本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2026-06-10 |
A Novel Low-Dimensional Sparse and Low-Rank Representation Method for Single-Cell RNA Sequencing Data Clustering
2026 May-Jun, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3674992
PMID:41843533
|
研究论文 | 提出一种名为LDSLRR的低维稀疏低秩表示方法,用于单细胞RNA测序数据聚类 | 创新性地将降维、自表示矩阵构建和聚类过程整合为端到端模型,并同时优化三个模块以提高聚类精度 | 未明确说明限制,可能涉及高维稀疏数据处理的泛化性或计算复杂度 | 解决单细胞RNA测序数据中高维稀疏性导致的聚类精度问题 | 单细胞RNA测序数据中的细胞聚类 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | LDSLRR(低维稀疏低秩表示)、图正则化非负矩阵分解(NMF) | 基因表达矩阵 | 多个scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 122 | 2026-06-10 |
DyGFormer:Transformer With Resistance-Distance Bias for Semi-Supervised Cell-Type Identification
2026 May-Jun, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3676606
PMID:41870934
|
研究论文 | 提出一种名为DyGFormer的半监督模型,通过基于电阻距离的Transformer偏置和自注意力机制,联合建模转录相似性和组织结构,实现单细胞空间转录组学数据的准确细胞类型识别 | 创新性在于将电阻距离的相对位置偏置引入Transformer,设计邻域交互历史编码器稳定跨层交互,并采用三元组引导的度量监督在小标注子集上提升类别可分性 | 未明确讨论模型在跨平台异质性或极端稀疏标注场景下的鲁棒性,以及计算复杂度对大型数据集的可扩展性 | 开发一种半监督细胞类型分类模型,应对单细胞空间转录组数据中的测序噪声、平台异质性和标注限制等挑战 | 来自不同组织和平台的多个单细胞分辨率空间数据集(如NanoString/CosMx和MERFISH) | 机器学习 | 癌症 | 单细胞空间转录组学 | Transformer | 单细胞空间转录组数据 | 多个单细胞分辨率空间数据集,具体样本量未说明 | NA | 空间转录组学 | NanoString CosMx, MERFISH | NA |
| 123 | 2026-06-10 |
Multi-Omics Graph Attention Network for Key Gene Prediction in Triple-Negative Breast Cancer
2026 May-Jun, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3682485
PMID:41955157
|
研究论文 | 提出基于图注意力网络的多模态框架,整合单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序和影像组学数据,用于预测三阴性乳腺癌关键基因 | 首次将图注意力网络与多模态数据(转录组、染色质可及性和影像组学)融合,通过典型相关分析对齐特征,并利用转录因子结合引导边和细胞间通讯关系构建多模态图,实现了对三阴性乳腺癌异质性的跨模态调控交互捕捉 | 未在本文中明确提及局限性,但可能包括依赖外部验证集、计算资源需求高或特征选择偏倚等潜在问题 | 开发可解释的多模态生物标志物发现框架,以识别三阴性乳腺癌的关键基因和潜在治疗靶点 | 三阴性乳腺癌患者的单细胞转录组、单细胞染色质可及性和影像组学数据 | 机器学习 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、影像组学 | 图注意力网络、集成多层感知器 | 转录组数据、染色质可及性数据、影像数据 | 外部TCGA-TNBC队列 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 124 | 2026-06-10 |
Epidermal MHC-II-mediated NK cell recruitment triggers keratinocyte pyroptosis, facilitating pathogenesis of psoriasis
2026-May, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-026-01717-z
PMID:42104015
|
研究论文 | 本文研究了表皮MHC-II介导的NK细胞招募诱导角质形成细胞焦亡在银屑病发病机制中的作用 | 首次揭示表皮MHC-II通过ERK-CREB轴调控CXCL10招募NK细胞,以及NK细胞释放颗粒酶B引发GSDME阳性角质形成细胞焦亡的新机制 | 本研究主要基于小鼠模型和体外实验,未在人体样本中进行全面验证,且对MHC-II调控角质形成细胞-免疫细胞相互作用的分子机制解析尚不够深入 | 探讨银屑病发病中角质形成细胞如何招募自然杀伤细胞以及NK细胞参与炎症反应的机制 | 银屑病患者的皮肤病变组织和小鼠银屑病样皮炎模型 | 数字病理学 | 银屑病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 未在摘要中明确说明样本量的具体数字 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 125 | 2026-06-10 |
MeCP2 regulates cell-type-specific functions of depressive-like symptoms in the nucleus accumbens
2026-May, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-026-01721-3
PMID:42120477
|
研究论文 | 本研究利用慢性束缚应激模型,揭示了MeCP2在伏隔核多巴胺D2受体神经元中的细胞类型特异性功能,及其在抑郁样症状调节中的作用 | 首次发现慢性束缚应激选择性降低伏隔核D2R神经元中的MeCP2蛋白,并通过细胞类型特异性MeCP2恢复实验证明其可减轻应激诱导的抑郁样表型及伴随的回路/转录组特征 | 腹侧苍白球的下游分子特征未解决投射特异性问题,且未进行全脑范围的分析 | 探究MeCP2在伏隔核D2R神经元中的细胞类型特异性功能及其在应激反应和抑郁中的作用机制 | 小鼠伏隔核中的D2R表达中等棘状神经元,以及腹侧苍白球区域 | 分子神经科学 | 抑郁症 | 慢性束缚应激模型、脑片电生理记录、光遗传学刺激、GeoMx数字空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 慢性束缚应激模型小鼠,具体样本数未在摘要中提及 | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiler | GeoMx数字空间转录组学用于病毒标记的NAc D2R神经元的细胞类型解析 |
| 126 | 2026-06-10 |
LoHi-SSL: A Multi-Level Synergistic Learning Model for Integrating Single-Cell Multi-Omics Data via Low- and High-Order Information Fusion
2026 May-Jun, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3672503
PMID:41805524
|
研究论文 | 提出一种多层级协同学习模型LoHi-SSL,通过低阶和高阶信息融合实现单细胞多组学数据高效整合 | 首次将低阶信息(图自编码器保留组学内细胞相似性)与高阶信息(超图学习捕获跨组学复杂关系)结合,并利用对比学习增强细胞分辨能力 | 未提及对大规模数据集的计算效率或超大规模细胞图谱的适用性 | 开发单细胞多组学数据整合方法以解析细胞异质性和状态转变 | 单细胞多组学数据(如不同分子层的数据集) | 机器学习 | NA | 单细胞多组学测序 | 图自编码器、超图学习、对比学习 | 单细胞多组学数据 | 6个公开数据集 | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 127 | 2026-06-10 |
DGAE: Dynamic Graph Convolutional Network for Multi-Slice Spatial Transcriptomics Alignment and Enhancement
2026 May-Jun, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3682296
PMID:41950130
|
研究论文 | 提出基于动态图卷积网络的多切片空间转录组学对齐与增强框架DGAE | 利用动态图卷积网络自适应更新图结构,结合K近邻和r半径构建混合图,实现多切片空间数据精确对齐与信息增强 | 未提及计算开销或对大规模数据集的适用性限制 | 开发一种多切片空间转录组学数据对齐与增强方法 | 多切片空间转录组学数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 动态图卷积神经网络(DGCNN) | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 128 | 2026-06-10 |
Robust Algorithm With Contrastive Learning for Identifying Spatial Domains From Noised Spatial Transcriptomics Data
2026 May-Jun, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3683521
PMID:42247557
|
研究论文 | 提出了一种名为jNFACL的鲁棒联合框架,用于从含噪声的空间转录组数据中识别空间域,同时进行去噪和域识别 | 通过联合网络特征-亲和度对比学习框架,将去噪与空间域识别集成在一个端到端过程中,无需单独预处理步骤;采用非负矩阵分解从特征层面分离噪声,并利用对比学习增强斑点特征质量 | 未明确讨论超参数敏感性及对不同噪声分布类型的适应性 | 开发一种鲁棒方法,直接从含噪声的空间转录组数据中识别空间域,克服现有预处理方法的性能限制 | 空间转录组数据中的组织斑点(spots)及其表达和空间坐标信息 | 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 对比学习与非负矩阵分解结合的联合网络框架 | 空间转录组数据 | 来自多个平台和物种的不同噪声水平的多个数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 129 | 2026-06-10 |
ZBP1 Drives CD8+ T cell-mediated anti-tumor immunity in head and neck squamous cell carcinoma
2026-May, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1012107
PMID:42189863
|
研究论文 | 揭示ZBP1在头颈部鳞状细胞癌中驱动CD8+ T细胞介导的抗肿瘤免疫,重建免疫抑制性肿瘤微环境 | 首次鉴定ZBP1作为关键免疫调节因子,通过趋化因子信号网络和代谢重编程双重调控淋巴细胞募集与髓系抑制,将“冷”肿瘤转化为免疫活性微环境 | NA | 研究ZBP1在头颈部鳞状细胞癌免疫微环境重塑中的作用及其机制 | 头颈部鳞状细胞癌肿瘤样本及SCC-7/MOC2小鼠模型 | 机器学习和计算生物学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞转录组测序、多重免疫荧光、流式细胞术、多模型验证 | NA | 转录组数据(TCGA/SangerBox)、单细胞转录组数据、多重免疫荧光图像、流式细胞术数据 | 92例头颈部鳞状细胞癌组织标本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 130 | 2026-06-10 |
Prenatal exposure to polystyrene nanoplastics impairs offspring fertility in mice by disrupting meiotic recombination and chromatin accessibility in oocytes
2026-Apr-28, Archives of toxicology
IF:4.8Q1
DOI:10.1007/s00204-026-04371-6
PMID:42047698
|
研究论文 | 研究产前暴露于聚苯乙烯纳米塑料如何通过破坏卵母细胞的减数分裂重组和染色质可及性来损害小鼠后代的生育能力 | 首次揭示了环境纳米塑料通过表观遗传机制(特别是染色质重塑)损害减数分裂完整性的新机制 | 基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类;仅关注雌性后代,未涵盖雄性影响 | 阐明产前聚苯乙烯纳米塑料暴露对雌性后代生育能力的跨代影响及其分子机制 | 雌性小鼠后代的卵母细胞 | 数字病理学 | 生殖系统疾病 | 单细胞转录组测序、单细胞ATAC测序、功能细胞测定 | NA | 文本 | 小鼠模型,具体样本量未在标题和摘要中提及 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 131 | 2026-06-10 |
Depletion of macrophages during early postnatal development leads to disrupted tooth root development and altered Gli1⁺ MSC trajectory
2026-Apr-26, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08753-7
PMID:42036413
|
研究论文 | 本研究揭示了巨噬细胞在出生后牙齿根部发育中的关键作用,通过免疫-间充质相互作用调控Gli1⁺间充质干细胞命运 | 首次阐明了巨噬细胞作为牙齿发育微环境关键成分,通过TGF-β信号通路调控Gli1⁺间充质干细胞命运,进而影响牙根形态发生的机制 | 研究主要基于小鼠模型,且巨噬细胞清除可能导致全身性炎症反应;具体信号通路细节和人类相关性有待进一步验证 | 探究巨噬细胞在小鼠出生后牙根发育过程中的功能作用及其分子机制 | 小鼠出生后牙根发育过程中的巨噬细胞和Gli1⁺间充质干细胞 | 数字病理学 | 发育性疾病 | 单细胞RNA测序、体外共培养实验、巨噬细胞清除实验 | NA | 基因表达数据、图像 | 小鼠磨牙组织样本(具体数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于单细胞转录组分析 |
| 132 | 2026-06-10 |
Single-cell profiling reveals distinct populations of tumor-associated macrophages and metastatic tumor cells in breast cancer brain metastasis
2026-Apr-25, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08807-w
PMID:42034645
|
研究论文 | 通过单细胞分析揭示乳腺癌脑转移中肿瘤相关巨噬细胞和转移性肿瘤细胞的不同亚群 | 首次在单细胞分辨率下全面描绘乳腺癌脑转移微环境,鉴定出12种肿瘤相关巨噬细胞亚型和5种转移性肿瘤细胞亚型,并发现GABRB3和NRXN1基因突变与患者生存相关 | 样本量相对较小(7例患者用于单细胞测序,47例用于bulk测序),功能实验仅使用异种移植模型 | 阐明乳腺癌脑转移进展的分子机制 | 乳腺癌脑转移患者 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、bulk DNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、DNA测序数据 | 7例患者用于单细胞RNA测序,47例患者用于bulk DNA测序 | NA | 单细胞RNA测序、bulk DNA测序 | NA | NA |
| 133 | 2026-06-10 |
Persistent loss of intrahepatic IFN-γ in HBV is linked to selective impairment of liver-resident CXCR6+NK cells despite long-term NUC therapy
2026-Apr-18, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2026.101865
PMID:42009166
|
研究论文 | 通过多参数免疫荧光和单细胞RNA测序,发现长期核苷酸类似物治疗下,慢性乙肝患者肝脏中CXCR6+NK细胞持续丧失并转录重编程,导致肝内IFN-γ无法恢复 | 首次在人类肝脏中定义IFN-γ主要来源为肝驻留CXCR6+NK细胞,并揭示NUC治疗后抗原抑制下仍存在选择性NK细胞功能缺陷,提出了非耗竭驱动的免疫改变机制 | 样本量较小(NUC-HBV肝活检n=9,健康肝n=7),且仅分析了组织学和临床稳定患者,未探讨不同NUC疗程或疾病阶段的影响 | 明确健康肝脏中IFN-γ的主要细胞来源,并评估在长期NUC治疗对HBV抑制后这一免疫轴的变化 | 长期NUC治疗的慢性乙肝患者和健康供者的肝活检组织及配对外周血和肝脏细针穿刺样本 | 数字病理学 | 慢性乙肝 | 多参数免疫荧光、单细胞RNA测序 | NA | 图像、基因表达数据 | NUC-HBV患者肝活检9例、健康供者肝活检7例;NUC-HBV患者肝细针穿刺9例、外周血18例;对照数据集肝5例、血9例 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 134 | 2026-06-10 |
Immune landscape in NOD.H-2h4 mouse model thyroid revealed by single-cell RNA sequencing
2026-Apr-16, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.153484
PMID:41734714
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析NOD.H-2h4小鼠模型甲状腺的免疫景观,揭示桥本甲状腺炎的细胞机制 | 首次构建NOD.H-2h4小鼠模型甲状腺的单细胞转录组图谱,发现甲状腺细胞可塑性和调节性T细胞功能障碍可能是疾病进展的驱动因素 | 未提及具体限制,但可能包括小鼠模型与人类疾病的差异以及样本量有限 | 阐明桥本甲状腺炎中甲状腺细胞类型在免疫失调中的具体作用 | NOD.H-2h4小鼠甲状腺组织,包括免疫浸润细胞和驻留组织细胞 | 单细胞组学 | 桥本甲状腺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 38,461个细胞,来自三个疾病阶段(4周、8周和16周)的NOD.H-2h4小鼠 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 135 | 2026-06-10 |
Spatial and single-cell transcriptomic atlas of human suprachiasmatic nucleus
2026-Apr-15, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2025.12.032
PMID:41720090
|
研究论文 | 通过空间转录组学、单核RNA测序及深度学习组织学分析,构建了人类视交叉上核的综合分子与细胞图谱,揭示了其神经元亚型、保守功能分区及昼夜节律机制 | 首次在成人人类SCN中整合空间转录组与单核RNA测序数据,结合深度学习分析,揭示了保守的功能分区由LHX1和RORB调控,以及神经肽信号网络的重组,并通过GWAS整合分析鉴定出AVP/NMS神经元亚型与清晨型表型的关联 | 仅基于成人样本,未涵盖发育或衰老阶段;跨物种比较主要限于小鼠和猕猴,可能不完全反映人类特有的昼夜节律调控机制 | 阐明人类视交叉上核(SCN)的分子与细胞组成及其昼夜节律调控机制 | 成人人类视交叉上核(SCN)组织样本 | 数字病理学, 机器学习 | NA | 空间转录组学, 单核RNA测序(snRNA-seq) | 深度学习模型 | 空间转录组数据, 单核RNA测序数据, 组织学图像 | 成人SCN组织样本(具体数量未在摘要中明确) | NA | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 136 | 2026-06-10 |
Tumor cell-derived IFN spatially reprograms osteopontin-enriched macrophage niches to promote PARP inhibitor resistance
2026-Apr-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI199035
PMID:41734034
|
研究论文 | 该研究整合空间转录组学和单细胞RNA测序技术,揭示了肿瘤细胞来源的IFN通过重编程富含骨桥蛋白的巨噬细胞微环境促进PARP抑制剂耐药的新机制 | 首次在临床前试验样本中运用PhenoCycler-Fusion空间图谱、单细胞RNA测序和多重免疫组化技术,鉴定了治疗调节的细胞邻域,并发现IFN-SPP1轴是PARP抑制剂耐药的关键驱动机制 | 未明确提及在免疫缺陷小鼠中验证了该机制的免疫依赖性,但未说明其他潜在局限性如样本量或模型适用性 | 探究PARP抑制剂(尼拉帕利)耐药机制,特别是肿瘤微环境中的空间免疫重编程 | 高级别浆液性卵巢癌患者(新辅助尼拉帕利单药治疗临床试验)、同源重组缺陷小鼠模型 | 数字病理学 | 卵巢癌 | PhenoCycler-Fusion空间图谱、单细胞RNA测序、多重免疫组化 | NA | 空间转录组学数据、单细胞RNA测序数据、组织图像 | 来自前瞻性新辅助尼拉帕利单药治疗试验的样本(具体数量未提及) | 10x Genomics, Akoya Biosciences | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, PhenoCycler-Fusion | 10x Chromium单细胞3'试剂盒, PhenoCycler-Fusion空间图谱系统 |
| 137 | 2026-06-10 |
Design of the biosensor-dependent coupling system stabilizes the high-synthesis phenotype of cell factory
2026-Apr-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71801-5
PMID:41974726
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于生物传感器的生长耦合系统,通过转录组挖掘工作流获得甘草次酸和美迪紫檀素的酵母生物传感器,并构建生长成瘾回路以稳定细胞工厂的高合成表型 | 提出了一种快速转录组挖掘工作流用于设计特定产物响应的生物传感器,并通过生长耦合策略结合单细胞转录组分析揭示了群体水平的表型异质性与分工机制 | 生物传感器种类有限,仅验证了两种植物天然产物的传感器;生长耦合策略并未完全消除表型异质性,仍需进一步优化 | 稳定微生物细胞工厂的高产表型,解决产量漂变和菌株退化问题 | 酿酒酵母细胞工厂及其生产甘草次酸和美迪紫檀素的菌株群体 | 机器学习 | NA | 转录组挖掘、单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 酵母菌株群体(初始菌株与进化菌株的多个亚群) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 138 | 2026-06-10 |
CBP/p300 is critical for the expansion and maintenance of functional pancreatic α cell mass
2026-Apr-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71499-5
PMID:41965878
|
研究论文 | 揭示CBP/p300在功能性胰腺α细胞团扩张与维持中的关键作用及机制 | 首次发现CBP/p300通过调控氨基酸感应通路(特别是Slc7a2介导的机制)来维持α细胞身份和功能,并影响mTORC1信号和自噬 | 未明确说明,但可推断研究仅在动物模型中进行,可能缺乏人体验证 | 研究CBP/p300在胰腺α细胞增殖和功能维持中的分子机制 | 小鼠胰腺α细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠胰腺α细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 未提及具体平台型号 |
| 139 | 2026-06-10 |
RESCUE: recovery of unattributed expression patterns in spatial transcriptomics
2026-Apr-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71720-5
PMID:41963343
|
研究论文 | 提出一种名为RESCUE的计算方法,用于恢复空间转录组学中被现有分析方法遗漏的表达模式 | 首次系统性地解决了空间转录组学中未被归因的分子表达模式问题,并提供了一种无需完整参考即可进行稳健推断的方法 | 未明确说明局限性 | 开发一种能够恢复空间转录组学中未被现有方法归因的表达模式的计算方法 | 空间转录组学数据中的基因表达模式,包括脆弱或代表性不足的细胞类型、亚细胞结构(如神经突)和胞外表达 | 计算生物学 | NA | MERFISH, 空间转录组学 | RESCUE | 空间转录组学数据 | 蜜蜂脑组织MERFISH数据集及多个空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学, MERFISH | NA | NA |
| 140 | 2026-06-10 |
Aging restricts maturation of CXCL13+ T follicular helper cells in human immunity
2026-Apr-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.03.715992
PMID:41993471
|
研究论文 | 研究了人类免疫衰老过程中CXCL13+滤泡辅助性T细胞成熟受限的机制 | 利用人扁桃体类器官、单细胞RNA测序和CRISPR扰动技术,首次揭示了衰老导致CXCL13+ GC-Tfh细胞选择性丢失并伴随Tfh前体细胞积累,以及BACH2和SOX4作为年龄相关分化调控因子的新机制 | 未提及明显局限性 | 阐明人类衰老过程中抗体反应下降的细胞和分子机制,重点探究Tfh细胞的功能缺陷 | 人类扁桃体类器官、Tfh细胞、B细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序、CRISPR扰动、类器官培养 | NA | 单细胞转录组数据 | 不同年龄供体的扁桃体样本 | 10x Genomics(推测) | 单细胞RNA-seq | NA | NA |