单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
121	2025-05-23	Swimming induces bone loss via regulating mechanical sensing pathways in bone marrow 2025-Jun, Mechanobiology in medicine DOI:10.1016/j.mbm.2025.100125 PMID:40395774	研究论文	该研究通过建立长期游泳训练模型，探讨了低负荷运动对骨稳态的影响机制	揭示了游泳通过调节骨髓中的机械感应通路（如Integrins和ERK1/2信号通路）诱导骨丢失的新机制	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证	探究低负荷运动（如游泳）对骨稳态的影响机制	小鼠的骨组织和骨髓细胞	骨生物学	骨丢失	单细胞测序、microCT扫描、组织学染色	小鼠长期游泳训练模型	基因表达谱数据、影像数据	未明确说明小鼠数量
122	2025-05-23	Dual cytokine-engineered macrophages rejuvenate the tumor microenvironment and enhance anti-PD-1 therapy in renal cell carcinoma 2025-05-27, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2025.114725 PMID:40294469	研究论文	研究开发了一种双细胞因子工程化的巨噬细胞，用于重编程肾细胞癌的肿瘤微环境并增强抗PD-1疗法的效果	开发了同时递送IL-12和CXCL-9的双细胞因子工程化巨噬细胞，能够重塑肿瘤微环境并显著增强抗PD-1疗法的效果	NA	克服肾细胞癌对抗PD-1疗法的耐药性	肾细胞癌的肿瘤微环境	肿瘤免疫治疗	肾细胞癌	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	NA
123	2025-05-23	ICOS+CD4+ T cells define a high susceptibility to anti-PD-1 therapy-induced lung pathogenesis 2025-May-22, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.186483 PMID:40198121	research paper	该研究探讨了抗PD-1治疗诱导的肺毒性机制，特别是在老年小鼠模型中ICOS+CD4+ T细胞的作用	揭示了ICOS+CD4+ T细胞在抗PD-1治疗诱导的肺毒性中的关键作用，并发现ICOS-ICOSL相互作用的破坏可以减轻这种毒性	研究主要基于小鼠模型，人类数据的验证有限	研究抗PD-1治疗诱导的免疫相关不良事件（irAEs）的细胞机制，特别是在老年个体中	老年小鼠模型和癌症患者的CD4+ T细胞	免疫学	癌症	单细胞转录组学，过继性T细胞转移	小鼠模型	基因表达数据，细胞表型数据	老年小鼠和年轻小鼠，部分癌症患者数据
124	2025-05-23	Shared roles of immune and stromal cells in the pathogenesis of human bronchiolitis obliterans syndrome 2025-May-22, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.176596 PMID:40232854	研究论文	通过单细胞RNA测序技术研究人类闭塞性细支气管炎综合征（BOS）的发病机制，揭示免疫细胞和基质细胞在其中的共同作用	首次在CLAD-BOS和cGVHD-BOS两种形式的BOS中发现CD8+组织驻留记忆T细胞（TRM）的扩增群体，并识别出与巨噬细胞趋化和增殖相关的基因和通路	样本量较小（4例CLAD-BOS患者、3例cGVHD-BOS患者和3例对照）	理解闭塞性细支气管炎综合征（BOS）的疾病机制	人类肺移植后的慢性肺同种异体移植功能障碍BOS（CLAD-BOS）和异基因造血干细胞移植后的慢性移植物抗宿主病BOS（cGVHD-BOS）	生物医学研究	闭塞性细支气管炎综合征	单细胞RNA测序（scRNA-Seq）	NA	RNA测序数据	4例CLAD-BOS患者、3例cGVHD-BOS患者和3例对照
125	2025-05-23	Characterization of a pathogenic nonmigratory fibroblast population in systemic sclerosis skin 2025-May-22, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.185618 PMID:40232859	research paper	本研究鉴定并比较了系统性硬化症（SSc）皮肤中迁移性和非迁移性成纤维细胞的特性及其在疾病不同阶段的作用	首次分离并描述了SSc皮肤中的非迁移性‘常驻’成纤维细胞群体，揭示了其在疾病不同阶段的独特致病特征和治疗靶点潜力	研究主要基于体外实验和有限的样本分析，需要进一步在体实验验证这些发现	探究系统性硬化症皮肤中不同成纤维细胞群体的致病机制及其在疾病进展中的作用	系统性硬化症患者的皮肤成纤维细胞	digital pathology	systemic sclerosis	bulk and single-cell RNA-seq, multichannel immunofluorescence	NA	RNA-seq data, immunofluorescence images	来自系统性硬化症患者皮肤活检的成纤维细胞样本
126	2025-05-23	Bisecting GlcNAc expression by bone marrow stromal cells modulates TGF-β1-driven macrophage polarization in myeloid leukemias 2025-May-22, Haematologica IF:8.2Q1 DOI:10.3324/haematol.2024.287091 PMID:40400458	研究论文	研究骨髓基质细胞中双分N-乙酰葡萄糖胺（GlcNAc）表达如何通过TGF-β1调控髓系白血病中的巨噬细胞极化	揭示了骨髓基质细胞中特定糖链（减少的双分GlcNAc）通过TGFβ1分泌促进M2极化巨噬细胞亚型的机制，并发现这一过程提高了PD-L1表达，从而损害CD8+ T细胞功能	NA	探讨骨髓基质细胞中糖链修饰对髓系白血病肿瘤微环境中巨噬细胞极化的影响	骨髓基质细胞、肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）、CD8+ T细胞	肿瘤免疫学	髓系白血病（AML和MDS）	单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫组织化学	NA	RNA测序数据、流式细胞数据、免疫组织化学数据	NA
127	2025-05-23	Single-Cell and Spatial Transcriptomics Identified Fatty Acid-Binding Proteins Controlling Endothelial Glycolytic and Arterial Programming in Pulmonary Hypertension 2025-May-22, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology DOI:10.1161/ATVBAHA.124.321173 PMID:40401371	research paper	该研究探讨了脂肪酸结合蛋白FABP4和FABP5在肺动脉高压（PAH）发病机制中的作用	首次揭示了FABP4/5通过调控内皮细胞糖酵解和动脉编程促进PAH血管重塑的分子机制	研究主要基于动物模型，人类样本验证仍需进一步扩大	阐明内皮细胞FABP4/5在PAH发病中的分子机制	肺动脉内皮细胞和PAH患者/动物模型	分子病理学	肺动脉高压	单细胞RNA测序、空间转录组分析、RNA-seq	Egln1Tie2Cre小鼠模型	基因表达数据、蛋白质组数据	PAH患者样本和PH大鼠模型
128	2025-05-23	Transcriptional signatures of endothelial cells shape immune responses in cardiopulmonary health and disease 2025-May-22, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.191059 PMID:40401523	review	本文综述了心肺血管系统中内皮细胞（ECs）在健康和疾病状态下的免疫调节功能及其转录特征	揭示了心肺血管系统中内皮细胞亚群的多样性及其在免疫调节中的特殊作用，强调了ECs在疾病发病机制中的关键角色和作为未来治疗靶点的潜力	NA	探讨心肺血管系统中内皮细胞在免疫调节中的作用及其在健康和疾病状态下的转录特征	心肺血管系统中的内皮细胞（ECs）	生物医学	心肺疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	转录组数据	NA
129	2025-05-23	A conserved epilepsy-associated gene co-expression module identifies increased metabolic rate as a shared pathomechanism 2025-May-22, Disease models & mechanisms IF:4.0Q1 DOI:10.1242/dmm.052307 PMID:40401642	研究论文	通过果蝇全脑单细胞RNA测序，研究癫痫相关基因共表达网络，揭示代谢率增加作为癫痫的共同病理机制	利用果蝇单细胞表达数据和行为验证人类基因共表达网络，首次将代谢率增加与癫痫易感性联系起来	研究结果主要基于果蝇模型，需要在人类样本中进一步验证	揭示癫痫的分子机制，特别是代谢与癫痫易感性的关系	果蝇和人类癫痫相关基因	神经科学	癫痫	单细胞RNA测序	果蝇基因敲低模型	RNA测序数据	26个基因的果蝇全脑单细胞RNA测序数据
130	2025-05-23	Single-cell sequencing on PBMCs from HA & HB patients with inhibitors reveals different immune responses to FVIII & FIX 2025-May-22, Blood advances IF:7.4Q1 DOI:10.1182/bloodadvances.2025015799 PMID:40402102	研究论文	通过单细胞测序技术研究血友病A和血友病B患者对FVIII和FIX的不同免疫反应	首次在单细胞水平上比较了HA和HB患者对FVIII和FIX的免疫反应差异，揭示了淋巴细胞亚群组成和功能状态的差异	样本量较小（5例HA和5例HB患者），可能影响结果的普遍性	探索HA和HB患者对FVIII和FIX的不同免疫反应机制	血友病A和血友病B患者的外周血单个核细胞（PBMCs）	单细胞测序	血友病	单细胞测序	NA	单细胞转录组数据	5例HA患者和5例HB患者的PBMCs，共75,051个细胞
131	2025-05-23	Myeloid Cells in Abdominal Aortic Aneurysm 2025-May-22, Current atherosclerosis reports IF:5.7Q1 DOI:10.1007/s11883-025-01302-1 PMID:40402405	review	综述了髓系细胞在腹主动脉瘤(AAA)发病机制中的关键作用及其治疗潜力	单细胞RNA测序揭示了AAA中髓系细胞的多样性，并阐明了不同髓系细胞亚群在疾病中的作用机制	临床转化面临微环境串扰和潜在脱靶效应的挑战	探讨髓系细胞在腹主动脉瘤发病机制中的作用及治疗靶向潜力	腹主动脉瘤中的髓系细胞	血管生物学	腹主动脉瘤	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	NA
132	2025-05-23	Mechanism of Initial Favorable Response to Decitabine in TP53-Mutated MDS/AML and Potential Mechanisms of Subsequent Relapse 2025-May-21, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1 DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-3192 PMID:40397797	研究论文	该研究探讨了TP53突变型MDS/AML患者对地西他滨初始治疗反应及后续复发的潜在机制	整合了靶向骨髓组测序、纳米孔DNA甲基化测序和单细胞转录组学分析，揭示了白血病与免疫细胞群之间的动态变化	样本量有限，且为单中心研究	阐明TP53突变型MDS/AML患者对地西他滨治疗反应及复发的分子机制	骨髓增生异常综合征(MDS)和急性髓系白血病(AML)患者	血液肿瘤学	骨髓增生异常综合征/急性髓系白血病	靶向骨髓组测序、纳米孔DNA甲基化测序、单细胞转录组学	NA	基因组数据、转录组数据	II期临床试验中的系列患者样本
133	2025-05-23	Exploring the untapped potential of single-cell and spatial omics in plant biology 2025-May-21, The New phytologist DOI:10.1111/nph.70220 PMID:40398874	综述	本文探讨了单细胞和空间组学技术在植物生物学中的未开发潜力及其当前应用	强调了单细胞和空间组学技术在植物生物学中的创新应用，包括多组学、谱系追踪、分子记录和高通量遗传与化学扰动表型分析等新兴技术	植物特有的技术挑战和资源限制，如细胞壁复杂性和抗体资源有限，以及需要更完整的参考图谱和计算工具	探索单细胞和空间组学技术在植物生物学中的应用潜力，推动植物科学的发展	植物细胞和组织	植物生物学	NA	单细胞转录组分析、染色质可及性分析、空间转录组学、多组学、谱系追踪、分子记录、高通量遗传与化学扰动表型分析	NA	分子和细胞数据	多个模型植物物种的综合细胞图谱
134	2025-05-23	Gain-of-function PPM1D mutations attenuate ischemic stroke 2025-May-21, Cell death and differentiation IF:13.7Q1 DOI:10.1038/s41418-025-01523-6 PMID:40399534	研究论文	研究发现PPM1D基因的功能获得性突变可以减轻缺血性脑损伤，并验证了其药物稳定剂T2755作为缺血性中风的有前景疗法	首次发现PPM1D基因的功能获得性突变与缺血性中风患者的临床表型改善相关，并揭示了PPM1D通过PPARα途径保护内皮细胞功能的机制	研究中仅发现8例携带PPM1D突变的患者，样本量较小	探索缺血性中风的遗传基础及潜在治疗靶点	10,241名缺血性中风患者和Ppm1d缺陷小鼠	遗传学	缺血性中风	全基因组测序、空间转录组学、蛋白质组学分析	Ppm1d缺陷小鼠模型	基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据	10,241名缺血性中风患者（其中8例携带PPM1D突变）和Ppm1d缺陷小鼠
135	2025-05-23	A single-cell spatial chart of the airway wall reveals proinflammatory cellular ecosystems and their interactions in health and asthma 2025-May-21, Nature immunology IF:27.7Q1 DOI:10.1038/s41590-025-02161-3 PMID:40399607	研究论文	应用单细胞空间转录组学揭示健康和哮喘状态下气道壁的细胞生态系统及其相互作用	首次绘制了气道壁的单细胞空间图谱，揭示了健康和哮喘中促炎性细胞生态系统的空间分布及其相互作用	未提及样本量是否足够大以覆盖所有哮喘亚型	揭示气道壁在健康和哮喘状态下的细胞空间分布及其相互作用机制	健康和哮喘患者的气道壁细胞	单细胞组学	哮喘	单细胞空间转录组学	NA	单细胞转录组数据	NA
136	2025-05-23	Multigenerational cell tracking of DNA replication and heritable DNA damage 2025-May-21, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-025-08986-0 PMID:40399682	research paper	该研究通过多代单细胞追踪技术，结合内源性标记蛋白和定制计算工具，探讨了致癌扰动如何诱导姐妹细胞不对称和表型异质性	使用双CRISPR基因组编辑同时追踪DNA复制模式和可遗传的内源性DNA损伤，结合单细胞转录组学揭示了致癌事件如何触发多倍体化的多种途径	研究仅追踪了最多四代的细胞谱系树，可能无法完全反映长期细胞异质性的发展过程	解析细胞异质性的来源及其在多代细胞中的传递机制	异步生长的细胞及其多代谱系	基因组学	癌症	双CRISPR基因组编辑、单细胞转录组学、迭代染色	NA	基因组数据、转录组数据	异步生长的细胞谱系树（最多四代）
137	2025-05-23	A multi-kingdom genetic barcoding system for precise clone isolation 2025-May-21, Nature biotechnology IF:33.1Q1 DOI:10.1038/s41587-025-02649-1 PMID:40399693	research paper	介绍了一种名为CloneSelect的多界遗传条形码系统，用于从复杂细胞群中精确分离目标克隆	开发了一种通过CRISPR碱基编辑触发目标克隆表达报告基因的新方法，实现了对特定表型或基因型克隆的精确分离	未提及具体的技术限制或应用范围限制	开发一种能够从复杂细胞群中精确分离目标克隆的技术	人类胚胎肾293T细胞、小鼠胚胎干细胞、人类多能干细胞、酵母细胞和细菌细胞	基因编辑技术	NA	CRISPR base editing, single-cell RNA sequencing	NA	基因序列数据	多种细胞类型（人类胚胎肾293T细胞、小鼠胚胎干细胞、人类多能干细胞、酵母细胞和细菌细胞）
138	2025-05-23	Unveiling the hidden dance: SPP1 + macrophages identified in ulcerative colitis reveal crosstalk with CHI3L1 + fibroblasts 2025-May-21, Journal of translational medicine IF:6.1Q1 DOI:10.1186/s12967-025-06565-5 PMID:40399882	research paper	该研究通过单细胞RNA测序技术揭示了溃疡性结肠炎中SPP1+巨噬细胞和CHI3L1+成纤维细胞的关键作用及其在疾病进展中的互作机制	首次鉴定出SPP1+巨噬细胞和CHI3L1+成纤维细胞作为溃疡性结肠炎的关键致病因素，并揭示其在炎症部位富集与疾病严重程度的相关性	研究样本量有限，且主要依赖生物信息学分析，需要更多实验验证	探索巨噬细胞和成纤维细胞在溃疡性结肠炎发病机制中的具体作用及其互作关系	溃疡性结肠炎患者的巨噬细胞和成纤维细胞	digital pathology	ulcerative colitis	scRNA-seq, bulk RNA-seq, spatial transcriptomics, flow cytometry, mIHC	NA	RNA-seq数据、空间转录组数据、流式细胞术数据、多重免疫组化数据	UC患者外周血和结肠活检样本（具体数量未明确说明）
139	2025-05-23	Long noncoding RNAs in familial hypercholesterolemia: biomarkers, therapeutics, and AI in precision medicine 2025-May-21, Lipids in health and disease IF:3.9Q2 DOI:10.1186/s12944-025-02605-7 PMID:40399983	综述	本文综述了长链非编码RNA（lncRNA）在家族性高胆固醇血症（FH）中的机制作用及其作为非侵入性生物标志物和治疗靶点的潜力	探讨了lncRNA作为FH的新型生物标志物和治疗靶点，以及AI驱动的lncRNA发现和单细胞转录组学在精准医疗中的应用	生物标志物验证、RNA递送效率和监管批准等挑战仍需解决	研究lncRNA在FH发病机制中的作用及其在精准医疗中的应用	家族性高胆固醇血症（FH）患者	精准医疗	心血管疾病	单细胞转录组学、RNA测序	NA	转录组数据	NA
140	2025-05-23	Controlling Human Stem Cell-Derived Islet Composition Using Magnetic Sorting 2025-May-21, Biotechnology and bioengineering IF:3.5Q2 DOI:10.1002/bit.29030 PMID:40400171	research paper	该研究开发了一种通过磁激活细胞分选技术富集干细胞来源胰岛中功能性β细胞的方法，以提高其治疗1型糖尿病的潜力	首次使用CD49a标记的磁激活细胞分选技术控制干细胞来源胰岛的细胞组成，显著提高了β细胞比例和功能	研究仅在小鼠模型中进行体内验证，尚未进行人体临床试验	改善干细胞来源胰岛的细胞组成和功能，用于1型糖尿病细胞替代治疗	人类多能干细胞来源的胰岛样细胞团	干细胞治疗	1型糖尿病	磁激活细胞分选技术、单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	基因表达数据、免疫染色图像	人类多能干细胞来源的胰岛样细胞团(包括CD49a富集、CD49a缺失和未分选三组)