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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2025-11-16 |
Immune cell-specific gene expression and its causal role in osteoporosis and bone mineral density: Insights from single-cell eQTL and GWAS data integration
2025-Nov-14, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000045869
PMID:41239652
|
研究论文 | 通过整合单细胞eQTL和GWAS数据,系统研究免疫细胞特异性基因表达与骨质疏松症风险的因果关系 | 首次在免疫细胞亚型水平上探索基因表达与骨质疏松症的因果关联,识别出7个关键基因 | NA | 探究免疫细胞特异性基因表达在骨质疏松症和骨密度中的因果作用 | 骨质疏松症患者和骨密度数据 | 生物信息学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序, 全基因组关联分析, 孟德尔随机化 | NA | 基因表达数据, 基因型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 122 | 2025-11-16 |
Hepatocyte metabolic adaptations during pregnancy and lactation
2025-Nov-13, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.08.007
PMID:40882627
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序系统揭示了小鼠在妊娠和哺乳期间肝细胞的代谢适应机制 | 发现了控制妊娠代谢变化的'妊娠时钟'周期性轨迹,并揭示了哺乳期独特的脂质合成分支轨迹 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 阐明妊娠和哺乳期间肝细胞代谢适应的精确过程和调控机制 | 小鼠肝细胞,绵羊肝细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠妊娠和产后多个阶段的肝细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 高分辨率单细胞RNA测序 |
| 123 | 2025-11-16 |
Stereo-seq V2: Spatial mapping of total RNA on FFPE sections with high resolution
2025-Nov-13, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.08.008
PMID:40882628
|
研究论文 | 介绍Stereo-seq V2技术,能够在FFPE组织切片上实现高分辨率全RNA空间图谱分析 | 采用随机引物策略在FFPE切片上实现原位RNA捕获测序,提供单细胞分辨率,具有无偏转录本捕获和均匀基因覆盖特性 | NA | 开发适用于FFPE样本的空间转录组技术,提升临床样本的RNA分析能力 | 三阴性乳腺癌组织切片、结核分枝杆菌感染小鼠模型、人类结核肺样本 | 空间转录组学 | 乳腺癌, 结核病 | 空间转录组测序 | NA | 空间RNA表达数据 | 临床FFPE样本、小鼠感染模型、人类结核样本 | 华大基因(BGI) | 空间转录组学 | Stereo-seq V2 | 基于随机引物的FFPE切片空间全RNA分析技术 |
| 124 | 2025-11-16 |
Protocol for preparation of mouse synovium for flow cytometry and RNA-seq
2025-Nov-13, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104207
PMID:41236928
|
研究论文 | 本文提供了一种从小鼠滑膜制备单细胞悬液的详细实验方案,用于关节炎模型研究 | 开发了包含血管内标记的滑膜单细胞悬液制备流程,适用于多种下游分析 | NA | 建立小鼠滑膜单细胞悬液标准化制备方法 | 小鼠滑膜组织 | NA | 关节炎 | 流式细胞术,RNA测序 | NA | 单细胞悬液 | NA | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 125 | 2025-11-16 |
Mendelian Randomization and ScTranscriptomics Reveal a Lipid Low Malignant Cells Driving Immunosuppression and Matrix Remodeling in Oral squamous cell carcinoma
2025-Nov-13, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2025.104009
PMID:41237591
|
研究论文 | 通过孟德尔随机化和单细胞转录组学分析,发现口腔鳞状细胞癌中脂质低恶性细胞亚群与不良预后相关 | 首次结合孟德尔随机化和单细胞RNA测序技术鉴定出与甘油磷脂代谢低相关的Lipid_Low恶性细胞亚群 | NA | 探索口腔鳞状细胞癌中脂质代谢与预后的关系 | 口腔鳞状细胞癌患者 | 单细胞转录组学 | 口腔鳞状细胞癌 | 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 126 | 2025-11-16 |
A unified single-cell atlas of human lung provides insights into pulmonary diseases
2025-Nov-13, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2025.106025
PMID:41237668
|
研究论文 | 构建了人类肺部最全面的单细胞RNA测序图谱uniLUNG,整合了6200万个细胞数据,揭示了肺部疾病中的细胞异质性和转化机制 | 创建了首个跨疾病、高分辨率的人类肺部单细胞图谱,发现了新的细胞亚群和肺癌转化机制 | 基于已发表数据集的整合分析,可能存在批次效应和技术差异 | 建立统一的人类肺部单细胞参考图谱,探索肺部疾病的共同致病机制 | 人类肺部细胞,涵盖健康状态和17种疾病条件下的1807名供体 | 单细胞组学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | 920万个细胞,来自1807名供体,整合62个已发表数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 127 | 2025-11-16 |
Skeletal muscle-derived IL-33 mediates muscle-to-bone crosstalk and regulates bone metabolism via CD8+ T cell-secreted CCL5
2025-Nov-13, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2025.106024
PMID:41237669
|
研究论文 | 本研究揭示了骨骼肌来源的IL-33通过CD8+ T细胞分泌的CCL5介导肌肉-骨骼通讯并调节骨代谢的机制 | 首次发现IL-33作为肌因子介导肌肉-骨骼通讯,并阐明其通过CD8+ T细胞-CCL5-CCR3信号轴调控骨代谢的新机制 | 研究主要基于动物模型,人类临床数据的因果关系尚未完全确立 | 探究肌肉萎缩与骨丢失关联中的肌肉-骨骼通讯机制 | 老年人群队列和大鼠模型 | 骨骼肌肉生物学 | 骨质疏松症和肌肉减少症 | 单细胞RNA测序,抗体阻断,重组蛋白干预 | NA | 临床数据,实验数据,测序数据 | 老年人群队列和大鼠模型(具体样本量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 128 | 2025-11-16 |
Divergence of immune cell types in chordate blood
2025-Nov-13, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2025.10.032
PMID:41237770
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术定义了海鞘循环血细胞的类型和分化层次 | 首次在尾索动物中系统鉴定血细胞类型并揭示其与脊椎动物免疫细胞的显著差异 | 无脊椎动物免疫细胞的分子特征研究仍然有限,细胞状态同源性难以确定 | 研究脊索动物血细胞类型的进化差异 | 海鞘(Ciona robusta)的循环血细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序,原位杂交,活体报告基因 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 129 | 2025-11-16 |
Single-cell analysis of human airway epithelium identifies cell-type-specific responses to Aspergillus and Coccidioides
2025-Nov-12, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.02121-25
PMID:41081505
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析人类气道上皮细胞对两种真菌病原体的细胞类型特异性反应 | 首次报道了使用单细胞转录组分析人类气道上皮细胞对曲霉菌和球孢子菌感染的反应 | 动物模型不能完全重现人类疾病,需要更先进的模型来研究人类-真菌病原体相互作用 | 研究人类气道上皮细胞对不同真菌病原体的早期发病机制 | 原代人类气道上皮细胞 | 单细胞测序 | 呼吸道真菌感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 130 | 2025-11-16 |
Anti-diuretic hormone ITP signals via a guanylate cyclase receptor to modulate systemic homeostasis in Drosophila
2025-Nov-12, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.97043
PMID:41222455
|
研究论文 | 本研究系统表征了果蝇中离子转运肽(ITP)信号系统及其通过鸟苷酸环化酶受体Gyc76C调节全身稳态的机制 | 首次鉴定Gyc76C为ITP的专一性受体,揭示了ITP信号系统在渗透调节和代谢稳态中的双重功能 | 研究主要基于果蝇模型,在哺乳动物中的保守性需要进一步验证 | 阐明果蝇中抗利尿激素ITP信号系统在维持全身稳态中的作用机制 | 果蝇(Drosophila)的神经系统、肾小管、直肠和脂肪体等组织 | 分子生物学 | 代谢性疾病 | RNA干扰、外分泌测定、异源哺乳动物细胞测定、连接组学、单细胞转录组学 | 基因敲低、过表达 | 基因表达数据、生理功能数据、行为数据 | 果蝇幼虫和成虫组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 131 | 2025-11-16 |
Integrative analysis of single-cell and bulk transcriptome data reveals age-related immune cell alterations in primary glioblastoma associated with prognosis
2025-Nov-12, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04206-w
PMID:41222641
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研究论文 | 通过整合单细胞和批量转录组数据分析,揭示原发性胶质母细胞瘤中与年龄相关的免疫细胞变化及其预后关联 | 首次系统比较原发性和复发性胶质母细胞瘤中年龄相关的免疫细胞差异,发现小胶质细胞在原发性胶质母细胞瘤中随年龄发生显著状态变化 | 样本量相对有限(13例pGBM和12例rGBM患者),需要在更大队列中验证发现 | 探究衰老如何影响胶质母细胞瘤进展及免疫微环境变化 | 胶质母细胞瘤患者(原发性和复发性)及小鼠模型 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,批量转录组分析,细胞通讯分析,轨迹分析 | NA | 转录组数据,临床数据,基因组变异数据 | 88,908个细胞来自13例原发性GBM和12例复发性GBM患者,另加小鼠模型验证 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 132 | 2025-11-16 |
Age-impaired remyelination is associated with dysregulated microglial transitions
2025-Nov-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-64906-w
PMID:41224757
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析脱髓鞘小鼠模型中微胶质细胞在髓鞘再生过程中的反应 | 发现髓鞘再生早期存在多种不同的微胶质细胞状态,这些状态最终汇聚为包含髓鞘转录物的解决状态,且该状态也存在于多发性硬化症患者大脑中 | 研究基于小鼠模型,结果向人类应用的转化需要进一步验证 | 探究年龄相关的髓鞘再生障碍与微胶质细胞状态转变失调的关联 | 小鼠模型中的微胶质细胞 | 单细胞基因组学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 133 | 2025-11-16 |
HPCAL1 as a novel prognostic biomarker in acute myeloid leukemia and its correlation with immune infiltrates
2025-Nov-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-23386-0
PMID:41224963
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研究论文 | 本研究探讨HPCAL1作为急性髓系白血病新型预后生物标志物的潜力及其与免疫浸润的关联 | 首次将钙结合蛋白HPCAL1确立为AML的新型预后指标,并揭示其通过免疫微环境调节和单核细胞群体动态介导不良预后的机制 | 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步的实验验证来阐明HPCAL1在AML发病机制中的具体作用 | 探索HPCAL1在急性髓系白血病中的预后价值及其与肿瘤免疫微环境的相互作用 | 急性髓系白血病患者样本和多个独立队列数据集 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | RNA测序,单细胞RNA测序,ESTIMATE分析,GSEA/GSVA分析 | 共表达网络分析,蛋白质相互作用分析 | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | 多个独立队列(GSE13159,GSE34184,GSE24395,机构数据和GSE130756单细胞数据集) | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 134 | 2025-11-16 |
The landscape of dynamic tumor immunophenotyping on neoadjuvant chemotherapy combined with trastuzumab for the treatment of HER2-positive breast cancer
2025-Nov-12, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02483-8
PMID:41225463
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研究论文 | 本研究通过空间表达谱分析探索HER2阳性乳腺癌新辅助化疗联合曲妥珠单抗治疗期间肿瘤微环境的动态免疫表型变化 | 首次在HER2阳性乳腺癌中建立与治疗疗效相关的动态免疫表型分类系统,并验证其在多个数据集中的可重复性 | 样本量相对有限(28例患者),需要更大规模研究验证 | 探索HER2阳性乳腺癌新辅助化疗联合靶向治疗期间肿瘤微环境动态变化与病理完全缓解的关系 | 28例HER2阳性乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间表达谱分析,DSP技术 | NA | 空间转录组数据,单细胞数据 | 28例患者的94个感兴趣区域 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 135 | 2025-11-16 |
THBS1high macrophages promote aortic aneurysm formation by orchestrating an inflammatory and smooth muscle cell phenotypic transition program in vascular Behçet's disease
2025-Nov-12, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-025-04434-y
PMID:41225543
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研究论文 | 本研究揭示了THBS1高表达巨噬细胞通过协调炎症反应和平滑肌细胞表型转换促进白塞病血管动脉瘤形成的机制 | 首次鉴定出THBS1高表达巨噬细胞在血管白塞病中的关键作用,并阐明其通过ETS2和TNF-α介导的机制促进动脉瘤形成 | 研究样本量有限,动物模型为CaCl2诱导的人源化模型,与真实疾病环境存在差异 | 阐明血管白塞病动脉瘤形成的细胞分子机制 | 血管白塞病患者主动脉组织、巨噬细胞、平滑肌细胞 | 单细胞组学 | 血管白塞病 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 免疫荧光染色, 批量RNA测序, 共培养系统 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据, 基因表达数据 | 血管白塞病患者主动脉样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 136 | 2025-11-16 |
DAPK1 identified as a novel biomarker for colorectal cancer liver metastasis
2025-Nov-12, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-04037-w
PMID:41225570
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研究论文 | 本研究通过机器学习与多组学分析鉴定DAPK1作为结直肠癌肝转移的新型生物标志物 | 首次通过整合机器学习算法与单细胞多组学技术系统鉴定DAPK1在结直肠癌肝转移中的关键作用 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内动物模型验证 | 发现结直肠癌肝转移的新型生物标志物和治疗靶点 | 结直肠癌肝转移组织和LoVo细胞系 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, ATAC-seq, CRISPR/Cas9基因编辑 | Lasso回归, SVM, 随机森林 | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 137 | 2025-11-16 |
Single-cell RNA sequencing and in vitro validation reveal risankizumab induces anti-inflammatory macrophage polarization in psoriasis
2025-Nov-12, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-03346-0
PMID:41225578
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和体外实验验证瑞莎珠单抗在银屑病中诱导抗炎巨噬细胞极化的机制 | 首次结合单细胞RNA测序和体外实验系统揭示瑞莎珠单抗通过调控巨噬细胞极化发挥治疗作用 | 研究主要基于公共数据库数据和体外细胞实验,缺乏体内实验验证 | 探索瑞莎珠单抗治疗银屑病的潜在治疗机制 | 银屑病患者单细胞测序数据和THP-1单核细胞分化的巨噬细胞 | 单细胞组学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序, ELISA, CCK-8检测 | Seurat, Harmony, Monocle2 | 单细胞RNA测序数据, 实验数据 | 97,434个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 138 | 2025-11-16 |
Neurogenic inducers inhibit the proliferation of pancreatic cancer by promoting tumor cell transdifferentiation
2025-Nov-12, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03563-9
PMID:41225636
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研究论文 | 本研究通过诱导胰腺癌细胞转分化来降低其恶性程度 | 发现NeuroD1转录因子可促进胰腺癌细胞向神经元转分化并抑制增殖,鉴定出神经诱导剂Neuropathiazol通过MET-PI3K/Akt通路上调NeuroD1 | NA | 研究诱导胰腺癌细胞转分化是否能降低恶性肿瘤性 | 胰腺导管腺癌(PDAC)细胞 | 单细胞测序分析 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,RNA测序,免疫共沉淀,质谱分析,分子对接 | NA | 单细胞RNA-seq数据,RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 139 | 2025-11-16 |
Characteristics linking ischemia-reperfusion to chronic lung allograft dysfunction in lung transplantation: A single-cell bioinformatics analysis
2025-Nov-12, Transplant immunology
IF:1.6Q3
DOI:10.1016/j.trim.2025.102326
PMID:41232781
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研究论文 | 通过单细胞生物信息学分析揭示肺移植中缺血再灌注损伤与慢性肺移植物功能障碍之间的细胞和分子联系 | 首次整合多个单细胞RNA-seq数据集,系统描绘了IRI向CLAD转变过程中细胞群体动态变化、铜死亡机制和巨噬细胞-肌成纤维细胞转分化 | 研究结果需要在动物模型和临床样本中进一步验证 | 探索肺移植中缺血再灌注损伤与慢性肺移植物功能障碍之间的分子机制 | 肺移植患者的单细胞转录组数据 | 生物信息学 | 肺移植相关并发症 | 单细胞RNA测序 | Louvain聚类,UMAP可视化,Augur方法,轨迹分析,pySCENIC | 单细胞转录组数据 | 整合GSE220797和GSE224210数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 140 | 2025-11-16 |
scRNA-Sequencing Reveals Bu-Shen-Yi-Qi Formula (BSYQF) Ameliorates Airway Remodeling via Regulating Imbalanced M1/M2 Macrophage Subtypes in Chronic Asthmatic Mice
2025-Nov-12, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2025.120883
PMID:41237867
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示补肾益气方通过调节M1/M2巨噬细胞亚型失衡改善慢性哮喘小鼠气道重塑的作用机制 | 首次在单细胞水平揭示补肾益气方通过调节巨噬细胞极化平衡改善哮喘气道重塑的分子机制 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人体验证 | 探究补肾益气方治疗慢性哮喘的分子作用机制 | 慢性哮喘小鼠模型 | 单细胞测序分析 | 哮喘 | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序, 免疫组织化学, 免疫荧光, qRT-PCR | NA | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据, 组织图像数据 | 8个小鼠肺组织样本,超过60,000个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |