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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2025-11-08 |
GCNLA: Inferring Cell-Cell Interactions From Spatial Transcriptomics With Long Short-Term Memory and Graph Convolutional Networks
2025-Nov, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3572383
PMID:40402695
|
研究论文 | 提出一种基于图卷积网络和长短期记忆注意力模块的GCNLA网络架构,用于从空间转录组数据推断细胞间相互作用 | GCNLA不仅能学习细胞的空间结构,还能捕获远端细胞间的相互作用信息,注意力模块进一步提取和增强与细胞间相互作用相关的特征 | NA | 从空间转录组数据推断细胞间相互作用 | 细胞间相互作用 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 图卷积网络(GCN), 长短期记忆网络(LSTM) | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | seqFISH, MERFISH | NA |
| 122 | 2025-11-08 |
Spatially informed phenotyping by cyclic-in-situ-hybridisation identifies novel fibroblast populations and their pathogenic niches in systemic sclerosis
2025-Nov, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.06.002
PMID:40603206
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研究论文 | 本研究通过循环原位杂交技术结合空间转录组学,在系统性硬化症皮肤中发现并表征了新型成纤维细胞亚群及其致病作用 | 首次在单细胞分辨率下实现原位深度转录谱分析,发现SFRP2+网状真皮成纤维细胞和CCL19+非血管周成纤维细胞两个新型亚群 | 研究样本量有限,需要更大规模的验证研究 | 通过空间转录组学技术研究系统性硬化症皮肤中成纤维细胞亚群的分布特征和致病机制 | 系统性硬化症患者和健康个体的皮肤组织 | 空间转录组学 | 系统性硬化症 | 循环原位杂交,单细胞RNA测序 | BANKSY聚类算法 | 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 系统性硬化症患者和健康对照的皮肤样本 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 123 | 2025-11-08 |
Brain tumors induce widespread disruption of calvarial bone and alteration of skull marrow immune landscape
2025-Nov, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-025-02064-4
PMID:41044343
|
研究论文 | 本研究揭示胶质母细胞瘤通过改变破骨细胞活性和增加颅骨通道数量,导致颅骨骨髓免疫景观改变并影响肿瘤进展 | 首次发现脑肿瘤会诱导颅骨骨髓免疫景观改变,并揭示骨吸收抑制对免疫检查点抑制剂疗效的影响 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 探究脑肿瘤对颅骨骨髓免疫环境的影响机制 | 胶质母细胞瘤小鼠模型和患者样本 | 免疫学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型和患者样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 124 | 2025-11-08 |
Discovering Heterogeneous Leukocytes Subsets Associated With Alcoholic Steatohepatitis by scRNAseq Analysis
2025-Nov, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70448
PMID:41190282
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析发现与酒精性脂肪性肝炎相关的异质性白细胞亚群 | 首次在单细胞水平系统分析酒精性脂肪性肝炎中免疫白细胞的异质性及其与肝纤维化的关联 | 研究仅使用小鼠模型,未在人类样本中验证 | 探究酒精性肝病中免疫细胞类型的特异性反应 | 酒精性肝病诱导小鼠和健康对照小鼠的免疫白细胞 | 单细胞组学 | 酒精性肝病 | 单细胞RNA测序 | t-SNE, SingleR | 单细胞转录组数据 | 酒精诱导和健康对照小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 125 | 2025-11-08 |
Matrix stiffness regulates profibrotic fibroblast differentiation and fibrotic niche activation in systemic sclerosis
2025-Nov, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.05.016
PMID:40579317
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研究论文 | 本研究探讨基质硬度如何调节系统性硬化症中促纤维化成纤维细胞分化和纤维化生态位激活 | 首次揭示基质硬度通过机械转导驱动PI16+前体细胞向SFRP2+COMP+PU.1+肌成纤维细胞分化的机制 | 研究主要基于体外3D培养系统,需进一步体内验证 | 探究基质硬度对成纤维细胞转录状态和谱系分化的影响 | 系统性硬化症患者和健康人皮肤成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 系统性硬化症 | RNA测序,单细胞RNA测序,空间转录组分析 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据 | SSc患者和健康人皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 126 | 2025-11-08 |
Diamond-Inspired DNA Hydrogel Based on Tetrahedral Framework Nucleic Acids for Burn Wound Healing
2025-Nov, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202509727
PMID:40817796
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于四面体框架核酸的钻石启发DNA水凝胶,用于促进烧伤创面愈合 | 首次利用四面体框架核酸构建具有钻石结构的DNA水凝胶,显著提升了机械强度并具备多重功能特性 | 研究主要在小鼠模型中进行,尚未在更大动物模型或临床试验中验证 | 开发一种具有增强机械性能和多重功能的新型DNA水凝胶用于烧伤创面治疗 | 烧伤创面愈合过程中的免疫微环境和细胞相互作用 | 组织工程与再生医学 | 烧伤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 小鼠皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 127 | 2025-11-08 |
A comprehensive molecular atlas of the mesenchymal cell types in the mouse liver
2025-Nov, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-025-00580-9
PMID:40954217
|
研究论文 | 通过深度单细胞RNA测序构建了成年小鼠肝脏主要细胞类型的全面分子图谱 | 揭示了门静脉微血管、肝窦和门静脉中细胞的多样性,发现门静脉表现出混合动静脉表型,识别了先前未被认识的肝星状细胞被膜群体在纤维化疾病中的扩张 | 研究仅限于小鼠模型,人类肝脏的适用性需要进一步验证 | 解析肝脏细胞结构的分子架构,为肝病治疗提供基础 | 成年小鼠肝脏中的间充质细胞类型 | 单细胞生物学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 成年小鼠肝脏细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 128 | 2025-11-08 |
Single-Cell Immune Signature and Response to Neoadjuvant Chemotherapy in BRCA1/2-Mutated Breast Cancer
2025-Nov, JCO precision oncology
IF:5.3Q1
DOI:10.1200/PO-25-00349
PMID:41197086
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析BRCA1/2突变乳腺癌的免疫微环境特征,并开发预测新辅助化疗反应的BRCA-IM模型 | 首次在单细胞水平揭示BRCA1/2突变乳腺癌的免疫微环境图谱,并建立基于单细胞和bulk RNA-seq数据的免疫特征预测模型 | 样本量相对有限,需要在更大队列中进一步验证 | 探索BRCA1/2突变乳腺癌的免疫微环境特征及其与新辅助化疗反应的关系 | BRCA1/2突变乳腺癌患者和BRCA野生型乳腺癌患者 | 单细胞测序分析 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 免疫组织化学 | BRCA-IM预测模型 | 基因表达数据, 病理数据 | 80例BRCA1/2携带者(新辅助化疗队列),40例BRCA1/2携带者和56例非携带者(验证队列) | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 129 | 2025-11-08 |
Myeloid cells mediate interferon-driven resistance to immunotherapy in advanced renal cell carcinoma
2025-Oct-31, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.10.013
PMID:41175876
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了骨髓细胞在肾细胞癌中介导干扰素驱动的免疫治疗耐药机制 | 开发了推断细胞类型中干扰素诱导基因的混合效应模型框架,首次发现骨髓细胞而非肿瘤细胞的IFNγ信号可预测免疫检查点阻断治疗的耐药性 | 研究主要基于观察性数据,需要进一步实验验证机制 | 探究干扰素信号在肾细胞癌免疫治疗耐药中的作用机制 | 肾细胞癌患者的肿瘤免疫微环境 | 单细胞分析 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 混合效应模型 | 单细胞RNA测序数据 | 多个临床试验队列的患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 130 | 2025-11-08 |
Spatial Transcriptomics of Adipose Tissue: Technologies, Applications, and Challenges
2025-Oct-30, Journal of obesity & metabolic syndrome
IF:4.7Q1
DOI:10.7570/jomes25078
PMID:41094746
|
综述 | 本文综述了空间转录组学在脂肪组织研究中的技术进展、应用场景和当前挑战 | 系统整合了空间转录组学技术在解析脂肪组织空间结构方面的最新突破,强调了该技术在揭示脂肪生成微环境、区域特异性重塑和免疫细胞相互作用方面的独特优势 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据,主要基于现有文献进行归纳总结 | 探讨空间转录组学技术在脂肪组织生物学研究中的应用前景 | 脂肪组织的空间结构和细胞微环境 | 空间转录组学 | 代谢疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 131 | 2025-11-08 |
SerpinB2 promotes the proliferation of glioma cells by regulating the cell cycle through the Wnt/β-catenin signaling pathway
2025-Oct-30, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2025.111148
PMID:41176096
|
研究论文 | 本研究揭示SerpinB2通过Wnt/β-catenin信号通路调控细胞周期促进胶质瘤细胞增殖的分子机制 | 首次结合转录组测序和单细胞转录组分析揭示SerpinB2通过Wnt/β-catenin通路调控胶质瘤细胞周期的具体机制 | 研究主要聚焦于细胞周期调控机制,对其他潜在信号通路探索不足 | 阐明SerpinB2在胶质瘤细胞增殖中的分子调控机制 | 胶质瘤细胞系和荷瘤小鼠模型 | 肿瘤生物学 | 胶质瘤 | 转录组测序,单细胞转录组分析,CCK-8,伤口愈合实验,流式细胞术,q-PCR,Western blotting | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据,细胞功能数据 | 胶质瘤组织样本和细胞系,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq,转录组测序 | NA | NA |
| 132 | 2025-11-08 |
Differentiation latency and dormancy signatures define fetal liver hematopoietic stem cells at single-cell resolution
2025-Oct-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116289
PMID:40971295
|
研究论文 | 本研究通过单细胞技术揭示了胎儿肝脏造血干细胞具有分化延迟和休眠特征 | 首次在单细胞水平鉴定了胎儿肝脏造血干细胞的区分特征,包括分化延迟、细胞分裂对称性和生物合成休眠特征 | 研究主要基于体外培养平台,可能无法完全模拟体内真实微环境 | 探索胎儿肝脏造血干细胞自我更新的内在和外在调控机制 | 胎儿肝脏造血干细胞 | 单细胞分析 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 活细胞成像, 移植实验 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 133 | 2025-11-08 |
CCL26 and CXCL12 preserve insulin-sensitizing macrophages in subcutaneous adipose tissue in obesity
2025-Oct-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116450
PMID:41100258
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研究论文 | 本研究揭示了皮下脂肪组织通过CCL26和CXCL12信号通路维持胰岛素敏感巨噬细胞的新机制 | 首次发现皮下脂肪组织巨噬细胞释放的小细胞外囊泡具有改善胰岛素敏感性的功能,并阐明CCL26和CXCL12信号通路在维持巨噬细胞稳态中的作用 | 研究主要聚焦于肥胖模型,其他代谢疾病状态下的机制尚需进一步验证 | 探究皮下脂肪组织在肥胖中抵抗胰岛素抵抗的保护机制 | 皮下脂肪组织巨噬细胞、小细胞外囊泡、脂肪细胞及其前体细胞 | 代谢疾病研究 | 代谢综合征 | 单细胞RNA测序, 体内外细胞生长和迁移测量 | NA | 基因表达数据, 细胞功能数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 134 | 2025-11-08 |
The constitutive 20S proteasome is required for the maintenance and differentiation of spermatogonia in mice
2025-Oct-28, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.10.068
PMID:41167419
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研究论文 | 本研究揭示了组成型20S蛋白酶体在小鼠精原细胞维持和分化中的关键作用 | 首次证明组成型20S蛋白酶体对精原细胞维持和分化至关重要,并发现s20S蛋白酶体可补偿c20S功能缺失 | 研究仅限于小鼠模型,人类中的相关性尚需验证 | 阐明组成型20S蛋白酶体在精子发生过程中的功能 | 小鼠雄性生殖细胞 | 生殖生物学 | 男性不育 | 单细胞RNA测序, 条件性基因敲除 | 动物模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 135 | 2025-11-08 |
Hydroxylsafflower yellow A modulates tumor vascularization in liver cancer through intercellular communication and extracellular matrix-receptor interactions
2025-Oct-24, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157455
PMID:41197344
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研究论文 | 本研究探讨羟基红花黄色素A通过调控细胞间通讯和细胞外基质-受体相互作用调节肝癌血管化的机制 | 首次揭示HSYA通过上调miR-29a-3p表达,抑制Col-IV/ITGB1/FAK和PI3K/AKT信号通路,从而调节肿瘤血管化的新机制 | 研究主要聚焦于miR-29a-3p通路,可能存在其他未被发现的调控机制 | 研究HSYA在纤维化相关肝癌中的治疗作用及其分子机制 | 肝星状细胞、肝癌细胞、纤维化相关肝癌小鼠模型 | 生物信息学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析,分子生物学技术,共培养实验,组织染色,免疫组化,蛋白质印迹,RT-qPCR,扫描电镜,荧光原位杂交 | NA | 单细胞RNA测序数据,分子生物学数据,组织学数据 | 肝癌患者样本和纤维化相关肝癌小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 136 | 2025-11-08 |
Integrated spatial and single-cell transcriptomics reveal PAK kinase as a therapeutic target in fibroblastic foci and dense fibrosis of idiopathic pulmonary fibrosis
2025-Oct, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.00022-2025
PMID:40675771
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研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学和单细胞RNA测序技术,揭示了PAK激酶作为特发性肺纤维化中成纤维细胞灶和致密纤维化的治疗靶点 | 首次发现一种新型肌成纤维细胞群体在成纤维细胞灶和致密纤维化区域富集,并证实PAK激酶在这些纤维化区域被激活 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,需要进一步临床验证 | 探索特发性肺纤维化中纤维化进展的分子机制和潜在治疗靶点 | 特发性肺纤维化患者的肺组织样本和博来霉素诱导的肺纤维化小鼠模型 | 空间转录组学,单细胞分析 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 基因表达数据,空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 137 | 2025-11-08 |
The multifaceted role of YAP in the tumor microenvironment and its therapeutic implications in cancer
2025-Oct, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-025-01551-9
PMID:41028521
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综述 | 本文综述了YAP/TAZ在肿瘤微环境中的多重作用及其在癌症治疗中的意义 | 系统阐述了YAP/TAZ作为Hippo信号通路关键效应子在肿瘤微环境重塑中的核心调控作用,及其与免疫治疗联合应用的潜力 | 肿瘤选择性和耐药机制等挑战仍然存在 | 探讨YAP在肿瘤微环境中的作用机制及其治疗意义 | 肿瘤微环境中的YAP/TAZ信号通路 | 肿瘤生物学 | 癌症 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 138 | 2025-11-08 |
Comparative Single-Cell Transcriptome Analysis of c-Met Receptor Expressing and Non-Expressing Projection Neurons in the Developing Frontal and Visual Cortices
2025-Sep-25, Developmental neuroscience
IF:2.3Q3
DOI:10.1159/000548617
PMID:40996948
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析比较发育中前额叶和视觉皮层c-Met受体表达与非表达投射神经元的转录组差异 | 首次在发育阶段系统比较同一投射神经元亚类中Met+和Met-群体的转录组差异,揭示MET受体在皮层回路异步成熟中的作用 | 研究仅关注小鼠发育早期阶段,未涵盖整个发育过程;样本数量相对有限 | 探究发育中皮层投射神经元亚类内转录组异质性的分子基础 | 小鼠视觉和前额叶皮层中的投射神经元 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, smFISH | NA | 单细胞转录组数据, 基因表达数据 | 小鼠皮层神经元(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 139 | 2025-11-08 |
A 30-gene classifier distinguishes low-risk MDS HSPCs from healthy HSPCs
2025-Sep-17, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2025.105252
PMID:40972808
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学开发了一个30基因分类器,用于区分低风险骨髓增生异常综合征的造血干细胞与健康造血干细胞 | 首次利用单细胞转录组学在LR-MDS中开发了30基因评分系统,并揭示了囊泡运输通路在疾病中的新作用机制 | 研究仅限于低风险MDS患者,未涵盖高风险MDS群体 | 阐明低风险骨髓增生异常综合征的病理生理机制并发现潜在治疗靶点 | 低风险骨髓增生异常综合征患者的造血干细胞和祖细胞 | 单细胞组学 | 骨髓增生异常综合征 | 单细胞转录组测序 | 基因评分模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 140 | 2025-11-08 |
Spatiotemporal Single-Cell Analysis Reveals T Cell Clonal Dynamics and Phenotypic Plasticity in Human Graft-versus-Host Disease
2025-May-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.24.655962
PMID:40501545
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研究论文 | 本研究通过时空单细胞分析揭示了人类移植物抗宿主病中T细胞克隆动态和表型可塑性 | 开发了新型计算工具DecompTCR用于纵向TCR分析,首次整合混合淋巴细胞反应克隆指纹识别、TCR克隆分型、单细胞RNA/TCR测序和空间转录组学技术 | 样本量相对有限(27名alloHCT受者),研究结果需要在更大队列中验证 | 解析异基因造血细胞移植后T细胞介导的复杂病理机制 | 27名异基因造血细胞移植受者的T细胞 | 单细胞多组学 | 移植物抗宿主病 | 单细胞RNA/TCR测序,空间转录组学,TCR克隆分型,混合淋巴细胞反应 | DecompTCR | 单细胞多组学数据,空间转录组数据 | 27名异基因造血细胞移植受者 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞TCR测序,空间转录组学 | NA | NA |