单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
121	2025-09-19	DNA methylation-mediated Rbpjk suppression protects against fracture nonunion caused by systemic inflammation 2023-12-05, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1 DOI:10.1172/JCI168558 PMID:38051594	研究论文	本研究揭示了系统性炎症通过DNA甲基化调控Rbpjk表达影响骨折不愈合的机制，并提出了表观遗传修饰的祖细胞局部治疗策略	首次发现NF-κB/Dnmt3b/Rbpjk轴在炎症性骨再生中的作用机制，并验证了表观遗传干预的治疗潜力	研究主要基于小鼠模型，临床转化效果仍需进一步验证	探究系统性炎症导致骨折不愈合的分子机制并开发治疗策略	骨折愈合过程中的祖细胞及其表观遗传调控	骨再生医学	骨折不愈合	单细胞RNA测序、遗传动物模型、表观遗传修饰	转基因小鼠模型（Ikk2ca、Dnmt3b功能缺失/过表达）	基因表达数据、表观遗传数据	多种遗传修饰小鼠模型，具体数量未明确说明
122	2025-09-19	Modelling the distinct roles of epithelial and stromal androgen receptor in the regulation of prostate epithelial dynamics 2023-11, The FEBS journal DOI:10.1111/febs.16900 PMID:37424435	研究论文	本文提出一个概念框架和数学模型，描述雄激素依赖的前列腺上皮动态调节机制	区分上皮和基质雄激素受体的不同功能，并提出IGF1作为关键协调因子，建立能模拟健康与疾病状态的数学模型	基于现有文献推导，模型相对简化，可能需要更全面的实验验证	阐明雄激素调控前列腺上皮细胞动态的分子机制	前列腺上皮细胞和基质细胞	计算生物学	前列腺癌	单细胞RNA-seq数据分析，数学建模	数学模型	基因表达数据	NA
123	2025-09-19	Spatial transcriptomics reveals the distinct organization of mouse prefrontal cortex and neuronal subtypes regulating chronic pain 2023-Nov, Nature neuroscience IF:21.2Q1 DOI:10.1038/s41593-023-01455-9 PMID:37845544	研究论文	利用空间转录组学揭示小鼠前额叶皮层在慢性疼痛调节中的独特细胞与环路组织	首次通过空间分辨单细胞转录组分析揭示前额叶皮层细胞类型组成、基因表达模式及神经元亚型靶向特性的区域特异性	研究局限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证	解析前额叶皮层调控多种功能（包括慢性疼痛）的细胞与环路机制	成年小鼠前额叶皮层组织	空间转录组学	慢性疼痛	空间分辨单细胞转录组测序	NA	空间转录组数据	未明确样本数量（成年小鼠前额叶皮层）
124	2025-09-19	Recent insights into the pathogenesis and therapeutic targets of chronic liver diseases 2023-Oct, eGastroenterology DOI:10.1136/egastro-2023-100020 PMID:38074919	综述	本文概述了慢性肝病（包括酒精性肝病、非酒精性脂肪肝和肝癌）的发病机制研究进展及治疗靶点	聚焦非编码RNA、自噬、肝外信号和巨噬细胞等新兴机制，并探讨单细胞RNA测序技术在肝病研究中的应用	基于会议内容总结，未涉及原始实验数据或临床验证	探讨慢性肝病的发病机制和潜在治疗靶点	酒精性肝病(ALD)、非酒精性脂肪肝(NAFLD)和肝癌	肝病学	肝病	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	NA	NA
125	2025-09-19	Myelin dysfunction drives amyloid-β deposition in models of Alzheimer's disease 2023-06, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-023-06120-6 PMID:37258678	研究论文	本研究探讨髓鞘功能障碍如何通过影响淀粉样前体蛋白加工和分散小胶质细胞清除能力，驱动阿尔茨海默病模型中β淀粉样蛋白沉积	首次揭示髓鞘完整性丧失是AD上游风险因素，发现髓鞘损伤会分散斑块清除小胶质细胞至髓鞘病变部位	基于小鼠模型研究，人类年龄相关性髓鞘变化与AD的直接关联仍需进一步验证	探究年龄相关髓鞘功能障碍与阿尔茨海默病β淀粉样蛋白沉积的因果关系	阿尔茨海默病小鼠模型	神经科学	阿尔茨海默病	bulk and single-cell transcriptomics（批量与单细胞转录组学）	小鼠疾病模型	基因表达数据	NA
126	2025-07-22	Nonlesional lupus skin contributes to inflammatory education of myeloid cells and primes for cutaneous inflammation 2022-04-27, Science translational medicine IF:15.8Q1 DOI:10.1126/scitranslmed.abn2263 PMID:35476593	研究论文	本文通过单细胞RNA测序和空间RNA测序技术，研究了狼疮性皮肤病的免疫发病机制，特别关注了非病变皮肤在疾病中的作用	首次全面描述了狼疮患者病变和非病变皮肤的特征，并揭示了CD16树突状细胞在皮肤中的促炎表型获得过程	研究样本量有限，且未探讨发现的分子机制如何转化为临床表型	探究皮肤性红斑狼疮(CLE)的免疫发病机制	狼疮患者的正常外观皮肤、病变皮肤和循环免疫细胞	数字病理学	红斑狼疮	单细胞RNA测序, 空间RNA测序	NA	RNA测序数据	未明确说明样本数量的狼疮患者皮肤和免疫细胞样本
127	2025-09-19	Single cell RNA sequencing of AML initiating cells reveals RNA-based evolution during disease progression 2021-10, Leukemia IF:12.8Q1 DOI:10.1038/s41375-021-01338-7 PMID:34244611	研究论文	通过单细胞RNA测序技术研究AML起始细胞在疾病进展过程中的RNA水平演化	首次在AML起始细胞中发现RNA克隆演化现象，揭示了代谢、凋亡和趋化因子信号通路的共同演化网络	研究样本量有限，需要在更大队列中验证发现	探究急性髓系白血病（AML）复发机制和起始细胞的演化规律	AML患者的白血病起始细胞（LICs）	单细胞组学	急性髓系白血病	单细胞RNA测序（scRNA-seq），流式细胞术	NA	单细胞RNA测序数据	匹配的诊断和复发患者样本（具体数量未明确说明）
128	2024-08-07	Single-cell RNA sequencing identifies macrophage transcriptional heterogeneities in granulomatous diseases 2021-06, The European respiratory journal DOI:10.1183/13993003.03794-2020 PMID:33602861	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
129	2025-09-19	Beta-Poisson model for single-cell RNA-seq data analyses 2016-07-15, Bioinformatics (Oxford, England) DOI:10.1093/bioinformatics/btw202 PMID:27153638	研究论文	提出一种针对单细胞RNA测序数据的beta-Poisson混合模型，用于捕获基因表达的双峰分布特性并进行差异表达分析	开发了能捕捉单细胞RNA-seq数据双峰分布特征的beta-Poisson模型，优于传统的gamma-Poisson模型	NA	改进单细胞RNA测序数据的统计建模和差异表达分析方法	单细胞RNA测序数据	生物信息学	NA	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	beta-Poisson混合模型，广义线性模型	基因表达数据	多个真实单细胞RNA-seq数据集
130	2025-09-18	Targeting CLK1/SRSF7 axis-dependent alternative splicing sensitizes pancreatic ductal adenocarcinoma to chemotherapy and immunotherapy 2025-Nov, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy IF:15.8Q1 DOI:10.1016/j.drup.2025.101292 PMID:40840404	研究论文	本研究揭示了环状RNA cALG8通过调控选择性剪接促进胰腺导管腺癌化疗耐药和免疫抑制的分子机制	首次发现cALG8作为蛋白支架促进CLK1磷酸化SRSF7，从而形成ATM203变体增强DNA损伤修复能力	研究主要基于临床前模型，尚未进行人体临床试验验证	阐明胰腺导管腺癌吉西他滨耐药机制并开发靶向治疗策略	胰腺导管腺癌细胞系、患者来源类器官(PDO)和异种移植模型(PDX)	肿瘤生物学	胰腺癌	环状RNA测序、液相色谱-质谱联用(LC-MS)、单细胞测序、反义寡核苷酸(ASO)	NA	基因组数据、蛋白质组数据、单细胞数据	化疗敏感与耐药肿瘤样本、PDO/PDX模型
131	2025-09-18	Environmental nano-particulates induced pre-implantation embryonic toxicity in pluripotent stem cell-derived blastoids 2025-Oct-15, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987) DOI:10.1016/j.envpol.2025.126809 PMID:40645264	研究论文	本研究利用多能干细胞衍生的胚状体评估环境纳米颗粒污染物对早期胚胎发育的毒性作用	首次建立灵长类多能干细胞来源的胚状体平台，构建了多层面、多维度的早期胚胎暴露组数据集，并发现与暴露剂量线性相关的滋养层细胞群和分子事件	研究基于体外胚状体模型，与体内真实胚胎发育环境存在差异	评估环境纳米颗粒污染物对早期胚胎发育的毒性效应	灵长类多能干细胞衍生的胚状体	发育生物学	生殖发育疾病	10X scRNA-seq, DIA-MS	胚状体模型	单细胞转录组数据、蛋白质组数据	未明确说明具体样本数量，但采用高通量研究模型
132	2025-09-18	Single-cell transcriptomics combined with spatial transcriptomics reveals a fibrotic microenvironment in hyperuricemic nephropathy 2025-Oct-15, European journal of pharmacology IF:4.2Q1 DOI:10.1016/j.ejphar.2025.178062 PMID:40816527	研究论文	结合单细胞转录组和空间转录组技术揭示高尿酸血症肾病中纤维化微环境的关键细胞和分子机制	首次整合单细胞RNA测序与空间转录组分析高尿酸血症肾病模型，发现巨噬细胞/单核细胞与受损近端小管细胞的关键作用及CCL4-CCR5等趋化因子信号通路在纤维化中的重要性	研究基于大鼠模型，人类临床适用性需进一步验证；样本量较小可能影响统计效力	探究高尿酸血症肾病肾纤维化的细胞组成和分子机制	高尿酸血症肾病大鼠模型肾组织	数字病理学	肾病	单细胞RNA测序, 空间转录组, 差异基因表达分析, 伪时序分析, 基因富集分析, 转录因子网络分析, 体内外基因敲低实验	NA	转录组数据, 空间基因表达数据	高尿酸血症肾病大鼠及对照组肾组织样本（具体数量未明确说明）
133	2025-09-18	IGF2BP2 alleviates ulcerative colitis by inhibiting MEK1/2 and ERK1/2 signaling pathways in intestinal epithelial cells via m6A-dependent stabilization of LGI4 mRNA 2025-Oct-10, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2025.115206 PMID:40663812	研究论文	本研究探讨m6A阅读蛋白IGF2BP2通过稳定LGI4 mRNA抑制MEK1/2-ERK1/2信号通路，从而缓解溃疡性结肠炎的机制	首次揭示IGF2BP2通过m6A依赖性方式稳定LGI4 mRNA，并抑制MEK1/2-ERK1/2信号通路在UC中的保护作用	研究主要基于动物模型和细胞实验，人类临床转化仍需进一步验证	阐明IGF2BP2在溃疡性结肠炎发病机制中的作用及分子机制	肠道上皮细胞、UC患者组织样本、UC细胞模型和DSS诱导的UC小鼠模型	分子生物学	溃疡性结肠炎	单细胞测序、IHC、Western blot、IF、RT-qPCR、meRIP-qPCR、RNA pulldown、RIP、mRNA稳定性检测	NA	测序数据、蛋白质数据、RNA数据	人类组织样本、细胞模型和多组小鼠模型（包括基因敲除和过表达救援实验）
134	2025-09-18	Lonidamine alleviates inflammation and tissue remodeling in a mouse model of eosinophilic chronic sinusitis: A single-cell transcriptomics study 2025-Oct-10, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2025.115258 PMID:40700828	研究论文	本研究通过单细胞转录组学分析，探讨了己糖激酶2抑制剂lonidamine在嗜酸性慢性鼻窦炎小鼠模型中的抗炎和抗组织重塑作用	首次在单细胞水平揭示HK2在ECRS中的表达模式，并发现lonidamine通过抑制Cxcl1-Cxcr2和Ptn-Ncl信号通路发挥治疗作用	研究主要基于小鼠模型，人类临床适用性仍需进一步验证	探究HK2抑制剂lonidamine对嗜酸性慢性鼻窦炎的治疗机制	ECRS小鼠模型和体外培养的人鼻上皮细胞	单细胞转录组学	嗜酸性慢性鼻窦炎	scRNA-seq, 体外细胞模型	小鼠疾病模型	基因表达数据	ECRS小鼠模型和体外细胞实验
135	2025-09-18	Immunoglobin attenuates fulminant myocarditis by inhibiting overactivated innate immune response 2025-Oct, British journal of pharmacology IF:6.8Q1 DOI:10.1111/bph.17372 PMID:39442535	研究论文	本研究探讨免疫球蛋白通过抑制过度激活的先天免疫反应来减轻暴发性心肌炎的作用机制	首次利用单细胞RNA测序技术揭示免疫球蛋白靶向Plac8+单核细胞和S100a8+中性粒细胞，调控Bst2-ILT7配体-受体介导的细胞互作	研究仅基于小鼠模型，尚未进行人体临床试验验证	评估免疫调节药物对暴发性心肌炎的治疗效果及作用机制	A/JGpt小鼠模型中的暴发性心肌炎	免疫学	心血管疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、超声心动图、心导管检查	NA	基因表达数据、生理功能数据	NA
136	2025-09-18	Microglial Regulation of Neural Networks in Neuropsychiatric Disorders 2025-Oct, The Neuroscientist : a review journal bringing neurobiology, neurology and psychiatry DOI:10.1177/10738584251316558 PMID:39932233	综述	本文探讨小胶质细胞在神经精神疾病中对神经网络的调控作用及其潜在治疗意义	结合单细胞测序技术揭示小胶质细胞亚型多样性及其与神经网络的复杂互作机制	NA	深入理解小胶质细胞在神经系统疾病发病机制中的作用并探索新型治疗策略	小胶质细胞及其与神经网络的相互作用	神经科学	神经精神疾病与神经退行性疾病	单细胞测序技术	NA	NA	NA
137	2025-09-18	Single-Cell and Bulk RNA Sequencing Reveal Tumor Cell Characteristics and Communication Features of Primary and Lymphatic Metastatic Hypopharyngeal Squamous Cell Carcinoma 2025-Oct, Head & neck DOI:10.1002/hed.28195 PMID:40395022	研究论文	通过单细胞和批量RNA测序揭示下咽鳞状细胞癌原发灶和淋巴结转移灶的肿瘤细胞特征及细胞通讯模式	首次结合单细胞和批量RNA测序数据构建配体-受体对模型，用于预测下咽鳞癌患者预后和淋巴结转移状态	NA	识别下咽鳞癌淋巴结转移的关键驱动因素和潜在治疗靶点	下咽鳞状细胞癌（HPSCC）原发灶和淋巴结转移灶的恶性上皮细胞	生物信息学	下咽鳞状细胞癌	单细胞RNA测序，批量RNA测序	配体-受体对（LRs）模型	RNA测序数据	多个下咽鳞癌患者队列（训练集、测试集和整体队列）
138	2025-09-18	Single-cell RNA sequencing reveals systemic and placental immune landscape in preeclampsia 2025-Oct, Placenta IF:3.0Q2 DOI:10.1016/j.placenta.2025.08.325 PMID:40803063	研究论文	通过单细胞RNA测序揭示先兆子痫患者外周血和胎盘区域的系统性及胎盘免疫景观	发现了EPE患者外周血中新型CD8+初始T细胞亚群和基底板中新的dNK4细胞亚群，并揭示了早发型与晚发型先兆子痫的免疫学差异	需要进一步研究胎盘不同区域的空间差异及疾病亚型	理解先兆子痫的系统性和胎盘免疫微环境	先兆子痫患者及正常妊娠对照的外周血和胎盘分区免疫细胞	单细胞组学	先兆子痫	单细胞RNA测序	NA	单细胞转录组数据	早发型和晚发型先兆子痫患者及正常对照的外周血和胎盘样本
139	2025-09-18	Immune cell transcriptional profiles from pre-vaccination peripheral blood predict immune response to preventative MUC1 cancer vaccine 2025-Oct-01, European journal of cancer (Oxford, England : 1990) DOI:10.1016/j.ejca.2025.115685 PMID:40815873	研究论文	本研究通过分析疫苗接种前外周血单细胞转录组数据，预测个体对MUC1癌症预防疫苗的免疫反应	首次利用scRNA-seq数据结合机器学习方法，发现CD4+ naïve T细胞等特定免疫细胞特征与疫苗反应相关，并识别出潜在生物标志物	样本量较小（32例），且研究对象仅限于有晚期结肠腺瘤病史的个体	预测癌症预防疫苗的免疫反应并探索相关免疫机制	既往有晚期结肠腺瘤的个体	生物信息学	结肠癌	scRNA-seq, 生物信息学分析, 机器学习	贝叶斯图分析	单细胞RNA测序数据	32例（16名应答者和16名无应答者）
140	2025-09-18	Single-Cell Transcriptomic Atlas of Peripheral Blood Reveals B-Cell-Driven Signature Predictive of Acute Pancreatitis Severity 2025-Oct, MedComm IF:10.7Q1 DOI:10.1002/mco2.70350 PMID:40959459	研究论文	本研究通过单细胞转录组分析揭示了外周血中B细胞驱动的特征可预测急性胰腺炎的严重程度	发现了MZB1表达浆细胞的扩张与疾病严重程度相关，并建立了九基因B细胞转录组特征模型	初始队列样本量较小（n=7），需要更大规模研究验证	开发早期预测急性胰腺炎严重程度的免疫学生物标志物	急性胰腺炎患者的外周血单核细胞	单细胞组学	急性胰腺炎	单细胞RNA测序，T细胞和B细胞受体分析	基因特征预测模型	转录组数据，血清蛋白数据	发现队列7例，验证队列14例，内部验证114例，外部验证AP患者87例，AP合并脓毒症174例