单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27536 篇文献，本页显示第 13921 - 13940 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 13921 | 2024-08-04 |
Machine learning combined with single-cell analysis reveals predictive capacity and immunotherapy response of T cell exhaustion-associated lncRNAs in uterine corpus endometrial carcinoma
2024-05, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111077
PMID:38311301
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研究论文 | 本研究建立了与 T 细胞耗竭相关的长链非编码 RNA 在子宫体内膜癌中的预测模型并研究了其免疫特征 | 首次探讨了与 T 细胞耗竭相关的长链非编码 RNA 在子宫体内膜癌中的作用，并建立了相关的预测模型 | 研究主要基于公共数据库的数据，可能存在信息的偏倚和不足 | 建立与子宫体内膜癌 T 细胞耗竭相关的长链非编码 RNA 的预测模型 | 与 T 细胞耗竭相关的长链非编码 RNA | 数字病理学 | 子宫体内膜癌 | 转录组和单细胞测序 | 逻辑回归模型 | 基因表达数据 | 使用癌症基因组图谱和基因表达综合数据库中的数据，具体样本数量未提及 |
| 13922 | 2024-08-07 |
Multi-omics reveals the switch role of abnormal methylation in the regulation of decidual macrophages function in recurrent spontaneous abortion
2024-05, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111071
PMID:38295895
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研究论文 | 本文通过整合转录组学、DNA甲基化组学和单细胞RNA测序，探讨了DNA甲基化与蜕膜细胞在复发性自然流产中的调控关系 | 首次系统地描绘了异常DNA甲基化在调控蜕膜巨噬细胞功能中的作用，为复发性自然流产的发生机制提供了新的见解 | NA | 阐明DNA甲基化与蜕膜细胞在复发性自然流产中的调控关系 | 复发性自然流产中的DNA甲基化和蜕膜细胞功能 | 数字病理学 | 生殖系统疾病 | 转录组学、DNA甲基化组学、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据、DNA甲基化数据、单细胞RNA测序数据 | 涉及22个低甲基化的CpG位点和16个关键通路 |
| 13923 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the MIF-ACKR3 receptor-ligand interaction between iCAFs and tumor cells in esophageal squamous cell carcinoma
2024-05, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111093
PMID:38336189
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了食管鳞状细胞癌（ESCC）样本，揭示了肿瘤微环境中iCAFs与肿瘤细胞之间的MIF-ACKR3受体-配体相互作用。 | 本研究首次在ESCC中发现并验证了iCAFs与肿瘤细胞之间的MIF-ACKR3相互作用，并揭示了其在肿瘤细胞迁移和侵袭中的作用。 | 研究主要基于GEO数据库中的ESCC样本进行单细胞RNA测序分析，可能存在样本选择偏倚。 | 深入理解食管鳞状细胞癌的肿瘤微环境异质性，并识别新的治疗靶点。 | 食管鳞状细胞癌（ESCC）的肿瘤微环境及其细胞间的相互作用。 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 31,283个单细胞 |
| 13924 | 2024-08-07 |
Histone deacetylase 6 suppression of renal tubular epithelial cell promotes interstitial mineral deposition via alpha-tubulin acetylation
2024-04, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111057
PMID:38242268
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研究论文 | 本研究探讨了组蛋白去乙酰化酶6（HDAC6）在肾小管上皮细胞中的抑制作用及其通过α-微管蛋白乙酰化促进间质矿物沉积的机制 | 研究发现HDAC6的抑制加剧了MDCK细胞中的矿物沉积，而其过表达则减轻了这一现象，表明HDAC6在调节肾小管上皮细胞矿物沉积中起关键作用 | 研究未观察到与矿物沉积增加相关的成骨相关蛋白表达增加，且单细胞RNA测序结果显示上皮细胞的钙化活性较低，提示成骨性转分化可能并未实际发生 | 探讨HDAC6在肾小管上皮细胞中的作用及其对间质矿物沉积的影响 | 肾小管上皮细胞、高草酸尿大鼠的肾脏组织、体外培养的MDCK细胞及NRK49F细胞 | NA | 肾结石 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及肾乳头样本的单细胞RNA测序 |
| 13925 | 2024-08-04 |
Single cell atlas of Xenoturbella bocki highlights limited cell-type complexity
2024-Mar-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45956-y
PMID:38503762
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研究论文 | 这篇文章展示了对海洋生物Xenoturbella bocki进行单细胞RNA测序的研究，突出了其细胞类型的复杂性有限。 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了Xenacoelomorpha的细胞类型补充，提供了与其他动物的比较。 | 研究主要集中在单一物种上，可能无法全面代表整个Xenacoelomorpha门的细胞类型多样性。 | 探索Xenacoelomorpha中的细胞类型及其与其他生物的关系，理解动物细胞类型演化。 | 研究对象为海洋生物Xenoturbella bocki及其细胞类型。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 涉及Xenoturbella bocki的样本 |
| 13926 | 2024-08-07 |
Long-term effects of Omicron BA.2 breakthrough infection on immunity-metabolism balance: a 6-month prospective study
2024-Mar-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46692-z
PMID:38503738
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研究论文 | 本研究追踪了轻度BA.2突破性感染康复者在六个月内的免疫代谢平衡情况 | 首次详细探讨了Omicron BA.2突破性感染后长期免疫代谢失衡的机制和病理特征 | 研究仅限于轻度BA.2突破性感染康复者，可能无法完全代表所有感染情况 | 评估COVID-19长期影响及Omicron突破性感染后的免疫恢复情况，为理解疾病和新一代疫苗管理提供依据 | 轻度BA.2突破性感染康复者 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 血液检测数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 13927 | 2024-08-07 |
CD38-RyR2 axis-mediated signaling impedes CD8+ T cell response to anti-PD1 therapy in cancer
2024-Mar-12, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2315989121
PMID:38451948
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研究论文 | 本文探讨了CD38通过RyR2轴介导的信号传导如何阻碍CD8+ T细胞对PD1阻断疗法的反应，并提出通过靶向CD38来提高抗PD1治疗癌症的疗效。 | 首次揭示了CD38通过RyR2钙通道激活导致细胞内钙水平升高，进而促进AKT慢性激活和TCF1表达抑制，导致CD8+ T细胞对PD1阻断疗法的抵抗。 | 研究主要在体外和小鼠模型中进行，需要进一步的人体临床试验来验证其效果。 | 研究CD38在CD8+ T细胞中的作用机制，以及如何通过靶向CD38提高抗PD1治疗的疗效。 | CD8+ T细胞、CD38、RyR2、PD1阻断疗法。 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 体外慢性刺激和肿瘤内CD8+ T细胞 |
| 13928 | 2024-08-04 |
Region-specific cellular and molecular basis of liver regeneration after acute pericentral injury
2024-03-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2024.01.013
PMID:38402618
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研究论文 | 本研究探讨了急性中心周围损伤后肝脏再生的细胞和分子基础 | 使用Cyp2e1-DreER追踪肝脏再生，并揭示了mTOR/4E-BP1轴和乳酸脱氢酶A在中心周围再生中的重要作用 | 研究主要集中在特定的损伤模式上，可能不适用于所有类型的肝脏损伤 | 研究急性中心周围损伤后肝脏的再生机制 | 重点关注中心周围肝细胞及其再生反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、免疫染色、体内功能测定 | NA | NA | 使用Cyp2e1-DreER命运追踪系统进行的实验，样本数量未具体说明 |
| 13929 | 2024-08-07 |
Canonical Wnt signaling directs the generation of functional human PSC-derived atrioventricular canal cardiomyocytes in bioprinted cardiac tissues
2024-03-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2024.01.008
PMID:38366588
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序分析和3D生物打印技术，发现阶段特异性激活的规范Wnt信号通路可以生成功能性的人类多能干细胞衍生的房室管（AVC）心肌细胞 | 首次发现规范Wnt信号通路在体外调控AVC心肌细胞分化的关键作用，并提供了一种用于功能性人心脏生物制造的关键细胞来源 | NA | 探索生成功能性3D生物打印人类心脏的方法 | 房室管（AVC）心肌细胞 | 生物工程 | NA | 单细胞RNA测序分析，3D生物打印技术 | NA | 细胞 | NA |
| 13930 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics reveal neuron-astrocyte synergy in long-term memory
2024-Mar, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-07011-6
PMID:38326616
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研究论文 | 使用空间转录组学研究神经元与星形胶质细胞在长期记忆中的协同作用 | 揭示了脑下部杏仁体内存储长期记忆的神经元和星形胶质细胞的转录特征 | 未提及具体的局限性 | 探讨脑下部杏仁体在长期记忆形成中的细胞和分子机制 | 脑下部杏仁体的神经元和星形胶质细胞亚群 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学和单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了完整切片的单细胞样本 |
| 13931 | 2024-08-07 |
A prognostic model based on Scissor+ cancer associated fibroblasts identified from bulk and single cell RNA sequencing data in head and neck squamous cell carcinoma
2024-02, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2023.110984
PMID:38029947
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研究论文 | 本文通过结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，识别出与头颈鳞状细胞癌（HNSCC）不良预后相关的成纤维细胞亚群，并构建了一个预测HNSCC患者生存概率的风险模型 | 首次结合单细胞和批量RNA测序数据，识别出与HNSCC不良预后相关的成纤维细胞亚群，并构建了预测模型 | 需要进一步的实验验证和临床试验来验证模型的准确性和实用性 | 识别与头颈鳞状细胞癌预后相关的成纤维细胞亚群，并构建预测模型 | 头颈鳞状细胞癌患者的成纤维细胞亚群及其预后相关基因 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | 风险模型 | RNA测序数据 | 使用The Cancer Genome Atlas (TCGA)和Gene Expression Omnibus (GEO)数据库中的数据进行验证 |
| 13932 | 2024-08-04 |
Comparative and integrative single cell analysis reveals new insights into the transcriptional immaturity of stem cell-derived β cells
2024-Jan-24, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10013-x
PMID:38267908
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研究论文 | 文章探讨了干细胞衍生的β细胞（SC-β细胞）的转录身份，尤其是与原代胎儿和成年β细胞的关系 | 揭示了SC-β细胞具有独特的转录特征，特别是持续表达和激活前体和神经偏向基因网络 | 尚未明确SC-β细胞与原代β细胞的关系，需要进一步研究 | 研究干细胞衍生β细胞的转录身份及其发育过程中神经转录网络的作用 | 研究对象为干细胞衍生的β细胞、胎儿β细胞和成年β细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞测序 | NA | 转录数据 | NA |
| 13933 | 2024-08-07 |
Decoding aging-dependent regenerative decline across tissues at single-cell resolution
2023-12-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.09.014
PMID:37898124
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，探讨了年轻和老年小鼠八个组织中再生能力的年龄依赖性下降机制 | 揭示了老年组织中再生过程减弱的细胞和分子机制，特别是干细胞移动能力受损和血管生成不足的影响 | NA | 解码年龄与再生能力之间的关系 | 年轻和老年小鼠的八个组织 | 生物学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 年轻和老年小鼠的八个组织 |
| 13934 | 2024-08-07 |
Generation of transgene-free hematopoietic stem cells from human induced pluripotent stem cells
2023-12-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.11.002
PMID:38065068
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研究论文 | 本文通过一种原创的一步培养系统，从人诱导多能干细胞（hiPSCs）中分化出无载体和基质的可移植造血干细胞（HSCs） | 首次成功从hiPSCs中生成无载体和基质的可移植HSCs，并展示了其在免疫缺陷小鼠中的多系造血能力 | NA | 研究从多能干细胞生成造血干细胞的可行性，并帮助识别人类个体发育过程中HSC产生的关键调控因子 | 人诱导多能干细胞（hiPSCs）和造血干细胞（HSCs） | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 13935 | 2024-08-05 |
Tissue morphology influences the temporal program of human brain organoid development
2023-10-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.09.003
PMID:37802039
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研究论文 | 本文研究了组织形态如何影响人脑类器官的发展时间程序 | 创新点在于揭示了组织形态对细胞命运决策的影响，并通过单核RNA测序和空间转录组学分析了这种相互作用 | 研究的局限性在于实验模型的复杂性可能影响结果的推广性 | 研究的目的是探讨组织形态如何影响细胞命运和组织架构的相互作用 | 研究对象为人类脑类器官及其发育过程中的细胞命运变化 | 数字病理 | NA | snRNA-seq 和空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 13936 | 2024-08-07 |
CCL21-DC in situ vaccination in murine NSCLC overcomes resistance to immunotherapy and generates systemic tumor-specific immunity
2023-09, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-006896
PMID:37730274
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研究论文 | 本研究探讨了CCL21-DC在位疫苗与免疫检查点抑制剂联合治疗在小鼠非小细胞肺癌（NSCLC）中的应用，旨在克服免疫治疗抵抗并产生系统性肿瘤特异性免疫 | CCL21-DC在位疫苗能够增强免疫抵抗性小鼠NSCLC对免疫检查点抑制剂的敏感性，并建立肿瘤特异性免疫记忆 | NA | 研究CCL21-DC在位疫苗与免疫检查点抑制剂联合治疗对小鼠NSCLC的疗效 | 具有不同驱动突变的小鼠NSCLC模型 | 数字病理学 | 非小细胞肺癌 | 流式细胞术，单细胞RNA测序，全外显子测序 | NA | 细胞 | 具有不同驱动突变的小鼠NSCLC模型（KrasG12D/P53+/-/Lkb1-/- (KPL); KrasG12D/P53+/- (KP); 和 KrasG12D (K)) |
| 13937 | 2024-08-07 |
Construction of a cross-species cell landscape at single-cell level
2023-01-25, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac633
PMID:35929025
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术构建了跨物种的细胞图谱，涵盖了小鼠、斑马鱼和果蝇等多个生命阶段。 | 首次实现了跨物种的细胞景观动态比较，并识别了生命周期中变化的特征和共同通路。 | NA | 研究不同物种的细胞异质性及其在生命周期中的变化。 | 小鼠、斑马鱼和果蝇的细胞景观。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞数据 | 超过260万个单细胞 |
| 13938 | 2024-08-07 |
Pathogen Cell-to-Cell Variability Drives Heterogeneity in Host Immune Responses
2015-Sep-10, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2015.08.027
PMID:26343579
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研究论文 | 本文开发了一种结合单细胞RNA测序和荧光标记的实验系统，用于研究单个巨噬细胞对入侵沙门氏菌的反应，并揭示了细菌因子活性的异质性如何影响宿主免疫反应的多样性 | 首次展示了细菌群体中PhoPQ活性的变异性如何通过改变LPS驱动宿主I型IFN反应的变异性，证明了宿主和细菌变异性之间的因果关系 | NA | 研究免疫细胞与入侵细菌之间的相互作用，特别是细胞间变异对感染结果的影响 | 单个巨噬细胞对入侵沙门氏菌的反应 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 13939 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics using spliced leader PCR: Evidence for multiple losses of photosynthesis in polykrikoid dinoflagellates
2015-Jul-17, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-015-1636-8
PMID:26183220
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研究论文 | 本文利用拼接领导者PCR（SLPCR）技术，对海洋沉积物中的单细胞多克里科斯·勒布里亚（Polykrikos lebouriae）进行转录组分析，探讨其光合作用的丢失情况 | 本文首次使用SLPCR技术对单细胞多克里科斯·勒布里亚进行转录组分析，并发现其保留了祖先的peridinin质体，而其近亲则独立地多次丢失了光合作用 | NA | 探讨多克里科斯·勒布里亚的光合作用丢失情况及其在多克里科斯类甲藻中的意义 | 多克里科斯·勒布里亚（Polykrikos lebouriae） | 基因组学 | NA | 拼接领导者PCR（SLPCR） | NA | 转录组 | 单细胞分离物 |
| 13940 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics systematically discloses the immune-inflammatory responses of peripheral blood mononuclear cells for diabetic nephropathy
2024-Jul, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2023.06.007
PMID:38510479
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |