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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2026-04-19 |
Genomic characterization of sub-populations in human pluripotent stem cell-derived retinal progenitor cells driving retinal lamination
2026-Apr-14, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2026.102831
PMID:41791386
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研究论文 | 本研究利用人胚胎干细胞来源的视网膜类器官中的Rax::GFP阳性视网膜祖细胞,探讨了视网膜球层形成的机制 | 通过单细胞RNA测序揭示了非层状和良好层状视网膜球体在细胞周期退出、增殖特性及WNT信号通路激活方面的差异,并发现两者在移植后均能形成光感受器层并实现功能整合 | 研究主要基于体外模型,体内环境的影响可能未被完全模拟;Rax::GFP阳性细胞的异质性可能导致部分结果解释复杂 | 探究视网膜球层形成的分子机制及移植后光感受器的整合能力 | 人胚胎干细胞来源的视网膜类器官中的Rax::GFP阳性视网膜祖细胞 | 发育生物学 | 视网膜退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 未明确指定样本数量,涉及人胚胎干细胞来源的视网膜类器官 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 122 | 2026-04-19 |
Stem-like PD-1+TCF-1+ CD8+ T cells result from helpless priming and rely on CD4+ T-cell help to complete their cytotoxic effector differentiation
2026-Apr-12, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-014041
PMID:41974457
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研究论文 | 本研究探讨了CD4+ T细胞辅助在干细胞样PD-1+TCF-1+ CD8+ T细胞分化中的作用,揭示了其在癌症和慢性感染中的分化轨迹 | 揭示了干细胞样CD8+ T细胞是无助激活的细胞,位于CD8+ T细胞效应和耗竭轨迹的分叉点,并阐明了CD4+ T细胞辅助对其分化的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,结果在人类系统中的适用性需要进一步验证 | 阐明CD4+ T细胞辅助对干细胞样CD8+ T细胞分化命运的影响 | 小鼠模型中的干细胞样PD-1+TCF-1+ CD8+ T细胞 | 免疫学 | 癌症 | 光谱流式细胞术、单细胞RNA测序、生物信息学分析 | NA | 流式细胞数据、单细胞RNA测序数据 | 小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 123 | 2026-04-19 |
Single-cell TCR mapping reveals spatially coordinated T cell states in head and neck cancer
2026-Apr-10, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.aec3133
PMID:41961948
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研究论文 | 本文介绍了一种空间T细胞受体(TCR)分析策略,用于在单细胞分辨率下解析头颈癌中T细胞克隆的转录状态和空间定位 | 开发了一种新的空间TCR分析方法,能够将T细胞克隆身份、转录状态和空间定位在肿瘤微环境中关联起来,这是现有方法所缺乏的 | 方法仅应用于人类头颈鳞状细胞癌,尚未在其他癌症类型或更大样本中验证 | 研究头颈癌中T细胞克隆的空间分布、转录状态及其与肿瘤微环境的关系 | 人类头颈鳞状细胞癌中的T细胞 | 单细胞分析 | 头颈癌 | 空间TCR分析、单细胞RNA测序、光谱流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据、空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 124 | 2026-04-19 |
CD55-expressing myeloid-derived suppressor cells (MDSCs) drive cancer immunoevasion
2026-Apr-10, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012980
PMID:41963079
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研究论文 | 本研究通过多组学分析发现CD55是髓源性抑制细胞介导肿瘤免疫逃逸的关键调节因子,并揭示了其通过代谢重编程发挥作用的机制 | 首次系统鉴定CD55作为MDSCs的保守表面标志物,阐明其通过PYGL磷酸化驱动糖酵解维持免疫抑制表型的新机制,并发现靶向该轴可增强免疫治疗疗效 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床转化效果需进一步验证;靶向CD55的长期安全性尚未评估 | 鉴定MDSCs上具有功能重要性的保守表面标志物,并开发靶向免疫抑制微环境的治疗策略 | 髓源性抑制细胞、肿瘤微环境、CD8+ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序、RNA测序、染色质免疫沉淀、免疫沉淀-质谱、分子对接、表面等离子共振成像 | 小鼠肿瘤模型、基因敲除模型 | 单细胞转录组数据、蛋白质互作数据、临床样本数据 | 八种癌症类型的公共单细胞数据集、人类患者样本、小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 125 | 2026-04-19 |
Multimodal profiling reveals Mycobacterium tuberculosis restricts lung mitochondrial immunometabolism to promote pathogenesis
2026-Apr-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.07.717012
PMID:41993288
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研究论文 | 本研究通过多模态分析揭示了结核分枝杆菌通过限制肺部线粒体免疫代谢来促进发病的机制 | 首次定义了与结核感染保护性结局相关的线粒体免疫代谢肺部特征,并发现结核分枝杆菌通过其丝氨酸蛋白酶Hip1诱导线粒体功能障碍以操纵免疫代谢 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据验证尚需进一步扩展 | 阐明结核分枝杆菌感染早期肺部免疫代谢环境如何影响保护性与致病性免疫结局 | 小鼠肺部免疫细胞及结核分枝杆菌感染的人类样本 | 免疫代谢学 | 结核病 | 高维流式细胞术、单细胞转录组学、非靶向代谢组学 | NA | 流式细胞数据、转录组数据、代谢组数据 | 动物模型及人类样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 126 | 2026-04-19 |
RNA helicase SKIV2L impedes tumor immunity by reprogramming arginine metabolism of hepatocellular carcinomas
2026-Apr-09, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-014192
PMID:41956538
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研究论文 | 本研究揭示了RNA解旋酶SKIV2L通过调控精氨酸代谢促进肝细胞癌免疫逃逸的机制 | 首次发现SKIV2L作为c-Myc转录靶点,通过招募GNL3稳定精氨酸代谢相关mRNA,驱动肿瘤免疫抑制微环境形成 | 研究主要基于体外实验和动物模型,临床转化仍需进一步验证 | 阐明肝细胞癌免疫抑制微环境的分子机制,寻找免疫治疗新靶点 | 肝细胞癌肿瘤微环境、SKIV2L基因功能、精氨酸代谢通路 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、RNA免疫沉淀测序、免疫沉淀-质谱分析、邻近连接实验、流式细胞术 | NA | RNA测序数据、质谱数据、流式细胞数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 127 | 2026-04-19 |
Chemotherapy-Induced Oral Mucosal Injury Is Defined by p53 Activation, Cell Cycle Arrest and Diverse Epithelial Progenitor Dynamics
2026-Apr-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.06.716752
PMID:41993375
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型揭示了5-氟尿嘧啶诱导的口腔黏膜炎的机制,重点关注p53激活、细胞周期停滞和上皮祖细胞动态变化 | 首次在口腔黏膜中定义了化疗诱导的细胞周期停滞主导的萎缩机制,并识别出具有p53和AP-1复合物基因特征的化疗耐药祖细胞群 | 研究基于小鼠模型,人类口腔黏膜反应的直接适用性尚需验证 | 阐明化疗诱导的口腔黏膜损伤与修复的分子机制 | 小鼠口腔黏膜组织 | 单细胞转录组学 | 口腔黏膜炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 128 | 2026-04-19 |
Weighted gene coexpression network analysis and machine learning identify mitochondria programmed cell death-related genes as diagnostic biomarkers for septic shock
2026-Apr-02, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiag044
PMID:41902830
|
研究论文 | 本研究整合公共数据集,通过WGCNA和机器学习方法,鉴定出与脓毒性休克相关的线粒体程序性细胞死亡基因作为诊断生物标志物 | 首次系统整合WGCNA、LASSO回归和Boruta算法筛选脓毒性休克诊断基因,并通过单细胞转录组分析和动物模型验证ACSL1的功能作用 | 研究主要基于公共数据集和动物模型,临床样本验证规模有限,需要更大规模的前瞻性研究进一步验证 | 鉴定脓毒性休克的诊断生物标志物并探索其病理机制 | 脓毒性休克患者和CLP诱导的脓毒性休克小鼠模型 | 生物信息学 | 脓毒症 | 加权基因共表达网络分析,机器学习,单细胞转录组分析,qRT-PCR,Western blot,免疫荧光 | LASSO回归,Boruta算法 | 基因表达数据,临床样本数据,动物模型数据 | GEO公共数据集和独立队列的临床血液样本,CLP诱导的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 129 | 2026-04-19 |
Metabolically reprogrammed eosinophils impair T cell immunity and cause chronic skin infection
2026-Apr, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.1038/s44321-026-00392-x
PMID:41813911
|
研究论文 | 本研究通过小鼠模型揭示了在慢性皮肤炎症中,代谢重编程的嗜酸性粒细胞通过竞争性葡萄糖摄取抑制Th1细胞功能,从而促进疾病慢性化 | 首次在非肠道组织中发现了具有代谢重编程特性的炎症性嗜酸性粒细胞亚群,并阐明其通过形成竞争性代谢微环境抑制T细胞免疫的新机制 | 研究基于小鼠模型,在人体中的验证尚需进一步研究;单细胞转录组分析仅揭示了转录水平的变化,蛋白质功能验证不足 | 探究皮肤嗜酸性粒细胞在慢性皮肤感染中的功能和转录异质性 | C57BL/6小鼠模型中的皮肤嗜酸性粒细胞和T细胞 | 免疫学 | 皮肤感染 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 130 | 2026-04-19 |
The importance of long-lived IgE plasma cells for protracted allergies
2026-Apr, Trends in immunology
IF:13.1Q1
DOI:10.1016/j.it.2026.01.006
PMID:41846175
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评论 | 本文讨论了长寿命IgE浆细胞在持久性过敏反应中的重要性,基于遗传命运图谱和单细胞测序技术的最新发现 | 通过遗传命运图谱和单细胞测序技术,揭示了长寿命IgE浆细胞和'2型'记忆B细胞是维持IgE的两个细胞群体,为理解过敏反应的持久性提供了新视角 | NA | 探讨长寿命IgE浆细胞在持久性过敏反应中的作用机制 | IgE浆细胞和'2型'记忆B细胞 | NA | 过敏性疾病 | 遗传命运图谱, 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 131 | 2026-04-19 |
Single-cell spatial transcriptomic analysis of human skin anatomy
2026-Apr, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-026-02552-8
PMID:41872488
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研究论文 | 本研究构建了正常成人皮肤的单细胞空间转录组图谱,揭示了皮肤细胞类型、空间组织及其在疾病中的变化 | 首次构建了覆盖全身15个解剖部位、包含约120万个细胞的皮肤单细胞空间转录组图谱,定义了10个多细胞邻域,并发现了疾病中免疫改变的空间区室化模式 | 研究仅基于正常成人皮肤样本,未涵盖不同年龄、种族或更广泛的疾病状态,且空间分辨率可能受技术限制 | 解析人类皮肤在全身范围内的细胞和分子空间组织,并探索其在疾病中的变化 | 正常成人皮肤组织 | 空间转录组学 | 皮肤疾病 | 单细胞空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 114个样本,覆盖15个解剖部位,约120万个细胞 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 132 | 2026-04-19 |
Unveiling gene perturbation effects through gene regulatory networks inference from single-cell transcriptomic data
2026-Apr, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014067
PMID:41984780
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研究论文 | 本文介绍了一种名为IGNITE的无监督机器学习框架,用于从单细胞RNA测序数据中推断有向、加权和带符号的基因调控网络,并模拟基因扰动效应 | IGNITE基于统计物理中的逆动力学Ising模型,无需先验知识,直接从非扰动的单细胞RNA测序数据中推断基因调控网络,并模拟单基因和多基因敲除效应 | 研究仅在两种多能干细胞系统(小鼠和人类)上进行了测试,虽然展示了跨物种和技术的泛化能力,但未涵盖更广泛的细胞类型或疾病模型 | 开发一种从单细胞转录组数据推断基因调控网络的方法,以模拟基因扰动对细胞行为的影响 | 小鼠和人类的多能干细胞,包括从初始态向形成态过渡的小鼠多能干细胞以及向确定内胚层分化的人类多能干细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 逆动力学Ising模型 | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics, Fluidigm | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium, Fluidigm C1 | 10x Chromium单细胞RNA测序平台和Fluidigm C1单细胞自动制备系统 |
| 133 | 2026-04-19 |
Study on the Potential Molecular Mechanism of Keloid Disease Associated With Single Cell Combined Mendelian Randomization
2026-Apr, Journal of cosmetic dermatology
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/jocd.70849
PMID:41986576
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学、蛋白质数量性状位点、孟德尔随机化分析等多种方法,探索了瘢痕疙瘩的潜在分子机制 | 首次将单细胞RNA测序与孟德尔随机化分析相结合,识别出SRA1和SSR1作为瘢痕疙瘩的关键保护基因,并揭示了它们在免疫微环境调控和细胞分化中的新作用 | 研究依赖于公开数据库的数据,样本来源可能有限,且功能验证实验未在文中详细描述 | 识别瘢痕疙瘩形成的关键基因和调控网络 | 瘢痕疙瘩病变组织和正常瘢痕样本 | 生物信息学 | 瘢痕疙瘩 | 单细胞RNA测序, 蛋白质数量性状位点分析, 孟德尔随机化分析, 共定位分析 | hdWGCNA, CellChat | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据, GWAS汇总统计 | 92,659个高质量细胞,来自GEO数据库的多个数据集(GSE181297, GSE163973, GSE145725) | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 134 | 2026-04-19 |
Hepatic-Differentiated Subpopulation in Clear Cell Renal Cell Carcinoma: A Multi-Omics Analysis of Tumors With Lymphovascular Invasion
2026-Apr, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.71843
PMID:41981779
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研究论文 | 本研究通过多组学分析探索了透明细胞肾细胞癌中淋巴血管侵袭的分子基础,发现了一个具有肝系分化特征的肿瘤亚群 | 首次在ccRCC中识别出一个表达肝系转录因子HNF1A和HNF4A的肿瘤亚群,该亚群位于肿瘤演化的终末阶段,并与淋巴血管侵袭和缺氧微环境相关 | 这是一项基于发现的假设生成研究,所有发现需要在临床应用前进行独立的功能验证 | 理解透明细胞肾细胞癌中淋巴血管侵袭的分子基础 | 透明细胞肾细胞癌标本(31例,其中11例LVI阳性,20例LVI阴性) | 数字病理学 | 肾癌 | 全基因组测序,RNA测序,蛋白质组学分析,单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 基因组数据,转录组数据,蛋白质组数据 | 31例ccRCC标本(11例LVI+,20例LVI-),并整合了公共单细胞RNA测序和空间转录组学数据集 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,全基因组测序,RNA测序,蛋白质组学 | NA | NA |
| 135 | 2026-04-19 |
Fibroblast-Driven Fibroblast Growth Factor and Fibronectin 1 Signaling Orchestrates Extracellular Matrix Remodeling for Ovine Mammary Lactation Decline
2026-Apr, Comprehensive Physiology
IF:4.2Q1
DOI:10.1002/cph4.70150
PMID:41998868
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据,揭示了绵羊泌乳衰退期乳腺组织中成纤维细胞通过FGF和FN1信号通路驱动细胞外基质重塑的分子机制 | 首次在绵羊泌乳衰退模型中,利用单细胞RNA测序技术系统解析了成纤维细胞作为关键基质调节者,通过FGF和FN1信号通路协调细胞外基质重塑的细胞和分子网络 | 研究主要基于转录组数据,缺乏蛋白质水平和功能验证实验来确认信号通路的具体作用机制 | 阐明绵羊泌乳衰退期乳腺组织细胞外基质重塑的细胞和分子机制 | 绵羊乳腺组织在泌乳高峰期和晚期阶段的细胞群体 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 绵羊泌乳高峰期和晚期阶段的乳腺组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 136 | 2026-04-19 |
Alpha-ketoglutarate accelerates granulocyte-monocyte progenitor differentiation and atherosclerotic plaque inflammation via oxoglutarate receptor 1
2026-Mar-27, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2026.104134
PMID:41931905
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研究论文 | 本文探讨了α-酮戊二酸通过其受体OXGR1加速粒细胞-单核细胞祖细胞分化并促进动脉粥样硬化斑块炎症的机制 | 首次揭示了α-酮戊二酸/OXGR1轴通过上调PNP表达,影响嘌呤合成和NAD代谢,从而扰乱线粒体稳态并加剧动脉粥样硬化炎症 | 研究主要基于小鼠模型,人类相关性仅通过血浆代谢物相关性分析初步验证,需进一步临床研究确认 | 探究代谢物α-酮戊二酸在动脉粥样硬化进展中的作用机制 | Ldlr缺陷小鼠的骨髓细胞、粒细胞-单核细胞祖细胞及动脉粥样硬化斑块 | NA | 心血管疾病 | 靶向代谢组学、单细胞RNA测序、蛋白质组学、骨髓移植实验 | NA | 代谢组数据、单细胞转录组数据、蛋白质组数据 | Ldlr小鼠模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 137 | 2026-04-19 |
Smoothie: efficient inference and integration of spatial co-expression networks from denoised spatial transcriptomics data
2026-Mar-26, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09898-z
PMID:41888598
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Smoothie的流程,用于对空间转录组数据进行去噪并构建和整合全基因组共表达网络 | 提出了一个结合高斯平滑去噪与并行化计算的高效流程,能够处理超过1亿个空间分辨点的数据集,并实现快速运行和低内存使用 | NA | 从高分辨率空间转录组数据中提取深入的生物学见解,包括基因模块检测、功能注释和跨样本比较 | 空间转录组数据中的基因共表达网络 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 高斯平滑 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 138 | 2026-04-19 |
Palmatine ameliorates MASLD in type 2 diabetes by modulating hepatic apoptosis and inflammation
2026-Mar-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-45476-3
PMID:41865191
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研究论文 | 本研究通过多组学生物信息学分析和实验验证,揭示了黄连素通过调控ADRB2、BCL3等五个核心靶点抑制肝细胞凋亡,从而改善2型糖尿病相关的代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD) | 首次采用顺序性多组学生物信息学工作流程,结合机器学习预测和单细胞测序验证,系统性地识别了黄连素治疗MASLD的五个核心靶点,并通过动物模型进行了机制验证 | 研究主要在动物模型中进行,尚未进行人体临床试验;多组学预测的靶点网络需要更深入的分子机制研究 | 探究黄连素改善2型糖尿病相关MASLD的作用机制 | 2型糖尿病相关的代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD) | 生物信息学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | 单细胞测序,分子对接,多组学分析 | 机器学习 | 基因表达数据,单细胞测序数据 | 大鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 139 | 2026-03-11 |
DGM: deep graph clustering with mincut for analysis of single-cell transcriptomics
2026-Mar-09, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-026-12694-y
PMID:41803718
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 140 | 2026-03-11 |
Single-cell RNA-seq and in vitro study reveal Fusobacterium nucleatum impairs β-cell identity in type 2 diabetes via the NF-κB-CDKN1C axis
2026-Mar-09, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07981-x
PMID:41803883
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |