单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27536 篇文献，本页显示第 13861 - 13880 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 13861 | 2024-08-04 |
Dynamic video recognition for cell-encapsulating microfluidic droplets
2024-Mar-25, The Analyst
DOI:10.1039/d4an00022f
PMID:38441128
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研究论文 | 本研究探讨了在微流体液滴视频识别中应用弱监督细胞计数网络的软件 | 提出了一种实时视频处理方法，能够在没有监督位置信息的情况下准确定位液滴和被包覆的细胞，并显著减少标注工作量 | 未提及研究的具体限制 | 优化液滴微流控技术中的质量控制，并提高基于视频识别的细胞包覆评估 | 主要研究不同微流体结构中包覆六种类型细胞/珠子的液滴 | 数字病理学 | NA | 弱监督细胞计数网络 | NA | 视频 | 六种类型的细胞/珠子液滴 |
| 13862 | 2024-08-04 |
Spatial High-resolution Analysis of Gene Expression Levels in Tendons
2024-Mar-08, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/65852
PMID:38526117
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method paper | 本文集中于使用新型原位杂交实验分析肌腱组织中基因表达水平的空间方法 | 提出了一种新的在单细胞水平上检测目标RNA的技术，并增强了对肌腱细胞的分子表征 | 尚未讨论在多种动物模型或人类肌腱组织分析中的潜在局限性 | 研究和分析肌腱中基因表达水平的空间分布 | 肌腱组织中的特定细胞以及其他富含基质的组织如骨、软骨和韧带 | 数字病理学 | NA | 原位杂交 | NA | NA | 不同动物模型和人类肌腱组织的样本 |
| 13863 | 2024-08-04 |
Dynamic YAP expression in the non-parenchymal liver cell compartment controls heterologous cell communication
2024-Mar-04, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-024-05126-1
PMID:38436764
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研究论文 | 该文章探讨了YAP和TAZ在小鼠非实质性肝细胞中的动态表达如何控制细胞间的通信。 | 提出了一种新的机制，说明YAP如何通过影响非实质性细胞的细胞间通信来促进炎症。 | 研究主要集中在小鼠模型，结果是否适用于人类尚不清楚 | 研究YAP和TAZ的失活对肝细胞特征和细胞间通信的影响 | 使用了专门缺失YAP和TAZ的小鼠模型进行观察 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 免疫组化，单细胞测序，蛋白质组学 | NA | 组织样本，血清 | YAPKO和DKO小鼠，具体样本数量未提及 |
| 13864 | 2024-08-07 |
GLIPR2: a potential biomarker and therapeutic target unveiled - Insights from extensive pan-cancer analyses, with a spotlight on lung adenocarcinoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1280525
PMID:38476239
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研究论文 | 本研究通过广泛的数据集分析，探讨了GLIPR2在多种人类恶性肿瘤中的表达情况及其作为生物标志物和治疗靶点的潜力，特别关注肺腺癌。 | 首次全面分析GLIPR2在多种癌症中的表达及其与免疫细胞浸润的关系，揭示了其在肺腺癌中的诊断和预后价值。 | NA | 探讨GLIPR2在多种癌症中的表达及其作为生物标志物和治疗靶点的潜力。 | GLIPR2在多种人类恶性肿瘤中的表达及其与免疫细胞浸润的关系。 | 数字病理学 | 肺腺癌 | RNA测序 | NA | 基因组数据 | 多中心队列涵盖多种癌症类型 |
| 13865 | 2024-08-07 |
Coniferyl ferulate alleviate xylene-caused hematopoietic stem and progenitor cell toxicity by Mgst2
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1334445
PMID:38523643
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探讨了松脂素阿魏酸酯（CF）通过靶向Mgst2基因减轻二甲苯引起的造血干细胞和祖细胞毒性的作用 | 首次揭示了松脂素阿魏酸酯通过靶向Mgst2基因减轻二甲苯引起的造血干细胞和祖细胞毒性的新机制 | NA | 探讨松脂素阿魏酸酯对二甲苯引起的造血干细胞和祖细胞毒性的缓解作用及其分子机制 | 造血干细胞和祖细胞（HSPCs）及二甲苯引起的毒性 | 数字病理学 | 血液疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型中的骨髓造血干细胞和祖细胞 |
| 13866 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals the landscape of epithelial-mesenchymal transition molecular heterogeneity in esophageal squamous cell carcinoma
2024-Apr-10, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216723
PMID:38342234
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研究论文 | 本研究通过分析209,231个食管鳞状细胞癌（ESCC）细胞的高分辨率单细胞转录组数据，揭示了ESCC中上皮-间质转化（EMT）的分子异质性 | 首次全面分析了ESCC发展过程中EMT的分子异质性，并鉴定了87个EMT相关分子，发现了SERPINH1作为ESCC EMT的新潜在标记物 | NA | 揭示食管鳞状细胞癌中上皮-间质转化的分子异质性，并探索潜在的抑制策略 | 食管鳞状细胞癌（ESCC）细胞的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 209,231个ESCC细胞，来自44个个体中的39个肿瘤样本和16个邻近样本 |
| 13867 | 2024-08-04 |
Distinct mast cell subpopulations within and around lymphatic vessels regulate lymph flow and progression of inflammatory-erosive arthritis in TNF-transgenic mice
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1275871
PMID:38155962
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研究论文 | 本文探讨了小鼠模型中肥大细胞对淋巴管功能和炎症侵蚀性关节炎的影响 | 首次阐明了不同肥大细胞亚群对关节淋巴流动及炎症-侵蚀性关节炎进展的调控作用 | 研究主要集中在TNF转基因小鼠上，缺乏对其他模型的验证 | 研究肥大细胞在肿瘤坏死因子转基因小鼠中对关节淋巴管功能和炎症-侵蚀性关节炎的作用 | TNF转基因小鼠和各种基因缺失小鼠，用于评估肥大细胞的作用 | 数字病理学 | 炎症性关节炎 | 单细胞RNA测序和免疫荧光显微镜 | TNF转基因小鼠 | 组织学和生物信息学数据 | TNF-tg小鼠、WT小鼠及cKit缺失小鼠共计数十只 |
| 13868 | 2024-08-05 |
The utilization of single-cell sequencing technology in investigating the immune microenvironment of ccRCC
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1276658
PMID:38090562
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评论 | 本文回顾了单细胞测序技术在研究ccRCC免疫微环境中的应用。 | 文章创新地强调了单细胞测序技术如何揭示肿瘤微环境中特定细胞特征的重要性。 | 以往的先进测序方法忽视了特定较少的细胞特征，可能未能全面反映肿瘤微环境的复杂性。 | 探讨ccRCC中肿瘤微环境的特性及其免疫浸润的最新进展。 | ccRCC中肿瘤微环境和免疫浸润相关的细胞特征。 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞测序 | NA | 细胞特征数据 | NA |
| 13869 | 2024-08-05 |
Identification of drug candidates targeting monocyte reprogramming in people living with HIV
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1275136
PMID:38077315
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研究论文 | 本文探讨了针对HIV感染者单核细胞重编程的药物候选物的识别 | 利用单细胞RNA测序技术识别用于逆转HIV感染者单核细胞转录表型的药物候选物 | 样本数量较小，仅限于200-HIV队列研究的部分参与者 | 评估组学技术在HIV感染者大规模队列中的应用可行性 | HIV感染者和健康对照者中的免疫细胞 | 数字病理学 | HIV | 单细胞RNA-seq、流式细胞术、蛋白质组学、ATAC-seq | NA | 血液样本 | 少量血液样本来自HIV感染者及健康对照者 |
| 13870 | 2024-08-05 |
Comprehensive analysis of mitophagy-related genes in NSCLC diagnosis and immune scenery: based on bulk and single-cell RNA sequencing data
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1276074
PMID:38155968
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研究论文 | 本研究系统分析了线粒体自噬与非小细胞肺癌（NSCLC）之间的关系 | 通过机器学习选择六个与线粒体自噬相关的特征基因并构建了NSCLC的诊断模型 | NA | 探索线粒体自噬在NSCLC中的潜在机制以及其与免疫微环境的关系 | 非小细胞肺癌患者的线粒体自噬相关基因 | 数字病理学 | 非小细胞肺癌 | RNA测序 | 机器学习模型 | 单细胞数据与大规模RNA测序数据 | NA |
| 13871 | 2024-08-07 |
Comprehensive analysis of necroptosis-related genes in renal ischemia-reperfusion injury
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1279603
PMID:37965311
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研究论文 | 本研究对肾移植中缺血再灌注损伤相关的坏死性凋亡基因进行了综合分析，并探讨了其在延迟移植物功能中的作用。 | 研究首次系统地分析了坏死性凋亡相关基因在肾缺血再灌注损伤中的表达和功能，并开发了一个预测延迟移植物功能的模型。 | 研究主要基于基因表达数据和单细胞RNA测序数据，可能需要更多的临床数据来进一步验证和优化模型。 | 旨在识别和功能表征肾移植中与坏死性凋亡相关的基因，并探讨其在免疫反应和缺血再灌注损伤进展中的作用。 | 肾移植中的缺血再灌注损伤及其相关的坏死性凋亡基因。 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括预处理和再灌注后的肾活检样本，以及IRI小鼠模型 |
| 13872 | 2024-08-07 |
Elaboration and validation of a prognostic signature associated with disulfidoptosis in lung adenocarcinoma, consolidated with integration of single-cell RNA sequencing and bulk RNA sequencing techniques
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1278496
PMID:37965333
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序技术，详细阐述并验证了与硫化物凋亡相关的肺腺癌预后标志物 | 首次将单细胞RNA测序与批量RNA测序技术结合，探索与硫化物凋亡相关的基因，并构建预后风险标志物 | NA | 旨在通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序技术，揭示与硫化物凋亡相关的基因，并预测肺腺癌患者的临床预后 | 肺腺癌（LUAD）及其与硫化物凋亡相关的基因 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（bulk RNA-seq） | LASSO-Cox回归模型 | RNA序列数据 | 使用GSE149655数据集的肺腺癌和正常样本，具体样本数量未详述 |
| 13873 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomic atlas throughout anti-BCMA CAR-T therapy in patients with multiple myeloma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1278749
PMID:38035111
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了多发性骨髓瘤患者在接受抗BCMA CAR-T治疗过程中骨髓和外周血样本的转录组图谱 | 揭示了复发患者肿瘤细胞中HSP90B1和HSPA5的高表达以及内质网应激和未折叠蛋白反应途径的显著富集 | NA | 探究多发性骨髓瘤患者在接受抗BCMA CAR-T治疗后的免疫细胞变化及其与复发的关系 | 多发性骨髓瘤患者在接受抗BCMA CAR-T治疗过程中的骨髓和外周血细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 24个骨髓或外周血样本，共分析了59,725个骨髓细胞和72,479个外周血细胞 |
| 13874 | 2024-08-07 |
Single cell transcriptome analyses reveal the roles of B cells in fructose-induced hypertension
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1279439
PMID:38045685
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了B细胞在果糖诱导的高血压中的作用 | 首次揭示了B细胞在果糖诱导的高血压中的重要作用，并发现了B细胞与Tfh细胞及干扰素途径的激活之间的关联 | 研究仅限于Dahl盐敏感性雄性大鼠，结果的普遍性有待进一步验证 | 探讨B细胞在果糖诱导的高血压发展中的作用 | Dahl盐敏感性雄性大鼠的肠黏膜细胞和外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 8周龄Dahl盐敏感性雄性大鼠，分为两组，每组给予不同处理，共进行4周的实验 |
| 13875 | 2024-08-07 |
Assessing characteristics of RNA amplification methods for single cell RNA sequencing
2016-11-24, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-016-3300-3
PMID:27881084
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研究论文 | 本文通过大规模对照实验评估了三种单细胞RNA测序方法的传递函数及其调控因素 | 首次系统评估了不同单细胞RNA测序方法的性能和可靠性 | 实验中检测到的基因数量和表达水平存在一定偏差 | 评估单细胞RNA测序方法的性能和可靠性 | 三种单细胞RNA测序方法及其性能 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 大规模对照实验 |
| 13876 | 2024-08-07 |
ICOS costimulation in combination with CTLA-4 blockade remodels tumor-associated macrophages toward an antitumor phenotype
2024-Apr-01, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20231263
PMID:38517331
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研究论文 | 研究探讨了ICOS共刺激与CTLA-4阻断联合治疗对肿瘤相关巨噬细胞表型的重塑作用 | 发现ICOS共刺激与CTLA-4阻断联合治疗能显著重塑淋巴和髓系细胞，增强Th1 CD4 T细胞、效应CD8 T细胞和M1样抗肿瘤促炎巨噬细胞的富集 | NA | 研究ICOS共刺激与CTLA-4阻断联合治疗在抗肿瘤治疗中的协同作用及其机制 | 肿瘤相关巨噬细胞和效应T细胞 | 免疫学 | 肿瘤 | CyTOF和单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 涉及B16-F10细胞疫苗和多种免疫细胞 |
| 13877 | 2024-08-07 |
Single cell deciphering of progression trajectories of the tumor ecosystem in head and neck cancer
2024-Mar-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46912-6
PMID:38519500
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了头颈部鳞状细胞癌在不同阶段的肿瘤生态系统进展轨迹 | 首次揭示了恶性上皮细胞的转录发育轨迹及由TFDP1调控的肿瘤生成上皮亚群，并发现了POSTN纤维母细胞和SPP1巨噬细胞在肿瘤进展中的浸润增加及其与恶性细胞的相互作用增强 | NA | 旨在更好地表征头颈部鳞状细胞癌的肿瘤进展轨迹 | 头颈部鳞状细胞癌的正常组织、癌前组织、早期和晚期癌症组织、淋巴结及复发肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 头颈部癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及多种组织样本，包括正常组织、癌前组织、早期和晚期癌症组织、淋巴结及复发肿瘤组织 |
| 13878 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing integrated with bulk RNA sequencing analysis identifies a tumor immune microenvironment-related lncRNA signature in lung adenocarcinoma
2024-Mar-22, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-024-01866-5
PMID:38519942
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据，识别出与肺腺癌肿瘤免疫微环境相关的长非编码RNA（lncRNA）特征 | 首次开发了一种基于肿瘤免疫微环境相关lncRNA的特征（TRLS），该特征在预测肺腺癌患者总体生存方面表现出色，并显示出对免疫治疗的敏感性 | NA | 开发一种新的工具，用于肺腺癌患者的个性化治疗和预后管理 | 肺腺癌患者的肿瘤免疫微环境相关的lncRNA | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序和批量RNA测序 | 机器学习框架 | RNA测序数据 | 1368名肺腺癌患者 |
| 13879 | 2024-08-07 |
Involvement of TGFBI-TAGLN axis in cancer stem cell property of head and neck squamous cell carcinoma
2024-03-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-57478-0
PMID:38514830
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研究论文 | 本研究探讨了TGFBI在头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中的作用及其通过TAGLN轴促进癌症干细胞特性的机制 | 首次揭示了TGFBI通过上调TAGLN促进HNSCC中癌症干细胞特性的新机制 | NA | 阐明TGFBI对HNSCC细胞恶性行为的影响 | 头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）细胞 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 使用TCGA数据库中的RNA测序数据进行验证 |
| 13880 | 2024-08-04 |
Transcriptomic changes associated with oral immunotherapy for food allergy
2024-Mar, Pediatric allergy and immunology : official publication of the European Society of Pediatric Allergy and Immunology
IF:4.3Q1
DOI:10.1111/pai.14106
PMID:38520061
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综述 | 这篇综述总结了与口服免疫疗法相关的转录通路的最新进展 | 采用单细胞测序等技术，提供了对口服免疫疗法后基因表达变化的新见解 | 对长期和明确临床结果相关的免疫特征的研究仍然不足 | 研究口服免疫疗法后免疫机制的转录变化 | 关注过敏性食物患者在接受口服免疫疗法后的基因表达变化 | 数字病理学 | 食物过敏 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA |