单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27279 篇文献，本页显示第 13901 - 13920 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 13901 | 2024-08-04 |
Signaling Pathway Alterations Driven by BRCA1 and BRCA2 Germline Mutations are Sufficient to Initiate Breast Tumorigenesis by the PIK3CAH1047R Oncogene
2024-01-05, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-23-0330
PMID:38059556
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研究论文 | 本研究生成了BRCA1和BRCA2突变携带者乳腺组织的单细胞转录组图谱，并与健康非携带者进行了比较 | 首次揭示了BRCA1和BRCA2突变对乳腺上皮细胞转录组的特定影响，并阐明了其与肿瘤发生的关系 | 本研究的样本仅限于BRCA1和BRCA2突变携带者，未能涵盖所有类型的乳腺癌变异 | 研究BRCA1和BRCA2突变在乳腺肿瘤发生中的信号通路改变 | BRCA1和BRCA2突变携带者及健康非携带者的乳腺上皮细胞和间质细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | BRCA1和BRCA2突变携带者的乳腺组织样本与健康非携带者样本进行比较 |
| 13902 | 2024-08-04 |
Spatial Distribution of Immune Cells Drives Resistance to Neoadjuvant Chemotherapy in Triple-Negative Breast Cancer
2024-01-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-23-0076
PMID:37856875
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学探讨三阴性乳腺癌中免疫细胞的空间分布对新辅助化疗的影响 | 研究通过空间转录组学的方法，更深入地理解了三阴性乳腺癌生态系统的复杂元素及其与新辅助化疗反应之间的关系 | 研究基于回顾性病例系列，样本量相对较小，仅包含24名患者 | 旨在探索三阴性乳腺癌对新辅助化疗反应的机制 | 涉及24名三阴性乳腺癌患者，其中12名患者经历了病理完全反应，12名患者则未反应或疾病进展 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 24例三阴性乳腺癌患者 |
| 13903 | 2024-08-07 |
Bexmarilimab Activates Human Tumor-Associated Macrophages to Support Adaptive Immune Responses in Interferon-Poor Immune Microenvironments
2024-01-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-23-0350
PMID:37922365
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研究论文 | 本文研究了bexmarilimab在干扰素贫乏的免疫微环境中激活人肿瘤相关巨噬细胞以支持适应性免疫反应的作用。 | 首次揭示了bexmarilimab在低基线干扰素信号的巨噬细胞中效果最佳，并阐明了其在免疫冷肿瘤中的应用潜力。 | 目前尚不清楚bexmarilimab在个体患者中治疗结果的机制。 | 探讨bexmarilimab在卵巢癌腹水巨噬细胞中的反应，并评估其在免疫冷肿瘤中的治疗效果。 | 卵巢癌腹水巨噬细胞及bexmarilimab的治疗效果。 | 免疫学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 13904 | 2024-08-07 |
Combination of Anti-PD-1 and Electroacupuncture Induces a Potent Antitumor Immune Response in Microsatellite-Stable Colorectal Cancer
2024-01-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-23-0309
PMID:37956404
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研究论文 | 研究电针（EA）与抗PD-1联合治疗在微卫星稳定（MSS）结直肠癌中的抗肿瘤效果 | 首次探讨了电针与抗PD-1联合治疗在MSS结直肠癌中的应用，并发现这种联合疗法通过激活STING通路增强了肿瘤的免疫反应 | 研究主要在动物模型中进行，需要进一步的临床试验验证其安全性和有效性 | 探索电针与抗PD-1联合治疗在MSS结直肠癌中的抗肿瘤效果及机制 | 微卫星稳定的结直肠癌 | 肿瘤学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个MSS结直肠癌小鼠模型 |
| 13905 | 2024-08-04 |
BCG vaccination stimulates integrated organ immunity by feedback of the adaptive immune response to imprint prolonged innate antiviral resistance
2024-Jan, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-023-01700-0
PMID:38036767
|
研究论文 | 本研究探讨了BCG疫苗如何通过适应性免疫反应反馈刺激整合的器官免疫。 | 展示了BCG疫苗通过CD4 T细胞在组织巨噬细胞和上皮细胞中的反馈作用，促进了持久的广泛先天抗病毒抵抗力。 | 仅在小鼠模型中进行，没有在人类实验中验证结果 | 揭示BCG疫苗对异源病原体的非特异性保护机制 | BCG疫苗接种的小鼠 | 免疫学 | 呼吸道疾病 | 流式细胞术, 空间转录组学 | 小鼠模型 | 生物样本数据 | 小鼠数量不明确，但涉及多种病毒感染 |
| 13906 | 2024-08-04 |
The exploration of mitochondrial-related features helps to reveal the prognosis and immunotherapy methods of colorectal cancer
2024-01, Cancer reports (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/cnr2.1914
PMID:37903487
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研究论文 | 该文章探讨了线粒体相关特征如何揭示结直肠癌的预后和免疫疗法方法 | 文章通过线粒体相关基因风险评分构建预后模型，并与其他模型进行比较，展示了新的预后评估方法 | 该研究可能仅限于数据库中的数据，临床实用性需要进一步验证 | 研究结直肠癌中线粒体特征与肿瘤微环境及免疫景观的关系 | 使用非负矩阵分解（NMF）对结直肠癌患者数据进行亚组分析 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 免疫组化和单细胞测序 | 风险评分模型 | 临床数据和基因数据 | 使用内外部队列的 CRC 患者数据进行广泛测试 |
| 13907 | 2024-08-07 |
Integration of single-cell and bulk RNA-sequencing to analyze the heterogeneity of hepatocellular carcinoma and establish a prognostic model
2024-01, Cancer reports (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/cnr2.1935
PMID:37994394
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据，分析肝细胞癌的异质性，并建立了一个预测模型 | 本研究首次结合单细胞和批量RNA测序数据，探讨了肝细胞癌肿瘤异质性与治疗反应和预后的关联，并开发了一个新的预测模型 | NA | 研究肝细胞癌肿瘤异质性与治疗反应和预后的关联 | 肝细胞癌的肿瘤细胞异质性 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA测序 | Cox比例风险模型 | RNA测序数据 | 数据来自TCGA和GEO数据库，具体样本数量未提及 |
| 13908 | 2024-08-07 |
The challenge of defining rare genetic programs by single-cell RNA sequencing: Insights from phloem studies
2024-01-01, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2023.12.012
PMID:38115581
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 13909 | 2024-08-07 |
CAR T-cell Design-dependent Remodeling of the Brain Tumor Immune Microenvironment Modulates Tumor-associated Macrophages and Anti-glioma Activity
2023-12-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-23-0424
PMID:37971169
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研究论文 | 本研究探讨了脑肿瘤免疫微环境（TIME）和嵌合抗原受体（CAR）设计对B7-H3特异性CAR T细胞抗胶质瘤活性的影响 | 研究通过转基因表达41BBL在基于CD28的CAR T细胞中，增强了治疗效果和持久性，并揭示了CAR设计对TIME的调节作用 | 尽管在体外实验中CAR设计提高了抗胶质瘤疗效，但在体内实验中并未观察到类似改善 | 旨在理解转移性免疫细胞与脑肿瘤免疫微环境之间的复杂动态关系，以开发有效的基于T细胞的免疫疗法 | B7-H3特异性CAR T细胞及其在脑肿瘤免疫微环境中的作用 | 免疫学 | 脑肿瘤 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | CAR T细胞 | 细胞 | 使用了七种完全鼠源的B7-H3 CARs进行评估 |
| 13910 | 2024-08-04 |
Cancer-prone Phenotypes and Gene Expression Heterogeneity at Single-cell Resolution in Cigarette-smoking Lungs
2023-11-10, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-23-0195
PMID:37910161
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研究论文 | 该文章通过单细胞RNA测序技术揭示了吸烟肺部的癌症易感性表型和基因表达异质性 | 提出了两种新的单细胞元分析方法VARIED和AGED，并建立了吸烟肺部图谱，揭示了与吸烟相关的基因表达多样性和衰老差异 | 未提及研究的样本来源和潜在的外部影响因素 | 建立吸烟肺部图谱，以探究吸烟对人类肺部细胞多样性的影响 | 104个肺部单细胞RNA测序样本和相关的临床病理信息 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 104个肺部单细胞RNA测序样本 |
| 13911 | 2024-08-07 |
Plasticity in airway smooth muscle differentiation during mouse lung development
2023-03-13, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.02.002
PMID:36868232
|
研究论文 | 研究探讨了在小鼠肺部发育过程中，平滑肌分化对气道上皮分支形态的影响 | 发现胚胎期气道平滑肌表现出可塑性，并证实合成型平滑肌层促进气道分支形态发生 | NA | 探究平滑肌分化在肺部发育中的作用及其机制 | 小鼠胚胎肺部平滑肌分化 | NA | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | Srf基因缺失的小鼠胚胎肺部样本 |
| 13912 | 2024-08-07 |
Endothelial and Leptin Receptor+ cells promote the maintenance of stem cells and hematopoiesis in early postnatal murine bone marrow
2023-03-13, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.02.003
PMID:36868235
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了出生后4天、14天和8周的小鼠骨髓基质细胞，探讨了早期新生小鼠骨髓中内皮细胞和瘦素受体阳性细胞在造血干细胞和造血维持中的作用。 | 首次详细描述了早期新生小鼠骨髓中瘦素受体阳性细胞和内皮细胞在造血干细胞和造血维持中的作用，并揭示了这些细胞表达的干细胞因子在不同造血阶段的作用。 | NA | 探究早期新生小鼠骨髓中内皮细胞和瘦素受体阳性细胞在造血干细胞和造血维持中的作用。 | 小鼠骨髓中的内皮细胞和瘦素受体阳性细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 出生后4天、14天和8周的小鼠骨髓基质细胞 |
| 13913 | 2024-08-07 |
Tumor PD-L1 engages myeloid PD-1 to suppress type I interferon to impair cytotoxic T lymphocyte recruitment
2023-03-13, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2023.02.005
PMID:36917954
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研究论文 | 研究揭示了肿瘤细胞PD-L1通过与骨髓细胞PD-1相互作用，抑制I型干扰素信号通路，从而影响细胞毒性T淋巴细胞在肺转移中的招募 | 首次报道了肿瘤细胞PD-L1通过与骨髓细胞PD-1结合，激活SHP2，抑制I型干扰素和STAT1信号通路，减少Cxcl9表达，从而影响细胞毒性T淋巴细胞在肺转移中的招募 | 研究主要在肿瘤小鼠模型中进行，尚未在人体中验证 | 探讨肿瘤细胞PD-L1在肿瘤免疫逃逸中的分子机制 | 肿瘤细胞PD-L1、骨髓细胞PD-1、细胞毒性T淋巴细胞 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及肿瘤小鼠模型和人类癌症患者 |
| 13914 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA-seq revealing the immune features of donor liver during liver transplantation
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1096733
PMID:36845096
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研究论文 | 本研究揭示了肝移植过程中供体肝脏的免疫特征 | 使用单细胞RNA测序和TCR/BCR谱序列分析供体肝脏免疫细胞的表达和分布 | 样本数量较少，仅分析了三对供体肝脏的免疫特征 | 探讨肝移植过程中免疫细胞的变化及其与移植排斥反应的关联 | 三对供体肝脏的免疫细胞及其TCR/BCR谱 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和TCR/BCR谱序列 | NA | 转录组数据 | 三对供体肝脏样本 |
| 13915 | 2024-08-07 |
Shared immune metabolic reprogramming between COVID-19 patients in the intensive care unit and ischemic stroke: a pilot study
2023, Archives of medical science : AMS
IF:3.0Q1
DOI:10.5114/aoms/172161
PMID:38058697
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研究论文 | 本研究探讨了COVID-19和缺血性中风之间的共享基因特征 | 通过结合现有的批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，更全面地理解了代谢失调的作用，并使用机器学习方法识别了潜在的诊断模型 | NA | 研究COVID-19和缺血性中风之间的共享基因特征 | COVID-19患者和缺血性中风患者 | NA | COVID-19, 缺血性中风 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | 机器学习 | RNA测序数据 | 19个上调差异表达基因和24个下调基因 |
| 13916 | 2024-08-07 |
DeepVelo: Single-cell transcriptomic deep velocity field learning with neural ordinary differential equations
2022-Dec-02, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abq3745
PMID:36449617
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研究论文 | 本文介绍了一种基于神经网络的常微分方程模型DeepVelo，用于模拟单细胞转录组动力学 | DeepVelo能够通过描述单细胞内连续时间的基因表达变化，来模拟复杂的转录组动力学 | NA | 研究单细胞转录组动力学，并探索细胞状态的不稳定性及发育驱动基因 | 单细胞基因表达数据和RNA速度 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 神经网络 | 基因表达数据 | 使用来自不同测序平台的公共数据集 |
| 13917 | 2024-08-07 |
Improving Transcriptome Fidelity Following Synovial Tissue Disaggregation
2022, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2022.919748
PMID:36035425
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研究论文 | 本文通过改进关节组织分散技术，提高了解散关节组织细胞转录组的保真度，特别是对于单细胞RNA测序（scRNAseq）的应用 | 本文引入了RNA聚合酶抑制剂和冷酶消化方法，有效减少了组织处理过程中相关转录本的诱导，从而提高了转录组的保真度 | NA | 提高解散关节组织细胞转录组的保真度 | 骨关节炎（OA）和类风湿关节炎（RA）的关节组织 | 数字病理学 | 关节疾病 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | RNA | 骨关节炎和类风湿关节炎的关节组织样本 |
| 13918 | 2024-08-07 |
A high interferon gamma signature of CD8+ T cells predicts response to neoadjuvant immunotherapy plus chemotherapy in gastric cancer
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1056144
PMID:36685525
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研究论文 | 研究探讨了胃癌中肿瘤微环境（TME）与新辅助免疫治疗加化疗之间的相互作用，并分析了CD8+ T细胞中高基线干扰素γ（IFN-γ）信号对治疗反应的预测作用。 | 首次阐明了胃癌中新辅助免疫治疗加化疗与肿瘤微环境特征之间的相互作用，并强调了CD8+ T细胞的信号在预测治疗反应中的重要性。 | 研究样本量较小，仅涉及十个胃癌样本，可能影响结果的普遍性。 | 探究胃癌中新辅助免疫治疗加化疗与肿瘤微环境的相互作用及其对治疗效果的影响。 | 胃癌患者的肿瘤微环境及CD8+ T细胞的干扰素γ信号。 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 十个胃癌样本 |
| 13919 | 2024-08-07 |
Single-cell computational machine learning approaches to immune-mediated inflammatory disease: New tools uncover novel fibroblast and macrophage interactions driving pathogenesis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1076700
PMID:36685542
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综述 | 本文综述了利用单细胞测序技术结合计算生物学方法，探索纤维母细胞与骨髓细胞在免疫介导炎症疾病中的相互作用及其临床意义 | 介绍了新的计算生物学技术，如维度降低、聚类和轨迹推断，以及这些技术在揭示纤维母细胞亚群与巨噬细胞之间新型相互作用中的应用 | 需要更强大的模型来进一步分析纤维母细胞的异质性及其与骨髓细胞的相互作用 | 总结计算技术在分类纤维母细胞异质性及其与骨髓细胞在特定生物学和临床环境中的相互作用方面的关键进展 | 纤维母细胞的异质性及其与巨噬细胞在免疫介导炎症疾病中的相互作用 | 机器学习 | 免疫介导炎症疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 13920 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics reveals striking heterogeneity and functional organization of dendritic and monocytic cells in the bovine mesenteric lymph node
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1099357
PMID:36685557
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析了牛肠系膜淋巴结中树突状细胞和单核细胞的异质性和功能组织 | 揭示了树突状细胞和单核细胞的十个集群和七个集群，具有明显的转录组特征，并定义了淋巴结定居子集及其前体，以及高度激活的迁移树突状细胞子集 | NA | 研究树突状细胞和单核细胞在次级淋巴组织中启动和塑造适应性免疫反应的复杂系统 | 牛肠系膜淋巴结中的单核吞噬细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 三头成年牛的肠系膜淋巴结 |