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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2025-12-06 |
Imprinted genes and the manipulation of parenting in mammals
2023-11, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-023-00644-3
PMID:37714957
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综述 | 本文探讨了基因组印记在哺乳动物亲代抚育行为中的角色及其进化意义 | 利用单细胞RNA测序数据,揭示了印记基因与亲代抚育质量之间的双向、迭代关系 | NA | 研究基因组印记如何影响哺乳动物的亲代抚育行为及其进化背景 | 哺乳动物中的印记基因及其在亲代抚育中的作用 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 122 | 2025-12-06 |
Spatiotemporal, optogenetic control of gene expression in organoids
2023-10, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-023-01986-w
PMID:37735569
|
研究论文 | 本研究结合光遗传学和基因扰动技术,在类器官中实现了目标基因表达的可编程时空控制 | 首次将光遗传学与基因扰动技术结合,用于控制类器官中基因表达的时空模式,并通过空间和单细胞转录组分析揭示了SHH信号在神经发育中的新调控机制 | 未明确说明技术适用范围、效率或潜在脱靶效应,且可能仅限于特定类器官模型 | 开发控制类器官中基因表达时空模式的方法,以研究人类发育和疾病建模 | 干细胞衍生的类器官,特别是人类神经发育类器官模型 | 生物医学工程 | NA | 光遗传学、基因扰动技术、空间转录组学、单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 123 | 2025-12-06 |
Colorectal Cancer Metastases in the Liver Establish Immunosuppressive Spatial Networking between Tumor-Associated SPP1+ Macrophages and Fibroblasts
2023-01-04, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-22-2041
PMID:36239989
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间成像技术,揭示了结直肠癌肝转移微环境中SPP1+巨噬细胞与成纤维细胞之间的免疫抑制性空间网络 | 首次在结直肠癌肝转移微环境中鉴定出具有代谢改变和泡沫细胞特征的SPP1+巨噬细胞,并发现其与成纤维细胞通过配体-受体对形成空间邻近的互作网络,促进免疫抑制 | 研究主要关注微卫星稳定型结直肠癌肝转移,可能不适用于其他亚型;样本量相对有限,需进一步验证 | 表征结直肠癌肝转移肿瘤微环境的细胞变化,特别是免疫抑制机制 | 结直肠癌肝转移组织、配对正常肝组织和外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 多重空间成像, 批量基因表达与细胞反卷积 | NA | 单细胞转录组数据, 空间成像数据, 批量基因表达数据 | 一系列微卫星稳定型结直肠癌肝转移样本及配对组织 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 124 | 2025-12-06 |
A human fetal lung cell atlas uncovers proximal-distal gradients of differentiation and key regulators of epithelial fates
2022-Dec-08, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2022.11.005
PMID:36493756
|
研究论文 | 本文通过多组学方法构建了人类胎儿肺发育的细胞图谱,揭示了细胞分化的近端-远端梯度及上皮细胞命运的关键调控因子 | 结合单细胞RNA与ATAC测序、高通量空间转录组学和单细胞成像技术,首次全面描绘了人类肺发育过程中的细胞状态,并发现了新的细胞类型,如发育特异性分泌祖细胞和与人类小细胞肺癌相关的神经内分泌细胞亚型 | 研究主要基于5-22孕周的胎儿样本,可能未覆盖更早期或成年肺发育的完整过程,且器官模型验证的普适性有待进一步确认 | 构建人类肺发育的多组学细胞图谱,以解析细胞分化机制和关键调控网络 | 人类胎儿肺组织中的上皮细胞、间充质细胞、内皮细胞以及红细胞/白细胞等细胞类型 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学, 单细胞成像 | NA | 单细胞多组学数据, 空间转录组数据, 成像数据 | 覆盖5-22孕周的人类胎儿肺组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 125 | 2025-12-05 |
The unfolded protein response in progeria arteries originates from non-endothelial cell types
2026-Feb, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202503485
PMID:41326174
|
研究论文 | 本研究探讨了早衰症动脉中未折叠蛋白反应的起源,发现其主要源于非内皮细胞类型 | 揭示了在表达早老素的动脉中,UPR激活具有细胞类型特异性,挑战了先前关于血管平滑肌细胞和成纤维细胞中UPR普遍激活的观点 | 研究基于小鼠模型,可能不完全反映人类HGPS的病理生理学,且未详细探讨非内皮细胞中UPR的具体机制 | 研究早衰症中未折叠蛋白反应是否导致内皮细胞功能障碍 | Hutchinson-Gilford早衰综合征小鼠模型,特别是内皮细胞特异性表达早老素的动脉组织 | 数字病理学 | 早衰症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 126 | 2025-12-05 |
Spatial transcriptomics mapping of immune cell and TGFβ signalling pathway heterogeneity in testicular germ cell tumours
2026-Jan, Andrology
IF:3.2Q1
DOI:10.1111/andr.70100
PMID:40693358
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术,绘制了睾丸生殖细胞肿瘤中免疫细胞和TGFβ信号通路的异质性图谱 | 首次应用空间转录组学分析睾丸生殖细胞肿瘤的组织切片,揭示了肿瘤内部及周围区域的免疫细胞和TGFβ信号通路异质性 | 样本量较小(仅4例患者),且未涉及长期临床结果验证 | 探究睾丸生殖细胞肿瘤的异质性,特别是免疫细胞和TGFβ信号通路在肿瘤发生发展中的作用 | 睾丸生殖细胞肿瘤组织切片,包括非精原细胞瘤和精原细胞瘤样本 | 空间转录组学 | 睾丸生殖细胞肿瘤 | 空间转录组学分析 | NA | 空间转录组数据 | 4例TGCT患者样本,超过90个感兴趣区域 | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx | NanoString GeoMx空间全转录组工作流程 |
| 127 | 2025-12-05 |
Altered Inflammatory Signature in a C9ORF72 -ALS iPSC-Derived Motor Neuron and Microglia Coculture Model
2026-Jan, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.70084
PMID:40952044
|
研究论文 | 本研究利用携带C9ORF72基因突变的人类诱导多能干细胞(iPSC)来源的运动神经元与小胶质细胞共培养模型,揭示了ALS中炎症反应的改变机制 | 首次在iPSC来源的运动神经元与小胶质细胞共培养模型中,结合单细胞RNA测序技术,系统分析了C9ORF72突变对神经炎症的影响,并发现LPS响应性小胶质细胞亚群的消失 | 研究主要基于体外细胞模型,可能无法完全模拟体内复杂的神经微环境;样本类型和数量有限 | 探究肌萎缩侧索硬化症(ALS)中,C9ORF72基因突变如何通过小胶质细胞介导的神经炎症影响疾病病理 | 人类诱导多能干细胞(iPSC)来源的运动神经元和小胶质细胞,包括携带C9ORF72六核苷酸重复扩增(HRE)的ALS患者iPSC系和C9ORF72敲除(KO)iPSC系 | 神经科学 | 肌萎缩侧索硬化症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),细胞共培养,炎症因子表达与分泌分析 | iPSC来源的细胞共培养模型 | 单细胞转录组数据,细胞表型数据 | 多个iPSC细胞系(包括C9ORF72 HRE和KO系),具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 128 | 2025-12-05 |
Plasma proteomics identifies potential drug targets for diabetic polyneuropathy: Evidence from prospective cohorts and genetic analysis
2026-Jan, Diabetes, obesity & metabolism
DOI:10.1111/dom.70239
PMID:41144938
|
研究论文 | 本研究通过血浆蛋白质组学分析,结合前瞻性队列和遗传数据,识别出与糖尿病多发性神经病相关的潜在药物靶点,特别是TNFRSF14,并探讨其临床和细胞机制 | 首次大规模整合临床、遗传和单细胞测序数据,系统性地筛选并验证TNFRSF14作为糖尿病多发性神经病的新型生物标志物和治疗靶点 | 研究依赖于观察性队列和遗传关联分析,因果推断需进一步实验验证;单细胞测序数据可能样本有限,需扩大验证 | 识别糖尿病多发性神经病的潜在药物靶点,以提升治疗效果 | 糖尿病多发性神经病患者及相关蛋白质和遗传因素 | 蛋白质组学 | 糖尿病多发性神经病 | 血浆蛋白质组学、单细胞测序 | NA | 蛋白质组数据、遗传数据、临床数据 | 大规模临床和遗传数据集(具体样本数未在摘要中说明) | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 129 | 2025-12-05 |
Dissolvable microneedles loaded with denosumab alleviate knee osteoarthritis in rodent and canine models by inhibiting macrophage senescence
2026, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.116970
PMID:41328338
|
研究论文 | 本研究开发了一种负载地诺单抗的可溶性微针阵列,用于局部递送药物以治疗骨关节炎,并在啮齿类和犬类模型中验证了其疗效 | 首次将可溶性微针平台用于地诺单抗的经皮关节内递送,以靶向衰老巨噬细胞,提供了一种微创、局部治疗骨关节炎的新策略,避免了关节内注射的侵入性和全身给药的不良反应 | 研究主要在啮齿类和犬类动物模型中进行,其疗效和安全性仍需在人体临床试验中进一步验证 | 开发一种微创的微针给药平台,用于局部递送地诺单抗以治疗骨关节炎,并评估其疗效和机制 | 骨关节炎(OA) | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),免疫荧光,组织学评估,行为学评估,衰老巨噬细胞-软骨细胞共培养 | NA | 基因表达数据,图像数据,行为数据 | 啮齿类动物(具体物种和数量未明确说明)和比格犬 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 130 | 2025-12-05 |
Enhancer-mediated NR2F2 recruitment activates BGN to promote tumor growth and shape tumor microenvironment in papillary thyroid cancer
2026, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.113712
PMID:41328346
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研究论文 | 本研究揭示了NR2F2-BGN轴在调控甲状腺乳头状癌(PTC)肿瘤生长和肿瘤微环境(特别是巨噬细胞极化)中的关键作用,并评估了靶向该轴的潜在治疗策略 | 首次系统阐明了BGN在PTC中通过内分泌和旁分泌方式促进肿瘤进展的双重作用机制,并发现了NR2F2作为BGN转录的关键上游调控因子,同时验证了NR2F2特异性抑制剂CIA1的治疗潜力 | 研究主要基于细胞系和小鼠模型,其临床转化效果和长期安全性仍需在更多临床样本和试验中验证 | 探究细胞外基质成分BGN在甲状腺乳头状癌(PTC)发生发展中的内分泌与旁分泌作用及其分子机制 | 甲状腺乳头状癌(PTC)细胞、小鼠模型、肿瘤微环境中的免疫细胞(特别是巨噬细胞) | 肿瘤生物学 | 甲状腺癌 | 多组学整合分析、RNA-seq、单细胞RNA-seq、流式细胞术、CRISPR干扰、荧光素酶报告基因检测 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据、流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 131 | 2025-12-05 |
RNA tomography reveals spatial gene expression maps of Arabidopsis thaliana roots infected with Heterodera schachtii
2026-Jan, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.70674
PMID:41104608
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研究论文 | 本研究介绍了RNA断层扫描技术,用于揭示拟南芥根部受甜菜孢囊线虫感染后的空间基因表达图谱 | 首次将RNA断层扫描技术应用于植物,实现了高空间分辨率的非靶向空间转录组学研究,并成功定位了线虫咽腺及新基因表达区域 | 研究仅关注了感染后1-2天的早期阶段,未覆盖整个寄生过程;技术应用范围有待进一步验证 | 探究甜菜孢囊线虫感染拟南芥根部时,早期寄生过程中的分子机制和空间基因表达变化 | 拟南芥(Arabidopsis thaliana)根部及感染其的甜菜孢囊线虫(Heterodera schachtii) | 空间转录组学 | 植物寄生线虫感染 | RNA断层扫描(RNA tomography) | NA | 空间基因表达数据 | 感染后1天和2天的拟南芥根部,共捕获96个连续20微米厚的横截面 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 132 | 2025-12-05 |
Microglial Prrc2a regulates microglia-neuron interaction in cerebellum and motor functions in mice
2025-Dec-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113949
PMID:41341849
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研究论文 | 本研究探讨了Prrc2a在小脑小胶质细胞中的功能及其对小鼠运动功能的影响 | 首次在小脑小胶质细胞中特异性敲除Prrc2a,揭示其作为转录后调节器在小胶质细胞-神经元相互作用中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类相关性尚待验证;机制细节如Prrc2a具体靶点需进一步探索 | 探究小胶质细胞与神经元相互作用的分子机制及其对运动功能的影响 | 小脑小胶质细胞和Purkinje细胞 | 神经科学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | 条件性敲除小鼠模型 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 133 | 2025-12-05 |
Unraveling tumor associated macrophage biology in gynecological cancers for targeted therapy in the single cell omics era
2025-Dec-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113924
PMID:41341850
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综述 | 本文综述了单细胞组学时代下,针对妇科癌症中肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)的生物学特性及其靶向治疗策略的最新证据 | 利用单细胞RNA测序技术精确解析TAMs亚群,揭示其在妇科癌症中的功能多样性和表型可塑性,并评估靶向特定亚型的转化策略 | 作为综述文章,主要基于现有文献总结,未涉及原始实验数据,可能受限于当前研究的覆盖范围和深度 | 总结妇科癌症中TAMs亚群的新证据,强调其表型可塑性、在肿瘤进展和耐药中的作用,并评估靶向治疗策略以改善临床结果 | 妇科癌症(如卵巢癌、宫颈癌、子宫内膜癌等)中的肿瘤相关巨噬细胞(TAMs) | 数字病理学 | 妇科癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 134 | 2025-12-05 |
Spatial Myeloid Landscape of Large Artery Atherosclerotic and Cardioembolic Thrombi Retrieved by Mechanical Thrombectomy
2025-Dec-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202501658RR
PMID:41329022
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和免疫组化分析,比较了大动脉粥样硬化性和心源性栓塞性血栓的免疫细胞组成和分子特征 | 首次在急性缺血性卒中的两种主要亚型中,结合空间转录组学和单细胞RNA测序,揭示了巨噬细胞和中性粒细胞在血栓形成中的特异性免疫血栓模式 | 样本量相对较小(空间转录组学分析仅8例,免疫组化分析35例),且未包括其他卒中病因亚型 | 探究大动脉粥样硬化性和心源性栓塞性卒中血栓中髓系细胞的分子特征和免疫血栓机制 | 接受血管内血栓切除术的急性缺血性卒中患者的血栓样本 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学, 免疫组化, 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 免疫组化图像, 单细胞RNA测序数据 | 42例急性缺血性卒中患者(其中8例LAA,27例CE),空间转录组学分析8例(4例LAA,4例CE),免疫组化分析35例(8例LAA,27例CE) | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 135 | 2025-12-05 |
Deciphering precursor cell dynamics in esophageal preneoplasia via genetic barcoding and single-cell transcriptomics
2025-Dec-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2509534122
PMID:41337486
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研究论文 | 本研究通过结合遗传条形码技术和单细胞RNA测序,追踪食管癌前病变细胞的谱系,揭示了一个具有高可塑性的前体样细胞群及其在肿瘤发生早期的作用 | 首次将遗传条形码与单细胞转录组学结合,用于追踪食管癌前病变细胞的起源和轨迹,并识别出高可塑性前体细胞及其分子标记 | NA | 阐明食管癌前病变中前体细胞的起源、轨迹和可塑性,以理解早期肿瘤发生机制 | 食管癌前病变细胞 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 136 | 2025-12-05 |
Comparing great apes reveals human-specific ZEB2 roles in neural development
2025-Dec-04, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/msaf318
PMID:41340546
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研究论文 | 本研究通过比较人类、黑猩猩和猩猩的ZEB2转录因子调控差异,揭示了人类特异性神经发育调控网络 | 首次在可控细胞系统中检测到跨物种ZEB2调控差异,并发现人类ZEB2调控更多神经发育相关基因,特别是非编码基因的富集 | 研究主要使用B淋巴细胞样细胞系作为模型,虽验证于脑类器官,但仍需更多直接神经组织验证 | 探究人类与其他灵长类在转录调控层面的进化差异 | 人类、黑猩猩、猩猩的B淋巴细胞样细胞及脑类器官数据 | 基因组学与进化生物学 | NA | 转录组测序、单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据、单细胞转录组数据 | 三种大猿物种的B淋巴细胞样细胞系(含生物学重复) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 137 | 2025-12-05 |
Pericytes and Lung Vascular Remodeling
2025-Dec-04, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.125.322518
PMID:41342143
|
综述 | 本文综述了周细胞在肺血管重塑中的作用,特别是在肺动脉高压中的病理生物学机制 | 利用单细胞RNA测序技术识别了新的特异性周细胞标记物,揭示了周细胞亚型,并阐明了其在缺氧信号、TGF-β等机制下的表型转换 | 周细胞由于与其他壁细胞共享标记物和谱系关系,在单细胞数据集中存在识别重叠和代表性不足的问题 | 探讨周细胞在肺血管重塑和肺动脉高压病理生物学中的角色及潜在治疗靶点 | 周细胞(毛细血管壁细胞)及其在肺等器官中的功能 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 138 | 2025-12-05 |
Endothelial ADAR1 Deficit Induces the NOCT-IRF7 Axis in Pulmonary Hypertension
2025-Dec-04, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.326277
PMID:41342206
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研究论文 | 本研究揭示了缺氧诱导的ADAR1缺乏通过上调NOCT表达,激活肺内皮细胞干扰素信号通路,导致细胞凋亡并促进肺动脉高压的发病机制 | 首次发现ADAR1通过RNA编辑调控NOCT基因表达,并建立了ADAR1-NOCT轴在肺动脉高压中的关键作用机制 | 研究主要基于体外细胞和动物模型,人类样本验证相对有限,且具体RNA编辑位点的功能机制需进一步阐明 | 阐明ADAR1依赖性RNA编辑在调控肺内皮细胞病理表型和肺动脉高压发病中的功能和靶点 | 肺内皮细胞、人类和小鼠肺动脉高压模型 | 分子生物学 | 肺动脉高压 | RNA测序、单细胞RNA测序、腺相关病毒表达 | NA | RNA测序数据、单细胞RNA测序数据 | 人类肺动脉高压肺组织、缺氧PH小鼠模型、多种啮齿动物疾病模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 139 | 2025-12-05 |
Ptbp1 is not required for retinal neurogenesis and cell fate specification
2025-Dec-04, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.108331
PMID:41342897
|
研究论文 | 本研究通过条件性敲除小鼠视网膜祖细胞中的Ptbp1基因,评估其在体内发育性神经发生中的作用 | 首次在体内发育环境中系统评估Ptbp1对视网膜神经发生和细胞命运决定的作用,挑战了Ptbp1作为神经发生核心抑制因子的传统观点 | 研究仅聚焦于视网膜发育,未评估Ptbp1在其他神经系统区域或成年神经发生中的作用 | 评估RNA结合蛋白Ptbp1在发育性神经发生和细胞命运决定中的功能 | 小鼠视网膜祖细胞和成熟视网膜细胞 | 发育神经生物学 | NA | 条件性基因敲除、免疫染色、bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据、剪接模式数据 | 突变型小鼠视网膜组织 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 140 | 2025-12-05 |
Identification of CD7 as a novel biomarker of embryonal hepatoblastoma
2025-Dec-04, Pediatric surgery international
IF:1.5Q3
DOI:10.1007/s00383-025-06255-9
PMID:41343061
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研究论文 | 本研究通过多种生物信息学分析和免疫组化染色,探讨了CD7在肝母细胞瘤中的表达及其作为新型生物标志物的潜力 | 首次将CD7鉴定为胚胎型肝母细胞瘤的新型生物标志物,并揭示其与肿瘤进展和不良临床结局的关联 | 研究主要基于回顾性分析,需要进一步的前瞻性验证和功能实验来确认CD7的生物学作用 | 研究CD7在肝母细胞瘤中的表达及其作为生物标志物的潜力 | 人类肝母细胞瘤样本 | 数字病理学 | 肝母细胞瘤 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学分析, 免疫组化染色 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |