fibroblast: Biomarkers, signaling pathways, and therapeutic opportunities 2024-Mar-20, Chinese medical journal IF:7.5Q1 DOI:10.1097/CM9.0000000000003031 PMID:38420743	综述	本文总结了癌症相关成纤维细胞（CAFs）的研究进展，重点关注其表型和功能的异质性、特定信号通路以及涉及CAFs的治疗策略	综述了CAFs的异质性、信号通路和表观遗传变化，并探讨了CAFs作为治疗靶点的潜力	CAFs在肿瘤微环境中的复杂性仍知之甚少，针对CAFs的临床试验结果大多不理想	探讨CAFs在肿瘤微环境中的作用及其作为治疗靶点的潜力	癌症相关成纤维细胞（CAFs）	肿瘤生物学	癌症	单细胞RNA测序、基因工程小鼠模型	NA	NA	NA
124	2025-06-04	Mapping inherited genetic variation with opposite effects on autoimmune disease and cancer identifies candidate drug targets associated with the anti-tumor immune response 2023-Dec-28, medRxiv : the preprint server for health sciences DOI:10.1101/2023.12.23.23300491 PMID:38234717	研究论文	通过系统性分析遗传变异与自身免疫性疾病和癌症的相反关联，识别出潜在的癌症免疫治疗靶点	首次系统地识别出与自身免疫性疾病风险和癌症保护相关的遗传变异，并验证了五个基因作为潜在的癌症免疫治疗靶点	研究主要基于GWAS数据，功能验证仍需进一步实验	识别具有相反自身免疫性疾病和癌症效应的遗传变异，以发现新的癌症免疫治疗靶点	乳腺癌、前列腺癌、卵巢癌和子宫内膜癌患者及自身免疫/自身炎症性疾病患者	遗传学	癌症	GWAS, RNA-Seq, 单细胞RNA-Seq	NA	基因组数据, 转录组数据	240,540例癌症患者/317,000例对照和112,631例自身免疫/自身炎症性疾病患者/895,386例对照
125	2025-06-04	An atlas of immune cell transcriptomes in human immunodeficiency virus-infected immunological non-responders identified marker genes that control viral replication 2023-Nov-20, Chinese medical journal IF:7.5Q1 DOI:10.1097/CM9.0000000000002918 PMID:37914674	研究论文	本研究通过单细胞转录组测序分析了HIV感染免疫无应答者的免疫细胞亚型特征，并鉴定了与病毒复制相关的标志基因	首次在单细胞水平上比较了HIV感染免疫应答者和无应答者的免疫细胞转录组差异，并发现了一组与HIV复制相关的单核细胞标志基因	样本量相对较小，仅分析了外周血单个核细胞，未涉及其他组织中的免疫细胞	探究HIV感染免疫无应答者特定免疫细胞亚型的特征	HIV感染免疫应答者和无应答者的外周血单个核细胞	免疫学	HIV感染/艾滋病	单细胞转录组测序	NA	转录组数据	免疫应答者(CD4+T细胞计数>500)和免疫无应答者(CD4+T细胞计数<300)的外周血单个核细胞
126	2025-06-04	Ovarian cancer mutational processes drive site-specific immune evasion 2022-12, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-022-05496-1 PMID:36517593	研究论文	该研究通过整合全基因组测序、单细胞RNA测序、数字组织病理学和多重免疫荧光技术，分析了42名未经治疗的高级别浆液性卵巢癌患者的160个肿瘤部位，揭示了突变过程和肿瘤解剖位置如何决定肿瘤微环境的免疫状态	首次揭示了卵巢癌突变过程与解剖位置如何共同决定肿瘤微环境的免疫状态，并发现了不同突变类型肿瘤的免疫逃逸机制差异	样本量相对有限（42名患者），且仅针对治疗初治患者进行研究	评估突变过程和肿瘤解剖位置如何决定肿瘤微环境的免疫状态	42名未经治疗的高级别浆液性卵巢癌患者的160个肿瘤部位	数字病理学	卵巢癌	全基因组测序、单细胞RNA测序、数字组织病理学、多重免疫荧光	NA	基因组数据、转录组数据、图像数据	42名患者的160个肿瘤部位
127	2025-06-04	Intratumor heterogeneity and T cell exhaustion in primary CNS lymphoma 2022-Sep-24, Genome medicine IF:10.4Q1 DOI:10.1186/s13073-022-01110-1 PMID:36153593	研究论文	本研究通过流式细胞术、单细胞RNA测序、B细胞受体测序和空间转录组学技术，深入分析了原发性中枢神经系统淋巴瘤（PCNSL）的肿瘤异质性和T细胞耗竭现象	首次在PCNSL中揭示了恶性B细胞的转录和空间肿瘤内异质性，并发现T细胞耗竭与高度恶性的B细胞簇共定位	研究样本量有限，且仅分析了活检、血液和脑脊液中的细胞	探究PCNSL的肿瘤异质性和免疫微环境特征	原发性中枢神经系统淋巴瘤（PCNSL）细胞及其微环境中的T细胞	数字病理学	淋巴瘤	流式细胞术、单细胞RNA测序、B细胞受体测序、空间转录组学	NA	单细胞转录组数据、空间转录组数据	活检组织、血液和脑脊液样本（具体数量未明确说明）
128	2025-06-03	Paricalcitol plus hydroxychloroquine enhances gemcitabine activity and induces mesenchymal to epithelial transition in pancreatic ductal adenocarcinoma: A single cell RNA-seq analysis 2025-Aug-10, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2025.217809 PMID:40409452	研究论文	本研究探讨了帕立骨化醇、羟氯喹与吉西他滨联合治疗对胰腺导管腺癌中上皮-间质转化（EMT）的影响	首次在单细胞RNA测序水平上揭示了GPH联合治疗通过下调纤维连接蛋白（Fn1）和相关信号通路减少EMT的分子机制	研究仅基于KPC-Luc小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证	探索针对胰腺导管腺癌EMT过程的新型联合治疗方案	KPC-Luc原位小鼠模型中的胰腺导管腺癌细胞	肿瘤学	胰腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、高维加权基因共表达网络分析（hdWGCNA）、细胞间通讯分析	KPC-Luc小鼠模型	单细胞转录组数据	未明确说明样本量（基于KPC-Luc小鼠模型）
129	2025-06-03	Decoding the corneal immune microenvironment in healthy and diabetic mice during corneal wound healing 2025-Jul, The ocular surface DOI:10.1016/j.jtos.2025.02.010 PMID:40023495	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术解析了健康和糖尿病小鼠角膜在稳态和伤口愈合过程中免疫细胞的转录变化	首次建立了健康和糖尿病小鼠角膜伤口愈合过程中免疫细胞的全面单细胞RNA测序转录组图谱	研究仅针对小鼠模型，尚未在人类样本中验证	探究糖尿病角膜病变(DK)中免疫微环境的变化机制	健康和糖尿病小鼠的角膜免疫细胞	生物医学	糖尿病角膜病变	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	转录组数据	健康和糖尿病小鼠的角膜样本
130	2025-06-03	Investigating the molecular mechanisms and clinical potential of APO+ endothelial cells associated with PANoptosis in the tumor microenvironment of hepatocellular carcinoma using single-cell sequencing data 2025-Jul, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2025.102402 PMID:40318262	研究论文	该研究利用单细胞RNA测序数据探索了肝细胞癌肿瘤微环境中与PANoptosis相关的APO+内皮细胞的分子机制及临床潜力	首次系统性地研究了PANoptosis在肝细胞癌肿瘤微环境中的细胞分布和功能，并揭示了APO+内皮细胞在改善预后和免疫治疗效果中的潜在机制	样本量相对较小（16例患者），且研究结果需要进一步的实验验证	探究PANoptosis在肝细胞癌肿瘤微环境中的具体功能和分子机制	肝细胞癌患者的肿瘤微环境细胞	数字病理学	肝细胞癌	单细胞RNA测序	AUCell算法、CytoTRACE、scMetabolism	单细胞RNA测序数据	16例肝细胞癌患者的单细胞RNA测序样本
131	2025-06-03	SARS-CoV-2 Infection of Human Lung Air-Liquid Interface Cultures Reveals Basal Cells as Relevant Targets 2025-Jun-02, The Journal of infectious diseases IF:5.0Q1 DOI:10.1093/infdis/jiaf125 PMID:40065723	research paper	该研究通过感染人类原代鼻和支气管上皮细胞的空气-液体界面培养物，揭示了基底细胞在SARS-CoV-2感染中的重要作用	研究发现基底细胞是SARS-CoV-2的重要靶点，并证实了局部应用Camostat mesylate可有效抑制病毒感染和免疫激活	研究结果可能受供体特异性影响，且样本来源仅限于鼻和支气管上皮细胞	探究SARS-CoV-2感染上呼吸道时涉及的多种上皮细胞类型及其免疫反应	人类原代鼻和支气管上皮细胞的空气-液体界面培养物	NA	COVID-19	病毒复制分析、单细胞RNA测序、光谱显微镜	NA	RNA测序数据、显微镜图像	人类原代鼻和支气管上皮细胞培养物（未提供具体样本数量）
132	2025-06-03	Cxcr3 promotes protection from colorectal cancer liver metastasis by driving NK cell infiltration and plasticity 2025-Jun-02, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1 DOI:10.1172/JCI184036 PMID:40168086	research paper	该研究探讨了CXCR3在促进NK细胞浸润和可塑性中的作用，从而保护免受结直肠癌肝转移的影响	揭示了CXCR3/配体轴在促进巨噬细胞依赖性NK细胞积累和功能维持中的新机制	研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限	探究NK细胞在结直肠癌肝转移中的抗肿瘤机制	结直肠癌肝转移中的NK细胞和巨噬细胞	肿瘤免疫学	结直肠癌	scRNA-seq	MC38小鼠模型和SL4诱导的CRC转移模型	基因表达数据	未明确提及具体样本数量，包括小鼠模型和人类患者样本
133	2025-06-03	Perivascular Niche-Resident Alveolar Macrophages Promote Interstitial Pneumonitis Related to Trastuzumab Deruxtecan Treatment 2025-Jun-02, Cancer research IF:12.5Q1 DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-2021 PMID:40300097	research paper	该研究揭示了曲妥珠单抗德鲁替康（T-DXd）通过肺泡巨噬细胞引发间质性肺炎的机制，并提出了预防策略	首次发现T-DXd通过肺泡巨噬细胞的Fc-FcγR相互作用触发促间质性肺炎表型转变，并证实血管周围微环境预处理可减轻ADC肺部毒性	研究基于小鼠模型，临床转化效果需进一步验证	阐明抗体药物偶联物T-DXd引发间质性肺病的机制并开发预防策略	曲妥珠单抗德鲁替康（T-DXd）及其诱导的间质性肺病	免疫病理学	间质性肺病/乳腺癌	单细胞RNA测序、活体显微镜成像	免疫活性小鼠模型	基因表达数据/显微成像数据	NA
134	2025-06-03	Vascular Normalization Augments the Anti-tumor Efficacy of Combined HDAC Inhibitor with Immunotherapy in Solid Tumors 2025-Jun-02, Cancer discovery IF:29.7Q1 DOI:10.1158/2159-8290.CD-24-1033 PMID:40452600	研究论文	本文探讨了组蛋白去乙酰化酶抑制剂（HDACi）与免疫疗法联合使用在实体瘤治疗中的效果，并提出了通过抗血管生成疗法来增强其协同作用的新策略	提出了一种结合HDACi、抗血管生成疗法和免疫疗法的新治疗策略，并通过单细胞RNA测序数据验证了其机制	研究主要基于患者样本的scRNA-seq数据，未涉及大规模临床试验	优化实体瘤的免疫治疗效果	实体瘤患者样本	肿瘤免疫治疗	实体瘤	scRNA-seq	NA	基因表达数据	患者样本（具体数量未提及）
135	2025-06-03	Wnt1's Differential Effects on Craniofacial Bone and Tooth Development 2025-Jun-02, Journal of dental research IF:5.7Q1 DOI:10.1177/00220345251336191 PMID:40454459	research paper	该研究探讨了Wnt1信号通路在小鼠颅面骨和牙齿发育中的不同作用	揭示了Wnt1在不同发育阶段对颅面骨和牙齿发育的差异性影响，并发现了其对破骨细胞生成的剂量依赖性抑制作用	研究仅基于小鼠模型，结果可能无法完全适用于人类	探究Wnt1信号通路在颅面骨和牙齿发育中的具体机制	小鼠颅面骨和牙齿	发育生物学	颅面发育异常	单细胞测序、RNA测序、显微CT	转基因小鼠模型	基因表达数据、影像数据	NA
136	2025-06-03	Therapeutic B cell depletion identifies immunoregulatory networks 2025-Jun-02, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1 DOI:10.1172/JCI189442 PMID:40454471	研究论文	本文通过单细胞RNA测序和流式细胞术研究了B细胞耗竭在多发性硬化症中的免疫调节作用	揭示了B细胞耗竭对免疫反应的全面影响，包括抗炎性脑脊液巨噬细胞的增加和外周CD16+单核细胞TNF-α表达的升高	NA	探索B细胞耗竭在多发性硬化症中的免疫调节机制及治疗策略	多发性硬化症患者的免疫细胞	免疫学	多发性硬化症	单细胞RNA测序, 流式细胞术	NA	RNA序列数据, 细胞表型数据	NA
137	2025-06-03	CD300A+ CD8+ T Cells as Predictive Biomarkers for Achieving Functional Cure in Chronic Hepatitis B Patients Undergoing Pegylated Interferon-Alpha Therapy 2025-Jun-02, Alimentary pharmacology & therapeutics IF:6.6Q1 DOI:10.1111/apt.70214 PMID:40454546	研究论文	本研究探讨了CD300A+ CD8+ T细胞作为慢性乙型肝炎患者接受聚乙二醇干扰素-α治疗实现功能性治愈的预测生物标志物	首次发现CD300A+ CD8+ T细胞在功能性治愈患者中显著富集，并具有更强的克隆扩增能力和细胞毒性	研究样本量有限，且仅针对HBsAg水平<3000 IU/mL的患者	寻找能够预测慢性乙型肝炎患者对聚乙二醇干扰素-α治疗反应的生物标志物	慢性乙型肝炎患者	免疫学	慢性乙型肝炎	单细胞转录组分析、T细胞受体测序、流式细胞术	NA	单细胞转录组数据、流式细胞数据	发现队列和独立验证队列的慢性乙型肝炎患者
138	2025-06-03	Lung endothelial cell heterogeneity in health and pulmonary vascular disease 2025-Jun-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology DOI:10.1152/ajplung.00296.2024 PMID:39772753	mini-review	本文探讨了肺内皮细胞（ECs）在健康和肺血管疾病中的异质性，特别关注单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术的应用	通过scRNA-seq技术揭示了肺内皮细胞的异质性，发现了新的细胞类型如aerocytes和general capillary ECs，并识别了与肺动脉高压（PH）发病机制相关的多个新途径和机制	NA	探索肺内皮细胞异质性在肺血管疾病中的作用，特别是肺动脉高压（PH）的发病机制	肺内皮细胞（ECs）	生物医学研究	肺动脉高压（PH）	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单核RNA测序、空间转录组学	NA	基因表达数据	NA
139	2025-06-03	Characterization of the recombination activity in the pituitary and ovary of Prop1-iCre knockin mice 2025-Jun-01, American journal of physiology. Endocrinology and metabolism DOI:10.1152/ajpendo.00049.2025 PMID:40327412	研究论文	本研究描述了Prop1-iCre敲入小鼠在垂体内分泌细胞和卵巢颗粒细胞中的重组活性	通过CRISPR/Cas9系统引入IRES-Cre盒，实现了Prop1和Cre重组酶的双顺反子表达，展示了在垂体内分泌细胞和卵巢颗粒细胞中的特异性重组活性	Prop1-iCre小鼠在卵巢颗粒细胞中的重组活性可能会对数据解释造成复杂影响	研究Prop1-iCre敲入小鼠的重组活性，为垂体生物学提供基因操作工具	Prop1-iCre敲入小鼠的垂体内分泌细胞和卵巢颗粒细胞	分子生物学	NA	CRISPR/Cas9系统，单细胞RNA测序分析	NA	基因表达数据	Prop1-iCre小鼠及其与Rosa-tdTomato报告鼠的杂交后代
140	2025-06-03	Oncostatin-M: a novel leukocyte-derived factor facilitating the ovulatory process in the human ovary 2025-Jun-01, Human reproduction (Oxford, England) DOI:10.1093/humrep/deaf076 PMID:40327872	研究论文	研究探讨了白细胞衍生的Oncostatin-M (OSM)在人类优势卵泡排卵过程中的调控作用	首次揭示了OSM在人类排卵过程中的关键作用，特别是在激活信号通路、调节类固醇生成和前列腺素合成方面的功能	研究使用的是体外培养的人类颗粒/黄体细胞(hGLCs)，可能无法完全模拟体内排卵动态，且结果仅适用于人类样本，需要在其他哺乳动物物种中验证	探索白细胞衍生的OSM是否调控人类优势卵泡的排卵过程	人类优势卵泡和体外培养的人类颗粒/黄体细胞(hGLCs)	生殖生物学	NA	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、定量PCR(qPCR)、免疫组化、Western blotting、RNA测序	NA	基因表达数据、蛋白质数据	自然周期女性优势卵泡(n=19)和IVF患者卵泡抽吸物(n=12)