单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27329 篇文献，本页显示第 13801 - 13820 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 13801 | 2024-08-04 |
mitoSplitter: A mitochondrial variants-based method for efficient demultiplexing of pooled single-cell RNA-seq
2023-09-26, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2307722120
PMID:37725654
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研究论文 | 本文开发了一种基于线粒体变体的方法‘mitoSplitter’，用于高效地解混合池化的单细胞RNA-seq数据 | 提出利用线粒体RNA变体进行解混合的新算法，从而克服传统方法的局限 | 在多样本和大规模细胞数据的情况下，仍可能存在一定的挑战与限制 | 旨在提高单细胞RNA-seq数据分析的效率，减少批次效应 | 研究五种非小细胞肺癌细胞系对BET化学降解的反应 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA-seq | NA | RNA数据 | 10个样本，60000个细胞 |
| 13802 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of murine hearts for studying the development of the cardiac conduction system
2023-09-04, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-023-02333-6
PMID:37666871
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，对小鼠心脏在不同发育阶段的约0.5百万个单细胞进行转录组分析，以研究心脏传导系统的发育 | 首次生成包含约0.5百万个单细胞的小鼠心脏转录组大数据集，为心脏传导系统及其他心脏组件的发育研究提供了强大的资源库 | NA | 研究心脏传导系统的发育及其在心脏功能中的作用 | 小鼠心脏在不同发育阶段的单细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 约0.5百万个单细胞 |
| 13803 | 2024-08-04 |
Human and murine fibroblast single-cell transcriptomics reveals fibroblast clusters are differentially affected by ageing and serum cholesterol
2023-07-04, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvad016
PMID:36718802
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研究论文 | 本文探讨了人类和小鼠动脉中的成纤维细胞异质性及其在心血管疾病中的作用 | 文章提出了PDGFRA和DPEP1两种特异性成纤维细胞标记，并展示了成纤维细胞在健康和心血管疾病中的异质性 | 研究主要集中在小鼠模型上，尚需进一步确认在人类中的具体应用 | 阐明成纤维细胞在心血管疾病及相关风险因素中的作用 | 人类和小鼠动脉中的成纤维细胞及其对心血管疾病的反应 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 包括多个小鼠和人类样本，具体数量未说明 |
| 13804 | 2024-08-07 |
Modelling capture efficiency of single-cell RNA-sequencing data improves inference of transcriptome-wide burst kinetics
2023-07-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad395
PMID:37354494
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研究论文 | 本文提出了一种新的数学理论来解释单细胞RNA测序数据中的变异性，并开发了基于似然和模拟的方法来推断转录组范围内的爆发动力学 | 本文引入了新的数学模型来捕捉细胞大小和捕获效率的爆发动力学和变异性 | NA | 研究基因表达的随机爆发动力学，并改进单细胞RNA测序数据中转录组范围爆发动力学的推断 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达爆发动力学 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 神经网络 (Neural Network) | RNA测序数据 | NA |
| 13805 | 2024-08-04 |
Positional influence on cellular transcriptional identity revealed through spatially segmented single-cell transcriptomics
2023-06-21, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2023.05.003
PMID:37348462
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研究论文 | 本文描述了一种通过空间分割的单细胞转录组技术揭示细胞转录身份的位置信息 | 提出了一种新的快速整合方法SEEP，将表面接近性和环境可达性与三维疾病模型中的转录身份关联起来 | 现有方法需要特定的技术和专业知识，本研究的适用范围可能受限于特定类型的肿瘤模型 | 研究细胞状态在肿瘤组织中的空间分布及其对转录身份的影响 | 高等级浆液性卵巢癌的球体、类器官以及体内肿瘤模型 | 数字病理 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | 三维疾病模型 | 转录组数据 | NA |
| 13806 | 2024-08-04 |
Vascular mechanisms of post-COVID-19 conditions: Rho-kinase is a novel target for therapy
2023-06-02, European heart journal. Cardiovascular pharmacotherapy
DOI:10.1093/ehjcvp/pvad025
PMID:37019821
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研究论文 | 本研究探讨了后新冠肺炎（后COVID-19）患者的血管机制，尤其是Rho-激酶作为治疗的新靶点。 | 本研究首次提出Rho-激酶的激活可能是治疗后COVID-19状态的新靶点，显示疫情后患者血管纤维化的加重和肌球蛋白轻链磷酸化增加。 | 本研究样本量相对较小，仅包含37名患者和10名对照，限制了结果的普遍适用性。 | 探讨后COVID-19条件下的血管功能障碍机制，并评估Rho-激酶作为潜在治疗靶点的可行性。 | 27名出院后新冠患者和10名匹配的对照者。 | 数字病理学 | 后COVID-19状态 | 血液生物标志物，心肾和肺部影像学，臀部皮下活检 | NA | 生物标志物数据，影像数据 | 37名患者（27名COVID-19患者和10名对照者） |
| 13807 | 2024-08-04 |
CIARA: a cluster-independent algorithm for identifying markers of rare cell types from single-cell sequencing data
2023-Jun-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.201264
PMID:37294170
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研究论文 | 该论文提出了一种名为CIARA的计算工具，用于从单细胞测序数据中识别稀有细胞类型的标记基因 | CIARA是一个独立于聚类的方法，能够选择可能成为稀有细胞类型标记的基因，超越了现有的稀有细胞类型检测方法 | 该研究未提及具体的限制 | 开发一种工具以识别单细胞基因组中的稀有细胞类型及其标记基因 | 识别来自人类胚胎和处理过视黄酸的小鼠胚胎干细胞的未表征稀有细胞群 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 来自人类胚胎和小鼠胚胎干细胞的多样本数据 |
| 13808 | 2024-08-04 |
Single-cell gene and isoform expression analysis reveals signatures of ageing in haematopoietic stem and progenitor cells
2023-05-24, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-04936-6
PMID:37225862
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研究论文 | 本研究揭示了造血干细胞和祖细胞在衰老中的基因和亚型表达特征 | 通过整合短读和长读的单细胞RNA测序分析，提供了一个关于造血过程中的亚型多样性的新参考 | 衰老对亚型使用的影响有限 | 探讨衰老对造血干细胞和祖细胞的影响 | 造血干细胞和祖细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 13809 | 2024-08-04 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Conserved Regulatory Networks in Human and Mouse Interneuron Development
2023-May-01, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24098122
PMID:37175835
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学揭示了人类和小鼠抑制性神经元发育中的保守调控网络 | 识别出人类抑制性神经元分化的新候选转录调控因子 | 关于不同神经元群体发育的知识仍不完全 | 探讨人类和小鼠抑制性GABA能神经元的发育过程 | 人类胎儿的中脑中间隆起(MGE)单细胞数据 | 数字病理学 | 癫痫，自闭症，精神分裂症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 10至15周后的人类胎儿中脑中间隆起组织 |
| 13810 | 2024-08-07 |
Low-dose IL-2 enhances the generation of IL-10-producing immunoregulatory B cells
2023-04-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-37424-w
PMID:37045832
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研究论文 | 本文研究了低剂量白细胞介素-2（IL-2）对IL-10产生调节性B细胞生成的增强作用 | 首次证明了低剂量IL-2可以增强人体内IL-10产生调节性B细胞的生成 | NA | 探讨低剂量IL-2是否能在人体内诱导产生调节性B细胞 | 人体外周血和脾脏B细胞以及接受低剂量IL-2治疗的患者 | 免疫学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自接受低剂量IL-2治疗患者的循环免疫细胞 |
| 13811 | 2024-08-07 |
A Refined Single Cell Landscape of Haematopoiesis in the Mouse Foetal Liver
2023-Mar-23, Journal of developmental biology
IF:2.2Q3
DOI:10.3390/jdb11020015
PMID:37092477
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，对小鼠胎肝中的造血细胞进行了精细的细胞图谱构建 | 发现了小鼠胎肝中一种类似于人类已知的胎盘中等血红蛋白特征，以及一种先前未被识别的原始红细胞群 | NA | 获得胎肝中造血细胞的精细单细胞图谱 | 小鼠胎肝中的造血细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括了比先前数据集更多的细胞的E12.5小鼠胎肝样本 |
| 13812 | 2024-08-07 |
Zinc Supplementation Induced Transcriptional Changes in Primary Human Retinal Pigment Epithelium: A Single-Cell RNA Sequencing Study to Understand Age-Related Macular Degeneration
2023-02-28, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12050773
PMID:36899910
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了锌补充剂对人类视网膜色素上皮细胞转录组变化的影响，以理解年龄相关性黄斑变性的分子机制 | 首次使用单细胞RNA测序技术研究锌补充剂对视网膜色素上皮细胞转录组的影响，并揭示了锌处理后与年龄相关性黄斑变性相关的多个生物途径的基因表达变化 | 研究仅限于体外细胞培养，未涉及临床试验，且锌补充剂对视网膜色素上皮细胞的长期影响仍需进一步研究 | 探讨锌补充剂对年龄相关性黄斑变性进展的分子机制 | 人类视网膜色素上皮细胞 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及2周、9周和19周的细胞培养样本，以及1周和18周的锌补充处理样本 |
| 13813 | 2024-08-07 |
PD-1 and TIM-3 differentially regulate subsets of mouse IL-17A-producing γδ T cells
2023-02-06, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20211431
PMID:36480166
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研究论文 | 研究探讨了在小鼠中，PD-1和TIM-3如何不同地调节产生IL-17A的γδ T细胞亚群 | 首次展示了肺部Vγ4+和Vγ6+细胞在肿瘤和非肿瘤状态下表达不同的细胞表面分子和共抑制分子，并发现这些分子抑制其扩张 | NA | 研究γδ T细胞亚群在稳态和癌症中的调控机制 | 小鼠中产生IL-17A的γδ T细胞亚群 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序和流式细胞术 | NA | 细胞表面分子表达数据 | 肿瘤和非肿瘤小鼠的肺部Vγ4+和Vγ6+细胞 |
| 13814 | 2024-08-04 |
LRRC15 mediates an accessory interaction with the SARS-CoV-2 spike protein
2023-02, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3001959
PMID:36735681
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研究论文 | 本研究发现LRRC15是一种伴随因子，与SARS-CoV-2的刺突蛋白相互作用 | 本研究首次揭示了LRRC15作为SARS-CoV-2刺突蛋白的附加结合因子，与已知的结合机制不同 | LRRC15单独并不足以引发病毒进入，需要进一步研究其在感染中的作用 | 探讨SARS-CoV-2刺突蛋白与人类细胞之间的相互作用 | SARS-CoV-2刺突蛋白及其与人类细胞因子LRRC15的相互作用 | NA | COVID-19 | 蛋白组学与单细胞转录组学 | 细胞基因表达模型 | NA | 人类肺血管细胞和成纤维细胞的分析 |
| 13815 | 2024-08-07 |
Smoking induces shifts in cellular composition and transcriptome within the bronchial mucus barrier
2023-02, Respirology (Carlton, Vic.)
DOI:10.1111/resp.14401
PMID:36414410
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研究论文 | 本研究评估了吸烟对支气管黏液屏障细胞组成和基因表达的影响，并探讨了基于单细胞RNA测序的细胞解卷积方法在预测RNA测序数据中细胞类型组成的能力 | 研究首次使用细胞解卷积方法预测RNA测序数据中的细胞类型组成，并验证了该方法的有效性 | 研究样本量相对较小，且仅限于特定的疾病和吸烟状态群体 | 理解吸烟暴露对支气管黏液屏障黏膜损伤的机制 | 支气管黏液屏障的细胞组成和基因表达 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | 细胞解卷积 | RNA测序数据 | 共149名参与者，包括56名慢性阻塞性肺疾病患者，77名无慢性阻塞性肺疾病参与者，以及16名停止吸烟一年的参与者 |
| 13816 | 2024-08-07 |
Entropy sorting of single-cell RNA sequencing data reveals the inner cell mass in the human pre-implantation embryo
2023-01-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2022.09.007
PMID:36240776
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研究论文 | 本文介绍了一种名为熵排序（ES）的数学框架，用于从单细胞RNA测序数据中区分出指示细胞身份的基因，并在人类胚胎植入前阶段的单细胞RNA测序数据中成功识别出内细胞团（ICM）。 | ES方法无需用户定义的显著性阈值，通过量化特征间观察到的相关性是更可能由于随机机会还是依赖关系来区分基因，实现了无监督的细胞身份基因识别。 | NA | 解决单细胞基因表达分析中区分技术或生物噪声与有意义的细胞异质性的挑战。 | 人类胚胎植入前阶段的单细胞RNA测序数据。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量 |
| 13817 | 2024-08-04 |
A spatially resolved atlas of the human lung characterizes a gland-associated immune niche
2023-01, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-022-01243-4
PMID:36543915
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研究论文 | 本研究通过多组学单细胞和空间转录组学深入分析了健康人类肺部的组织结构和免疫微环境 | 本文发现了新的与腺体相关的免疫细胞栖息地，并对其在呼吸健康中的重要性进行了验证 | 研究主要集中于健康人类肺部，可能不适用于肺病患者的分析 | 重新定义人类肺部和气道的组织结构 | 健康人类肺部的不同位置的单细胞类型及其空间背景 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | NA | 五个健康人类肺部近远区域的位置 |
| 13818 | 2024-08-04 |
Single-cell and bulk RNA sequencing analysis of B cell marker genes in TNBC TME landscape and immunotherapy
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1245514
PMID:38111587
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研究论文 | 本研究旨在通过分析三阴性乳腺癌（TNBC）患者的B细胞标记基因来调查其预后特征 | 建立了基于B细胞标记基因的肿瘤微环境预测模型，以预测TNBC患者的预后和免疫治疗反应 | 鉴于样本量仅限于四个TNBC患者，可能限制了结果的普遍适用性 | 探索三阴性乳腺癌患者的预后特征 | 四名TNBC患者的肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | RNA测序 | NA | 细胞和基因表达数据 | 参与研究的样本量为四名TNBC患者的22,106个细胞和20,556个基因 |
| 13819 | 2024-08-04 |
A New Understanding, Guided by Single-Cell Sequencing, of the Establishment and Maintenance of the Ovarian Reserve in Mammals
2023, Sexual development : genetics, molecular biology, evolution, endocrinology, embryology, and pathology of sex determination and differentiation
IF:2.4Q2
DOI:10.1159/000526426
PMID:36122567
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review | 本综述详细介绍了卵巢储备的建立和维持的关键阶段 | 本文突出了几个重大的单细胞测序研究，这些研究显著推动了我们对卵巢储备新分子调节因子的知识 | NA | 探索与卵巢储备建立和维持相关的细胞和分子动态 | 卵巢中的原始卵泡及其相关阶段 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 13820 | 2024-08-07 |
Loss of CFTR function in macrophages alters the cell transcriptional program and delays lung resolution of inflammation
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1242381
PMID:38035088
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研究论文 | 本文研究了囊性纤维化（CF）中CFTR基因功能丧失对巨噬细胞的影响及其对肺部炎症消退的延迟作用 | 首次报道了CFTR功能丧失在巨噬细胞中引起的细胞转录程序改变，以及这种改变对肺部炎症消退的影响 | NA | 探讨CFTR功能丧失与中性粒细胞性炎症之间的关系 | CFTR基因功能丧失对巨噬细胞和肺部炎症的影响 | NA | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |