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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2026-04-02 |
Editorial: Unraveling breast cancer complexity: insights from single-cell sequencing and spatial transcriptomics
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1816191
PMID:41918756
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 122 | 2026-04-02 |
Identification of a GPR182-postive stem cell population that drives polyp progression in familial adenomatous polyposis
2026, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.20704
PMID:41918858
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据分析,识别了家族性腺瘤性息肉病中驱动息肉异质性的关键细胞亚群——GPR182阳性息肉干细胞 | 首次在家族性腺瘤性息肉病中鉴定出GPR182阳性息肉干细胞,并揭示其在驱动息肉异质性、免疫逃逸及预后和药物反应预测中的关键作用 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据分析,缺乏前瞻性临床验证,且功能验证实验可能有限 | 解析家族性腺瘤性息肉病中息肉进展的异质性,以识别新的治疗靶点和生物标志物 | 家族性腺瘤性息肉病患者的单细胞和批量转录组数据 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞测序,批量转录组测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 涉及多个公共数据集(GSE109308等),具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 123 | 2026-04-02 |
Elevated growth differentiation factor-15 in sepsis: clinical associations and immune cell context
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1789747
PMID:41918885
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研究论文 | 本研究探讨了脓毒症患者血清中生长分化因子-15(GDF-15)水平的升高情况,及其与疾病严重程度、器官功能障碍和炎症活动的关联,并利用单细胞RNA测序数据分析了GDF15在免疫细胞中的表达模式 | 首次在脓毒症中结合临床血清GDF-15测量与公开的单细胞转录组数据,系统描述了GDF-15与疾病严重程度的关联及其在特定免疫细胞(浆细胞和单核细胞)中的表达富集,为理解其在危重疾病中的生物学背景提供了新见解 | 研究样本量较小(脓毒症患者n=19,健康对照n=23),为探索性观察研究,需要更大规模、特征明确的队列进行验证 | 阐明脓毒症中GDF-15的临床关联及其在免疫细胞中的表达背景,评估其作为反映系统生物应激的潜在生物标志物的价值 | 成人脓毒症患者和健康对照者的血清样本,以及公开的单细胞RNA测序数据集(GSE217906)中的免疫细胞 | NA | 脓毒症 | 酶联免疫吸附试验(ELISA),单细胞RNA测序数据分析 | NA | 血清蛋白浓度数据,单细胞转录组数据 | 临床队列:脓毒症患者19例,健康对照23例;生物信息学分析:公开数据集GSE217906 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 124 | 2026-04-02 |
Noninvasive assessment of core metastatic genes in lung adenocarcinoma: development of a predictive model integrating single-cell transcriptomics and radiomics
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1784914
PMID:41919253
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学和CT影像组学,识别了肺腺癌转移的关键分子驱动基因,并开发了一个非侵入性的影像预测模型 | 创新性地结合单细胞RNA测序和CT影像组学来识别肺腺癌转移的核心基因并构建预测模型,实现了分子表型与影像特征的关联 | 研究基于公共数据库数据,可能需要进一步的前瞻性临床验证来确认模型的泛化能力 | 开发一个非侵入性的预测模型,用于评估肺腺癌的转移潜能和预后 | 肺腺癌(LUAD)患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、CT影像组学、免疫组织化学(IHC)、RT-qPCR | LASSO回归、影像组学模型 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据、CT影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 125 | 2026-04-02 |
Systematic benchmarking of imaging spatial transcriptomics platforms in FFPE tissues
2025-Nov-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-64990-y
PMID:41266321
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研究论文 | 本文系统性地比较了三种商业成像空间转录组学平台在FFPE组织中的性能 | 首次在包含多种肿瘤和正常组织的组织微阵列上,对10X Xenium、Vizgen MERSCOPE和Nanostring CosMx三种iST平台进行综合技术性能与生物性能基准测试 | 研究仅基于组织微阵列的连续切片,可能未完全反映实际临床应用中的组织异质性,且平台比较受限于匹配基因集 | 评估和比较不同成像空间转录组学平台在FFPE组织中的性能,为研究者在珍贵样本研究中提供方法选择指导 | 包含17种肿瘤和16种正常组织类型的组织微阵列的连续切片 | 空间转录组学 | 多种肿瘤 | 成像空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 组织微阵列包含33种组织类型(17种肿瘤和16种正常) | 10X Genomics, Vizgen, Nanostring | 成像空间转录组学 | 10X Xenium, Vizgen MERSCOPE, Nanostring CosMx | 商业成像空间转录组学平台应用于FFPE组织切片 |
| 126 | 2026-04-02 |
Mechanisms of lactylation-related biomarker in neonatal hypoxic-ischemic brain damage analyzed through multi-omics data
2025-Oct-30, Pediatric research
IF:3.1Q1
DOI:10.1038/s41390-025-04538-4
PMID:41168403
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研究论文 | 本研究通过多组学数据分析,探讨了乳酸化相关基因在新生大鼠缺氧缺血性脑损伤中的作用,并筛选出关键生物标志物GFAP和LCP1,验证了银杏内酯B和橘皮素的神经保护作用 | 首次在新生大鼠缺氧缺血性脑病模型中采用多组学方法,并研究了乳酸代谢相关基因的作用,为药物开发提供了新靶点和方向 | 研究基于大鼠模型,结果向人类临床转化需进一步验证 | 探究乳酸化相关基因在新生儿缺氧缺血性脑损伤中的机制,并寻找潜在治疗靶点 | 新生SD大鼠的脑组织 | 机器学习和多组学分析 | 新生儿缺氧缺血性脑损伤 | 转录组学、蛋白质组学、单细胞RNA测序、分子对接 | 机器学习 | 转录组数据、蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据 | SD大鼠模型,具体数量未在摘要中明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 127 | 2026-04-02 |
Engineering unnatural cells with a 21st amino acid as a living epigenetic sensor
2025-Oct-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-64448-1
PMID:41130980
|
研究论文 | 本文开发了能够生物合成和遗传编码乙酰赖氨酸的自主细胞,作为活体表观遗传传感器,用于实时监测活体动物中的蛋白质翻译后修饰动态 | 利用遗传密码扩展技术,首次在活体动物中实现了基于21种氨基酸的工程化细胞作为非侵入性表观遗传传感器,用于实时跟踪去乙酰化酶活性和抑制剂效果 | 未明确说明传感器在复杂生物环境中的长期稳定性或潜在免疫反应,且可能仅限于乙酰化修饰的监测 | 开发非侵入性方法以实时监测活体动物中蛋白质翻译后修饰的动态变化 | 工程化的原核和真核细胞,以及活体动物模型 | 合成生物学 | NA | 遗传密码扩展技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 128 | 2026-04-02 |
Concerted changes in Epithelium and Stroma: a multi-scale, multi-omics analysis of progression from Barrett's Esophagus to adenocarcinoma
2025-Oct-20, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.06.034
PMID:40695287
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研究论文 | 本研究通过多组学分析,揭示了从巴雷特食管到食管腺癌进展过程中上皮与基质细胞的协同变化 | 首次整合单细胞转录组学、细胞外基质蛋白质组学、组织力学和空间蛋白质组学,系统描绘了从鳞状上皮到腺癌的多阶段进展特征 | 样本量相对有限(26例患者),且为观察性研究,需要更大队列验证 | 阐明巴雷特食管向食管腺癌进展的分子与细胞机制 | 食管组织样本(包括鳞状上皮、化生、异型增生和腺癌阶段) | 数字病理学 | 食管腺癌 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学、空间蛋白质组学、组织力学分析 | 多组学整合分析 | 单细胞转录组数据、蛋白质组数据、空间蛋白表达数据、力学测量数据 | 107个样本来自26例患者(两个独立队列) | NA | 单细胞RNA-seq, 空间蛋白质组学, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 129 | 2026-04-02 |
Precisely defining disease variant effects in CRISPR-edited single cells
2025-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09313-3
PMID:40702188
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研究论文 | 本文提出了一种多组学单细胞测序方法,用于精确评估CRISPR编辑后疾病相关等位基因的功能效应 | 开发了一种结合基因组DNA编辑识别、转录组分析和细胞表面蛋白表达测量的多模态单细胞测序方法,能够直接检测疾病等位基因的功能后果 | 未明确说明样本量或实验重复次数,可能受限于编辑效率和培养条件引起的非特异性转录变化 | 旨在克服CRISPR编辑中效率低、编辑结果异质性和非特异性转录变化的限制,以识别疾病相关非编码等位基因的因果变异和功能 | 人类T细胞中的基因破坏、调控区域缺失、非编码单核苷酸多态性等位基因以及多重编辑 | 单细胞多组学 | 自身免疫性疾病 | CRISPR-Cas编辑,单细胞测序 | NA | 基因组DNA,转录组,蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞多组学测序 | NA | NA |
| 130 | 2026-04-02 |
Robust and adaptive non-parametric tests for detecting general distributional shifts in gene expression
2025-Sep-15, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2025.101147
PMID:40902592
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研究论文 | 本文提出了一种名为QRscore的非参数框架,用于检测基因表达中的分布变化,包括均值偏移和方差偏移 | QRscore通过从负二项分布和零膨胀负二项分布中推导模型信息权重,扩展了Mann-Whitney检验,能同时检测均值和方差偏移,具有高统计功效和错误发现率控制 | NA | 开发一种强大的非参数测试方法,用于检测基因表达中的一般分布偏移 | 基因表达数据,包括bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | 非参数框架(QRscore) | 基因表达数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 131 | 2026-04-02 |
Chromoanagenesis in Osteosarcoma
2025-06-07, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15060833
PMID:40563473
|
综述 | 本文综述了染色体灾难性事件(chromoanagenesis)在骨肉瘤中的作用机制及其对肿瘤进展的影响 | 系统阐述了染色体碎裂和染色体再合成等关键机制如何源于复制应激和DNA修复缺陷,并推动骨肉瘤的基因组不稳定性 | 针对骨肉瘤的靶向治疗仍难以实现,且基于染色体灾难性事件的临床转化策略尚处探索阶段 | 阐明染色体灾难性事件在骨肉瘤发生发展中的分子机制,并探索其作为治疗靶点的潜力 | 骨肉瘤(儿童和青少年中最常见的恶性骨肿瘤)及其相关的基因组重排事件 | 基因组学 | 骨肉瘤 | 下一代测序(NGS)、光学基因组图谱、单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 132 | 2026-04-02 |
Mechanisms and strategies of immunosenescence effects on non-small cell lung cancer (NSCLC) treatment: A comprehensive analysis and future directions
2025-02, Seminars in cancer biology
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.semcancer.2025.01.001
PMID:39793777
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综述 | 本文全面分析了免疫衰老对非小细胞肺癌(NSCLC)进展及治疗影响的分子、细胞和遗传机制,并探讨了针对老年患者的未来治疗策略 | 系统性地整合了免疫衰老在NSCLC中的作用机制,并重点探讨了如何利用单细胞测序、CRISPR-Cas9等新兴技术来理解并靶向免疫衰老,以优化老年患者的免疫治疗 | 本文是一篇综述性文章,未涉及原始实验数据或具体的临床研究,主要基于现有文献进行分析和展望 | 阐明免疫衰老如何影响NSCLC的进展和治疗反应,并探索改善老年NSCLC患者治疗效果的未来方向 | 非小细胞肺癌(NSCLC),重点关注老年患者群体及其衰老的免疫系统 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞测序,CRISPR-Cas9 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 133 | 2026-04-02 |
Single-Cell RNA-Sequencing Analysis Provides Insights into IgA Nephropathy
2025-01-29, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15020191
PMID:40001494
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在IgA肾病研究中的应用进展 | 利用scRNA-seq技术揭示了IgA肾病中免疫特征的全景,包括外周血B细胞和Th细胞活化、细胞毒性T细胞耗竭、肾脏浸润细胞亚型,以及系膜细胞和内皮细胞在肾损伤早期的关键作用 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在IgA肾病研究中的进展,以理解其复杂分子机制并开发生物标志物和特异性治疗策略 | IgA肾病(IgAN) | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 134 | 2026-04-02 |
Integrated single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq analysis to investigate key adipogenesis genes in adipose-derived stem cells
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0335152
PMID:41325391
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA-seq和bulk RNA-seq数据,探索了脂肪来源干细胞(ADSCs)在脂肪生成过程中的关键基因及其阶段特异性调控网络 | 整合了bulk和单细胞RNA-seq数据,识别了脂肪生成早期和晚期的阶段特异性调控基因,并构建了包含mRNA、miRNA和lncRNA的ceRNA调控网络 | 研究主要基于转录组数据,未涉及蛋白质水平或功能验证,且样本来源和数量可能有限 | 探究ADSCs脂肪生成过程中的关键调控基因和阶段特异性转录调控网络 | 脂肪来源干细胞(ADSCs) | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, qPCR | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 135 | 2026-04-02 |
Single-cell multi-omics map of human fetal blood in Down syndrome
2024-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07946-4
PMID:39322663
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学、染色质可及性和空间转录组学数据,构建了人类唐氏综合征胎儿血液的高分辨率多组学图谱 | 首次结合单细胞多组学与空间转录组学,揭示了唐氏综合征中造血干细胞被“启动”分化的分子机制,并发现了非编码元件与基因调控网络的重构 | 样本量相对较小(仅18个胎儿),且仅关注胎儿期,未涉及出生后或成人阶段的造血异常 | 理解唐氏综合征中失调的造血过程及其分子基础 | 人类胎儿肝脏和骨髓样本,包括3个二倍体和15个三倍体(唐氏综合征)胎儿 | 数字病理学 | 唐氏综合征 | 单细胞转录组学,染色质可及性分析,空间转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq数据,ATAC-seq数据,空间转录组数据 | 18个胎儿样本(3个二倍体,15个三倍体),超过110万个细胞 | 10x Genomics | 单细胞多组学,空间转录组学 | 10x Chromium,10x Visium | 10x Chromium Single Cell Multiome ATAC + Gene Expression,10x Visium空间转录组技术 |
| 136 | 2026-04-02 |
Cholinergic Neuronal Activity Promotes Diffuse Midline Glioma Growth through Muscarinic Signaling
2024-Sep-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.21.614235
PMID:39386427
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研究论文 | 本研究揭示了胆碱能神经元活动通过毒蕈碱信号通路促进弥漫性中线胶质瘤生长的机制 | 首次发现中脑胆碱能神经元的长程投射通过M1和M3毒蕈碱受体促进DMG生长,并揭示了其与健康少突胶质前体细胞增殖的平行效应 | 研究主要基于小鼠模型和体外共培养,人类患者样本验证有限,且胆碱能神经元亚群的具体作用机制仍需进一步探索 | 探究胆碱能神经元活动对弥漫性中线胶质瘤生长的影响及其分子机制 | 弥漫性中线胶质瘤细胞、健康少突胶质前体细胞、胆碱能神经元 | 神经科学 | 弥漫性中线胶质瘤 | 光遗传学刺激、单细胞RNA测序、体外共培养、药理学阻断 | 小鼠模型、hiPSC衍生神经元模型 | 基因表达数据、细胞增殖数据 | 原发性患者DMG样本、DMG荷瘤小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 137 | 2026-04-02 |
Spatial transcriptomics of fetal membrane-Decidual interface reveals unique contributions by cell types in term and preterm births
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0309063
PMID:39159152
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析了胎儿膜-蜕膜界面在足月和早产中的细胞类型特异性贡献 | 首次在空间水平上揭示胎儿膜各层(羊膜上皮、羊膜间质、绒毛膜和蜕膜)在足月与早产中的差异基因表达模式 | 样本量较小(13例患者),且未涉及更广泛的妊娠并发症或种族多样性 | 探究胎儿膜-蜕膜界面在足月分娩和早产中的分子机制 | 人类胎儿膜组织(包括羊膜上皮、羊膜间质、绒毛膜和母体蜕膜) | 空间转录组学 | 早产 | 单细胞转录组学 | 分层聚类分析 | 转录组数据 | 13例患者(包括足月未临产、足月临产、早产和早产胎膜早破) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 138 | 2026-04-02 |
Reprogramming the tumor microenvironment leverages CD8+ T cell responses to a shared tumor/self antigen in ovarian cancer
2023-Mar-16, Molecular therapy oncolytics
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.omto.2023.02.002
PMID:36875325
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研究论文 | 本研究探讨了使用CXCR4拮抗剂武装的溶瘤病毒疗法,通过重编程肿瘤微环境来增强对卵巢癌共享肿瘤/自身抗原的CD8+ T细胞反应 | 揭示了在耐受性肿瘤微环境中,靶向免疫抑制性癌症相关成纤维细胞与巨噬细胞之间的相互作用,可以诱导肿瘤/自身特异性CD8 T细胞反应,从而提高治疗效果 | 研究基于小鼠模型,结果在人类患者中的转化应用仍需进一步验证 | 研究CXCR4拮抗剂武装的溶瘤病毒疗法对肿瘤进展和抗肿瘤免疫的影响,特别是在耐受性肿瘤微环境中 | SV40 T抗原卵巢癌模型小鼠(包括抗原初始野生型小鼠和表达SV40 T抗原作为自身抗原的Tg转基因小鼠) | 肿瘤免疫学 | 卵巢癌 | 免疫染色,单细胞RNA测序 | NA | 图像,转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 139 | 2026-04-02 |
Senescent cancer cell vaccines induce cytotoxic T cell responses targeting primary tumors and disseminated tumor cells
2023-02, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2022-005862
PMID:36792123
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研究论文 | 本文研究了衰老癌细胞疫苗通过诱导细胞毒性T细胞反应来靶向原发性肿瘤和播散性肿瘤细胞 | 利用辐射和veliparib处理诱导癌细胞衰老,将其作为疫苗或激活树突状细胞,以增强抗肿瘤免疫反应,特别是针对播散性肿瘤细胞 | 将肿瘤细胞重新注射到患者体内可能不切实际,但研究通过体外激活的树突状细胞解决了这一问题 | 开发基于衰老癌细胞的治疗性疫苗,以改善基因毒性和免疫疗法,并限制肿瘤复发或转移 | 小鼠CT26结肠癌细胞和4T1乳腺癌细胞 | 免疫学 | 癌症 | scRNA-seq, 流式细胞术, T细胞增殖实验 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 140 | 2026-04-02 |
Tumor-on-a-chip platform to interrogate the role of macrophages in tumor progression
2020-09-30, Integrative biology : quantitative biosciences from nano to macro
IF:1.5Q4
DOI:10.1093/intbio/zyaa017
PMID:32930334
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研究论文 | 本研究利用微生理“肿瘤芯片”平台,探究了特定巨噬细胞亚群对肿瘤行为的影响 | 开发了一种新型的3D体外模型,能够高时空分辨率地捕捉细胞间动态,并首次在TOC设备中展示了M1和M2巨噬细胞对肿瘤生长、血管生成和迁移的不同作用机制 | 研究依赖于体外模型,可能无法完全模拟体内肿瘤微环境的复杂性,且样本类型和数量有限 | 探究肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)在肿瘤微环境中的作用机制 | 人类胰腺癌和结直肠癌细胞,以及M1和M2极化巨噬细胞 | 数字病理 | 胰腺癌,结直肠癌 | 单细胞RNA测序,蛋白质分析,抗体中和研究 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |