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当前共找到 32055 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2025-11-02 |
Integrated machine learning-based establishment of a prognostic model in multicenter cohorts for acute myeloid leukemia
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1649594
PMID:41164126
|
研究论文 | 本研究通过整合机器学习方法建立了急性髓系白血病的预后模型MLAPS | 使用10种机器学习算法的101个模型开发预后特征，并通过实验验证CD69在AML恶性进展中的作用 | NA | 评估白血病细胞相关基因的功能和预后意义 | 急性髓系白血病患者 | 机器学习 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | 集成机器学习模型 | 基因表达数据 | 多个独立队列验证 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 122 | 2025-11-02 |
Integrative modeling of malignant epithelial programs in EGFR-mutant LUAD via single-cell transcriptomics and multi-algorithm machine learning
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1661679
PMID:41164195
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学和多算法机器学习整合建模EGFR突变肺腺癌中的恶性上皮程序 | 在单细胞水平解析EGFR突变上皮细胞的恶性程序，开发了EGFRmERS预后评分系统并验证其优于现有模型，首次将PERP鉴定为关键功能基因 | 使用公开数据库数据，样本来源可能受限；功能验证仅限于体外实验 | 表征EGFR突变肺腺癌中恶性上皮细胞特征，开发预后预测模型 | EGFR突变肺腺癌患者样本中的恶性上皮细胞 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序，qRT-PCR，Transwell迁移/侵袭实验，集落形成实验 | inferCNV，k-means聚类，Monocle2，十种机器学习算法 | 单细胞转录组数据，批量转录组数据 | 多个独立队列的EGFR突变肺腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 123 | 2025-11-02 |
Integrative multi-omics reveals energy metabolism-related prognostic signatures and immunogenetic landscapes in lung adenocarcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1679464
PMID:41164190
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学方法开发了能量代谢相关预后模型，用于评估肺腺癌预后并揭示相关免疫遗传通路 | 首次结合孟德尔随机化和机器学习方法构建能量代谢相关基因的预后模型，并通过单细胞RNA测序揭示其在肿瘤微环境中的细胞特异性表达 | 研究样本量有限，需要更大规模的前瞻性研究验证模型的临床适用性 | 探索能量代谢相关基因在肺腺癌中的预后价值和免疫遗传机制 | 肺腺癌患者和细胞系 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 多组学整合分析, 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, RT-qPCR | 随机生存森林机器学习算法 | 基因组数据, 转录组数据, 临床数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 124 | 2025-11-02 |
Ménière's disease and vestibular migraine: a narrative review of pathogenetic insights, diagnostic evolution, and clinical management advances
2025, Frontiers in neurology
IF:2.7Q3
DOI:10.3389/fneur.2025.1653509
PMID:41164402
|
综述 | 比较分析梅尼埃病与前庭性偏头痛的发病机制、临床特征和诊断标准，总结研究进展并展望未来研究方向 | 提出整合单细胞转录组学、高分辨率内耳MRI、标准化蛋白质组平台和机器学习方法的综合研究框架 | 现有生物标志物研究受限于样本量小和缺乏标准化验证方案 | 阐明梅尼埃病与前庭性偏头痛的发病机制并改进临床诊疗策略 | 梅尼埃病和前庭性偏头痛患者 | 医学研究 | 前庭疾病 | 单细胞转录组学, 高分辨率MRI, 蛋白质组学, 机器学习 | 机器学习 | 临床数据, 影像数据, 分子数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 125 | 2025-11-02 |
Multiplets in scRNA-seq data: Extent of the problem and efficacy of methods for removal
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0333687
PMID:41166377
|
研究论文 | 评估单细胞RNA测序数据中多重捕获问题的普遍性及现有去除方法的有效性 | 通过细胞哈希数据确定真实多重捕获率的下限，揭示常用启发式估计系统性低估问题，并提出改进的泊松模型 | 大多数数据集缺乏多重检测技术验证，研究者仍需依赖有限的工具和启发式方法 | 评估单细胞RNA测序中多重捕获问题的严重程度及现有检测工具的有效性 | 公开可用的单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，细胞哈希技术 | 泊松模型 | 基因表达数据 | 多个公开数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 液滴基单细胞RNA测序 |
| 126 | 2025-11-02 |
Construction of a prognostic prediction model for concurrent radiotherapy in cervical cancer using GEO and TCGA databases with preliminary validation analysis
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0334281
PMID:41171827
|
研究论文 | 本研究利用GEO和TCGA数据库构建了宫颈癌同步放疗的预后预测模型 | 首次基于单细胞RNA测序和批量RNA测序数据构建宫颈癌放疗预后预测模型，并识别出四个关键预后基因 | 样本量相对有限，需要更大规模的前瞻性研究验证 | 开发宫颈癌同步放疗的预后预测模型 | 宫颈癌患者 | 生物信息学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 免疫组织化学 | Cox回归模型 | 基因表达数据, 临床数据 | 144例TCGA宫颈癌样本，加上GSE236738和GSE56363数据集样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 127 | 2025-11-02 |
In-Silico discovery of Pediatric Acute-Myeloid-Leukemia (pAML) causing druggable molecular signatures highlighting their pathogenetic processes and therapeutic agents through single-cell RNA-Seq profile analysis
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0335410
PMID:41171828
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析发现儿童急性髓系白血病的可药物分子特征及其致病机制 | 首次通过整合单细胞RNA测序数据识别pAML关键细胞类型和共同关键基因，并系统揭示其致病机制和潜在治疗药物 | 研究基于计算分析，需要后续实验验证 | 发现儿童急性髓系白血病的致病分子特征和替代治疗药物 | 儿童急性髓系白血病患者样本 | 生物信息学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | 分子对接，分子动力学模拟 | 单细胞RNA测序数据 | 两个数据集(GSE154109和GSE235923) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 128 | 2025-11-02 |
Interleukin-1β Drives Disease Progression in Arrhythmogenic Cardiomyopathy
2024-Dec-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.11.628020
PMID:39763850
|
研究论文 | 本研究通过单细胞核RNA测序和空间转录组学分析，发现白细胞介素-1β在致心律失常性心肌病进展中的关键驱动作用 | 首次在ACM中识别出炎症-纤维化空间生态位，并证明靶向IL-1β可改善疾病表型 | 研究样本量有限，主要基于小鼠模型验证机制 | 探究致心律失常性心肌病的发病机制并寻找潜在治疗靶点 | ACM患者心肌样本和Desmoglein-2突变小鼠模型 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据, 空间基因表达数据 | ACM患者和对照供者心肌样本 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 129 | 2025-11-02 |
Method of moments framework for differential expression analysis of single-cell RNA sequencing data
2024-Oct-31, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.09.044
PMID:39454576
|
研究论文 | 提出了一种用于单细胞RNA测序数据差异表达分析的矩量法框架工具Memento | 开发了可同时分析均值表达、变异性和基因相关性的稳健高效差异分析工具，可扩展至数百万细胞和数千样本 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中区分生物和技术变异源、评估细胞组间定量比较统计显著性的挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 矩量法框架 | 基因表达数据 | 70,000气管上皮细胞、160,000 CRISPR-Cas9扰动T细胞、120万外周血单核细胞、5000万细胞CELLxGENE数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 130 | 2025-11-02 |
Improved characterization of single-cell RNA-seq libraries with paired-end avidity sequencing
2024-Jul-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.10.602909
PMID:39026715
|
研究论文 | 评估Element Biosciences的亲和性测序技术在单细胞RNA-seq文库中准确测序通过同聚物区域的能力及其对多聚腺苷酸化位点分析的影响 | 首次系统评估亲和性基础化学测序技术准确测序通过胸腺嘧啶同聚物区域的能力，并开发了改进的接头修剪和比对流程 | 与单端比对相比，配对端比对并未持续提高读段映射率，且未排除其他新兴平台可能具有类似性能的可能性 | 改进单细胞RNA-seq文库的表征方法，特别是多聚腺苷酸化位点的精确量化 | 单细胞RNA-seq文库 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序，亲和性测序 | NA | DNA测序数据 | NA | Element Biosciences, Illumina | 单细胞RNA-seq | Element Aviti, Illumina测序平台 | Element Aviti亲和性测序平台，标准单细胞RNA-seq |
| 131 | 2025-11-02 |
STimage-1K4M: A histopathology image-gene expression dataset for spatial transcriptomics
2024-Jun-20, ArXiv
PMID:38947920
|
研究论文 | 介绍了一个名为STimage-1K4M的新型空间转录组学数据集，该数据集将组织病理学图像与基因表达数据相结合 | 首次提供了亚图像切片与高维基因表达数据的配对，实现了前所未有的数据粒度 | NA | 解决现有医学图像-文本数据集中文本描述过于概括、缺乏亚区域细节的问题 | 组织病理学图像和基因表达数据 | 计算病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像, 基因表达数据 | 1,149张图像，4,293,195对亚切片图像-基因表达配对 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 132 | 2025-11-01 |
Clinical application of single-cell RNA sequencing in disease and therapy
2025-Nov, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70512
PMID:41169094
|
综述 | 本文系统综述了单细胞RNA测序技术在疾病机制研究和临床应用中的进展 | 全面总结了scRNA-seq技术在多种疾病领域和药物开发中的临床应用前景 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在疾病研究和临床治疗中的应用价值 | 人类疾病中的体细胞进化、生物标志物发现和药物开发 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 133 | 2025-11-01 |
Mechanisms of lactylation-related biomarker in neonatal hypoxic-ischemic brain damage analyzed through multi-omics data
2025-Oct-30, Pediatric research
IF:3.1Q1
DOI:10.1038/s41390-025-04538-4
PMID:41168403
|
研究论文 | 本研究通过多组学数据分析乳酰化相关生物标志物在新生儿缺氧缺血性脑损伤中的作用机制 | 首次在新生大鼠缺氧缺血性脑病模型中采用多组学方法，探索乳酸盐代谢相关基因的作用 | 研究基于大鼠模型，结果向人类临床转化的有效性需进一步验证 | 研究乳酰化相关基因在新生儿缺氧缺血性脑损伤中的机制并探索潜在治疗靶点 | SD大鼠新生幼鼠的脑组织 | 多组学分析 | 新生儿缺氧缺血性脑病 | 转录组学, 蛋白质组学, 单细胞RNA测序, 机器学习, 分子对接 | 机器学习 | 基因表达数据, 蛋白质数据, 单细胞数据 | SD大鼠脑组织样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组学, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 134 | 2025-11-01 |
A novel spatial framework to validate arsenic exposure gene expression profiling in bladder cancer using multiplex FISH and AI-powered digital pathology
2025-Oct-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-23396-y
PMID:41168438
|
研究论文 | 本研究开发了一种结合多重荧光原位杂交和AI数字病理的空间框架，用于验证膀胱癌中砷暴露相关基因表达特征 | 首次将mFISH与AI驱动的数字病理整合，在单细胞分辨率下验证砷暴露相关三基因模型的空间分布特征 | 仅为探索性试点研究，样本量较小(5例膀胱肿瘤标本) | 验证砷暴露相关基因表达特征在膀胱癌中的空间分布及其临床意义 | 膀胱癌肿瘤标本 | 数字病理 | 膀胱癌 | 多重荧光原位杂交(mFISH), AI数字病理分析 | HoverNet | 全玻片图像, 基因表达数据 | 5例膀胱肿瘤标本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 135 | 2025-11-01 |
Nicheformer: a foundation model for single-cell and spatial omics
2025-Oct-30, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02814-z
PMID:41168487
|
研究论文 | 提出基于Transformer的基础模型Nicheformer，用于单细胞和空间组学数据分析 | 首个同时训练于人类和小鼠解离单细胞及靶向空间转录组数据的基础模型，能够学习捕获空间背景的细胞表征 | 未明确说明模型在特定组织类型或疾病状态下的性能限制 | 开发能够整合多尺度数据的机器学习模型，用于空间单细胞分析 | 人类和小鼠的细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | Transformer | 单细胞数据，空间转录组数据 | 超过1.1亿个细胞（5700万解离细胞和5300万空间解析细胞），涵盖73种组织 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 136 | 2025-11-01 |
Integrating single-cell RNA-seq datasets with substantial batch effects
2025-Oct-30, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-12126-3
PMID:41168710
|
研究论文 | 提出一种基于条件变分自编码器的新方法sysVI，用于整合具有显著批次效应的单细胞RNA测序数据集 | 使用VampPrior和循环一致性约束来改进条件变分自编码器，能够在保持生物信号的同时有效整合跨系统数据集 | NA | 开发能够有效整合具有显著批次效应的单细胞RNA测序数据集的计算方法 | 单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 条件变分自编码器(cVAE) | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 137 | 2025-11-01 |
Genome-wide association, single-cell, and spatial transcriptomics analyses reveal the role of the STK24-expressing positive cells in LUAD progression and the tumor microenvironment, identifying STK24 as a potential therapeutic target
2025-Oct-30, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07111-z
PMID:41168822
|
研究论文 | 本研究通过整合基因组关联分析、单细胞转录组学和空间转录组学，揭示了STK24阳性细胞在肺腺癌进展和肿瘤微环境中的作用 | 首次发现STK24作为肺腺癌风险基因，并通过多组学方法系统阐明了STK24阳性上皮细胞在肿瘤微环境中的功能机制 | 研究主要基于公共数据库数据，实验验证部分仍需进一步扩展 | 探索肺腺癌的遗传机制和潜在治疗靶点 | 肺腺癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 肺癌 | GWAS, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 机器学习 | 多种机器学习算法, 预后模型 | 基因组数据, 转录组数据, 空间位置数据 | 来自FinnGen、IEU OpenGWAS、GWAS Catalog和GEO数据库的多个队列数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 138 | 2025-11-01 |
Ex vivo lung-organoid model for aberrant basaloid cell induction and activation
2025-Oct-30, Inflammation and regeneration
IF:5.0Q1
DOI:10.1186/s41232-025-00396-z
PMID:41168897
|
研究论文 | 本研究开发了一种离体小鼠肺类器官模型，用于诱导和激活肺纤维化特异性异常基底样细胞 | 开发了首个能够诱导和激活肺纤维化特异性异常基底样细胞的离体肺类器官模型，并识别出两个不同的ABC亚群 | 仅使用小鼠模型进行研究，未在人体组织中验证所有发现 | 研究肺纤维化中异常基底样细胞的诱导机制和功能 | 小鼠肺类器官和异常基底样细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序，细胞-细胞相互作用分析 | 类器官模型 | 基因表达数据，单细胞测序数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 139 | 2025-11-01 |
A Dynamic DNA Nano-Antioxidant Targeting Galectin-3 Attenuates Liver Fibrosis via Reducing Macrophage Oxidative Stress
2025-Oct-30, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202509977
PMID:41168966
|
研究论文 | 开发了一种靶向Galectin-3的动态DNA纳米抗氧化剂，通过减少巨噬细胞氧化应激缓解肝纤维化 | 首次开发动态DNA纳米抗氧化剂实现肝巨噬细胞特异性siRNA递送，并发现Galectin-3与巨噬细胞氧化应激的正相关性 | 研究仅在小鼠模型中进行验证，尚未进行临床前或临床试验 | 开发靶向治疗肝纤维化的新型纳米药物平台 | 肝巨噬细胞和肝纤维化小鼠模型 | 纳米医学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序，siRNA递送，IVIS成像 | NA | 基因表达数据，荧光成像数据，组织学数据 | 四氯化碳诱导的肝纤维化小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 140 | 2025-11-01 |
Spatiotemporal transcriptomic and metabolomic landscapes of wild soybean seed development reveal regulatory mechanisms of nutrient accumulation
2025-Oct-29, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2025.101580
PMID:41169047
|
研究论文 | 本研究结合空间转录组学和代谢组学解析野生大豆种子发育过程中的营养积累调控机制 | 首次在野生大豆中整合空间转录组学和代谢组学分析，揭示了胚胎不同区域细胞的代谢分化模式及关键调控因子GsMAPK23-4的功能 | 研究仅聚焦于中成熟期种子，未涵盖整个发育过程的动态变化 | 阐明野生大豆种子发育过程中细胞分化和营养积累的时空调控机制 | 野生大豆(Glycine soja Sieb. et Zucc.)种子 | 植物生物学 | NA | 空间转录组学, 空间代谢组学, 差异表达分析, 伪时间轨迹分析, 细胞间通讯分析 | NA | 转录组数据, 代谢组数据 | 中成熟期野生大豆种子 | NA | 空间转录组学, 空间代谢组学 | NA | NA |