单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27707 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2025-05-12 |
HyperCell: Advancing Cell Type Classification with Hyperdimensional Computing
2024-Jul, Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. Annual International Conference
DOI:10.1109/EMBC53108.2024.10782122
PMID:40039180
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research paper | 提出了一种利用超维计算提高单细胞RNA测序数据中细胞类型分类准确性的新方法 | 首次将超维计算应用于单细胞RNA测序数据的细胞类型分类，提高了分类准确性 | 未提及具体的数据集规模限制或计算资源需求 | 提高单细胞RNA测序数据中细胞类型分类的准确性 | 单细胞RNA测序数据 | genomics | NA | scRNA-seq, 超维计算 | QuantHD | 基因表达数据 | 多个数据集（具体数量未提及） |
| 122 | 2025-05-12 |
Mutual information for detecting multi-class biomarkers when integrating multiple bulk or single-cell transcriptomic studies
2024-Jun-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.11.598484
PMID:38915481
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研究论文 | 提出了一种名为MICA的统计框架，用于从信息论角度检测多个组学研究中的多类别生物标志物 | MICA框架能够检测跨多个组学研究的多类别表达模式一致的生物标志物，填补了现有方法仅适用于两类别场景的不足 | 未明确提及方法在特定数据类型或样本规模下的性能限制 | 开发一种能够整合多个组学研究并检测多类别生物标志物的统计方法 | 多类别组学数据（如不同疾病亚型、处理方式、组织或细胞类型） | 生物信息学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | MICA（基于互信息的统计框架） | 转录组数据（包括bulk和单细胞） | 涉及小鼠代谢相关转录组研究（四种组织）和雌激素处理表达谱（三个来源） |
| 123 | 2025-05-12 |
Genetic and transcriptomic landscape of colonic diverticulosis
2024-05-10, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2023-331267
PMID:38443061
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研究论文 | 通过遗传和转录组学研究结肠憩室病的遗传和细胞决定因素及其与其他胃肠道疾病的关系 | 首次整合DNA和RNA测序数据，结合单细胞RNA-seq和全基因组关联研究，揭示了结肠憩室病的遗传和转录组学特征 | 研究样本量相对较小，且仅针对特定人群 | 揭示结肠憩室病的遗传和细胞机制及其与其他胃肠道疾病的关联 | 404例结肠憩室病患者（172例）和对照者（232例）的结肠组织 | 遗传学与转录组学 | 结肠憩室病 | DNA测序、RNA测序、单细胞RNA-seq、全基因组关联研究（GWAS）、孟德尔随机化（MR） | 多基因风险评分（PRS） | 遗传数据、转录组数据 | 404例（172例憩室病患者，232例对照） |
| 124 | 2025-05-12 |
Genomic and immune signatures predict clinical outcome in newly diagnosed multiple myeloma treated with immunotherapy regimens
2023-Dec, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-023-00657-1
PMID:37945755
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研究论文 | 该研究通过整合肿瘤全基因组和微环境单细胞RNA测序数据，揭示了基因组驱动因素和免疫微环境特征对新诊断多发性骨髓瘤患者临床结果的预测作用 | 首次揭示了APOBEC突变活性、IKZF3和RPL5缺失以及8q增益等基因组驱动因素与临床结果的关系，并发现治疗前后免疫微环境特征的变化可预测持续微小残留病灶阴性 | 研究样本来自特定临床试验(NCT03290950)，可能限制结果的普遍适用性 | 探索基因组和免疫特征对新诊断多发性骨髓瘤患者免疫治疗方案临床结果的预测作用 | 新诊断的多发性骨髓瘤患者 | 基因组学与免疫治疗 | 多发性骨髓瘤 | 全基因组测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、RNA测序数据 | 来自NCT03290950临床试验的患者样本 |
| 125 | 2025-05-12 |
Vascular mechanisms of post-COVID-19 conditions: Rho-kinase is a novel target for therapy
2023-06-02, European heart journal. Cardiovascular pharmacotherapy
DOI:10.1093/ehjcvp/pvad025
PMID:37019821
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research paper | 该研究探讨了COVID-19后遗症（长期COVID）中的血管功能障碍机制，并提出Rho激酶作为新的治疗靶点 | 研究发现Rho激酶激活是COVID-19后遗症患者血管纤维化和肌球蛋白轻链磷酸化的关键机制，并提出了fasudil作为潜在治疗药物 | 研究样本量较小（37例患者），且仅针对住院后康复的COVID-19患者 | 探究COVID-19后遗症中血管功能障碍的机制并寻找潜在治疗靶点 | COVID-19康复患者（27例）和风险因素匹配的对照组（10例） | 心血管疾病研究 | COVID-19后遗症 | wire myography, histopathology, immunohistochemistry, spatial transcriptomics | NA | 生物标志物、影像学数据、组织活检 | 37例（27例COVID-19康复患者和10例对照组） |
| 126 | 2025-05-11 |
Novel therapeutic targets uncovered by genome-wide integrative analysis in bronchopulmonary dysplasia
2025-Dec, The journal of maternal-fetal & neonatal medicine : the official journal of the European Association of Perinatal Medicine, the Federation of Asia and Oceania Perinatal Societies, the International Society of Perinatal Obstetricians
DOI:10.1080/14767058.2025.2469837
PMID:39988826
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研究论文 | 通过整合基因组关联研究、单细胞转录组学和孟德尔随机化分析，揭示了支气管肺发育不良的遗传机制和潜在治疗靶点 | 首次整合GWAS、scRNA-seq和MR分析，识别出与BPD相关的关键基因和药物相互作用 | 研究结果需要进一步的实验验证，且样本来源可能有限 | 识别BPD的基因表达失调并探索相关分子通路 | 支气管肺发育不良(BPD)患者 | 基因组学 | 支气管肺发育不良 | GWAS, scRNA-seq, MR | NA | 基因组数据、转录组数据 | NA |
| 127 | 2025-05-11 |
The Role of Autophagy and Cell Communication in COPD Progression: Insights from Bioinformatics and scRNA-seq
2025-Dec, COPD
IF:2.2Q3
DOI:10.1080/15412555.2024.2444663
PMID:39991824
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research paper | 研究通过生物信息学和单细胞RNA测序技术探讨自噬和细胞通讯在慢性阻塞性肺疾病（COPD）进展中的作用 | 利用生物信息学工具识别吸烟激活的自噬相关基因，并通过scRNA-seq数据分析细胞通讯模式，揭示COPD的免疫景观 | 研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证 | 探讨自噬和细胞通讯在COPD进展中的作用 | COPD患者中的自噬相关基因和细胞通讯模式 | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病（COPD） | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 128 | 2025-05-11 |
Pdia3 deficiency exacerbates intestinal injury by disrupting goblet and Paneth cell function during ischemia/reperfusion
2025-Jun, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.111682
PMID:39988288
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research paper | 本研究探讨了PDIA3在肠缺血/再灌注损伤中维持肠道完整性和免疫功能的作用 | 首次揭示了PDIA3在肠缺血/再灌注损伤中通过影响杯状细胞和潘氏细胞功能维持肠道屏障功能的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探索PDIA3在肠缺血/再灌注损伤中的保护作用及其机制 | 人类和小鼠的肠道上皮细胞，特别是杯状细胞和潘氏细胞 | 分子病理学 | 肠缺血/再灌注损伤 | 单细胞RNA测序、免疫组化、转录组分析 | 肠道上皮特异性条件性敲除小鼠模型 | 基因表达数据、组织病理学数据 | 人类肠系膜动脉缺血患者样本和Pdia3基因敲除小鼠模型 |
| 129 | 2025-05-11 |
Pathogenesis, attenuation, and treatment strategies for keloid management
2025-Jun, Tissue & cell
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.tice.2025.102800
PMID:39999656
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review | 该综述探讨了瘢痕疙瘩的发病机制、减缓和治疗策略 | 综述了单细胞RNA测序和转录组学在理解瘢痕疙瘩发病机制中的应用，并讨论了新型纳米治疗技术的进展 | 瘢痕疙瘩治疗后容易复发，治疗过程复杂，需要长期随访 | 探讨瘢痕疙瘩的发病机制及治疗策略 | 瘢痕疙瘩的病理生理学及治疗方法 | NA | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序, 转录组学 | NA | NA | NA |
| 130 | 2025-05-11 |
High-resolution transcriptome analysis on a mouse model of neonatal hypoxic-ischemic encephalopathy using single-nucleus RNA-seq
2025-Jun, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2025.102026
PMID:40342532
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研究论文 | 利用单核RNA测序技术对新生儿缺氧缺血性脑病小鼠模型进行高分辨率转录组分析 | 首次在HIE小鼠模型中应用单核RNA测序技术，揭示了海马区神经元群体的显著减少和小胶质细胞的激活 | 研究仅基于小鼠模型，结果可能无法完全反映人类HIE的复杂病理机制 | 深入理解新生儿缺氧缺血性脑病的发病机制 | 新生儿缺氧缺血性脑病小鼠模型 | 基因组学 | 新生儿缺氧缺血性脑病 | 单核RNA测序(snRNA-seq) | 小鼠疾病模型 | RNA测序数据 | 未明确提及样本数量 |
| 131 | 2025-05-11 |
Multifaceted profiling of virus-specific CD8 T cells reveals distinct immune signatures against cytomegalovirus infection states during pregnancy
2025-May-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112416
PMID:40343282
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术，分析了孕妇体内针对巨细胞病毒(CMV)的特异性CD8 T细胞，揭示了不同血清学模式下细胞免疫的特征 | 首次在孕妇中系统研究了CMV特异性CD8 T细胞的免疫特征，发现不同感染阶段具有独特的T细胞表型和抗原识别模式 | 样本量相对有限，且仅针对特定CMV抗原(IE1和pp65)进行研究 | 探究孕妇体内CMV特异性细胞免疫特征及其与血清学诊断的关系 | 孕妇体内的CMV特异性CD8 T细胞 | 免疫学 | 巨细胞病毒感染 | MHC-葡聚糖单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据，流式细胞数据 | 具有不同抗CMV血清学模式的孕妇样本(包括IgGIgM/AI-low、IgGIgM/AI-high和IgGIgM) |
| 132 | 2025-05-11 |
Sex differences in adenosine deaminase activity associate with disparities in SARS-CoV-2 innate immunity
2025-May-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112418
PMID:40343269
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research paper | 该研究探讨了腺苷脱氨酶（ADA）活性在性别差异中对SARS-CoV-2先天免疫反应的影响 | 揭示了ADA活性性别差异与内源性逆转录病毒元素（hERV）和干扰素刺激基因（ISG）表达的关系，以及IL-18在性别特异性ADA2表达中的作用 | 研究样本可能不足以全面反映所有人群的差异，且机制细节仍需进一步验证 | 探究性别差异在抗病毒先天免疫反应中的机制 | 健康人群和COVID-19患者的血液和肺组织样本 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 健康人群和COVID-19患者的血液和肺组织样本 |
| 133 | 2025-05-11 |
Single-cell RNA sequencing highlights a significant retinal Müller glial population in dry age-related macular degeneration
2025-May-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112464
PMID:40343286
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了干性年龄相关性黄斑变性（dAMD）中视网膜Müller胶质细胞的重要作用 | 首次在dAMD模型和患者中鉴定出高表达Sox2的Müller细胞亚群，并发现其在AMD进展中的数量显著减少，同时揭示了铁死亡和凋亡是导致这些细胞损伤的原因 | 研究主要基于小鼠模型和有限的患者样本，可能需要更大规模的临床验证 | 解析干性年龄相关性黄斑变性（dAMD）的细胞和通路机制 | 小鼠AMD模型和dAMD患者的视网膜Müller胶质细胞 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠模型和dAMD患者样本（具体数量未明确说明） |
| 134 | 2025-05-11 |
Identification of novel biomarkers and drug targets for frailty-related skeletal muscle aging: a multi-omics study
2025-May-09, QJM : monthly journal of the Association of Physicians
DOI:10.1093/qjmed/hcaf108
PMID:40343466
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研究论文 | 通过多组学研究识别与衰弱相关骨骼肌衰老的新型生物标志物和药物靶点 | 首次发现24个生物标志物基因，并构建了基于转录组特征的预测模型，揭示了内皮细胞在肌肉退化中的关键作用 | 研究结果需要在更大样本中进行验证，且药物靶点的临床转化效果尚不明确 | 识别早期检测和治疗干预衰弱相关骨骼肌衰老的生物标志物和药物靶点 | 人类骨骼肌衰老过程 | 生物信息学 | 老年疾病 | 转录组学、单细胞RNA测序、孟德尔随机化分析、贝叶斯共定位分析 | 机器学习预测模型 | 转录组数据、单细胞测序数据 | 未明确说明样本数量 |
| 135 | 2025-05-11 |
Bi-level identification of governing equations for nonlinear physical systems
2025-May-09, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-025-00804-x
PMID:40346196
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研究论文 | 介绍了一种名为BILLIE的双层优化框架，用于从观测数据中识别非线性物理系统的控制方程 | 利用强化学习的策略梯度算法实现双层优化，同时发现和验证方程 | 未明确提及具体限制 | 从观测数据中识别非线性物理系统的控制方程 | 非线性物理系统（如湍流和三体系统）及单细胞测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 强化学习 | 观测数据 | 未明确提及具体样本量 |
| 136 | 2025-05-11 |
Biomarkers Related to Interferon-γ Pathway in Myocardial Ischemia-Reperfusion Injury and the Potential Molecular Mechanisms
2025-May-09, Cardiovascular toxicology
IF:3.4Q2
DOI:10.1007/s12012-025-09999-x
PMID:40346414
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研究论文 | 探讨干扰素-γ通路在心肌缺血再灌注损伤(MIRI)中的分子机制及其潜在生物标志物 | 通过挖掘转录组和单细胞测序数据，首次揭示了干扰素-γ通路相关基因Myd88和Trp53在MIRI中的作用机制 | 研究主要基于公开数据集，缺乏实验验证 | 阐明干扰素-γ通路在心肌缺血再灌注损伤中的分子机制 | 心肌缺血再灌注损伤患者样本 | 生物信息学 | 心血管疾病 | scRNA-seq, 转录组分析 | PPI网络分析 | 基因表达数据 | GSE160516和GSE83472数据集中的样本 |
| 137 | 2025-05-11 |
A single cell atlas of the mouse seminal vesicle
2025-May-08, G3 (Bethesda, Md.)
DOI:10.1093/g3journal/jkaf045
PMID:40036847
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研究论文 | 本文报告了首个小鼠精囊的单细胞RNA-seq图谱，揭示了精囊分泌细胞的转录组特征及其免疫细胞群 | 首次构建小鼠精囊的单细胞RNA-seq图谱，明确了分泌细胞的转录组特征和免疫细胞群的组成 | 研究仅基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需验证 | 理解精囊这一研究较少的生殖组织的细胞组成及其功能 | 小鼠精囊组织 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | 23只不同年龄和饮食条件的小鼠 |
| 138 | 2025-05-11 |
Unraveling Tissue Complexity Through Single-Cell and Spatial Transcriptomics
2025-May-08, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202500710
PMID:40342283
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 139 | 2025-05-11 |
Impact of intercellular adhesion molecule 1-positive dental pulp stem cells in deep caries progression
2025-May-08, International endodontic journal
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/iej.14248
PMID:40343788
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研究论文 | 研究探讨了深龋进展中ICAM1阳性牙髓干细胞的作用及其对免疫微环境的影响 | 首次揭示了ICAM1+ DPSCs在深龋进展中的关键作用及其与单核巨噬细胞的相互作用 | 研究主要基于体外实验，需要进一步在体内验证这些发现 | 开发针对深龋的治疗策略 | 牙髓干细胞(DPSCs)和深龋病变组织 | 牙科医学 | 龋齿 | 单细胞测序、免疫荧光/流式细胞术、RT-qPCR、Western Blot、ELISA、SCENIC和RNA-seq | NA | 基因表达数据和细胞表型数据 | 人类和小鼠模型的牙髓组织样本 |
| 140 | 2025-05-11 |
PP1A Modulates the Efficacy of Lenvatinib Plus ICIs Therapy by Inhibiting Ferroptosis in Hepatocellular Carcinoma
2025-May-08, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202501730
PMID:40344394
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研究论文 | 本文研究了PP1A在肝细胞癌中通过抑制铁死亡调节Lenvatinib联合ICIs治疗效果的机制 | 发现PP1A通过去磷酸化Keap1抑制铁死亡，并揭示了其在调节抗肿瘤免疫中的作用 | 研究主要基于体外和动物实验，临床转化效果尚需进一步验证 | 探索PP1A在肝细胞癌治疗抵抗中的作用机制 | 肝细胞癌细胞和动物模型 | 肿瘤生物学 | 肝细胞癌 | 转录组分析、铁死亡代谢物分析、单细胞测序 | NA | 分子生物学数据、测序数据 | 体外培养细胞和动物模型 |