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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 13901 - 13920 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 13901 | 2024-10-09 |
RNA-seq and bulk RNA-seq data analysis of cancer-related fibroblasts (CAF) in LUAD to construct a CAF-based risk signature
2024-10-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-74336-1
PMID:39369095
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研究论文 | 研究通过分析LUAD中的CAF相关RNA-seq数据，构建了一个基于CAF的风险特征，用于预测LUAD患者的预后 | 构建了一个新的基于CAF的风险特征，并验证了其在预测LUAD预后和免疫治疗反应中的有效性 | NA | 开发一种基于CAF的风险特征，用于预测LUAD患者的预后和免疫治疗反应 | LUAD中的CAF及其相关基因表达数据 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA-seq | Lasso回归 | RNA-seq数据 | 2811个差异表达基因，其中1002个与CAF簇显著相关 | NA | NA | NA | NA |
| 13902 | 2024-10-09 |
Lumican promotes calcific aortic valve disease through H3 histone lactylation
2024-Oct-05, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehae407
PMID:38976370
|
研究论文 | 研究揭示了lumican在钙化性主动脉瓣疾病（CAVD）中的关键调节作用，特别是通过H3组蛋白乳酸化促进钙化过程 | 首次发现lumican通过介导H3组蛋白乳酸化促进主动脉瓣钙化 | NA | 探讨lumican在钙化性主动脉瓣疾病中的作用机制 | 主动脉瓣间质细胞（VICs）及其在钙化过程中的转变 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 9个人类主动脉瓣 | NA | NA | NA | NA |
| 13903 | 2024-10-09 |
Imputing spatial transcriptomics through gene network constructed from protein language model
2024-Oct-05, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06964-2
PMID:39369061
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研究论文 | 本文介绍了一种基于蛋白质语言模型构建基因网络的空间转录组学插补方法stImpute | stImpute利用蛋白质语言模型ESM-2构建基因网络，通过图神经网络进行基因表达插补，显著提高了插补和聚类的准确性 | NA | 开发一种新的计算方法来克服空间转录组学中基因数量有限的挑战 | 空间转录组学数据和单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 图神经网络 | 基因表达数据 | 多个数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 13904 | 2024-10-09 |
Spatial multi-omics in whole skeletal muscle reveals complex tissue architecture
2024-Oct-05, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06949-1
PMID:39369093
|
研究论文 | 本文通过结合RNA断层扫描和质谱成像技术，揭示了小鼠胫骨前肌的完整组织结构 | 首次在全组织水平上展示了基因表达、代谢差异和肌纤维类型比例的区域化特征 | NA | 阐明骨骼肌的完整组织结构 | 小鼠胫骨前肌的基因表达、代谢和脂质组织 | 数字病理学 | NA | RNA断层扫描和质谱成像 | NA | 空间转录组学、空间代谢组学和空间脂质组学数据 | 小鼠胫骨前肌、趾长伸肌和比目鱼肌 | NA | NA | NA | NA |
| 13905 | 2024-10-09 |
C-ziptf: stable tensor factorization for zero-inflated multi-dimensional genomics data
2024-Oct-05, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05886-4
PMID:39369208
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研究论文 | 本文介绍了一种新的零膨胀多维基因组数据分解方法，名为零膨胀泊松张量分解（ZIPTF），并提出了共识ZIPTF（C-ZIPTF）以解决随机性问题 | 提出了ZIPTF和C-ZIPTF方法，能够有效处理零膨胀的多维基因组数据，并在重建精度和一致性方面优于传统方法 | NA | 开发一种能够有效处理零膨胀多维基因组数据的稳定张量分解方法 | 零膨胀的多维基因组数据，特别是单细胞RNA测序数据 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 张量分解（TF） | 基因组数据 | 涉及合成数据、模拟scRNA-seq数据和真实的多样本多条件scRNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA |
| 13906 | 2024-10-09 |
Antagonistic effects of the cytotoxic molecules granzyme B and TRAIL in the immunopathogenesis of sclerosing cholangitis
2024-10-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000830
PMID:38441998
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研究论文 | 研究了细胞毒性分子GzmB和TRAIL在硬化性胆管炎免疫发病机制中的拮抗作用 | 首次揭示了GzmB和TRAIL在硬化性胆管炎中的不同作用机制，GzmB促进细胞凋亡和纤维化，而TRAIL则调节炎症和细胞毒性免疫反应，减少肝损伤和纤维化 | 研究主要基于Mdr2-/-小鼠模型和患者样本，可能不完全适用于所有硬化性胆管炎病例 | 探讨GzmB和TRAIL在硬化性胆管炎中的作用及其对疾病进展的影响 | 硬化性胆管炎患者样本和Mdr2-/-小鼠 | NA | 肝病 | 单细胞RNA测序、多参数流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | 患者样本和Mdr2-/-小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 13907 | 2024-10-09 |
COFFEE: consensus single cell-type specific inference for gene regulatory networks
2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae457
PMID:39311699
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研究论文 | 本文介绍了一种基于Borda投票的共识算法COFFEE，用于从单细胞RNA测序数据中推断基因调控网络 | COFFEE算法通过整合10种已建立的基因调控网络推断方法，提高了在合成、精选和实验数据集上的性能 | COFFEE算法目前仅在10种算法上进行了基准测试，未来可能需要扩展到更多算法 | 开发一种适用于单细胞RNA测序数据的共识基因调控网络推断方法 | 单细胞RNA测序数据中的基因调控网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 共识算法 | 基因调控网络 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 13908 | 2024-10-09 |
Application of Unsupervised Multi-Omic Factor Analysis to Uncover Patterns of Variation and Molecular Processes Linked to Cardiovascular Disease
2024-Sep-20, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66659
PMID:39373483
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研究论文 | 本文展示了一种无监督的多组学因子分析方法，用于揭示与心血管疾病相关的变异模式和分子过程 | 本文提出了多组学因子分析（MOFA）方法，用于无监督地分析复杂的多组学数据集，揭示主要的变异轴和相关的分子特征 | 本文主要集中在心血管疾病的急性冠状动脉综合征和慢性冠状动脉综合征，未涵盖其他疾病类型 | 研究目的是通过多组学数据分析，揭示与心血管疾病相关的分子过程和变异模式 | 研究对象包括急性冠状动脉综合征和慢性冠状动脉综合征患者的血液样本 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 多组学因子分析（MOFA） | NA | 多组学数据 | 多个患者的血液样本，包括不同时间点的测量数据 | NA | NA | NA | NA |
| 13909 | 2024-10-09 |
The aminophospholipid transporter, ATP8B3, as a potential biomarker and target for enhancing the therapeutic effect of PD-L1 blockade in colon adenocarcinoma
2024-Sep, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2024.110907
PMID:39074670
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研究论文 | 研究探讨了ATP8B3作为结肠腺癌潜在生物标志物和靶点，以增强PD-L1阻断疗法的疗效 | 发现ATP8B3在MSI-H结肠腺癌患者中与PD-L1表达相关，抑制ATP8B3可增加PD-L1疗法的敏感性 | 研究主要集中在MSI-H亚型，MSS亚型的结果有限 | 探索ATP8B3在结肠腺癌中的作用，评估其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 结肠腺癌患者及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 结肠腺癌 | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、siRNA、shRNA、western blot分析、流式细胞术 | NA | RNA | 使用TCGA和GEO数据库中的数据，具体样本数量未明确提及 | NA | NA | NA | NA |
| 13910 | 2024-10-09 |
Exploring public cancer gene expression signatures across bulk, single-cell and spatial transcriptomics data with signifinder Bioconductor package
2024-Sep, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqae138
PMID:39363890
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研究论文 | 本文介绍了一个名为signifinder的R Bioconductor包，用于在批量、单细胞和空间转录组数据中探索和使用公共癌症基因表达特征 | 开发了signifinder包，整合了批量、单细胞和空间转录组数据中的癌症基因表达特征，提供了一个全面的框架来解释高分辨率数据并解决肿瘤复杂性 | NA | 探索癌症机制、定义亚型、预测预后和评估治疗效果 | 癌症基因表达特征在批量、单细胞和空间转录组数据中的应用 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 13911 | 2024-10-09 |
A Bioinformatics-Based Study on Methylation Alterations of the FBLN1 Gene in Hippocampal Tissue of Alzheimer's Disease Model DKO and DTG Mice
2024-Aug-20, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25169036
PMID:39201719
|
研究论文 | 本研究探讨了阿尔茨海默病模型DKO和DTG小鼠海马组织中FBLN1基因的甲基化变化 | 首次通过单细胞测序和实验方法验证了FBLN1基因在阿尔茨海默病中的异常甲基化状态及其与疾病的相关性 | 样本量较小，仅限于DKO和DTG小鼠模型 | 研究阿尔茨海默病中海马组织FBLN1基因的甲基化变化及其与疾病的关系 | DKO和DTG小鼠海马组织中的FBLN1基因 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序、RT-PCR、Western blotting、Reduced Representation Bisulfite Sequencing | NA | 基因组DNA、mRNA、蛋白质 | DKO、DTG和CBAC57小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 13912 | 2024-10-09 |
Simple aneuploidy evades p53 surveillance and promotes niche factor-independent growth in human intestinal organoids
2024-Aug-01, Molecular biology of the cell
IF:3.1Q3
DOI:10.1091/mbc.E24-04-0166
PMID:38985518
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研究论文 | 本文研究了简单非整倍体在人类肠道类器官中逃避p53监控并促进非微环境因子依赖性生长的机制 | 发现简单非整倍体细胞能够逃避p53监控，并可能促进癌症起始结肠干细胞的非微环境因子依赖性生长 | NA | 探讨非整倍体在癌症早期演化中的作用 | 人类结肠类器官中的非整倍体细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 非整倍体诱导的人类结肠类器官 | NA | NA | NA | NA |
| 13913 | 2024-10-09 |
Human IL-6 fosters long-term engraftment of patient-derived disease-driving myeloma cells in immunodeficient mice
2024-May-07, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.177300
PMID:38713510
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研究论文 | 研究展示了人IL-6转基因NSG小鼠支持恶性及前恶性人浆细胞的植入，并建立了一个有效的患者来源的异种移植模型 | 首次展示了NSG+hIL6小鼠作为多发性骨髓瘤及相关浆细胞疾病的有效患者来源异种移植模型 | NA | 建立一个有效的动物模型来重现人类多发性骨髓瘤及相关浆细胞疾病 | 多发性骨髓瘤及相关浆细胞疾病 | NA | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括单克隆丙种球蛋白病、前及复发后骨髓瘤、浆细胞白血病和轻链淀粉样变性的患者来源的浆细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 13914 | 2024-10-09 |
Brief Report: Comprehensive Clinicogenomic Profiling of Small Cell Transformation From EGFR-Mutant NSCLC Informs Potential Therapeutic Targets
2024-Feb, JTO clinical and research reports
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.jtocrr.2023.100623
PMID:38357092
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研究论文 | 本研究对EGFR突变型非小细胞肺癌转化为小细胞肺癌的患者进行了临床和基因组特征的回顾性分析，并探讨了潜在的治疗靶点 | 首次对EGFR突变型非小细胞肺癌转化为小细胞肺癌的患者进行了全面的临床基因组分析，并揭示了潜在的治疗靶点 | 研究样本量较小，需要进一步的大规模研究来验证结果 | 探讨EGFR突变型非小细胞肺癌转化为小细胞肺癌的临床和基因组特征，并寻找潜在的治疗靶点 | EGFR突变型非小细胞肺癌转化为小细胞肺癌的患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 下一代测序（NGS）、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据、临床数据 | 34例患者 | NA | NA | NA | NA |
| 13915 | 2024-10-09 |
MerTK-dependent efferocytosis by monocytic-MDSCs mediates resolution of post-lung transplant injury
2024-Jan-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.18.576261
PMID:38328174
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研究论文 | 研究探讨了MerTK依赖的单核细胞来源的髓系抑制细胞（M-MDSCs）在肺移植后缺血再灌注损伤（IRI）中的作用 | 首次揭示了MerTK在M-MDSCs中的作用，通过吞噬凋亡细胞促进肺IRI的恢复 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探讨MerTK在M-MDSCs中的作用，以促进肺移植后IRI的恢复 | 肺移植患者和小鼠模型中的M-MDSCs | 数字病理学 | 肺移植相关疾病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | RNA序列数据 | 包括肺移植患者和小鼠模型的多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 13916 | 2024-10-09 |
Pain sensitivity genes as therapeutic targets in knee osteoarthritis: A comprehensive analysis
2024 Jan-Dec, Molecular pain
IF:2.8Q2
DOI:10.1177/17448069241289961
PMID:39313491
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研究论文 | 本研究系统分析了疼痛敏感基因在膝骨关节炎中的作用，并探讨了其作为治疗靶点的潜力 | 通过综合分析RNA-seq数据和单细胞RNA-seq数据，识别出关键的疼痛敏感基因，并验证了其在膝骨关节炎中的重要作用 | NA | 探讨疼痛敏感基因在膝骨关节炎中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 疼痛敏感基因在膝骨关节炎患者中的表达和作用 | 生物信息学 | 骨关节炎 | RNA-seq | LASSO, SVM, 随机森林 | RNA-seq数据 | 涉及GSE114007、GSE169077、GSE152805、GSE133449和GSE104782等多个数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 13917 | 2024-10-09 |
The single-cell transcriptome of mTECs and CD4+ thymocytes under adhesion revealed heterogeneity of mTECs and a network controlled by Aire and lncRNAs
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1376655
PMID:39328409
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研究论文 | 研究了在粘附过程中，自身免疫调节因子（Aire）基因缺陷对胸腺髓质上皮细胞（mTECs）和CD4+胸腺细胞单细胞转录组的影响 | 揭示了mTECs在转录组水平上的异质性，并发现Aire和长链非编码RNAs（lncRNAs）在调控mTECs和胸腺细胞网络中的作用 | NA | 探讨Aire基因缺陷对胸腺髓质上皮细胞和胸腺细胞在粘附过程中的影响 | 胸腺髓质上皮细胞（mTECs）和CD4+胸腺细胞 | 基因表达 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 野生型（WT）和Aire缺陷型（Aire-deficient）mTECs与WT单阳性（SP）CD4胸腺细胞共培养的单细胞库 | NA | NA | NA | NA |
| 13918 | 2024-10-09 |
The Role of Polycystic Kidney Disease-Like Homologs in Planarian Nervous System Regeneration and Function
2024, Integrative organismal biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/iob/obae035
PMID:39364443
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研究论文 | 研究了多囊肾病样同源基因在涡虫神经系统再生和功能中的作用 | 首次全面研究了涡虫基因组中所有基因在感觉神经元中的表达和功能，并开发了用于机械感觉刺激的自动化设置 | 对数十种神经元亚型的功能了解仍然有限 | 探讨多囊肾病样同源基因在涡虫神经系统再生和功能中的作用 | 涡虫的感觉神经元及其在机械刺激和食物检测中的功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涡虫的无性和雌雄同体品系 | NA | NA | NA | NA |
| 13919 | 2024-10-09 |
Altered immune cell in human severe acute pancreatitis revealed by single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1354926
PMID:39372399
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了严重急性胰腺炎患者中免疫细胞的变化 | 首次构建了严重急性胰腺炎患者外周血单细胞图谱，并发现了一种表达高水平PPBP和PF4的新型单核细胞亚群 | 样本量较小，仅包括7名未治疗的严重急性胰腺炎患者 | 研究严重急性胰腺炎中特定免疫细胞亚型的变化及其机制，并识别预测急性胰腺炎严重程度的潜在生物标志物 | 严重急性胰腺炎患者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 胰腺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 7名未治疗的严重急性胰腺炎患者和6名健康对照 | NA | NA | NA | NA |
| 13920 | 2024-10-09 |
Prognosis of colorectal cancer, prognostic index of immunogenic cell death associated genes in response to immunotherapy, and potential therapeutic effects of ferroptosis inducers
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1458270
PMID:39372411
|
研究论文 | 本研究利用生物信息学和医学大数据整合了来自Gene Expression Omnibus (GEO)和The Cancer Genome Atlas (TCGA)的数据集，全面概述了免疫原性细胞死亡(ICD)相关基因在结直肠癌(CRC)中的表达 | 研究揭示了ICD相关基因在CRC中的分子通路和基因网络，并探讨了细胞死亡诱导剂（包括铁死亡诱导剂）的治疗潜力及其在精准医学中的应用 | NA | 阐明ICD在结直肠癌中的分子机制及其在治疗中的潜在应用 | 结直肠癌(CRC)中的免疫原性细胞死亡(ICD)相关基因 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 差异表达分析、共识聚类、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自GEO和TCGA的多个结直肠癌样本 | NA | NA | NA | NA |