单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
121	2025-07-17	Foxn3 is required to suppress aberrant ciliogenesis in nonphotoreceptor retinal neurons 2025-Jul-22, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2500871122 PMID:40663603	研究论文	本研究探讨了转录因子Foxn3在视网膜非感光神经元中抑制异常纤毛生成的作用	揭示了Foxn3作为关键转录抑制因子，通过直接结合并抑制纤毛基因及其转录激活因子的启动子，维持视网膜神经元纤毛结构的正确性	未明确Foxn3在人类视网膜疾病中的具体作用机制	探究Foxn3在视网膜神经元纤毛结构分化中的调控机制	视网膜非感光神经元（如双极细胞和无长突细胞）	分子生物学	视网膜疾病	条件性基因敲除、单细胞RNA测序、染色质分析、转录检测	Foxn3条件性敲除小鼠模型	基因表达数据、电生理数据	Foxn3条件性敲除小鼠
122	2025-07-17	Research advances in intramuscular fat deposition and chicken meat quality: genetics and nutrition 2025-Jul-16, Journal of animal science and biotechnology IF:6.3Q1 DOI:10.1186/s40104-025-01234-5 PMID:40665461	综述	本文综述了过去十年中关于遗传和营养基础如何调控鸡肉肌内脂肪沉积和肉质的研究进展	单细胞RNA测序揭示了肌细胞是肌内脂肪形成的主要场所，LncHLFF通过外泌体介导机制促进肌内脂肪沉积而不影响腹部脂肪沉积，miR-27b-3p和miR-128-3p通过靶向PPARG抑制脂肪生成分化	NA	改善鸡肉品质	肉鸡	动物科学	NA	单细胞RNA测序	NA	NA	NA
123	2025-07-17	PIEZO1 Overexpression in Hereditary Hemorrhagic Telangiectasia Arteriovenous Malformations 2025-Jul-16, Circulation IF:35.5Q1 DOI:10.1161/CIRCULATIONAHA.124.073630 PMID:40665909	研究论文	本研究探讨了PIEZO1在遗传性出血性毛细血管扩张症动静脉畸形中的过度表达及其作用机制	发现PIEZO1在2型遗传性出血性毛细血管扩张症中的表达和信号传导升高，并证明PIEZO1阻断可减少AVM形成	研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限	探索ALK1变异导致的信号改变及寻找更有效的AVM形成抑制剂	Alk1敲除小鼠视网膜内皮细胞和人类2型遗传性出血性毛细血管扩张症病变	血管生物学	遗传性出血性毛细血管扩张症	单细胞RNA测序	Alk1敲除小鼠模型	RNA测序数据	未明确说明样本数量
124	2025-07-17	Rewriting the dendritic cell code in cancer-from subset identity to immunotherapeutic design 2025-Jul-16, FEBS letters IF:3.0Q3 DOI:10.1002/1873-3468.70108 PMID:40667699	综述	本文综述了树突状细胞（DCs）在抗肿瘤免疫中的核心作用，探讨了不同DC亚群的发育路径和功能特性，以及肿瘤微环境（TME）如何动态重编程这些细胞	整合了空间转录组学和单细胞研究的最新发现，揭示了关键的DC-T细胞生态位，并评估了当前和新兴的治疗策略	未提及具体实验数据或样本量，主要基于现有研究的综述	探讨树突状细胞在肿瘤免疫中的作用及其治疗潜力	树突状细胞亚群（如cDC1、cDC2、pDCs、DC3s、tDCs、moDCs和RORγt抗原呈递细胞）及其与肿瘤微环境的相互作用	肿瘤免疫学	癌症	空间转录组学、单细胞研究	NA	NA	NA
125	2025-07-17	Leptin Aggravates Thoracic Aortic Dissection Through Impairment of Energy Metabolism in Nrip2+ Smooth Muscle Cells 2025-Jul-16, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202502027 PMID:40667784	研究论文	研究探讨了肥胖激素瘦素在胸主动脉夹层（TAD）中的作用及其通过影响血管平滑肌细胞（VSMCs）能量代谢加剧疾病的机制	发现了一种新型平滑肌细胞簇Nrip2，并揭示了其在抑制瘦素诱导的表型转换和增强线粒体能量代谢中的作用	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证	探究瘦素如何通过影响血管平滑肌细胞的能量代谢加剧胸主动脉夹层的发病机制	瘦素、血管平滑肌细胞（VSMCs）、Nrip2平滑肌细胞簇	心血管疾病	胸主动脉夹层	单细胞RNA测序	瘦素敲除小鼠模型	基因表达数据	NA
126	2025-07-17	Single-cell RNA sequencing in human atherosclerotic plaques reveals a novel smooth muscle cell subtype that possesses multi differentiation potential and shapes the microenvironment 2025-Jul-16, Clinical and experimental medicine IF:3.2Q2 DOI:10.1007/s10238-025-01735-7 PMID:40668312	研究论文	通过单细胞RNA测序技术，研究人类动脉粥样硬化斑块中的平滑肌细胞亚型，发现了一种新型平滑肌细胞亚型SMC_C5，具有多向分化潜能并影响微环境	首次在人类冠状动脉斑块中鉴定出独特的平滑肌细胞亚型SMC_C5，并揭示了其与转录因子GABP1的关联及其在代谢、缺氧反应和免疫微环境调控中的作用	研究主要基于ApoE小鼠模型验证，人类样本的验证可能不足	探究动脉粥样硬化斑块中平滑肌细胞亚型的异质性及其在疾病中的作用	人类冠状动脉斑块和平滑肌细胞亚型	数字病理学	心血管疾病	单细胞RNA测序(scRNA-seq), bulk RNA测序, 生物信息学分析, pySCENIC	NA	RNA测序数据	整合了三个单细胞RNA测序数据集，并使用ApoE小鼠的动脉粥样硬化斑块进行验证
127	2025-07-17	Chemotaxis overrides the killing response in alloreactive CTLs, providing vascular immune privilege during cellular rejection 2025-Jul-15, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1 DOI:10.1172/JCI155191 PMID:40435228	研究论文	本文探讨了同种异体反应性细胞毒性T淋巴细胞（CTLs）在细胞排斥过程中通过趋化作用避免对移植血管内皮细胞的杀伤，从而维持血管免疫特权的机制	挑战了传统的细胞内在免疫特权观点，提出了一种细胞外在机制，即趋化作用在T细胞介导的排斥反应中保护移植血管	研究主要基于小鼠模型和人类肾移植样本，可能不适用于所有类型的移植或病理条件	揭示移植血管在T细胞介导的排斥反应中免受攻击的机制	移植内皮细胞（ECs）和细胞毒性T淋巴细胞（CTLs）	免疫学	移植排斥	转录组学分析、内皮-间质转化评估、共培养实验、活体显微镜检查、单细胞RNA-Seq	NA	转录组数据、显微镜图像、单细胞RNA-Seq数据	小鼠肾移植模型和人类肾移植样本
128	2025-07-17	The acute myeloid leukemia microenvironment impairs neutrophil maturation and function through NFκB signaling 2025-Jul-15, Blood IF:21.0Q1 DOI:10.1182/blood.2024028199 PMID:40663784	研究论文	本研究探讨急性髓系白血病（AML）微环境如何通过NFκB信号通路损害中性粒细胞的成熟和功能	揭示了AML微环境通过NFκB信号通路导致中性粒细胞功能受损和免疫抑制的新机制	研究主要基于小鼠模型，人类AML患者的验证数据有限	探究AML对健康造血系统特别是中性粒细胞功能的影响	AML微环境中的中性粒细胞	血液肿瘤学	急性髓系白血病	单细胞转录组学、细胞因子筛选、染色质重塑分析	AML小鼠模型	基因表达数据、蛋白质表达数据	小鼠模型和AML患者样本（具体数量未明确说明）
129	2025-07-17	Disruption of cell-intrinsic PCSK9 enhances the antitumor efficacy of CD8+ T cells 2025-Jul-15, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1 DOI:10.1136/jitc-2025-011657 PMID:40664445	研究论文	探讨细胞固有PCSK9对CD8+ T细胞抗肿瘤功效的影响	首次揭示PCSK9在CD8+ T细胞中的抑制作用，并证明其缺失可增强抗肿瘤效果	研究主要基于小鼠模型，人类临床应用的转化效果尚待验证	研究PCSK9在肿瘤免疫治疗中的作用机制	胰腺癌和黑色素瘤模型中的CD8+ T细胞	肿瘤免疫学	胰腺癌, 黑色素瘤	单细胞RNA测序, 流式细胞术	小鼠肿瘤模型, CAR-T细胞模型	基因表达数据, 细胞表型数据	Pcsk9缺陷小鼠模型和体外培养的T细胞
130	2025-07-17	Targeting HK3 in tumor-associated macrophages enhances antitumor immunity through augmenting antigen cross-presentation in cervical cancer 2025-Jul-15, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1 DOI:10.1136/jitc-2025-011948 PMID:40664447	研究论文	本研究探讨了靶向肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）中的HK3如何通过增强抗原交叉呈递来增强抗肿瘤免疫，特别是在宫颈癌中	揭示了HK3在TAMs与CD8+ T细胞之间的交叉调控中的核心作用，并提出了HK3抑制作为一种新的免疫治疗策略	研究主要基于临床前模型，尚未在人体临床试验中验证其效果	探索HK3在宫颈癌肿瘤微环境中的作用及其作为免疫治疗靶点的潜力	宫颈癌患者样本和临床前肿瘤模型	肿瘤免疫学	宫颈癌	单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫共沉淀、共聚焦显微镜成像	NA	RNA测序数据、流式细胞数据、显微镜图像	119名宫颈癌患者样本及临床前肿瘤模型
131	2025-07-17	Endocrine Resistance Score Based on Three Key Genes Predicts Prognosis and Reveals Potential Therapeutic Targets for ER+HER2- Breast Cancer 2025-Jul-15, Cell proliferation IF:5.9Q2 DOI:10.1111/cpr.70100 PMID:40664624	研究论文	本研究通过构建内分泌抗性细胞系和转录组分析，鉴定了三个关键基因CLEC3A、PCDH10和ST3GAL1，并开发了内分泌抗性评分（ERS）来预测ER+HER2-乳腺癌患者的预后	首次发现CLEC3A、PCDH10和ST3GAL1三个基因与内分泌抗性相关，并构建了ERS评分系统，为ER+HER2-乳腺癌提供了新的预后指标和治疗靶点	研究主要基于细胞系和小样本组织，尚未进行大规模临床验证	探索ER+HER2-乳腺癌内分泌抗性的分子机制并寻找预后标志物和治疗靶点	ER+HER2-乳腺癌细胞系和患者组织样本	肿瘤学	乳腺癌	转录组分析、单细胞RNA测序、Cox回归分析	nomogram模型	RNA-seq数据	内分泌抗性细胞系和患者组织样本（具体数量未明确说明）
132	2025-07-17	High-resolution mapping of single cells in spatial context 2025-Jul-15, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-025-61667-4 PMID:40664667	研究论文	开发了一种名为CMAP的方法，通过整合单细胞和空间数据，高效地将大规模单个细胞映射到其精确的空间位置	提出了一种新的方法CMAP，能够有效解决单细胞和空间转录组数据之间的不一致性问题，并为单细胞赋予精确的空间坐标	未提及具体的样本量或数据集的详细限制	开发一种高效的方法来映射单细胞到其空间位置，以解析组织微环境中的分子调控和细胞相互作用	单细胞和空间转录组数据	空间转录组学	癌症	单细胞测序和空间转录组技术	NA	单细胞和空间转录组数据	NA
133	2025-07-17	A pluripotent stem cell atlas of multilineage differentiation 2025-Jul-15, Scientific data IF:5.8Q1 DOI:10.1038/s41597-025-05549-w PMID:40664685	研究论文	该研究通过单细胞RNA测序时间序列，探索了多能干细胞在体外多谱系分化中的基因表达变化和发育信号通路作用	构建了一个包含超过60,000个细胞的单细胞转录组图谱，覆盖从原肠胚形成状态到祖细胞和定型细胞类型的全胚层分化过程	研究仅基于体外分化系统，可能与体内发育存在差异	揭示多能干细胞体外分化过程中的基因表达调控机制	人类多能干细胞及其分化产生的多谱系细胞	干细胞生物学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	超过60,000个细胞
134	2025-07-17	Mapping trait-associated cells with spatial transcriptomics 2025-Jul-15, Nature reviews. Genetics DOI:10.1038/s41576-025-00877-4 PMID:40664743	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
135	2025-07-17	Exploring the mechanism of metabolic cell death-related genes AKR1C2 and MAP1LC3A as biomarkers in Parkinson's disease 2025-Jul-15, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-11481-1 PMID:40664780	研究论文	本研究探讨了代谢细胞死亡相关基因AKR1C2和MAP1LC3A作为帕金森病生物标志物的机制	首次将代谢细胞死亡相关基因与帕金森病发病机制联系起来，并鉴定了AKR1C2和MAP1LC3A作为潜在生物标志物	研究结果需要进一步的实验验证，样本来源和数量未明确说明	探索代谢细胞死亡相关基因在帕金森病中的作用机制	帕金森病患者和代谢细胞死亡相关基因	生物信息学	帕金森病	单细胞RNA测序、蛋白质互作网络分析、机器学习	机器学习	基因表达数据	NA
136	2025-07-17	A novel cancer-associated membrane signature predicts prognosis and therapeutic response for lung adenocarcinoma 2025-Jul-15, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-11105-8 PMID:40664871	研究论文	本文通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和批量RNA测序数据，识别了肺腺癌特异性膜蛋白，并构建了一个预后标志物LCaMPS，用于预测患者预后和治疗反应	首次在单细胞和空间分辨率水平上揭示了肺腺癌膜表达模式的重要性，并开发了一个基于9个膜基因的预后模型LCaMPS	研究依赖于现有数据集，需要进一步实验验证膜蛋白的生物学功能和临床适用性	开发可靠的生物标志物以预测肺腺癌患者的预后和治疗反应	肺腺癌患者和肿瘤微环境	数字病理学	肺癌	scRNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq	预后预测模型	RNA测序数据	多个肺腺癌队列数据集
137	2025-07-17	Deciphering cancer therapy resistance via patient-level single-cell transcriptomics with CellResDB 2025-Jul-15, Communications biology IF:5.2Q1 DOI:10.1038/s42003-025-08457-2 PMID:40664938	研究论文	介绍了一个名为CellResDB的患者来源平台，用于研究癌症治疗耐药性的潜在机制	提供了首个结合患者水平单细胞转录组学和全面肿瘤微环境特征注释的平台，并集成了智能机器人CellResDB-Robot以增强数据可访问性	未提及具体的技术验证或临床应用效果的局限性	解决癌症治疗耐药性研究的资源不足问题，深入探索肿瘤微环境在治疗耐药性中的动态变化	1391名患者的近470万个细胞，涵盖24种癌症类型	数字病理学	癌症	单细胞转录组学	LLM（大语言模型）	单细胞RNA-seq数据	1391名患者的近470万个细胞
138	2025-07-17	Unraveling the role of gut microbiota on the formation of nephrolithiasis: insights from integrated analysis of GWAS, single-cell transcriptomics, bulk RNA sequencing and network Pharmacology 2025-Jul-15, Urolithiasis IF:2.0Q2 DOI:10.1007/s00240-025-01809-x PMID:40664942	研究论文	本研究通过整合GWAS、单细胞转录组学、批量RNA测序和网络药理学分析，探讨了肠道微生物群（GM）与肾结石形成的关键基因分子机制	首次通过Mendelian随机化等方法确定了35种与肾结石有因果关系的GM，并鉴定出PALLD和R3HDM1作为关键基因，同时发现了这些基因在成纤维细胞和血管平滑肌细胞/周细胞分化过程中的非线性变化特征	研究依赖于公共数据库的数据，可能受到样本来源和数量的限制	探索肠道微生物群在肾结石形成中的分子机制	肠道微生物群和肾结石相关基因	生物信息学	肾结石	GWAS, 单细胞转录组学, RNA测序, 网络药理学, Mendelian随机化	NA	基因组数据, 转录组数据	来自公共数据库的GWAS数据(ukb-b-18372)、GM数据、GSE73680、GSE117518和GSE231569数据集
139	2025-07-17	Human myelocyte and metamyelocyte-stage neutrophils suppress tumor immunity and promote cancer progression 2025-Jul-15, Cell research IF:28.1Q1 DOI:10.1038/s41422-025-01145-0 PMID:40664963	research paper	该研究揭示了人类髓细胞和晚幼粒细胞阶段中性粒细胞在肿瘤免疫微环境中的免疫抑制和促癌作用	首次将人类和小鼠中性粒细胞按发育阶段分为三类，并发现MC & MM阶段中性粒细胞在骨髓中占主导且具有强免疫抑制和促癌特性	研究主要基于NCG-Gfi1 HIS小鼠模型，人类患者样本验证仍需进一步研究	探索肿瘤浸润中性粒细胞(TINs)的异质性及其在癌症进展中的作用	人类和小鼠的中性粒细胞	肿瘤免疫学	癌症	单细胞RNA测序分析	NCG-Gfi1 HIS小鼠模型	基因表达数据	17种癌症类型的患者样本
140	2025-07-17	In silico analysis of the oncogenic role of myoferlin (MYOF) and suggestion of folate as a potential therapeutic for brain cancer in the Caucasian population 2025-Jul-15, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-03091-0 PMID:40665025	研究论文	通过生物信息学分析探讨肌铁蛋白（MYOF）在脑癌中的致癌作用，并提出叶酸作为潜在治疗药物	首次通过计算药物发现和生成人工智能实验，结合空间转录组学，研究叶酸在MYOF敲低中的治疗潜力	研究主要针对高加索人群，可能不适用于其他种族	探讨MYOF在脑癌发生发展中的作用及其作为治疗靶点的潜力	肌铁蛋白（MYOF）及其在脑癌中的表达、突变和相互作用基因	生物信息学	脑癌	计算药物发现、空间转录组学、生成人工智能	NA	基因表达数据、突变数据	NA