单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
121	2025-09-25	Single-cell transcriptomics analysis of mild cognitive impairment in World Trade Center disaster responders 2021, Alzheimer's & dementia (Amsterdam, Netherlands) DOI:10.1002/dad2.12154 PMID:33665344	研究论文	通过单细胞转录组分析研究世贸中心救援人员轻度认知障碍的分子机制	首次在世贸中心救援人员群体中应用单细胞分辨率CITE-Seq技术分析MCI的血液转录组特征	样本量较小（共40名男性受试者），仅针对特定暴露人群	探索轻度认知障碍的血液生物标志物和分子机制	世贸中心灾难救援人员	生物信息学	神经退行性疾病	CITE-Seq单细胞转录组测序	NA	单细胞转录组数据	40名男性救援人员（发现队列：9名MCI+9名对照；验证队列：11名MCI+11名对照）
122	2025-09-24	Single-cell RNA sequencing analysis reveals a novel porcine alveolar macrophage subtype with high SLAMF7 expression promoting PRRSV infection 2025-Dec, Virulence IF:5.5Q1 DOI:10.1080/21505594.2025.2560894 PMID:40944943	研究论文	通过单细胞RNA测序发现高表达SLAMF7的新型猪肺泡巨噬细胞亚型可促进PRRSV感染	首次在单细胞水平鉴定出与PRRSV感染相关的特异性巨噬细胞亚群，并揭示SLAMF7基因在病毒复制中的关键作用	体外培养与体内真实感染环境存在差异，部分通路激活不完全一致	解析PRRSV感染过程中肺泡巨噬细胞的异质性及其分子机制	猪肺泡巨噬细胞、T细胞、B细胞	单细胞基因组学	猪繁殖与呼吸综合征	单细胞RNA测序	NA	单细胞转录组数据	未明确样本数量（包含体外培养和新鲜分离的肺泡巨噬细胞）
123	2025-09-24	Type I IFN drives neutrophil swarming, impeding lung T cell-macrophage interactions and TB control 2025-Dec-01, The Journal of experimental medicine IF:12.6Q1 DOI:10.1084/jem.20250466 PMID:40986319	研究论文	本研究通过比较不同小鼠模型，揭示了I型干扰素在结核感染早期通过促进中性粒细胞聚集而限制CD4+ T细胞浸润的免疫机制	发现相对耐药小鼠早期肺内I型干扰素反应更强，并首次阐明I型干扰素通过调控中性粒细胞群聚影响T细胞-巨噬细胞空间互作的机制	研究局限于小鼠模型，尚未在人类感染中得到验证	探究结核分枝杆菌感染早期决定感染结果的免疫机制	C57BL/6和C3HeB/FeJ品系小鼠的肺组织免疫细胞	免疫学	结核病	bulk RNA-seq, scRNA-seq（单细胞RNA测序）	NA	基因表达数据	两种品系小鼠在感染数周内的肺组织样本
124	2025-09-24	Exosomal gene signature in esophageal carcinoma: Insights from single-cell and bulk RNA sequencing 2025-Nov, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2025.102490 PMID:40816225	研究论文	通过整合单细胞和批量RNA测序数据，开发并验证了食管癌外泌体相关基因标志物用于预后预测和免疫治疗指导	首次结合单细胞和批量RNA测序构建食管癌外泌体相关九基因风险模型，并验证其与免疫治疗反应的相关性	免疫治疗验证使用膀胱癌队列而非食管癌特异性队列，需要进一步在食管癌免疫治疗队列中验证	开发食管鳞状细胞癌的外泌体相关生物标志物用于预后评估和治疗指导	食管鳞状细胞癌患者和癌细胞系	生物信息学	食管癌	批量RNA测序、单细胞RNA测序、LASSO-Cox回归分析	九基因风险模型	RNA测序数据	TCGA-ESCA、GSE53625、GSE196756等多个数据集，包含121个文献筛选的外泌体基因
125	2025-09-24	Single-cell omics reveal the mechanisms of traditional Chinese medicines 2025-Nov, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1 DOI:10.1016/j.phymed.2025.157204 PMID:40916282	综述	本文探讨单细胞组学技术在揭示中药作用机制方面的应用潜力	首次系统阐述单细胞组学技术如何解析中药多组分复杂作用机制	存在技术局限性和数据复杂性等挑战	推动中药现代化和科学验证	传统中药及其活性成分	生物医学	NA	单细胞组学（scRNA-seq, scATAC-seq, 空间转录组学）	NA	基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学数据	基于截至2025年6月的科学数据库文献
126	2025-09-24	Integrated transcriptome and single-cell RNA sequencing analysis revealed the prognostic significance of GBP4 in pancreatic adenocarcinoma 2025-Nov, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2025.102532 PMID:40944976	研究论文	本研究通过整合转录组和单细胞RNA测序分析，揭示了GBP4基因在胰腺腺癌中的预后意义	首次结合转录组学和单细胞RNA测序技术系统分析GBP4在胰腺癌中的作用，并构建了基于GBP4相关基因的风险预测模型	研究主要基于公共数据库数据，需要进一步临床验证	确定GBP4基因对胰腺腺癌的影响机制和预后价值	胰腺腺癌患者样本和肿瘤细胞系	生物信息学	胰腺癌	转录组测序、单细胞RNA测序、LASSO回归分析	风险预测模型	基因表达数据	公共数据库中的胰腺癌转录组和单细胞RNA测序数据
127	2025-09-24	Single-cell RNA sequencing reveals palmitoylation-driven cellular heterogeneity and prognostic biomarkers in lung adenocarcinoma 2025-Nov, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2025.102501 PMID:40811979	研究论文	通过单细胞RNA测序揭示棕榈酰化驱动的肺腺癌细胞异质性并建立12基因预后标志物	首次在单细胞水平系统分析棕榈酰化对肺腺癌细胞异质性的影响，并构建具有临床预测价值的12基因风险模型	研究主要基于生物信息学分析，实验验证仅限于ASPH基因的功能研究	探究棕榈酰化修饰在肺腺癌细胞异质性形成及预后预测中的作用	肺腺癌患者肿瘤细胞	生物信息学	肺腺癌	单细胞RNA测序、GSVA、ssGSEA、拷贝数变异分析、伪时间序列分析	基因风险模型	基因表达数据	TCGA数据集（训练集）和GEO数据集（验证集）的肺腺癌样本
128	2025-09-24	Elucidating the therapeutic mechanisms of resveratrol in benign prostatic hyperplasia via an integrated strategy of network pharmacology, multi-omics and molecular biology 2025-Nov, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1 DOI:10.1016/j.phymed.2025.157165 PMID:40839986	研究论文	通过整合网络药理学、多组学分析和分子生物学方法，阐明白藜芦醇治疗良性前列腺增生的作用机制	首次采用网络药理学结合单细胞/批量转录组、分子对接、分子动力学模拟和实验验证的综合策略解析白藜芦醇治疗BPH的多靶点作用机制	未提及临床样本验证及动物模型实验数据	系统揭示白藜芦醇治疗良性前列腺增生的药理靶点和信号通路	前列腺细胞系及良性前列腺增生相关分子靶点	网络药理学	前列腺增生	网络药理学、单细胞RNA测序、批量转录组分析、分子对接、分子动力学模拟、体外实验	NA	转录组数据、分子相互作用数据、实验数据	鉴定228个交叉靶点，3个核心基因（TGF-β1、IGF1、ITGA4）
129	2025-09-24	Genistein ameliorates thoracic aortic dissection by inhibiting CB1 receptor hyperactivation and modulating its-mediated cAMP-PKA signaling 2025-Nov, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1 DOI:10.1016/j.phymed.2025.157178 PMID:40845589	研究论文	本研究探讨染料木黄酮通过抑制CB1受体过度激活并调节cAMP-PKA信号通路来改善胸主动脉夹层的作用机制	首次揭示CB1受体在胸主动脉夹层中的过度表达机制，并发现染料木黄酮通过靶向CB1受体-cAMP-PKA信号轴发挥治疗作用	研究未涉及临床人体试验，主要基于体外和动物实验模型	探究染料木黄酮通过调控CB1受体及其下游cAMP-PKA信号通路延缓胸主动脉夹层进展的潜力	血管平滑肌细胞（VSMCs）和胸主动脉夹层动物模型	心血管疾病研究	胸主动脉夹层	单细胞RNA测序、体外细胞实验、动物模型实验	NA	分子生物学数据、基因表达数据、病理学数据	未明确具体样本数量，包含体外细胞实验和体内动物模型
130	2025-09-24	Immune cell transcriptional profiles from pre-vaccination peripheral blood predict immune response to preventative MUC1 cancer vaccine 2025-Oct-01, European journal of cancer (Oxford, England : 1990) DOI:10.1016/j.ejca.2025.115685 PMID:40815873	研究论文	通过单细胞RNA测序分析疫苗接种前外周血免疫细胞转录谱，预测MUC1癌症预防疫苗的免疫反应	首次利用单细胞RNA测序技术结合贝叶斯图分析，在疫苗接种前识别出与疫苗反应相关的特定免疫细胞类型和基因通路	样本量较小（16名应答者和16名无应答者），需要进一步验证	预测癌症预防疫苗的免疫反应并识别相关生物标志物	曾患晚期结肠腺瘤的临床试验参与者	生物信息学	结肠癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	贝叶斯图分析、机器学习方法	单细胞转录组数据	32名参与者（16名疫苗应答者和16名无应答者）的外周血单核细胞
131	2025-09-24	Inhibition of ACVR1 in Cancer-Associated Fibroblasts Suppresses Colorectal Cancer Cell Growth 2025-Oct, Annals of surgical oncology IF:3.4Q1 DOI:10.1245/s10434-025-17765-0 PMID:40745121	研究论文	本研究通过类器官模型揭示ACVR1-BMP7轴作为结直肠癌治疗新靶点	首次发现ACVR1抑制剂可通过靶向癌症相关成纤维细胞抑制结直肠癌生长	研究主要基于小鼠模型和体外实验，需进一步临床验证	探索癌症相关成纤维细胞中ACVR1信号通路在结直肠癌进展中的作用	结直肠癌细胞、癌症相关成纤维细胞、小鼠模型	肿瘤生物学	结直肠癌	单细胞RNA测序、类器官培养、小鼠异种移植模型	二维类器官模型	基因表达数据、生存分析数据	涉及人类结直肠癌样本和小鼠模型
132	2025-09-24	Selective EPAC1 activators enhance endothelial function in models of vascular inflammation 2025-Oct, Pharmacological research IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.phrs.2025.107923 PMID:40848957	研究论文	本研究通过体外和离体模型探讨选择性EPAC1激活剂在血管炎症中改善内皮功能的作用机制	首次系统验证选择性EPAC1激活剂通过SOCS3上调抑制JAK/STAT3通路，在多种血管炎症模型中恢复内皮功能	研究主要基于离体和体外模型，尚未进行在体动物模型验证	探究EPAC1在调节血管炎症和损伤中的作用及治疗潜力	小鼠主动脉环、人冠状动脉、三细胞共培养系统（内皮细胞/平滑肌细胞/巨噬细胞）	心血管药理学	心血管疾病	单细胞RNA测序、离体主动脉环实验、三细胞共培养	NA	基因表达数据、血管功能数据	健康与动脉粥样硬化小鼠主动脉、人冠状动脉样本、细胞共培养体系
133	2025-09-24	Stage-specific regulation by autophagy-related transcription factors drives hematopoietic stem cell formation 2025-Oct, Autophagy IF:14.6Q1 DOI:10.1080/15548627.2025.2551671 PMID:40878056	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和转录因子分析揭示了自噬相关转录因子在造血干细胞发育不同阶段的特异性调控机制	首次结合scRNA-seq和metaTF方法系统解析了小鼠造血干细胞发育过程中自噬相关转录因子的阶段特异性调控网络	研究仅限于小鼠模型，人类造血干细胞发育的调控机制可能存在差异	探究自噬相关转录因子在造血干细胞发育过程中的调控机制	小鼠胚胎期主动脉-性腺-中肾区域、胎肝和成年骨髓中的造血干细胞	发育生物学	NA	单细胞RNA测序(scRNA-seq), metaTF分析	NA	单细胞转录组数据	涵盖E10.5 AGM区域、E12.5/E14.5胎肝和成年骨髓六个连续发育阶段的小鼠样本
134	2025-09-24	Triple checkpoint blockade of PD-1, Tim-3, and Lag-3 enhances adoptive T cell immunotherapy in a mouse model of ovarian cancer 2025-Sep-30, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2419888122 PMID:40982684	研究论文	本研究通过在小鼠卵巢癌模型中联合阻断PD-1、Tim-3和Lag-3三个检查点，显著增强了工程化T细胞的免疫治疗效果	首次证明三重检查点阻断（PD-1/Tim-3/Lag-3）与工程化T细胞联合治疗可协同增强抗肿瘤效应，并通过单细胞RNA测序揭示其分子机制	研究仅限于小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证	探索多重检查点阻断策略对 adoptive T细胞免疫疗法的增强作用	卵巢癌小鼠模型和靶向MSLN的工程化T细胞	免疫治疗	卵巢癌	单细胞RNA测序、工程化T细胞技术、检查点阻断抗体治疗	动物模型	基因表达数据、生存分析数据	小鼠模型（具体数量未明确说明）
135	2025-09-24	Longitudinal single-cell analysis of glucagon-like peptide-2 treatment in patients with short bowel syndrome 2025-Sep-23, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.194497 PMID:40773292	研究论文	本研究通过纵向单细胞RNA测序分析，探讨GLP-2类似物治疗对短肠综合征患者肠道上皮细胞和免疫细胞动态变化的影响	首次在短肠综合征患者中开展为期一年的纵向单细胞分析，并结合微生物组组成分析，揭示GLP-2类似物治疗对肠道免疫微环境和微生物群的重塑作用	样本量较小（仅5例男性患者），且缺乏对照组	阐明GLP-2类似物在短肠综合征患者中改善营养吸收的精确作用机制	短肠综合征患者（5例男性）的肠道组织和微生物群	单细胞组学	短肠综合征	单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、微生物组组成分析	NA	单细胞转录组数据、微生物组数据	5例接受teduglutide治疗的男性短肠综合征患者，进行为期一年的纵向采样
136	2025-09-24	Inflammatory, transcriptomic, and cell fate responses underlying the mammalian transmission of avian influenza viruses 2025-Sep-23, Journal of virology IF:4.0Q2 DOI:10.1128/jvi.00647-25 PMID:40778772	研究论文	本研究通过雪貂鼻上皮细胞对H1N1禽流感病毒的反应，揭示了与病毒空气传播能力相关的宿主响应机制	首次系统揭示了禽流感病毒在哺乳动物呼吸道上皮细胞中引发的宿主转录组和细胞命运响应与空气传播表型的关联	研究主要基于雪貂模型，结果向人类外推需进一步验证	探究禽流感病毒在哺乳动物呼吸道传播的宿主决定因素	H1N1禽流感病毒株和雪貂鼻上皮细胞	病毒学与宿主互作研究	禽流感	单细胞转录组测序	NA	转录组数据	使用一组H1N1禽流感病毒株感染的雪貂鼻上皮细胞样本
137	2025-09-24	Urine proteomic signatures of kidney function decline after hospitalization 2025-Sep-23, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.195577 PMID:40794429	研究论文	通过尿液蛋白质组学分析住院后患者肾功能下降的分子标志物	首次系统鉴定与肾功能下降相关的387种尿液蛋白，并通过单细胞转录组学定位其在肾脏特定细胞群的表达	样本量有限（174例），需更多队列验证	探索住院后肾功能下降的蛋白质组学机制	急性肾损伤（AKI）患者及非AKI住院患者	蛋白质组学	肾脏疾病	Olink蛋白质组学、单细胞转录组学、空间转录组学	加权相关网络分析	蛋白质组数据、转录组数据	174例患者（ASSESS-AKI队列），另含4个独立验证队列
138	2025-09-24	Innate Immune-Cloaked Microgel-Coated Mesenchymal Stromal Cells Reverse Persistent Pulmonary Fibrosis via Reparative Macrophages 2025-Sep-23, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.) DOI:10.1002/adma.202504590 PMID:40984773	研究论文	提出一种基于先天免疫检查点材料的策略，通过微凝胶包被的间充质基质细胞治疗持续性肺纤维化	首次将CD47自我标记激动剂功能化的软微凝胶包被技术与间充质基质细胞结合，实现免疫逃逸并诱导修复性巨噬细胞	NA	开发新型细胞疗法逆转持续性肺纤维化	间充质基质细胞和肺组织巨噬细胞	细胞治疗	肺纤维化	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	NA
139	2025-09-24	Single-Cell Transcriptomics Reveals ITGA2-Mediated Metabolic Reprogramming and Immune Crosstalk in Pediatric Thyroid Carcinogenesis 2025-Sep-23, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202504088 PMID:40985182	研究论文	通过单细胞转录组学揭示ITGA2介导的代谢重编程和免疫互作在儿童甲状腺癌发生中的作用机制	首次在单细胞层面鉴定出PPTC特异性细胞亚群（ITGA2-PTC细胞），并揭示其通过双重致癌通路（糖酵解通量增强和M2巨噬细胞极化）驱动肿瘤发生	样本量有限（4例PPTC和9例APTC临床样本）	阐明儿童甲状腺乳头状癌特异性病理生物学的分子机制	儿童与成人甲状腺乳头状癌临床样本	单细胞组学	甲状腺癌	单细胞RNA测序、类器官模型、多重免疫组化	NA	单细胞转录组数据	90234个细胞转录组（来自4例PPTC和9例APTC样本）
140	2025-09-24	Multiomics Analyses Reveal an Essential Role of Tryptophan in Treatment of csDMARDs in Rheumatoid Arthritis 2025-Sep-23, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202413170 PMID:40985320	研究论文	通过多组学分析揭示色氨酸在类风湿关节炎csDMARDs治疗中的关键调节作用	首次采用多组学整合方法系统阐明色氨酸在csDMARDs治疗响应中的分子机制，并通过体外/体内实验及临床试验验证	NA	阐明类风湿关节炎患者对csDMARDs治疗响应差异的分子机制	类风湿关节炎患者样本（血浆、粪便、PBMCs）及小鼠模型	多组学分析	类风湿关节炎	代谢组学、微生物组学、转录组学、单细胞转录组学、蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学	NA	多组学数据（代谢物、微生物、基因表达、蛋白质）	涉及患者生物样本（血浆、粪便、PBMCs）及动物模型