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当前共找到 39637 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2026-05-21 |
KIM-1 as an Early Diagnostic Biomarker of Cisplatin-Induced Acute Kidney Injury
2026 Jan-Dec, Iranian journal of pharmaceutical research : IJPR
IF:1.8Q3
DOI:10.5812/ijpr-164432
PMID:42157797
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研究论文 | 本研究整合生物信息分析、体外实验以及系统综述与荟萃分析，全面评估KIM-1作为顺铂诱导急性肾损伤早期诊断生物标志物的潜力 | 该研究创新性地结合了单细胞RNA测序、大量RNA测序、体外实验和荟萃分析，多模态验证了KIM-1在顺铂诱导急性肾损伤早期诊断中的特异性和准确性 | 荟萃分析纳入的研究数量可能有限，且临床诊断标准基于血清肌酐，可能影响KIM-1的早期检测性能评估 | 综合评估KIM-1在顺铂诱导急性肾损伤中的表达、功能及早期诊断性能 | 顺铂诱导的急性肾损伤小鼠模型及人肾近端小管细胞（HK-2细胞） | 生物信息学与医学诊断 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序、大量RNA测序、实时定量PCR、酶联免疫吸附试验、CCK-8细胞活力检测 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据、临床试验数据 | 荟萃分析涉及多个研究，具体样本量未在摘要中明确列出 | NA | 单细胞RNA测序、大量RNA测序 | NA | NA |
| 122 | 2026-05-21 |
The Role of Methylacrylylated Hyaluronic Acid Hydrogels in Promoting Skin Wound Healing
2026 Jan-Dec, Iranian journal of pharmaceutical research : IJPR
IF:1.8Q3
DOI:10.5812/ijpr-169881
PMID:42157798
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研究论文 | 探究甲基丙烯酰化透明质酸水凝胶在促进皮肤伤口愈合中的作用及局部微环境特征 | 首次结合单细胞测序和CellChat软件分析HAMA水凝胶治疗下伤口局部成纤维细胞和巨噬细胞的亚群变化及细胞间通讯状态 | 仅在小鼠模型中进行，未在人体中验证，且样本量较小（每组6只），可能无法完全代表临床实际情况 | 探索甲基丙烯酰化透明质酸水凝胶在皮肤伤口愈合中的作用并分析伤口局部微环境特征 | 小鼠（C57BL/6）和RAW264.7小鼠巨噬细胞系 | 机器学习 | 皮肤伤口愈合 | 单细胞测序、RT-qPCR、免疫组织荧光染色 | NA | 基因表达数据 | 12只小鼠，分为对照组（n=6）和HAMA组（n=6） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 使用Seurat软件包进行细胞聚类分析，CellChat软件包分析细胞通讯 |
| 123 | 2026-05-21 |
Activation of GABBR1 by New Ligand Valerate Transcriptionally Regulates ATF4-NRF2-CXCL13 Axis Mediating CD8+ T Cell Anti-Tumor Immunity
2026, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.127859
PMID:42157924
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研究论文 | 本研究鉴定戊酸作为GABBR1的新型配体，通过转录调节ATF4-NRF2-CXCL13轴介导CD8+ T细胞抗肿瘤免疫 | 首次发现戊酸作为GABA受体的偏向性配体，特异性结合GABBR1亚基并上调其表达，揭示其在非小细胞肺癌中介导CD8 T细胞抗肿瘤免疫的新机制 | 未提及明显局限性 | 探讨戊酸在非小细胞肺癌中通过GABBR1调节CD8+ T细胞抗肿瘤免疫的作用机制 | 非小细胞肺癌细胞和CD8+ T细胞 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 公共数据集及患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 124 | 2026-05-21 |
The SPP1-CD44 Signaling Axis Orchestrates Macrophage Metabolism to Promote Early Inflammation in Acute Kidney Injury
2026, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.130922
PMID:42157927
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研究论文 | 结合单细胞RNA测序、代谢组学和基因编辑方法，揭示SPP1-CD44信号轴通过PI3K/AKT-PKM2模块调控巨噬细胞代谢重编程，促进急性肾损伤早期炎症的机制 | 首次从单细胞和代谢水平阐明受损肾小管上皮细胞分泌的SPP1通过CD44受体调控巨噬细胞免疫代谢和炎症极化的完整机制，并验证了靶向该轴的潜在治疗价值 | 未明确说明局限性 | 探究急性肾损伤早期受损肾小管上皮细胞如何调控巨噬细胞代谢和表型，并揭示其分子机制 | 缺血再灌注诱导的急性肾损伤小鼠模型及巨噬细胞 | 机器学习和数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序, 代谢组学, 基因编辑 | NA | 单细胞RNA测序数据, 代谢组学数据 | 小鼠模型（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 125 | 2026-05-21 |
Bone Marrow-Derived Macrophage NLRP3 Mediates Renal Fibrosis by triggering TGF-β/Smad3-mediated Macrophage-Myofibroblast Transition
2026, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.131452
PMID:42157945
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研究论文 | 发现骨髓来源巨噬细胞中的NLRP3通过触发TGF-β/Smad3介导的巨噬细胞-肌成纤维细胞转化促进肾纤维化 | 首次揭示NLRP3在肾纤维化中的促纤维化新角色，并阐明其通过直接结合TGF-β受体激活信号通路的新机制 | 局限可能包括仅在小鼠模型中验证，缺乏人类样本的直接证据，以及未深入探讨NLRP3在其他细胞类型中的潜在作用 | 研究NLRP3在肾纤维化发病机制中的新功能及其作用机制 | 小鼠骨髓来源巨噬细胞以及UUO和IRI诱导的肾纤维化小鼠模型 | 机器学习 | 慢性肾病 | 大规模单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 涉及不同基因型小鼠（如NLRP3敲除和巨噬细胞特异性NLRP3敲除小鼠）及UUO和IRI模型，样本数量未具体说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'转录组测序 |
| 126 | 2026-05-21 |
Decoding the Sphingolipid Landscape of Clear Cell Renal Cell Carcinoma: A Single-Cell-Guided Prognostic Model Built With 101 Machine Learning
2026, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/3249360
PMID:42158467
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和批量转录组数据，结合101种机器学习方法，构建了一个基于鞘脂代谢的透明细胞肾细胞癌预后模型 | 首次利用单细胞测序数据解析鞘脂代谢在ccRCC微环境中的细胞类型特异性特征，并通过101种机器学习组合筛选出最优预后模型 | 未提及具体局限性 | 探索鞘脂代谢在透明细胞肾细胞癌微环境中的异质性作用，并构建预后模型以指导风险分层和治疗优先级 | 透明细胞肾细胞癌患者肿瘤微环境中的免疫细胞和基质细胞亚群 | 机器学习 | 肾癌 | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 非负矩阵分解, 机器学习 | Lasso+SuperPC | 基因表达数据 | 多队列整合数据，包括GEO单细胞RNA-seq数据及Xena、ArrayExpress、ICGC的批量转录组和临床数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 127 | 2026-05-21 |
Delineating novel diagnostic biomarkers and therapeutic targets for oral submucosal fibrosis: an integrative multi-omics and machine learning approach
2026, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2026.1803111
PMID:42158597
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研究论文 | 通过整合多组学和机器学习方法，鉴定口腔黏膜下纤维化的新型诊断生物标志物和治疗靶点 | 结合转录组、表观基因组和单细胞RNA-seq数据，并应用机器学习模型来识别潜在生物标志物 | 未明确说明局限性，但样本量较小且主要依赖公共数据库数据 | 发现口腔黏膜下纤维化的新型诊断生物标志物和治疗靶点 | 口腔黏膜下纤维化患者 | 机器学习 | 口腔黏膜下纤维化 | RNA-seq, 微阵列, 表观基因组测序, 单细胞RNA-seq | 随机森林模型 | 基因表达数据, 甲基化数据, 单细胞转录组数据 | 多个公共数据集，具体样本数未明确 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 微阵列 | NA | NA |
| 128 | 2026-05-21 |
Characteristics of peripheral blood neutrophil subsets in patients with primary Sjogren's syndrome based on single-cell RNA sequencing
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1820004
PMID:42158857
|
研究论文 | 基于单细胞RNA测序构建原发性干燥综合征患者外周血中性粒细胞亚群图谱，并探索其作用机制 | 首次利用单细胞RNA测序技术系统描绘原发性干燥综合征患者外周血中性粒细胞的亚群谱系及细胞间相互作用，发现中性粒细胞2亚群具有独特特征，并鉴定LY6E和CLEC12A为潜在生物标志物和治疗靶点 | 未明确说明研究的局限性 | 探究中性粒细胞亚群在原发性干燥综合征发生发展中的角色与机制 | 原发性干燥综合征患者的外周血中性粒细胞 | 机器学学习 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 纳入2022年12月至2025年1月间新诊断的原发性干燥综合征患者及健康对照者外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 129 | 2026-05-21 |
Identification of characteristic hub genes in the immune-active phase of chronic hepatitis B
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1769749
PMID:42158856
|
研究论文 | 通过整合生物信息学和机器学习方法，鉴定慢性乙型肝炎免疫活跃期外周经典单核细胞中的特征性枢纽基因SLC24A4，并探索其作为免疫调节潜在药物靶点的作用 | 首次利用单细胞RNA测序数据验证SLC24A4在慢性乙型肝炎免疫活跃期外周经典单核细胞中高表达，并通过计算机敲除分析揭示其可能作为单核细胞活化的负调控因子，提出其高表达是限制过度炎症的补偿机制 | 研究主要基于公共数据库和计算机模拟分析，SLC24A4的功能验证局限于计算机敲除和临床样本蛋白表达，缺乏体内功能实验证据 | 识别慢性乙型肝炎免疫活跃期的关键分子靶点，为调控宿主免疫反应提供新策略 | 慢性乙型肝炎患者外周经典单核细胞 | 生物信息学, 机器学习 | 慢性乙型肝炎 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, 蛋白质印迹法 | 加权基因共表达网络分析, 机器学习算法, 计算机敲除分析 | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | GSE230397数据集（样本量未明确）、GSE182159和GSE283471单细胞数据集（样本量未明确）、临床样本蛋白质印迹验证（样本量未明确） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 130 | 2026-05-21 |
Integrative transcriptomic analysis revealed the roles and prognostic value of ion channels in hypertrophic cardiomyopathy
2026, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2026.1810143
PMID:42158954
|
研究论文 | 通过整合转录组分析揭示离子通道在肥厚型心肌病中的作用及预后价值 | 首次结合多个转录组数据集、单细胞RNA测序和空间转录组分析，系统识别出四个关键离子通道（KCNC4、KCNN3、ANO1、CACNA2D3）与HCM发展相关，并发现它们与心肌肥厚、纤维化和巨噬细胞比例变化等病理特征的联系 | 未提及具体局限性，但基于公开数据集的分析可能受样本异质性和数据质量影响 | 阐明离子通道在肥厚型心肌病发展中的角色及其诊断和预后价值 | 肥厚型心肌病患者与对照人群的心脏组织样本 | 机器学习 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组测序 | NA | 转录组数据 | 基于三个转录组数据集，具体样本量未明确 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 131 | 2026-05-21 |
Infection of 5xFAD mice with a mouse-adapted SARS-CoV-2 does not alter Alzheimer's disease neuropathology yet induces wide-spread changes in gene expression across diverse cell types
2025-Dec-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.19.695600
PMID:41497643
|
研究论文 | 本研究使用小鼠适应型SARS-CoV-2（MA10）感染5xFAD阿尔茨海默病模型小鼠，发现感染虽未加剧阿尔茨海默病神经病理，但诱导了广泛的基因表达变化 | 首次在阿尔茨海默病小鼠模型中系统评估SARS-CoV-2感染对Aβ病理的直接效应，并利用批量RNA测序与空间转录组学揭示无神经侵袭情况下的细胞功能基因组变化 | 病毒RNA在中枢神经系统中未检测到，未评估长期感染或多次感染对神经病理的潜在累积效应，且仅使用特定年龄小鼠探讨急性感染阶段 | 探究SARS-CoV-2感染如何影响阿尔茨海默病的神经病理机制 | 老年5xFAD（阿尔茨海默病模型）和野生型C57BL/6小鼠 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据 | 两种基因型（5xFAD和WT）的老年小鼠，详细样本数量未在摘要中说明 | NA | 批量RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 132 | 2026-05-21 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomics-Based Research Reveals Association Between M2a Macrophages and Tumor Spread through Air Spaces in Lung Adenocarcinoma
2025-12, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2025.07.017
PMID:40946801
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序和空间转录组学揭示M2a巨噬细胞与肺腺癌气腔扩散的关联 | 创新性地结合单细胞RNA测序和数字空间分析空间转录组学技术，研究特定类型肿瘤相关巨噬细胞对肺腺癌气腔扩散发生和发展的影响机制 | 未提及明显的局限性 | 探索肿瘤相关巨噬细胞亚型在肺腺癌气腔扩散中的作用及其分子机制 | 肺腺癌中的气腔扩散和M2a巨噬细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 133 | 2026-05-21 |
Deciphering neutrophil dynamics in the focal lesion tumor microenvironment to overcome immunosuppression in multiple myeloma
2025-Nov-13, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025028963
PMID:40758944
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析多发性骨髓瘤局灶病变微环境中的中性粒细胞动态，揭示三种具有免疫抑制功能的中性粒细胞亚群，并发现CXCR2阻断可改善治疗效果 | 首次在多发性骨髓瘤局灶病变微环境中发现三种表达CXCR2的成熟中性粒细胞亚群，并揭示TREM1+CD10+亚群在局灶病变中的高免疫抑制活性，同时验证CXCR2阻断作为新治疗策略的潜力 | 未提及具体局限性，但可能涉及样本量有限、需要进一步验证临床转化可行性等 | 阐明中性粒细胞在多发性骨髓瘤免疫抑制微环境中的功能机制，并探索新的治疗靶点 | 多发性骨髓瘤患者的骨髓和局灶病变组织中的中性粒细胞 | 机器学习 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序、免疫荧光成像、功能分析 | NA | 单细胞转录组数据、免疫荧光图像 | 多发性骨髓瘤患者样本（具体数量未在摘要中说明） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞RNA测序 |
| 134 | 2026-05-21 |
Molecular and spatial analysis of ganglion cells on retinal flatmounts identifies perivascular neurons resilient to glaucoma
2025-Oct-15, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2025.07.025
PMID:40840447
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研究论文 | 通过结合成像空间转录组学和免疫染色技术，分析小鼠视网膜神经节细胞在视网膜平面上的分子和空间分布，发现血管周围神经元对青光眼具有恢复力 | 首次建立了全面的视网膜神经节细胞空间图谱，并揭示了血管微环境对神经退行性疾病中细胞差异易感性的影响 | 主要基于小鼠模型，研究未涵盖人类视网膜；对血管周围保护机制的进一步分子通路验证不足 | 研究视网膜神经节细胞在二维视网膜表面上的空间分布及其局部微环境对功能的影响，探索青光眼模型中神经元的保护机制 | 小鼠视网膜神经节细胞 | 数字病理学 | 青光眼 | MERFISH, 免疫染色 | NA | 图像 | 小鼠视网膜扁平样本 | NA | 空间转录组学 | MERFISH | 基于成像的空间转录组学（MERFISH）结合免疫染色 |
| 135 | 2026-05-21 |
Targeting tumor-intrinsic TAK1 triggers anti-tumor immunity and sensitizes pancreatic cancer to checkpoint blockade
2025-Oct-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.08.681226
PMID:41280086
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研究论文 | 揭示肿瘤内部TAK1激酶通过维持基因组完整性抑制抗肿瘤免疫，抑制TAK1可增强免疫检查点阻断剂对胰腺癌的疗效 | 发现TAK1通过磷酸化EphA2和RAD51维持基因组稳定性，并揭示其作为免疫检查点阻断剂的敏感化靶点 | NA | 探究TAK1在胰腺导管腺癌免疫微环境中的功能及其作为治疗靶点的潜力 | 人类PDAC组织样本、p48-Cre;TP53 flox/flox;LSL-KRAS G12D基因工程小鼠模型、肿瘤-CD8 T细胞共培养系统 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、多路免疫组化、蛋白质组学 | NA | 基因表达数据、组织图像 | 人类PDAC样本和基因工程小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 136 | 2026-05-21 |
Islet-intrinsic sex differences in inflammatory signaling contribute to autoimmune diabetes susceptibility
2025-Oct-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.06.680429
PMID:41279069
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研究论文 | 该研究揭示了胰岛β细胞在炎症反应中的性别差异如何影响自身免疫性糖尿病的易感性 | 首次发现雄性胰岛对促炎细胞因子具有更强的干扰素信号诱导和发育信号抑制反应，并证明雌二醇通过重编程β细胞降低免疫原性，为性别偏倚的1型糖尿病易感性提供机制见解 | 研究主要基于体外实验和NOD小鼠模型，人体内的长期效应和临床转化潜力尚需进一步验证 | 阐明性激素如何在胰岛内调控炎症反应，从而影响1型糖尿病的性别差异 | 人类胰岛（男性和女性供体）、小鼠β细胞、非肥胖糖尿病（NOD）小鼠 | 机器学习（若指数据分析方法） | 1型糖尿病（自身免疫疾病） | 转录组学、蛋白质组学、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据 | 人类胰岛来自男性和女性供体（样本量未明确说明）；NOD小鼠和C57BL/6小鼠（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 137 | 2026-05-21 |
Redox Regulation of Microvascular Physiology and Pathophysiology: Insights into Therapeutic Strategies and Limitations
2025-10, Antioxidants & redox signaling
IF:5.9Q1
DOI:10.1177/15230864251372607
PMID:41020442
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综述 | 探讨氧化还原调控在微血管生理与病理中的作用，并评估现有治疗策略及其局限性 | 强调微血管与大型血管在氧化还原反应中的差异，并引入单细胞RNA测序揭示不同血管床内皮细胞的独特基因特征 | 技术挑战限制了对活性氧/活性氮水平与微血管结局的可靠关联；缺乏针对微血管氧化还原信号的特效治疗方法 | 阐明氧化还原介导的微血管功能障碍在多种疾病中的机制，并推动靶向治疗的发展 | 微血管系统（包括细胞存活与死亡、血管生成、血管扩张、屏障功能等） | 心血管领域 | 心血管疾病, 自身免疫性疾病, 感染性疾病, 血红蛋白病, 炎症性疾病, 血管炎, 代谢性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 138 | 2026-05-21 |
Pancreatic tumor microenvironment reprogramming via alloantigenexpressing virotherapy elicits tumor rejection and improves immunotherapy response
2025-Sep-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.15.675641
PMID:41000962
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研究论文 | 通过表达异体抗原的溶瘤病毒疗法重塑胰腺肿瘤微环境，引发肿瘤排斥并改善免疫治疗效果 | 提出利用急性移植排斥机制，通过重组溶瘤病毒载体表达小鼠MHC I类异体抗原（rVMG-H-2Kk），诱导肿瘤特异性抗原错配反应，将免疫冷肿瘤转化为热肿瘤 | 该疗法也诱导了补偿性免疫抑制通路，包括抗病毒反应基因和免疫检查点受体（如PDL-2）的上调 | 开发一种新型免疫治疗平台，通过异体抗原表达重塑肿瘤微环境，增强免疫检查点抑制剂疗效 | 胰腺导管腺癌（PDAC）小鼠模型及肿瘤微环境 | 机器学习 | 胰腺癌 | 溶瘤病毒疗法、空间转录组学、多重免疫组化、免疫表型分析 | NA | 空间转录组数据、免疫组化图像 | 两个独立免疫活性PDAC小鼠模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 139 | 2026-05-21 |
Investigating intestinal farnesoid X receptor functions at the intestinal mucosal barrier and in the intestinal microbiota in a biliary obstruction mouse model
2025-08-01, American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology
DOI:10.1152/ajpgi.00223.2024
PMID:40623002
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研究论文 | 本研究利用肠道特异性敲除小鼠模型，探究了法尼醇X受体在胆汁淤积小鼠模型中对肠道黏膜屏障及肠道菌群的作用和机制 | 首次通过肠道特异性敲除小鼠模型和单细胞测序技术，揭示了FXR在胆汁淤积疾病中直接调控肠道屏障功能和肠道菌群的具体分子机制，特别是发现FXR可能通过调节再生胰岛衍生蛋白3γ来影响肠道功能 | 未提供明确局限性信息 | 阐明法尼醇X受体在胆汁淤积疾病中对肠道黏膜屏障和肠道菌群的调节作用及分子机制 | 肠道特异性FXR敲除小鼠及其胆汁淤积模型（胆管结扎手术） | 生物医学 | 胆汁淤积疾病 | 基因敲除、胆管结扎手术、单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 肠道特异性FXR敲除小鼠及野生型小鼠，具体样本量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 140 | 2026-05-21 |
Scalable and unsupervised discovery from raw sequencing reads using SPLASH2
2025-Jul, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-024-02381-2
PMID:39313645
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研究论文 | 介绍SPLASH2，一种基于高效k-mer计数方法的快速可扩展实现，用于从多种测序技术的大规模数据集中检测调控序列变异 | 提出SPLASH2算法，实现了从原始测序reads中无监督、可扩展的发现，无需参考基因组或注释，并能有效处理大规模单细胞和批量RNA-seq数据 | NA | 开发一种快速、可扩展的算法，用于从原始测序数据中无监督发现调控序列变异 | 单细胞RNA-seq数据和癌症细胞系百科全书（CCLE）的批量RNA-seq数据 | 机器学习 | 癌症 | RNA-seq，k-mer计数 | NA | 测序数据 | 包含单细胞RNA-seq和CCLE批量RNA-seq数据 | Illumina | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | Illumina NovaSeq | NA |