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当前共找到 38417 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2026-04-17 |
Proteomic and single-cell landscape reveals novel pathogenic mechanisms of HBV-infected intrahepatic cholangiocarcinoma
2023-Feb-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106003
PMID:36852159
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研究论文 | 本研究通过蛋白质组学和单细胞测序揭示了HBV感染的肝内胆管癌（ICC）的新致病机制，包括细胞间连接减少和上皮-间质转化（EMT）程序增强 | 首次结合全外显子测序、蛋白质组分析和单细胞RNA测序，系统探究HBV感染对ICC的致癌效应，发现细胞间连接水平降低与EMT程序激活的关联 | 样本量相对较小（32例HBV-ICC和89例非HBV-ICC），且为观察性研究，需进一步实验验证机制 | 探究HBV感染在肝内胆管癌（ICC）中的致癌机制和免疫微环境变化 | HBV感染的肝内胆管癌（ICC）患者和非HBV感染的ICC患者 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 全外显子测序, 蛋白质组分析, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据 | 121例患者（32例HBV-ICC, 89例非HBV-ICC） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 122 | 2026-04-17 |
Molecular Computational Anatomy: Unifying the Particle to Tissue Continuum via Measure Representations of the Brain
2022, BME frontiers
IF:5.0Q1
DOI:10.34133/2022/9868673
PMID:37206893
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研究论文 | 本文提出了一种基于几何测度表示的分子计算解剖学理论，用于统一大脑映射中空间转录组学和细胞尺度组织学与组织尺度的计算解剖学 | 引入几何varifold测度和统计力学方法，首次将分子尺度的确定性粒子描述与组织尺度的统计集合统一起来，实现从分子到组织尺度的无缝过渡 | 未明确说明实验验证或具体应用案例，理论框架的实践可行性有待进一步探索 | 统一大脑映射中的分子尺度（如空间转录组学）和组织尺度（如计算解剖学）表示，以理解大脑的结构和功能特性 | 大脑的分子、细胞和组织尺度结构，包括蛋白质、转录组功能身份、电生理学、分子组织学等 | 计算解剖学 | NA | 空间转录组学、数字病理学、分子组织学、电生理学 | 几何varifold测度、统计力学模型 | 分子数据、图像数据、功能状态数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 123 | 2026-04-17 |
STtools: A Comprehensive Software Pipeline for Ultra-high Resolution Spatial Transcriptomics Data
2022, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbac061
PMID:36284674
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研究论文 | 本文介绍了STtools，一个用于处理超高清空间转录组数据的综合软件管道 | STtools能处理新兴技术生成的亚微米分辨率数据，计算可扩展性强，且不牺牲分辨率，相比现有方法提供数倍更高的分析分辨率 | NA | 开发一个能处理多种分辨率空间转录组数据的软件工具，以解决现有工具无法有效处理超高清数据的问题 | 空间转录组数据集，包括Seq-Scope、Slide-seq和VISIUM生成的数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | Seq-Scope, Slide-seq, VISIUM | Seq-Scope（<1μm分辨率）, Slide-seq（10μm分辨率）, VISIUM（100μm分辨率） |
| 124 | 2026-04-17 |
Preclinical safety studies of human embryonic stem cell-derived retinal pigment epithelial cells for the treatment of age-related macular degeneration
2020-08, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/sctm.19-0396
PMID:32319201
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研究论文 | 本研究对人胚胎干细胞衍生的视网膜色素上皮细胞进行了临床前安全性评估，以支持其用于年龄相关性黄斑变性的治疗 | 采用无外源成分的明确分化方案生成功能性hESC-RPE细胞，并通过全基因组测序、单细胞RNA测序等多层次分析评估细胞安全性和基因组稳定性 | 研究主要基于体外和临床前模型，未涉及长期临床疗效或人体内安全性数据 | 评估人胚胎干细胞衍生的视网膜色素上皮细胞在治疗年龄相关性黄斑变性中的安全性 | 人胚胎干细胞衍生的视网膜色素上皮细胞 | 干细胞治疗 | 年龄相关性黄斑变性 | 全基因组测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 全基因组测序 | NA | NA |
| 125 | 2026-04-17 |
A Single-Cell Transcriptomics CRISPR-Activation Screen Identifies Epigenetic Regulators of the Zygotic Genome Activation Program
2020-07-22, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2020.06.004
PMID:32634384
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研究论文 | 本研究结合单细胞转录组学与CRISPR激活技术，在小鼠胚胎干细胞中鉴定了调控合子基因组激活程序的表观遗传因子 | 首次将CRISPR激活筛选与单细胞转录组学结合，系统识别ZGA样转录的调控因子，并揭示其分子机制 | 使用小鼠胚胎干细胞作为早期胚胎的体外模型，可能无法完全模拟体内胚胎的复杂性 | 识别调控合子基因组激活程序的表观遗传因子 | 小鼠胚胎干细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA-seq, CRISPR激活 | MOFA+ | 单细胞转录组数据 | 约200,000个单细胞转录组，包含230个CRISPR激活扰动 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 126 | 2026-04-17 |
Single-Cell Map of Diverse Immune Phenotypes in the Breast Tumor Microenvironment
2018-08-23, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2018.05.060
PMID:29961579
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，绘制了乳腺癌肿瘤微环境中多样免疫细胞表型的图谱，揭示了T细胞的连续激活模型 | 开发了SEQC预处理流程和Biscuit贝叶斯聚类归一化方法，以解决单细胞数据固有的计算挑战，并结合单细胞RNA和T细胞受体测序数据，揭示了TCR利用对表型多样性的组合影响 | 研究仅基于8个乳腺癌样本，样本量相对较小，可能限制了结果的普遍性 | 旨在理解肿瘤微环境中免疫细胞表型，以阐明癌症进展和免疫治疗响应的机制 | 乳腺癌肿瘤微环境中的免疫细胞，包括来自肿瘤、正常乳腺组织、血液和淋巴结的细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA-seq, 单细胞T细胞受体测序 | 贝叶斯聚类方法 | 单细胞RNA测序数据 | 约45,000个免疫细胞来自8个乳腺癌样本，以及匹配的正常组织、血液和淋巴结；额外27,000个T细胞用于配对分析 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 127 | 2026-04-17 |
Single-cell RNA-seq supports a developmental hierarchy in human oligodendroglioma
2016-11-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/nature20123
PMID:27806376
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析人类少突胶质细胞瘤，支持其存在发育层级结构，并验证癌症干细胞模型 | 首次在人类少突胶质细胞瘤中通过单细胞RNA测序无偏地揭示癌症干细胞的存在及其在肿瘤生长中的主导作用 | 需要完整的系统发育树来明确遗传进化对推断层级结构的影响 | 探究人类少突胶质细胞瘤的细胞架构和发育层级，验证癌症干细胞模型 | 六例IDH1或IDH2突变的人类少突胶质细胞瘤样本 | 数字病理学 | 少突胶质细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 4,347个单细胞来自六例肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 128 | 2026-04-16 |
Spatial transcriptomics analysis of uterine gene expression in enhancer of zeste homolog 2 conditional knockout mice†
2021-11-15, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioab147
PMID:34344022
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析子宫特异性Ezh2条件性敲除小鼠的子宫基因表达变化 | 首次应用空间转录组学方法探究Ezh2在子宫上皮和间质细胞中的特异性基因调控作用 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类子宫内膜疾病中直接验证 | 阐明EZH2在子宫组织中对基因表达的空间特异性调控机制 | 子宫特异性Ezh2条件性敲除小鼠的子宫组织 | 空间转录组学 | 子宫内膜疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 成年去势野生型和Ezh2cKO小鼠子宫组织 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 129 | 2026-04-16 |
TRUST4: immune repertoire reconstruction from bulk and single-cell RNA-seq data
2021-06, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-021-01142-2
PMID:33986545
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研究论文 | 介绍TRUST4开源算法，用于从RNA-seq数据重建αβ/γδ T细胞和B细胞的免疫受体库 | TRUST4支持FASTQ和BAM格式，速度更快、灵敏度更高，能组装更长甚至全长的受体库，且能从单细胞RNA-seq数据中调用库序列而无需V(D)J富集 | NA | 开发一种算法以重建免疫受体库 | αβ/γδ T细胞和B细胞的免疫受体库 | 生物信息学 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Genomics平台 | SMART-seq和5' 10x Genomics平台 |
| 130 | 2026-04-16 |
Expression of Amyloidogenic Transthyretin Drives Hepatic Proteostasis Remodeling in an Induced Pluripotent Stem Cell Model of Systemic Amyloid Disease
2020-08-11, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2020.07.003
PMID:32735824
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研究论文 | 本研究利用诱导多能干细胞模型探索系统性淀粉样变疾病中肝细胞样细胞对淀粉样蛋白原性转甲状腺素蛋白分泌的贡献 | 首次结合诱导多能干细胞和单细胞RNA测序技术，揭示肝细胞在淀粉样蛋白原性转甲状腺素蛋白分泌中的蛋白稳态重塑作用 | 研究基于体外诱导多能干细胞模型，可能无法完全模拟体内肝细胞的复杂生理环境 | 探究系统性淀粉样变疾病中合成器官对疾病发病机制的贡献 | 遗传性转甲状腺素蛋白淀粉样变性患者的诱导多能干细胞及其衍生的肝细胞样细胞 | 单细胞组学 | 系统性淀粉样变疾病 | 单细胞RNA测序 | 诱导多能干细胞模型 | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 131 | 2026-04-16 |
IL-2 production by self-reactive CD4 thymocytes scales regulatory T cell generation in the thymus
2019-11-04, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20190993
PMID:31434685
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研究论文 | 本研究揭示了胸腺中调节性T细胞（T reg细胞）生成的关键调控机制，即自身反应性CD4单阳性胸腺细胞通过产生IL-2来调节胸腺T reg细胞的生成规模 | 首次发现胸腺中IL-2的主要来源是成熟的CD4单阳性胸腺细胞，并证明这些自身反应性细胞通过IL-2产生来调节胸腺T reg细胞的生成规模，建立了胸腺T reg细胞池大小与成熟胸腺前体细胞整体自身反应性之间的调控关系 | 研究主要基于小鼠模型，人类胸腺中是否存在相同机制尚需验证；IL-2产生的具体调控机制和信号通路细节有待进一步阐明 | 探究胸腺中调节性T细胞（T reg细胞）生成和维持的调控机制，特别是IL-2在其中的作用 | 小鼠胸腺中的CD4 T细胞亚群，包括调节性T细胞（T reg细胞）及其前体细胞、成熟的CD4单阳性胸腺细胞 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 132 | 2026-04-16 |
Genetic and phenotypic difference in CD8+ T cell exhaustion between chronic hepatitis B infection and hepatocellular carcinoma
2019-01, Journal of medical genetics
IF:3.5Q2
DOI:10.1136/jmedgenet-2018-105267
PMID:29666149
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研究论文 | 本研究探讨了慢性乙型肝炎和肝细胞癌中CD8+ T细胞耗竭的遗传和表型差异 | 首次系统比较了慢性感染与癌症中CD8+ T细胞耗竭的差异，并利用单细胞测序数据进行再分析 | 样本来源有限，仅基于已发表数据集和部分组织样本，未涉及动态过程或治疗干预 | 探究慢性乙型肝炎与肝细胞癌中CD8+ T细胞耗竭的异同 | 从慢性乙型肝炎和肝细胞癌组织中分离的CD8+ T细胞 | 单细胞组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 聚类分析 | 单细胞测序数据 | 未明确具体样本数量，但使用了已发表数据集GSE98638 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 133 | 2026-04-15 |
Bisphenol analogs affected hepatic development and disrupted lipid homeostasis in zebrafish larvae
2026-May-15, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2026.127929
PMID:41812818
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研究论文 | 本研究通过暴露斑马鱼胚胎于BPA及其替代物BPAF和BPG，揭示了这些双酚类似物对肝脏发育和脂质稳态的干扰机制 | 首次系统比较了BPA、BPAF和BPG对斑马鱼幼虫肝脏发育和脂质代谢的影响，并利用10x单细胞RNA-Seq技术揭示了肝细胞中脂质积累和代谢通路的具体变化 | 研究仅基于斑马鱼模型，结果向人类外推需谨慎；暴露浓度设置可能未完全覆盖环境相关水平 | 探究双酚类似物对早期生命发育阶段肝脏发育和脂质稳态的影响机制 | 斑马鱼胚胎和幼虫 | 毒理学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA-Seq, 脂质组学分析, 油红O染色 | NA | 基因表达数据, 脂质组数据, 图像数据 | 斑马鱼胚胎暴露于不同浓度双酚类似物（0.5, 50, 500 μg/L BPA/BPAF; 0.5, 50, 250 μg/L BPG） | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x单细胞RNA-Seq分析系统 |
| 134 | 2026-04-15 |
Longitudinal spatial transcriptomics reveals the molecular dynamics of pulmonary artery remodeling in pulmonary arterial hypertension
2026-May, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
DOI:10.1016/j.healun.2026.01.017
PMID:41577266
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研究论文 | 本研究通过纵向空间转录组学分析，揭示了肺动脉高压患者肺动脉重塑的分子动态变化 | 首次在肺动脉高压患者中进行纵向空间转录组学分析，比较了13年间两次肺移植样本，揭示了小和大肺动脉在严重重塑病变中的转录组差异，并识别出独特的基因特征 | 研究基于单例患者样本，样本量较小，可能限制结果的普遍性 | 探究肺动脉高压中肺动脉重塑的病理生理机制和分子动态变化 | 肺动脉高压患者的肺组织样本，特别是小和大肺动脉区域 | 空间转录组学 | 肺动脉高压 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 1例患者，在13年间两次肺移植的样本，包括严重和中等重塑两个时间点 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 135 | 2026-04-15 |
Novel insights into the mechanism of formaldehyde-induced lung cancer: a network toxicology and molecular docking approach
2026-May, Toxicology mechanisms and methods
IF:2.8Q2
DOI:10.1080/15376516.2026.2621747
PMID:41641566
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研究论文 | 本研究通过网络毒理学和分子对接技术，探讨了甲醛对肺癌的复杂影响，揭示了其分子机制 | 结合网络毒理学、分子对接和单细胞RNA测序数据分析，系统识别甲醛影响肺癌的关键靶点和通路，揭示了传统毒理学方法难以发现的复杂关系 | 研究主要基于数据库和计算模拟，缺乏实验验证，且样本来源和单细胞数据的具体细节未明确说明 | 探索甲醛诱导肺癌的分子机制，识别关键靶点和通路 | 甲醛与肺癌相关的靶点基因和蛋白质 | 生物信息学 | 肺癌 | 网络毒理学、分子对接、单细胞RNA测序数据分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 136 | 2026-02-14 |
First longitudinal spatial transcriptomics analysis in pulmonary arterial hypertension
2026-May, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
DOI:10.1016/j.healun.2026.02.003
PMID:41679567
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 137 | 2026-04-15 |
Lumican-mediated fibroblast differentiation in skin fibrosis
2026-May, Matrix biology : journal of the International Society for Matrix Biology
IF:4.5Q2
DOI:10.1016/j.matbio.2026.03.006
PMID:41912056
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学，探讨了皮肤纤维化中Lumican介导的成纤维细胞分化机制 | 结合单细胞RNA测序与空间转录组学，系统比较了胎儿皮肤、成人皮肤和瘢痕疙瘩中成纤维细胞的基因表达谱和分化轨迹，并首次验证了Lumican作为成纤维细胞分化的关键调控因子 | 研究主要基于体外模型和动物模型，临床转化仍需进一步验证 | 探究从无瘢痕愈合到病理性纤维化的分子机制，并识别关键调控基因 | 胎儿皮肤、成人皮肤和瘢痕疙瘩组织中的成纤维细胞 | 数字病理学 | 皮肤纤维化 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据, 空间转录组数据 | 胎儿皮肤、成人皮肤和瘢痕疙瘩组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 138 | 2026-04-15 |
Nanoplastics target lung monocytes, disrupting immune dynamics
2026-May-01, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2026.141961
PMID:41934838
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研究论文 | 本研究通过活体荧光成像、流式细胞术和单细胞RNA测序，揭示了纳米塑料在小鼠体内的生物分布及其对肺免疫动态的干扰 | 首次发现纳米塑料特异性靶向肺部的非经典单核细胞和CD206间质巨噬细胞亚群，并揭示其通过延迟单核细胞向巨噬细胞分化来重编程免疫动态 | 研究仅使用雌性小鼠模型，未探索性别差异；长期暴露后果和人类相关性需进一步验证 | 探究纳米塑料在体内的生物分布及其对免疫系统的直接细胞响应 | 雌性小鼠的肺组织和血液免疫细胞 | 单细胞组学 | 环境暴露相关免疫失调 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 活体荧光成像 | NA | 单细胞转录组数据, 成像数据, 流式数据 | 未明确样本数量的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 139 | 2026-04-15 |
Amoeboid-mesenchymal transition and the proteolytic control of cancer invasion plasticity
2026-Apr-14, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2520717123
PMID:41961858
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研究论文 | 本研究揭示了癌细胞在侵袭过程中通过MMP14介导的蛋白水解作用调控间充质-阿米巴样表型转换的机制 | 挑战了传统观点，发现阿米巴样侵袭程序同样依赖MMP14介导的基质降解，并证明MMP14对维持核完整性至关重要 | 研究主要使用体外3D模型和人组织外植体，体内验证仍需进一步开展 | 探究癌细胞侵袭可塑性（间充质与阿米巴样表型转换）的调控机制 | 癌细胞（乳腺癌模型）、人乳腺癌组织外植体 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、CRISPR/Cas9基因编辑、免疫组织化学 | 3D肿瘤球体模型、人组织外植体模型 | 基因表达数据、空间转录组数据、组织图像数据 | 未明确样本数量，使用癌细胞系模型和人乳腺癌组织外植体 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 140 | 2026-04-15 |
DAPK2 Regulates PKM2 Phosphorylation at Threonine 45 to Facilitate Disturbed Flow-Induced Atherosclerosis
2026-Apr-14, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究揭示了死亡相关蛋白激酶2（DAPK2）通过磷酸化丙酮酸激酶M2（PKM2）的第45位苏氨酸，调控内皮细胞炎症反应，从而促进血流扰动诱导的动脉粥样硬化发生的新机制 | 首次发现DAPK2是KLF2下游的振荡剪切力敏感因子，并鉴定出PKM2是DAPK2的直接作用底物，阐明了DAPK2通过磷酸化PKM2第45位苏氨酸促进其二聚化和核转位，进而激活STAT1并上调VCAM-1和ICAM-1表达的完整信号轴 | 研究主要基于小鼠模型，其在人类疾病中的完全转化意义尚需进一步验证；DAPK2-PKM2轴在其他血管病理条件下的作用未予探索 | 阐明振荡剪切力诱导动脉粥样硬化的分子机制，并寻找潜在的治疗靶点 | 内皮细胞、小鼠动脉粥样硬化模型 | 分子细胞生物学 | 心血管疾病 | 质谱分析、免疫共沉淀、邻近连接实验、RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因组学数据、蛋白质组学数据、单细胞转录组数据 | 利用公共数据库资源及Apoe-/-背景的EC特异性基因修饰小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, RNA测序 | NA | NA |