单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 13961 - 13980 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 13961 | 2024-08-07 |
Novel approaches in function-driven single-cell genomics
2017-07-01, FEMS microbiology reviews
IF:10.1Q1
DOI:10.1093/femsre/fux009
PMID:28591840
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综述 | 本文综述了功能驱动单细胞基因组学的策略及其未来发展方向 | 提出了一种基于功能的筛选方法，用于从复杂的微生物群落中靶向分离和单细胞基因组测序，从而聚焦于具有特定表型或代谢特征的细胞 | NA | 旨在提高对微生物群落功能及其未表征基因产物空间的理解 | 环境微生物群落及其在生物地球化学中的作用 | 基因组学 | NA | 单细胞基因组学 | NA | 基因组数据 | NA |
| 13962 | 2024-08-04 |
Combinatorial expression of γ-protocadherins regulates synaptic connectivity in the mouse neocortex
2024-Mar-12, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.89532
PMID:38470230
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研究论文 | 本文研究了γ-protocadherins在小鼠新皮层突触连接中的作用 | 识别了组合性γ-protocadherin表达在突触连接中的关键角色 | 尚未探讨如何在其他类型神经元中应用这一发现 | 探讨突触形成过程中的连接选择机制 | 小鼠新皮层中的神经元 | 数字病理学 | NA | 5'端单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 13963 | 2024-08-04 |
Differentiation is accompanied by a progressive loss in transcriptional memory
2024-Mar-12, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-024-01846-9
PMID:38468285
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研究论文 | 本研究探讨了细胞分化过程中的转录记忆丧失与基因表达变异之间的关系 | 首次提供了关于相同细胞在分化早期阶段转录组分化速度的实验数据 | 研究主要集中在两种分化生物系统，可能限制了广泛应用性 | 研究细胞分化过程中转录记忆如何随着细胞分裂而丧失 | 人CD34+细胞和T2EC鸡初级红细胞前体 | 数字病理学 | NA | scRT-qPCR和scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 相关细胞的转录组，包含一代和二代细胞 |
| 13964 | 2024-08-07 |
Rejuvenated iPSC-derived GD2-directed CART Cells Harbor Robust Cytotoxicity Against Small Cell Lung Cancer
2024-Mar-11, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-23-0259
PMID:38380966
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研究论文 | 本文研究了通过引入GD2-CAR到诱导多能干细胞（iPSC）衍生的 rejuvenated 细胞毒性T淋巴细胞（GD2-CARrejT）来增强针对小细胞肺癌（SCLC）的GD2-CART细胞的细胞毒性。 | 本文创新性地使用iPSC衍生的 rejuvenated 细胞毒性T淋巴细胞（GD2-CARrejT），其在体外和体内对SCLC细胞的细胞毒性显著强于传统的GD2-CART细胞。 | NA | 旨在增强GD2-CART细胞对小细胞肺癌的细胞毒性。 | 研究对象为小细胞肺癌（SCLC）细胞和GD2-CART细胞。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | CAR T细胞 | RNA | NA |
| 13965 | 2024-08-04 |
Principled and interpretable alignability testing and integration of single-cell data
2024-Mar-05, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2313719121
PMID:38416677
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研究论文 | 该文章提出了一种可解释的单细胞数据对齐测试和集成的方法。 | 文章创新性地提出了SMAI框架，提供了严谨的统计检验以评估单细胞数据集的对齐能力，并保持数据结构的完整性。 | 现有方法缺乏对高维单细胞数据集是否可对齐的严格统计检验，并且在对齐过程中可能会严重扭曲数据。 | 研究旨在改进单细胞数据集成的方法，以提高分析的可靠性和可解释性。 | 本研究的对象是不同的单细胞数据集，包括真实和模拟的基准数据集。 | 数字病理学 | NA | 统计检验 | 谱流形对齐与推断框架 | 单细胞数据 | 多种真实和模拟的基准数据集 |
| 13966 | 2024-08-07 |
Adipocyte Precursor-Derived NRG1 Promotes Resistance to FGFR Inhibition in Urothelial Carcinoma
2024-03-04, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-1398
PMID:38175774
|
研究论文 | 本文研究了脂肪细胞前体衍生的NRG1如何促进尿路上皮癌对FGFR抑制剂的抵抗 | 发现脂肪细胞前体通过旁分泌方式促进对erdafitinib的抵抗，并揭示了NRG1通过激活ERBB3信号传导介导的抵抗机制 | NA | 探讨尿路上皮癌对FGFR抑制剂的抵抗机制 | 尿路上皮癌及其对FGFR抑制剂的抵抗 | 数字病理学 | 尿路上皮癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 13967 | 2024-08-07 |
Adipose Stromal Cell-Derived Cancer-Associated Fibroblasts Suppress FGFR Inhibitor Efficacy
2024-03-04, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-3904
PMID:38437636
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研究论文 | 研究揭示了脂肪组织中的前体细胞通过分泌神经调节蛋白1（NRG1）激活HER3信号通路，导致尿路上皮癌对FGFR抑制剂erdafitinib产生耐药性 | 发现NRG1介导的FGFR抑制剂耐药性可通过pertuzumab抗体进行干预 | NA | 探讨脂肪组织来源的细胞如何影响癌症治疗效果 | 脂肪组织中的前体细胞及其在癌症治疗中的作用 | NA | 尿路上皮癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 13968 | 2024-08-04 |
Stromal Signals Dominate Gene Expression Signature Scores That Aim to Describe Cancer Cell-intrinsic Stemness or Mesenchymality Characteristics
2024-02-23, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-23-0383
PMID:38349551
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研究论文 | 本文探讨了肿瘤微环境对EMT相关基因表达特征分数的影响 | 揭示了肿瘤样本中细胞成分主导EMT特征分数的现象 | 未能深入探讨非癌细胞的具体影响机制 | 验证非癌细胞在肿瘤特征评分中的主导作用 | 已发表的11个与EMT相关的基因表达特征 | 数字病理学 | 癌症 | RNA测序(RNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 分析了多个肿瘤类型的样本 |
| 13969 | 2024-08-07 |
EZH2 Inhibition Promotes Tumor Immunogenicity in Lung Squamous Cell Carcinomas
2024-02-13, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-23-0399
PMID:38265267
|
研究论文 | 本研究探讨了抑制甲基转移酶增强子zeste 2 (EZH2)是否能增加肺鳞状细胞癌(LSCC)对免疫检查点抑制剂(ICI)的反应 | 首次证明EZH2抑制剂能增加MHC I/II类分子的表达，并通过单细胞RNA测序和免疫细胞分析揭示了肿瘤抑制表型的变化 | NA | 研究EZH2抑制剂在肺鳞状细胞癌中增强免疫检查点抑制剂反应的作用 | 肺鳞状细胞癌(LSCC) | 数字病理学 | 肺鳞状细胞癌 | 染色质免疫沉淀测序 | NA | mRNA和蛋白质 | 使用二维人类癌细胞系和三维小鼠及患者来源的类器官进行体外实验 |
| 13970 | 2024-08-07 |
Data-driven detection of age-related arbitrary monotonic changes in single-cell gene expression distributions
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.16851
PMID:38344300
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研究论文 | 本研究介绍了一种新的工作流程，用于检测单细胞表达谱中与年龄相关的任意单调变化分布 | 使用信息论量化分布差异，并通过距离矩阵进行关联分析 | NA | 理解衰老背后的机制 | 单细胞基因表达随年龄的变化 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 13971 | 2024-08-04 |
Roles of immune microenvironment in the female reproductive maintenance and regulation: novel insights into the crosstalk of immune cells
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1109122
PMID:38223507
|
研究论文 | 本文探讨了免疫微环境在女性生殖维持与调节中的作用 | 通过单细胞测序技术揭示了免疫细胞的分布图，为免疫细胞在女性生殖中的作用提供了新见解 | 本文未提及具体的实验数据与样本量 | 构建女性生殖过程中免疫微环境的全面描述 | 关注女性生殖过程中免疫细胞的动态作用 | 数字病理学 | 女性生殖健康 | 单细胞测序（scRNA-seq） | NA | NA | NA |
| 13972 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing analysis identifies one subpopulation of endothelial cells that proliferates and another that undergoes the endothelial-mesenchymal transition in regenerating pig hearts
2023, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2023.1257669
PMID:38288246
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研究论文 | 本研究利用自编码器算法分析新生猪心脏中内皮细胞的单核RNA测序数据，识别出五种内皮细胞集群，其中VEC1集群表达增殖相关标记，而VEC3集群富集了调节细胞间连接和促进内皮间质转化的基因 | 首次在再生猪心脏中发现内皮细胞的两种不同响应机制：增殖和内皮间质转化，并揭示了这些过程在心肌再生中的潜在作用 | 研究仅限于新生猪模型，且样本量较小，需要进一步在更多种类的动物模型和更大样本量中验证 | 探讨内皮细胞在心肌再生中的作用及其分子机制 | 新生猪心脏中的内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单核RNA测序 | 自编码器 | RNA测序数据 | 新生猪心脏样本 |
| 13973 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA-seq reveals the links between the metabolic heterogeneity and cell identity in NBM and AML
2024-Mar, British journal of haematology
IF:5.1Q1
DOI:10.1111/bjh.19233
PMID:38009537
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 13974 | 2024-08-04 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals the Heterogeneity of the Immune Landscape of IDH-Wild-Type High-Grade Gliomas
2024-02-02, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-23-0211
PMID:38091354
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研究论文 | 本研究构建了IDH野生型高等级胶质瘤的免疫细胞单细胞转录组景观 | 揭示了肿瘤相关巨噬细胞的异质性及其在胶质瘤进展中的潜在作用，并探讨了T细胞的功能失调调节因子AHR | 研究主要聚焦于IDH-WT高等级胶质瘤，可能不适用于其他类型的胶质瘤 | 全面了解IDH-WT高等级胶质瘤的免疫微环境 | IDH-WT高等级胶质瘤患者的肿瘤组织和外周血单核细胞样本 | 数字病理学 | 神经胶质瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | RNA数据 | 肿瘤组织和外周血单核细胞的样本来自IDH-WT高等级胶质瘤患者 |
| 13975 | 2024-08-04 |
Signaling Pathway Alterations Driven by BRCA1 and BRCA2 Germline Mutations are Sufficient to Initiate Breast Tumorigenesis by the PIK3CAH1047R Oncogene
2024-01-05, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-23-0330
PMID:38059556
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研究论文 | 本研究生成了BRCA1和BRCA2突变携带者乳腺组织的单细胞转录组图谱，并与健康非携带者进行了比较 | 首次揭示了BRCA1和BRCA2突变对乳腺上皮细胞转录组的特定影响，并阐明了其与肿瘤发生的关系 | 本研究的样本仅限于BRCA1和BRCA2突变携带者，未能涵盖所有类型的乳腺癌变异 | 研究BRCA1和BRCA2突变在乳腺肿瘤发生中的信号通路改变 | BRCA1和BRCA2突变携带者及健康非携带者的乳腺上皮细胞和间质细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | BRCA1和BRCA2突变携带者的乳腺组织样本与健康非携带者样本进行比较 |
| 13976 | 2024-08-04 |
Spatial Distribution of Immune Cells Drives Resistance to Neoadjuvant Chemotherapy in Triple-Negative Breast Cancer
2024-01-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-23-0076
PMID:37856875
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学探讨三阴性乳腺癌中免疫细胞的空间分布对新辅助化疗的影响 | 研究通过空间转录组学的方法，更深入地理解了三阴性乳腺癌生态系统的复杂元素及其与新辅助化疗反应之间的关系 | 研究基于回顾性病例系列，样本量相对较小，仅包含24名患者 | 旨在探索三阴性乳腺癌对新辅助化疗反应的机制 | 涉及24名三阴性乳腺癌患者，其中12名患者经历了病理完全反应，12名患者则未反应或疾病进展 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 24例三阴性乳腺癌患者 |
| 13977 | 2024-08-07 |
Bexmarilimab Activates Human Tumor-Associated Macrophages to Support Adaptive Immune Responses in Interferon-Poor Immune Microenvironments
2024-01-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-23-0350
PMID:37922365
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研究论文 | 本文研究了bexmarilimab在干扰素贫乏的免疫微环境中激活人肿瘤相关巨噬细胞以支持适应性免疫反应的作用。 | 首次揭示了bexmarilimab在低基线干扰素信号的巨噬细胞中效果最佳，并阐明了其在免疫冷肿瘤中的应用潜力。 | 目前尚不清楚bexmarilimab在个体患者中治疗结果的机制。 | 探讨bexmarilimab在卵巢癌腹水巨噬细胞中的反应，并评估其在免疫冷肿瘤中的治疗效果。 | 卵巢癌腹水巨噬细胞及bexmarilimab的治疗效果。 | 免疫学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 13978 | 2024-08-07 |
Combination of Anti-PD-1 and Electroacupuncture Induces a Potent Antitumor Immune Response in Microsatellite-Stable Colorectal Cancer
2024-01-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-23-0309
PMID:37956404
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研究论文 | 研究电针（EA）与抗PD-1联合治疗在微卫星稳定（MSS）结直肠癌中的抗肿瘤效果 | 首次探讨了电针与抗PD-1联合治疗在MSS结直肠癌中的应用，并发现这种联合疗法通过激活STING通路增强了肿瘤的免疫反应 | 研究主要在动物模型中进行，需要进一步的临床试验验证其安全性和有效性 | 探索电针与抗PD-1联合治疗在MSS结直肠癌中的抗肿瘤效果及机制 | 微卫星稳定的结直肠癌 | 肿瘤学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个MSS结直肠癌小鼠模型 |
| 13979 | 2024-08-04 |
BCG vaccination stimulates integrated organ immunity by feedback of the adaptive immune response to imprint prolonged innate antiviral resistance
2024-Jan, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-023-01700-0
PMID:38036767
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研究论文 | 本研究探讨了BCG疫苗如何通过适应性免疫反应反馈刺激整合的器官免疫。 | 展示了BCG疫苗通过CD4 T细胞在组织巨噬细胞和上皮细胞中的反馈作用，促进了持久的广泛先天抗病毒抵抗力。 | 仅在小鼠模型中进行，没有在人类实验中验证结果 | 揭示BCG疫苗对异源病原体的非特异性保护机制 | BCG疫苗接种的小鼠 | 免疫学 | 呼吸道疾病 | 流式细胞术, 空间转录组学 | 小鼠模型 | 生物样本数据 | 小鼠数量不明确，但涉及多种病毒感染 |
| 13980 | 2024-08-04 |
The exploration of mitochondrial-related features helps to reveal the prognosis and immunotherapy methods of colorectal cancer
2024-01, Cancer reports (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/cnr2.1914
PMID:37903487
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研究论文 | 该文章探讨了线粒体相关特征如何揭示结直肠癌的预后和免疫疗法方法 | 文章通过线粒体相关基因风险评分构建预后模型，并与其他模型进行比较，展示了新的预后评估方法 | 该研究可能仅限于数据库中的数据，临床实用性需要进一步验证 | 研究结直肠癌中线粒体特征与肿瘤微环境及免疫景观的关系 | 使用非负矩阵分解（NMF）对结直肠癌患者数据进行亚组分析 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 免疫组化和单细胞测序 | 风险评分模型 | 临床数据和基因数据 | 使用内外部队列的 CRC 患者数据进行广泛测试 |