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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
13921 2024-10-09
The Role of Polycystic Kidney Disease-Like Homologs in Planarian Nervous System Regeneration and Function
2024, Integrative organismal biology (Oxford, England)
研究论文 研究了多囊肾病样同源基因在涡虫神经系统再生和功能中的作用 首次全面研究了涡虫基因组中所有基因在感觉神经元中的表达和功能,并开发了用于机械感觉刺激的自动化设置 对数十种神经元亚型的功能了解仍然有限 探讨多囊肾病样同源基因在涡虫神经系统再生和功能中的作用 涡虫的感觉神经元及其在机械刺激和食物检测中的功能 NA NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 涡虫的无性和雌雄同体品系 NA NA NA NA
13922 2024-10-09
Altered immune cell in human severe acute pancreatitis revealed by single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了严重急性胰腺炎患者中免疫细胞的变化 首次构建了严重急性胰腺炎患者外周血单细胞图谱,并发现了一种表达高水平PPBP和PF4的新型单核细胞亚群 样本量较小,仅包括7名未治疗的严重急性胰腺炎患者 研究严重急性胰腺炎中特定免疫细胞亚型的变化及其机制,并识别预测急性胰腺炎严重程度的潜在生物标志物 严重急性胰腺炎患者的外周血单核细胞 数字病理学 胰腺炎 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 7名未治疗的严重急性胰腺炎患者和6名健康对照 NA NA NA NA
13923 2024-10-09
Prognosis of colorectal cancer, prognostic index of immunogenic cell death associated genes in response to immunotherapy, and potential therapeutic effects of ferroptosis inducers
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究利用生物信息学和医学大数据整合了来自Gene Expression Omnibus (GEO)和The Cancer Genome Atlas (TCGA)的数据集,全面概述了免疫原性细胞死亡(ICD)相关基因在结直肠癌(CRC)中的表达 研究揭示了ICD相关基因在CRC中的分子通路和基因网络,并探讨了细胞死亡诱导剂(包括铁死亡诱导剂)的治疗潜力及其在精准医学中的应用 NA 阐明ICD在结直肠癌中的分子机制及其在治疗中的潜在应用 结直肠癌(CRC)中的免疫原性细胞死亡(ICD)相关基因 生物信息学 结直肠癌 差异表达分析、共识聚类、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 来自GEO和TCGA的多个结直肠癌样本 NA NA NA NA
13924 2024-10-09
Comprehensive Analysis of scRNA-Seq and Bulk RNA-Seq Reveals Transcriptional Signatures of Macrophages in Intrahepatic Cholestasis of Pregnancy
2024, Journal of inflammation research IF:4.2Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序分析了妊娠期肝内胆汁淤积症中巨噬细胞的转录特征 首次揭示了妊娠期肝内胆汁淤积症中巨噬细胞的转录特征,并发现了炎症状态的倾向 NA 探究妊娠期肝内胆汁淤积症中免疫细胞和免疫基因的调控机制 妊娠期肝内胆汁淤积症中的巨噬细胞 数字病理学 妊娠期肝内胆汁淤积症 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA NA NA NA
13925 2024-10-09
Dynamics of alternative polyadenylation in single root cells of Arabidopsis thaliana
2024, Frontiers in plant science IF:4.1Q1
研究论文 研究了拟南芥根细胞中单细胞RNA测序数据中的选择性多聚腺苷酸化(APA)动态 开发了一种新的流程来识别和整合来自不同单细胞RNA测序数据的APA位点,并分析单细胞中的APA动态 NA 揭示选择性多聚腺苷酸化在拟南芥根细胞发育中的动态变化 拟南芥根细胞中的选择性多聚腺苷酸化位点及其动态变化 基因表达调控 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 超过150,000个细胞,涵盖四个主要组织分支、十二种细胞类型和三个发育阶段 NA NA NA NA
13926 2024-10-09
scResolve: Recovering single cell expression profiles from multi-cellular spatial transcriptomics
2023-Dec-19, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种名为scResolve的方法,用于从多细胞空间转录组学测量中恢复单细胞表达谱 scResolve能够准确恢复单细胞在其位置上的表达谱,这是细胞类型反卷积无法实现的 NA 开发一种方法来恢复多细胞空间转录组学测量中的单细胞表达谱 人类乳腺癌数据和人类肺部疾病数据 空间转录组学 NA 空间转录组学 NA 转录组数据 人类乳腺癌和肺部疾病数据 NA NA NA NA
13927 2024-10-09
A review of the current state of single-cell proteomics and future perspective
2023-Nov, Analytical and bioanalytical chemistry IF:3.8Q1
综述 本文综述了单细胞蛋白质组学的当前状态,包括工作流程、样本制备技术、仪器和生物应用,并展望了其未来发展 单细胞蛋白质组学作为单细胞转录组学的补充,为生物研究提供了新的视角 目前存在样本体积小和数据解释需要稳健统计方法的挑战 评估单细胞蛋白质组学的当前技术状态,并展望其在生物研究中的未来应用 单细胞蛋白质组学的工作流程、样本制备技术、仪器和生物应用 NA NA 单细胞蛋白质组学 NA NA NA NA NA NA NA
13928 2024-10-09
Cross-Dataset Single-Cell Analysis Identifies Temporal Alterations in Cell Populations of Primary Pancreatic Tumor and Liver Metastasis
2023-Apr-21, Cancers IF:4.5Q1
研究论文 本研究通过跨数据集的单细胞RNA测序分析,揭示了原发性胰腺肿瘤和肝转移瘤中细胞群落的时空变化 首次系统比较了原发性胰腺癌和肝转移瘤的细胞群落组成和基因组特征,并识别出肝转移瘤中独特的癌细胞亚群和标记物 NA 探讨胰腺导管腺癌(PDAC)原发肿瘤和肝转移瘤中细胞群落的组成和基因组特征的差异 胰腺导管腺癌(PDAC)的原发肿瘤和肝转移瘤 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因组数据 使用了转基因KPC小鼠模型及其自发PDAC和匹配的肝转移瘤的scRNA-seq数据集 NA NA NA NA
13929 2024-10-09
Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Intratumoral Heterogeneity in ccRCC, which Results in Different Clinical Outcomes
2020-07-08, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy IF:12.1Q1
研究论文 研究通过单细胞转录组分析揭示了透明细胞肾细胞癌(ccRCC)的肿瘤内异质性,并探讨了其对临床结果的影响 首次通过单细胞RNA测序数据分析了ccRCC的肿瘤内异质性,并发现了T细胞耗竭是导致ccRCC组织免疫抑制特性的关键因素 研究样本量有限,且主要基于TCGA数据集,可能存在数据偏倚 探讨透明细胞肾细胞癌(ccRCC)的肿瘤内异质性及其对临床结果的影响 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)的肿瘤内异质性及其与免疫抑制和预后的关系 数字病理学 肾癌 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 533名患者 NA NA NA NA
13930 2024-10-08
The heterogeneity of breast cancer metastasis: a bioinformatics analysis utilizing single-cell RNA sequencing data
2024-Nov, Breast cancer research and treatment IF:3.0Q2
研究论文 本文利用单细胞RNA测序数据分析了乳腺癌转移的异质性 利用单细胞RNA测序技术区分转移的分子特征并识别患者预后的预测基因 没有单一基因或通路能完全解释肿瘤转移的机制 探索乳腺癌原发肿瘤组织与淋巴结和肝脏转移细胞之间的基因表达差异 乳腺癌原发肿瘤组织与淋巴结和肝脏转移细胞 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA NA NA NA
13931 2024-10-08
Identification of KLHL17 as a prognostic marker for prostate cancer based on single-cell sequencing and in vitro/in vivo experiments
2024-Oct-04, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序数据识别前列腺癌中的恶性上皮细胞亚群及其分子特征,并构建了预测患者预后的风险评分模型 首次通过单细胞RNA测序和体内外实验验证KLHL17作为前列腺癌的预后标志物 NA 深入理解前列腺癌的异质性并识别潜在的治疗靶点 前列腺癌中的恶性上皮细胞及其分子特征 数字病理学 前列腺癌 单细胞RNA测序 风险评分模型 RNA测序数据 NA NA NA NA NA
13932 2024-10-08
Single-cell RNA sequencing reveals peripheral immunological features in Parkinson's Disease
2024-Oct-04, NPJ Parkinson's disease
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了帕金森病患者和健康对照者的外周血单个核细胞中的免疫特征 首次揭示了NK细胞在帕金森病进展中的关键作用及其与疾病严重程度的正相关性 研究样本量有限,需要进一步验证和扩大样本以确认结果的普遍性 探讨帕金森病患者外周免疫反应与疾病严重程度之间的关系 帕金森病患者和健康对照者的外周血单个核细胞 数字病理学 帕金森病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 包括早期和晚期帕金森病患者及健康对照者的外周血单个核细胞样本 NA NA NA NA
13933 2024-10-08
Exploring the prognostic and diagnostic value of lactylation-related genes in sepsis
2024-10-04, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究探讨了乳酸化相关基因在脓毒症中的预后和诊断价值 首次识别出与脓毒症相关的55个乳酸化基因,并通过多种分析方法验证了这些基因的预后和诊断价值 样本量较小,且仅限于中国西南医科大学附属医院的患者 研究乳酸化相关基因在脓毒症中的预后和诊断作用 脓毒症患者和健康个体的血液样本 NA 脓毒症 RNA测序、单细胞RNA测序、基因本体论分析、京都基因与基因组百科全书分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络分析 NA RNA序列数据 20名脓毒症患者和10名健康个体的血液样本,以及5个外周血样本用于单细胞RNA测序 NA NA NA NA
13934 2024-10-08
Leveraging explainable deep learning methodologies to elucidate the biological underpinnings of Huntington's disease using single-cell RNA sequencing data
2024-Oct-04, BMC genomics IF:3.5Q2
研究论文 利用可解释深度学习方法阐明亨廷顿病生物学基础的研究 使用单细胞RNA测序数据和残差神经网络(ResNet)模型,结合SHapley Additive exPlanations(SHAP)算法,揭示了影响亨廷顿病预测的基因及其在病理生物学中的作用 尽管模型在测试集上的F1分数达到96.53%,但仍存在一定的局限性 阐明亨廷顿病病理学的潜在机制 亨廷顿病细胞与健康细胞的差异基因表达模式 数字病理学 亨廷顿病 单细胞RNA测序 残差神经网络(ResNet) 基因表达数据 NA NA NA NA NA
13935 2024-10-08
Deep learning to estimate response of concurrent chemoradiotherapy in non-small-cell lung carcinoma
2024-Oct-04, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本文构建了一个深度学习模型,用于预测非小细胞肺癌患者在接受同步放化疗后的反应,并探索了相关的生物信号通路 首次使用深度学习模型预测非小细胞肺癌患者在接受同步放化疗后的反应 NA 开发和验证一个深度学习模型,用于预测非小细胞肺癌患者在接受同步放化疗后的反应 非小细胞肺癌患者在接受同步放化疗后的反应 机器学习 肺癌 深度学习 ResNet50 图像 229名非小细胞肺癌患者 NA NA NA NA
13936 2024-10-08
Uncovering the role of traditional Chinese medicine in immune-metabolic balance of gastritis from the perspective of Cold and Hot: Jin Hong Tablets as a case study
2024-Oct-04, Chinese medicine IF:5.3Q1
研究论文 本研究探讨了传统中药在慢性胃炎免疫代谢平衡中的作用,特别是从寒热角度出发,以金红片为例进行分析 首次结合转录组数据和机器学习算法,揭示了寒热证型慢性胃炎的分子特征及其对应中药的作用机制 样本量较小,且仅基于转录组数据进行分析,缺乏更全面的生物学验证 探讨传统中药在慢性胃炎免疫代谢平衡中的作用机制 慢性胃炎患者及其寒热证型,以及金红片等中药配方 机器学习 胃炎 转录组测序 机器学习算法 转录组数据 35名寒热证型慢性胃炎患者和3例单细胞RNA测序样本 NA NA NA NA
13937 2024-10-08
ERP29 regulates the proliferation of endometrial carcinoma via M6A modification
2024-Oct-01, Life sciences IF:5.2Q1
研究论文 研究ERP29通过M6A修饰调控子宫内膜癌增殖的作用 首次揭示了ERP29在子宫内膜癌中的高表达及其通过M6A修饰调控癌细胞增殖的机制 研究主要基于GEO和TCGA数据库,缺乏体内实验验证 探讨ERP29和M6A在子宫内膜癌进展中的作用 ERP29基因、M6A修饰及其对子宫内膜癌细胞增殖的影响 数字病理学 子宫内膜癌 WGCNA、机器学习算法、scRNA-seq、qPCR、Western blot、免疫组化、m6A Dot blot、MeRIP-qPCR NA 基因表达数据 基于GEO和TCGA数据库的多个样本 NA NA NA NA
13938 2024-10-08
Proteomic Analysis Reveals Oxidative Phosphorylation and JAK-STAT Pathways Mediated Pathogenesis of Pemphigus Vulgaris
2024-Oct, Experimental dermatology IF:3.5Q1
研究论文 本研究通过蛋白质组学分析揭示了寻常型天疱疮发病机制中氧化磷酸化和JAK-STAT通路的潜在作用 首次通过蛋白质组学和单细胞RNA测序技术揭示了寻常型天疱疮中氧化磷酸化和JAK-STAT通路的激活 研究仅限于体外细胞模型,尚未在临床试验中验证 阐明寻常型天疱疮的信号机制 寻常型天疱疮患者和健康志愿者的皮肤样本 蛋白质组学 自身免疫性疾病 LC-MS/MS, scRNA-seq NA 蛋白质, 单细胞RNA 880, 605, 586个差异表达蛋白 NA NA NA NA
13939 2024-10-08
RNA Sequencing Reveals a Strong Predominance of THRA Splicing Isoform 2 in the Developing and Adult Human Brain
2024-Sep-13, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 研究通过RNA测序分析了人类大脑发育和成年期THRA剪接异构体2的表达情况 首次在健康人体组织和发育中的大脑中研究了THRA1和THRA2剪接异构体的表达模式 研究仅限于RNA测序数据,未涉及蛋白质水平的验证 探讨THRA剪接异构体在人类大脑发育和成年期的表达模式 THRA1和THRA2剪接异构体在人类大脑和中枢神经系统的表达 基因表达 NA RNA测序 NA RNA 四个bulk RNA-seq数据集和两个scRNA-seq数据集 NA NA NA NA
13940 2024-10-08
Single-cell and spatially resolved transcriptomics for liver biology
2024-09-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
综述 本文综述了单细胞和空间转录组学技术在肝脏生物学中的应用,涵盖了肝脏稳态、发育、再生、慢性肝病和癌症等方面的关键生物学见解 本文介绍了肝脏细胞图谱的最新进展,包括细胞组成的全面特征、多样性和功能、空间结构如肝脏分区、细胞通信和邻近关系、细胞身份转换和与肝脏病理相关的细胞特异性改变,以及新的治疗靶点 本文讨论了当前研究中的突出挑战,并提出了先进的实验技术和计算方法来解决这些挑战 综述单细胞和空间转录组学技术在肝脏生物学中的应用,并讨论相关技术的进展和挑战 肝脏稳态、发育、再生、慢性肝病和癌症 基因组学 肝病 单细胞转录组学、空间转录组学 NA 转录组数据 NA NA NA NA NA
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