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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2026-07-15 |
Potential role of PPARGC1A in linking ulcerative colitis to colorectal cancer: a novel prognostic biomarker and therapeutic target
2026-Jun-30, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2026-1-0109
PMID:42445441
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研究论文 | 通过多组学整合分析揭示PPARGC1A在溃疡性结肠炎向结直肠癌转化中的潜在作用,作为早期预警和个性化管理的生物标志物和治疗靶点 | 首次通过多组学整合和单细胞RNA测序验证PPARGC1A在溃疡性结肠炎相关结直肠癌恶性转化过程中持续低表达,作为早期打击因子,并关联免疫抑制微环境和药物敏感性 | 未提供具体局限性信息 | 识别溃疡性结肠炎向结直肠癌转化的潜在生物标志物和分子机制 | 溃疡性结肠炎和结直肠癌患者 | 机器学习 | 结直肠癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 模拟基因敲除分析 | NA | 表达数据, 药物敏感性数据 | 基于多个数据库的多组学数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 122 | 2026-07-15 |
Reanalysis of Public Transcriptomes Reveals Shared Immune Signatures Between Major Depressive Disorder And Dermatomyositis With Single-Cell Context
2026-Jun-26, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/71024
PMID:42441576
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研究论文 | 通过整合生物信息学重分析公共单细胞转录组数据,识别重度抑郁症与皮肌炎之间共享的免疫信号特征 | 首次通过单细胞RNA-seq背景化分析,系统鉴定重度抑郁症与皮肌炎之间共享的转录组免疫信号,并利用机器学习模型筛选诊断特征基因 | 结果基于公共数据集,需在实际共病队列中进一步验证,且MIF-(CD74+CD44)轴和初始/中央记忆T细胞信号的功能仍需后续研究确认 | 识别重度抑郁症与皮肌炎之间共享的候选转录组免疫信号,并揭示其免疫相关细胞背景 | 公共GEO数据集中的皮肌炎和重度抑郁症转录组数据 | 机器学习 | 重度抑郁症,皮肌炎 | RNA-seq,单细胞RNA-seq | WGCNA,机器学习模型(113个),SHAP | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | 公共GEO数据集中的皮肌炎相关样本(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 123 | 2026-07-15 |
Single-cell and spatial transcriptomic colocalization analysis reveals the roles of histone deacetylation in lung adenocarcinoma progression and microenvironment
2026-Jun-23, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2026.06.013
PMID:42336135
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组共定位分析揭示了组蛋白去乙酰化在肺腺癌进展和微环境中的作用 | 首次整合单细胞RNA测序与空间转录组学并结合分子生物学实验,揭示了FOXA1-HDAC2轴在肺腺癌中的新型调控通路,并建立了7基因预后模型 | 未明确提及相关局限性 | 研究组蛋白去乙酰化酶相关基因在肺腺癌中的空间分布及调控网络 | 肺腺癌患者样本及细胞系 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 分子生物学实验 | NA | 基因表达数据 | 使用GSE131907、GSE189487和TCGA-LUAD数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 124 | 2026-07-15 |
Neuronal subtype-specific ribosomal protein mRNA expression
2026-06-16, RNA (New York, N.Y.)
DOI:10.1261/rna.080954.126
PMID:41956739
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研究论文 | 利用单细胞转录组学分析小鼠大脑皮层和海马体中不同神经元亚型的核糖体蛋白 mRNA 表达 | 首次全面描绘神经元亚类层面的核糖体蛋白基因表达图谱,揭示兴奋性和抑制性神经元之间以及不同亚类间的表达差异,并提出核糖体蛋白可能具有未被充分认识的调控层 | 表达模式在衰老和应激数据集中稳定,但表型相关变化有限 | 探究核糖体蛋白基因在神经元亚型中的表达组织方式 | 小鼠大脑皮层和海马体中的兴奋性及抑制性神经元亚类 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 (Smart-seq2 和 10x Genomics) | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠大脑皮层和海马体的单细胞RNA-seq数据集 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium, Smart-seq2 | Smart-seq2和10x Genomics单细胞RNA测序技术 |
| 125 | 2026-07-15 |
Beyond polarization: single-cell atlas unveils macrophage heterogeneity and neuro-immune crosstalk in bone regeneration
2026-Jun-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116592
PMID:41931958
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示骨再生过程中巨噬细胞的异质性及其与神经系统的交互作用 | 超越了传统的巨噬细胞极化概念,首次系统揭示了骨再生微环境中巨噬细胞的八个异质性亚群,并发现了神经信号通过G蛋白偶联受体基因调控巨噬细胞功能的机制 | 未明确说明研究限制 | 全面解析骨再生过程中巨噬细胞的异质性及其在神经-免疫互作中的角色 | 骨缺损区域的巨噬细胞 | 数字病理学 | 骨再生 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 8148个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 126 | 2026-07-15 |
NINJ1-mediated macrophage ferroptosis impairs diabetic wound healing attenuated by Ruan Jian Qing Mai formula
2026-Jun, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.157955
PMID:41930812
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研究论文 | 本研究揭示NINJ1介导的巨噬细胞铁死亡损害糖尿病伤口愈合,并验证软坚清脉方的保护作用 | 首次发现NINJ1-STAT3-铁死亡通路在糖尿病伤口巨噬细胞中的正反馈环路,并证实软坚清脉方通过打断此环路促进愈合 | 未提及具体局限性,但可推断动物模型与人体临床存在差异,且单细胞测序样本量可能有限 | 探究巨噬细胞铁死亡在糖尿病足溃疡发病中的作用,并评估软坚清脉方的治疗效果及机制 | 巨噬细胞、内皮细胞、糖尿病小鼠伤口组织、人伤口组织 | 数字病理学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序、HPLC-MS、Western blot、qPCR、流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据、图像数据 | 人伤口组织(具体数量未提及)、链脲佐菌素诱导糖尿病小鼠 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒用于人伤口组织单细胞测序 |
| 127 | 2026-07-15 |
Sirt1 deficiency promotes dynamic fibroblast-to-myofibroblast transition in ligamentum flavum hypertrophy via the Smad2/3 pathway
2026-Jun-01, Experimental cell research
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.yexcr.2026.115003
PMID:41932595
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研究论文 | 本研究探讨Sirt1缺乏通过Smad2/3通路促进黄韧带肥大中成纤维细胞向肌成纤维细胞转化的机制 | 首次揭示Sirt1在调控黄韧带肥大中成纤维细胞转化中的作用及其分子机制 | 主要基于动物模型和体外实验,临床验证尚不充分 | 探究Sirt1在黄韧带肥大病理进程中的调控作用及潜在治疗靶点 | 人黄韧带组织、大鼠黄韧带肥大模型及体外培养的黄韧带细胞 | 机器学习 | 腰椎管狭窄 | 单细胞RNA测序、组织学分析、免疫组化、分子分析、转录组分析 | NA | 基因表达数据、组织图像 | 人黄韧带样本及大鼠模型,具体数量未在摘要中提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序用于探索黄韧带细胞异质性 |
| 128 | 2026-07-15 |
Integrated single‑cell and spatial transcriptomics reveal the colorectal cancer microenvironment
2026-Jun, Critical reviews in oncology/hematology
DOI:10.1016/j.critrevonc.2026.105311
PMID:41933856
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综述 | 综述整合单细胞测序和空间转录组学在结直肠癌微环境研究中的应用进展 | 整合单细胞与空间转录组学揭示了结直肠癌微环境中空间组织的肿瘤-基质-免疫网络,包括免疫排斥区、免疫活性微环境和三级淋巴结构相关域,并发现驱动肝转移的上皮细胞标志物和免疫抑制性转移微环境 | 综述未具体说明自身研究的局限性,但隐含了整合技术在实际应用中可能面临的挑战,如数据整合的复杂性、样本来源和患者异质性等 | 总结基于单细胞测序和空间转录组学整合技术在结直肠癌研究中的最新进展,探讨其应用前景和挑战,为精准诊断和治疗提供理论框架 | 结直肠癌肿瘤微环境中的细胞类型,包括肿瘤细胞、基质细胞(如癌症相关成纤维细胞)和免疫细胞(如T细胞、巨噬细胞) | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序和空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞和空间转录组平台 |
| 129 | 2026-07-15 |
Regulatory patterns of antibody-dependent cellular phagocytosis-related genes in triple-negative breast cancer: An integrated multi-omics and single-cell analysis
2026-Jun, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05291-z
PMID:41957185
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研究论文 | 通过多组学和单细胞分析探究三阴性乳腺癌中抗体依赖性细胞吞噬相关基因的调控模式 | 首次系统鉴定ADCP相关基因在三阴性乳腺癌中的预后标志物作用,并联合多组学与单细胞测序揭示其亚型特异性表达模式及药物敏感性关联 | NA(摘要未提及明确局限性) | 揭示ADCP相关基因在三阴性乳腺癌中的分子机制及其对风险分层和治疗的指导意义 | 三阴性乳腺癌患者标本及细胞数据 | 机器学习 | 乳腺癌 | 多组学分析、单细胞RNA测序 | NA(未提及具体模型类型) | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据、单细胞转录组数据 | 100064个细胞(单细胞RNA测序数据)以及来自TCGA、METABRIC、GEO等多个队列的标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 130 | 2026-07-15 |
Vorinostat Potentiates Chemoimmunotherapy in Immune-Enriched Pancreatic Cancer
2026-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202521844
PMID:41969226
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研究论文 | 通过整合体外药物筛选和计算机敏感性预测,发现HDAC抑制剂伏立诺他可以增强免疫富集型胰腺导管腺癌的化学免疫治疗效果 | 首次发现HDAC抑制剂伏立诺他能够特异性增敏免疫富集型胰腺癌的化学免疫治疗,并揭示其通过抑制FASN和PARP9破坏肿瘤细胞代谢陷阱的机制 | NA | 探究免疫富集型胰腺导管腺癌的潜在机制并识别有效治疗方法 | 免疫富集型胰腺导管腺癌的肿瘤细胞和肿瘤微环境 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、体外药物筛选、计算机敏感性预测 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 131 | 2026-07-15 |
Alpha-ketoglutarate accelerates granulocyte-monocyte progenitor differentiation and atherosclerotic plaque inflammation via oxoglutarate receptor 1
2026-Jun, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2026.104134
PMID:41931905
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研究论文 | 该研究发现α-酮戊二酸通过其受体OXGR1促进粒细胞-单核祖细胞分化和动脉粥样硬化斑块炎症 | 揭示了α-酮戊二酸/OXGR1轴通过上调嘌呤核苷磷酸化酶促进嘌呤从头合成、消耗NAD并破坏线粒体稳态的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本中仅观察到异柠檬酸与低密度脂蛋白胆固醇的相关性,分子机制在人体中的验证有限 | 探讨代谢物α-酮戊二酸在动脉粥样硬化斑块进展中的作用及其分子机制 | 高脂饮食喂养的Ldlr小鼠的粒细胞-单核祖细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 靶向代谢组学、单细胞RNA测序、蛋白质组学 | NA | 代谢物数据、单细胞转录组数据、蛋白质组数据 | Ldlr小鼠(具体数量未说明)和人类血浆样本 | NA | 单细胞RNA测序、靶向代谢组学、蛋白质组学 | NA | NA |
| 132 | 2026-07-15 |
Targeting astrocytic Nrf2 by Trilobatin alleviates lipopolysaccharide-induced depressive-like behaviors and cognitive impairment in mice: Mechanistic insights into gut microbiota and metabolites modulation
2026-Jun, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158118
PMID:41931990
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研究论文 | 三叶苷通过靶向星形胶质细胞Nrf2缓解脂多糖诱导的小鼠抑郁样行为与认知障碍,揭示其通过调节肠道菌群和代谢物的机制 | 首次发现三叶苷直接结合Nrf2,通过Nrf2-介导的微生物-肠-脑轴机制减轻抑郁和认知缺陷,并利用单细胞测序、表面等离子共振和基因敲除等技术明确其分子靶点 | 未说明具体局限性 | 探究三叶苷对抑郁样行为和认知障碍的缓解作用,及其通过调节肠道菌群和代谢物的机制 | LPS诱导的抑郁和认知障碍小鼠模型 | 机器学习 | 抑郁症、阿尔茨海默病 | 单细胞测序、表面等离子共振、基因敲除、16S rRNA测序、粪菌移植 | NA | 测序数据、行为学数据 | 小鼠(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 133 | 2026-07-15 |
Molecular phenotypes stratify small cell lung cancer for targeted therapy and immunotherapy
2026-Jun, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-026-03390-5
PMID:41933195
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研究论文 | 本研究通过共识聚类识别出三种小细胞肺癌分子表型,并评估了其对免疫检查点抑制剂的治疗反应 | 首次定义增殖型、iNotch型和浸润型三种SCLC分子表型,并发现ANXA1高表达的浸润型亚群对免疫治疗不敏感 | 文章未明确说明局限性 | 探索小细胞肺癌的分子表型以指导靶向治疗和免疫治疗 | 小细胞肺癌患者的肿瘤组织样本和转录组数据 | 机器学习 | 肺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 共识聚类 | 转录组数据 | 41例新收集的广泛期小细胞肺癌患者及公共数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 134 | 2026-07-15 |
Glia Are Bussin': How Single-Cell and Spatial Transcriptomics Enlighten the Role of Neuroglia in Spinal Cord Injury and Regeneration
2026-Jun, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.70139
PMID:41934089
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综述 | 综述单细胞和空间转录组学技术如何揭示神经胶质细胞在脊髓损伤与再生中的作用 | 通过元分析整合五个脊髓损伤单细胞时间图谱,揭示损伤模型、时间进程、样本制备等因素对研究结果解读的影响 | 未提及具体局限性 | 总结神经胶质细胞在脊髓损伤后表型变化和分子信号的最新发现,并通过对多个数据集的分析提供研究注意事项 | 神经胶质细胞在脊髓损伤中的角色 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 五个单细胞时间图谱数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 135 | 2026-07-15 |
Metabolic and inflammatory roles of glial cells in neurodegenerative and cerebrovascular diseases
2026-Jun, Ageing research reviews
IF:12.5Q1
DOI:10.1016/j.arr.2026.103120
PMID:41932503
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综述 | 探讨胶质细胞在神经退行性和脑血管疾病中的代谢与炎症作用 | 总结了单细胞转录组学和代谢谱分析揭示的小胶质细胞和星形胶质细胞异质性与可塑性,强调其神经保护与神经毒性的双重作用,并探讨了关键炎症通路(如NF-κB、NLRP3炎症小体和C3/C3aR信号轴)及代谢重编程(如氧化磷酸化向糖酵解的转变)在胶质细胞相互作用中的角色 | 对特定背景下胶质细胞相互作用的机制理解仍存在重要空白,且当前实验模型存在局限性 | 总结胶质细胞介导的神经炎症在老年相关神经系统疾病中的最新见解,并讨论靶向胶质代谢和免疫信号的新兴治疗策略 | 小胶质细胞和星形胶质细胞 | 机器学习 | 神经退行性疾病, 脑血管疾病 | 单细胞转录组学 | 不适用 | 文本 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 |
| 136 | 2026-07-15 |
Integration of multi-omics and machine learning to identify core genes in PANoptosisof lung adenocarcinoma and their mechanisms in the tumor microenvironment and therapeutic potential
2026-Jun, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05251-7
PMID:41935997
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研究论文 | 整合多组学和机器学习,鉴定肺腺癌PANoptosis核心基因,并探索它们在肿瘤微环境中的机制及治疗潜力 | 首次系统揭示肺腺癌中M2巨噬细胞为中心的PANoptosis核心基因网络,并阐明人参皂苷通过调控该网络诱导整合性细胞死亡的新机制 | NA | 鉴定肺腺癌PANoptosis核心基因,阐明其在肿瘤微环境中的作用机制及治疗潜力 | 肺腺癌转录组数据集、单细胞转录组数据、免疫细胞浸润分析、人参皂苷干预实验 | 机器学习 | 肺腺癌 | 转录组测序、单细胞转录组测序、分子对接、免疫组化、CCK-8、Western Blot | 113种机器学习算法 | 转录组数据、单细胞转录组数据 | 三个LUAD转录组数据集 | NA | 转录组测序、单细胞转录组测序 | NA | NA |
| 137 | 2026-07-15 |
Integrative multi-omics identifies a diagnostic T cell signature for cutaneous squamous cell carcinoma
2026-Jun, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05272-2
PMID:41935998
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研究论文 | 通过整合多组学数据,鉴定出一组T细胞相关基因特征,用于诊断皮肤鳞状细胞癌并表征其免疫环境 | 利用单细胞RNA测序和批量微阵列数据整合分析,识别出CYBA、S100A2和APOE三个关键基因作为诊断标志物,并揭示了它们与免疫调节的关联 | 未明确说明研究的局限性 | 识别T细胞相关基因特征,以描绘皮肤鳞状细胞癌的免疫环境并辅助分子诊断 | 皮肤鳞状细胞癌患者 | 机器学习 | 皮肤癌 | 单细胞RNA测序, 批量微阵列, RNA-seq, qRT-PCR, 免疫荧光染色 | 机器学习模型, 诊断列线图 | 基因表达数据 | 多个队列,包括训练集和外部验证集 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 138 | 2026-07-15 |
Integrated multi-omics and experimental validation for identifying novel biomarkers of acute myocardial infarction
2026-Jun, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05281-1
PMID:41949600
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研究论文 | 通过整合多组学和实验验证,鉴定急性心肌梗死的新型生物标志物STAT3和DUSP4 | 首次结合单细胞RNA测序、孟德尔随机化和分子对接技术,系统验证了STAT3和DUSP4作为AMI潜在治疗靶点的因果关系 | 实验部分仅限于大鼠和H9C2细胞模型,未在人体心肌组织样本中验证 | 鉴定急性心肌梗死的新型诊断和预后生物标志物 | 急性心肌梗死患者和大鼠模型 | 机器学习 | 心血管疾病 | RNA-seq, scRNA-seq, WGCNA, 孟德尔随机化, qRT-PCR, Western blotting, 分子对接 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 两个独立队列以及单细胞RNA测序的AMI分期样本 | Illumina | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | Illumina NovaSeq | 高通量bulk RNA测序及单细胞RNA测序 |
| 139 | 2026-07-15 |
Network toxicology and single-cell transcriptomics nominate candidate pyrethroid-associated targets and pathways in clear cell renal cell carcinoma
2026-Jun, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05259-z
PMID:41949597
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研究论文 | 整合网络毒理学和单细胞转录组学,识别拟除虫菊酯类杀虫剂在透明细胞肾细胞癌中的潜在靶点和通路 | 首次将网络毒理学、单细胞测序分析和分子对接相结合,系统研究六种常见家用拟除虫菊酯杀虫剂活性成分在透明细胞肾细胞癌发展中的核心靶点和信号通路 | 研究主要基于计算分析和体外实验,缺乏体内模型验证和临床样本的进一步确认 | 阐明拟除虫菊酯类杀虫剂与透明细胞肾细胞癌之间的分子机制 | 六种常见家用拟除虫菊酯杀虫剂活性成分 | 计算机视觉 | 肾细胞癌 | 网络毒理学,单细胞转录组学,分子对接 | 机器学习算法 | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | GSE36895数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 140 | 2026-07-15 |
Multimodal characterisation of spontaneous Merkel cell carcinoma in the endangered Caucasian squirrel (Sciurus anomalus pallescens): integrating spatial transcriptomics, imaging mass cytometry and metagenomic sequencing
2026-Jun, Journal of veterinary research
IF:1.3Q2
DOI:10.2478/jvetres-2026-0034
PMID:42441076
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研究论文 | 通过对濒危高加索松鼠的自发性Merkel细胞癌进行空间转录组学、成像质谱流式细胞术和宏基因组测序综合分析,揭示了肿瘤的分子特征和微环境 | 首次对非家养野生动物自发性Merkel细胞癌进行多模态整合分析,包括空间转录组学和成像质谱流式细胞术的高分辨率肿瘤表征 | 仅基于单个病例,缺乏跨物种比较,且未发现Merkel细胞多瘤病毒证据 | 探讨濒危高加索松鼠自发性Merkel细胞癌的分子和组织学特征 | 一只濒危高加索松鼠(Sciurus anomalus pallescens)的皮肤结节 | 数字病理学 | 皮肤癌(Merkel细胞癌) | 空间转录组学, 成像质谱流式细胞术, 宏基因组测序 | NA | 空间转录组数据, 质谱成像数据, 宏基因组序列 | 1个皮肤结节样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台 |